Stage2015. Microbio

Proposition de Stage M2
Année Universitaire 2014 - 2015
LE LABORATOIRE :
Nom du laboratoire d’accueil : ANSES
Nom du Responsable du Laboratoire : Mme Anne BRISABOIS
Nom du Responsable de l’Équipe : Mme Graziella BOURDIN
Nom de l’équipe d’accueil : Unité Bactériologie et Parasitologie des Produits de la Pêche et
de l'Aquaculture
Adresse : Boulevard Bassin Napoléon, Boulogne sur Mer
Responsable de l’encadrement : Mme Graziella BOURDIN, Mr Thomas BRAUGE
L’AGENCE, LE LABORATOIRE ET LA PROBLEMATIQUE LIE AU SUJET DU
STAGE :
L’Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du
travail (Anses, www.anses.fr) est un établissement public administratif placé sous la tutelle des
ministères chargés de l’agriculture, de la consommation, de l’environnement, de la santé et du
travail.
Le laboratoire de sécurité des aliments -Site de Boulogne sur mer- travaille sur des activités
destinées à couvrir les risques sanitaires des produits de la pêche, à savoir les risques
microbiologiques et physico-chimiques ainsi que les risques liés aux parasites.
La consommation française des produits aquatiques, par an et par habitant, et plus
particulièrement, celle des produits frais dans lequel on trouve notamment la truite et le saumon
fumé, est en constante augmentation depuis 1992. La France a produit 29900 tonnes de saumon et
truite fumés en 2007. Les données relatives à la France correspondent à une consommation de
saumon fumé d'environ 200 g par habitant et par an, ce qui place la France au sixième rang des
pays consommateurs. D’autre part, si des produits de la pêche, comme par exemple de la truite
gravad et/ou fumée ont été incriminées dans des cas de listérioses, aucune étude n’a établi de lien
entre des cas épidémiques et la consommation de saumon fumé.
La qualité microbiologique des produits issus des ateliers de transformation des produits
aquatiques a beaucoup évolué ces dernières années. En effet, les professionnels ont recours à des
pratiques et des systèmes de gestion de la qualité de plus en plus performants. Néanmoins, des
problèmes persistent et les professionnels ont parfois des difficultés à éliminer de manière efficace
certaines flores d’altération (Ex : Pseudomonas) ou pathogène (Listeria monocytogenes,…)
indésirable.
TITRE ET DESCRIPTION DU SUJET :
Etude de la fonction des exopolymères (EPS) de la matrice extracellulaire dans la formation et
la persistance des biofilms de Listeria monocytogenes monoespèce et mixte.
Les EPS (ExoPolymeric Substances) sont des constituants majeurs des biofilms, et ils
jouent un rôle phare dans l’adhésion, la formation et la structure d’un biofilm, mais aussi dans
ses propriétés (capacité de résistance à diverses molécules toxiques, comme les
antibiotiques...). Les EPS sont principalement composés de biomolécules de type glucide,
protéine, acide nucléique sécrétées par les bactéries.
Il est donc important dans le cadre de la lutte contre les biofilms de Listeria monocytogenes
dans les industries agroalimentaires (IAA), de mieux caractériser la matrice extracellulaire, du
point de vue de sa composition notamment, et donc d’étudier les EPS. Des travaux sur la
matrice du biofilm de Listeria monocytogenes sur polystyrène ont déjà été initiés à l’Anses
(Combrouse et al., 2013). Les travaux réalisés avaient ainsi montré que les EPS produits par
cette bactérie étaient en majorité de nature protéique puis glucidique et enfin nucléique
(ADNe) mais que leur quantité était différente selon la souche étudiée et le milieu de culture
utilisé.
Le projet proposé a pour but de définir le rôle de chacune des familles d’EPS dans la structure
du biofilm formé par cette bactérie sur des surfaces retrouvées dans les IAA et d’évaluer leur
fonction dans la persistance des biofilms lors de procédure de nettoyage (CIP). Des biofilms
monoespèce de Listeria monocytogenes seront étudiés ainsi que des biofilms mixtes de
Listeria monocytogenes associé à une souche non pathogène. Cette étude consistera à étudier
différents mutants de Listeria monocytogenes dans leur capacité à former des biofilms. Une
première partie des travaux consistera à évaluer la formation des biofilms sur polystyrène par
microscopie, dénombrement sur milieu gélosé et PCR quantitative couplé à la technologie du
propidium monoazide. Une seconde partie des travaux consistera à étudier la persistance des
biofilms formés par les mutants en présence ou non de traitements enzymatique et chimique.
Ce projet contribue à mieux appréhender et gérer le risque sanitaire lié à L. monocytogenes.
LIEU ET DUREE DU STAGE :
Le stage aura lieu à Boulogne sur mer à partir de janvier 2015 pour une durée de 6 mois.
PROFIL :
Etudiant niveau bac+5 en biologie vous avez des connaissances en biologie cellulaire,
microbiologie et en biologie moléculaire.
REMUNERATION :
La rémunération est celle prévue dans les textes pour des stages de plus de 8 semaines (436
euros).
DATE LIMITE DE REPONSE : 15 Novembre 2014
CONTACT + MODALITES DE REPONSE:
Merci d’adresser un CV + lettre de motivation à
Mme Graziella BOURDIN- ANSES- Boulevard Bassin Napoléon – 62200 BOULOGNE SUR
MER. Mail : [email protected]
Et
Mr Thomas BRAUGE- ANSES- Boulevard Bassin Napoléon – 62200 BOULOGNE SUR MER.
Mail : [email protected]