microbiologie et physico-chimie des biofilms - Accueil

Ecole Thématique – CNRS
MICROBIOLOGIE ET PHYSICO-CHIMIE DES
BIOFILMS
Une école financée et pilotée par la délégation Centre-Est du CNRS.
Avec le soutien de Nancy-Université (Université Henri Poincaré et Institut Polytechnique de Lorraine)
Sous le parrainage de la SFM
4 jours en résidentiel du lundi 19 octobre (soir) au vendredi 23 Octobre (matin) 2009
Droits d'inscription de 500 à 750 € HT selon statuts (inscription non payante pour les personnels CNRS)
site web : http://lcpe.cnrs-nancy.fr
CLUB MED VITTEL LE PARC (VITTEL, 88)
Comité d'organisation : Frédéric Jorand & Fabien Gaboriaud
Comité scientifique :
Jérôme Duval, Grégory Francius, Fabien Gaboriaud, Frédéric Jorand, Bruno Lartiges,
Christophe Merlin.
Renseignements :
Frédéric JORAND
LCPME UMR 7564
405, rue de Vandœuvre
54600 VILLERS-LES-NANCY
Tél : 03 83 68 52 20 / Télécopie : 03 83 27 54 44
[email protected]
Inscriptions :
Caroline FRANÇOIS & Sylvie DANIN
Bureau formation permanente - Délégation Centre-Est
17 rue Notre-Dame des Pauvres, B.P. 10075
54519 VANDOEUVRE-LES-NANCY
Tél. : 03 83 85 60 41 / Télécopie : 03 83 17 46 21
[email protected]
Modules du programme
Module I. Notions de base en microbiologie et en physicochimie
Structure et fonctions de la cellule bactérienne, les enveloppes bactériennes, bases de génétique bactérienne
Physico-chimie des surfaces et des interfaces
Module II. Bioadhésion
Conditionnement des surfaces : interactions protéines – surfaces
Physico-chimie des interphases biologiques
Méthodes biophysiques d’étude de l’adhésion bactérienne
Nanomicrobiologie
Module III. Travaux dirigés / Tables rondes : aspects méthodologiques
Les propriétés de surface des cellules microbiennes
Suivi et conception de biofilms au laboratoire
Module IV. Régulations et activités microbiennes dans les biofilms
Perception des surfaces et expression de gènes spécifiques à la croissance en biofilm
Les transferts génétiques au sein des biofilms
Virus et biofilms
Module V. Les biofilms du milieu naturel et anthropisé
Les biofilms de rivière
Analyses in situ par approche moléculaire
Biofilms "multi-espèces"
Module VI. Usage des biofilms et lutte contre les biofilms
Les biofilms du milieu agro-alimentaire
Installation d’un biofilm dans un réseau d’eau potable
Surfaces anti-adhésives
Biofilms et production d’énergie
Biofilms et biodétérioration.
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Ecole Thématique 2009
PROGRAMME
Du lundi 19 (soir) au vendredi 23 (matin) octobre 2009
Effectif attendu (tous compris) : 60 personnes
Jour 1 Lundi 19
Accueil en soirée sur le site
18h – 19h30 :
Présentation de l’école et accueil par les organisateurs
Apéritif d’accueil
Vers 20h00 :
dîner
Jour 2 Mardi 20
Module I. Notions de base en microbiologie et en physicochimie.
8h30 – 10h15
Structure et fonctions de la cellule bactérienne
- Structures, enveloppes et composition de la surface bactérienne, FJ
- Bases de génétique bactérienne,
CM
Frédéric Jorand & Christophe Merlin (UHP - Nancy-Université) COURS
10h15 – 10h45 : Pause café (devant les posters)
10h45 – 12h30 :
12h30 :
Physico-chimie des surfaces et des interfaces
Paul Rouxhet (UCL - Louvain, B.)
COURS
Pause déjeuner
Module II. Bioadhésion
14h00 – 15h00 :
15h00 - 16h00 :
Physico-chimie des interphases biologiques
Jérôme Duval (CNRS - Nancy)
COURS
Conditionnement des surfaces : interactions protéines - matériaux
Paul Rouxhet (UCL - Louvain, B.)
CONFERENCE
16h00 - 16h30 :
Pause café & posters
16h30 – 17h15 :
L’adhésion bactérienne en cytométrie en flux
Nelly Henry
(Institut Curie - Paris)
Nanomicrobiologie
Yves Dufrêne
(UCL - Louvain, B.)
17h15 – 18h00 :
Vers 19h00 :
CONFERENCE
CONFERENCE
Dîner
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Ecole Thématique 2009
Jour 3 : Mercredi 21
Module III. Travaux dirigés et pratiques sur les aspects méthodologiques
08h30 – 10h00 :
Groupe A (25 personnes max) :
- Propriétés de surface des cellules microbiennes
(animé par Jérôme Duval & Grégory Francius, …)
Groupe B (25 personnes max) :
- Suivi et conception de biofilms au laboratoire
(animé par Christophe Merlin & Bruno Lartiges, …)
10h00 – 10h30 :
pause café
10h30 – 12h00 :
Groupe B & A, mêmes séances alternées.
12h – 14h :
pause déjeuner
Après midi : Repos, activités de détentes en groupe
18h00 – 19h00 :
Présentation flash des posters
(1, 2 diapo par poster, 5 mn max discussion comprise, 10 - 12 posters).
Vers 19h00 :
dîner
21h00 – 22h00 :
Conférence de soirée:
Formation des biofilms chez E. coli: "Les dessous de la vie sur les surfaces"
Une introduction au module IV.
Christophe Beloin
(Institut Pasteur - Paris)
CONFERENCE-DEBAT
Jour 4 : Jeudi
Module IV : Régulations et activités microbiennes dans les biofilms
08h30 – 09h15 :
09h15 – 09h45 :
09h45– 10h15 :
10h15 – 10h45 :
Module V :
Perception des surfaces par la cellule bactérienne et expression de
gènes spécifiques à la croissance en biofilms
Corinne Dorel
(INSA - Lyon)
COURS
Les transferts génétiques au sein des biofilms
Christophe Merlin
(UHP, Nancy-Université)
CONFERENCE
Virus et biofilms
Christophe Gantzer
(UHP
Nancy-Université)
CONFERENCE
Pause café
Les biofilms du milieu naturel et anthropisé
10h45 – 11h30 :
Des biofilms témoins et acteurs du fonctionnement de la rivière
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Ecole Thématique 2009
11h30 – 12h00 :
12h00 – 12h30 :
12h30 :
Module VI.
F. Garabetian
(Université Bordeaux 1)
COURS
Compétition et socialisation dans des biofilms dégradants des
polluants - effets de changements environnementaux
Dirk Springael
(UCL - Louvain, B.)
CONFERENCE
Exploration in situ du fonctionnement des communautés
microbiennes de méthanisation par couplage SIP-NanoSIMS
Théodore Bouchez
(CEMAGREF - Antony)
CONFERENCE
Pause déjeuner
Usage des biofilms et lutte contre les biofilms
14h00 – 15h00 :
15h00 – 15h30 :
15h30 – 16h00 :
Les biofilms de la chaîne alimentaire : dynamiques d'installation et
moyens de maîtrise
Romain Briandet
(INRA - Jouy)
COURS
Biofilms en réseaux d'eaux potables : structures, propriétés et
contrôle
Jean-Claude Block
(UHP - Nancy-Université) CONFERENCE
Développement de surfaces anti-adhésives et/ou antibactériennes
Thierry Jouenne
(CNRS - Rouen)
CONFERENCE
16h00 – 16h30 :
Pause café
16h30 – 17h00 :
Biofilms électro-actifs et production d’énergie
Alain Bergel
(CNRS - Toulouse)
CONFERENCE
Développement de biofilms aux interfaces eaux - composés
organiques hydrophobes
Régis Grimaud
(Univ. Pau & p. de l'Adour) CONFERENCE
Biofilms et biodétérioration des matériaux cimentaires
Françoise Feugeas
(INSA Strasbourg)
CONFERENCE
17h00 – 17h30 :
17h30 – 18h00 :
19h :
dîner
Soirée conviviale - pot de départ
Jour 5 : Vendredi 23
9h00 - 10h00 : CONCLUSION –DISCUSSION
Bilan des acquis sur les biofilms, orientation de la recherche sur les biofilms dans les années
à venir… les enjeux et les verrous scientifiques
Place des biofilms dans l'industrie,
10h00 : café - CLOTURE de l'école
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Ecole Thématique 2009