Évaluations Génétique de Caprins Laitiers au Minho, Portugal

ÉVALUATION GÉNÉTIQUE DE CAPRINS
LAITIERS AU MINHO, PORTUGAL
L. F. Pacheco , F. W. Macedo
1
2
1: DRAEDM, Divisão de Produção Animal, S. Torcato - 4800 Guimarães, Portugal
2: Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro (UTAD), Apt. 202 - 5001 Vila Real Codex,
Portugal
Le Best Linear Unbiased Prediction (BLUP), permet la prédiction des valeurs génétiques et l’estimation
des effets d'ambiance (race, l’époque de mise bas, durée de lactation...) d'une façon très générale et
rigoureuse.
On a adopté le modèle linéaire
ayant
Y =mixte,
Xb + Za
+ e la forme matricielle: y = Xb + Za + e
y = n x 1 étant le vecteur des observations;
b = p x 1 le vecteur des efects fixes, inconnus;
a = q x 1 le vecteur des effets génétiques, aléatoires;
X, z les matrices d´incidence des effets fixes et aléatoires, respectivement.
Forme matricielle plus simple des équations du modèle
X´Z
X´X
 bˆ  X´y
 Z´X Z´Z + α ⋅ A −1 ⋅ aˆ  =  Z´y 

   

mixte:
(1) la formation de la matrice de parentage, A, et son inversion
?
(2) l’estimation des composantes de variance, σ 2a et σ 2e , pour chaque caractère, dont
dépend le paramètre α = σ e2 / σ a2 = ( 1 − h 2 ) / h 2 , oú h est l'héritabilité du caractère
POUR SURMONTER
considéré
?
(1) on a creé un script (CAPRINUS) en langage MATLAB. Cet outil cherche
éventuelles érreurs dans la formation de la matrice de généalogie, calcule la matrice
de parentage, A , selon les règles de Henderson, faisant la décomposition
−1
−1
−1
−1
A = T ⋅ D ⋅ T′ , ce que facilite le calcul de l’inverse A = (T ) ⋅ D ⋅ T , nécessaire
pour la formation des équations du modèle mixte
(2) la méthode plus recommandée c’est le REML-Restricted Maximum Likelihood
(Searle, 1979). Cette méthode peut s'apliquer à travers le logiciel VCE et PEST
(Groeneveld, 1990, 1995)
Les résultats du logiciel PEST, en ce qui concerne les trois caractères étudiés (moyenne, effets fixes et valeurs
génétiques additives) permettent la construction d’un indice linéaire, en atribuant des poids à ces valeurs-là selon
les objectifs zootechniques et économiques particuliers.
CONCLUSIONS
1 La résolution des équations du modèle mixte exige pourtant 2 Au-delà de ces logiciels, le script CAPRINUS, écrit en langage
des logiciels de grande capacité et qui soient faciles à utiliser.
Parmi ces logiciels figurent le PEST et VCE , testés dans ce
travail pour l’estimation des composantes de variance et le
calcul de l’héritabilité. La version utilisée a une structure assez
complexe, bien que très versatile. Les auteurs souhaitent
qu'une version pour PC et Windows 95 soit prochainement
disponible, qui puisse leur servir d'appui pour une facile
divulgation de la méthodologie BLUP;
MATLAB, a permis la formation et l'inversion de la matrice de
parentage. Cet outil pourra être utile, même s’il est employé
indépendamment, pour l'établissement de généalogies et le calcul
des coefficients de consanguinité.