TP1 : Etablir des liens de parenté entre les espèces. Partie 1

TP1 : Etablir des liens de parenté entre les espèces.
Partie 1 : Utilisation des caractères homologues macroscopiques et embryologiques.
Vous allez utiliser le logiciel "PHYLOGENE" pour construire un arbre phylogénétique illustrant
les liens de parenté entre :
Sardine, dauphin, Grenouille, Chat
Grâce à l’étude de caractères homologues:
pièce(s) basale(s), organe respiratoire, amnios
Pour ce faire, vous vous conformerez au protocole d'utilisation du logiciel suivant:
1 - Ouvrez, dans le menu "fichier" le "fichier images Vertébrés".
2 - Sélectionnez le menu "Construire" afin de réaliser une matrice taxons / caractères: choisissez les
taxons et les caractères homologues -> la matrice est vierge.
3 - Cliquez sur chaque case vierge et choisissez, en fonction des données qui apparaissent, le bon caractère.
4 - Quand toute la matrice est remplie, vérifiez votre travail (toujours vérifier pour continuer et faire
apparaître les menus-tâches "Classer" et "Arbre").
5 - Sélectionnez le menu "Arbre": un arbre phylogénétique (cladogramme) apparaît.
Vous allez maintenant prendre en compte chacun des caractères: l'ordre de prise en compte des
caractères n'est pas important; ce qui est important est de ne pas remettre en cause ce qui a
déjà été fait lorsque l'on considère un nouveau caractère.
6 - A chaque fois que vous cliquez, dans la matrice, sur le caractère considéré, un code couleur apparaît:
en jaune, état dérivé du caractère - en bleu, état primitif du caractère.
N.B. Le nombre de sauts évolutifs en fonction de la figure construite et de la matrice utilisée apparaît
dans un "tableau d'affichage des longueurs".
Vous pouvez accéder au "fichier de codage" des caractères en cliquant avec le bouton droit de la souris
sur la plage verte de la fenêtre ouverte.
Pour terminer votre étude, vous allez déplacer les branches de l'arbre afin de tenir compte de
l'ordre d'apparition des caractères:
7 - Pointez sur la branche à déplacer avec le bouton gauche de la souris et déplacez-la où vous le
souhaitez. Lorsque le branchement est possible, un symbole apparaît: doigt pointé vers le haut pour un
branchement simple, symbole de multibifurcation pour un branchement multiple).
Annexe guide d’utilisation PHYLOGENE.
 Reproduisez votre travail sur votre feuille : matrice puis arbre après vérification du
professeur. Identifiez les différentes innovations sur chacune des branches de l'arbre et
schématisez la flèche du temps.