L`actualité R4ciam L`actualitéR ciam

AVRIL 2015, N O 4
L’actualité R4ciam
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Pour fêter le printemps, nous vous proposons une promenade du
côté de FUN, plate-forme qui met en ligne des MOOC (Massive
Open Online Courses).
Pourquoi ne pas profiter des nouvelles possibilités qu’offre le numérique pour élargir ses compétences ?
Actuellement, plusieurs des MOOC affichés vous proposent une introduction à R ou bien s’appuient sur R pour présenter des concepts
statistiques.
• Introduction à la statistique avec R : du 30 mars au 8 mai 2015 :
L’objectif de ce cours est de savoir analyser des données, de comprendre ce que l’on fait et de pouvoir communiquer ses résultats.
Les méthodes abordées sont : les techniques descriptives, les tests,
l’analyse de variance, les modèles de régression linéaire et logistique,
les données censurées (de survie). À noter, le cours inclut des vidéos
de pratique sous RStudio.
• Fondamentaux en statistiques : du 26 mars au 30 avril 2015 : Ce cours est une introduction aux concepts de base
en statistique. Il met l’accent sur l’application pratique . . . et repose sur l’utilisation du logiciel libre et gratuit R, dont
l’installation et la manipulation seront expliquées pas à pas en semaine 0.
• Analyse des données multidimensionnelles : du 2 mars au 30 mars : L’objectif est de comprendre et appliquer les
quatre méthodes fondamentales de l’analyse des données : analyse en composantes principales (ACP), analyse factorielle
des correspondances (AFC), analyse des correspondances multiples (ACM) et classification ascendante hiérarchique
(CAH).
Agenda : annonces
• Une nouvelle version de R est sortie le 9 mars 2015. Il s’agit
de la version 3.1.3 ((2015-03-09) ) appelée Smooth Sidewalk.
• La dernière version de RStudio est sortie le 7 mars 2015. Il
s’agit de la version 0.98.1103 (www.rstudio.com).
R4ciam : nouvelles fiches
• Savez-vous créer un wordle, à la mode de chez nous ?
R4ciam : nouveaux tutoriels
• Outliers ou données extrêmes, comment les détecter ? que
faire de ces observations ?
• Utilisation de l’interface R Commander
Agenda : séminaires, conférences
• Conférence sur les données manquantes à Rennes les 18 et
19 juin 2015. Plus d’information sur le site missDATA 2015.
Agenda : ouvrages, publications
• Le dernier numéro du R Journal est sorti en décembre 2014
(journal.r-project.org/archive/2014-2/).
• Le dernier numéro de Journal of Statistical Software est un
numéro spécial sur l’analyse spatiale (www.jstatsoft.org/v63).
• Modélisation Prédictive et Apprentissage Statistique avec R,
Stéphane T UFFERY, Technip
• Initiation au logiciel R : premiers pas en analyse de données : survol théorique et applications avec Rcmdr et FactoMineR, Jean-Pierre A SSELIN DE B EAUVILLE, Sacha VARIN, AcademiaL’harmattan
Focus : une task view
Les Task views sont des compilations disponibles sur le site du
CRAN, regroupant par grands thèmes/disciplines, les packages
R jugés les plus pertinents pour le thème ou la discipline (voir la
fiche Les Task views et le package ctv)
La task view « Bayesian » maintenue par Jong Hee Park, recense les packages R autour des analyses bayésiennes. Elle présente plus de 110 packages.
Focus : un site
install.packages("ctv")
library("ctv")
Un site sur lequel on peut déposer des « bouts de code » ou
install.views("Bayesian")
« snippets » R. il s’agit de www.jstatsoft.org, cliquer sur l’onglet
# update.views("Bayesian")
« Code Snippets » (à droite).
Focus : une fonction
R est un logiciel très actif avec des mises à jours régulières
et relativement fréquentes. Pour connaitre la version de R utilisée ainsi que les packages chargés, on peut utiliser la fonction
sessionInfo().
> sessionInfo()
R version 3.1.3 (2015-03-09)
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
Running under: OS X 10.9.5 (Mavericks)
Détente : un script amusant
Sur le blog Ripples, on peut trouver un script R permettant
la génération de figures mathématiques assez esthétiques. Ces
figures changent à chaque exécution du script.
locale:
[1] fr_FR.UTF-8/ ...
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils ...
Focus : un package
Le package installr maintenu par Tal G ALILI, propose, pour
les utilisateurs de R sous Windows, différentes fonctions permettant l’installation d’applications externes (git, GitHub, LyX,
RStudio, etc.) depuis R.
Il fournit aussi la fonction updateR(). Cette fonction vérifie
l’existence d’une nouvelle version de R et lorsque cette dernière
existe, se charge du téléchargement et de l’installation.
Différents arguments permettent d’affiner l’installation et par
exemple, de conserver ou non la version précédente.
Rédaction :
> paste(sample(auteurs), collapse=", ")
[1] "F. Dessaint, C. Chabanet"
;-) fortunes::fortune()
> My solution when I run into mysteries like this is to put ’browser()’ in the function just before or
after the line of interest. The magnitude and direction of my stupidity usually become clear quickly.
-- Patrick Burns (February 2006)
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