La Croissance Bactérienne Croissance Bactérienne Fission Binaire
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La Croissance Bactérienne Croissance Bactérienne Fission Binaire
2016-06-28 La Croissance Bactérienne 1 Croissance Bactérienne • Augmentation du nombre de cellules • La bactérie se reproduit par fission binaire – (12, 24….2n) • Les mesures de la croissance représentent des suivis des changements dans le nombre total de cellules ou de la masse des cellules 2 Fission Binaire • Reproduction asexuée – Réplication d’ADN élongation cellulaire formation du septum septum complété et formation de la paroi séparation cellulaire et formation de cellules filles • La quantité de toutes les molécules double : protéines, ADN, ARN, lipides pour les membranes, matériaux de la paroi, etc. • Tout est distribué de façon quasi égale 3 1 2016-06-28 ADN Réplication ADN Élongation cellulaire Une génération Formation du septum Formation du septum complété et synthèse de la paroi Séparation des cellules 4 Croissance en Culture Discontinue (Batch) • Système FERMÉ – Aucun ajout de nouveaux nutriments – Pas d’élimination des déchets – Les cellules ne sont pas retirées • Ex. Production de yogourt, fermentation de la bière, infection sanguine • La densité cellulaire augmente jusqu’à ce que quelque chose devienne limitant 5 Profil de Croissance en Culture Discontinue Exponentielle Stationnaire Mortalité Log10 du nombre de cellules Latence Inoculation (Temps = 0) Temps 6 2 2016-06-28 Phase de Latence ou d’Adaptation • Aucune augmentation dans le nombre ou la masse de cellules • Synthèses de composantes requises pour la croissance dans un milieu donné – Adaptation métabolique 7 Phase Exponentielle ou Logarithmique • Développement et division cellulaire à vitesse maximale • Le nombre et la masse cellulaire doublent à des intervalles réguliers • Population en équilibre physiologique et biochimique • Nombre et la masse de cellules augmente par un facteur exponentiel (2n) – n = nombre de division ou de générations 8 Division Exponentielle 1er doublement 2e doublement 3e doublement 4e doublement Nb final de cellules (N) = nombre initial de cellules (N0) X (2n) n = nombre de générations 9 3 2016-06-28 Division Exponentielle Temps Nombre de (h) générations (n) Nombre de cellules (N) Temps (h) Nombre de générations (n) Nombre de cellules (N) 0 0 1 (20) 4.5 9 512 (29) 0.5 1 2 (21) 5 10 1024 (210) 1 2 4 (22) 5.5 11 2048 (211) 1.5 3 8 (23) 6 12 4096 (212) 2 4 16 (24) 6.5 13 8192 (213) 2.5 5 32 (25) 7 14 16384 (214) 32768 (215) 3 6 64 (26) 7.5 15 3.5 7 128 (27) 8 16 65536 (216) 4 8 256 (28) 8.5 17 131072 (217) 10 Paramètres de la Phase Log • Temps de génération: g – Temps requis pour que le nombre de cellules double • g = Δt/n • Nombre de division : n – Nombre de fois le nombre de cellules double • N = No (2n) • Taux de croissance: µ – Taux auquel le nombre de cellules change en fonction du temps • µ = ln2/g 11 Calcul • Après 4 h de croissance une culture d’E.coli passe de 100 cellules à 6.6 X 106 cellules – Quel était n pour la période de 4h? – Quel est le temps de génération? – Quel est le taux de croissance 12 4 2016-06-28 Calcul • E. coli a un temps de génération de 20 minutes. Si vous commencez avec 1 cellule d’E. coli combien en aurez-vous après 2 heures? • Après 5 heures? 13 Paramètres de Croissance à partir d’un Graphique Tracé Arithmétique Tracé Logarithmique 140000 1000000 100000 Nombre de cellules Nombre de cellules 120000 100000 80000 60000 40000 10000 1000 100 10 20000 0 1 0 2 4 6 Temps (h) 8 10 0 2 4 6 8 10 Temps (h) 14 Paramètres de Croissance à partir d’un Graphique Tous les paramètres de croissance doivent être déterminés à partir de la phase logarithmique! Dans ce cas-ci, entre 40-190 min. 15 5 2016-06-28 Lecture d’une échelle logarithmique 1 23456 78 9 Quelle est cette valeur? 106 107 108 109 16 Le Taux de Croissance - µ • La croissance en fonction du temps: Cellules/ml Pente: 0.05 Population double en 6h Cellules/ml Pente: 0.15 Population double en 2h – Plus le temps de génération est court, plus la croissance est rapide – Plus la croissance est rapide, plus la pente est abrupte – g=6 heures; pente 0.05 – g=2 heures; pente 0.15 Temps (h) 17 Déterminer le Temps de Génération Méthode 1: • Choisir deux points qui représentent un doublement du nombre de cellules • Ex. 10 et 20 • Déterminer l’écart de temps g Méthode 2: • Choisir n’importe quel deuxpoints et déterminer les coordonnés. (Nombre de cellule et temps) • Calculer n pour l’écart de temps • Calculer g: Δt/n 18 6 2016-06-28 Phase Stationnaire • Arrêt de la croissance cellulaire • Population n’est plus en équilibre • Arrêt en raison d’un manque de nutriments, d’oxygène ou à une accumulation excessive de déchets, etc. • Représente le rendement de croissance maximal sous les conditions données – Yg : Masse de microorganismes formés/Masse (g) de substrat consommé – Ym: Masse de microorganismes formés/mole de substrat consommé 19 Phase de Mortalité • Perte de viabilité exponentielle en raison d’un manque de nutriments ou d’une exposition prolongée à des déchets • Pas nécessairement une perte de masse 20 Biofilms 7 2016-06-28 C’est quoi les Biofilms? • En nature plus de 90% des toutes les bactéries vivent dans des biofilms • Les biofilms sont des collections de microorganismes qui se forment sur des surfaces solides • Ex. La plaque dentaire et plaque et la pellicule visqueuse qui se forme sur les surfaces dans les zones aquatiques Problèmes Causés par les Biofilms • Ont tendance à boucher les tuyaux et les filtres à eau • Peut causer de nombreuses maladies, y compris de nombreuses maladies communes dans les hôpitaux • Très résistants aux antibiotiques • Peut se former presque partout où il y a de l'eau, y compris des cathéters, des comptoirs de cuisine, etc. Formation des Biofilms • Se forme dans des endroits qui ont accès à l'eau • Se fixe aux surfaces solides par plusieurs moyens: • Fimbriae • Parois cellulaires hydrophobes • Polymères collants 8 2016-06-28 Altruisme Parmi les Microorganismes • Les biofilms sont comme de petites villes • Avoir beaucoup de voisins très proches qui restent ensemble pendant de longues périodes de temps • Les biofilms encouragent l'altruisme • Les bactéries sacrifient leur taux de croissance maximum afin d’utiliser les ressources communautaires plus efficacement • Bien que les individus sont désavantagés, la communauté dans son ensemble bénéficie Fermentation par la Levure Fermentation en Société • Le procédé de la fermentation est essentiel pour… – Production de carburant d'éthanol – Fabrication du pain (la levure fait lever le pain) – Boissons alcoolisées 9 2016-06-28 Pourquoi la Fermentation? • Fermentation: Métabolisme énergétique cellulaire fait en absence d’oxygène (anaérobie) • Les levures sont souvent utilisées comme fermenteurs • Elles consomment des sucres pour la libération d'énergie et des sous-produits tels que l'éthanol et du dioxyde de carbone • La fermentation industrielle est le procédé par lequel l'éthanol est créé à partir de matières végétales renouvelables Composantes de la Fermentation • La fermentation comporte ... – Substrats - habituellement un sucre – Produit - la substance créée (éthanol) • La fermentation nécessite un organisme qui peut utiliser des substrats en absence d'oxygène – La levure (Saccharomyces) est souvent l'organisme de choix Convertir le Glucose en Éthanol • Glycolyse: – – – – Plus commun des sentiers glycolytiques Oxydation partielle du glucose au pyruvate Production nette de 2 ATP 2 NAD sont réduits au NADH Chacune de ces étapes procède deux fois pour chaque molécule de glucose 30 10 2016-06-28 Fermentation - Éthanolique • Capteur d’électron organique - Acétaldéhyde • Régénération de NAD + 31 11