microbiologie et physico-chimie des biofilms - Accueil
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Ecole Thématique – CNRS MICROBIOLOGIE ET PHYSICO-CHIMIE DES BIOFILMS Une école financée et pilotée par la délégation Centre-Est du CNRS. Avec le soutien de Nancy-Université (Université Henri Poincaré et Institut Polytechnique de Lorraine) Sous le parrainage de la SFM 4 jours en résidentiel du lundi 19 octobre (soir) au vendredi 23 Octobre (matin) 2009 Droits d'inscription de 500 à 750 € HT selon statuts (inscription non payante pour les personnels CNRS) site web : http://lcpe.cnrs-nancy.fr CLUB MED VITTEL LE PARC (VITTEL, 88) Comité d'organisation : Frédéric Jorand & Fabien Gaboriaud Comité scientifique : Jérôme Duval, Grégory Francius, Fabien Gaboriaud, Frédéric Jorand, Bruno Lartiges, Christophe Merlin. Renseignements : Frédéric JORAND LCPME UMR 7564 405, rue de Vandœuvre 54600 VILLERS-LES-NANCY Tél : 03 83 68 52 20 / Télécopie : 03 83 27 54 44 [email protected] Inscriptions : Caroline FRANÇOIS & Sylvie DANIN Bureau formation permanente - Délégation Centre-Est 17 rue Notre-Dame des Pauvres, B.P. 10075 54519 VANDOEUVRE-LES-NANCY Tél. : 03 83 85 60 41 / Télécopie : 03 83 17 46 21 [email protected] Modules du programme Module I. Notions de base en microbiologie et en physicochimie Structure et fonctions de la cellule bactérienne, les enveloppes bactériennes, bases de génétique bactérienne Physico-chimie des surfaces et des interfaces Module II. Bioadhésion Conditionnement des surfaces : interactions protéines – surfaces Physico-chimie des interphases biologiques Méthodes biophysiques d’étude de l’adhésion bactérienne Nanomicrobiologie Module III. Travaux dirigés / Tables rondes : aspects méthodologiques Les propriétés de surface des cellules microbiennes Suivi et conception de biofilms au laboratoire Module IV. Régulations et activités microbiennes dans les biofilms Perception des surfaces et expression de gènes spécifiques à la croissance en biofilm Les transferts génétiques au sein des biofilms Virus et biofilms Module V. Les biofilms du milieu naturel et anthropisé Les biofilms de rivière Analyses in situ par approche moléculaire Biofilms "multi-espèces" Module VI. Usage des biofilms et lutte contre les biofilms Les biofilms du milieu agro-alimentaire Installation d’un biofilm dans un réseau d’eau potable Surfaces anti-adhésives Biofilms et production d’énergie Biofilms et biodétérioration. 1 Ecole Thématique 2009 PROGRAMME Du lundi 19 (soir) au vendredi 23 (matin) octobre 2009 Effectif attendu (tous compris) : 60 personnes Jour 1 Lundi 19 Accueil en soirée sur le site 18h – 19h30 : Présentation de l’école et accueil par les organisateurs Apéritif d’accueil Vers 20h00 : dîner Jour 2 Mardi 20 Module I. Notions de base en microbiologie et en physicochimie. 8h30 – 10h15 Structure et fonctions de la cellule bactérienne - Structures, enveloppes et composition de la surface bactérienne, FJ - Bases de génétique bactérienne, CM Frédéric Jorand & Christophe Merlin (UHP - Nancy-Université) COURS 10h15 – 10h45 : Pause café (devant les posters) 10h45 – 12h30 : 12h30 : Physico-chimie des surfaces et des interfaces Paul Rouxhet (UCL - Louvain, B.) COURS Pause déjeuner Module II. Bioadhésion 14h00 – 15h00 : 15h00 - 16h00 : Physico-chimie des interphases biologiques Jérôme Duval (CNRS - Nancy) COURS Conditionnement des surfaces : interactions protéines - matériaux Paul Rouxhet (UCL - Louvain, B.) CONFERENCE 16h00 - 16h30 : Pause café & posters 16h30 – 17h15 : L’adhésion bactérienne en cytométrie en flux Nelly Henry (Institut Curie - Paris) Nanomicrobiologie Yves Dufrêne (UCL - Louvain, B.) 17h15 – 18h00 : Vers 19h00 : CONFERENCE CONFERENCE Dîner 2 Ecole Thématique 2009 Jour 3 : Mercredi 21 Module III. Travaux dirigés et pratiques sur les aspects méthodologiques 08h30 – 10h00 : Groupe A (25 personnes max) : - Propriétés de surface des cellules microbiennes (animé par Jérôme Duval & Grégory Francius, …) Groupe B (25 personnes max) : - Suivi et conception de biofilms au laboratoire (animé par Christophe Merlin & Bruno Lartiges, …) 10h00 – 10h30 : pause café 10h30 – 12h00 : Groupe B & A, mêmes séances alternées. 12h – 14h : pause déjeuner Après midi : Repos, activités de détentes en groupe 18h00 – 19h00 : Présentation flash des posters (1, 2 diapo par poster, 5 mn max discussion comprise, 10 - 12 posters). Vers 19h00 : dîner 21h00 – 22h00 : Conférence de soirée: Formation des biofilms chez E. coli: "Les dessous de la vie sur les surfaces" Une introduction au module IV. Christophe Beloin (Institut Pasteur - Paris) CONFERENCE-DEBAT Jour 4 : Jeudi Module IV : Régulations et activités microbiennes dans les biofilms 08h30 – 09h15 : 09h15 – 09h45 : 09h45– 10h15 : 10h15 – 10h45 : Module V : Perception des surfaces par la cellule bactérienne et expression de gènes spécifiques à la croissance en biofilms Corinne Dorel (INSA - Lyon) COURS Les transferts génétiques au sein des biofilms Christophe Merlin (UHP, Nancy-Université) CONFERENCE Virus et biofilms Christophe Gantzer (UHP Nancy-Université) CONFERENCE Pause café Les biofilms du milieu naturel et anthropisé 10h45 – 11h30 : Des biofilms témoins et acteurs du fonctionnement de la rivière 3 Ecole Thématique 2009 11h30 – 12h00 : 12h00 – 12h30 : 12h30 : Module VI. F. Garabetian (Université Bordeaux 1) COURS Compétition et socialisation dans des biofilms dégradants des polluants - effets de changements environnementaux Dirk Springael (UCL - Louvain, B.) CONFERENCE Exploration in situ du fonctionnement des communautés microbiennes de méthanisation par couplage SIP-NanoSIMS Théodore Bouchez (CEMAGREF - Antony) CONFERENCE Pause déjeuner Usage des biofilms et lutte contre les biofilms 14h00 – 15h00 : 15h00 – 15h30 : 15h30 – 16h00 : Les biofilms de la chaîne alimentaire : dynamiques d'installation et moyens de maîtrise Romain Briandet (INRA - Jouy) COURS Biofilms en réseaux d'eaux potables : structures, propriétés et contrôle Jean-Claude Block (UHP - Nancy-Université) CONFERENCE Développement de surfaces anti-adhésives et/ou antibactériennes Thierry Jouenne (CNRS - Rouen) CONFERENCE 16h00 – 16h30 : Pause café 16h30 – 17h00 : Biofilms électro-actifs et production d’énergie Alain Bergel (CNRS - Toulouse) CONFERENCE Développement de biofilms aux interfaces eaux - composés organiques hydrophobes Régis Grimaud (Univ. Pau & p. de l'Adour) CONFERENCE Biofilms et biodétérioration des matériaux cimentaires Françoise Feugeas (INSA Strasbourg) CONFERENCE 17h00 – 17h30 : 17h30 – 18h00 : 19h : dîner Soirée conviviale - pot de départ Jour 5 : Vendredi 23 9h00 - 10h00 : CONCLUSION –DISCUSSION Bilan des acquis sur les biofilms, orientation de la recherche sur les biofilms dans les années à venir… les enjeux et les verrous scientifiques Place des biofilms dans l'industrie, 10h00 : café - CLOTURE de l'école 4 Ecole Thématique 2009