Superdex 75 10/300 GL et Superdex 200 10/300
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Superdex 75 10/300 GL et Superdex 200 10/300
Essayer d'abord ces conditions Instructions 71-5017-96 AK Colonnes à haute performance Éluant : Tampon de phosphate à 50 mM, NaCl à 0,15 M, pH 7,0 Débit : 0,5–0,75 ml/min, température ambiante Volume de l'échantillon : 25 µl SuperdexTM 75 10/300 GL et 17-5175-01 Superdex 200 10/300 GL 17-5174-01 Sélectionner un échantillon garantissant que l'échantillon soit entièrement soluble. De plus, essayer de choisir un éluant qui simplifie les applications en aval. Par exemple, si les protéines / peptides doivent être lyophilisées, un éluant volatile est nécessaire. Comme certaines interactions dépendantes du pH à 7,0 peuvent se produire avec les protéines acides et basiques à de très faibles concentrations en sel, un tampon recommandé est du phosphate de sodium à 50 mM, du NaCl à 0,15 M, pH 7,0. Le tableau 1 présente une liste de compositions d'éluants utiles. (1) Pousser le bouchon à ressort vers le bas (2) Retirer la goupille d'arrêt 2 L'équilibrage n'est pas nécessaire entre les analyses effectuées avec le même tampon éluant. Lire la section « Optimisation » pour obtenir des informations sur la manière dont optimiser une séparation. Choix d'éluant Comment retirer le dispositif de stockage / expédition. 1 (3) Libérer le bouchon et dévisser le dispositif Tableau 1. Compositions d'éluants utiles. 3 Tampons et résistance au solvant pH Tampon / éluant Propriétés / exemples d'application 5,0acétate d'ammonium à 0,1 M cellulases. Bonne solubilité pour certaines enzymes, par ex. les Volatile. 7,2phosphate à 0,05 M + NaCl à 0,15 M Conditions physiologiques. Informations rapides Tous les tampons aqueux couramment utilisés, pH 3 à 12 7,8carbonate acide d'ammonium à 0,15 M Convient à certaines séparations d'ADN et de protéines. Volatile. Doit être utilisé frais. Urée, jusqu'à 8 M 8,0 Très bonne solubilité pour l'ADN et l'ARN. Superdex 75 10/300 GL et Superdex 200 10/300 GL sont des colonnes Tricorn™ à haute performance. Les colonnes sont des colonnes en verre préremplies pour une filtration sur gel à haute performance de protéines, peptides, fragments d'ADN (< 200 bp) et autres biomolécules. Acétonitrile, jusqu'à 30 % dans les tampons aqueux Installer un filtre en ligne avant la vanne d'injection. Les tampons et solvants à viscosité élevée ont un impact sur la contre-pression et le débit. Dégazer et filtrer toutes les solutions à travers un filtre de 0,22 µm. Usage quotidien Détergents ioniques et non ioniques Chlorhydrate de guanidine, jusqu'à 6 M La colonne est fournie avec deux connecteurs fingertight 1/16" mâles pour un branchement aux systèmes ÄKTA™ design et deux connecteurs union 1/16" mâle / M6 femelle pour un branchement à un système FPLC. Nettoyage Hydroxyde de sodium, jusqu'à 1 M Dimensions de la matrice Volume de matrice Efficacité de la colonne, N/M Taille moyenne des particules Plage de stabilité du pH utilisation régulière nettoyage Températurefonctionnement Limite d'exclusion, M r, protéines globulaires Plage de séparation optimale protéines globulaires, M r 600 000dextranes Débit (eau à température ambiante) recommandé minmaximum Pression dans la colonne maximum 10 × 300 à 310 mm Environ 24 ml >30 000 m -1 13 µm Éthanol, jusqu'à 70 % 3 à 12 1 à 14 4 °C à 40 °Cstockage 4 °C à 30 °C Superdex 75 Environ 1 × 105 dénaturation. Tris-HCl à 50 mM Acétonitrile à 30 % dans un tampon approprié (1) Connecter une seringue ou une pompe au dispositif de stockage / expédition et remplir d'éthanol à 20 % au-dessus de la marque sur le tube. Retirer la seringue ou la connexion à la pompe. Acétonitrile, jusqu'à 30 % Composite d'agarose réticulé et de dextrane Méthanol, jusqu'à 100 % Acide acétique, jusqu'à 1 M Acide chlorhydrique, jusqu'à 0,1 M Pour la séparation de composés très hydrophobes. Volatile. Urée jusqu'à 8 M (pH < 7)Bonne solubilité pour de nombreux composants. L'activité biologique peut être maintenue à des contenus uréiques inférieurs. Risque certain de carbamylation des protéines. (2) Faire sortir les bulles d'air et pousser le piston jusqu'à la marque sur le dispositif. Isopropanol, jusqu'à 30 % Bonne solubilité pour certains composés. Additifs aux tampons Comment remplir le dispositif de stockage / expédition. Acide formique, jusqu'à 70 % Matrice Bonne transparence UV. Convient lorsqu'il est nécessaire de purifier des protéines dans des conditions de 11,5 NaOH à 0,05 M Acide trifluoriacétique, jusqu'à 10 % Données sur la colonne Tris/HCl à 0,1 M, EDTA à 1 mM 8,6chlorhydrate de guanidine à 6 M dans Chlorhydrate de guanidine à 6 M Détermination du poids moléculaire de sous-unités. SDS à 0,1 %, Tween ou équivalentBonne solubilité pour certaines protéines, par ex. les protéines protéines. Bien s'assurer que vous équilibrez complètement avec la solution de détergent. Éviter : Superdex 200 Environ 1,3 × 106 3 000–70 000 500–30 000 10 000– 1 000–100 000 0,5à 1,0 ml/min 1,5 ml/min 1,8 MPa, 18 bars, 261 psi 0,25–0,75 ml/ 1 ml/min 1,5 MPa, 15 bars, 18 psi Première utilisation Agents oxydants q Solutions non filtrées Poids moléculaire, M i 3 000 à 70 000 (Superdex 75) 10 000 à 600 000 (Superdex 200) Concentration en protéines ≤ 10 mg dans l'échantillon Volume de l'échantillon 25 à 500 µl Informations approfondies Livraison / stockage Fig 1. Illustration du verrouillage de l'adaptateur. La bague de verrouillage (noire) doit être en position basse pour empêcher un réglage incontrôlé de la hauteur de matrice de la colonne. La colonne est livrée avec un dispositif de stockage / expédition qui maintient la pression dans la colonne et l'empêche ainsi de sécher. La colonne est équilibrée avec de l'éthanol à 20 % dégazé. S'assurer qu'il n'y a pas d'air dans la tubulure et les vannes avant de brancher la colonne à un système de chromatographie. Retirer le dispositif de stockage / expédition et la fiche d'arrêt de la colonne. Vérifier que l'adaptateur supérieur est verrouillé (bague de verrouillage enfoncée, voir la figure 1). S'assurer que l'entrée de la colonne est remplie de liquide et la brancher en goutte-à-goutte au système. Équilibrer la colonne pour la première utilisation ou après un long stockage comme suit : Si la colonne doit être stockée pendant plus de 2 jours après utilisation, laver la colonne avec 2 volumes de colonne d'eau distillée puis équilibrer avec au moins 2 volumes de colonne d'éthanol à 20 %. Nous vous recommandons de brancher le dispositif de stockage / expédition selon la section « Comment brancher le dispositif de stockage / expédition » pour le stockage à long terme. Remarque : S'assurer que la contre-pression de la colonne ne dépasse pas la pression maximale recommandée (1,8 MPa pour Superdex 75 et 1,5 MPa pour Superdex 200). Ceci est particulièrement important lorsque vous travaillez dans des températures basses, par exemple dans une pièce froide. q Comment brancher le dispositif de stockage / expédition. Recommandations relatives aux échantillons PréparationDissoudre l'échantillon dans l'éluant, filtrer à travers un filtre de 0,22 µm ou centrifuger à 10 000 g pendant 10 min. a) Au moins 50 ml de H2O distillée à un débit de 0,5 ml/min. b) 50 ml d'éluant à un débit de 0,5 ml/min. q Le tube en verre est revêtu d'un film plastique de protection. De petites quantités d'air peuvent occasionnellement être piégées entre le verre et le film pendant la fabrication. La surface inégale qui en résulte n'a pas de conséquence sur la performance ou la durabilité de la colonne. 2 3 1 (1) Remplir l'entrée de la colonne et le connecteur luer avec de l'éthanol à 20 % et brancher le dispositif de stockage / expédition rempli en goutte-à-goutte au haut de la colonne. (2,3) Placer le bouchon à ressort et le fixer avec la goupille d'arrêt. Optimisation q Effectuer une première analyse comme indiqué dans la section « Essayer d'abord ces conditions ». Si les résultats obtenus ne sont pas satisfaisants, envisager les procédures suivantes : Action Effet Réduire le débit moléculaire Améliore la résolution pour les composants à poids élevé. La résolution de petits composants peut être réduite. Réduire le Améliore la résolution.volume de l'échantillon Changer la concentration Change la sélectivité.de solvant organique Brancher deux colonnes Augmente la résolution en raison d'une hauteur de matrice accrue. Maintenir en sériela contre-pression totale inférieure à 3 MPa pour Superdex 75 10/300 GL et 2,5 MPa pour Superdex 200 10/300 GL Pour plus d'informations, consulter le manuel «Gel filtration, Principles & Methods » (Filtration sur gel, principes et méthodes) qui peut être commandé auprès de GE Healthcare, ou le « Method Handbook » (Manuel des méthodes) fourni avec chaque système ÄKTAdesign. Nettoyage en place (NEP) Contrôle de performance de la colonne Colonne Superdex 200 10/300 GL Vérifier la performance de la colonne selon la procédure suivante : Échantillon : 1. Thyroglobuline (M r 669 000) 5 mg/ml Informations de commande Effectuer le cycle de nettoyage régulier suivant tous les 10 à 20 cycles de séparation. 2. Ferritine (M r 440 000) 0,4 mg/ml Désignation 3. BSA (M r 67 000) 8 mg/ml 4. ß-lactoglobuline (M r 35 000) 2,5 mg/ml 5. Ribonucléase A (M r 13 700) 5 mg/ml Échantillon : 100 µl d'acétone à 0,5 % (5 mg/ml) Nettoyage régulier : Éluant : solution tampon ou de H2O distillée 1. Laver la colonne avec 25 ml d'hydroxyde de sodium à 0,5 M alternativement avec de l'acide acétique à 0,5 M à un débit de 0,5 ml/min. Débit : 0,75 ml/min, température ambiante 2. Rincer immédiatement la colonne avec 25 ml d'eau distillée puis au moins 50 ml de tampon éluant à un débit de 0,5 ml/min. 6. Cytochrome C (M r 13 600) 1,5 mg/ml L'efficacité de la colonne, exprimée comme le nombre de plateaux théoriques par mètre, N/m, est calculée grâce à l'équation suivante : 7. Aprotinine (M r 6 512) 2 mg/ml 8. Vitamine B12 (M r 1 355) 0,1 mg/ml Avant l'analyse suivante, équilibrer la colonne jusqu'à ce que la base UV et le pH soient stables. N/m Détection : 280 nm Nettoyage plus strict : 1. Changer le filtre en haut de la colonne. (Puisque les contaminants arrivent avec le flux liquide, la plupart d'entre eux sont capturés par le filtre.) Les instructions de changement du filtre sont fournies avec le Kit du filtre. Effectuer un nettoyage régulier comme décrit ci-dessus. Selon la nature des contaminants, une des solutions de nettoyage de la page précédente peut être utilisée. Toujours rincer avec au moins 2 volumes de colonne d'eau distillée après avoir utilisé une des solutions de nettoyage. Volume de l'échantillon : 500 µl N/m = nombre de plateaux théoriques par mètre Éluant : Tampon de phosphate) 0,05 M, NaCl à 0,15 M, pH 7,0 VR = volume élué à partir du début de l'application de l'échantillon au maximum du pic Débit : 0,4 ml/min, température ambiante Wh = largeur de pic mesurée comme la largeur du pic enregistrée à mi-hauteur du pic Détection : 280 nm L = hauteur de la matrice (m) Échantillon : 1. BSA (M r 67 000) 8 mg/ml 2. Ovalbumine (M r 43 000) 2,5 mg/ml 3. Ribonucléase A (M r 13 700) 5 mg/ml 4. Aprotinine (M r 6 512) 2 mg/ml Si nécessaire, suspendre à nouveau 2–3 mm en haut de la matrice de gel et la retirer avec une pipette Pasteur. Régler l'adaptateur pour éliminer l'espace au-dessus du gel. 5. Vitamine B12 (M r 1 355) 0,1 mg/ml Volume de l'échantillon : 500 µl Éluant : Tampon de phosphate) 0,05 M, NaCl à 0,15 M, pH 7,0 Débit : 0,4 ml/min, température ambiante Détection : 280 nm Dépannage SymptômeSolution Contre-pression accrue pièces de l'équipement Confirmer que la colonne est la cause (voir ci-dessous). Si c'est le cas, la nettoyerdans la colonne et/ou en suivant la procédure décrite dans la section « Nettoyage plusperte de résolution strict ». A280 nm (mAU) Pour confirmer que la contre-pression élevée du système est la une par une (en commençant par le collecteur de fractions) pendant que les pompes fonctionnent. Vérifier le relevé de pression après avoir débranché chaque pièce afin de déterminer la source de la contre-pression. 25.0 Air piégé dans la colonneAnalyser 80–100 ml de tampon éluant bien dégazé à un débit de 0,5 ml/min. Noter que de petites quantités d'air ne doivent normalement pas avoir de conséquences sur la performance de la colonne. 2 1 60 8 7 40 4 3 5 6 N° de code 1 17-5176-01 Kit d'étalonnage pour filtration sur 1 gel à faible poids moléculaire 28-4038-41 Kit d'étalonnage pour filtration sur 1 gel à poids moléculaire élevé 28-4038-42 Nombre par paquet N° de code Kit de filtre Tricorn 10 * 1 29-0536-12 Filtre 1 18-1153-20 Connecteur Fingertight, 1/16" mâle 10 18-1112-55 Connecteur Union M6 femelle / 1/16" mâle 8 18-1112-58 Filtre en ligne (1/16") 1 18-1118-01 Connecteur 1/16" mâle vers luer femelle 2 18-1112-51 Dispositif de stockage / expédition 1 18-1176-43 Manuel : Size exclusion chromatography Principles & Methods 1 (Chromatographie d'exclusion de taille) 18-1022-18 * Ranger à l'abri de la lumière du soleil. 5 0 20.0 q q 15.0 2 5.0 10.0 15.0 20.0 25.0 30.0 ml Fig 3. Chromatogramme typique d'un test de fonctionnement de Superdex 200 10/300 GL. 4 3 0.0 Remarque : Les pics 5 et 6 ne sont séparés l'un de l'autre que par une différence de forme. 1 5.0 0.0 0.0 5.0 10.0 15.0 20.0 25.0 ml Fig 2. Chromatogramme typique d'un test de fonctionnement de Superdex 75 10/300 GL. GE Healthcare Bio-Sciences AB Björkgatan 30 751 84 Uppsala Suède Nombre par paquet Désignation 20 10.0 Pour les coordonnées des bureaux locaux, visiter le site www.gelifesciences.com/contact 17-5175-01 Accessoires 80 Si la performance de la colonne n'est toujours pas restaurée, injecter une solution de 1 mg/ml de pepsine dans de l'acide acétique à 0,1 M contenant du NaCl à 0,5 M et laisser reposer pendant la nuit à température ambiante ou une heure à 37 °C. Après le traitement enzymatique, nettoyer la colonne en suivant la procédure décrite dans la section « Nettoyage régulier ». 1 Superdex Peptide 10/300 GL A280 nm (mAU) Colonnes Superdex 75 10/300 GL 17-5174-01 Superdex 200 10/300 GL Désignation 5,54 × (VR/Wh)2 / L Comme alternative au test d'efficacité ci-dessus, vérifier la performance de la colonne en effectuant le test de fonctionnement décrit dans la figure 2 et 3. N° de code 1 Produits connexes = où, Nombre par paquet Superdex 75 10/300 GL GE Healthcare Europe GmbH Munzinger Strasse 5, D-79111 Freiburg, Allemagne GE et le monogramme GE sont des marques de commerce de General Electric Company. GE Healthcare UK Ltd Amersham Place, Little Chalfont, Buckinghamshire, HP7 9NA, R-U © 2002-2014 General Electric Company – Tous droits réservés. Première publication : mars 2002 GE Healthcare Bio-Sciences Corp 800 Centennial Avenue, P.O. 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