Master 2ème année Nutrition et Sciences des Aliments

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Scolarité UFR Médecine
28 place Henri Dunant BP 38
63001 Clermont-Ferrand cedex 1
Tél. : 04 73 17 79 00
Fax : 04 73 17 79 13
Courriel : [email protected]
Master 2ème année
Nutrition et Sciences des Aliments
Cohabilité avec l’Université Blaise Pascal
Spécialité : Nutrition humaine et Santé
Ce dossier doit être retourné ou déposé à l’adresse ci-dessous, avec toutes les
pièces demandées au plus tard le 14 juin 2011*
Unité de Nutrition Humaine UMR 1019 – A l’attention d’Irène FARIA
58, rue Montalembert- BP 321
63009 CLERMONT-FERRAND CEDEX 1
*ETUDIANTS ETRANGERS HORS CEE : ces dossiers de candidature ne concernent que les étudiants effectuant
actuellement leurs études en France. Les étudiants étrangers hors CEE effectuant leurs études dans leur pays
d'origine ou dans un autre pays étranger, doivent IMPERATIVEMENT et OBLIGATOIREMENT suivre la procédure
précisée sur le site de Campus France : http://www.campusfrance.org
Régime d’inscription :
q Formation Initiale
q Formation Continue
Fiche de renseignements : (écrire lisiblement)
NOM :…………………………………………… Nom Marital :……………………………………………….
Prénoms :……………………………………………………………………………………………………………….
Adresse actuelle :……………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………………………………
Code Postal :………………………
Ville :……………………………………………………………
Pays :……………………………………………………………………………………………………………………..
Téléphone : ………/ ………/ ………/ …….../………
Courriel (obligatoire) :……………………………………………@..............................................................
Sexe : q Masculin
q Féminin
Date de naissance (jj/mm/aaaa) : ………../ ………../ ………………………
Lieu de naissance :…………………………………………………………………………………………………
Département de naissance :………..
Nationalité : q Française
q Etrangère, précisez :…………………………………….
Situation de famille :
q Célibataire
q Marié(e)
qAutre :
*
1
1
Cursus universitaires antérieurs :
Type de
diplômes
Licence ou
équivalent
Licence
professionnelle
Master
professionnel
Spécialité
Etablissement
Année
Moyenne
d’obtention obtenue
Master recherche
Diplôme étranger
Autre(s)
Stages :
Fonctions
Période
Entreprise/Laboratoire
Pièces à fournir :
Une photocopie des diplômes ou des relevés de notes des 2 dernières années ;
Une lettre de motivation présentant les raisons de votre candidature (une page maximum) ;
Un curriculum vitae détaillé ;
Une enveloppe timbrée à votre adresse.
La fiche de stage, ci-dessous, dûment complétée
Cadre réservé au jury d’admission
Avis :
q Favorable
q Défavorable
Motif :
Date et signature du Responsable
2
3
MASTER 2 « SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE »
MENTION « NUTRITION ET SCIENCES DES ALIMENTS » (NSA)
Porteur : Université d’Auvergne
Partenaires : Université Blaise Pascal, VetAgro Sup, ENV Lyon, ISARA Lyon
3 spécialités au choix :
Nutrition Humaine et Santé (Co-Responsable : Dr. Didier ATTAIX)
Sciences des Aliments (Co-Responsable : Pr. André LEBERT)
Nutrition Animale et Élevage (Co-Responsable : Dr. Fabienne BLANC)
__________________________________________________________________________________________
FICHE DE VOEUX
Année 2011-2012
Nom : ........................................... Prénom : .........................................
Spécialité souhaitée : ………………………………………………….
Il est impératif de contacter les responsables de stage avant de remplir votre fiche de vœux.
Mon choix préférentiel de stage pour l’année 2011-2012 est :
Choix
Intitulé du stage
Nom du responsable
N° 1
N° 2
N° 3
N° 4
Fiche à retourner impérativement avec le dossier de candidature à l’adresse ci-dessous :
Irène Faria - Secrétariat Master M2 Nutrition et Sciences des Aliments
Unité de Nutrition Humaine – UMR 1019 – 58, rue Montalembert – BP 321
63009 CLERMONT-FERRAND CEDEX 1 - Tél. : 04.73.60.82.83 - Fax : 04 73 60 82 55
E-mail : [email protected]
MASTER 2 « SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE »
MENTION « NUTRITION ET SCIENCES DES ALIMENTS » (NSA)
Porteur : Université d’Auvergne
Partenaires : Université Blaise Pascal, VETAGRO SUP, ENV Lyon, ISARA Lyon
3 spécialités au choix :
Nutrition Humaine et Santé (Co-Responsable : Dr. Didier ATTAIX)
Sciences des Aliments (Co-Responsable : Pr. André LEBERT)
Nutrition Animale et Élevage (Co-Responsable : Dr. Fabienne BLANC)
LISTE DES PROPOSITIONS DE STAGES ANNEE 2011/2012
SPECIALITE NUTRITION HUMAINE ET SANTE
No
du
Intitulé du stage
stage
1 Effet de l’exercice excentrique en
mode dynamique sur l’amélioration
de la masse et des capacités
oxydatives musculaire (étude
expérimentale chez le rat).
2
Nom du responsable du stage
Ruddy RICHARD
Tél. : 04 73 75 16 60
Jean-Michel CHARDIGNY
04 73 75 16 65
(Unité de Nutrition Humaine
[email protected]
UMR 1019)
Etude de réseaux métaboliques Aicha DEMIDEM
impliqués dans la transformation de Tél. : 04 73 62 47 51
la cellule hépatique et impact des
acides gras sur la prolifération.
[email protected]
3
Nutrition et vieillissement : lutte
contre l’anorexie et l’inflammation.
Isabelle PAPET
Tél. : 04 73 62 42 01
[email protected]
4
Régulation de gènes impliqués dans
la bioénergétique de la
dédifférenciation de la cellule
hépatique ; effet des acides gras
polyinsaturés.
Pascale RIO
Tél. : 04 73 62 42 15
[email protected]
Rôle de la vitamine D dans la
résistance anabolique musculaire
chez le rat âgé.
Stéphane WALRAND
Yves BOIRIE
Tél. : 04 73 60 82 76
[email protected]
Activité anti-inflammatoire de
micronutriments de nature
polyphénolique : étude
expérimentale dans un modèle
d’inflammation colique.
Impact du microenvironnement
adipocytaire tumoral sur les
processus d’angiogenese.
Catherine FELGINES
Tél. : 04 73 17 80 31
[email protected]
5
6
7
Directeur du laboratoire
Florence CALDEFIE-CHEZET
Tél. : 04 73 17 79 71
[email protected]
Laetitia DELORT
Tél. : 04 73 17 79 70
[email protected]
UMR 1019)
UMR 1019)
UMR1019)
UMR 1019)
Marie-Paule VASSON
(EA 4233)
Marie-Paule VASSON
(EA 4233)
8
9
10
11
12
13
Rachida NACHAT-KAPPES
Samar BASU
Tél. : 04 73 17 80 44
[email protected]
Bertrand EVRARD
Interactions cellules dendritiques
humaines - bactéries probiotiques et Arlette TRIDON
Tél. : 04 73 17 79 73
polarisation de la réponse
[email protected]
lymphocytaire T.
Analyse de marqueurs de stress
oxydant et de leur implication lors
de la tumorigénèse mammaire liée à
l’obésité.
Impact d’une supplémentation en
vitamine D sur les cellules
immunocompétentes.
Nicolas GONCALVES-MENDES
Tél. : 04 73 17 80 49
Modifications épigénétiques par les
phyto-oestrogènes du soja dans des
cellules mammaires humaines
Dominique BERNARD-GALON
Tél. : 04 73 17 83 58
Phyto-œstrogènes du soja et
modifications de la méthylation de
l’ADN: Etude dans trois lignées
continues de cancer de la prostate
DU-145, PC-3 et LNCaP
Rôle des interactions entre
communautés microbiennes dans la
dysbiose fonctionnelle du microbiote
intestinal des patients atteints du
syndrome de l’intestin irritable.
Laurent GUY
Tél. : 04 73 17 83 58
[email protected]
Dominique.BERNARDGALLON@cj
p.fr
[email protected]
Annick BERNALIER-DONADILLE
Tél. : 04 73 62 45 81
[email protected]
Marie-Paule VASSON
(EA 4233)
Marie-Paule VASSON
(EA 4233)
Marie-Paule VASSON
(EA 4233)
Marie-Paule VASSON
Yves-Jean BIGNON
(EA 4233)
Marie-Paule VASSON
Yves-Jean BIGNON
(EA 4233)
Régine TALON
RECAPITULATIF DETAILLE
DES STAGES M2 NSA SPECIALITE NUTRITION HUMAINE ET SANTE
STAGE N° 1
PROPOSITION DE STAGE DE MASTER M2 NUTRITION ET SCIENCES DES ALIMENTS
SPECIALITE : NUTRITION HUMAINE ET SANTE
POUR L’ANNƜE 2011-2012
Titre du stage :
Effet de l’exercice excentrique en mode dynamique sur l’amélioration de la masse et des capacités
oxydatives musculaire (étude expérimentale chez le rat).
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Laboratoire d’accueil :
Service de Médecine du Sport et des Explorations Fonctionnelles (CHU G Montpied), ClermontFerrand.
Unité de Nutrition Humaine, Equipe CHLEO, Laboratoire de Nutrition Humaine, ClermontFerrand
*Directeur du Laboratoire : Jean-Michel Chardigny
*Responsable d'équipe : Béatrice Morio
*Directeur du stage et coordonnées précises :
Docteur Ruddy RICHARD, MD, PhD
Professeur des Universités, Praticien Hospitalier
Service de Médecine du Sport et des Explorations Fonctionnelles
CHU G Montpied, 58 rue Montalembert,
63003 Clermont-Ferrand Cedex 1
[email protected]
Tel : 04.73.75.16.60 (secretariat)
Dir : 04.73.75.16.65
Fax : 04.73.75.16.61
Titre du stage proposé :
Effet de l’exercice excentrique en mode dynamique sur l’amélioration de la masse et des capacités
oxydatives musculaire (étude expérimentale chez le rat).
La contraction musculaire en mode excentrique (allongement du muscle) permet l’application d’une
contrainte mécanique élevée pour une faible sollicitation métabolique. Ce mode d’entraînement va être
particulièrement adapté aux sujets qui présentent une amyotrophie musculaire associée à une limitation
cardiaque et/ou respiratoire (obésité, BPCO, sujet âgé). Cependant les effets de ce type d’exercice sur
l’accroissement des capacités oxydatives restent à préciser (amplitude des réponses, intensité et durée des
sessions de réentraînement).
L’objectif de cette étude est d’étudier l’effet d’un programme d’entraînement chez le rat en mode
excentrique, comparé à un groupe de rat entraîné en concentrique (même niveau de dépense énergétique).
Les paramètres principaux étudiés seront la mesure des capacités oxydatives mitochondriales par la
technique des fibres perméabilisées et l’expression tissulaire des marqueurs de biogenèse mitochondriale.
Description des étapes expérimentales
1) Période d’évaluation et d’entraînement des rats, à la course sur tapis roulant, en descente (mode
excentrique) et en monté (mode concentrique)
2) Formation spécifique aux techniques de la mesure de la respiration mitochondriales sur fibres
perméabilisées (prévoir une formation extériorisée de 15 jours)
3) Mise en place des mesures et exploitation des résultats.
Références bibliographiques
1) Lastayo PC et al. Chronic eccentric exercise: improvements in muscle strength can occur with
little demand for oxygen. Am J Physiol 1999 Feb;276(2 Pt 2):R611-5.
2) Dufour SP et al. Deciphering the metabolic and mechanical contributions to the exercise-induced
circulatory response: insights from eccentric cycling. Am J Physio; 2007 Apr;292(4):R1641-8.
Travaux du Laboratoire :
(maximum 4 références)
Daussin FN, Zoll J, Dufour SP, Ponsot E, Lonsdorfer-Wolf E, Doutreleau S, Mettauer B, Piquard F, Geny
B, Richard R. Effect of interval versus continuous training on cardiorespiratory and mitochondrial
function: relationship to aerobic performance improvements in sedentary. Am J Physiol Regul Integr
Comp Physiol 2008 Jul; 295(1): R264-R272. Epub 2008 April 16.
Dufour SP, Doutreleau S, Lonsdorfer-Wolf E, Lampert E, Hirth C, Piquard F, Lonsdorfer J, Geny B,
Mettauer B, Richard R. Deciphering the metabolic and mechanical contributions to the exercise-induced
response: insights from eccentric cycling. Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol 2007 Apr; 292(4):
R1641-8. Epub 2006 Dec 7.
Dufour SP, Lampert E, Doutreleau S, Lonsdorfer-Wolf E, Billat VL, Piquard F, Richard R. Eccentric
cycle exercise: training application of specific circulatory adjustments. Med Sci Sports Exerc. 2004 Nov;
36(11): 1900-6.
Chanseaume E, Barquissau V, Salles J, Aucouturier J, Patrac V, Giraudet C, Gryson C, Duché P, Boirie
Y, Chardigny JM, Morio B. Muscle mitochondrial oxidative phosphorylation activity, but not content, is
altered with abdominal obesity in sedentary men: synergism with changes in insulin sensitivity. J Clin
Endocrinol Metab. 2010, 95:2948-56.
Techniques utilisées :
Entraînement des rats sur tapis roulant
Mesure des échanges gazeux (VO2, VCO2, VE, QR)
Mesure polarographique de la consommation d’oxygène sur fibres musculaires perméabilisées
Marquages sur coupes du tissu musculaire
Biologie moléculaire, western blotting
STAGE N° 2
Titre du stage : Etude de réseaux métaboliques impliqués dans la transformation de la cellule
hépatique et impact des acides gras sur la prolifération
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Laboratoire d’accueil : INRA UMR 1019; Unité de Nutrition Humaine
*Directeur du stage et coordonnées précises : Aicha Demidem (CR1 INSERM),
Tel : 04 73 62 47 51
[email protected]
_____________________________________________________________________________________
Etude de réseaux métaboliques impliqués dans la transformation de la cellule hépatique et impact
des acides gras sur la prolifération
Le projet a pour but d’identifier les réseaux métaboliques impliqués dans le carcinome hépatocellulaire
(CHC). Nous nous proposons d’explorer les voies du métabolisme cellulaire grâce aux outils de
métabolomique (RMN et SM). Le projet consiste à comparer les altérations des voies métaboliques dans
3 tissus obtenus à partir de résections hépatiques: foie normal, foie de cirrhose et de CHC. L’impact de
nutriments à potentiel hépatoprotecteur sera évalué à l’issue des développements ci-dessus. Les agents
nutritionnels étudiés sont les acides gras de type Ȧ-3 connus pour interférer avec la prolifération
cellulaire. Cette étape pourrait conduire à l’identification de facteurs nutritionnels d’intérêt clinique. Les
deux objectifs du projet sont: 1 - de rechercher des biomarqueurs métaboliques utiles au diagnostic du
CHC. 2- d’accroître les connaissances sur les voies métaboliques impliquées dans la cancérogenèse
hépatique et ciblées pour la prévention et le traitement du CHC.
Guenin et al (2009) Nutrition and Cancer. 61: 518-529
Morvan D et Demidem A. (2007) Cancer Res. 67: 2150-2159.
_____________________________________________________________________________________
1-Morvan D, Demidem A. Metabolomics by Proton NMR Spectroscopy of the Response to Chloroethylnitrosourea reveals Drug Efficacy and Tumor Adaptive Metabolic Pathways.
Cancer Res. 2007; 67:2150-59 (IF: 8.6)
2-Guenin S, Morvan D, Thivat E, Stepien G, Demidem A. Combined methionine stress and Chloroethylnitrosourea treatment have a time-dependent synergy effect which NMR-based metabolomics explains
by methionine metabolism reprogramming of melanoma tumors.
Nutrition and Cancer. 2009; 61: 518-29 (IF = 4.0)
3-Bayet M, Loiseau D, Rio P, Demidem A, Barthomeuf C Stepien G, Morvan D. Quantitative twodimensional HRMAS 1H-NMR spectroscopy-based metabolite profiling of human cancer cell lines and
response to chemotherapy. Magn Reson Med 2010, 63:1172-83, (IF = 3.9)
4-Behzadi M, Demidem A, Morvan D, Schwartz L, Steyaert JM. A Model of phospholipid biosynthesis in
tumor in response to an anticancer agent in vivo. J Integr Bioinform. 2010, 7:129-145.
Les outils de mesure des changements phénotypiques des hépatocytes seront la métabolomique par
Spectroscopie de Résonance Magnétique Nucléaire(RMN) et Spectrométrie de Masse (SM).
STAGE N° 3
Titre du stage : Nutrition et vieillissement : lutte contre l’anorexie et l’inflammation
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Laboratoire d’accueil : UMR 1019, Unité de Nutrition Humaine, INRA Theix
*Directeur du Laboratoire : Jean-Michel CHARDIGNY
*Directeur du stage et coordonnées précises : Isabelle PAPET
(Tél. et mail notamment) :
UNH, INRA Theix, 63122 Saint-Genès-Champanelle
Tél : 04 73 62 42 01, [email protected]
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Nutrition et vieillissement : lutte contre l’anorexie et l’inflammation
Le stage proposé s’intègre dans une prestation de recherche avec un industriel qui vise à tester des
ingrédients permettant de lutter contre l’anorexie et l’inflammation associées au vieillissement. Une étude
d’intervention nutritionnelle de 6 mois sera réalisée chez le rat âgé. Les critères principaux de l’efficacité
nutritionnelle seront la prise alimentaire et le statut inflammatoire. Les critères secondaires seront la
mortalité, la variation de poids corporel, le poids des tissus et organes, les concentrations en cystéine et
glutathion et les auto-anticorps dirigés contre les peptides régulateurs de la prise alimentaire.
L’étudiant s’investira pleinement dans les dosages de protéines de la réaction inflammatoire, de la
cystéine et de glutathion. Il exploitera l’ensemble des données de l’expérience (mortalité, poids corporel,
consommation et composés dosés) et en fera la synthèse. Il sera sensibilisé à la démarche de l’assurance
qualité et au travail en partenariat avec l’industrie.
Mayot G, Vidal K, Martin JF, Breuillé D, Blum S, Obled C, Papet I. Prognostic values of 2macroglobulin, fibrinogen and albumin in regards to mortality and frailty in old rats Experimental
Gerontology , 2007 42(6):498-505.
Kanapuru B, Ershler WB. Inflammation, coagulation, and the pathway to frailty. The American
Journal of Medicine, 2009, 122(7):605-613.
____________________________________________________________________________________
Balage M, Dupont J, Mothe-Satney I, Sornet C, Tesseraud S, Mosoni L & Dardevet D. (2011). Leucine
supplementation in rats induced a delay in muscle IR/PI3K signaling pathway associated with overall
impaired glucose tolerance. Journal of Nutritional Biochemistry, 22:219-26.
Rémond D, Buffière C, Pouyet C, Papet I, Dardevet D, Savary-Auzeloux I, Williamson G, Faure M &
Breuillé D. (2011). Cysteine fluxes across the portal-drained viscera of enterally fed minipigs: effect
of an acute intestinal inflammation. Amino acids, 40:543-52.
Mayot G, Vidal V, Combaret L, Breuillé D, Blum S, Obled C, Papet I. Presence of low-grade
inflammation in old rats does not worsen skeletal muscle loss under an endotoxemic and dietary
stress. Experimental Gerontology, 2007, 42:1167-75
Mercier S, Breuillé D, Buffière C, Gimonet J, Papet I, Patureau Mirand P, Obled C. Methionine kinetics
are altered in the elderly both in the basal state and after vaccination. American Journal of Clinical
Nutrition, 2006, 83:291-298
- Protéines de la réaction inflammatoire par turbidimétrie ou immuno-diffusion radiale
- Glutathion par méthode colorimétrique avec recyclage enzymatique ou HPLC.
Cystéine par méthode colorimétrique
STAGE N° 4
Titre du stage :
Régulation de gènes impliqués dans la bioénergétique de la dédifférenciation de la cellule
hépatique ; effet des acides gras polyinsaturés
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INRA, Unité de Nutrition Humaine, UMR 1019
Pascale Rio
Tel : 04 73 62 42 15
Email : [email protected]
UNH UMR 1019 INRA Centre de Clermont-Ferrand - Theix
63122 Saint Genès-Champanelle
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(titre + 5-10 lignes de description + 2 références (du laboratoire ou non)
Les acides gras polyinsaturés (AGPI) ont un effet protecteur vis-à-vis de certaines pathologies. Notre
étude porte sur leur action sur la dédifférenciation cellulaire de foie sain et pathologique
(hépatocarcinome). Le but est de déterminer, et à plus long terme de modéliser, l’évolution de voies
métaboliques majeures sous l’effet du traitement par les AGPI.
Le stage concernera l’étude de l’expression d’un ensemble de gènes impliqués dans les réseaux
métaboliques bioénergétiques reliés à la transformation hépatique. Ces gènes auront été proposés
précédemment par analyse métabolomique de biopsies hépatiques et de cellules hépatiques en culture,
sélectionnés par des analyses de promotologie et une modélisation mathématique par le Laboratoire
d'Informatique, de Modélisation et d'Optimisation des Systèmes) de l’ISIMA. L’expression des gènes
sera suivie dans un modèle de cellules hépatiques, les HepaRG dans leurs deux états, indifférencié et
différencié, ceci en présence de différents acides gras (acides oléique, arachidonique et
docosahexaénoique).
- Swagell CD, Henly DC, Morris CP. Regulation of human hepatocyte gene expression by fatty acids.
Biochel Biophys Res Commun. 2007, 362:374-80.
- Jump DB, Botolin D, Wang Y, Xu J, Demeure O, Christian B. Docosahexaenoic acid (DHA) and
hepatic gene transcription. Chem Phys Lipids. 2008, 153:3-13.
_____________________________________________________________________________________
Jourdan ML, Maheo K, Barascu A, Goupille C, De Latour MP, Bougnoux P, Rio PG. Increased BRCA1
protein in mammary tumours of rats fed marine omega-3 fatty acids. Oncology Rep. 2007, 17:713-9.
Loiseau D, Morvan D, Chevrollier A, Demidem A, Douay O, Reynier, P, Stepien G. Mitochondrial
bioenergetic background confers a survival advantage to HepG2 cells in response to chemotherapy. Mol
Carcinogenesis. 2009, 48:733-41
Bayet M, Loiseau D, Rio P, Demidem A, Barthomeuf C Stepien G, Morvan D. Quantitative two-dimensional
HRMAS 1H-NMR spectroscopy-based metabolite profiling of human cancer cell lines and response to
chemotherapy. Magn Reson Med 2010, 63:1172-83
Behzadi M, Demidem A, Morvan D, Schwartz L, Steyaert JM. A Model of phospholipid biosynthesis in
tumor in response to an anticancer agent in vivo. J Integr Bioinform. 2010, 7:129-145.
- Culture de deux lignées hépatocytaires, les cellules HepaRG, et des cellules témoin HepG2 en présence
de divers AGPI
- Transfection et interférence d’ARN
- Extraction d’ARN, RT-PCR quantitative
STAGE N° 5
Titre du stage : Rôle de la vitamine D dans la résistance anabolique musculaire chez le rat âgé
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Laboratoire d’accueil : Equipe Adaptation Métabolique Musculaire, Unité de Nutrition Humaine,
Laboratoire de Nutrition Humaine, 58 rue Montalembert, BP321, 63009 Clermont-Ferrand cedex 1
*Directeur du stage et coordonnées précises : Stéphane Walrand & Yves Boirie
Laboratoire de Nutrition Humaine, 58 rue Montalembert, BP321, 63009 Clermont-Ferrand cedex 1
04 73 60 82 76
[email protected]
_____________________________________________________________________________________
Titre du stage proposé : Rôle de la vitamine D dans la résistance anabolique musculaire chez le rat
âgé
La sarcopénie est définie comme étant la perte de la masse et des fonctions musculaires liée à l’âge. Cette
dégénérescence musculaire dont les mécanismes sont mal connus, présente des conséquences
fonctionnelles et métaboliques importantes. Une moindre capacité anabolique musculaire et une
augmentation des anomalies métaboliques liées à l’âge participent à ce phénomène. Dans ce contexte, la
vitamine D du fait de son action au niveau du muscle squelettique pourrait permettre d’améliorer les
capacités mécano-métaboliques musculaires chez l’individu âgé. En effet, il a été clairement démontré,
par différentes études cliniques et épidémiologiques, qu’un faible statut en vitamine D était toujours
associé à une diminution de la masse, de la force et des capacités contractiles musculaires chez la
personne jeune ou âgée aboutissant à une réduction des capacités physiques. A l’inverse, un apport
supplémentaire en vitamine D pendant plusieurs semaines chez le sujet âgé, améliore significativement
les paramètres fonctionnels musculaires classiquement recherchés. Même si une étude humaine a montré
que l’expression du récepteur à la vitamine D (VDR) à la surface de la cellule musculaire diminuait avec
l’avance en âge, très peu d’indications existent actuellement sur le rôle métabolique, cellulaire et
moléculaire de ce micro-nutriment au sein du muscle et l’impact du vieillissement sur celui-ci. L’objectif
de ce travail est de rechercher l’effet de la vitamine D sur les voies participant à la régulation de la masse
et des fonctions musculaires chez le rat âgé sarcopénique (exemple : mesure du taux de synthèse
protéique musculaire et de ses voies de régulation).
Pour répondre à cet objectif, l’effet bénéfique d’un apport en vitamine D sur l’anabolisme protéique
musculaire et sa régulation, la masse musculaire et la force musculaire chez des rats jeunes, âgés
sarcopéniques et âgés sarcopéniques carencés en vitamine D sera évalué.
Ceglia L. Vitamin D and its role in skeletal muscle. Curr Opin Clin Nutr Metab Care. 2009
Nov;12(6):628-33.
Bischoff-Ferrari HA, Dietrich T, Orav EJ, Hu FB, Zhang Y, Karlson EW, Dawson-Hughes B. Higher 25hydroxyvitamin D concentrations are associated with better lower-extremity function in both active and
inactive persons aged > or =60y. Am J Clin Nutr. 2004 Sep;80(3):752-8.
Zangarelli A., Chanseaume E., Morio B., Mosoni L., Rousset P., Giraudet C., Patrac V., Gachon P.,
Boirie Y., Walrand S. Synergistic effects of caloric restriction together with protein intake on
skeletal muscle performance in old rats: a mitochondrial-mediated pathway. FASEB J.
2006;20(14):2439-50.
Walrand S., Short K.R., Bigelow M.L., Sweat A.J., Hutson S.M., Nair K.S. Functional impact of high
protein intake on healthy elderly subjects. Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab. 2008;295(4):E921-8.
Koopman R., Walrand S., Beelen M., Gijsen A.P., Kies A.K., Boirie Y., Saris W.H., van Loon L.J.
Dietary protein digestion and absorption rates and the subsequent postprandial muscle protein
synthetic response do not differ between young and elderly men. J Nutr. 2009;139(9):1707-13.
Walrand S., Zangarelli A., Soulier K. Gachon P., Giraudet C., Patrac V. Rousset P., Boirie Y. Fast
proteins as a strong determinant of contractile protein maintenance in caloric-restricted old rats. Br J
Nutr, 2011 sous presse
Mesure du taux de synthèse protéique musculaire par l'utilisation d'isotopes stables (acides aminés
traceurs)
Mesure de l'activation des voies de régulation de la traduction protéique musculaire (mTOR, eIF2...) et du
métabolisme de la vitamine D par western blot
Mesure de l'expression de gènes d'intérêt par qPCR
Technique de biochimie de base : Automate de biochimie, Elisa, activités enzymatiques
STAGE N° 6
Titre du stage :
Activité anti-inflammatoire de micronutriments de nature polyphénolique : étude expérimentale
dans un modèle d’inflammation colique.
_______________________________________________________________________
Laboratoire de Pharmacognosie et Phytothérapie
Equipe d’accueil EA 4233 « Nutrition, Cancérogenèse, Thérapie anti tumorale » (Pr. M.P. Vasson)
*Directeur du Laboratoire :
Responsable pédagogique : Odile Texier, MCU
Directeur recherche : Marie-Paule Vasson, Professeur
Catherine Felgines, MCU
Laboratoire de Pharmacognosie et Phytothérapie, EA 4233
Faculté de Pharmacie Tel. 04 73 17 80 31 [email protected]
___________________________________________________________________________
Titre du stage proposé : Activité anti-inflammatoire de micronutriments de nature
polyphénolique : étude expérimentale dans un modèle d’inflammation colique.
Des études épidémiologiques ont montré que des populations ayant une alimentation riche en
polyphénols ont une incidence plus faible de maladies inflammatoires chroniques. Les polyphénols sont
pour la plupart faiblement absorbés dans l'intestin grêle et une forte proportion des polyphénols ingérés
arrive ainsi dans le côlon. Les polyphénols et leurs métabolites pourraient exercer au niveau colique un
rôle protecteur vis-à-vis du stress oxydant et réduire l'inflammation. L’inflammation colique sera induite
par administration orale de sulfate de dextran sodique et les rats recevront de façon préventive dans leur
alimentation un extrait végétal riche en polyphénols. L'effet anti-inflammatoire au niveau du côlon sera
évalué par la détermination des atteintes histologiques et l'analyse de différents marqueurs biochimiques
de l'inflammation et du stress oxydant.
Romier B., Schneider Y-J., Larondelle Y. and During A. Dietary polyphenols can modulate the intestinal
inflammatory response. Nutr. Rev. 2009, 67, 363-378.
Larrosa M., Luceri C., Vivoli E., Pagliuca C., Lodovici M., Moneti G. and Dolara P. Polyphenol
metabolites from colonic microbiota exert anti-inflammatory activity on different inflammation models.
Mol. Nutr. Food Res. 2009, 53, 1044-1054.
___________________________________________________________________________
Felgines C., Texier O., Garcin P., Besson C., Lamaison J-L., Scalbert A. Tissue distribution of
anthocyanins in rats fed a blackberry anthocyanin-enriched diet. Mol. Nutr. Food Res., 2009, 53, 10981103.
Felgines C., Krisa S., Mauray A., Besson C., Lamaison J-L., Scalbert A., Mérillon J-M., Texier O.
Radiolabelled cyanidin 3-O-glucoside is poorly absorbed in the mouse. Br. J. Nutr, 2010, 103, 17381745.
Lenoir L., Felgines C., Joubert-Zakeyh J., Ouchchane L., Vergnaud J., Farges M-C., Vasson M-P.,
Lamaison J-L., Texier O. Atténuation des atteintes coliques par les polyphénols de verveine odorante
dans un modèle d'inflammation intestinale induite par le DSS chez le rat. 25ème congrès annuel de la
Société Francophone Nutrition Clinique et Métabolisme SFNEP, Clermont-Ferrand, 25-27 novembre
2009.
- Analyse histologique des lésions coliques.
- Dosage d’activités enzymatiques marqueurs du stress oxydant et de l'inflammation.
- Dosage du glutathion tissulaire par HPLC.
- Détermination de la production de cytokines par dosage ELISA.
STAGE N° 7
Titre du stage :
IMPACT DU MICROENVIRONNEMENT ADIPOCYTAIRE TUMORAL SUR LES
PROCESSUS D’ANGIOGENESE
____________________________________________________________________________________
Laboratoire SVFp, Faculté de Pharmacie (1erR3)
EA4233 « Nutrition, Cancérogenèse et thérapies anti-tumorales » (Directeur : Pr MP Vasson)
Pr F Caldefie-Chézet
*Directeurs du stage et coordonnées précises :
Pr F Caldefie-Chézet : 04 73 17 79 71 : [email protected]
Dr Laetitia Delort : 04 73 17 79 70 : [email protected]
Laboratoire SVFp, Faculté de Pharmacie, 28, place Henri-Dunant, 63000 Clermont-Ferrand
_____________________________________________________________________________________
IMPACT DU MICROENVIRONNEMENT ADIPOCYTAIRE TUMORAL SUR LES
PROCESSUS D’ANGIOGENESE
L’obésité en post-ménopause est considérée comme un facteur de risque de développement du cancer
mammaire. Les sécrétions adipocytaires (adipokines) jouent un rôle dans la cancérogenèse mammaire.
Deux adipokines majeures, la leptine et l’adiponectine, exercent respectivement un effet stimulant et
inhibiteur sur la prolifération de cellules cancéreuses mammaires et sont exprimées au niveau de biopsies
d’adénocarcinomes mammaires. Elles seraient également susceptibles d’influencer le processus
d’angiogenèse, notamment chez les patientes obèses pour lesquelles une hyperleptinémie, une
hypoadiponectimémie et une augmentation du potentiel métastatique sont décrites. L’angiogenèse
pourrait aussi être directement induit par le microenvironnement tumoral. En effet, le tissu épithélial
mammaire, sain ou tumoral, se trouve directement au contact des adipocytes, et les interactions entre ces
types cellulaires, en mettant en jeu non seulement les adipokines, mais aussi des mécanismes proinflammatoires locaux, le stress oxydant et des processus d’hypoxie pourraient stimuler la prolifération
cellulaire, l’angiogenèse et les processus d’invasion tumorale. Ces interrelations seront évaluées dans des
approches in vitro et clinique.
Ce projet est soutenu financièrement par la Ligue contre le Cancer et le Cancéropôle CLARA
Jardé et al. Molecular mechanisms of leptin and adiponectin in breast cancer. Eur J Cancer. 2011
Jan;47(1):33-43.
Jardé et al. Involvement of adiponectin and leptin in breast cancer: clinical and in vitro studies. Endocr
Relat Cancer. 2009 Dec;16(4):1197-210. Epub 2009 Aug 6
1: Jardé T, Perrier S, Vasson MP, Caldefie-Chézet F. Molecular mechanisms of leptin and adiponectin in
breast cancer. Eur J Cancer. 2011 Jan;47(1):33-43.
2: Dubois V, Delort L, Mishellany F, Jarde T, Billard H, Lequeux C, Damour O, Penault-Llorca F,
Vasson MP, Caldefie-Chézet F. Zinc-alpha2-glycoprotein: a new biomarker of breast cancer? Anticancer
Res. 2010 jul;30(7):2919-25.
3: Jardé T, Caldefie-Chézet F, Goncalves-Mendes N, Mishellany F, Buechler C, Penault-Llorca F,
Vasson MP. Involvement of adiponectin and leptin in breast cancer: clinical and in vitro studies. Endocr
Relat Cancer. 2009 Dec;16(4):1197-210. Epub 2009 Aug 6.
4: Perrier S, Caldefie-Chézet F, Vasson MP. IL-1 family in breast cancer: potential interplay with leptin
and other adipocytokines. FEBS Lett. 2009 Jan 22;583(2):259-65. Epub 2008 Dec 25.
-Cultures simples et co-cultures cellulaires (cellules épithéliales, cancéreuses et adipocytaires)
-Cultures tridimensionnelles
-Immunohistochimie (cellules ou biopsies humaines)
-Fluorescence et luminescence (lecteurs microplaques)
-Western-Blot, PCR et qRT-PCR (microplaques), études trancriptomiques
-Exploration de l’angiogenèse (tests in vitro)
-Cytométrie en flux -Microscopie optique et microscopie fluorescence
STAGE N° 8
Titre du stage : ANALYSE DE MARQUEURS DE STRESS OXYDANT ET DE LEUR
IMPLICATION LORS DE LA TUMORIGENESE MAMMAIRE LIEE A L'OBESITE.
___________________________________________________________________________
Laboratoire d’accueil : Laboratoire de Biochimie, Biologie Moléculaire et Nutrition
EA4233 "Nutrition, Cancérogenèse et Thérapie anti-tumorale"
*Directeur du Laboratoire : Pr Marie-Paule Vasson
Dr Rachida Nachat-Kappes et Pr Samar Basu
Laboratoire de Biochimie, Biologie Moléculaire et Nutrition
UFR de Pharmacie, 28, place Henri Dunant, BP 38, 63001 CLERMONT-FERRAND CEDEX 1
(Tél. et mail) : [email protected] – tel. 04 73 17 80 44
___________________________________________________________________________________
Titre du stage proposé : Analyse de marqueurs de stress oxydant et de leur implication lors de la
tumorigénèse mammaire liée à l'obésité.
L'obésité est associée à une production anormale d’adipokines ainsi qu’à un état inflammatoire chronique
et à une augmentation du stress oxydant. De plus, elle est connue comme facteur de risque de
développement de cancer du sein chez les femmes en post ménopause (1). Les F2-isoprostanes, tel que le
8-iso-PGF2Į, sont produits par un mécanisme radicalaire non enzymatique de peroxydation lipidique des
acides gras polyinsaturés. Reconnus à ce jour comme de véritables marqueurs du stress oxydant, leur
synthèse est augmentée lors de nombreuses pathologies, dont le cancer (2).
Disposant d’un outil immunologique hautement spécifique du 8-iso-PGF2Į, l’objectif du stage sera
d’évaluer le statut oxydatif dans des lignées cellulaires mammaires (MCF7, MDA MB 231) traitées par
des adipokines, ainsi que dans des modèles de xénogreffe de tumeurs mammaires chez des souris nude
ayant suivi un régime hyper ou normo-calorique. Ce travail permettra ainsi d’évaluer les interactions
susceptibles d’exister entre inflammation et stress oxydant lors de la tumorigenèse mammaire liée à
l'obésité.
1. Prieto-Hontoria PL, et al. Role of obesity-associated dysfunctional adipose tissue in cancer: A
molecular nutrition approach. Biochim Biophys Acta. 2010
2. Basu S. Fatty acid oxidation and isoprostanes: oxidative strain and oxidative stress. Prostaglandins
Leukot Essent Fatty Acids. 2010
- Jardé T, Perrier S, Vasson MP, Caldefie-Chézet F. Molecular mechanisms of leptin and adiponectin in
breast cancer. Eur J Cancer. 2011 Jan;47(1):33-43.
- Dubois V, Delort L, Mishellany F, Jarde T, Billard H, Lequeux C, Damour O, Penault-Llorca F, Vasson
MP, Caldefie-Chezet F. Zinc-alpha2-glycoprotein: a new biomarker of breast cancer? Anticancer Res.
2010 Jul;30(7):2919-25.
- Jardé T, Caldefie-Chézet F, Damez M, Mishellany F, Perrone D, Penault-Llorca F, Guillot J, Vasson
MP. Adiponectin and leptin expression in primary ductal breast cancer and in adjacent healthy epithelial
and myoepithelial tissue. Histopathology. 2008 Oct;53(4):484-7
Culture Cellulaire, Cytométrie de Flux, Immunohisto(cyto)chimie, Immunofluorescence indirecte,
microscopie confocale, western-blotting, RT-PCR
STAGE N° 9
Titre du stage : Interactions cellules dendritiques humaines - bactéries probiotiques et polarisation
de la réponse lymphocytaire T.
___________________________________________________________________________
Laboratoire d’accueil : Laboratoire d’Immunologie
EA 4233 « Nutrition, Cancérogenèse, Thérapie anti-tumorale »
*Directeur du Laboratoire : Dr TRIDON Arlette
Dr EVRARD Bertrand, Dr TRIDON Arlette
Laboratoire d’Immunologie, facultés de médecine et de pharmacie, Clermont Ferrand
Tel : 04 73 17 79 73 Mail : [email protected]
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Titre du stage proposé : Interactions cellules dendritiques humaines - bactéries probiotiques et
polarisation de la réponse lymphocytaire T.
Les cellules dendritiques sont les sentinelles de l’immunité. Disposées tout le long de la muqueuse
digestive, elles scrutent l’environnement à la recherche de signaux de danger. Elles doivent donc être
capables de discriminer entre les centaines de bactéries commensales qui composent la flore intestinale, et
les bactéries pathogènes éventuelles dont la présence est anormale. Elles induiront alors une réponse
immunitaire différente des lymphocytes T, à type de tolérance pour les commensaux et d’inflammation
pour les pathogènes.
Des travaux préalables réalisés par notre équipe ont mis en évidence une réponse inflammatoire
dose-dépendante des cellules dendritiques incubées en présence d’une bactérie probiotique, le
Lactobacillus rhamnosus Lcr35. Nous souhaitons maintenant déterminer grâce à la réalisation de cultures
lymphocytaires mixtes (allogéniques et autologues) comment ces cellules dendritiques vont être capables
à leur tour de moduler la réponse des lymphocytes T. Au cours de ce Master, nous nous proposons
également d’analyser plus finement les sous-populations lymphocytaires T qui vont être générées par le
contact cellules-bactéries lors d’expériences de coculture de lymphocytes T naïfs en présence des cellules
dendritiques, prétraitées ou non par la bactérie probiotique.
Drakes M, Blanchard T, Czinn S. (2004) Bacterial probiotic modulation of dendritic cells. Infect
Immun.72:3299-309.
Smits HH, Engering A, van der Kleij D, et al. (2005) Selective probiotic bacteria induce IL-10-producing
regulatory T cells in vitro by modulating dendritic cell function through dendritic cell-specific
intercellular adhesion molecule 3-grabbing nonintegrin. J Allergy Clin Immunol. 115:1260-7.
___________________________________________________________________
Evrard B, Coudeyras S, Dosgilbert A, Charbonnel N, Alamé J, Tridon A, Forestier C. Dose-dependent
Immunomodulation of Human Dendritic Cells by the Probiotic Lactobacillus rhamnosus Lcr35. Sous
presse, Plos One 2011.
Evrard B, Balestrino D, Dosgilbert A, Bouya-Gachancard JL, Charbonnel N, Forestier C, Tridon A.
Roles of capsule and lipopolysaccharide O antigen in interactions of human monocyte-derived dendritic
cells and Klebsiella pneumoniae. Infect Immun. 2010 ;78(1):210-9.
Evrard B., Dosgilbert A., Jacquemot N., Demeocq F., Thibault G., Chassagne J., Berger M., Tridon A.
CFSE flow cytometric quantification of lymphocytic proliferation in extracorporeal photopheresis : use
for quality control. Transfus Apher Sci. 2010 Feb;42(1):11-9.
Techniques utilisées : ELISA, Luminex, culture de cellules, CMF, microscopie confocale
STAGE N°10
Titre du stage : Impact d’une supplémentation en vitamine D sur les cellules immunocompétentes.
_____________________________________________________________________________________
Laboratoire de Biochimie, Biologie Moléculaire et Nutrition
EA4233 "Nutrition, Cancérogenèse et Thérapie anti-tumorale"
Pr Marie-Paule VASSON
Dr Nicolas Goncalves-Mendes, Pr Henri Laurichesse
Tel : 04 73 17 80 49 - [email protected]
_____________________________________________________________________________________
Impact d’une supplémentation en vitamine D sur les cellules immunocompétentes.
La vitamine D (VitD), dont le rôle est bien établi dans le métabolisme phosphocalcique, semble avoir de
multiples effets biologiques notamment dans la réponse inflammatoire et l'immunité.
Un déficit en VitD est fréquemment rencontré chez la personne âgée ainsi que dans des maladies
chroniques comme l’asthme. De plus, l’hypovitaminose D est associée à une incidence accrue de
pathologies inflammatoires et infectieuses (BPCO, infections virales). Ainsi, la VitD semble avoir un
impact sur les fonctions et le métabolisme des cellules immunitaires, en particulier, les lymphocytes et les
polynucléaires [1 ; 2].
L’objectif de ce projet est d’étudier in vitro l’influence de la vitamine D sur les fonctions des cellules
immunocompétentes. Différentes fonctions cellulaires seront analysées telles que la phagocytose, le statut
oxydatif, la cytotoxicité. Une approche transcriptomique (qPCR) sera mise en œuvre pour caractériser les
voies de signalisation de la vitamine D et son implication dans la régulation post-transcriptionnelle.
1-Chen S et al. Modulatory effects of 1,25-dihydroxyvitamin D3 on human B cell differentiation. J
Immunol 2007, 179: 1634-1647.
2-Boonstra A et al. 1alpha,25-Dihydroxyvitamin d3 has a direct effect on naive CD4(+) T cells to
enhance the development of Th2 cells. J Immunol 2001, 167: 4974- 4980.
_____________________________________________________________________________________
- Extracorporeal photochemotherapy induces arginase 1 in patients with graft versus host disease.
Merlin E, Goncalves-Mendes N, Hannani D, De la Torre A, Farges MC, Laroye H, Demeocq F, Kanold J,
Vasson MP. Transpl Immunol. 2011 Jan15;24(2):100-6
- Molecular mechanisms of leptin and adiponectin in breast cancer.
Jardé T, Perrier S, Vasson MP, Caldefie-Chézet F. Eur J Cancer. 2011 Jan;47(1):33-43.
- Involvement of adiponectin and leptin in breast cancer: clinical and in vitro studies.
Jardé T, Caldefie-Chézet F, Goncalves-Mendes N, Mishellany F, Buechler C, Penault-Llorca F, Vasson
MP. Endocr Relat Cancer. 2009 Dec;16(4):1197-210.
Culture cellulaire, microscopie optique, cytométrie en flux, techniques de biologie moléculaire (PCR,
qPCR, Western-Blot).
STAGE N°11
Titre du stage : Modifications épigénétiques par les phyto-oestrogènes du soja dans des cellules
mammaires humaines
__________________________________________________________________________________
Département d'Oncogénétique du centre Jean Perrin,
EA 4233,CBRV,28 Place Henri Dunant, BP 38, 63001 Clermont-Ferrand
*Directeur du Laboratoire : Pr Yves-Jean Bignon
*Directeur du stage et coordonnées précises : Dominique Bernard-Gallon
Département d'Oncogénétique du centre Jean Perrin,
EA 4233,CBRV,28 Place Henri Dunant, BP 38, 63001 Clermont-Ferrand
Tel : 04-73-17-83-58
Mail : [email protected]
_____________________________________________________________________________________
Les phyto-œstrogènes sont des molécules naturelles contenues dans des végétaux dont certains entrent
dans la consommation humaine. Ceux qui sont le plus étudiés à ce jour sont les phyto-œstrogènes du soja.
Les données épidémiologiques et mécanistiques suggèrent que ces composés exercent un effet protecteur
des cancers du sein lors d’expositions précoces alors que des expositions plus tardives ne sont pas
protectrices voire accélèreraient la prolifération de tumeurs œstrogéno-dépendantes. Chez les asiatiques,
les effets protecteurs sont obtenus avec des doses plasmatiques allant de 200 à 500 nM. Les mécanismes
qui président à la transformation des cellules mammaires normales en cellules mammaires tumorales
incluent des modifications de l’expression des oncosuppresseurs BRCA1 et BRCA2 et d’autres gènes
contrôlant le cycle cellulaire notamment par des mécanismes épigénétiques. Certains phyto-œstrogènes
semblent capables de modifier l’expression des oncosuppresseurs BRCA1 et BRCA2 et certaines
molécules de la famille des phyto-œstrogènes du soja (flavonoïdes) semblent capables de modifier les
contrôles epigénétiques. Compte tenu de ce contexte il nous semble pertinent d’analyser les effets des ces
molécules de soja. Ainsi, nous nous proposons de tester in vitro des lignées continues de cellules
mammaires modèles (MCF-7, MDA-MB-231, MCF-10a), différentes concentrations de molécules
circulantes (génistéine, daidzéine, glycitéine et S-équol). Ceci devrait nous permettre d’identifier
clairement l’effet de chacune d’elle dans ces systèmes. Les tests seront réalisés sur l’étude de l’acétylation
et de la méthylation des histones aux loci BRCA1 et BRCA2.
_____________________________________________________________________________________
N. Chalabi, L. Delort, S. Satih, P. Dechelotte, Y.J. Bignon, D.J. Bernard-Gallon. Immunohistochemical
expression of RARα, RARβ and connexin 43 in breast tumor cell lines after treatment with lycopene and
correlation with RT-QPCR. Journal of Histochemistry and Cytochemistry 2007 ; 55 : 877-883.
S. Satih, N. Chalabi, N. Rabiau, R. Bosviel, L. Fontana, Y.-J. Bignon , D.J. Bernard-Gallon. Gene
expression profiling of breast cancer cell lines in response to soy isoflavones using a pangenomic
microarray approach.OMICS 2010 ; 14 : 231-8.
S. Satih, N. Chalabi, N. Rabiau,Y.J. Bignon, D.J.Bernard-Gallon. Transcriptional profiling of breast
cancer cells exposed to soy phytoestrogens after BRCA1 knockdown with a whole human genome
microarray approach. Nutrition and Cancer 2010 ; 62 : 659-67.
L. Delort, S. Satih, F. Kwiatkowski, Y.J. Bignon, D.J. Bernard-Gallon. Evaluation of breast cancer risk
in a multigenic model including low penetrance genes involved in xenobiotic and estrogen metabolisms.
Nutrition and Cancer 2010 ; 62 (2):243-51.
Culture de celulles, Chromatine Immunoprecipitation (ChIP) et PCR quantitative. Des anticorps
polyclonaux contre les marques d’activation, de répression ou d’acétylation des histones seront utilisées.
Ces marques seront ensuite analysées en couplant la ChIP à des puces promoteurs (Agilent).
STAGE N°12
Titre du stage : Phyto-œstrogènes du soja et modifications de la méthylation de l’ADN: Etude dans
trois lignées continues de cancer de la prostate DU-145, PC-3 et LNCaP
_____________________________________________________________________________________
Laboratoire d’accueil : Département d’Oncogénétique du Centre Jean Perrin –CBRV. 1er Etage
Faculté de Médecine.28 Place Henri Dunant 63000 Clermont-Ferrand .
*Directeur du Laboratoire : Professeur Yves-Jean BIGNON
*Directeur du stage et coordonnées précises : Pr Laurent GUY
(Tél. et mail notamment) :0473178358
_____________________________________________________________________________________
De nombreuses études ont mis en évidence l’effet protecteur de certains micronutriments dont les phytoœstrogènes du soja vis-à-vis des cancers de la prostate. Ces molécules de phyto-œstrogènes agiraient sur
les cellules cancéreuses via différents mécanismes: apoptose, inhibition de la prolifération cellulaire mais
aussi via des mécanismes épigénétiques. Les phyto-œstrogènes semblent induire une réversion de la
méthylation de l’ADN au niveau des îlots CpG observée dans les cellules prostatiques. Des résultats
récents ont permis de montrer une augmentation de l’expression de nombreux oncosuppresseurs de
tumeurs par déméthylation de leurs promoteurs après traitement par les phyto-œstrogènes du soja
notamment la génistéine et la daidzéine.
Deux études menées au sein du laboratoire confirment l’effet déméthylant de ces molécules sur un certain
nombre de gènes suppresseurs de tumeurs.
En considérant ces résultats, nous nous proposons d’étudier l’effet de la génistéine, daidzéine et du Séquol, métabolite de la daidzéine dans trois lignées continues humaines de cancer de la prostate (DU-145,
PC-3 et LNCaP) et ce au niveau des îlots CpG des promoteurs de gènes grâce à la technique de
l’immunoprécipitation de l’ADN suivie d’une hybridation sur puce îlot CpG. Les cellules seront aussi
traitées avec la génistéine, la daidzéine, la 5 azacytidine, un agent déméthylant, la budesonide, un agent
méthylant par comparaison avec des cellules témoins non traitées.
1.
Vardi A, Bosviel R, Rabiau N, Adjakly M, Satih S, Dechelotte P, Boiteux JP, Fontana L, Bignon
YJ, Guy L, Bernard-Gallon DJ. Soy phytoestrogens modify DNA methylation of GSTP1, RASSF1A, EPH2
and BRCA1 promoter in prostate cancer cells. In Vivo. 2010 Jul-Aug; 24(4):393-400.
2.
Rabiau N, Kossaï M, Braud M, Chalabi N, Satih S, Bignon YJ, Bernard-Gallon DJ. Genistein and
daidzein act on a panel of genes implicated in cell cycle and angiogenesis by polymerase chain reaction
arrays in human prostate cancer cell lines. Cancer Epidemiol. 2010 Apr; 34(2):200-6. Epub 2010 Jan
25.
3.
Rabiau N, Thiam MO, Satih S, Guy L, Kemeny JL, Boiteux JP, Fontana L, Bignon YJ, BernardGallon D. Methylation analysis of BRCA1, RASSF1, GSTP1 and EPHB2 promoters in prostate biopsies
according to different degrees of malignancy. In Vivo. 2009 May-Jun; 23(3):387-91.
4.
Rabiau N, Dechelotte P, Guy L, Satih S, Bosviel R, Fontana L, Kemeny JL, Boiteux JP, Bignon YJ,
Bernard-Gallon D. Immunohistochemical staining of mucin 1 in prostate tissues. In Vivo. 2009 Mar-Apr;
23(2):203-7.
Techniques utilisées : Culture cellulaire; MeDIP (Immunoprécipitation de l’ADN méthylé) ;
Immunoprécipitation de la chromatine et hybridation sur puces promoteur (CHIp-on-chips)
STAGE N°13
Titre du stage : Rôle des interactions entre communautés microbiennes dans la dysbiose fonctionnelle
du microbiote intestinal des patients atteints du syndrome de l’intestin irritable.
_____________________________________________________________________________________
UNITE DE MICROBIOLOGIE – INRA – Centre de Recherches de Clermont-Ferrand – Theix, 63 122
Saint Genès Champanelle.
*Directeur du Laboratoire : R. Talon
A. BERNALIER-DONADILLE, Unité de Microbiologie, CR de Clermont-Ferrand / Theix, 63 122 Saint
Genès-Champanelle. Tel : 04 73 62 46 42. Fax : 04 73 62 45 81. Email : annick.bernalier @clermont.inra.fr
___________________________________________________________________________________
Rôle des interactions entre communautés microbiennes dans la dysbiose fonctionnelle du microbiote
intestinal des patients atteints du syndrome de l’intestin irritable.
Le microbiote intestinal des sujets souffrant du syndrome de l’intestin irritable (SII) est caractérisé par une
importante dysbiose fonctionnelle, se traduisant par un métabolisme microbien perturbé (Chassard et al,
2009). Ces dysfonctionnements du microbiote ont, de plus, des conséquences majeures sur la physiologie de
l’hôte et sont ainsi susceptibles d’être à l’origine de certains symptômes digestifs caractéristiques du SII.
Nos travaux antérieurs ont permis de démontrer le rôle central de la communauté sulfato-réductrice (SRB)
dans ces phénomènes de déséquilibres fonctionnels microbiens chez le sujet SII. La prédominance de ces
espèces au sein du microbiote SII affecte ainsi d’autres groupes fonctionnels microbiens, la nature des interrelations entre ces communautés n’étant toutefois pas complètement élucidée. L’objectif des études
proposées dans le cadre du stage est de mieux appréhender les interactions existant entre la communauté
SRB et ces autres groupes microbiens affectés (utilisateurs de lactate, producteurs de butyrate…) afin de
comprendre les mécanismes microbiens mis en jeu dans la dysbiose fonctionnelle du microbiote SII. Les
travaux seront conduits in vitro (cocultures) et in vivo (animaux gnotobiotiques).
Chassard C, M Dapoigny, KP Scott, C Del’homme, C Dubray, A Eschalier, HJ Flint and A BernalierDonadille 2009. THe intestinal microbiota of irritable bowel syndrome patients is characterized by
functionnal dysbiosis. Digestive Disease week, Chicago, 30 May-4 June, USA. Gastroenterology,
136(5): A21
_____________________________________________________________________________________
Chassard C, Delmas E, Robert C, Lawson PA, Bernalier-Donadille A. 2011 Ruminococcus champanellensis
sp. nov., a cellulose-degrading bacteria from the human gut microbiota. Int J Syst Evol Microbiol., in
press.
Chassard C., Delmas E., Robert C., Bernalier-Donadille A. 2010. The cellulolytic microbial community of
the human gut varies according to the presence or absence of methanogens. FEMS Microbiol. Ecol. 74,
205-213.
Marquet P., Duncan S.H., Chassard C., Bernalier-Donadille A . and Flint H.J. 2009. Lactate has the
potential to promote hydrogen sulfide formation in the human colon. FEMS Microbiol. Lett. 299(2),
128-134.
Chassard C., Scott K.P., Marquet P., Martin J.C., Del’homme C., Dapoigny M., Flint H. and BernalierDonadille A. 2008. Assessment of metabolic diversity within the intestinal microbiota from healthy
humans using combined molecular and cultural approaches. FEMS Microbiol. Ecol., 66, 496-504.
Techniques utilisées : Techniques de microbiologie adaptées aux microorganismes anaérobies strictes,
écologie moléculaire ciblant ADNr16S (TTGE, qPCR), RMN 1H, chromatographie phase gazeuse,
enzymologie, dosages enzymatiques et colorimétriques, animaux gnotobiotiques (animaux à flore contrôlée
élevés en isolateurs stériles

Master 2ème année Nutrition et Sciences des Aliments

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