Projet_scientifique - Ecole Nationale Supérieure Polytechnique

PROJET SCIENTIFIQUE DE L’ECOLE DE RECHERCHE CIMPA-­‐CETIC 2016 Titre : Modélisation Mathématique en Sciences du Vivant Date : 19 au 30 Septembre 2016 Lieu : Ecole Nationale Polytechnique, Université de Yaoundé 1, Cameroun Résumé des objectifs : Les maladies infectieuses, qu’elles soient des humains, des animaux ou des plantes, continuent de constituer un obstacle majeur, aussi bien pour le développement économique que pour la santé humaine dans le monde et en Afrique en particulier. Aussi, un certain nombre de problèmes de très grande importance sociétale en sciences du vivant se posent pour lesquels la modélisation mathématique et informatique est la seule façon d'apporter des réponses rationnelles. L’objectif de cette école vise à initier les participants à la formulation des modèles mathématiques et informatiques en épidémiologie, immunologie, écologie et agronomie et à l’utilisation des outils des systèmes dynamiques et d’analyse numérique dans l’analyse des situations réelles d’épidémies au sein d'une population humaine ou animale, de bio-­‐agresseurs des plantes et de dynamiques de population. Le but est de contribuer fortement à l’instauration et à la consolidation de curricula relatifs à la recherche et l’enseignement des biomathématiques dans les universités africaines. Les objectifs spécifiques sont les suivants: -­‐ Contribuer au développement des mathématiques appliquées au sciences du vivant en Afrique et par les africains; -­‐ Briser l’isolement des chercheurs et étudiants africains en créant un cadre de rencontre et d’échange scientifique entre les participants africains et l’expertise étrangère de ce domaine; -­‐ Renforcer les capacités des apprenants africains en modélisation mathématique et informatique en sciences du vivant; -­‐ Créer un cadre favorable à la mise en place d’un réseau africain pour la modélisation mathématique et informatique en science du vivant; -­‐ Favoriser le rapprochement entre les mathématiciens et biologistes autour des thèmes fédérateurs en science du vivant; -­‐ Discuter avec les professionnels locaux de la santé et de l’agriculture de la pertinence des axes de recherche adaptés à notre environnement dans le but de favoriser la professionnalisation de ces cursus d’enseignement et l’insertion des jeunes diplômés de la formation; -­‐ Encourager les participants (jeunes collègues et étudiants) africains qui viennent de s'engager ou qui souhaitent s’engager dans le domaine des Mathématiques appliquées aux outils et méthodes mathématiques pour les sciences du vivant (épidémiologie, immunologie, agronomie, écologie,…) en leur apprenant les nouvelles méthodes de modélisation mathématique des phénomènes en science du vivant à travers des cours ou exposés. Travail scientifique et les formations déjà réalisés sur place Le Cameroun dispose d’une équipe travaillant dans le domaine de l’épidémiologie mathématique. L’objectif de l’équipe est de mettre au point et d’analyser la dynamique des modèles mathématiques et informatiques qui simulent les flambées de maladies infectieuses telles le paludisme, la tuberculose, le sida, l’hépatite B… ainsi que la lutte contre ces maladies et leur prévention. Le but est d’arriver à soutenir les décisions en santé publique par une expertise scientifique pour préserver et promouvoir la santé au sein d’une population humaine. L’équipe s’attèle à développer des outils mathématiques et informatiques permettant une meilleure conception en amont et un bon suivi en aval des programmes de sant ́e qui sont mis en oeuvre en Afrique sub Saharienne et plus particulièrement au Cameroun. Pour ce faire, les membres de l’équipe développe la dynamique des modèles épidémiologiques et immunologiques dans le but de 1) analyser la propagation d’une maladie infectieuse; 2) simuler et tester les hypothèses; 3) identifier et estimer les paramètres importants ; 4) estimer les variables difficiles à mesurer ; 5) prédire l’ évolution d’une maladie infectieuse ; 6) contrôler la propagation d’une maladie infectieuse ; 7) optimiser l’utilisation des médicaments pour minimiser l’apparition des résistances ; 8) developer des programmes multi-­‐agents de simulation spécifique. Il existe un réseau EPIMATH (Réseau d’Afrique Central en Epidémiologie et Immunologie) dont l’objectif est de favoriser l’interaction entre les membres, de partager les résultats obtenus par les membres, de discuter de la pertinence des axes de recherche du réseau et d’encourager les étudiants qui veulent s’engager dans le domaine de l’épidémiologie mathématique. Le réseau EPIMATH a organisé six atéliers (Yaoundé 2003, Brazzaville 2004, Ngaoundéré 2008, Brazzaville 2009, Ngaoundéré 2012, Brazzaville 2014). Il existe également un master et cycle de doctorat en épidémiologie mathématique dans les universités de Yaoundé 1, Douala, Buéa et Ngaoundéré. Une soixante de mémoires de master ont déjà été soutenus dans le domaine et les premières thèses de doctorat seront soutenues courant de l’année prochaine. Cependant, deux problèmes majeurs des étudiants en Master restent l’isolement et le besoin de formation complémetaire d’où l’organisation de cette école. Cette école accompagnera et renforcera la dynamique amorcée au sein du réseau pluridisciplinaire EPIMATH et l’équipe GRIMCAPE (Groupe de Recherche Informatique et Mathématique Camerounais pour l’Epidémiologie) et permettra ensuite d'assurer la pérennisation d'une recherche pluridisciplinaire avec la possibilité de justifier le recrutement de chercheurs à vocations transversales. Elle permettra d’introduire dans les masters de mathématiques et/ou de biologie des différentes universités camerounaise partenaires un module de modélisation mathématique et informatique en épidémiologie, immunologie, écologie et agronomie. Aussi, forts de nos précédentes expériences, cette école permettra d’initier une plate-­‐forme scientifique internationale et pluri-­‐disciplinaire dédiée à la modélisation et au contrôle des maladies infectieuses et des bio-­‐agresseurs en agronomie. Elle permettra à coût sûr de mettre en avant des thématiques fortes de recherche dans le domaine de la modélisation des sciences du vivant en Afrique et au Cameroun en particulier pour les années futures. Organisateurs : 1. Samuel BOWONG, Université de Douala, Cameroun, Email : [email protected] 2. Nguyen-­‐Huu Tri, IRD, ENS Lyon, France, Email : tri.nguyen-­‐[email protected] Comité scientifique : 1. David Bekolle, Cameroun 2. Jean Lubuma, Afrique du Sud 3. Suzanne Touzeau, France 4. Jurgen Kurths, Allemagne 5. Yves Dumont, France 6. Tri Nguyen-­‐Huu, France Comité d’organisation local 1. Samuel BOWONG TSAKOU Rôle: Coordonnateur Courriel: [email protected] 2. Jean Jules TEWA Rôle: Secretariat et Finances Courriel: [email protected] 3. Yves EMVUDU Rôle: Communication Courriel: [email protected] 4. Joseph MBANG Rôle: Transport et Hébergement Courriel: [email protected] 5. Léontine NKAGUE Rôle: Acceuil et Logistique Courriel: [email protected] Nombre et origine des participants attendus Nous attendons une soixantaine de participants dont -­‐ 10 conférentiers venant de la France, du Canada, de l’Allemagne et de l’Afrique du Sud -­‐ une quinzaine de participants (jeunes enseignants et thèsards) venant du Congo-­‐Brazaville, Gabon, Congo-­‐Kinshasa, Tchad, Sénégal, Kenya, Bénin, Maroc, Burundi, Rwanda et Algérie. -­‐ Une quarantaine de participants (enseignants, thèsards et étudiants en Master) venant des universités d’état du Cameroun Site web de la conférence http://www.citi.cm/minesup-recherche/ Conférenciers 1. Gauthier Sallet, Université de Lorraine, France Titre: Modélisation Mathématique en Immunologie 2. Julien Arino, Université de Manitoba, Canada Titre: Modélisation Mathématique en Epidémiologie 3. Pierre Auger, IRD, France Titre: Introduction aux Systèmes Dynamiques 4. Nguyen-­‐Huu Tri, IRD et ENS Lyon, France Titre: Applications des Systèmes Dynamiques à la Dynamique des Populations et Communauté 5. A.M. Aziz Alaoui, Université du Haute-­‐Normandie, France Titre: Modélisation et Analyse des Maladies Vectorielles 6. Arnaud Ducrot, Institut de Mathématique de Bordeaux, France Titre: Analyse Mathématique de la propagation spatiales des maladies infectieuses 7. Yves Dumont, AMAP, CIRAD, France Titre: Outils mathématiques et Méthodes en Agronomie et Ecologie 8. Jean Lubuma, Université de Pretoria, Afrique du Sud Titre: Outils et Méthodes Numériques pour Epidémiologie et l’Agronomie 9. Suzanne Touzeau EPI BIOCORE, INRIA, France Titre: Modélisation Mathématique en Epidémiologie Animale et Végétale 10. Jurgen Kurths, Postdam Institute of Climatology, Allemagne Titre: Interaction entre changement climatique et apparition des maladies infectieuses Programme Scientifique Les cours d'initiation de base auront lieu la première semaine et les cours avancés seront laissés pour la deuxième semaine. Les cours seront dispenses en français ou en Anglais. Une rencontre est prévue à la fin de la deuxième semaine entre les professionnels des secteurs de la santé et de l'agriculture, les conférenciers invités et les participants. Cette rencontre servira de plate forme aux professionnels de ces secteurs (santé et agriculture) pour présenter les problèmes pratiques rencontrés dans le cadre de l'exercice de leur métier. Un échange débat suivra pour envisager une possible collaboration entre les équipes de recherche travaillant dans le domaine de la modélisation en science du vivant et les structures exerçant dans les secteurs de santé et d'agriculture Date limite d’inscription: 03 Juillet 2016 Modalité d’inscription uniquement pour les non locaux. Les candidats du Cameroun doivent contacter les organisateurs locaux: Samuel Bowong (sbowong@univ-­‐douala.com) ou Jean Jules Tewa ([email protected]) Site web local: http://www.citi.cm/minesup-­‐recherche/