pattes tordues » du poulet

ESTTMATTON DES PARAMETRES GENETIQT ES DF,s DEFORMATTONS OBSERVEES DANS LE
SYNDROME DIT DES "PATTES TORDUES" DU POULET DE CHAIR
Le Bihan-Duval Elisabethr, Betumont Cetheriner, Colleau JJ.2
TINRA,Stationde Recherches
Avicoles,37380Notuilly.
î.lRA, Station de GénétiqueQuantitativeet Appliquée,78350 Jouy-en-Josas.
Résumé
("valgus",'varus' et "cowdestois déformations
Cefieétudea pourbut d'estimerles paramèfesgénétiques
portÊntsurdeux
dalrsle syndromedit de.s"pattestordues"du pouletde chair.Iæsanalyses
boy") renconfrées
lignéesde pouletde tl1e "chair".Dansla première,14264animauxdesdeuxsexesissusde lll pèreset 76
8164animauxissusde% pères
grand-pères
maternels
et répartisdans14lots sontétudiéset, dansla seconde,
avocun modèlelinéaire
materîelset épartis dalrs ll loS. Iæs ônnês sont analysées
et 7l grand-pères
généralisé
Le modèled'analysecomporteleseffetsfixésdes
utilisantla fansfannationlogistiquemultinomiale.
sontestiméspar
Iæsparamères
maæmels.
los d'éclosionainsiqueleseffetsaléaoiresdespèreset grand-phes
'varus'
et "cow-boy"ont
de type
t.esrésultatsobtenusmontrentquelesdéformations
uneapproche
bayésienne.
génétique
un déterminisme
fès proche.b dr;gréde gravitéde la maladiepeutêtrenégligé.
Introduction
du pouletde chair se sontaccompagÉsde
Les pog1èsspectaculairas
réaliséssur la vitessede croissance
dit des"PatlesTordtres".Celui+i enEaînerme
du syndrome
I'apparitionde houbleslocomoteurs
et notamment
qtt
lmeaugmentation
dela mortalitéet un tauxdesaisieæcrii.Quaf,eéhdesseulement
baissedeperformance,
génétiqræs
de ce syndrome: cellesde llstmann et Flock QnD,
étéconwréesà I'estimationdesparamèlres
et llarlou (1984).Aucunene distingueles fois
Leenstaet al. (1984), M€rceret Hill, (1984)et Sor€nsen
I'objectifdenotre
(valgus,varusoucow-boy)décritesparIætenieretNys(1992).Enconséquence,
déformations
préciser
lesliaisons
et de
génétiques
decesûoisdéformations
étudeestd'estimer,sexeparsexe,lesparamères
génétiques
enFeles formeslégèreset grayesde chacuned'entreelles.
Matériel et Méthodes
de tlpe chair.Pendanttroutela
Les donnéessontrecueilliessur desanimauxde deuxligréescommeiciales
périoded'élevage,les animauxsontplæésau rcl et répartisselonla lignéedans14 ou 1l lots d'élevages
différcnts.Dansla pemière ligrée, l'étudeptrte sur l42g animauxissusde 111pèreset 76 grand-pèrc.s
animaux
mat€rnels.Iæs
maternels
srn8.164animauxissusde94 pèraset 7l grand-pèr€s
et, damla deuxièrne,
parlæterrieret Nys
pnoposés
individrællement
et classés,
enseréférantarx critèrres
sontexaminés
à 6 semaines
(1992),en sain,nalgus,varusou cow-boy.
parcatégorie
lesnombrestotauxd'observations
Deuxdéfautsnepouvantêfe mesurés
simulanément,
(définieoommeunecombinaison
de niveauxde variablesexplicativesdu
de réponseet par sous-population
modèle)suiventunedisfibution multinomiale.L'analysede ce typede donnéessort du cadreclassiquedes
avecfonctionde lien logistique
méthodeslinéaires.Nousavonsdonc utilisé un modèlelinéairegénéralisé
défannations,
la sensibilitéauxdifférenæs
multinomial.L'objectif decetteétudeétantd'analyserconjoinæment
durappoltente la probabilité
logarithme
pourchaquepathologie
nousconsidérons
et chaqrcsous-populuion,le
du logit va ônc
la maladieet celledercsærsain.Cerapportestappelélogit Uneaugmentatiott
de déclencher
auxcodes
ptlrologiquesconespondent
sesclass€s
dansle sensd'uneplusforteseruibilité.Selonlesanalyses,
de ces
debasedéfinisau seindu syndrome"pattestordues"(valgus,ymn ou cow-boy)ou à dessubdivisions
Le modèled'explicationdeslogitstientcompædes
mêmescatégories
en fonctionde la gfavitédu symptôme.
desanimaux
despèreset gand-pèresmatemels
effetsfixésdu lot d'éclosionsurleslogib ef deseffetsaléatoircs
mesurés.
par le modede
u sontestimésen utilisantuneapprochebayésienne
Iæs effetsfixés b et génétiques
la densitéconjointea posterioridu vecteru0 = ([', u'). Trouvercemoderevientà égalersadérivéeà zéro.]vlais
155
celle-ci n'est pas linéaire en 0. Un atgaithme itératif de Newton-Raphsona donc été utilisé. Pour un jeu de
paramèhesde dispersiondonné,les itérationssur les paramèfresde position sont poursuiviesjusqu'à ce que la
différence moyenneentre deux itérationssuccessivessoit inférieure à l0ro' Iæs paramètresde dispersionsont
estiméspar la Métlrodede Maximum de Vraisemblarrcelvfarginale(MWD (Foulley et al., 1987).Cetteméthode
correspondau REML dansle casde donnéesnormales(Foulley et al., 1987)maiselle entrafnede lourdscalculs
infumatiques. Van Raden et Jung (1988) ont proposé, dans le caôe du modèle linéaire, d'utiliser une
appoximæion du RE\,IL diæ "tilde-hat' pour I'estimationdesparamèr,asde dispersion.Celle+i rÉduitfqtement
les co{itsde calcul : elle requiertuniquementI'inversionde matricesde taille trs réduite(ici, (c-l)x(c-l), où
c est le nombrede catégoies considérées).
Les paramètresgénétiquesdes trois déformationssont d'abord estiméssexe par sexe dans les deux
lignées avec un modèle 'pèrc et grand-Sre" et I'appoximation "tilde-hat". Iæs itérations génétiquessont
poursuiviesjusqu'à ce que la différencemoyenneenFedeux itérationssuccessivessoit inférieure à l0r0'. Puis
les paramèhessont estimésen distinguantles déformationslégèreset gnves. Cetteanalysea été restreinteaux
mâles du fait de la faible incidencedes défautsgaves chez les femelles.Cetæanalyseportant sur un total de
six carætères,desdifficultés de convergenceont été rencontréesavecle tilde-hat Nous avonsdoncchoisi, pour
cetteapplication,d'estimerles composantes
de la variancepar le Maximum de Vraisemblarneldarginate(MVM)
avec un algcithme de type EM. Cere méthodea oommedésavantageune vitessede convergencelente, mais
garantitconhairementau tilde-hat une estimationdéfrniepositive de G. En raisonde coûtsde calcul imporans,
cetteanalysea étéconduiæen considérantun modèlestatistiquesimplifié, danslequel les effets génétiquessont
réduis aux effets pères (supposésnon apparentésdans ce cas particulier). Les itérations génétiqræssont
poursuiviesjusqu'à ce que la différencemoyenneentredeux itérationssuccessives
soientinférieuresà 2.10e.
Résultats
Il ressortde I'analyse réaliséeen utilisant un modèle "père et grand-pèrematernel"et en distinguantmâleset
femelles que tous les défauts sont héritablesdans les deux sexes.Pour les valgus, les héritabilités estimées
apparaissentsimilaires dans les deux sexes.Elles sont, respectivementchez les mâleset les femelles, & O.27
et 0.28 dans la lignée A et de 0.37 et0.4 dansla lignée B. Iæs estimationsdes héritabilités des déformations
de type cow-boy et vanrs sont plus variables.L'tréritabilité du cow-boy est forte et varie de 0.50 à 0.69, à
I'exception des fernellesde la lignée B pour lesquellesI'héritabililé estde0.22. L'héritabilité du varusvarie de
0.18 à 0.45 selonla lignéeet le sexe.
Les résultatssouligrent égalementI'existenced'une corélation génétiquefortementpositive entre
"vanrs' et "cow-boy". Dans la lignée A, cetle estimationvaut 0.75 dansles 2 sexes; dansla lignée B, elle vaut
0.80 et 0.71 pour les mâleset femellesrespectivement. Iæs liaisonsgénétiquesentrele valguset les deux autres
déformationsvarient selon le sexe.Chez les femellesla sensibilitéau valgus est négativementcorréléeavec lia
sensibilitéau varus : les estimationsde la corrélationgârétiqræsont de - 0.52 dansla ligrée A et de - 0.54 dans
la lignée B. I.es corrélationsgénétiquesenre valgus et cow-boy sont hès faibles dans ce sexe(- 0.13 dansla
lignéeA et 0.ll dansla lignéeB). Chezles mâlesde la lignéeB, valguset yanrssontpositivementcorrélés(r.
de 0.50) ; il en est de mêmedes valgus et cotv-boy (r. de 0.53). Chez le.smâlesde la lignée A, la corrélation
géttétiqueentre valgus et cow-boy est toujours psitive (0.28), celle entre valgus et van$ légèrementnégative
({.0e).
L'héritabilité desdéfautssévèresest plus élev& que celle desdéfautslégers.Ces différencessont plus
marquéespour les défmnrationsde t1ryevalguset cow-boy. L'héritabilité du valgusgraveest, dansles 2 lignées
rcspectivement,
de 0.39 et 0.53, celle du valguslégerde 0.09 et 0.18.Pour le cow-boygrave,elle est de l.l3
et 0.95 dansles deux lignéeset pour le cow-boy légerde 0.43 et 0.61.Par ailleurs,cetteéhrdemonhe I'existence
d'une forte corrélationgénétiqueenhe les formeslégèreset gravesde chaquedéformation.Cescorélations sont
estimées(respoctivementdansles lignéesA et B) à 0.91 et 0.96 pour le ralgus,0.95 et 0.74 pour le varus et
0.88 et 0.73 pour Ie cow-boy.
Discnssion
Les déformationséhdiées ici ne peuventêtre considér,ées
c(mme des caractèresordonnés.Le modèle à seuil
développépar Gianola et Foulley (1983) ne s'applique pas à c€ cas. hr conre le modèle logistique linéaire
multinomial convient à des donnéesdiscÈtes rnn ordonnées.lvlais si de nombreusesapplicationsdu modèleà
seuil avec un modèle mixte ont été décritesdans la littératue (Foulley et N[anfredi, 1991), I'utilisation d'un
156
modèlelogistiqueest rare.A noFeconnaissance
du moins,seulGianola(1980)a utilisé unetransformation
logistiquepourétudierdesdonnées
polyûomiques
discrèiesnonordonnées
dansle casd'un modèlemixæ.Mais
les logis considééscorespondent
auxrapportsdeseffectifsobsenrés
et nonaux rapportsde probabilités.
Ia
qualié desestimations
obtenues
avecnoEeméthode(expriméeen termed'unepart d'&araentremoyennedes
estimations
et valeurintroduitedansla simulation,de variancedesestimations
d'autreprt) a étévérifiéepar
simulationssur deuxcarætèrespour différentesvaleursd'incidenceet de pramètresgénétiques
(Le BihanDuval,195). En particuliexles estimations
sontpeuou pasbiaiséaslasque les incidences
sontsuffis:mt€s.
Læshéritabilitésdeshois déformations
apparaissent
élevês maisil est délicatde les compareraux
résultatsde la litérature. Très peu de travauxont êtêconsærésà l'éûde du déærminisme
génétiquedes
différentstypesde défautsd'aplomb.Ceux-ciétaientdephs le plussouventconfondus
dansun seulcarætère.
La seuleexceptionsembleêtrel'étudede lvferceret Hill (1984)qui distinguentles angulations
en valguset
vanrs.Ceux-citavaillent sur plus de 25.000poulersmâIeset femellesissusde 3 lignées.Iæs pramères
géttétiques
de cesdeuxdéformations,
ainsi qued'auûesdéfautsdu squelettasontestimésà la fois par une
méthodelinéaire et la méthodedes "hobands" de Falconer(l%5). La moyennede leurs estimations
d'héritabilitéest&,0.22 pourle valgusà de 029 pourle varus.Cesvaleurssontun peuplus faiblesqueles
nôtesmaisobtenuss
surdeslignéesdifférenæs
et avecd'aubesméthodes
Lescorélationsgénétiques
d'analyse.
ente vanrset corv-by sontélevées.
génétiques
Uneællesimilitudedesdéterminismes
decesdeuxdéformations
n'estguèresurprenante
carcesdeuxdéfautssontcliniquement
etépidémiologiquement
rès similaires.Parcontne,
le signede la corrélæiongénétique
entrevaruset les deuxautresdéformations
peutvarieravecle sexe.Pour
I'instantdu moins,alrcuneinterprétation
biologiquenepeutêtredonnéeà ce phénomène.
It pounaitêtredû au
hasardd'échantillonnage
orrà desdifférences
génétique
de déterminisme
enfe sexes.
PourchaquedéformationI'héf,itabilitéde la fannelégèreestplusfaiblequecellede la formegrave.
Cesdifférencessontimpatanæspourla déformation
de t1çevalgusdansles 2 lignéeset pourla déformation
de typecow-boydansla lignéeA. ta plusfaiblehéritabilitédesfanneslégèresestæs probablement
dueà des
confusionsentreanimauxsainset légèrement
par
aÉeints.Ceserreusde notationssontsansdouæaggravées
la tendance
du notateurà appliquerunenotationtrèssévère.Dansla pésenæétude,lescorélationsgénétiques
estiméesente les formeslégèreset gravessontÈ.s élevées.Celajustifie le fait de considérerles animanx
légèrementafieintscommemaladeset de confondreles deu formesde la maladie.Regrouperces deux
catégories
réduitle nombrede sors+lasses
présentant
desincidences
Pourchæunedesdéformations
extrêmes.
I'héritabilitéestiméesurl'échellecontinueen regoupantlesformeslégèreset gnvesestdeplts assezélevée.
Conclusion
Cespremiersrésultatsmonhentqu'aumoinsle valgusderrraitêtredistinguédesdeuxautresdéformations.
Il
sembleen effet qu'utrcsélectionbaséesurle seulcritèrrede la pésence(ou absence)
de roubleslocomoteurs
réduiraitles valgusen raisonde leur incidencepépondéranæ.
MaislesconsQuences
surI'incidencedesvanrs
ou cow-boypourraientêre faiblesvoircdéfavaables
du fait desconélationsgélrétiquas
négatives
estimées
chez
les femelles.hr conberegrcuperv:rruset cow-boypeutêneenvisagé.
Iæurfr{uence cumuléeestprochedu
l0 7o,ce qui amèned'aprèsnossimulationsà unemeilleueprécisiondesestimations.
Référenccs
Falconer
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