Master 1 *** UEs COMMUNES - Bioingénierie

Master 1
INGENIERIE ANALYTIQUE EN NUTRITION ET SANTE
*** UEs COMMUNES ***
1. SCIENCES DE L’INGENIEUR 2 – UM7GN1M – (40h cours, 24h TD, 16h TP, 6 ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Connaissance de l’Entreprise-Techniques de Communication
Objectifs/généralités :
Préparer l’étudiant à l’insertion en entreprise.
Cours, enseignements théoriques:
L’intégration personnelle dans l’entreprise, législation et droit du travail, les ressources humaines, les types de
management, la communication dans l'entreprise, les relations asymétriques et symétriques, les relations avec la
hiérarchie. L’intégration personnelle dans l’entreprise, législation et droit du travail, les ressources humaines, les
types de management, la communication dans l'entreprise, les relations asymétriques et symétriques, les relations
avec la hiérarchie.
Les étudiants du parcours type « Ingénierie analytique en nutrition et santé » suivront un enseignement
supplémentaire sur la qualité et réglementation en entreprise (connaissance des divers aspects de la qualité en
analyse et en production : métrologie, normes, audits, HACCP)
Enseignements dirigés :
Rédaction de CV – Lettre de motivation
Enseignements pratiques :
Techniques de recherche de stage
Enseignants Responsables :
Pierre GAVARD (PAST)
[email protected]
05 61 06 58 26
Laboratoire GAVARD CONSEIL 8 impasse Saint Jacques 31170 TOURNEFEUILLE
Equipe Pédagogique :
Pierre GAVARD- Rose-Marie GOURDOU-Bernadette ALIA-Dominique GUILHEM – Laurent CLARAC (Responsable Qualité
sté BIOQUAL)
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle Partiel
30
1ère Session
Contrôle Terminal
70
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
1
2. ANALYSE, TRAITEMENT ET INTERPRETATION DES DONNES EN BIOLOGIE – UM7GN2M – (30h cours, 30h TP, 6
ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Données Biologiques – Représentation –Analyse-Interprétation
Objectifs/généralités :
Poser les problèmes à étudier et analyser des données qualitatives et quantitatives en biologie: choix des méthodes,
mise en œuvre d'analyses à l'aide d'un logiciel de représentation et de traitement des données biologiques,
interprétation, rédaction des conclusions.
Cours, enseignements théoriques, enseignements dirigés
Description d'un jeu de données biologiques : représentations graphiques, paramètres des distributions,
échantillonnage, contrôle de qualité.
Hypothèses en biologie et rôle du test d'hypothèses statistiques.
Comparaisons d'échantillons (méthodes paramétriques et non-paramétriques): buts, conditions d'utilisation,
principe, mise en œuvre.
Liaison entre deux caractères.
Plans expérimentaux.
Sensibilisation aux analyses de données biologiques multivariées.
Enseignements pratiques :
Exercices pratiques illustrant les différents chapitres du cours avec et sans logiciel de traitement des données.
Préparation et rédaction d'un dossier sur un exemple expérimental.
Enseignant Responsable :
[email protected]
05 61 28 51 33
Laboratoire Comportement et Ecologie de la Faune Sauvage, INRA BP 52627 31326 Castanet Tolosan cedex
Equipe Pédagogique :
Stéphane AULAGNIER
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle Partiel
100
1ère Session
Contrôle Terminal
0
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
2
3. PROJET EXPERIMENTAL - UM8GN1M (60h TP, 3 ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Techniques analytiques séparatives, validation de méthodes, présentations écrite et orale de projets
Objectifs/généralités :
Mise en œuvre pratique du plan d’expérimentations élaboré en UM7GA1M, en vue d’acquérir une expertise dans la
manipulation d’appareils analytiques courants dans les laboratoires d’analyses agro-alimentaires et
pharmaceutiques. Présentations écrite et orale de projets en binôme.
Enseignements pratiques :
Réalisation d’une étude à partir de sujets d’études proposés par l’équipe pédagogique, par binôme, en cohérence
avec le parcours type et le projet professionnel.
Etude bibliographique : intégration de banques de données bibliographiques, lecture et interprétation d’articles.
Elaboration d’un plan de manipulation. Présentation écrite et orale du projet.
Enseignants Responsables :
Eric ESPINOSA
[email protected]
05 62 74 83 04
INSERM U563 CPTP CHU PURPAN BP3028 31024 Toulouse Cedex
Annick GRAZIANA
[email protected]
05 62 19 35 36
Pôle de Biotechnologie Végétale; UMR5546 BP 42617 Auzeville 31326 Castanet Tolosan Cedex
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH
[email protected]
05 61 17 55 44
IPBS – CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex
Equipe Pédagogique :
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH - Eric ESPINOSA - Jean-Noël GENTHON - Annick GRAZIANA - Anne LEMASSU Valérie PACQUIT - Arlette SAVAGNAC – Christophe JACQUET – Pascal LEBOURGEOIS
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle Continu
20
1ère Session
Contrôle Terminal
80
Total
100
2ème Session
Contrôle Continu Contrôle Terminal
20 (reporté)
80
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
3
4. STAGE – UM8GN2M – (5 à 7 mois, 15 ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
STAGE EN ENTREPRISE
Objectifs/généralités :
Réalisation d’une mission au sein de l’entreprise, proposée par le maître de stage et validée par l’équipe
pédagogique. Suivi assuré par le tuteur universitaire.
Enseignants Responsables :
Eric ESPINOSA
[email protected]
05 62 74 83 04
INSERM U563 CPTP CHU PURPAN BP3028 31024 Toulouse Cedex
Annick GRAZIANA
[email protected]
05 62 19 35 36
Pôle de Biotechnologie Végétale; UMR5546 BP 42617 Auzeville 31326 Castanet Tolosan Cedex
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH
[email protected]
05 61 17 55 44
IPBS – CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex
Equipe Pédagogique :
Christophe CAZAUX-Valérie COTELLE-Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH-Eric ESPINOSA- Pierre GAVARD-Annick
GRAZIANA-Michelle GUE-Pascal LE BOURGEOIS-Anne LEMASSU-Valérie PACQUIT - Alain PERIQUET- Soizic ROCHANGE
Modalités de contrôle des connaissances
Stage en entreprise
Rapport écrit
Présentation orale
Contrôle Continu
40
-
Contrôle Partiel
-
Contrôle Terminal
30
30
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
4
5. LV1 ANGLAIS – UM8GN3M – (24h TD, 3 ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Anglais de spécialité : LANSAD
Objectifs/généralités :
Développer les compétences indispensables en langue vivante afin d’intégrer au mieux la voie professionnelle.
Cours, enseignements théoriques, enseignements dirigés :
Préparation à la prise de parole en public. Recherche et compréhension de documents sur le domaine large de
spécialité et de communication .Niveau européen B2.
Enseignant Responsable :
Philippe MURILLO
[email protected]
05 61 55 69 34
UFR Langues Université Paul Sabatier Toulouse 3, 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex4
Equipe Pédagogique :
P. MURILLO, F. LAMARQUE
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle Continu
50
1ère Session
Contrôle Terminal
50
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
5
6. LV2 (ALLEMAND-ESPAGNOL-RUSSE) – UM8GN4M – (24h TD, 3 ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Allemand, Espagnol, Russe
Objectifs/généralités :
Développer les compétences indispensables en langue vivante afin d’intégrer au mieux la voie professionnelle.
Cours, enseignements théoriques, Enseignements dirigés :
Préparation à la prise de parole en public. Recherche et compréhension de documents sur le domaine large de
spécialité et de communication .Niveau européen B.
Enseignant Responsable :
Philippe MURILLO
[email protected]
05 61 55 69 34
UFR Langues Université Paul Sabatier Toulouse 3, 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex4
Equipe Pédagogique :
P. MURILLO, Muriel COMET, Jacqueline RUSSON-Serge ARBIOL
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle Partiel
50
1ère Session
Contrôle Terminal
50
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
6
*** UEs SPECIFIQUES ***
1. TRAVAUX PRATIQUES A INITIATIVE PERSONNELLE – UM7GA1M – (25h cours, 55h TP, 6 ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Techniques analytiques séparatives, plans d’expériences, étude bibliograhique, agroalimentaire, pharmaceutique
Objectifs/généralités :
Elaboration et réalisation d’un plan d’expérimentations pour résoudre un problème analytique dans le domaine
agroalimentaire ou pharmaceutique et à partir de données bibliographiques recherchées par l’étudiant.
Cours, enseignements théoriques et enseignements dirigés :
Enseignements théoriques des plans d’expérience et de la validation de méthodes.
Réalisation d’une étude analytique dans le domaine agroalimentaire ou pharmaceutique. Les sujets d’études sont
proposés par l’équipe pédagogique et renouvelés chaque année (par HPLC, CPV, électrophorèse capillaire ...)
A partir du plan de manipulation élaboré à partir d'une étude bibliographique, consultation de catalogues de
produits et de matériels, élaboration d’une liste d’achat permettant la réalisation du projet, évaluation du coût du
projet.
- Présentation écrite et orale de l’étude.
Initiation à la qualité et la métrologie dans un laboratoire.
Enseignements pratiques :
Travaux pratiques à initiative personnelle à partir du plan de manipulation élaboré par l’étudiant. Développement
de l’autonomie sur un appareil analytique (HPLC, GC-MS, Electrophorèse capillaire) et prise d’initiatives. Application
de plans d’expériences. Présentation orale de l’avancée du travail devant le groupe.
Enseignants Responsables :
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH
[email protected]
05 61 17 55 44
IPBS – CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex
Anne LEMASSU
[email protected]
05 61 17 55 68
IPBS – CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex
Equipe Pédagogique :
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH - Anne LEMASSU – Arlette SAVAGNAC – Jean-Noël GENTHON - Florence BENOITMARQUIE - S. CHEVOLLEAU (IE INRA)
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle Continu
20
1ère Session
Contrôle Terminal
80
Total
100
Contrôle Continu
20
2ème Session
Contrôle Terminal
80
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
7
2. TOXICOLOGIE – SECURITE DES ALIMENTS – REGLEMENTATION – UM7GA2M – (40h cours, 20h TD, 20h TP, 6
ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Toxicologie-Toxicocinetique-Expertise-Sécurité des aliments-Identification des dangers et gestion des risques.
Objectifs/généralités :
Préparer à l’expertise toxicologique notamment dans le secteur agroalimentaire – Donner les bases de
Pharmacologie et de Toxicologie fondamentales.
Cours, enseignements théoriques:
Absorption – Distribution – Métabolisme – Elimination – Modes d’action des toxiques –Organes cibles –Identification et
caractérisation des dangers . Analyse et gestion des risques dans un contexte de Sécurité des Aliments. Additifs et
auxiliaires de technologies-Matériaux au contact des denrées alimentaires – Arômes et colorants alimentaires –
Contaminants et produits néoformés. Produits phytosanitaires.
Enseignements dirigés :
Etudes de cas concrets : dioxines – Polychloroliphényles, Hydrocarbures aromatiques polycycliques- Acrylamide Produits phytosanitaires
Exemples de gestion de crise. Etudes des principaux textes réglementaires liés à l’utilisation des additifs, des
auxiliaires de technologies, des matériaux au contact des denrées alimentaires et à la présence de contaminants
dans les aliments.
Enseignements pratiques :
Quantification par diverses méthodes analytiques (HPLC, Immunoenzymologie etc…) de divers contaminants et
additifs alimentaires (pesticides, antioxydants, colorants, etc).
Enseignants Responsables :
Alain PERIQUET
[email protected]
05 61 55 86 84
IUP BIOINGENIERIE –Bat U3 Université Paul Sabatier Toulouse 3, 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex4
Equipe Pédagogique :
Alain PERIQUET – Pierre GAVARD – Vincent HEUSLER - Frank PASTA
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle
Continu
20
1ère Session
Contrôle
Contrôle
Partiel
Terminal
30
50
Total
100
Contrôle
Continu
2ème Session
Contrôle
Contrôle
Partiel
Terminal
30
70
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
8
3. CONTROLE MICROBIOLOGIQUE DANS L’AGROALIMENTAIRE – UM7GA3M – (30h cours, 18h TD, 32h TP, 6
ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Microbiologie alimentaire, Biologie, Physiologie, Génétique des microorganismes-Technologie microbienneTechniques de contrôle.
Objectifs/généralités :
Cet enseignement concerne principalement l’aspect microbiologique de la sécurité et qualité alimentaire dans les
industries agroalimentaires, mais couvre également certains aspects du diagnostic microbiologique en bactériologie
médicale et dans l’environnement.
Cours, enseignements théoriques, enseignements dirigés :
La biologie, physiologie et génétique des microorganismes présents dans les procédés d’élaboration des aliments
sont présentées : flore à incidence technologique (bactéries lactiques, levures,...), flore d’altération, bactéries
pathogènes (Listeria, E. coli, Salmonelles, Staphylocoques, Clostridium) et microorganismes recombinants (nature,
impact et traçabilité des OGM). Une part importante de l’enseignement est consacrée au contrôle microbiologique
industriel : principe de base, méthodes conventionnelles de microbiologie pour la détection et l’identification des
microorganismes (diagnostic phénotypique), techniques physico-chimiques (spectrophotométrie, impédancemétrie,
ATPmétrie…), techniques immuno-enzymatiques (ELISA), nouvelles technologies de diagnostic rapide dérivées de
l’ingénierie génétique : hybridation moléculaire (préparation et marquage des sondes, FISH, dot blot inverse, puces
à ADN), amplification génique (PCR qualitative, PCR quantitative en temps réel) et typage moléculaire à haute
résolution (RFLP, ribotypage, PFGE, RAPD, AFLP, MLST, PCR-D/TGGE, SSCP, etc...). Les principaux exemples
destinés à illustrer ces thèmes sont pris dans les différentes filières de produits alimentaires.
Enseignements pratiques :
Identification de souches bactériennes par analyse de restriction par électrophorèse (REA) et par polymorphisme de
taille de fragments de restriction (RFLP).
Identification de souches bactériennes par PCR aléatoire (RAPD).
Identification de souches bactériennes par électrophorèse en champ pulsé (PFGE).
Détection d’une contamination microbiologique (Entérobactérie) sur un produit laitier. Détection par amplification
PCR.
Détection de microorganismes chez les bovins par méthode ELISA
Enseignant Responsable :
Paul RITZENTHALER
[email protected]
05 61 33 58 25
LMGM – CNRS Bât IBCG –Université Paul Sabatier Toulouse 3, 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex 4
Equipe Pédagogique :
Paul RITZENTHALER – Pascal LE BOURGEOIS
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle
Continu
25
1ère Session
Contrôle
Contrôle
Partiel
Terminal
75
Total
Contrôle
Continu
100
25 (reporté)
2ème Session
Contrôle
Contrôle Terminal
Partiel
75 (dont 25
reportés)
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
9
4. SPECTROSCOPIE EN BIOCHIMIE – UM8GA1M – (26h cours, 22h TD, 12h TP, 6 ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Biochimie analytique quantitative et qualitative, spectrométrie de masse, spectroscopie infra-rouge, résonnance
magnétique nucléaire
Objectifs/généralités :
Acquérir les fondements des techniques utilisées pour la résolution structurale de molécules issues des domaines
pharmaceutiques et agroalimentaires. Mise en pratique, analyse de spectres de molécules et étude de cas concrets
par l’intervention d’industriels.
Cours, enseignements théoriques, Enseignements dirigés :
La spectroscopie appliquée à la biochimie analytique qualitative et quantitative : Spectrométrie de masse,
Spectroscopie infra-rouge, Résonnance magnétique nucléaire.
Aspects théoriques et analyse de spectres de molécules issues des domaines pharmaceutiques et agroalimentaires.
Enseignements pratiques :
Acquisition de spectres RMN et IR, traitement de données
Enseignants Responsables :
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH
[email protected]
05 61 17 55 44
IPBS – CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex
Anne LEMASSU
[email protected]
05 61 17 55 68
IPBS – CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex
Equipe Pédagogique :
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH-Anne LEMASSU-François COUDERC-Joëlle AZEMA- Yann PRIGENT- Laurent
DEBRAUWER (IR INRA)
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle Partiel
30
1ère Session
Contrôle Terminal
70
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
M1 Bioingénierie parcours Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
10