Master 1 *** UEs COMMUNES - Bioingénierie

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BIOTECHNOLOGIES MOLECULAIRES ET CELLULAIRES APPLIQUEES A
LA SANTE
Master 1
*** UEs COMMUNES ***
1. SCIENCES DE L’INGENIEUR 2 – UM7GN1M – (40h cours, 24h TD, 16h TP, 6 ECTS)
Contenu pédagogique :
Mots clés :
Connaissance de l’Entreprise-Techniques de Communication
Objectifs/généralités :
Préparer l’étudiant à l’insertion en entreprise.
Cours, enseignements théoriques:
L’intégration personnelle dans l’entreprise, législation et droit du travail, les ressources humaines, les types de
management, la communication dans l'entreprise, les relations asymétriques et symétriques, les relations avec la
hiérarchie. L’intégration personnelle dans l’entreprise, législation et droit du travail, les ressources humaines, les
types de management, la communication dans l'entreprise, les relations asymétriques et symétriques, les relations
avec la hiérarchie.
Les étudiants du parcours type « Ingénierie analytique en nutrition et santé » suivront un enseignement
supplémentaire sur la qualité et réglementation en entreprise (connaissance des divers aspects de la qualité en
analyse et en production : métrologie, normes, audits, HACCP)
Enseignements dirigés :
Rédaction de CV – Lettre de motivation
Enseignements pratiques :
Techniques de recherche de stage
Enseignants Responsables :
Pierre GAVARD (PAST)
[email protected]
05 61 06 58 26
Laboratoire GAVARD CONSEIL 8 impasse Saint Jacques 31170 TOURNEFEUILLE
Equipe Pédagogique :
Pierre GAVARD- Rose-Marie GOURDOU-Bernadette ALIA-Dominique GUILHEM – Laurent CLARAC (Responsable Qualité
sté BIOQUAL)
Modalités de contrôle des connaissances
Contrôle Partiel
30
1ère Session
Contrôle Terminal
70
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
M1 Bioingénierie parcours Biotechnologies Moléculaires et Cellulaires Appliquées à la Santé
IUP Bioingénierie - UPS Toulouse III - Année 2008/2009
Total
100
1
2. ANALYSE, TRAITEMENT ET INTERPRETATION DES DONNES EN BIOLOGIE – UM7GN2M – (30h cours, 30h TP, 6
ECTS)
Mots clés :
Données Biologiques – Représentation –Analyse-Interprétation
Poser les problèmes à étudier et analyser des données qualitatives et quantitatives en biologie: choix des méthodes,
mise en œuvre d'analyses à l'aide d'un logiciel de représentation et de traitement des données biologiques,
interprétation, rédaction des conclusions.
Cours, enseignements théoriques, enseignements dirigés
Description d'un jeu de données biologiques : représentations graphiques, paramètres des distributions,
échantillonnage, contrôle de qualité.
Hypothèses en biologie et rôle du test d'hypothèses statistiques.
Comparaisons d'échantillons (méthodes paramétriques et non-paramétriques): buts, conditions d'utilisation,
principe, mise en œuvre.
Liaison entre deux caractères.
Plans expérimentaux.
Sensibilisation aux analyses de données biologiques multivariées.
Exercices pratiques illustrant les différents chapitres du cours avec et sans logiciel de traitement des données.
Préparation et rédaction d'un dossier sur un exemple expérimental.
Enseignant Responsable :
[email protected]
05 61 28 51 33
Laboratoire Comportement et Ecologie de la Faune Sauvage, INRA BP 52627 31326 Castanet Tolosan cedex
Stéphane AULAGNIER
Contrôle Partiel
100
1ère Session
Contrôle Terminal
0
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
Total
100
2
3. PROJET EXPERIMENTAL - UM8GN1M (60h TP, 3 ECTS)
Mots clés :
Techniques analytiques séparatives, validation de méthodes, présentations écrite et orale de projets
Mise en œuvre pratique du plan d’expérimentations élaboré en UM7GA1M, en vue d’acquérir une expertise dans la
manipulation d’appareils analytiques courants dans les laboratoires d’analyses agro-alimentaires et
pharmaceutiques. Présentations écrite et orale de projets en binôme.
Réalisation d’une étude à partir de sujets d’études proposés par l’équipe pédagogique, par binôme, en cohérence
avec le parcours type et le projet professionnel.
Etude bibliographique : intégration de banques de données bibliographiques, lecture et interprétation d’articles.
Elaboration d’un plan de manipulation. Présentation écrite et orale du projet.
Eric ESPINOSA
[email protected]
05 62 74 83 04
INSERM U563 CPTP CHU PURPAN BP3028 31024 Toulouse Cedex
Annick GRAZIANA
[email protected]
05 62 19 35 36
Pôle de Biotechnologie Végétale; UMR5546 BP 42617 Auzeville 31326 Castanet Tolosan Cedex
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH
[email protected]
05 61 17 55 44
IPBS – CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH - Eric ESPINOSA - Jean-Noël GENTHON - Annick GRAZIANA - Anne LEMASSU Valérie PACQUIT - Arlette SAVAGNAC – Christophe JACQUET – Pascal LEBOURGEOIS
Contrôle Continu
20
1ère Session
Contrôle Terminal
80
Total
100
2ème Session
Contrôle Continu Contrôle Terminal
20 (reporté)
80
Total
100
3
4. STAGE – UM8GN2M – (5 à 7 mois, 15 ECTS)
Mots clés :
STAGE EN ENTREPRISE
Réalisation d’une mission au sein de l’entreprise, proposée par le maître de stage et validée par l’équipe
pédagogique. Suivi assuré par le tuteur universitaire.
Eric ESPINOSA
[email protected]
05 62 74 83 04
INSERM U563 CPTP CHU PURPAN BP3028 31024 Toulouse Cedex
Annick GRAZIANA
[email protected]
05 62 19 35 36
Pôle de Biotechnologie Végétale; UMR5546 BP 42617 Auzeville 31326 Castanet Tolosan Cedex
Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH
[email protected]
05 61 17 55 44
IPBS – CNRS 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex
Christophe CAZAUX-Valérie COTELLE-Marie-Pierre BOUSQUET-DUBOUCH-Eric ESPINOSA- Pierre GAVARD-Annick
GRAZIANA-Michelle GUE-Pascal LE BOURGEOIS-Anne LEMASSU-Valérie PACQUIT - Alain PERIQUET- Soizic ROCHANGE
Stage en entreprise
Rapport écrit
Présentation orale
Contrôle Continu
40
-
Contrôle Partiel
-
Contrôle Terminal
30
30
Total
100
4
5. LV1 ANGLAIS – UM8GN3M – (24h TD, 3 ECTS)
Mots clés :
Anglais de spécialité : LANSAD
Développer les compétences indispensables en langue vivante afin d’intégrer au mieux la voie professionnelle.
Cours, enseignements théoriques, enseignements dirigés :
Préparation à la prise de parole en public. Recherche et compréhension de documents sur le domaine large de
spécialité et de communication .Niveau européen B2.
Philippe MURILLO
[email protected]
05 61 55 69 34
UFR Langues Université Paul Sabatier Toulouse 3, 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex4
P. MURILLO, F. LAMARQUE
Contrôle Continu
50
1ère Session
Contrôle Terminal
50
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
Total
100
5
6. LV2 (ALLEMAND-ESPAGNOL-RUSSE) – UM8GN4M – (24h TD, 3 ECTS)
Mots clés :
Allemand, Espagnol, Russe
Développer les compétences indispensables en langue vivante afin d’intégrer au mieux la voie professionnelle.
Cours, enseignements théoriques, Enseignements dirigés :
Préparation à la prise de parole en public. Recherche et compréhension de documents sur le domaine large de
spécialité et de communication .Niveau européen B.
Philippe MURILLO
[email protected]
05 61 55 69 34
UFR Langues Université Paul Sabatier Toulouse 3, 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex4
P. MURILLO, Muriel COMET, Jacqueline RUSSON-Serge ARBIOL
Contrôle Partiel
50
1ère Session
Contrôle Terminal
50
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
Total
100
6
*** UEs SPECIFIQUES ***
1. VIROLOGIE APPLIQUEE ET MEDICALE – UM7GT2M – (30h cours, 20h TD, 30h TP, 6 ECTS)
Mots clés :
Virus à ARN/ADN – Diagnostic virologique-Physiopathologies des infections virales-Vaccins viraux-Les Virus comme
vecteurs de transfert de gènes.
L’objectif de cet enseignement est de traiter les virus d’intérêt médical pour l’homme, à la fois sur le plan
fondamental, en décrivant les cycles viraux et sur le plan médical en décrivant les méthodes de diagnostic
virologique, les mécanismes de physiopathologie de l’infection, et le traitement avec les vaccins et les antiviraux.
L’ensemble de cet enseignement est illustré par des travaux pratiques et des travaux dirigés.
COURS/ENSEIGNEMENTS THEORIQUES :
Les virus : structure et taxonomie virale : description des principales familles de virus d’intérêt médical et
vétérinaire.
Les méthodes de purification et de caractérisation des virus
Les méthodes de diagnostic virologique
Interactions virus –cellule et virus-virus
Pathogènèse des infections virales ( Picornaviridae, Hépadnaviridae, Adénoviridae, Papillomaviridae, Retroviridae)
Défense de l’organisme contre les infections virales
Les vaccins antiviraux
Les molécules antivirales
Les vecteurs viraux et applications
TD/ENSEIGNEMENTS DIRIGES :
Les TD seront réalisés sous forme d’analyses d’articles illustrant le cours.
TP/ENSEIGNEMENTS PRATIQUES : Méthodes de diagnostic virologique, Titration de baculovirus, Etudes du tropisme
du virus VIH-1, Etudes de modes d’action de la protéine Tait du virus VIH-1.
Techniques utilisées : ELISA, Electrophorèse, WB, Culture cellulaire, transfection cellulaire, coculture et suivi de la
formation de syncytia, titration des virus par la méthode des plages de lyse, production de la protéine Tat de VIH-1
sous forme de protéine de fusion avec la GST dans E coli, purification par affinité de la protéine Tat
Elmostapha BAHRAOUI (PU)
[email protected]
05 61 55 86 87
Immunovirologie EA 3038 Université Paul Sabatier Toulouse 3 Bât 4R3 118 Route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex
Elmostapha BAHRAOUI – Fabienne REYNE – Cécile MALNOU
Contrôle Partiel
30
1ère Session
Contrôle Terminal
70
Total
Contrôle Partiel
100
30
2ème Session
Contrôle Terminal
70
Total
100
7
2. MECANISMES D’ORGANISATION DE SURVEILLANCE ET D’INGENIERIE DU GENOME HUMAIN-TECHNIQUES DE
DIAGNOSTIC MOLECULAIRE - UM7GT3M – (24h Cours, 24h TD, 32h TP, 6 ECTS)
Mots clés :
Réplication et Réparation de l’ADN-Instabilité génétique. Cancérogénèse moléculaire et cellulaire. Médecine
moléculaire – Outils pronostiques et diagnostiques
Connaissance des mécanismes contrôlant la stabilité du génome, source de cibles anti-tumorales et de facteurs
pronostiques. Appréhender les processus de réparation de l’ADN cible des médicaments anti-tumoraux Connaissance des processus de thérapie génique et cellulaire anti-tumoraux
COURS/ENSEIGNEMENTS THEORIQUES ; TD/ENSEIGNEMENTS DIRIGES :
Organisation structurale et fonctionnelle du génome, mécanismes de réplication, réparation et recombinaison de
l’ADN, instabilité génétique et pathologies tumorales, thérapie génique.
TP/ENSEIGNEMENTS PRATIQUES :
Biologie moléculaire et biochimie de l’ADN (essais de réplication et réparation in vitro), tests cellulaires d’instabilité
génétique (mutagénèse, SCE, recombinaison). Manipulation de procédés moléculaires de diagnostic.
Christophe CAZAUX (PU)
[email protected]
05 61 17 59 61
IPBS – CNRS – UMR 5089 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex
Christophe CAZAUX - Pascal LE BOURGEOIS
Contrôle Continu
30
1ère Session
Contrôle Terminal
70
Total
100
2ème Session
Contrôle Terminal
100
Total
100
8
3. PHARMACOLOGIE FONDAMENTALE ET CLINIQUE - UM7GT1M – (32h Cours, 24h TD, 24h TP, 6 ECTS)
Mots clés :
Pharmacologie – Médicaments – Transduction du signal – Récepteurs - Métabolisme
Cette UE s’adresse uniquement aux étudiants de Master 1 IUP Bioingénierie.
Basé sur des exemples physiopathologiques, cet enseignement porte sur l'étude du mode d'action des médicaments,
de leur devenir dans l'organisme. La composition de l’équipe pédagogique permet d’aborder le sujet des
mécanismes fondamentaux jusqu’aux approches cliniques.
Cet enseignement est conseillé pour s’inscrire aux Masters 2R « Innovation pharmacologique », « Cancérologie » ou
« Physiopathologie » ou aux Master 2PRO « Biotechnologie, option Pharmacologie » ou « Métiers du Médicament » de
l’UPS ou formations équivalentes
COURS/ENSEIGNEMENTS THEORIQUES ; TD/ENSEIGNEMENTS DIRIGES :
- Molécules et paramètres pharmacologiques
- Stratégies expérimentales (modèles, toxines, mutagénèse, surexpression, ciblage, transgénèse...)
- Réception des signaux extracellulaires, systèmes membranaires et messagers intracellulaires
- Cibles intracellulaires des médicaments de la chimiothérapie
- Régulations et adaptations des systèmes de transduction (découplage, désensibilisation, contrôle transcriptionnel
de l’expression des gènes associés, mécanismes de résistance aux antitumoraux.)
- Traitements de l'hypertension artérielle et des cancers.
- Modes d’action des médicaments psychotropes et traitements des maladies neurodégénératives.
- Traitements des maladies métaboliques (Obésité, diabète, etc).
- Pharmacocinétique: Absorption, Distribution, Métabolisme, Elimination d'un médicament.
- Développement pré-clinique et clinique d'un médicament. Notions de pharmaco-économie et de
pharmacovigilance. Aspects
réglementaires de la mise sur le marché d’un médicament.
- Notion de toxicologie préclinique.
Etude des différentes étapes de pharmacologie expérimentale préliminaires aux études cliniques chez l'homme :
Evaluation de l'efficacité d'agonistes et d'antagonistes ; Etudes sur modèles membranaires et cellulaires. Organes
isolés et intégration à l'animal.
Bernard FRANCES (PU)
[email protected]
05 61 55 63 36
UMR 5169 Bât IVR3b3
UPS/CNRS, 118 route de Narbonne 31062 TOULOUSE cedex
Bernard FRANCES, Philippe. VALET, Virginie. BOURLIER, Etienne CHATELUT, Jean-Michel SENARD, Catherine.
MULLER-STAUMONT
Modalités de contrôle des connaissances:
Cours et TD
TP
CC
10
1ère Session
CP
CT
20
60
10
Total
80
20
CC
10
2ème Session
CP
CT
20
60
10
Total
80
20
9
4. MANIPULATIONS DE CELLULES ANIMALES – UM8GT1M – (6h Cours, 4h TD, 50h TP, 6 ECTS)
Mots clés :
Cultures primaires, définies, indéfinies-Prolifération – Mort cellulaire – Activation Cellulaire – Transfection
Maîtrise des principales techniques de manipulations de cellules animales au travers de la mise en place de cultures
primaires et de cultures indéfinies.
COURS/ENSEIGNEMENTS THEORIQUES :
Aspects théoriques de la culture cellulaire
TD/ENSEIGNEMENTS DIRIGES :
Analyses de données (cytométrie de flux- traitement d’images)
Mise en place de cultures primaires (ex : explants de peau, moelle osseuse, cellules péritonéales) et de culture de
cellules immortalisées (adhérentes et en suspension), appréciation de l’effet de certains paramètres sur la culture
(facteurs de croissances, poisons…);
- Mesure de la survie, de la prolifération et de la mort cellulaire (cytométrie en flux, microscopie à fluorescence,
test biochimiques et métaboliques)
- Evaluation d’une activité cellulaire et de l’effet de molécules actives ;
- Transfection de cellules.
Eric Espinosa (PRAG)
[email protected]
05 62 74 83 84
INSERM U563 CPTP bat A CHU Purpan BP3028, 31024 TOULOUSE cedex
Eric ESPINOSA
Contrôle Continu
25
1ère Session
Contrôle Terminal
75
Total
Contrôle Continu
100
-
2ème Session
Contrôle Terminal
100
Total
100
10

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