Vorlesung 4
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Vorlesung 4
Anaerobe Atmungen: NO3- Denitrifikation (zu N2), Nitratatmung, Ammonifikation (zu NH4+) MnO2 Manganreduktion FeOOH Eisenreduktion So Schwefelreduktion SO42- Sulfatreduktion CO2 Methanogenese (zu CH4), Homoacetogenese (zu Acetat) VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Stoffwechseltypen von Mikroorganismen Chemo / Phototroph Energiegewinnung (chemische Reaktion / Licht) Litho / Organotroph Elektronendonator (Dissimilation) (anorganisch / organisch) Auto / Heterotroph Kohlenstoffquelle (Assimilation) (CO2 / organisches Material) Photolithoautotroph Microcystis sp. (Cyanobakterium) Chlorella sp. (Grünalge) Chemoorganoheterotroph Escherichia coli Homo sapiens Nitrosomonas europaea Acidithiobacillus ferrooxidans Chemolithoautotroph VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Stickstoff-Kreislauf Ox.stufe des N NO3NO2N2 +V N-Assimilation: +III - Stickstofffixierung (endergoner Prozess) 0 NH4+ -III R-NH2 -III N2 + 3 H2 + 2H+ 2 NH4+ - Ammonifikation NO3- + 8 e- + 10 H+ NH4+ + 3 H2O VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Nitrifikation NO2- Präfix: Nitroz.B. Nitrobacter, Nitrococcus Präfix: Nitrosoz.B. Nitrosomonas Biomasse NH4+ NO3- N2-Fixierung N2 VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 oxisch anoxisch Nitrifikation Oxidation von Ammonium zu Nitrat Zweistufige Reaktion mit unterschiedlichen Organismengruppen. 1. Stufe: Oxidation des Ammonium zu Nitrit (Nitroso-) 2 NH4+ + 3 O2 2 NO2- + 2 H2O + 4H+ ∆Go‘ = -275 kJ/Reaktion Nitrosofikation, Nitrosomonas europaea 2. Stufe: Oxidation des Nitrit zu Nitrat (Nitro-) 2 NO2- + O2 2 NO3- ∆Go‘ = -76 kJ/Reaktion Nitrifikation, Nitrobacter winogradskyi VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Populationen Ammonium- und Nitrit- oxidierender Bakterien in Belebtschlammflocken. Zellen wurden mit 16S rRNASonden angefärbt. Blau: Ammonium-Oxidierer Rot: Nitrit-Oxidierer Aus Schramm et al. (1998) Appl. Environ Microbiol. 64:3480 ff VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Nitrifikation NO2- Präfix: Nitroz.B. Nitrobacter, Nitrococcus Präfix: Nitrosoz.B. Nitrosomonas Biomasse oxisch NH4+ NO3- anoxisch Nitrat-Ammonifikation z.B. Desulfovibrio NO2Denitrifikation “Anammox” anaerobe Ammoniumox. N2-Fixierung NO2- N2 VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Schwefelkreislauf S-Assimilation: Ox.stufe des S SO42S2O32So +VI H2S -II R-SH -II - assimilatorische Sulfatreduktion (endergoner Prozess) SO42- + 4 H2 + 2H+ +II 0 VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 2 ATP SO322 ADP H2S Vollständige Sulfidoxidation Atmungsprozess (O2 oder NO3-) (Schwefeloxidierende Bakterien, SOB) SO42oxisch anoxisch HS- Thiobacillus sp. (aerob) Thiomicrospira sp. (aerob oder NO3-) VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Unvollständige Sulfidoxidation Atmungsprozess (O2 oder NO3-) (So kann in den Zellen gespeichert werden) SO42S2O32- So oxisch anoxisch HS- VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Schwefeloxidierende Mikroorganismen: Archaea Acidianus sp. Sulfolobus sp. Bacteria Thiobacillus sp. Acidithiobacillus sp. Thiosphaera sp. Thiomicrospira sp. Thiomargerita sp. Thioploca sp. Achromatium sp. Beggiatoa sp. VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 SO42S2O32- So oxisch anoxisch Thiosulfatreduktion Schwefelreduktion, anaerobe Atmung (SRB, Schwefelreduzierer, Eisenreduzierer, Thiosulfatreduzierer) VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 HS-, FeS, FeS2 SO42oxisch anoxisch SO42S2O32- Anaerobe Sulfidoxidation, Photosyntheseprozess (Grüne und Rote Schwefelbakterien) So h·ν HS- Brock, 9th Ed. VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Chromatium okenii mit intrazellulären Schwefeltropfen (Schwefel-Purpurbakterium) Phototrophe Schwefelbakterien Im Hypolimnion des Dagowsee. Chlorobium limicola mit extrazellulären Schwefeltropfen (Grünes Schwefelbakterium) VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Thiosulfat- und Schwefeldisproportionierung “Anaerobe Gärung” SRB ATP ? S2O32- + H2O SO42- + HS- + H+ 4 So + 4 H2O SO42- + 3HS- + 5H+ oxisch anoxisch SO42- So HSS2O32VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 S2O32- SO32- So ADP 2 eATP H2S SO42- VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 SO42- HS- oxisch S2O32So anoxisch SO42FeS HS- Fe3+, MnO2 FeS2 So VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Schwefeloxidierer, aerob Sulfatreduzierer, anaerob Phototrophe S-Bakt., Schwefeloxidierer mit Nitrat Chemische Prozesse Dimethylsulfoniopropionat: compatible solute in Algen u.a. Abbauprodukt: u.a. Dimethylsulfid (DMS) leicht flüchtig, Oxidation in der Stratosphäre zu SO2 (saurer Regen) Kondensationsnukleus für Wolkenbildung (Anti-Greenhouse-Gas) Dimethylsulfoxid (DMSO) Oxidationsprodukt von DMS Elektronenakzeptor für anaerobe Atmung VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 MPA: Mercaptopropionsäure MMPA: Methylmercaptopropionsäure MSH: Monomethylsulfid DMSO: Dimethylsulfoxid VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Phosphorkreislauf PO43- R-PO42- Phosphor macht (normalerweise) keine Redoxänderung im Ökosystem durch. 4 HPO32- + SO42- + H+ Desulfotignum phosphitooxidans Nature (2000) 406:39 VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 4 HPO42- + HS- ∆Go‘= -364 kJ·mol-1 Eisen- und Mangan-Kreislauf Eisen- und Mangan reduktion Fe3+ Mn4+ Eisenoxidation Manganoxidation z.B. Geobacter, Shewanella z.B. Arthrobacter sp., Bacillus sp. Fe2+ Mn2+ VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Acidophile Eisenoxidierer Acidithiobacillus ferrooxidans Leptospirillum ferroxidans Metallosphaera sedula Neutrophile Eisenoxidierer Gallionella ferruginea Leptothrix discophora Links: Gallionella ferruginea, Oben: schematische Darstellung, unten: „Eisenstiele“ Rechts: Leptothrix sp., gewachsen auf Mn2+, zu erkennen die braunen MnO2-Ausfällungen. VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Assimilation ? Die meisten lithotrophen Mikroorganismen sind autotroph. VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 CO2-Fixierung meist über Calvin-Zyklus Für den Aufbau eines Moleküls Fructose-6-Phosphat werden benötigt: 6 CO2 18 ATP 12 NADPH (Elektronen) VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Problem: woher kommen die NADH für den Biomasseaufbau? Eo’ [mV] O2/H2O +820 Aerobe Atmung NO3-/N2 NO3-/NH4 +751 Denitrifikation +363 Nitratammonifikation MnO2/Mn2+ +390 Manganreduktion FeOOH +150 Eisenreduktion SO42-/HS- - 218 Sulfatreduktion So/HS- - 240 Schwefelreduktion Elektronen müssen gegen das thermodynamische Gefälle auf NADH übertragen werden. Reverser Elektronentransport NADH/NAD+ - 320 FADH/FAD + - 220 H+/H2 - 420 VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03 Übertragung von Elektronen von Mn2+ auf NADP ∆G '0 = − z ⋅ F ⋅ ( E Akz '0 − E Don '0 ) ∆G‘o = - 2 · 96,5 kJ·mol-1·V-1 ·( -320 mV – 390 mV) ∆G‘o = - 2 · 96,5 kJ·mol-1·V-1 · (-0,71 V) ∆G‘o = + 137 kJ Entspricht 3 ATP VL Mikrobielle Ökologie - Standorte und Prozesse, H.Sass, 04.11.03