OFFRE D`EMPLOI Ingénieur de développement génie logiciel

OFFRE D’EMPLOI Ingénieur de développement génie logiciel IRISA/INRA Rennes – Equipe GenScale Contexte L’amélioration rapide des techniques de séquençage haut débit (lecture des molécules d’ADN des êtres vivants) conduit à une production massive de données génomiques. Ces données sont analysées par ordinateur pour extraire des connaissances au regard d’une question biologique particulière. Parmi les traitements récurrents, la comparaison de séquences génomiques tient une place prépondérante. L’équipe de recherche GenScale a développé une méthode de comparaison de séquences génomiques efficace et rapide. Cette solution a été transférée au sein de la société Korilog avec qui GenScale a mis en place un partenariat étroit via une structure appelée Innovation Lab (I-­‐Lab). La société Korilog commercialise aujourd’hui le software KLAST qui repose sur un prototype de recherche développé par les chercheurs de GenScale. Dans le cadre de ce partenariat (GenScale/Korilog), nous recrutons un ingénieur de développement pour maintenir le logiciel KLAST à un haut niveau de compétitivité. Plusieurs optimisations algorithmiques récentes, ainsi que des extensions pour élargir le champ d’applications, sont à intégrer au logiciel. Une parallélisation massive de KLAST est aussi à prévoir sur le « cloud » pour répondre à l’évolution croissante des masses de données génomiques à gérer. Mission • Intégrer les dernières optimisations algorithmiques relatives au traitement de comparaison de séquences génomiques dans le logiciel KLAST • Développer une version « cloud » du logiciel KLAST • Mettre en œuvre de nouvelles fonctionnalités au sein du logiciel KLAST à partir des travaux de recherche de l’équipe GenScale Profil/Compétences • Génie logiciel, optimisation algorithmique • Langage C / C++ • Systèmes Linux, Windows et Mac OS • Cloud computing • Des connaissances dans le domaine de la bioinformatique seront appréciées, mais non obligatoires Diplôme requis Diplôme d’ingénieur en informatique, Master 2 informatique Lieu de travail Equipe de recherche GenScale, IRISA / INRIA Campus de Beaulieu – 35042 Rennes cedex Durée du contrat : 18 mois Date d’embauche : à partir du 1er février 2014 Salaire : de 2530 à 3000 Euros nets suivant niveau et expérience. Candidature : CV et lettre de motivation à D. Lavenier ([email protected]) Site WEB : https://team.inria.fr/genscale/