Hélène SCORNEC AgroSup Dijon, Bâtiment Erasme

Hélène SCORNEC
AgroSup Dijon, Bâtiment Erasme, Bureau 217, 2ième étage,Aile Nord
Tel 03.80.77.40.77
Mail : [email protected]
INTITULE DU SUJET DE THESE
Identification et caractérisation fonctionnelle des gènes de Lactobacillus sp. impliqués dans les
interactions de type commensalisme et/ou probiotisme avec le tube digestif des mammifères
ENCADRANT
PR. CAVIN Jean-François
Dr. LICANDRO-SERAUT Hélène
FINANCEMENT
Bourse MEN (Ministère de l’Education Nationale)
FORMATION
2011 : Master 2 Recherche Sciences des Aliments, Sensorialité et Comportements (SASC) - Université
de Bourgogne - Dijon
2010 : Master 1 Qualité des Aliments et Sensorialité (QAS) - Université de Bourgogne - Dijon
2009 : Licence de Biochimie - Université de Bourgogne - Dijon
2008 : BTS Bio-Analyses et Contrôles – Lycée le Castel - Dijon
RESUME DE LA THESE
Le projet de thèse s’inscrit dans le cadre d’un contrat européen ERC « HOMEOEPITH » : “Homeostasis
and rupture of the gut epithelium in the presence of commensals and pathogens”. Il a pour objectif
l’identification des gènes intervenant dans les mécanismes de commensalisme - probiotisme chez
Lactobacillus sp. dans le tube digestif des mammifères par une démarche globale de génétique
inverse. Cette démarche mettra en oeuvre la mutagenèse aléatoire in vivo par transposition et
l’approche STM (Signature Tagged Mutagenesis) pour identifier les mutants (donc les gènes
impliqués) de Lactobacillus sp. altérés dans ces mécanismes. L’objectif majeur des travaux de thèse
sera donc le criblage fonctionnel des banques de mutants de L. casei en fonction de leur capacité (ou
incapacité) à survivre et à coloniser des modèles animaux (souris, lapin) déplétés ou non de flore
indigène par des antibiotiques. L’évolution de la composition des pools de mutants sera analysée par
qPCR. Les gènes (et protéines correspondantes) identifiés par cette méthode seront caractérisés au
niveau biochimique et fonctionnel. Des mutants ciblés des gènes identifiés par l’approche STM
seront construits et testés dans les modèles mammifères, notamment en partenariat avec les autres
partenaires du projet ERC.
BIBLIOGRAPHIE / POSTERS
COMMUNICATION AFFICHEE :
SCORNEC H., LICANDRO-SERAUT H., CAVIN J. F., PEDRON T., SANSONETTi P. Comment
identifier les gènes de Lactobacillus casei qui lui permettent de se maintenir dans l’intestin ?
Forum des Jeunes Chercheurs – 2012 – Besançon
LICANDRO-SERAUT H., SCORNEC H., CAVIN JF., PEDRON T., SANSONETTI P. Développement
de la Signature Tagged Mutagenesis chez Lactobacillus casei pour identifer les gènes
impliqués dans le maintien dans l’intestin. Workshop Interactions des microorganismes avec
leurs environnements : circulation, adaptation – 2012 – Dijon
LICANDRO-SERAUT H., SCORNEC H., CAVIN JF., PEDRON T., SANSONETTI P. Development of
Signature Tagged Mutagenesis of Lactobacillus casei to identify genes implied in gut
persistence. The New Microbiology - Interacademies Symposium – 2012 – Institut de France,
Paris.
LICANDRO-SERAUT H., SCORNEC H., LEE HY., LEE WJ., SANSONETTI P. CAVIN JF. Drastic
fluorescence instability in the probiotic Lactobacillus plantarum expressing GFP. Colloque
CIGR - 2011
COMMUNICATION ORALE :
LICANDRO-SERAUT H., SCORNEC H., CAVIN JF., PEDRON T., SANSONETTI P. Développement
de la Signature Tagged Mutagenesis chez Lactobacillus casei pour identifer les gènes
impliqués dans le maintien dans l’intestin. Workshop Interactions des microorganismes avec
leurs environnements : circulation, adaptation – 2012 – Dijon
PUBLICATION :
LICANDRO-SERAUT H., BRINSTER S., VAN DE GUCHTE M., SCORNEC H., MAGUIN E.,
SANSONETTI P., CAVIN JF., SERROR P. 2012. Development of an efficient in vivo PjuncTpaseIS1223 –based system for random transposon mutagenesis of Lactobacillus casei. Appl.
Environ. Microbiol. doi:10.1128/AEM.00531-12.