CV détaillé - LIENSs - Université de La Rochelle

ARNAUDIN (Fruitier) Ingrid
Maître de Conférences HDR en Biochimie (section 64 du CNU, classe normale, 6ème échelon)
Date et lieu de naissance : 22 Novembre 1973 à Libourne (33)
Nationalité : Française
Mariée, 2 enfants
UMR 7266 CNRS-Université de La Rochelle, LIENSs
Université de La Rochelle
Bâtiment Marie-Curie, pôle sciences et technologies
Avenue Michel Crépeau
17042 La Rochelle, France
1. Synthèse de la carrière d’enseignant-chercheur
1-Situations depuis l’entrée dans l’Enseignement Supérieur: (12 ans d'ancienneté au 1er Octobre 2012) Section 64 du CNU.
Qualifiée aux fonctions de Professeur en 64e section (en 2009 et 2013)
Responsable scientifique de l’axe « Mécanismes d’action et dysfonctionnements » (9 permanents, 6
doctorants) de l’équipe Approches Moléculaires, Environnement-Santé de l’UMR 7266 CNRS LIENSs (depuis le
01 Janvier 2012)
Habilitation à diriger des recherches depuis décembre 2008
Maître de Conférences (nommée en Septembre 2000) Rattachée à l’UMR CNRS 7266 LIENSs, Université de La
Rochelle, Département de Biotechnologies.
A.T.E.R temps plein de 1999 à 2000. Rattachée au LGPC, Laboratoire de Génie Protéique et Cellulaire, dans le
groupe de Biochimie des Peptides du Professeur Jean-Marie PIOT (Université de La Rochelle, Département de
Biotechnologies)
Vacataire en Biochimie de 1996 à 1999 (Université de La Rochelle, Département de Biotechnologies)
2-Recherche :
- Auteur de 28 publications scientifiques internationales (1997-2012, facteur d’Impact moyen 3,2)
24 publications sont directement en relation avec les thèses encadrées (soit plus de 80% des publications).
9 publications depuis la première qualification aux fonctions de professeurs de la section 64.
- Titulaire de la PES (2012 à 2016)
- Titulaire de la prime d’encadrement doctorale et de recherche : Deux fois successives de 2003 à 2007 et de
2007 à 2011.
3-Encadrement Doctoral :
-HDR: 1 (ancienne étudiante de Thèse Marie Cohen)
-Thèses: 6 (4 soutenues sur la période 2003-2010 et 2 en cours)
-DEA/Masters 2: 6
4-Enseignements :
- Responsable pédagogique du parcours Génie Biotechnologique de master 2ème année de l’Université de La
Rochelle (de 2005 à 2012)- Département de Biotechnologies
- Responsable pédagogique du L2 Sciences du Vivant de l’Université de La Rochelle (depuis septembre 2012)UFR Sciences
- Responsable des unités d’enseignement de Biochimie structurale (L1), d’anabolisme (L3), des TP de Biochimie
structurale et d’analyses physico-chimiques (L2) et de protéome (M2 Biochimie)
- Développement d’outils d’e-learning pour l’apprentissage de la Biochimie aux étudiants de L1, inclus dans le
plan Licence de l’Université.
Depuis le début de ma carrière universitaire, mon service d’enseignement statutaire (192h équivalent TD) a
toujours été intégralement accompli.
5- Diplômes :
- DEUG SV/ Licence et maîtrise de Biochimie/ DEA Biomembranes (Université de Poitiers)
1
- Doctorat de Biochimie (Université de La Rochelle, 13 Décembre 1999) « Les hémorphines : peptides
biologiquement actifs issus de l’hémoglobine. Détermination d’une voie de biosynthèse et de dégradation in vivo et
mise en évidence de sites récepteurs cibles » (Directeur de thèse : Pr. Jean-Marie Piot ; Rapporteurs : Anny Cupo,
Jean-Luc Gaillard).
- Habilitation à diriger des Recherches (Université de La Rochelle, 02 Décembre 2008) Spécialité Biochimie
« Les hémorphines, peptides multifonctionnels dérivant de la protéolyse cellulaire de l’hémoglobine. Voies de
biogenèse, et applications cliniques comme bio-outils » (Rapporteurs : Bruno Clément, Jean-Baptiste Michel,
Bernard Vialettes ; Examinateurs : Jean-Marc Muller, Valérie Thiéry ; Président de jury : Jean-Marie Piot).
2. Publications et production scientifique
Auteurs de 28 publications à comité de lecture dans 22 revues internationales.
Dans les moteurs de recherche bibliographique « Scopus ou Web of science » entrer « Fruitier» ou « Fruitierarnaudin » dans le champ « Author ».
Facteur d’impact moyen = 3,16 (2010 Journal Citation Report (Thomson Reuters, 2011)
En Bleu le nom des étudiants et les publications auxquelles les thèses encadrées ont donné lieu (soit plus de 80%
des publications)
Soumis
Achour, O., Bridiau, N., Kacem, M., Bordenave-Juchereau, S., Sannier, F., Piot, J-M., Maugard, T., Arnaudin*, I.
Cathepsin D activity and selectivity in the acidic conditions of a tumor microenvironment: utilization in the
development of a novel Cathepsin D substrate for simultaneous cancer diagnosis and therapy. Soumis dans le
journal Biochimie. (IF 3,022)
En révision
Achour, O., Bridiau, N., Godhbani, A., Le Joubioux F., Bordenave-Juchereau, S., Sannier, F., Piot, J-M., FruitierArnaudin, I., Maugard, T. Novel ultrasonic-assisted preparation of a low molecular weight heparin (LMWH) with
anticoagulant activity: comparison with commercially available LMWH. Carbohydrate polymers, en révision. (IF
3,628)
2013 (1)
Maraninchi*, M., Feron*, D., Fruitier-Arnaudin, I., Bégu-Le Corroller, A., Nogueira, J. P., Mancini, J., Valéro, R.,
Piot, J-M., Vialettes, B. (2013). Serum Hemorphin-7 Levels Are Decreased in Obesity. Obesity (2013), 21(2), 378–
381. (IF 4,28) * Co-premier auteur
2012 (1)
Luna-Acosta A, Renault T, Thomas-Guyon H, Faury N, Saulnier D, Budzinski H, Le Menach K, Fruitier-Arnaudin
I, Bustamante P. Detection of early effects of a single herbicide (diuron) and a mix of herbicides and
pharmaceuticals (diuron, isoproturon, ibuprofen) on immunological parameters of Pacific Oyster (Crassostrea gigas)
spat. Chemosphere (2012) 1335-1340. (IF 3,155).
2011 (2)
Luna-Acosta A, Thomas-Guyon H, Amari M, Rosenfeld E, Bustamante P, Fruitier-Arnaudin I. Differential tissue
distribution and specificity of phenoloxidases from the Pacific oyster Crassostrea gigas. Comparative Biochemistry
and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology 2011; 159(4): 220-226.
Alemán A, Pérez-Santín E, Bordenave-Juchereau S, Arnaudin I, M.C. Gómez-Guillén MC, Montero P. Squid
gelatin hydrolysates with antihypertensive, anticancer and antioxidant activity. Food Research International 2011;
44(4): 1044-1051. (IF 2,964)
2010 (4)
A. Luna-Acosta, E. Rosenfeld, M. Amari, I. Fruitier-Arnaudin, P. Bustamante, H. Thomas-Guyon. First evidence of
laccase activity in the Pacific oyster Crassostrea gigas. Fish Shellfish Immunol 28 (2010) 719-726. (IF 3,101)
A. Luna-Acosta, P. Bustamante, J. Godefroy, I. Fruitier-Arnaudin, H. Thomas-Guyon. Seasonal variation of
pollution biomarkers to assess the impact on the health status of juvenile Pacific oysters Crassostrea gigas exposed
in situ. Environ Sci Pollut Res Int 17 (2010) 999-1008. (IF 2,140)
2
D. Feron, J.M. Piot, I. Fruitier-Arnaudin. Proteolytic degradation by cathepsin D of glycated hemoglobin from
diabetes patients gives rise to hemorphin-7 peptides. Peptides 31 (2010) 956-961. (IF 2,502)
T. Dejouvencel, D. Feron*, P. Rossignol, M. Sapoval, C. Kauffmann, J.M. Piot, J.B. Michel, I. Fruitier-Arnaudin,
O. Meilhac. Hemorphin 7 reflects hemoglobin proteolysis in abdominal aortic aneurysm. Arterioscler Thromb Vasc
Biol 30 (2010) 269-275. (IF 7,582) *Co-premier auteur.
2009 (1)
D. Feron, A. Begu-Le Corroller, J.-M. Piot, C. Frelicot, B. Vialettes, I. Fruitier-Arnaudin. Significant lower VVH7like immunoreactivity serum level in diabetic patients: Evidence for independence from metabolic control and three
key enzymes in hemorphin metabolism, cathepsin D, ACE and DPP-IV. Peptides 30 (2) (2009) 256-261. (IF 2,502)
Liste des 18 publications antérieures (2006-1997):
Murillo L, Piot JM, Coitoux C, Fruitier-Arnaudin I. Brain processing of hemorphin-7 peptides in various subcellular fractions
from rats. Peptides (2006); 27(12): 3331-40.
S. Didelot, S. Bordenave-Juchereau, E. Rosenfeld, I. Fruitier-Arnaudin, J-M Piot and F. Sannier. (2006) Preparation of ACE
inhibitory hydrolysates from unsupplemented caprine whey fermentation by various cheese microflora. International Dairy
Journal, 16 (9) , 976-983.
Picot L., Bordenave S., Didelot S., Fruitier-Arnaudin I., Sannier F.,Thorkelsson G., Bergé J.P., Guérard F., Chabeaud A. & Piot
J.M. (2006) Antiproliferative activity of fish protein hydrolysates on human breast cancer cell lines. Process Biochemistry, 41
(5), 1217-1222.
Cohen M, Fruitier-Arnaudin I, Piot JM. Hemorphins: substrates and/or inhibitors of dipeptidyl peptidase IV. Hemorphins Nterminus sequence influence on the interaction between hemorphins and DPPIV. Biochimie (2004); 86(1): 31-7.
A. Testard, L. Picot, I. Fruitier-Arnaudin, J-M. Piot, H. Chabane, L. Domon, V.Thiery, T. Besson. (2004) Microwave-assisted
synthesis of novel thiazolocarbazoles and evaluation as potential anticancer agents. Part III. J. Enz. Inhibition and Medicinal
Chemistry. 19 (6), 467-473.
S. Bordenave, I. Balandier, F. Sannier, I. Fruitier-Arnaudin, J-M. Piot. (2003) Angiotensin I converting enzyme inhibition
kinetic and opioid activities of synthetic alpha-lactorphin. Current topics in peptides and protein research. 5, 105-110.
Fruitier-Arnaudin I, Cohen M, Coitoux C, Piot JM. In vitro metabolism of LVV-Hemorphin-7 by renal cytosol and purified
prolyl endopeptidase. Peptides (2003); 24(8): 1201-6.
Cohen M, Fruitier-Arnaudin I, Sauvan R, Birnbaum D, Piot JM. Serum levels of Hemorphin-7 peptides in patients with breast
cancer. Clin Chim Acta (2003); 337(1-2): 59-67.
Cohen M, Fruitier-Arnaudin I, Garreau-Balandier I, Piot JM. Microplate assay for determination of cathepsin D activity based
on quantification of a specific and stable peptide released from hemoglobin: VV-hemorphin-7. Analytica Chimica Acta (2003);
486(1): 21-29.
Fruitier-Arnaudin, I., Cohen, M., Nervi, S., Bordenave, S., Sannier, F., Piot, J.M. (2003) Reduced Level of Opioid Peptides,
Hemorphin-7 Peptides, in Serum of Diabetic Patients. Diabetes Care, 26 (8), 2480.
Fruitier-Arnaudin I, Cohen M, Bordenave S, Sannier F, Piot JM. Comparative effects of angiotensin IV and two hemorphins on
angiotensin-converting enzyme activity. Peptides (2002); 23(8): 1465-70.
Cohen M, Fruitier-Arnaudin, I., Garreau-Balandier I, J.M. P. Quantification of hemorphin-7 peptides by enzyme linked
immunosorbent assay with secondary antibody. Analytica Chimica Acta (2002); 461: 229-233.
Bordenave S, Fruitier I, Ballandier I, Sannier F, Gildberg A, Batista I et al. HPLC preparation of fish waste hydrolysate
fractions. Effect on guinea pig ileum and ACE activity. Prep Biochem Biotechnol (2002); 32(1): 65-77.
Szikra J, Benyhe S, Orosz G, Darula Z, Piot JM, Fruitier I et al. Radioligand binding properties of VV-hemorphin 7, an atypical
opioid peptide. Biochem Biophys Res Commun (2001); 281(3): 670-7.
Fruitier I, Garreau I, Lacroix A, Cupo A, Piot JM. Proteolytic degradation of hemoglobin by endogenous lysosomal proteases
gives rise to bioactive peptides: hemorphins. FEBS Lett (1999); 447(1): 81-6.
Garreau I, Chansel D, Vandermeersch S, Fruitier I, Piot JM, Ardaillou R. Hemorphins inhibit angiotensin IV binding and
interact with aminopeptidase N. Peptides (1998); 19(8): 1339-48.
Fruitier I, Garreau I, Piot JM. Cathepsin D is a good candidate for the specific release of a stable hemorphin from hemoglobin
in vivo: VV-hemorphin-7. Biochem Biophys Res Commun (1998); 246(3): 719-24.
Garreau, I., Fruitier, I., Sannier, F., Zhao, Q., Cucumel, K., Cupo,A. and Piot, J.M. (1997) Identification of hemorphins in a
cathepsin D bovine haemoglobin hydrolysate by radioimmunoassay and photodiode array detections. Lett.Pept.Sci, 4, 293-296.
Autres Publications à comité de lecture : I.Fruitier, M. Cohen, J- M.Piot. Les Hémorphines : peptides bioactifs issus de
l’hémoglobine. (2002) Regard sur la biochimie n°1, p37-49.
Liste des communications (orales O ou affichées A) en relation avec les thèses encadrées (En Bleu le nom des étudiants en thèse ayant
contribués aux communications avec actes.* Personne ayant présentée la communication.)
O1
Achour* O., Bridiau, N., Piot, JM., Maugard, T., Fruitier-Arnaudin, I. Tumor microenvironment targeting by the development of
a nanosystem for the detection and treatment of tumors by targeted inhibition of heparanase. "Nanomedicine in Oncology" from the 26th to
29th of September 2012 in Berder Island, France
O2
Achour* O., Bridiau, N., Piot, JM., Maugard, T., Fruitier-Arnaudin, I. Tumor microenvironment targeting by the development of
a nanosystem for the detection and treatment of tumors by targeted inhibition of heparanase. (5th-8th October, 2011, Berder, France)-Fifth
Berder meeting « Apoptosis, Angiogenesis and Hpoxia in Tumor Microenvironment : Biological aspects and Imaging »
3
O3
Luna Acosta A, Amari M, Fruitier-Arnaudin* I, Bustamante P, Thomas-Guyon H (2010). Localisation and characterization of
phenoloxidase-like activity in Crassostrea gigas. In : Journal of Sciences Halieutic, European Society of Marine Biotechnology conference
2010, Concarneau, France. Special issue Marine Biotechnology, Y. Le Gal A. Van Vormhoudt (eds) : 2.
O4
Fruitier-Arnaudin*, I., Mersni R., Saulnier, D. Purification and Characterization of metalloproteinases in pathogenic Vibrio of the
Pacific Oyster : Crassostrea gigas. In : Marine Biotechnology: Future Challenges (ESF-COST), 20-25 June 2010, Hotel Villa del Mare,
Acquafredda di Maratea, Italy.
O5
Fruitier-Arnaudin I, Feron* D, Piot JM (2009) Hemorphin-7 peptides metabolism in diabetes. In : AMINO ACIDS, 11TH
Congress on Amino Acids Peptides and Proteins, SPRINGER (eds), 37, 96-97, Suppl. 1.
O6
Luna-Acosta* A, Barthelemy C, Fruitier-Arnaudin I, Bustamante P, Thomas-Guyon H (2008) Identification of molecular immune
related biomarker in the Pacific oyster, Crassostrea gigas (Thunberg). In : Comparative Biochemistry and Physiology A-Molecular and
Integrative Physiology, Elsevier Science (eds). Annual Meeting of the Society-for-Experimental-Biology, Marseille, France, 150 (3): S160S160.
O7
M. Cohen, I. Fruitier-Arnaudin, J-M. Piot Les hémorphines : nouveaux peptides inhibiteurs de l’activité de la Dipeptidyl
peptidase IV (DPPIV)- Une étude de relation structure-fonction 4ème colloque du groupe thématique de la SFBBM « Protéolyse Cellulaire »,
12-14 Décembre 2005, Aussois.
O8
Cohen, M., Fruitier-Arnaudin, I., Garreau-Balandier, I., Piot, J.M. Nouvelle méthode de dosage des hémorphines de type 7Application pour le pronostic du cancer du sein. XIIémes Conférences Européennes du Groupement des Pharmacochimistes de l’Arc
Atlantique (GP2A), 1-3 octobre 2003, La Rochelle.
A1
Fruitier-Arnaudin*I, Feron D., Boukhalfa T., Piot J-M. Characterization of bioactive peptides produced by tumoral secretomes of
lung (A549) and hepatic cells (HuH7) differentially cultured in microacidic pH and modified glucose concentration : two pathological
patterns of metabolic microenvironment of tumors cells. (5th-8th October, 2011, Berder, France)-Fifth Berder meeting « Apoptosis,
Angiogenesis and Hpoxia in Tumor Microenvironment : Biological aspects and Imaging »
A2
Fruitier-Arnaudin*I, Heuze-Vourch N, Feron D, Piot JM. (2009) Characterization, biodisponibility and biological effects of
polypeptide fragments from the pericellular matrix in tumour progression. In : AMINO ACIDS, 11TH Congress on Amino Acids Peptides and
Proteins, SPRINGER (eds) 37 : 99-99 Suppl. 1.
A3
Luna-Acosta, A., Fruitier-Arnaudin, I., Barthélémy, C., Bustamante, P., Thomas-Guyon, H. Identification of molecular immune
related biomarker in the Pacific oyster Crassostrea gigas. Society for Experimental Biology Congress, 5-7 July 2008, Marseille.
A4
A. Luna-Acosta, I. Fruitier-Arnaudin, C. Barthélémy, P. Bustamante, H. Thomas-Guyon.Pluridisciplinary study of the impact of
contaminants on the pacific oyster, crassostrea gigas. SERI 2008 (4ème edition). Paris.
A5
Jouvencel (de), T., Feron, D., Fruitier-Arnaudin, I., Piot, J-M., Michel, J-B., Meilhac, O.Le thrombus anévrismal : source de
LVV-Hémorphine 7, un fragment d’hémoglobine. 5th Annual Congress of the French Atherosclerosis Society, Biarritz, June 12-14, 2008.
A6
I. Fruitier-Arnaudin, L. Murillo, S. Bordenave-Juchereau, F. Sannier and J-M.Piot. Hemorphins : a novel class of regulatory
endogenous bioactive peptides derived from hemoglobin. Description of various physiological potential activities. 30th FEBS Congress and
9th IUBMB Conference, The protein World, Budapest, Hungary, 2-7 July, 2005.
A7
I. Fruitier-Arnaudin, J-M. Piot, A. Begu, B. Vialettes. Rôle des hémorphines dans la physiologie de l’hypertension artérielle et la
néphropathie incipiens chez les patients diabétiques de type 1. XXXIIème Forum des Jeunes chercheurs de la SFBBM Edition 2005-Nantes.
2. Encadrement doctoral et scientifique, résumé des travaux
v Encadrement doctoral : 6 thèses (4 soutenues, 2 en cours) et 26 publications directement liées aux thèses
encadrées.
Directrice de thèse : Rachida MERSNI (2010-), Delphine FERON (2007-2010), Laurence MURILLO (2004-2007) ;
Marie COHEN (2000-2003).
Co-direction de thèse : Oussama ACHOUR (2011-, co-direction avec Thierry Maugard)
Co-encadrante de Thèse : Andrea LUNA-ACOSTA (2007-2010)
•
•
•
•
•
•
Marie COHEN, doctorant allocataire territoriale (Région Poitou-Charentes), 2000-2003 (thèse soutenue le
10 Novembre 2003). Mme Cohen est chercheur associé au CHU de Genève (8 publications)
Laurence MURILLO, doctorant allocataire territoriale (CG17), 2004-2007. Mlle Murillo est aujourd’hui
Maître de Conférences à l’Université de La Rochelle. Sujet : Contribution à l’étude d’un environnement
physiologique favorable a la biogénèse de peptides hémorphiniques : application au système nerveux
central. (1 publication)
Delphine FERON, doctorant MENRT, 2006-2010. Mlle Feron est aujourd’hui en post-doctorat dans une unité
INSERM à Nantes. Sujet : Significations physiopathologiques des hémorphines de type 7 dans le diabète et
les cancers broncho-pulmonaires (4 publications)
Andrea LUNA-ACOSTA, doctorant CG17, 2007-2010. Mme Luna est aujourd’hui dans le privé en Colombie.
Sujet : Les phénoloxydases chez l’huitre creuse Crassostrea Gigas : Biomarqueurs potentiels de stress
environnemental (4 publications)
Rachida MERSNI, doctorante CNRS, 2010- Sujet : Etude du mode d’action de toxines bactériennes chez
un invertébré marin : l’huître creuse Crassostrea gigas
Oussama ACHOUR, doctorant Ligue Contre le Cancer, 2011- Sujet : Aide au ciblage du
microenvironnement tumoral par inhibition ciblée de l’héparanase (2 publications)
v Encadrement d’étudiants en Master 1 et Master 2 de Biochimie-Biotechnologies
4
2007: Annabelle Tanga – Master 1 (3 mois) ; 2009 : Myriam Amiri –Master 2 (6 mois) ; 2010 : Rachida Mersni
– Master 2 (6 mois) ; 2011 : Taha Boukhalfa – Master 2 (6 mois) ; 2012 : Ibtissem Doghri – Master 2 (6 mois) ;
2013 : Yosra Ben Cheich – Master 2 (6 mois) ; Adriana Sardi – DU (4 mois) ; Cédric Etien – Master 1 (4 mois).
Liste des étudiants en cinquième année d’école d’ingénieur INSAT (Tunis) effectuant leur stage de fin
d’étude en laboratoire de recherche encadrés sur la période :
2008: Myriam Amiri (1 publication) ; 2009 : Rachida Mersni ; 2010 : Taha Boukhalfa et Khalil Gargouri ;
2011 : Ibtissem Doghri ; 2012 : Yosra Ben Cheich – Stage de fin d’études (spécialité Biologie Industrielle,
Institut National des Sciences Appliquées et de Technologie de Tunis) (4 mois)
Résumé des travaux de recherche : Ils concernent principalement l’étude des mécanismes moléculaires de la
protéolyse dans différentes pathologies humaines et animales. Ils se déclinent selon plusieurs axes. Le premier
concerne l’étude des activités protéolytiques de protéases acides (cathepsines) au cours du remodelage du
microenvironnement tumoral (modulation de leur expression, caractérisation des substrats, effets du dégradome)
tandis que le second se focalise sur l’étude du mode d’action de métalloprotéases bactériennes produites par
des bactéries marines pathogènes (purification des enzymes, digestion des matrices extracellulaires, effets
cellulaires sur l’hôte, transcriptomique, protéomique). Les résultats de ces axes me permettent de développer
différentes stratégies de ciblage de ces protéases à visée diagnostique et thérapeutique comme notamment le
développement de nano-outil d’imagerie moléculaire de la protéolyse. Les approches que je développe sont
l’analyse protéomique des systèmes enzymatiques et de leurs effets (1D, 2D, zymographies, blot), des dosages
enzymatiques sur enzymes isolées ou à partir de milieux cellulaires complexes hétérogènes (milieu de culture), des
dosages ELISA pour le suivi des biomarqueurs, et tous les outils analytiques de caractérisation structurale des
protéines (LC/MS).
Mots clés : environnement-santé, biomarqueurs, biopeptides thérapeutiques, protéases humaines et bactériennes,
dysfonctionnements moléculaires et cellulaires, systèmes enzymatiques « sensors » des réponses, outils du diagnostic Thèmes
de recherche : • Compréhension des mécanismes moléculaires de la protéolyse associée à des pathologies humaines • Design
de nanosondes ciblantes des environnements pathologiques • Compréhension des mécanismes d’actions d’hydrolases
bactériennes impliquées dans la virulence de bactéries infectant l’huitre creuse, Crassostrea gigas.
Approches : protéomique, caractérisation structurale et fonctionnelle de protéases, chromatographie liquide et spectrométrie
de masse, développement de bioessais, culture cellulaire.
Détails de l’activité de recherche : Depuis mon arrivée à l’Université de La Rochelle en 1996, je me suis investie
dans une problématique de recherche ayant trait à des peptides originaux, les hémorphines, effecteurs peptidiques
multifonctionnels dérivant de la protéolyse cellulaire de l’hémoglobine. Leurs mécanismes de génération, leurs
mode d’action ainsi que leur capacité à marquer différentes environnements pathologiques ont été précisés donnant
lieu à 4 thèses (I. Fruitier-Arnaudin, Marie Cohen, Laurence Murillo et Delphine Feron) et plus de 18
publications associées. Depuis lors, ma recherche s’est élargie aux fonctionnements/dysfonctionnements de
protéases et aux peptides qu’elles génèrent dans diverses situations physiopathologiques humaines. En effet, les
protéases constituent des régulateurs importants des interactions qui s’établissent entre les cellules et leur
microenvironnement. Dans des conditions physiopathologiques particulières (relations hôte-pathogène, invasion
cellulaire), l’expression de ces protéases cellulaires se trouve exacerbée et l’exposition de protéines substrats
conduisent à la biogenèse d’oligopeptides régulateurs de la progression cellulaire. C’est dans ce contexte que deux
projets sont actuellement menés, en santé humaine, visant à 1) identifier les facteurs micro environnementaux
biochimiques modulateurs de la sécrétion des protéases tumorales et 2) à développer de nouveaux nanobiooutils
applicables à la détection physico-chimique d’activités biologiques (Thèse d’Oussama ACHOUR, projet PRES
NANO, ligue et INCa). Mon expérience dans la relation peptides et pathologies humaines et notamment dans
l’étude de leur biogenèse en rapport avec des dérèglements locaux impliquant des protéases est aujourd’hui dans
l’UMR mise au profit d’actions transversales en santé animale. Les résultats et savoir-faire obtenus dans le cadre de
pathologies humaines invasives permettent aujourd’hui de développer des recherches qui visent à définir de
nouveaux descripteurs moléculaires ou biosenseurs de réponses dont l’expression est fortement influencée par
l’exposition des organismes aux stress environnementaux. J’étudie à ce titre plusieurs systèmes hydrolytiques et
oxydasiques dont la mesure d’activité constitue de bons marqueurs de dysfonctionnements moléculaires. Une thèse
soutenue en 2010 (Andrea Luna-Acosta, 4 publications, projet POLERON) visant notamment à étudier « Les
phénoloxydases chez l’huître creuse Crassostrea gigas : biomarqueurs potentiels de stress environnemental» a
permis l’optimisation du protocole de dosage des phénoloxydases chez l’huître C. gigas mais aussi leur
caractérisation fine dans différents compartiments tissulaires. Enfin et toujours sur le modèle huitre, un autre
système hydrolytique est aujourd’hui à l’étude, celui d’une métalloprotéase bactérienne sécrétée par des bactéries
pathogènes pour l’huitre. C’est dans le cadre de la thèse de Rachida MERSNI (CNRS/IFREMER, projet PRES
TOXINES), débutée fin 2010, que le mode d’action de cette protéase devra être précisé. Les objectifs sont la
purification jusqu’à homogénéité d’une quantité suffisante de protéases et la détermination des conséquences de son
action in vitro et in vivo sur différentes fonctions cellulaires de son hôte. L’obtention pure de cette forme
5
d’exotoxines permettra également d’envisager le design de peptides antigéniques autorisant le développement
d’immunooutils sensibles à la détection de ces toxines dans les milieux aquatiques.
3. Rayonnements, responsabilités
3-1 Responsabilités Locales :
- Responsable scientifique de l’axe « Mécanismes d’action et dysfonctionnements » (9 permanents, 6
doctorants) de l’équipe Approches Moléculaires, Environnement-Santé de l’UMR 7266 CNRS LIENSs depuis le
01 Janvier 2012.
- Membre élu du Conseil Scientifique de l’Université de La Rochelle, collège B Docteur HDR (2012-2016)
- Vice-Présidente du Conseil Scientifique de La Ligue Contre le Cancer de Charente-Maritime depuis 2011.
- Membre élu du Conseil de Laboratoire de l’UMR CNRS LIENSs (2008-2011)
- Membre de la CSE (Sections 32, 64 et 65) (2005-2008) puis de Comités de Sélection depuis 2009 et membre de
la commission ad hoc de sélection des ATER de l’Université de La Rochelle.
3-2 Responsabilités Nationales :
- Membre élu du CNU en 64e section, Collège B (2011-2015). La 64e Section est l’une des plus importantes au
niveau national pour le nombre de candidats à la Qualification (plus de 1 000 par an) ce qui fait que le total des
expertises (Qualifications et Promotions de Maîtres de Conférences) que je réalise concerne environ 70 à 80
dossiers par an.
- Membre du GDR Or-nano pour les applications biologiques des nanoparticules d’or.
- Membre de la Société Française de Biochimie et Biologie moléculaire et du groupe thématique « Protéolyse
cellulaire » de la SFBBM.
- Participation en qualité de "referee" pour : Peptides, Regulatory Peptides, FEBS Letters, Journal of
Neurochemistry, Biotechnology Letters, Process Biochemistry…
- Examinatrices de 4 thèses (M. Cohen ; L. Murillo ; 2010, D. Feron et A. Luna-Acosta) et rapportrice d’une
thèse (2010, T. DeJouvencel) et d’une HDR (2010, Marie Cohen).
3-3 Responsabilités Internationales :
- Participation aux Projets Européens SEAFOODplus (2004-2008) et BIOTECMAR (2009-2012). Au cours de
ces dernières années, mon implication dans 2 projets européens (80 partenaires majoritairement
universitaires de différents pays : Finlande, Pays-Bas, Angleterre, Irlande, Ecosse, Portugal Espagne…) a été
l’occasion de participer à l’organisation de rencontres et colloques internationaux (entre universités, centres de
recherche, centres de transfert) importants, particulièrement dans le domaine des Biotechnologies Marines. Ce
domaine est actuellement en pleine expansion au sein de notre UMR.
- Collaboration scientifique et pédagogique avec le Laboratoire de Génie biologique et le Département de
Génie Biologique de l’INSAT de Tunis depuis 2008 : Projet UTIQUE (2011) et membre des jurys se
soutenances des Ingénieurs INSAT.
4. Responsabilités scientifiques
4-1-Responsabilité d’un axe de Recherche:
Depuis le 01 Janvier 2012, je suis responsable scientifique de l’axe « Mécanismes d’action et
dysfonctionnements » de l’équipe Approches Moléculaires, Environnement-Santé de l’UMR 7266 CNRS LIENSs.
J’anime un groupe de 9 permanents et de 6 doctorants dont les travaux de recherche concernent principalement la
caractérisation structurale et biologique de molécules (enzymes, peptides, oligosides) impliquées dans la régulation
de processus pathologiques conduisant au développement de pathologies humaines (cancers, syndrome
métabolique, infections bactériennes) et animales (interactions hôte-pathogènes). Plusieurs approches sont
conduites, à l’échelle du gène et des effecteurs protéiques utilisant les méthodologies d’omiques et de
caractérisation structurale (LC/MS) pour les études de relation structure-activité. Ces travaux trouvent leur
application en santé humaine, animale et nutrition et font l’objet de collaborations industrielles (thèses CIFRE,
contrat de prestations).
4-2-Responsabilités au sein de Réseaux de Recherche:
- de 2004 à 2008 : Partenaire d’un Projet Intégré Européen (SEAFOODplus) regroupant plus de 70 équipes
européennes.
- de 2009 à 2011 : Partenaire d’un Projet Européen (BIOTECMAR) dans le cadre d’Interreg IV-B « Espace
Atlantique », regroupant 12 Partenaires (quatre pays différents).
6
- de 2005 à 2009 : Responsable scientifique pour La Rochelle d’un Programme Hospitalier de Recherche
Clinique avec le CHU Timone de Marseille (Pr. VIALETTE-Diabétologue) , thème : Hémorphines et Diabète.
- de 2007 à 2010 : Partenaire du projet Régional POLERON : Modifications chimiques de polluants organiques
dans le bassin de Marennes-Oléron, toxicité des produits de dégradation sur l’huitre creuse.
- de 2008 à 2010 : Responsable scientifique pour La Rochelle du Projet MATRIGO (U.-La Rochelle, U.-Tours,
U.-Rennes 1, U.-Orléans) soutenu par l’INCa (Institut National du Cancer) dans le cadre du Cancéropôle
Grand-Ouest. Thème : Matricryptides, peptides bioactifs générés au cours du remodelage du microenvironnement
tumoral.
- de 2010 à 2011 : Responsable scientifique du Projet PRES NANO Limousin-Poitou-Charentes (Nouveaux nanooutils pour la détection physico-chimique d’activités biologiques) et Partenaire du Projet PRES TOXINES
Limousin-Poitou-Charentes (Caractérisation in vitro des effets de métalloprotéases sur différentes types cellulaires
de l’huitre creuse Crassostrea gigas).
- de 2013 à 2015 : Partenaire du projet « Environnement-santé » de la Région Poitou-Charentes «
- depuis 2005 : Contrats annuels avec la Ligue contre le Cancer (financement et thèse) sur les thèmes de
recherche en cancérologie présentés dans la partie « encadrement doctoral et scientifique ».
7