Pascal Mossuz - Introduction CRB

Les centres de
ressources
biologiques
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Stockage de matériel biologiques : une
pratique médicale ancienne
L’activité de stockage d’échantillons biologiques a toujours fait partie
intégrante de l’activité médicale pour la prise en charge diagnostique des
patients
- suivi sérologique de patients
- obligation réglementaire ( ex : toxoplasmose)
= Stockage à visée sanitaire
A partir des collections constituées au cours du soin
- évaluation de nouvelles méthodes
- évaluation de nouveaux marqueurs diagnostiques
- projet de recherche clinique
= Stockage à visée recherche
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Les CRB : une formalisation des activités
de stockage du matériel biologique
En 1999, l’OCDE introduit formellement le terme de centres
de
ressources biologiques (CRB).
Les centres de ressources biologiques sont centres de conservation des
ressources biologiques , Les collections contiennent :
des cellules et tissus (origine végétale / animale / humaine)
les parties repliables de ces organismes (génome, ADN, plasmide)
les micro-organismes
= regroupent les termes de tumorothèque / cellulothèque /plasmathèque /
Eléments essentiels de l'infrastructure sur laquelle s'appuient
les biotechnologies, dont le rôle principal est de mettre à disposition de la
recherche scientifique et biotechnologique des bio-ressources de qualité
et leurs données associées
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Cadre réglementaire
Recommandations OCDE 2001 ( définition des
biobanques)
Loi de bioéthique 2004 (révisée 2011)
Recommandations HAS 2009 « Cryopréservation de
tissus, cellules et liquides biologiques issus du corps
humains »
Recommandation INCa 2011 « Conservation et
utilisation des échantillons tumoraux en cancérologie »
Régime de déclaration et d’autorisation
•Activité soumise à déclaration (collection) MESR- CNIL
•Activité soumise à autorisation (cession)- code de la santé publique
article L1243-4
•Comité de protection des personnes (CPP)
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Conditions réglementaires à
l’échelle du CRB
Conditions
réglementaires
à:
Système
de management
de la qualité des CRB
Normes NF 96 900 (révisée 2011)
ISO 9001 l’échelle du CRB
Système de gouvernance
La direction opérationnelle
Le comité de Pilotage
Le conseil Scientifique
Recommandation INCa pour les CRB cancérologie
Consentement éclairé du patient pour le stockage de son
matériel biologique
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« Conservation et utilisation des
échantillons tumoraux en cancérologie »
Recommandation INCa 2001 pour les CRB cancérologie
Obligations sanitaires et
scientifiques
Intégré dans le
dispositif
d’autorisation pour le
traitement du cancer
Améliorer le prise en
charge des patients
Pas de
systématisation
Collection ciblées
en adéquation
avec une stratégie
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Constitution d’une collection
Définition des objectifs
scientifiques
Définition des modalités
techniques
Adéquation des modalités de
stockage avec les modalités
techniques
Adéquation des volumes
/quantité d’échantillons
stockés avec les objectifs
scientifiques
Congélation tissulaire et
cellulaire
Méthode de référence
infrastructure et cout
Congélation de liquides
biologiques
paillettes thermo-scellées /
micro-tubes
Paraffine / tissus fixés
coût du stockage / étude
morphologique
Produits dérivés
ADN/ ARN / protéines
encapsulation de l’ADN
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Procédures et organisation des circuits
Biologiste
Anat path
Clinicien
chirurgien
qualité
préanalytique
Annotation clinicobiologiques
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Contrôle Qualité de la Biobanque
• Traçabilité des données
• Contrôle des températures
• Certification ( ISO ) / Accréditation ( COFRAC )
• Contrôle de qualité des produits dérivés
• Contrôles histologiques
• Qualité des annotations cliniques (monitoring des
données)
• Audit de certification
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Organisations des activités du CRB
« cartographie des processus »
Pilotage
Pilotage des activités
Amélioration continue
Services cliniques
Réception
Traitement
Stockage et Conservation
Processus
Support
Prestation interne
CHU
Gestion informatique des données biocliniques
Cession
Services cliniques
Laboratoires de recherche
Intégration d’une collection
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Les enjeux des CRB
Mise en
place de
Réseaux
Données de
omics
Big data
Bases ClinicoBiologiques
/cohortes
CRB
Interopérabilité
des systèmes de
gestion
Partenariats
Collaboration
européenne
Communication
information
Business model
Valorisation
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Bases de données clinico-biologiques
Collections biologiques
/réseaux : enjeux
Plusieurs pays européens et d’Amérique du nord font actuellement des
investissements notables en matière de Biobanques, pour permettre des
collaborations internationales ou européennes afin de développer des
programmes à grande échelle dans le domaine de la recherche biomédicale
Constitution de bases de données clinico-biologique
permettant l’accès à des échantillons conservés dans des
conditions standardisées et qualifiées, associés à des
annotations cliniques de qualité
Renforcement de la collecte des données biologiques/
patients dans le cadre de cohortes HU/H multi-sites ou
multi-thématiques
Mise aux normes européennes et internationales des CRB
= Enjeu majeur pour la recherche clinique.
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interopérabilité des bases
clinico-biologiques
Problèmes :
nombreux logiciel de gestion des CRB
encore plus nombreux dossier patient informatisé ( 1/ CHU)
absence d’harmonisation possible vers un seul système informatique
possibilité de stockage centralisé mais circuit d’envoi d’échantillons à
mettre en place + nouvelle structure
= frein majeur à la constitution de tumorothèque virtuelle recensant l’ensemble des
échantillons de plusieurs CRB
= frein majeur à des projets de recherche clinique nationaux
Nécessité de faire communiquer les BDD des CRB, les SIH, SGL..
faciliter l’accès aux données de santé associées aux données
biologiques
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Information et consentement des
Patients
Obligatoire pour utilisation des ressources biologiques dans le cadre d’un
projet recherche
Nécessite une information du patient
Evolution en cours vers des consentements commun à un réseau ( ex réseau
hépato-carcinome)
Problème de la génétique constitutionnelle
Circuit complexe : récupération des feuillets à structurer , amélioration à
apporter en concertation avec cliniciens (remise du doc. lors des attentes en
cs, information incluse dans un livret d’accueil spécifique Cancérologie,
consentement avec inclusion dans un protocole thérapeutique)
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Définitions des coûts
Très souvent oubliés ou largement sous-estimés dans les
demandes de financement
Doivent intégrer l’ensemble des couts CRB : consommables, RH,
locaux, qualité….
Estimation par rapport à la nomenclature des actes HN
(nomenclature de « Montpelliers »)
Clément B, Yuille M, Zaltoukal K, Wichmann HE, Anton G, Parodi B, Kozera L, Bréchot C, Hofman P, Dagher G; EUUS Expert Group on cost recovery in biobanks. Public biobanks: calculation and recovery of costs. Sci Transl Med.
2014 Nov 5;6(261):261fs45
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78 200 échantillons / an
9 450 / 18 900
11 730 / 31 280
Si 5 années de conservation
90 700
Valorisation du CRB
• Publications
• Collaborations dans le cadre du projet scientifique
• Cession à un tiers (industriel…)
• Réseaux régionaux, nationaux , internationaux
• Bases de données thématiques
• AAP
• MERRI
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Conclusions
Structures labellisées évoluant vers des centres de ressources
analytiques et cliniques
Partie intégrante du parcours de soins du patients
Reflet de sa prise en charge médicale
Support à des projets transversaux de recherche à
l'échelle régionale, nationale et internationale
Structure partenaire pour des développements à
caractères technologiques, et pour la promotion des
compétences et des expertises.
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