Biologie et Physiologie Végétales
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Biologie et Physiologie Végétales
Ministère de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche Scientifique et de la Technologie Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux LA PHOTOSYNTHESE Imen KHOUNI Attention ! Ce produit pédagogique numérisé est la propriété exclusive de l'UVT. Il est strictement interdit de la reproduire à des fins commerciales. Seul le téléchargement ou impression pour un usage personnel (1 copie par utilisateur) est permis. Biologie et Physiologie Végétales Université Virtuelle de Tunis Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) OBJECTIF: Cette session présente: la structure des chloroplastes, la photosynthèse et la photo respiration PLAN I- Introduction II- Lieu de la photosynthèse et structure des chloroplastes III- Les photosystèmes IV- La phase lumineuse de la photosynthèse V- La phase obscure de la photosynthèse: le cycle de Calvin 2 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) I- Introduction A la différence des animaux, la plupart des végétaux possèdent des plastes. Il existe quelques exceptions : les champignons ou mycomycètes en sont dépourvus. Les plastes sont distincts des mitochondries par leurs tailles, leurs structures et leurs fonctions (figure 32). On distingue les leucoplastes non pigmentés, les chromoplastes riches en caroténoïdes, et les chloroplastes. Figure 32 : Plastes dans des cellules végétales 3 Imen KHOUNI Biologie et Physiologie Végétales Université Virtuelle de Tunis Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) I-1- Définition de la photosynthèse La photosynthèse est un processus complexe au cours du quel les plantes contenant de la chlorophylle synthétisent de la matière organique à partir de gaz carbonique et d’eau. Dans ce processus, il se forme en règle générale de l’oxygène moléculaire. Parmi les phénomènes qui dépendent de la lumière, la photosynthèse occupe une place privilégiée dans la mesure où l’énergie de rayonnement absorbée est utilisée à la synthèse de composés organiques à haute teneur en énergie à partir de produits minéraux simples. Il s’agit d’un processus endergonique, qui est lié à une augmentation d’énergie libre. Si on tient compte de cet aspect énergétique, l’ensemble de la photosynthèse peut être représenté par l’équation suivante : 6 CO2 + 12 H2O C6H12O6 + 6 H2O + 6O2 Lumière ; chlorophylle Remarque L’interprétation correcte de la photosynthèse s’est révélée compliquée à cause du nombre élevé des facteurs mis en jeu : lumière, eau, oxygène, gaz carbonique, composés organiques complexes, sels minéraux, pigments, etc (figure 33). L’équation formulée ci dessus s’est dégagée lentement et a trouvé son expression actuelle après deux siècles d’effort. Figure 33 : Les facteurs mis en jeu lors de la photosynthèse 4 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) I-2- Gaz carbonique Quand on place une plante dans les conditions optimales d’éclairage et de disponibilité d’eau, mais dans une atmosphère dépourvue de gaz carbonique, en supprimant aussi, à l’aide d’hydroxyde de potassium ou de sodium, la faible quantité de gaz carbonique produite par la respiration, on observe que la plante cesse de croître et dépérit. I-3- Eau La photosynthèse utilise peu d’eau en regard de la quantité totale disponible. Pour mettre en évidence la participation et le rôle de l’eau dans la photosynthèse, il a fallu utiliser de l’eau marquée avec un isotope lourd dont les molécules contiennent en partie l’oxygène 18O à la place de 16O. I-4- Chlorophylle Les cellules dépourvues de la chlorophylle sont incapables d’effectuer une synthèse nette de substances dans des conditions photo-autotrophes. C’est le cas des bactéries non photosynthétiques, des levures et des champignons, mais aussi celui des cellules végétales qui n’ont plus de chlorophylle à la suite d’une mutation. I-5- Lumière En 1882, Engelmann a pu montrer que la production photosynthétique d’oxygène chez les algues ne pouvait être mise en évidence que lorsqu’elles étaient éclairées par certains domaines de longueur d’onde de la lumière. I-6- Glucides Au cours de la photosynthèse, il y a production d’amidon : on met ce dernier en évidence en plongeant une feuille qui a été éclairée, dans une solution de lugol (iode + iodure de potassium), l’amidon se colore en bleu foncé intense. Avec des caches, on peut montrer que cette synthèse est restreinte aux parties éclairées de la feuille (figure 34). 5 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) Figure 34 : Expérience montrant la production d’amidon au cours de la photosynthèse I-7- Oxygène On peut renouveler l’expérience de Bonnet : on récolte les bulles de gaz qui montent d’une plante aquatique (Elodea, Fontinalis) éclairée. Un petit tison de bois rougeoyant se rallume lorsqu’on l’introduit dans ce gaz, indiquant la présence d’oxygène. On peut aussi utiliser deux réactions chimiques caractéristiques de l’oxygène moléculaire : une solution alcaline de pyrogallol devient brune et une solution de carmin indigo, préalablement décolorée, reprend sa teinte bleue au contact du gaz formé pendant la photosynthèse. II- Lieu de la photosynthèse et structure des chloroplastes II-1 Introduction Les chloroplastes possèdent des pigments assimilateurs et effectuent la photosynthèse. Ils absorbent certaines radiations lumineuses et réduisent le carbone du CO2 de l’air ou des bicarbonates de l’eau. L’énergie lumineuse captée est transférée sous forme chimique. Ce processus conditionne l’existence de tous les êtres : leur nutrition dépend directement ou indirectement des végétaux verts. De plus, tout l’oxygène atmosphérique provient de la photosynthèse. Des chloroplastes existent dans les algues et dans divers tissus (parenchymes,…) des végétaux supérieurs. Ces organites, relativement volumineux, ont 4 à 6µm de diamètre en moyenne dans les plantes terrestres. Si les courants du cytoplasme les déplacent, ils ont aussi des mouvements 6 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) autonomes. Leurs positions, leurs formes et leurs volumes peuvent se modifier sous l’influence des variations de l’intensité lumineuse. II-2 Structure des chloroplastes Comme les mitochondries, les chloroplastes ont une double membrane qui entoure un milieu intérieur (stroma). A la différence des mitochondries, ils possèdent de nombreux saccules (thylakoïdes) empilés. La membrane externe, perméable, est séparée par un mince espace de la membrane interne, moins perméable, pourvue de multiples protéines de transport. Dans le stroma, on caractérise un ADN et de petits ribosomes chloroplastiques, ainsi que de l’amidon et des plastoglobules lipidiques (figure 35). 1: membrane interne 2:membrane externe 3: espace intermembranaire 4: stroma 5: granum 6: thylakoïde Figure 35 : Schéma d’un chloroplaste Chaque thylakoïde est constitué d’une membrane qui isole un espace interne mince. Les saccules forment des empilements réguliers ou granums (figure 36). Les thylakoïdes se prolongent par des tubes aplatis qui les mettent en continuité avec des saccules d’autres granums. Les membranes granaires, plus épaisses en raison des superpositions, se distinguent des membranes intergranaires qui les prolongent. Elles séparent du stroma les compartiments que délimitent les thylakoïdes. Ces derniers renferment presque la moitié des protéines chloroplastiques, l’autre moitié étant en gros localisée dans le stroma. 7 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) Figure 36 : Schéma montrant la structure interne d’un chloroplaste : thylakoides, granum, ….. II-3 Pigments des chloroplastes La molécule d’une chlorophylle comprend un groupe tétrapyrrolique hydrophile lié à un atome de magnésium. II-3-1- Les chlorophylles Les végétaux verts possèdent deux chlorophylles, la chlorophylle a (figure 37) et la chlorophylle b, qui se distinguent par une courte chaîne latérale portée par l’anneau pyrrolique. 8 Imen KHOUNI Biologie et Physiologie Végétales Université Virtuelle de Tunis Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) Figure 37 : Structure de la molécule de la chlorophylle a Les chlorophylles a et b absorbent diverses radiations lumineuses, avec des pics dans le rouge (environ 650 nm) et le bleu (vers 450 nm) (figure 38). La chlorophylle a absorbe fortement La chlorophylle b absorbe fortement à à 430 nm (bleu) et 660 nm (rouge). 445 nm (bleu) et 645 nm (rouge). Figure 38 : Spectres d’absorption des chlorophylles a et b Plusieurs molécules de chlorophylle a sont groupées en polymères, caractérisés chacun par un maximum d’absorption d’une radiation rouge : 680 ou 700 nm pour les chlorophylles a des photosystèmes (respectivement P680 et P700). Les chlorophylles sont généralement combinées à des protéines (chromoprotéines) dont elles constituent les groupements prosthétiques. 9 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) II-3-2- Les caroténoïdes Les caroténoïdes comprennent des pigments rouges orangés, hydrophobes. Les carotènes (C40H56) sont des carbures d’hydrogène non saturés, précurseurs de la vitamine A. Chacun comprend une chaîne composée essentiellement de résidus isoprènes. Les xanthophylles, de même type, possèdent plusieurs fonctions alcool ou cétone. Les radiations absorbées par les carotènes et les xanthophylles sont dans la bande bleue verte (max. 480 à 500 nm). II-4 Pigments actifs et pigments accessoires La chlorophylle a est un pigment actif, avec une configuration électronique spéciale. Elle est liée étroitement à d’autres pigments, les uns donneurs, les autres accepteurs d’électrons. Parmi eux, la phéophytine a une composition et une structure moléculaire très voisines de celles de la chlorophylle. Ces pigments sont des molécules prosthétiques combinées à des protéines particulières. L’ensemble forme le centre réactionnel d’un photosystème. D’autres molécules (plusieurs centaines) de chlorophylles a et b associées sont des pigments accessoires, groupés en une antenne collectrice autour du centre réactionnel. L’énergie absorbée par les divers pigments accessoires est transmise par résonnance aux pigments actifs. L’ensemble du centre réactionnel et de l’antenne collectrice compose une unité photosynthétique. Les autres pigments accessoires (caroténoïdes) transfèrent également l’énergie reçue vers le centre actif, avec des rendements moindres que les précédents. III- Les photosystèmes Le rapport entre l’effet de la photosynthèse et l’absorption d’énergie lumineuse est accru dans des algues vertes, éclairées simultanément avec deux radiations déterminées de longueurs d’onde différentes. Ces expériences ont amené la découverte de deux photosystèmes différents, capables d’effectuer des réactions photochimiques (figure 39). 10 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) Figure 39 : Présence des deux photosystèmes PSII et PSI dans la membrane des chloroplastes. III-1 Le photosystème II (PS II) Le photosystème est un ensemble chlorophylles-protéines renfermant en particulier le complexe des pigments actifs (chlorophylle a, phéophytine, P680) et ceux des pigments accessoires (chlorophylle a ou Ca672, chlorophylle b, phycobilines, caroténoïdes). Le potentiel d'oxydoréduction est de +0,9 V. Grâce à l’énergie captée, il recevrait les électrons de l’eau, et les transfèrerait à la plastoquinone (figure 40). 11 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) Figure 40 : Fonctionnement du PSII en place dans la membrane du thylakoïde. D1-D2 : sous unités du centre réactionnel, OEC: Oxygen Evolving Complex, P680: dimère de chlorophylle a (molécule piège du centre réactionnel), Pheo: phéophytine, PQ/PQH2: Plastoquinones, QA-QB: Plastoquinones, Tyr: tyrosine III-2 Le photosystème I (PSI) Le photosystème I (PSI) est un autre ensemble, composé de pigments avec leurs protéines respectives, comprenant un complexe de chlorophylle a (P700) active, et d’autres complexes, avec des pigments accessoires (chlorophylles, caroténoïdes). Le potentiel redox s’élève à +0,43 V. Le photosystème capterait des électrons de la plastocyanine pour les céder à la ferrédoxine, et provoquer ainsi la réduction du NADP+ (figure 41). 12 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) Figure 41 : Fonctionnement du PSI en place dans la membrane du thylakoïde III-3 Remarque : Autres complexes D’autres complexes interviennent dans les réactions de la photosynthèse. III-3-1 Les complexes collecteurs de lumière Ces complexes n’exercent pas d’activité photochimique, bien qu’ils soient composés aussi de pigments liés à des protéines. Ils possèdent près de la moitié des chlorophylles du chloroplaste, comprenant presque autant de chlorophylles b que de a. A la différence des photosystèmes, ils sont dépourvus de centres réactionnels. L’énergie captée est transférée au photosystème associé, selon le cas PS II, ou PS I. III-3-2 Le complexe cytochromique Ce complexe renferme principalement divers cytochromes (f, b6) et d’autres composants (fer non hémique, phospholipides, caroténoïdes). Ce complexe assure le passage des électrons de la plastoquinone vers la plastocyanine et le photosystème I. III-3-3 Le complexe de la NADP réductase Il permet grâce aux électrons à haute énergie provenant du PS I et transmis par la ferrédoxine, la réduction du NADP+ en NADPH. III-3-4 Le complexe de l’ATP synthétase Il est analogue à celui des mitochondries, avec une partie intra-membranaire hydrophobe et une autre, en saillie dans le stroma. Il existe aussi un facteur de couplage, sur la face externe de la 13 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) membrane du thylakoïde, essentiellement dans les régions intergranaires. Le complexe assure également le passage transmembranaire des protons. IV- La phase lumineuse de la photosynthèse IV-1- Réaction photochimique primaire Des chloroplastes isolés et éclairés, en présence d’un oxydant (benzoquinone), transforment de l’hémoglobine en oxyhémoglobine. L’oxygène produit provient de l’eau, comme le montre l’emploi d’eau marquée à l’oxygène lourd H218O, selon une réaction du type : H2O ---> 2 H+ + 1/2 O2 + 2e- (Photolyse de l'eau) Le transfert des électrons à partir de l’eau s’effectue contre un gradient électrochimique grâce à l’énergie apportée par le photosystème II (P680) qui permet la production d’oxygène. Les électrons seraient transférés à un accepteur terminal, le NADP+, au moyen de l’intervention du photosystème I (P700). Ce photosystème prendrait le relais du précédent. Entre les deux, les électrons perdraient une partie de leur énergie, au cours du passage par une série de transporteurs, comprenant la plastoquinone, plusieurs cytochromes (b6, b559, f), et la plastocyanine. En résumé, les électrons seraient transférés de l’eau au NADP grâce à un apport d’énergie considérable, d’origine solaire. IV-2- La photo-phosphorylation Une fraction de chloroplastes illuminés, en solution avec de l’ADP, du phosphate inorganique et du NADP, produit de l’ATP et du NADPH. La phosphorylation engendrée par la lumière serait couplée avec le transfert des électrons, à l’issue du photosystème II. L’abaissement thermodynamique entre la plastoquinone et le photosystème I serait suffisant pour permettre la synthèse d’ATP. Une telle photo phosphorylation acyclique (figure 42) s’effectue au cours du 14 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) transfert des électrons vers le NADP. Elle produit environ 2 ATP pour un flux de 4 e-, soit pour un O2 dégagé. Figure 42 : Schéma de la photo phosphorylation acyclique. Une photo-phosphorylation cyclique (figure 43), a lieu quand les électrons issus du photosystème I, au lieu de passer vers le NADP, transitent à nouveau par la chaîne des transporteurs. Ce cycle est facilité par la raréfaction du NADP, due à l’accumulation de sa forme réduite. Il transforme une partie importante de l’énergie lumineuse en liaisons chimiques (ATP). Les deux sortes de phosphorylation ont vraisemblablement lieu en même temps. Elles approvisionnent le chloroplaste en NADPH et en ATP. 15 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) Figure 43 : Schéma de la photo phosphorylation cyclique. V- La phase obscure de la photosynthèse: le cycle de Calvin Le cycle de Calvin se fait dans le stroma des chloroplastes chez les eucaryotes. C'est la dernière étape de la photosynthèse où l'ATP et le NADPH, produits pendant les réactions photochimiques, sont utilisés. Ce cycle est une succession de réactions biochimiques, régulées par différentes enzymes pour permettre la réduction et l'incorporation du CO2 atmosphérique dans des molécules organiques. Ce cycle se répète 6 fois (donc 6 incorporations de CO2) pour former une molécule de glucose par exemple. Ce glucose pourra ensuite servir dans la synthèse de polysaccharides, d'acides gras, d'acides aminés, de nucléotides et de toutes les autres molécules nécessaires à la vie de la plante. Conclusion Le mécanisme de la photosynthèse peut se diviser en deux phases esentielles (figure 44), indépendantes sur le plan des réactions spécifiques mais parfaitement coordonnées entre elles grâce aux intermédiaires énergétiques formés. 16 Imen KHOUNI Université Virtuelle de Tunis Biologie et Physiologie Végétales Autotrophie des organismes végétaux (LA PHOTOSYNTHESE) Thylakoide Figure 44 : Schéma général de la photosynthèse dans un chloroplaste · à gauche, la phase photochimique réalisée dans les membranes des thylakoïdes, · à droite, la phase biochimique représentée par le cycle de Calvin dans le stroma, · au centre, les intermédiaires, NADP/NADPH et ADP/ATP. L'ATP est un intermédiaire énergétique qui doit être continuellement reformé à partir de l'ADP (couple ADP/ATP). Le NADPH est un intermédiaire d'oxydoréduction qui doit être maintenu continuellement à l'état réduit (couple NADPH / NADP). En d'autres termes, le NADPH et l'ATP produits par la phase photochimique permettent la réalisation de la phase biochimique mais leur régénération par la phase photochimique est indispensable à la poursuite de la phase biochimique. 17 Imen KHOUNI