Partie II exercice 1 : brassage génétique
Transcription
Partie II exercice 1 : brassage génétique
Sujet 2A : Recherche d’informations utiles à la résolution d’un problème scientifique (4pts) Stabilité et variabilité des génomes et évolution Un modèle possible de l'histoire évolutive des gènes qui codent la lactico-déshydrogénase, enzyme présente chez tous les êtres vivants, est représenté dans le document de référence. Question : Montrez que les informations apportées par le document valident le modèle proposé de l'histoire évolutive des gènes de la lactico-déshydrogénase. Document de référence Modèle proposé pour illustrer l'histoire évolutive qui a conduit aux gènes qui codent la lacticodéshydrogénase chez l'Homme. Document La lactico-déshydrogénase (LDH) est une enzyme constituée par l'association de quatre chaînes polypeptidiques qui peuvent être identiques ou non. Chez l'Homme il existe trois types de chaînes (LDH-A, LDH-B et LDH-C). a) Localisation des gènes de la LDH sur les chromosomes de l'Homme : b) Séquences partielles d'acides aminés des chaînes polypeptidiques LDH-A, LDH-B et LDH-C humaines, après alignement : N.B. : Dans les séquences de LDH-B et LDH-C un tiret indique un acide aminé identique à celui présent dans la séquence de LDH-A, laquelle est prise arbitrairement comme référence. Corrigé 2A Barème (4pts) Introduction On cherche à valider le modèle de l’histoire évolutive des gènes de la lacticodéshydrogénase à partir du document proposé 0,25pt Analyse et interprétation du document Notion de gène ancestral - Grande similitude de séquence entre les 3 chaînes de la Lactico-déshydrogénase (LDH-A, LDH-B et LDH-C) Ces 3 chaînes sont homologues et dérivent toutes d’une chaîne unique codée par un gène ancestral commun 3pts Notion de duplication-transposition - Chaque chaîne LDH est gouvernée par un gène distinct : deux des gènes (A et C) sont localisés sur le même chromosome 11 et le 3 ème est localisé sur le chromosome 12. ces 3 gènes sont issus du mécanisme de duplication-transposition à partir du gène ancestral Notion de mutations - La séquence des 3 gènes (A, B et C) présente des différences : Celles-ci sont dues à des mutations qui se sont accumulées au cours de temps sur les différents duplicata de gène - Le nombre de différence d’acides aminés entre la séquence des chaînes A et C n’est que de 7 alors qu’il est de 9 entre B et A et de 11 entre B et C La duplication qui a donné naissance à A et C est la plus récente dans le temps puisque le nombre de différence entre les deux séquences est le plus petit (7) La duplication, à partir du gène ancestral qui a donné naissance à B et au gène commun à A et C, est la plus lointaine car le nombre de différence entre la chaîne B et les deux autres est le plus élevé (9 et 12) Conclusion : - Les trois gènes de la Lacticodéshydrogénase correspondent à une famille multigénique, - ils ont été créés à partir d’un gène ancestral commun (séquences similaires des trois gènes) - par des mécanismes de duplication-transposition (localisés à des locci différents sur deux chromosomes) - ces gènes se différencient par mutations (différences +/- importantes entre les trois chaînes, renseignant sur la +/- grande proximité des duplications entre gènes ) 0,75pt