Fiche emploi 86 MCF 1388 - Université Paris-Sud

UNIVERSITE PARIS SUD
UFR PHARMACIE
CAMPAGNE EMPLOI 2013
Emploi n° 86 MCF 1388
« Modélisation Moléculaire »
Enseignement
filières de formation concernées
Rattaché à la discipline « Chimie Thérapeutique », l’enseignement de Modélisation Moléculaire concerne
des enseignements dirigés (L3 et M1) et pratiques (L3 et M1 de Pharmacie). Il concerne également des cours
magistraux en L3, M1, M2 et en M2 de Pharmacie, filière industrie. Les enseignements de modélisation
s’inscrivent dans une stratégie pédagogique inter-composantes (UFR de Châtenay-Malabry et UFR des
Sciences d’Orsay), mais aussi inter-départements, les plus concernés étant ceux de Chimie thérapeutique,
Chimie organique, Chimie analytique, Biotechnologie, Physique, Physico-chimie, Galénique et
Pharmacologie.
objectifs pédagogiques et besoin d'encadrement
Les enseignements de modélisation moléculaire doivent permettre aux étudiants de comprendre et d’utiliser
les outils et les méthodes de la modélisation moléculaire pour la conception de nouveaux principes actifs.
Ces enseignements, faisant partie intégrante des enseignements coordonnés, doivent permettre à l’étudiant de
mieux établir, via la modélisation moléculaire de complexes biomolécules-ligand, des passerelles entre
synthèses de molécules thérapeutiques et activités pharmacologiques. Le (la) Maître de Conférences (MCF)
aura également pour tâche de faire évoluer, avec le professeur de modélisation moléculaire, les
enseignements dirigés, pratiques et magistraux existants et d’introduire les nouvelles techniques et
technologies de la modélisation moléculaire nécessaires aux cursus des étudiants de la Faculté de Pharmacie.
Le (la) MCF sera rattaché au professeur de modélisation moléculaire nouvellement recruté avec pour objectif
d’offrir de nouveaux enseignements de niveau M1 et M2 en vue de former de futur(e)s doctorant(e)s en
modélisation moléculaire.
▪ Recherche
Rattaché dans le présent quinquennal à l’équipe « Molécules Fluorées et Chimie Médicinale » au sein de
l’UMR CNRS 8076 BioCIS, l’objectif du MCF sera de mettre au point des techniques innovantes de
modélisation moléculaire pour étudier et participer à la compréhension des phénomènes de changement
conformationnel et d’agrégation des protéines impliquées dans un grand nombre de pathologies telles que la
maladie d’Alzheimer. Les modèles obtenus constitueront une aide précieuse à la conception de molécules
capables de se lier à ces protéines afin de moduler et inhiber ces changements conformationnels et les
interactions protéine-protéine qui gouvernent les phénomènes pathologiques d’agrégation.
Le (la) MCF sera également impliqué(e) dans différents projets de l’Unité BioCIS et d’autres équipes de
notre UFR. Il(elle) participera à la création de la plateforme de MM de l’IFR 141 IPSIT et également
à la réalisation de projets du LabEx LERMIT en collaboration avec d’autres modélisateurs dans le
cadre d’un réseau en constitution. Notamment, il (elle) sera amené(e) à apporter une aide théorique à la
chimie de synthèse de ligands via des méthodes de chimie numérique : explication et prévision des
réactivités chimiques. Plus généralement, il (elle) devra participer à caractériser les structures de
biomolécules cibles et leurs interactions avec des molécules thérapeutiques grâce aux outils de la
modélisation moléculaire. Il (elle) devra maîtriser les techniques avancées de modélisation moléculaire,
utiles à l’innovation thérapeutique : Modélisation par homologie de séquence, affinage des structures
tridimensionnelles des biomolécules par simulation de dynamique moléculaire, docking moléculaire pour la
prédiction des interactions protéine-protéine, protéine-ligand et protéine-acide nucléique. En amont de ces
techniques, le (la) maître de conférence sera probablement amené à paramétrer des champs de forces
atomiques à partir de calculs quantiques. En aval, il (elle) devra pouvoir proposer des estimations d'énergie
libre d'association, par des approches de type MM/PBSA.
Par ailleurs, une maîtrise des outils informatiques nécessaires à l'installation et l'utilisation de logiciels
commerciaux mais aussi à la programmation de petits programmes « maison » sera très appréciée :
Environnements Linux, Unix..., scripts Shell, Python…, langages de programmation Fortran, C....
Laboratoire(s) d'accueil : (sigle et intitulé détaillé) UMR CNRS 8076 BioCIS
Type (UMR, EA, JE,
ERT)
UMR
N°
Nbre de chercheurs
8076
9
Nbre d'enseignantschercheurs
29
CONTACTS :
• enseignement : Professeur Tap Ha-Duong. [email protected].( +33) 0146835643
• recherche : Dr. Bruno Figadère. Bruno.Figadè[email protected]. (+33) 0146835592
Envoyer le dossier à l’adresse suivante :
UFR PHARMACIE – Service du Personnel – 5 rue Jean-Baptiste Clément 92290 Châtenay-Malabry