La digestion de la cellulose - ExpoJournal - Cégep de Saint
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La digestion de la cellulose - ExpoJournal - Cégep de Saint
La digestion de la cellulose Par : Luc Bouchard-Lalancette et Gabrielle Delisle Résumé : La digestion de la cellulose. Bouchard-Lalancette, L. & G. Delisle. 2015. Rapport interne. Sciences, Cégep St-Félicien. Analyse de la matière ruminée d’une vache pour déterminer si les bactéries continuent à hydrolyser la cellulose en glucose, et ce, à l’extérieur de son estomac. La concentration de glucose a augmenté selon le temps. Toutefois, après environ 1 heure elle tend à diminuer. Abstract : The cellulose digestion. Bouchard-Lalancette, L. & G. Delisle. 2015. Internal report. Sciences, Cégep St-Félicien. Ruminated matter analysis to determine if hydrolytic bacteria continue to transform cellulose to glucose out of cow’ stomach. Glucose concentration increased by time but tend to decrease after one hour. Mots clés: chimie, cellulose, hydrolyse, matière ruminée glucose, vache, bactérie, Les vaches, à l’inverse de l’être humain, sont capables de digérer le foin, c’est-à-dire la cellulose et de le transformer en glucose. De cette façon, elles obtiennent l’énergie nécessaire à leur bon fonctionnement. Le processus de digestion s’effectue grâce aux bactéries hydrolytiques contenues dans leurs estomacs. À travers cette expérimentation, le but était de vérifier si ces bactéries, manipulées à l’extérieur de l’estomac dans des conditions similaires, survivaient et continuaient à hydrolyser la cellulose. Théorie D’une part, les vaches sont des herbivores puisque leur alimentation est composée principalement de matières végétales, c’est-à-dire de foin, d’herbes, etc. Elles Fig. 1: Plusieurs monomères de glucoses attachés ensemble forment la cellulose sont aussi des ruminants, car elles mastiquent leurs aliments constamment, et ce, même après la première ingurgitation. Après avoir été avalés, les aliments reviennent dans la bouche (régurgitation) où ils sont mélangés avec de la salive et mastiqués à nouveau. Cette La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 1 activité permet de défaire la cellulose (fig.1) contenue dans leur alimentation en monomères de glucose, et ainsi obtenir de l’énergie. Le rumen, soit l’un des quatre estomacs de la vache, est un environnement propice à la croissance et la reproduction des bactéries qui créent les enzymes servant à défaire la cellulose. Il existe plusieurs types de bactéries présentes dans cet estomac, dont celles hydrolytiques, qui dégradent la matière organique pure (les polymères) en morceaux solubles (monomères). Une bactérie hydrolytique est l’équivalent d’une bactérie anaérobie facultative, c’est-à-dire qu’elle peut vivre en présence de dioxygène, à l’inverse de celle anaérobie stricte. D’autre part, la température corporelle d’une vache varie entre 38,8 °C et 39,2°C. De plus, le pH de l’estomac se situe normalement près de la neutralité, à environ 6.5. La gamme de pH optimale pour les bactéries hydrolytiques se situe entre 4,5 et 6,3. Hypothèses: 1. En milieu similaire à l’estomac de la vache, les bactéries présentes dans son estomac transforment la cellulose en monomères de glucose. 2. La concentration du glucose augmentera avec le temps et deviendra stable au moment où toute la cellulose sera transformée. Méthodologie Afin de déterminer si le glucose augmentait selon le temps, il a fallu, dans un premier temps, prélever un échantillon de matière ruminée chaque semaine. De cette façon, il était possible d’effectuer un dosage colorimétrique à l’anthrone. Cela consistait, d’abord, à ajouter le réactif d’anthrone dans des substances témoins dont la concentration de glucose était connue et de les passer au spectrophotomètre. Ainsi, une courbe standard témoin de l’absorbance en fonction de la concentration de glucose (fig.2) était établie. Ensuite, ce même processus était fait sur les échantillons de matière ruminée. Avec la courbe standard témoin et la lecture de l’absorbance de ces échantillons, le graphique de la concentration de glucose selon le temps était réalisable. De plus, un test supplémentaire (test de Molisch) est venu confirmer la présence de glucose dans les échantillons. Finalement, une culture de bactéries a été exécutée. Ces bactéries ont été ajoutées à un mélange d’eau et de foin et soumises au test de l’anthrone pour vérifier, encore une fois, si la concentration de glucose augmentait selon le temps. Résultats Voici les résultats obtenus des différents tests échelonnés sur une période de neuf semaines. En tout premier lieu, il y a les résultats du dosage à l’anthrone (une seule courbe standard est présentée) et ensuite celui du test de Molisch. Aucun résultat n’est disponible pour la culture de bactéries étant donné des erreurs de manipulation. La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 2 Fig.2: Courbe standard témoin de la semaine 2 Concentration de glucose (mmol/L) en fonction de l'absorbance Absorbance 1,5 1 y = 3,407x R² = 0,9964 0,5 0 0 0,05 0,1 Source: Bouchard-Lalancette L. et Delisle G. 2015, Courbe standard semaine 2. 0,15 0,2 0,25 0,3 0,35 0,4 Concentration de glucose (mmol/L) Fig.3: Courbes de la concentration de glucose en fonction du temps des différents échantillons de matière ruminée CONCENTRATION DE GLUCOSE (MMOL/L) 0,16 0,14 CONCENTRATION DE GLUCOSE (MMOL/L) SELON LE TEMPS (HEURE) DE 4 ÉCHANTILLONS y = -0,0212x2 + 0,0864x + 0,0432 R² = 1 y = -0,0485x2 + 0,102x + 0,062 R² = 1 0,12 y = -0,0017x2 + 0,0142x + 0,082 R² = 1 Semaine 2 0,10 Semaine 3 Semaine 6 0,08 Semaine 7 y = -0,0041x2 + 0,0296x + 0,0448 R² = 1 0,06 0,04 0 0,5 G. Source: Bouchard-Lalancette L. et Delisle 2015, 4 échantillons de matière ruminée. 1 1,5 2 2,5 TEMPS (HEURE) La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 3 Fig.4: Résultat du test de Molisch Discussion Avec les résultats précédents, il est possible de confirmer la première hypothèse, soit qu’en milieu similaire à l’estomac de la vache, les bactéries continuent à hydrolyser la cellulose en monomères de glucose. En effet, on constate que les quatre courbes de la concentration de glucose en fonction du temps augmentent (fig.3). Cela révèle que les bactéries sont vivantes et qu’elles poursuivent leur travail hydrolytique. De plus, le test de Molisch affiche une couleur pourpre (fig.4), ce qui témoigne de la présence de glucose dans les solutions de matière ruminée. Toutefois, la deuxième hypothèse, qui stipule que la concentration de glucose augmente en fonction du temps et se stabilise au moment où toute la cellulose est transformée, est en partie infirmée. En effet, au bout d’un certain temps (après 1h lors de la semaine 6 d’expérimentation), la concentration de glucose dans la solution diminue. Pour ce qui est des courbes des autres semaines, il aurait fallu prolonger la durée de leur analyse pour avoir une meilleure idée de leur allure. Selon les fonctions qu’elles affichent (fonctions polynomiales inverses de degré deux), on peut croire qu’elles finiront par redescendre, tout comme celle de la semaine 6. Mais cela reste néanmoins qu’une supposition. Critiques et suggestions Plusieurs points forts ressortent de cette expérience. Premièrement, les manipulations ont été répétées de la même façon chaque semaine, en diminuant à chaque fois les erreurs des semaines précédentes. Cela a permis de construire une base de données plutôt significative dont les résultats se ressemblent d’une semaine à l’autre. De plus, le test de Molisch est fiable puisqu’il ne contient pas d’incertitudes. La couleur pourpre est apparue, donc la présence de glucose dans les échantillons est certaine. Deuxièmement, les courbes standards (exemple à la fig.2) qui permettaient de La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 4 construire les graphiques étaient refaites chaque semaine pour rendre fiables les résultats malgré l’instabilité de l’anthrone. Par ailleurs, certains points faibles sont observables. Dans un premier temps, les résultats obtenus sont moyennement fiables puisque les marges d’incertitudes sont élevées. Cela s’explique par le fait que chacune des courbes des graphiques (fig.3) était construite à partir de deux ou de trois données seulement. En effet, peu de temps était disponible au laboratoire. De plus, les échantillons de matière ruminée n’étaient pas toujours prélevés sur la même vache et pris au même stade de rumination. Cela a pu avoir une influence sur le nombre de bactéries présentes dans ces échantillons. Dans un deuxième temps, la culture de bactéries n’a pas donné des résultats concluants, car les manipulations s’échelonnaient sur deux semaines. Ainsi, l’anthrone n’a pas réagi de la même façon d’une fois à l’autre. Afin d’améliorer les faiblesses du projet, il faudrait refaire le même protocole, mais sur un intervalle de temps plus long pour récolter plus de données. De plus, il serait préférable de récolter la matière ruminée sur le même animal et essayer de la prélever au même stade de rumination. Pour ce qui est de la culture de bactéries, il faudrait réduire la période entre les dosages à l’anthrone. À partir d’ici, il est possible d’émettre de nouvelles hypothèses : 1. Il est possible de transformer le bois en sucre à partir des bactéries hydrolytiques du rumen de la vache. 2. La diminution du glucose après un certain temps s’explique par le fait que les bactéries consomment le sucre qu’elles ont hydrolysé auparavant. (Pour la vérifier, on pourrait alors ajouter des nutriments dans les échantillons de matière ruminée afin de nourrir les bactéries et d’éviter une diminution du sucre.) Retombées et impacts du projet Le projet permet de mieux comprendre et expliquer le phénomène de la digestion de la cellulose à l’intérieur de la vache. S’il était plus élaboré, il pourrait peut-être permettre de régénérer la flore bactérienne d’une vache après la prise d’antibiotiques. Puisque les vaches sont essentielles à notre quotidien, il est important que leur digestion fonctionne convenablement. De plus, la transformation du bois en sucre avec les bactéries de la flore bactérienne pourrait être révolutionnaire. D’ailleurs, comme l’industrie forestière est en baisse, il serait envisageable d’exploiter le bois à des fins alimentaires. La fabrication de biocarburants, comme l’éthanol, serait aussi une retombée possible pour le projet. Conclusion Finalement, la première hypothèse est confirmée. En effet, les résultats obtenus prouvent que la quantité de glucose contenue dans les échantillons de matière ruminée La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 5 augmente selon le temps. De plus, le résultat positif du test de Molisch apporte une preuve additionnelle de la présence de glucose dans les échantillons. Ainsi, on peut conclure qu’en milieu similaire à l’estomac de la vache, les bactéries poursuivent leur travail hydrolytique, en décomposant la cellulose en glucose. Par contre, la seconde hypothèse est infirmée. Tout particulièrement aux résultats de la semaine 6, on remarque une diminution du glucose après une heure. De ce fait, il est impossible de dire que la concentration de glucose devient stable au moment où toute la cellulose est transformée. Remerciements Merci à M. Dany Delisle, agriculteur, pour son aide attribué au prélèvement des échantillons de matière ruminée chaque semaine. Cela a contribué à simplifier les manipulations du projet et a permis de refaire l’expérience plus d’une fois afin de valider avec le plus de précision possible les hypothèses. Médiagraphie Livre BOULIANNE, R. (2014). Laboratoire#5 : Dosage des glucides par colorimétrie, inspiré de la méthode de l’anthrone par Dreywood (1946), tiré du cahier de protocole du cours 202-204-FE, Cégep de St-Félicien, St-Félicien, Canada. Sites Internet DÉRY, Martin et BOIVIN, Patrick, Du glucose avec la cellulose, (page consultée le 30 novembre 2014, [En ligne], http://www.cstfelicien.qc.ca/scinat/cyberexpojournal2005/w05c04.pdf WATTIAUX, Michel A. et HOWARD, W. Terry, Digestion chez la vache laitière, (page consultée le 30 novembre 2014), [En ligne], http://babcock.wisc.edu/sites/default/files/de/fr/de_01.fr.pdf GRANDBOIS, Denys, L’analyse des composés biochimiques, (page consultée le 28 janvier 2015), [En ligne], http://cyber.collegeshawinigan.qc.ca/dgrandbois/Cours-enseignes/Analyseorganique-I/Laboratoires/05-Analyse-composes-bio-A04.pdf La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 6 DELFOSSE PHILIPPE, Microbiologie de la digestion anaérobie, (page consultée le 28 janvier 2015), [En ligne], http://www.aile.asso.fr/wp-content/uploads/2013/07/CR_presentationPhillipe-Delfosse_avec-ppt_2011-06-21.pdf WIKIPEDIA, Spectrophotomètre, (page consultée le 28 janvier 2015), [En ligne], http://fr.wikipedia.org/wiki/Spectrophotom%C3%A8tre Iconographie Image d’en-tête : http://pcd.wikipedia.org/wiki/Vake Figure 1 : http://commons.wikimedia.org/wiki/File:HaworthStrukturCellulose.jpg Figure 2 et 3 : Cégep Saint-Félicien 2015, microsoft excel 2013. BOUCHARDLALANCETTE. L et DELISLE. G Figure 4 : Photo personnelle, BOUCHARD-LALANCETTE. L, Cégep de SaintFélicien, 2015. Reproduction interdite La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 7 ANNEXE 1 : Tableaux complets des résultats Tableau de l'absorbance de 4 solutions de matière ruminée en fonction du temps (heure) Solution: Temps (heure) Semaine 2 Absorbance Incertitude 0 1,5 2 0 1 1,75 0 1 2 0 1 2 Semaine 3 Semaine 6 Semaine 7 0,17 0,44 0,46 0,162 0,255 0,305 0,19 0,35 0,22 0,25 0,28 0,31 ±0,005 ±0,005 ±0,005 ±0,005 ±0,005 ±0,005 ±0,005 ±0,005 ±0,005 ±0,005 ±0,005 ±0,005 Tableau de la concentration de glucose (mmol/L) en fonction du temps (heure) des 4 échantillons de matière ruminée semaine 2 semaine 3 semaine 6 semaine 7 Temps (heure) [] mmol/L [] mmol/L [] mmol/L [] mmol/L 0 0,05 ± 0,03 0,04 ± 0,03 0,06 ± 0,03 0,08 ± 0,03 0,07 ± 0,03 0,12 ± 0,04 0,09 ± 0,03 0,07 ± 0,03 0,1 ± 0,04 1 1,5 0,13 ± 0,04 1,75 2 0,08 ± 0,03 0,13 ± 0,04 La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 8 ANNEXE 2 : Incertitudes et exemples de calculs Incertitude sur l’absorbance: ±0,05 pour les lectures d’absorbance entre 0 et 0,5. Incertitude sur la balance électronique: 1% Incertitude sur la pipette de 2 ml: 1% Incertitude sur la pipette de 1 ml: 1% Incertitude sur le cylindre gradué de 100 ml : ±0,5 ml Exemple de calcul pour déterminer la concentration de glucose d’une solution (semaine 2): Fonction de la courbe standard : y=3,407x, où x=Concentration de glucose (mmol/L) et y=absorbance. Absorbance du spectrophotomètre (à temps 0) : 0,17 ± 0,05 Calcul : x = 0,17 ÷ 3,407 = 0,0499 mmol L Exemple de calcul pour déterminer l’incertitude sur la concentration de glucose d’une solution (semaine 2): Incertitude de l’absorbance= ±0,05 Absorbance max= 1,1 Absorbance min=0 Incertitude de la pente du graphique de l’absorbance= Pente max= Pente min = 𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒 𝑚𝑎𝑥+𝛥𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒 𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒𝑚𝑖𝑛− 𝛥𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒 𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒 𝑚𝑎𝑥−𝛥𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒 𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒𝑚𝑖𝑛+ 𝛥𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒 Incertitude de la pente= = |( =| 1.1+0,05 0−0,05 1.1−0,05 0+0,05 𝑃𝑒𝑛𝑡𝑒𝑚𝑎𝑥+𝑃𝑒𝑛𝑡𝑒𝑚𝑖𝑛 2 ) |=23 |=21 23−21 2 = ±1 Pente de la courbe témoin= 3±1 Incertitude sur la concentration de glucose : La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 9 𝛥[𝑔𝑙𝑢𝑐𝑜𝑠𝑒] 𝛥𝑃𝑒𝑛𝑡𝑒 𝛥𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒 = + [𝑔𝑙𝑢𝑐𝑜𝑠𝑒] 𝑃𝑒𝑛𝑡𝑒 𝐴𝑏𝑠𝑜𝑟𝑏𝑎𝑛𝑐𝑒 𝛥[𝑔𝑙𝑢𝑐𝑜𝑠𝑒] = 0,0499𝑚𝑚𝑜𝑙 1 0,05 𝑚𝑚𝑜𝑙 ∗( + ) = ±0,03 𝐿 3 0,17 𝐿 ANNEXE 3 : Matériel et manipulations de la matière ruminée Matériel: - - Une vache Matière ruminée 1 bain thermostaté Glucose Anthrone 1 spectrophotomètre 1 Centrifugeuse Alpha-naphtol Éthanol Acide sulfurique concentré 1 chronomètre Éprouvettes en vitre 1 malaxeur 10 tubes à spectrophotomètre 1 pipette pasteur 1 bain de glace 1 bain-marie bouillant 1 flacon distributeur 1 balance électronique Nacelles de pesée 1 pipette de 2 ml Pipette de 1 ml 1 cylindre gradué de 100 ml Eau distillée Charbon Erlenmeyer à vide Trompe à eau Joint conique Entonnoir de Büchner Papier filtre Manipulations : 1. Récolter la matière ruminée (contenu gastrique d’une vache) 2. Disposer 5g de matière ruminée dans un malaxeur et la mélanger avec 500 ml d’eau. (Solution) 3. Placer la solution dans un bain thermostaté à une température de 38,5°C. 4. Prendre des échantillons de la solution à différents temps et les placer dans des éprouvettes afin de les centrifuger pendant 15 minutes. La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 10 5. Effectuer un filtrage au charbon sous vide des échantillons. 6. Effectuer un dosage colorimétrique à l’anthrone sur les échantillons. *Effectuer le test de Molisch sur un échantillon afin de confirmer la présence de glucose. La digestion de la cellulose, Cégep de St-Félicien Page 11