Projet these 2013 Pe.. - BIO-SigNE - Université Paris-Sud

Ecole Doctorale 419
"Signalisations et Réseaux Intégratifs en Biologie"
APPEL A PROJETS DE THESE
POUR CANDIDATURES AUX ALLOCATIONS DOCTORALES 2013
A renvoyer à l’Ecole Doctorale par voie électronique au plus tard le 03 avril 2013 :
[email protected]
Cet appel constitue la 1ère phase obligatoire avant toute candidature éventuelle
au concours de l’ED (2ème phase juin2013 –Concours ED 08 et 09 juillet 2013)
Unité de Recherche et Equipe d’Accueil proposant le projet :
Nom, Intitulé et N° du Laboratoire : Neurobiologie & Développement, UPR3294
Nom, Libellé de l’Equipe d’accueil: SCaNR : Stem Cells and Neurogenesis in the Retina
Nom et prénom du directeur du Laboratoire: Philippe VERNIER
Etablissement(s) de rattachement : CNRS
Adresse postale (complète) du laboratoire : Institut de Neurobiologie A. Fessard, 91198
Gif-sur-Yvette Cedex
Tél. : 01 69 82 34 30
Fax : 01 69 82 34 47
E-mail : [email protected]
Responsable de l’équipe dans laquelle le doctorant fera sa thèse :
Nom :
PERRON
Prénom :
MURIEL
Titre :
DR
Nom du directeur de thèse (si différent) :
Titre :
Adresse postale (complète) :
Bat 445, Université Paris Sud, 91405 ORSAY
Tél. : 01 69 15 72 25
E-mail : [email protected]
Fax : 01 69 15 68 02
Nom du co-directeur éventuel (HDR) :
Nom du co-encadrant éventuel (sans HDR) :
Nombre de doctorants encadrés par le directeur de thèse l’année 2013-2014
(hors candidat pressenti) : 1 Pauline Cabochette (3ème année) MESR
Nom Prénom des allocataires (MESR, Région, Paris-Sud…)
de l’équipe durant les deux dernières années :
Pauline Cabochette MESR, Nicolas Mazurier Région Neuropôle Thèse soutenue en
2012; Warif El Yakoubi MESR et Retina France, Thèse soutenue en 2012
Un candidat est-il déjà pressenti : NON
1
Projet de thèse en français et en anglais:
Titre du projet :
ETUDE DES PROCESSUS REGENERATIFS DE LA RETINE CHEZ DES
MODELES AMPHIBIENS DE DYSTROPHIES RETINIENNES
Résumé du projet (15 lignes maximum) :
La découverte de cellules souches quiescentes dans la rétine des mammifères adultes offre des
perspectives de traitements des dystrophies rétiniennes par thérapie cellulaire. Un des enjeux
est de savoir comment recruter et activer ces cellules afin qu’elles participent au processus de
réparation chez des patients souffrant de maladies dégénératives de la rétine. Contrairement à
la rétine des mammifères, celle du xénope est capable de régénérer après lésion ou ablation.
Nous avons donc établi chez le xénope des modèles transgéniques de dégénérescence
rétinienne pour mettre en lumière les processus moléculaires mis en jeu lors de la régénération
du tissu rétinien. Les nombreux avantages du xénope en neurobiologie expérimentale et en
transgenèse constituent de réels atouts pour étudier ces mécanismes in vivo. L’objectif de
cette thèse est de caractériser les événements cellulaires et moléculaires à l’œuvre après
lésion. Plus particulièrement, notre étude s’intéressera au comportement des cellules souches
rétiniennes en conditions régénératives via l’analyse de leur activité proliférative et des
modifications de leur transcriptome (séquençage haut débit). Ce projet devrait permettre de
mieux comprendre les mécanismes de réactivation des cellules souches après lésion et ainsi
d’offrir des perspectives thérapeutiques pour restaurer ce processus chez les mammifères.
Title of the project:
STUDY OF RETINAL REGENERATIVE PROCESS IN AMPHIBIAN MODELS OF
RETINAL DYSTROPHIES
Summary of the project (15 lines maximum):
The discovery of various sources of quiescent neural stem cells in the mammalian retina
offers perspectives for the treatment of retinal dystrophies through cellular therapy. One
challenge is to know how to recruit and activate these cells so that they can participate to the
regenerative process in patients suffering from degenerative retinal diseases. Unlike that of
mammals, the Xenopus retina is able to repair following lesion or ablation. We have thus
established Xenopus transgenic models of degenerative diseases in order to bring more
insights into the molecular process of retinal tissue regeneration. The numerous advantages of
Xenopus in experimental neurobiology and in transgenesis represent a real asset to study these
mechanisms in vivo. The objective of the PhD thesis is to characterize the cellular and
molecular events at work after the lesion. In particular, our study will focus on retinal stem
cell behaviour under regenerative conditions through the analysis of their proliferative activity
and the modifications of their transcriptome (high throughput sequencing). This project
should increase our knowledge on the mechanisms underlying lesion-induced stem cells
reactivation and thereby offer therapeutic perspectives to restore the process in mammals.
Connaissances et compétences requises pour la thèse :
De bonnes connaissances/compétences en bio-informatique/transcriptomique ne sont pas
requises mais seraient un atout certain. De même pour la biologie des cellules souches.
2
Sélection des cinq meilleures publications de l'équipe depuis 2009 (en soulignant les noms
des membres de l'équipe au moment du travail. Attention : il s'agit des publications de
l'équipe, pas du laboratoire) :
1.
El Yakoubi W, Borday C, Hamdache J, Parain K, Tran HT, Vleminckx K, Perron M§
and Locker M§ (2012). Hes4 controls proliferative properties of neural stem cells during
retinal ontogenesis. Stem Cells 30(12):2784-95.
2.
Borday C*, Cabochette P*, Parain K, Mazurier, N, Janssens S, Tran HT, Sekkali B,
Bronchain O, Vleminckx K, Locker M & Perron M. (2012). Antagonistic cross-regulation
between Wnt and Hedgehog signaling pathways controls post-embryonic retinal proliferation.
Development 139(19):3499-509.
3.
Parain K*, Mazurier N*, Bronchain O, Borday C, Cabochette P, Chesneau A, Colozza
G, el Yakoubi W, Hamdache J, Gilchrist M, Pollet N, Perron M. (2012). A large scale screen
for neural stem cell markers in Xenopus retina. Developmental Neurobiology 72(4):491-506.
4.
Kaya F, Mannioui A, Chesneau A, Sekizar S, Maillard E, Ballagny C, Houel-Renault
L, Dupasquier D, Bronchain O, Holtzmann I, Desmazieres A, Thomas JL, Demeneix BA,
Brophy PJ, Zalc B, Mazabraud A. (2012). Live Imaging of Targeted Cell Ablation in
Xenopus: A New Model to Study Demyelination and Repair. Journal of Neuroscience
32(37):12885-12895.
5.
Locker M, El Yakoubi W, Mazurier N, Dullin JP, Perron M. (2010). A decade of
mammalian retinal stem cell research. Arch Ital Biol. 148:59-72.
* Co-first authors
§
Co-corresponding authors
3