Livret des résumés - Arc Espace Chercheurs
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Livret des résumés Livret des résumés 08h30 Accueil des participants 09h15 - 09h30 Ouverture du colloque 09h30 - 09h45 Etude de la régulation par sumoylation de la biogenèse des mRNPs et de la stabilité génétique Hugo BRETES (Institut Jacques Monod) 09h45 - 10h00 Analyse de la signalisation acide rétinoïque dans la leucémie aiguë promyélocytaire : rôle des interactions protéiques et détermination des cibles d’aval Julien ABLAIN (Hôpital Saint-Louis) 10h00 - 10h15 Etude de l’activité anti-vasculaire des agents anti-vasculaires dans des modèles murins de xénogreffes et du mécanisme d’échappement tumoral impliquant les progéniteurs endothéliaux circulants Mélissa TAYLOR MARCHETTI (Institut Gustave Roussy) 12h00 - 12h15 Rôle de WT1, gène suppresseur de la tumeur de Wilms, dans les neuroblastomes. Caroline MASSEROT-LUREAU (Centre Universitaire Des Saints-Pères) 12h15 - 12h30 Émergence du concept de «cancer stem cell». Lucie LAPLANE (Université Paris Ouest) 12h30 - 14h00 14h00 - 14h15 Le rôle de Rpp30 (RNaseP protein 30) dans la formation de piRNAs et le contrôle d’éléments transposables pendant l’ovogenèse chez D.melanogaster: une relation inattendue entre les tRNAs et les piRNAs Anahi MOLLA HERMAN (Institut Curie) 14h15 - 14h30 Plasticité cellulaire et le cancer: le rôle d’une déméthylase histone lors d’un événement reprogrammation cellulaire et l’identification de modificateurs de son activité Steven ZURYN (Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire) 14h30 - 14h45 Identification d’une nouvelle voie de signalisation aPKC-Cortactine-MT1MMP requise à l’invasion tumorale dans les cancers du sein Carine ROSSE (Institut Curie) 10h15 - 10h30 Mécanismes de biogénèse et sécrétion des exosomes Marina COLOMBO (Institut Curie) 10h30 - 10h45 Rôle de la N-cadherine dans la migration collective, un modèle in vivo pour l’étude de l’invasion métastatique Arun KUMAR (Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire) 10h45 - 11h15 PAUSE CAFÉ 11h15 - 11h30 Etude de la préprocalcitonine, candidat prometteur pour le développement d’un vaccin thérapeutique dans les cancers bronchiques : Identification et caractérisation de peptides antigéniques immunogènes issus de cet antigène Aurélie DURGEAU (Institut Gustave Roussy) COCKTAIL DÉJEUNATOIRE 14h45 - 15h00 Identification de nouveaux facteurs angiocrines contrôlant positivement l’expansion des cellules souches des gliomes Eva Maria GALAN MOYA (Institut Cochin) 15h00 - 15h15 L’éducation des cellules Natural Killers par le récepteur activateur NKp46 calibre leur réactivité fonctionnelle anti-tumorale et anti-virale. Emilie NARNI-MANCINELLI (Centre d’Immunologie de Marseille Luminy) 11h30 - 11h45 Analyse des événements génétiques et cellulaires associés à l’oncogénèse des leucémies aiguës dans un syndrome d’instabilité génétique constitutionnel, la maladie de Fanconi Raphael CECCALDI (Hôpital Saint-Louis) 15h15 - 15h30 Isocitrate deshydrogénase et mutation Arg132His : impact pronostique et sur la réponse à la radio- et chimiothérapie Marianne LABUSSIERE (Institut du Cerveau et de La Moelle Epinière) 15h30 - 16h00 PAUSE-CAFÉ 11h45 - 12h00 Les Septines sont requises lors de l’établissement de jonction en sortie de mitose des divisions de cellules épithéliales. Nabila FOUNOUNOU (Institut de Génétique et Développement de Rennes) 16h00 - 18h30 1ère session de présentation des posters scientifiques (Audition par le jury des candidats au Prix Alexandre Joël catégorie Master 2 et au Prix Hélène Starck Catégorie Post-doctorat) liste des posters présentés mercredi 24 et jeudi 25 octobre 2012 08h30 ACCUEIL DES PARTICIPANTS 09h30 - 12h00 2 session de présentation des posters scientifiques (Audition par le jury des candidats au Prix Alexandre Joël catégorie Thèse) ème 11h00 - 12h30 Echanges Jeunes chercheurs - donateurs autour des articles de vulgarisation scientifiques (Prix Kerner) et des posters scientifiques 12h30 - 14h00 DÉJEUNER 14h00 - 14h30 Café rencontre Chercheurs - Donateurs 14h30 - 15h00 Conférence du Docteur Pierre-Antoine Defossez (Université Denis Diderot Paris 7) L’épigénétique : bases conceptuelles, découvertes récentes, et perspectives pour la thérapie du cancer 15h00 - 16h30 Cérémonie de remise des Prix Jeunes Chercheurs de la Fondation ARC 16h30 COCKTAIL DE CLÔTURE Prix Alexandre Joël Catégorie Master 2 Facteurs socio-économiques et qualité de la prise en charge thérapeutique après un diagnostic de cancer du sein Sophie BROUSSY (Institut Bergonie) Développement de modèles précliniques de phéochromocytomes/paragangliomes malins SDHB-dépendants chez la souris Alexandre BUFFET (Centre de Recherche Cardiovasculaire de l’HEGP) Elaboration d’un nouveau modèle murin de LMC reproduisant la chronicité de la pathologie, afin d’évaluer des stratégies thérapeutiques visant à contourner la faible sensibilité des cellules souches leucémiques aux inhibiteurs de tyrosine kinase Noémie DE GUNZBURG (Commissariat à l’Energie Atomique) Prix Alexandre Joël Catégorie Thèse Rôle de l’hélicase FBH1 dans le maintien de la stabilité du génome Agathe BACQUIN (Institut Gustave Roussy) Utilisation de peptides issus des filaments intermédiaires pour le ciblage de nanocapsules lipidiques contenant du Paclitaxel vers les cellules de glioblastomes (tumeurs cérébrales) Julien BALZEAU (Centre Hospitalier Universitaire d’Angers) Rôle d’histones méthyltransférases spécifiques de H3K9 dans la régulation de l’équilibre entre prolifération et différenciation cellulaire. Valentine BATTISTI (Université Denis Diderot) Etude des fonctions des protéines virales de la famille EBNA3 dans l’immortalisation des lymphocytes B par le virus d’Epstein-Barr Quentin BAZOT (Ecole Normale Supérieure de Lyon) liste des posters présentés mercredi 24 et jeudi 25 octobre 2012 Implication fonctionnelle de la protéine adaptatrice Lnk dans les cellules normales et pathologiques du lignage mégacaryocytaire Hajer BEN MOUSSA (UFR de Santé Médecine et Biologie Humaine de Paris XIII) Rôle et mécanisme d’action du ligand ADMP1 et du récepteur Alk1/2 dans la signalisation BMP au cours du développement de l’embryon d’oursin Paracentrotus lividus Emmanuel HAILLOT (Station Zoologique) Rôle de la Poly(ADP-ribose) polymérase-3 (PARP-3) dans la réponse cellulaire aux cassures double-brin. Christian BOEHLER (Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg) Rôle des facteurs NER dans le processus de transcription Izarn ILTIS (Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire) Le complexe CRL2(LRR-1) E3 ubiquitine-ligase régule la stabilité de HTP-3 afin d’inhiber la mise en place de la méiose dans les cellules souches germinales chez C. elegans Julien BURGER (Institut Jacques Monod) MyD88 participe à la régulation des mécanismes de réparation de l’ADN et favorise la résistance des cellules tumorales aux agents génotoxiques. MyD88 une nouvelle cible thérapeutique ? Alain KFOURY (Centre Léon Bérard) Modifications de la chromatine associées à la sénescence cellulaire Kévin CONTREPOIS (Commissariat à l’Energie Atomique de Saclay) Les G-quadruplexes constituent un obstacle pour la réplication et une menace pour la stabilité du génome Aurèle PIAZZA (Institut Curie) Régulation du trafic et de l’activité de la métalloprotéase ADAM10 par les Tétraspanines à 8 cystéines Emmanuel DORNIER (Hôpital Paul Brousse) Rôle des lymphocytes T CD4 régulateurs dans la suppression des réponses immunitaires anti-tumorales Arnaud POMMIER (Institut Cochin) Etude de l’immunité cellulaire T CD4 dirigée contre la télomérase : implications pour l’immunothérapie antitumorale et l’immunosurveillance des cancers. Magalie DOSSET (Etablissement Français du Sang) Contrôle de l’homéostasie protéique par un nouveau complexe du reticulum endoplasmique Magali RICHARD (Institut de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure) Exploration d’une polythérapie ciblée dans le traitement des rhabdomyosarcomes Sarah DUMONT (Centre Léon Bérard) Nouvelles molécules perturbant la vascularisation tumorale: Synthèse, évaluation biologique et recherche de métabolites d’ analogues de la combrétastatine A-4. Mohamed Ali SOUSSI (Faculté de Pharmacie de l’Université Paris XI) Effet anti-angiogénique des inhibiteurs des kinésines Eg5 et Mklp2 : Etude de leur potentiel anti-tumoral dans des modèles pré-cliniques. Prisca EXERTIER (Université des Sciences et Technologies de Bordeaux) Toxines bactériennes ciblant les GTPases Rho et la voie cyclic-AMP : régulation du cytosquelette d’actine et conséquences sur la perméabilité vasculaire Caroline STEFANI (Centre Méditerranéen de Médecine Moléculaire) Rôle des isoformes des membres du pore de transition de perméabilité (PTP) mitochondrial dans la communication apoptotique entre le réticulum endoplasmique (RE) et la mitochondrie en réponse au stress RE dans des lignées cancéreuses humaines Cindy GALLERNE (Faculté de Pharmacie de l’Université Paris XI) Contrôle de la dynamique de réplication par Chk1 chez les mammifères. Hervé TECHER (Institut Curie) liste des posters présentés mercredi 24 et jeudi 25 octobre 2012 Identification des gènes régulés par les produits du gène de fusion TMPRSS2-ERG dans le cancer de la prostate Tian TIAN (Institut de Biologie de Lille) Nouveaux algorithmes d’identification de transcrits chimères dans les données de RNASequencing pour l’amélioration du diagnostic en cancérologie. Nicolas PHILIPPE (Centre de Recherche en Biochimie Macromoléculaire) Prix Hélène Starck Catégorie Post-doctorat La voie de signalisation Notch comme outil pour suivre les cellules souches et leurs lignages au cours du développement et de la tumorigenèse de la glande mammaire. Véronica RODILLA (Institut Curie) Caractérisation des modifications épigénétiques du chromosome X dans les différents types moléculaires de cancers du sein et de lignées cellulaires de cancers du sein Ronan CHALIGNÉ (Institut Curie) Etude de la participation d’une voie alternative de réparation de l’ADN dans les processus de déméthylation de l’ADN chez l’homme: interconnexions entre les mécanismes de régulation épigénétique, de réparation de l’ADN et de cancérogenèse Inga GRIN (Institut Gustave Roussy) Rôle des altérations du locus PTEN dans l’instabilité génétique du cancer du sein. Etude par CGH array haute résolution sur puce dédiée. Natalie JONES (Institut Bergonie) Recherche et étude des protéines partenaires d’Hsp27 responsables de l’évolution androgéno-indépendante des cancers de la prostate. Maria KATSOGIANNOU (Institut Paoli Calmette) Le ciblage thérapeutique de Clusterin, par l’utilisation de l’antisens OGX-011 augmente, de manière synergique, l’activité de thérapies ciblées (Acide Zolédronique et inhibiteurs de Hsp90) dans le traitement des tumeurs osseuses. François LAMOUREUX (Faculté de Médecine de Nantes) Validation fonctionnelle d’une nouvelle cible candidate pour le traitement du cancer colorectal : un possible rôle oncogénique de la MAP3K ZAK Lydia LARTIGUE (Institut Bergonie) Étude des voies de tolérance des lésions : introduction d’une lésion unique sur le chromosome Karel NAIMAN (Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille) Dynamique et mécano-transduction des intégrines à haute-résolution: Mécanismes cellulaires de détection de la rigidité des tissues et implication dans la croissance tumorale. Olivier ROSSIER (Institut Interdisciplinaire de Neurosciences) Etude de la réparation des adduits encombrants et des pontages interbrins de l’ADN induits par le stresse oxydant et/ou les agents anti-canéreux. Applications aux mécanismes de tumorigenèse et de résisatnce aux thérapeutiques anti-cancéreuses. Ibtissam TALHAOUI (Institut Gustave Roussy) PRIX ALEXANDRE JOËL - Master 2 Poster Facteurs socio-économiques et qualité de la prise en charge thérapeutique après un diagnostic de cancer du sein BROUSSY Sophie INSTITUT BERGONIE - BORDEAUX Dpt Recherche Clinique Information Financement de la Fondation ARC : Master 2 PRIX ALEXANDRE JOËL CATÉGORIE MASTER 2 ciés à la non-conformité aux BPC de chirurgie étaient le stade clinique II ou III (référence (ref) : stadeI; Rapport de cotes (RC)=2,54;IC95%=1,6-3,9) et l’âge supérieur à 70 ans (ref inférieur 50; RC=1,66;IC95%=1,1-2,7) et à la non-conformité aux BPC de radiothérapie étaient l’envahissement ganglionnaire (ref= sans envahissement ; RC=1,45;IC95%=1,1-2,0), de comorbidités (ref= sans comorbidités ; RC=2,58;IC95%=1,3-5,2) et le grade histopronostique III (ref= grade I; RC=1,85;IC95%=1,2-2,8). Concernant le statut SE, ni le niveau d’instruction, ni l’ID n’ont permis d’identifier de population à risque de nonconformité de PEC. Ainis, seuls des facteurs cliniques ont été identifiés comme associés à la non-conformité; ils sont donc à prendre en compte pour adapter la PEC. La part de l’éloignement géographique (distance résidence-centre de soins) comme le lien entre éloignement et certains facteurs SE est une approche que nous développerons. ● L’objectif de l’étude SES-Sein est de mesurer les associations entre facteurs socio-économiques (SE) et qualité de prise en charge (PEC) thérapeutique du cancer du sein, plus particulièrement les étapes de chirurgie et radiothérapie. Il s’agit d’une cohorte prospective multicentrique composée de cas incidents de cancer du sein infiltrant non invasif diagnostiqués en 2003-4 dans les établissements publics et privés d’Aquitaine et Poitou-Charentes. La qualité de la PEC était évaluée selon la conformité des pratiques aux recommandations de Bonnes Pratiques Cliniques (BPC) nationales et internationales. Les indicateurs SE utilisés étaient le niveau d’instruction au niveau individuel et l’indice de défavorisation (ID) de Townsend au niveau agrégé (constitué de 4 indicateurs : taux de logements surpeuplés, de ménages sans voiture, de chômeurs, de logements occupés par des non propriétaires). La méthodologie statistique reposait sur des modèles logistiques. L’étude portait sur 925 patientes. Les facteurs asso- 13 PRIX ALEXANDRE JOËL - Master 2 Poster Développement de modèles précliniques de phéochromocytomes/paragangliomes malins SDHB-dépendants chez la souris BUFFET Alexandre CENTRE DE RECHERCHE CARDIOVASCULAIRE DE L’HEGP - PARIS INSERM U970 - Equipe Gène Pression Artérielle Financement de la Fondation ARC : Master 2 Introduction Les paragangliomes (PGL) sont des tumeurs rares, développées aux dépens des cellules neuroendocrines du système nerveux autonome et de la médullosurrénale (on parle alors de phéochromocytome (PH)). Ils sont une cause classique d’hypertension artérielle (HTA) secondaire par leur sécrétion de catécholamines. Environ 30% des cas de PGL sont génétiquement déterminés et sont causés par une mutation constitutionnelle dans l’un des 10 gènes de prédisposition connus. Parmi eux, le gène SDHB est d’intérêt car ses mutations sont responsables de formes malignes de la maladie et associées à un mauvais pronostic. Cette propension aux formes agressives des PGL SDHB-dépendants n’a actuellement pas d’explication. L’objectif de ce projet de recherche est la compréhension des mécanismes de cancérogenèse impliquant le gène SDHB par l’étude de modèles animaux. Description du projet Initialement, mon équipe d’accueil a généré des modèles d’inactivation (KO) du gène SDHB chez la souris, pour avoir un modèle le plus proche possible du PGL malin chez l’homme. Toutefois, l’inactivation homozygote du gène SDHB (SDHB -/-) est létale in utero, et les souris ayant une inactivation hétérozygote du gène SDHB (SDHB +/-) ne présentent pas de phénotype apparent. Mon travail a donc consisté en la caractérisation de trois modèles murins différents : n tout d’abord, la caractérisation de 64 souris présentant une inactivation hétérozygote du gène PTEN (PTEN +/-), modèle pour lequel le développement de PH avait déjà été décrit. Nous avons retrouvé à l’histologie un PH chez 40 souris PTEN +/- (soit 62,5 %), âgées de 8 à 14 mois. La prise de pression artérielle à la queue a permis de mettre 14 PRIX ALEXANDRE JOËL - Master 2 Poster Elaboration d’un nouveau modèle murin de LMC reproduisant la chronicité de la pathologie, afin d’évaluer des stratégies thérapeutiques visant à contourner la faible sensibilité des cellules souches leucémiques aux inhibiteurs de tyrosine kinase DE GUNZBURG Noémie COMMISSARIAT A L’ENERGIE ATOMIQUE - FONTENAY AUX ROSES Institut des Maladies Emergentes et des Thérapies Innovantes (IMETI) Financement de la Fondation ARC : Master 2 en évidence une HTA chez des souris de 9 mois porteuses de PH. Des métastases pulmonaires ont été mises en évidence chez 4/7 souris PTEN +/-. n Ensuite, un modèle double transgénique, réalisé par croisement de cette lignée PTEN +/- avec les souris SDHB +/- (SDHB +/-, PTEN +/-). 19 souris double transgéniques ont été explorées. Un PH a été retrouvé dans 14 cas (soit 73,7 %), et des métastases pulmonaires dans 3/9 souris SDHB +/-, PTEN +/-. Ces souris sont hypertendues dès l’âge de 7 mois, âge où nous avons retrouvé les premiers PH dans cette lignée. Les recueils urinaires ont mis en évidence une sécrétion préférentielle de métanéphrines. De surcroit, l’immunohistochimie a permise la mise en évidence d’une perte focale de SDHB dans certains PH de ces souris. n Enfin, un modèle d’inactivation conditionnelle du gène SDHB, généré par croisement de souris SDHB floxées avec une lignée de souris exprimant la Cre sous contrôle du promoteur du PSA (Prostate Specific Antigen), qui est actif dans la médullo-surrénale chez la souris (SDHBlox/-, PSA-Cre). Les souris explorées n’ont pas présenté de PH jusqu’à l’âge de 12 mois. La leucémie myéloïde chronique (LMC) est un syndrome myéloprolifératif chronique qui se distingue par la présence dans les cellules leucémiques d’un remaniement génétique particulier, constitué par la translocation entre les chromosomes 9 et 22, résultant en l’expression de la protéine de fusion oncogénique BCR-ABL. La prise en charge de cette pathologie a été révolutionnée par l’arrivée sur le marché d’un traitement ciblé, représenté par les molécules de la classe des inhibiteurs de tyrosine kinase (ITK). Cependant, alors qu’ils ont considérément amélioré le pronostic de la maladie, les ITK ne permettent pas d’éradiquer l’ensemble du pool des cellules leucémiques, même chez les patients répondant le mieux. La problématique actuelle réside dans l’insensibilité des cellules souches leucémiques (CSL) aux ITK. Notre projet consiste en la mise en place d’un nouveau modèle murin de LMC, réalisé par la transplantation syngénique dans des souris irradiées, de cellules murines préalablement transduites par un vecteur permettant l’expression de la protéine BCR-ABL. Le but de ce modèle est de reproduire de façon optimale la physiopathologie et l’évolution de la pathologie humaine, afin de pouvoir réaliser des études in vivo. Conclusions et perspectives En conclusion, le développement de ces modèles animaux de prédisposition au PGL va permettre d’étudier et de décortiquer les mécanismes moléculaires de tumorigenèse et de cancérogenèse impliquant le gène SDHB. A terme, ces modèles permettront de réaliser les essais pré-cliniques essentiels à la mise en place de protocoles thérapeutiques innovants dans le PGL malin, destinés en particulier aux patients porteurs d’une forme rapidement évolutive de PGL SDHB-dépendant pour laquelle il n’existe actuellement aucune solution thérapeutique curative. ● Plusieurs innovations ont été réalisées en comparaison avec les modèles existants. La construction lentivirale « SIN LTV-BCR-ABL », dérivant du virus de l’Immunodéficience Simienne (SIV) et permettant l’expression de la séquence BCR-ABL, a tout d’abord été validée in vitro sur des cellules de la lignée BAF3. L’expression de BCR-ABL a ensuite été vérifiée dans la population de cellules souches à long terme de phénotype Lin-Sca+Kit+FLK2-Thy1low, CD45.1, préalablement transduites. Après avoir subi une irradiation létale, trois groupes de cinq souris de phénotype CD45.2, dénommés « BCR-ABL 1, 2 et 3 », ont été transplantés avec des quantités variables de cellules transduites (2 500, 1 000 et 250 respectivement), associées à 500 000 cellules de moelle de soutien (CD45.2). Un quatrième groupe de cinq souris, a également reçu, après irradiation, 2 500 cellules du même phénotype transduites par un vecteur témoin « LTV-GFP », associées à 500 000 cellules de moelle de soutien. Les souris transplantées ont majoritairement vu leur hématopoïèse se reconstituer à J19 pour la lignée érythrocytaire, à J40 pour la lignée granuleuse et à J48 pour la lignée plaquettaire. A J76 post transplantation, les souris n’ont pas encore déclaré de LMC, mais ont stabilisé la valeur de leur chimérisme CD45.1, à un niveau corrélé au nombre de cellules CD45.1 transplantées. Il semble y avoir un avantage prolifératif de bcr-abl dans notre modèle, puisque le chimérisme CD45.1 est nettement supérieur dans le groupe « BCR-ABL1 » (20,7%), que dans le groupe « GFP » (5,3%), alors qu’ils ont reçu le même nombre de cellules transplantées. L’expression de bcr-abl dans les souris transplantées a été confirmée chez 8 souris sur 9 par RT-qPCR. A l’heure actuelle, la poursuite du suivi des souris est nécessaire, afin de confirmer le fait qu‘elles développeront une LMC. Cependant, ceci montre déjà l’avantage de ce modèle par rapport aux modèles antérieurs, de ne pas entrainer de LMC d’évolution fulgurante après la transplantation. Des investigations pourront être réalisées sur ces souris, une fois la pathologie déclarée, pour étudier le mécanisme de résistance des CSL aux traitements existants, et développer de nouvelles stratégies thérapeutiques les contournant. ● 15 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale Analyse de la signalisation acide rétinoïque dans la leucémie aiguë promyélocytaire : rôle des interactions protéiques et détermination des cibles d’aval ABLAIN Julien HOPITAL SAINT LOUIS - PARIS CNRS UMR7212 / INSERM U944 Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse protéine PML. Dans les cellules de LAP, PML est séquestrée par PML/RARA. Le traitement par l’AR ou l’arsenic provoque la reformation de structures organisées par PML appelées corps nucléaires (CN). L’inactivation ou la perte de PML dans nos modèles de LAP abroge complètement l’effet de l’AR sur l’auto-renouvellement des cellules leucémiques et la régression de la maladie. La leucémie aiguë promyélocytaire (LAP) est initiée par la translocation chromosomique t(15;17) qui donne lieu à l’expression de l’oncoprotéine de fusion PML/RARA. Cette protéine suffit à transformer les progéniteurs hématopoïétiques ex vivo et induit des leucémies chez les souris transgéniques. La leucémogénèse associe un blocage de la différenciation et une augmentation de l’auto-renouvellement des cellules leucémiques. Deux agents thérapeutiques ont démontré leur efficacité dans des modèles précliniques et chez les patients : l’acide rétinoïque (AR) et l’arsenic. L’AR provoque la différenciation terminale des blastes leucémiques alors que l’arsenic ne conduit qu’à une différenciation marginale. En revanche, les deux agents induisent la dégradation de PML/RARA et permettent une éradication des cellules initiatrices de leucémie (CIL). PRIX ALEXANDRE JOËL CATÉGORIE THÈSE Communication orale / Poster Ces données permettent d’établir un nouveau modèle rendant compte de l’effet thérapeutique de l’AR dans la LAP. Ainsi, la dégradation de PML/RARA induit la reformation des CN par PML, ce qui cause l’activation de p53. Ce mécanisme aboutit à une perte de l’auto-renouvellement des cellules leucémiques menant à l’éradication de la maladie. Nos résultats suggèrent d’une part que la dégradation d’une oncoprotéine peut suffire à éliminer des cellules tumorales, ce qui ouvre de nouvelles perspectives thérapeutiques dans la lutte contre le cancer. D’autre part, l’activation d’un axe PML/p53 contrôlant l’auto-renouvellement des cellules constitue une piste d’étude pour le développement de thérapies ciblées visant à éradiquer spécifiquement les cellules souches cancéreuses. ● Par une analyse approfondie de l’effet de différents traitements in vivo, ainsi que par des approches d’interférence ARN ciblant PML/RARA, nous avons montré que l’éradication des CIL est liée à une perte d’auto-renouvellement due à la dégradation de PML/RARA et non à la différenciation des blastes leucémiques. Nous avons également identifié une signature transcriptionnelle correspondant à la perte d’auto-renouvellement provoquée par l’AR. Elle implique un arrêt de cycle et une activation atypique de p53 qui présente certaines caractéristiques de la sénescence cellulaire. L’inactivation de p53 par interférence ARN dans les modèles de LAP ex vivo et in vivo inhibe en effet la perte d’auto-renouvellement et réduit fortement le bénéfice thérapeutique en réponse à l’AR. Ce phénotype est confirmé par l’analyse des effets du traitement à l’AR dans des modèles murins de LAP p53+/+ ou p53-/-. Publications : Activation of a PML/p53 axis by therapy-triggered PML/ RARA degradation underlies APL cure Julien Ablain, Hassane Soihili, Aurélien de Reynies, Saverio Minucci & Hugues de Thé (soumis, en révision) Uncoupling RARA transcriptional activation and degradation elucidates the bases of a leukaemia therapy Julien Ablain, Magdalena Leiva, Laurent Peres & Hugues de Thé (soumis, en révision) Enfin, nous avons observé que l’activation de p53 et l’éradication des CIL par l’AR dépend de la présence de la 17 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale Etude de la régulation par sumoylation de la biogenèse des mRNPs et de la stabilité génétique. Analyse des événements génétiques et cellulaires associés à l’oncogénèse des leucémies aiguës dans un syndrome d’instabilité génétique constitutionnel, la maladie de Fanconi BRETES Hugo CECCALDI Raphael INSTITUT JACQUES MONOD - PARIS UMR 7592 CNRS - Equipe Pores nucléaires : Transport et cycle cellulaire. Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse HOPITAL SAINT LOUIS - PARIS Inserm U944 - Laboratoire d’hématologie APHP Financement de la Fondation ARC : 2ème et 3ème années de thèse avons mis en évidence que seule la sous-unité Hpr1 est SUMOylée. L’analyse de la SUMOylation de cette protéine dans un mutant d’Ulp1 révèle que cette enzyme régule la déSUMOylation de Hpr1. D’autre part, l’identification des résidus SUMOylés de Hpr1 nous a permis de montrer que cet événement de SUMOylation du complexe THO régule son association sur les mRNPs. Au cours de la transcription, plusieurs facteurs sont assemblés sur les ARN messagers (ARNm) pour former les Ribonucléoparticules de messagers (mRNPs), et contrôler leur maturation, leur stabilité et leur devenir dans le cytoplasme. Afin d’assurer la production de protéines fonctionnelles, la cellule dispose de plusieurs mécanismes de régulation et de contrôle de qualité assurant la fidélité de l’information génétique transmise au niveau ARNm et protéine. Pour étudier l’impact de cette SUMOylation sur les fonctions connues du complexe THO, nous avons analysé les conséquences d’un défaut de SUMOylation de ce complexe sur l’export des ARNm, et sur l’expression génique à l’aide de gènes rapporteurs LacZ. Nous avons pu montrer que des mutants affectant la SUMOylation de Hpr1 perturbent l’expression de ces rapporteurs sans affecter l’export des ARNm. De manière intéressante, les défauts d’expression de ces gènes LacZ observés dans des mutants inactivant le complexe THO ou affectant sa SUMOylation sont moins importants lorsqu’ils possèdent un intron, expliquant les phénotypes d’export d’ARN non épissés préalablement mis en évidence dans des mutants d’Ulp1. Chez la levure Saccharomyces cerevisiae, la SUMO-protéase Ulp1 a été impliquée dans un contrôle de qualité prévenant l’export d’ARN non épissés vers le cytoplasme, suggérant que ce processus pourrait être contrôlé par la modification post-traductionnelle par le polypeptide SUMO d’un ou de plusieurs effecteurs au sein des mRNPs. Afin de mieux comprendre ces mécanismes, nous avons mis en place un crible protéomique visant à identifier les protéines dont l’association sur les mRNPs dépend d’Ulp1. Dans ce but, nous avons purifié les mRNPs de cellules sauvages et mutées pour Ulp1, puis nous avons analysé leur contenu en protéines par spectrométrie de masse. Ces données mettent donc en évidence un nouveau mécanisme dans lequel des protéines des NPCs régulent l’expression génique en contrôlant Ulp1, et caractérisent pour la première fois un rôle de la SUMOylation dans le contrôle de l’assemblage des mRNPs, et potentiellement, de la stabilité du génome et de son expression. ● Cette approche nous a permis de mettre en évidence une diminution du recrutement des sous-unités du complexe THO sur les mRNPs de cellules mutantes pour Ulp1. Ce complexe est connu pour permettre l’assemblage de mRNPs compétentes pour l’export, favoriser la transcription, et prévenir l’instabilité génétique en empêchant la formation d’hybrides ADN matrice – ARNm (dénommés R-loops). Grâce à plusieurs analyses biochimiques, nous avons montré qu’une perte de fonction d’Ulp1 entraine un défaut de recrutement du complexe THO sur plusieurs ARNm, sans affecter l’intégrité du complexe ou la stabilité de ses différentes sous-unités. Pour comprendre comment Ulp1 régule l’association du complexe THO sur les mRNPs, nous avons procédé à une recherche de formes SUMOylées pour chacune des sous-unités du complexe THO, et nous Publications : Nuclear pore-associated proteins control mRNP metabolism through sumoylation of the THO complex. Hugo BRETES, Thibaut LEGER, Marlene OEFFINGER, Valérie DOYE and Benoit PALANCADE. (Publication soumise) 18 B- We then investigate the BMF pathogenesis in FA. We found that CD34+ counts and in vitro clonogenic activity were significantly lower in FA patients compared to donors. As FA cells have a constitutive DNA repair defect, we investigated the cellular response to DNA damage. We found that FA cells had a strong activation of p53 and p21, leading to a delayed G0/G1 cell-cycle arrest after resolution of the G2 checkpoint. ShRNA-mediated knockdown of p53 or p21 in hematopoietic stem/progenitor cells (HSPCs) from FA patients rescued in vitro clonogenic ability. Moreover, we lentivirally knocked-down the FANCD2 gene in normal CD34+ cord-blood cells and xeno-transplanted these FAlike cells into immunodeficient NSG mice. Strikingly, simultaneous knock-down of p53 using a tandem FANCD2-TP53 shRNA dramatically improved the engraftment capacities into NSG mice when compared to FANCD2 shRNA controls. Finally, analysis of fresh cells from FA patients and healthy donors showed that FA HSPCs strongly expressed the p21/ CDKN1A gene and a signature of G0/G1 cell cycle arrest. Altogether, these results identify an exacerbated p53/ p21-mediated G0/G1 cell cycle arrest in response to replicative stress and unresolved DNA damage as a central mechanism of BMF in FA patients. Fanconi anemia (FA) is a genetic condition characterized by congenital abnormalities, chromosome fragility, bone marrow failure (BMF) during childhood, and cancer susceptibility. FA patients experience a high risk to develop myelodysplasia (MDS) and acute myeloid leukemia (AML). FA cells harbor typical cellular features: a high level of chromosomal breaks, a massive G2 checkpoint arrest, and an excess of cell death. The combined background of genomic instability and hypoplastic bone marrow contributes to the development of an overt MDS or AML. This study was based on the cohort of FA patients referred at Saint-Louis Hospitals, French Reference Center for Constitutional Bone Marrow Failure. A- During the first part of my work, we observed that a fraction of FA patients has acquired an abrogation of the G2 checkpoint arrest, defining a new clonal phenotype, that is “checkpoint attenuation”. We hypothesized that (1) the ATR-CHK1-p53 checkpoint pathways could be involved in this phenotype, and (2) attenuation of this checkpoint pathway allows the cells to overcome the cell cycle arrest and related cell death. We indeed found that the attenuated cells expressed lower levels of the checkpoint proteins CHK1 and p53 than “classical” FA cells, and that this correlated with the strong expression of a microRNA targeting CHK1 expression, namely miR-15a. Attenuation was recapitulated using siRNA and chemical inhibitors. Moreover, CHK1 inhibition protected FA cells from cell death, consistently with a survival advantage conferred by the checkpoint abrogation. FA attenuated patients had milder bone marrow deficiency, but several of them developed MDS/AML. Purified MDS/AML cells expressed CHK2 but low levels of CHK1, suggesting that attenuation also contributed to tumor progression. The acquired deregulation of the DNA damage response here identified in FA, has implications for bone marrow oncogenic progression, with probable relevance in MDS/AML in general. Altogether, our results gave important new understanding in physiopathogenic mechanisms of bone marrow failure and tumor progression in FA. They are shown in Ceccaldi et al., JCI 2011 and in Ceccaldi et al., cell Stem Cell 2012. ● Publications : Article I : Quentin S, Cuccuini W, Ceccaldi R, Nibourel O, Pondarre C, Pagès MP, Vasquez N, Dubois d’Enghien C, Larghero J, Peffault de Latour R, Rocha V, Dalle JH, Schneider P, Michallet M, Michel G, Baruchel A, Sigaux F, Gluckman E, Leblanc T, Stoppa-Lyonnet D, Preudhomme C, Socié G, Soulier J. Myelodysplasia and leukemia of Fanconi anemia are associated with a specific pattern of genomic abnormalities that includes cryptic RUNX1/AML1 lesions. Blood. 2011 Apr 14;117(15):e161-70. 19 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale JM, Regairaz M, Pla M, Vasquez N, Zhang QS, Pondarre C, Peffault de Latour R, Gluckman E, Cavazzana-Calvo M, Leblanc T, Larghero J, Grompe M, Socié G, D’Andrea AD, Soulier J. Bone marrow failure in Fanconi anemia is triggered by an exacerbated p53/p21 DNA damage response that impairs hematopoietic stem and progenitor cells. Cell Stem Cell. 2012, Jun 7. Article II : Ceccaldi R, Briot D, Larghero J, Vasquez N, Dubois d’Enghien C, Chamousset D, Noguera ME, Waisfisz Q, Hermine O, Pondarre C, Leblanc T, Gluckman E, Joenje H, Stoppa-Lyonnet D, Socié G, Soulier J. Spontaneous abrogation of the G2 DNA damage checkpoint has clinical benefits but promotes leukemogenesis in Fanconi anemia patients. J Clin Invest. 2011 Jan 4;121(1):184-94. Article III : Ceccaldi R, Parmar K, Mouly E, Delord M, Kim Mécanismes de biogénèse et sécrétion des exosomes COLOMBO Marina INSTITUT CURIE - PARIS INSERM U 932 - Unité Immunité Cancer Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse STAM and TSG101 induced a decrease, knock-down of ALIX, CHMP4C, VTA1 and VPS4B caused an increase in the amount of secreted exosomes as compared to the control. Protein quantification and western blotting performed on exosomes purified by ultracentrifugation revealed that silencing of ALIX induced an increase in the MHC class II content in the exosomes, rather than of their total amount. Immuno-electron microscopy analysis indicated that vesicles released by ALIX KD cells were larger in size, and showed increased labeling for MHC class II as compared to the control, and that MVBs from ALIX KD cells accumulate MHC II molecules. Exosomes correspond to the small intraluminal vesicles (ILVs) of endosomal compartments called multivesicular bodies (MVBs), which are formed by inward budding of the endosomal limiting membrane. The molecular mechanisms involved in the formation of ILVs are still poorly understood in eukaryotic cells: several mechanisms have been described, dependent or not on the ESCRT machinery, a family of four protein complexes that have been involved in cargo sorting and MVB biogenesis. The aim of this study is to assess the involvement of the different ESCRT proteins in exosome biogenesis in HeLaCIITA cells. A medium-throughput screening was performed using a FACS-based assay, which allows relative quantification of CD63- and MHC class II-bearing exosomes in the supernatant of cells treated with small-interfering RNA. shRNA to seven of these proteins were shown to affect exosome secretion: whereas knock-down of HRS, 20 These observations reveal ALIX as a candidate involved in MHC II sorting and exosome biogenesis, which could be of potential use as a means to increase immunogenicity of vesicles secreted by antigen-presenting cells. ● 21 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale Etude de la préprocalcitonine, candidat prometteur pour le développement d’un vaccin thérapeutique dans les cancers bronchiques : Identification et caractérisation de peptides antigéniques immunogènes issus de cet antigène DURGEAU Aurélie INSTITUT GUSTAVE ROUSSY - VILLEJUIF Unité INSERM U753 - Immunologie des tumeurs Humaines : interactions effecteurs cytotoxiques - système tumoral Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse cellules tumorales pour échapper au système immunitaire, entraine la présentation de peptides antigéniques, tel que ppCT16-25, issus de séquences signal et apprêtés par la voie SP-SPP. Au contraire, le rétablissement de l’expression de TAP permet la présentation d’épitopes apprêtés par la voie conventionnelle protéasomes-TAP. Ainsi, mes résultats révèlent une compétition entre les deux voies d’apprêtement qui est directement régulée par le niveau d’expression de TAP. Mes résultats ont indiqué aussi que les épitopes issus des séquences signal correspondent à une alternative de choix utilisée par le système immunitaire pour éliminer les tumeurs ayant perdu TAP et contourner ainsi ce mécanisme d’échappement tumoral (Durgeau et al, J Immunol 2011). Les thérapies anti-cancéreuses nécessitent aujourd’hui des approches plus ciblées dont le but est d’éliminer les cellules cancéreuses sans altérer les tissus normaux. Les approches basées sur une vaccination peptidique suscitent un intérêt croissant, en stimulant activement le système immunitaire de l’hôte, afin d’activer spécifiquement les lymphocytes T cytotoxiques (CTL) contre la tumeur. Ainsi, différents vaccins thérapeutiques ont été développés dans les cancers de poumon, néanmoins, les succès de ces essais restent limités. Les limites majeures de ces approches résident dans la faible immunogénicité des peptides tumoraux utilisés, le faible nombre des précurseurs T spécifiques et la résistance des cellules tumorales aux CTL. Nos travaux antérieurs, fondés sur l’établissement de lignées tumorales et de clones CTL autologues dans les cancers bronchiques, nous ont permis d’identifier un Ag tumoral, la préprocalcitonine (ppCT) qui est surexprimé dans plusieurs carcinomes bronchiques et les carcinomes médullaires de la thyroïde (MTC) faisant ainsi de cet l’Ag un candidat prometteur en immunothérapie. Nous avons identifié un peptide antigénique (ppCT16-25) issu de la région C-terminale du peptide signal de ppCT, reconnu par un clone T cytotoxique. Il est apprêté de manière indépendante de la voie classique protéasomes-TAP par un nouveau mécanisme impliquant deux protéases différentes, la signal peptidase (SP) et la signal peptide peptidase (SPP). J’ai ensuite étudié l’immunogénicité de la ppCT chez des patients HLA-A2 atteints de cancers bronchiques. Mes résultats ont confirmé le pouvoir immunogène de la ppCT et m’ont permise d’identifier plusieurs peptides de 15 ou 10 acides aminés susceptibles d’induire une activation des lymphocytes T CD8. Notre objectif à plus long terme est de développer une approche vaccinale multiépitopique fondée sur la ppCT qui permettrait d’éliminer les cellules tumorales qui ont modulé ou non les molécules TAP. En effet, une réponse polyépitopique aurait l’avantage d’augmenter les chances d’éradiquer la tumeur et de diminuer les risques d’émergence de variants tumoraux ayant perdu une molécule HLA ou une sous-unité TAP. ● Au cours de ma thèse, je me suis intéressée à la régulation de ces deux voies d’apprêtement des Ag et à l’influence de l’altération de la voie protéasomes-TAP sur le répertoire antigénique présenté à la surface des cellules tumorales. Mes résultats ont montré que le niveau d’expression des transporteurs TAP détermine la voie d’apprêtement des Ag et par conséquent influence la nature des peptides antigéniques présentés aux lymphocytes T CD8. En effet, la modulation des molécules TAP, souvent utilisée par les Publications : Durgeau, A., El Hage, F., Vergnon, I., Validire, P., de Montpreville, V., Besse, B., Soria, J.C., van Hall, T., and MamiChouaib, F. (2011). Different expression levels of the TAP peptide transporter lead to recognition of different antigenic peptides by tumor-specific CTL. J Immunol 187, 5532-5539. 22 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale Les Septines sont requises lors de l’établissement de jonction en sortie de mitose des divisions de cellules épithéliales. FOUNOUNOU Nabila INSTITUT DE GENETIQUE ET DEVELOPPEMENT DE RENNES - RENNES UMR 6290 - Laboratoire « Polarité cellulaire, trafic membranaire et signalisation » Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse cours de la mitose en préservant la polarité jusqu’au rétablissement des jonctions adhérentes. Afin de vérifier cette hypothèse j’ai d’abord caractérisé l’établissement de jonction et la dynamique de l’appareil contractile lors de ces divisions, en utilisant différents marqueurs. L’analyse dans les cellules contrôle montre que la Myosine::RFP se concentre au sillon de division lors de la cytodiérèse, la Cadhérine::GFP (Ecad::GFP) révèle une diminution du marquage au niveau du sillon de division. D’autre part les molécules Ecad::EosFP photo-converties au niveau du futur sillon de division (avant l’ingression) forment la nouvelle jonction. Ces données suggèrent un remodelage localisé de la jonction permettant le repliement de la membrane et l’interaction en trans des molécules de Ecad dans la cellule en mitose. En comparaison avec les cellules mutantes pour une des septines, la Myosine est moins restreinte au sillon de division et la vitesse de contraction est ralentie. De plus Ecad apparaît plus concentrée au sillon de division pendant la contraction. À la fin de la contraction, le cortex apical est relâché sans établissement d’une nouvelle jonction. En résumé, nos résultats permettent d’expliquer les données contradictoires de la littérature sur le rôle des Septines dans la cytodiérèse, et pointent vers un rôle des Septines en plateforme organisatrice de la contraction localisée et restreinte. Nous avons également décri l’établissement en sortie de mitose des jonctions adhérentes in vivo, proposant un modèle de remodelage de jonction localisé au niveau du sillon de division. ● La division cellulaire asymétrique est un processus important pour la génération de la diversité cellulaire. Dans le but d’identifier de nouveaux régulateurs de ces divisions, un crible génétique a été réalisé au laboratoire, en combinant les outils génétiques de l’organisme modèle drosophile avec des techniques de pointe de biologie cellulaire. Nous avons identifié les septines comme régulateurs potentiels des divisions asymétriques. Les septines sont des petites GTPases très conservées, qui fonctionnent en complexe et qui sont impliquées dans de nombreux processus cellulaires comme la cytodiérèse ou la polarité cellulaire. Nos hypothèses portaient sur l’éventuel rôle des septines lors des divisions asymétriques des organes mécanosensoriels en affectant la polarité ou la ségrégation des déterminants d’identité. Pour tester ces hypothèses, j’ai analysé par microscopie confocale sur animal vivant la dynamique de Sep2::GFP ainsi que les divisions asymétriques grâce à un rapporteur de localisation de déterminant d’identité. Les résultats majeurs de cette analyse montrent que les Septines Pnut, Sep2 et Sep5 fonctionnent en complexe et qu’elles sont requises lors des divisions planaires (au sein d’un épithélium) et non durant les divisions orthogonales (les cellules qui délaminent de l’épithélium). Ce défaut est spécifique des Septines car il n’est pas observé dans des organes mutants pour la formine Diaphanous caractérisée pour son rôle dans la cytodiérèse. En effet, sa perte de fonction induit un défaut de cytodiérèse quelle que soit l’orientation de la division. Contrairement aux divisions orthogonales, les divisions au sein d’un épithélium monocouche sont contraintes de rétablir des jonctions adhérentes en sortie de mitose. D’après nos résultats et ceux d’autres équipes, nous avons émis l’hypothèse que les Septines garantissent l’intégrité de l’épithélium au Publications : Tissue polarity: PCP inheritance ensured by selective mitotic endocytosis. Founounou N, Le Borgne R. (Curr Biol. 2011) 23 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale Rôle de la N-cadherine dans la migration collective, un modèle in vivo pour l’étude de l’invasion métastatique PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale Émergence du concept de « cancer stem cell ». LAPLANE Lucie KUMAR Arun INSTITUT DE GENETIQUE ET DE BIOLOGIE MOLECULAIRE ET CELLULAIRE - ILLKIRCH CNRS UMR 7104 - INSERM U 964 -Department of Development & stems cells Financement de la Fondation ARC : 3ème année de thèse leading and promoting the movement of glia as collective and that homeostatic interaction ensure that glial cells do not leave the chain and migrate together. In this context, the project aims at looking into underlying molecular pathway involved in the migration and one such example is Cadherins, a cell adhesion molecule. Our recent findings show that N-cadherin (N-cad) is expressed in glial cells of the developing wings. We use conditional gain and loss of function condition as well as time lapse in the whole organism and show that N-cad affects collective glial cell migration efficiency. Cadherins (cad) are transmembrane glycoproteins that mediate Ca++-dependent cell–cell adhesion and classic cad including E-cad and N-cad are involved in various developmental and morphogenetic processes. Cadherins comprise an extracellular domain, a transmembrane domain and a highly conserved cytoplasmic domain interacting with catenins and other cytoskeleton molecules). The extracellular cad domain is intimately involved in homophilic interactions between cells. Cell migration is an essential component of metastatic dissemination of tumor cells from the primary tumors to the local and distant sites. In addition to E-cadherin loss in cancer cell progression, one of the mammalian N-cadherins is upregulated in the invasive migrating cells in breast, prostate cancer or in melanoma. Despite major efforts, we still lack detailed insight into how cancer cells actually migrate out of primary tumors and invade neighboring tissues; however, the importance of collective processes and cell adhesion is now recognized. We use genetic approaches at cellular resolution to dissect the collective migration process in vivo. Glia in the Drosophila developing wing provide an excellent tool to study collective migration in vivo and we have used genetic approaches at cellular resolution to dissect the bases of this process. Our previous studies have shown that glial chain front plays a crucial role in Further, combining knowledge on cellular interactions and molecular pathways regulating cell motility opens broader perspective for coordinated cell migration. Therefore, investigating migratory events in more detail will be valuable for cancer research and if confirmed, even more so from clinical oncology perspective. ● Publications : Sara Berzsenyi, Arun Kumar, and Angela Giangrande (2011). Homeostatic Interactions at the Front of Migration Control the Integrity and the Efficiency of a Migratory Glial Chain. J. Neurosci, 2011 Sep 28; 31(39): 13722-7. 24 UNIVERSITE PARIS OUEST - PARIS Laboratoire IREPH-DIPSA, Département de Philosophie Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse INTRODUCTION. On considère les cellules souches comme des « entités » stables. Mais cette conception a été critiquée par certains biologistes qui jugent qu’il ne s’agit là que d’un « état », transitoire, dépendant du microenvironnement, susceptible d’être induit. L’objectif de ma recherche est de montrer que la résolution de cette controverse est primordiale pour la production de thérapies contre les cancers. L’importance de cette question provient de la découverte récente des cellules souches cancéreuses (CSC). Ces cellules cancéreuses, porteuses de la propriété souche, seraient les seules capables d’initier et de maintenir le développement des cancers. Depuis la découverte des CSC, une nouvelle stratégie thérapeutique a émergé. Cette stratégie consiste à éliminer spécifiquement les CSC et repose sur l’idée qu’en l’absence de ces cellules les cancers dégénèreront et disparaitront. Ma recherche montre que cette stratégie thérapeutique n’est valable que si les cellules souches (et donc les CSC) sont des « entités » stables. D’autres stratégies thérapeutiques doivent être développées si la propriété souche qualifie un « état » cellulaire. l’acquisition de la propriété souche est possible in vivo. Enfin, l’issue de la controverse sur l’origine des CSC a démontré que les CSC pouvaient provenir de cellules nonsouches. Nous montrons également que d’autres stratégies thérapeutiques sont envisageables pour lutter contre les CSC et l’induction potentielle de la propriété souche, telles que des thérapies différenciatrices ou des thérapies ciblant les facteurs susceptibles d’induire la propriété souche. CONCLUSION ET PERSPECTIVES. Il paraît urgent, pour le développement de thérapies contre les cancers adéquates et efficaces, de résoudre le problème de la nature des cellules souches (« entité » ou « état »). En effet, si la cellule souche désigne un « état » cellulaire possible, il faut alors déterminer : (1) de quel type d’état il s’agit et (2) sur quels facteurs/relations repose l’émergence de cet état. En revanche, si les cellules souches sont des entités stables, d’autres questions doivent être résolues : (1) Comment cibler les CSC si ce sont des populations hétérogènes de cellules ? (2) Comment éviter les effets secondaires « on target » ? Les nanovecteurs semblent offrir une solution élégante mais la toxicité de leur dégradation reste inconnue ; et enfin, (3) Comment évaluer ces nouvelles thérapies qui ne détruiront d’abord qu’un très petit nombre de cellules ? ● DESCRIPTION DU PROJET. La stratégie thérapeutique qui a été proposée par les partisans des CSC suggère d’abandonner les stratégies classiques consistant à éliminer la masse tumorale (évaluation RECIST) au profit d’une thérapie ciblée sur les CSC. Nous montrons que cette dernière stratégie repose sur une vision des CSC comme « entité » et non comme « état ». En effet, si les partisans de la vision de « l’état » devaient avoir raison, alors la propriété souche serait susceptible d’être acquise par des cellules cancéreuses non-souches et la stratégie thérapeutique anti-CSC mènerait à une impasse. Or, nous avons relevé un nombre croissant de données en faveur de l’hypothèse de « l’état », particulièrement crédible dans le cas des cancers. D’une part, les données en faveur de l’hypothèse de « l’entité » sont remises en question par le système expérimental (cytométrie en flux et lignées de souris immunodéficientes). D’autre part, des données montrent que Publications : - Laplane L. (2009) « Cellule souche cancéreuse : réflexions épistémologiques ». Sociétés 3(105) : 45-55. - Laplane L. (2011) « Stem Cells and the Temporal Boundaries of Development: Toward a Species-Dependent View. » Biological Theory, 6(1): 48-58. - Pradeu T, Laplane L, Morange M, Nicoglou A and Vervoort M. (2011) « The Boundaries of development ». Biological Theory 6(1): 1-3. - Laplane L. (2011) « Le mystère de la genèse des individus ». Critique, 764-765 : 143-152. 25 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale Rôle de WT1, gène suppresseur de la tumeur de Wilms, dans les neuroblastomes. MASSEROT-LUREAU Caroline CENTRE UNIVERSITAIRE DES SAINTS-PERES - PARIS INSERM UMR-S 1007- Homéostasie Cellulaire et Cancer : reprogrammation des réponses biologiques et thérapies alternatives Financement de la Fondation ARC : 1ère à 3ème années de thèse Situation du projet : Le Neuroblastome est la tumeur solide extra crânienne la plus fréquente chez l’enfant de moins de 5 ans. Il s’agit d’une tumeur embryonnaire ayant pour origine le système nerveux sympathique. L’amplification de l’oncogène N-Myc, qui est retrouvée dans environ 25% des neuroblastomes, est un facteur de mauvais pronostic clairement établi puisqu’elle est présente dans des tumeurs plus agressives, disséminantes, avec des taux de survie inférieurs à 10% à 3 ans. Les mécanismes par lequels l’oncogène N-Myc conduit à cette agressivité ne sont pas encore bien identifiés. roblastomes et notamment de savoir s’il pourrait être impliqué dans les voies de signalisation de N-Myc. Résultats : 1) Nous avons montré, dans des lignées cellulaires de neuroblastomes et des échantillons tumoraux de patients, une corrélation inverse entre, d’une part, l’amplification et l’expression de l’oncogène N-Myc et d’autre part, l’expression de WT1: les tumeurs avec amplification de N-Myc n’expriment pas WT1 alors les tumeurs N-Myc non amplifié l’expriment plus fortement; 2) la diminution de l’expression de WT1 par ARN interférence ne modifie pas l’expression de N-Myc mais induit une augmentation de l’expression de hTERT associée à une prolifération cellulaire accrue. WT1 code un facteur de transcription à doigt de zinc qui joue un rôle fondamental dans le développement du rein. Sa délétion a été décrite pour la première fois dans les tumeurs de Wilms (tumeurs rénales de l’enfant). Cependant le rôle de WT1 dans développement tumoral varie en fonction des modèles cellulaires ; il peut avoir un rôle d’oncogène ou au contraire agir comme un gène suppresseur de tumeur. Des données récentes semblent montrer que WT1 serait fortement exprimé dans des neuroblastomes plus différenciés donc moins agressifs. L’objectif de notre travail est d’évaluer quel est son rôle dans les neu- Conclusion : Nous montrons ainsi que WT1, dont la forte expression est associée à l’absence d’amplification de NMyc et à une moins forte agressivité tumorale, pourrait jouer un rôle suppresseur de tumeurs dans les neuroblastomes en inhibant la télomérase et la prolifération cellulaire. Si WT1 ne semble pas moduler l’expression de N-Myc, un des mécanismes permettant d’expliquer l’agressivité des tumeurs N-Myc amplifié et qu’il nous reste à démontrer pourrait donc être lié à l’inhibition de WT1 par N-Myc. ● 26 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Communication orale Etude de l’activité anti-vasculaire des agents anti-vasculaires dans des modèles murins de xénogreffes et du mécanisme d’échappement tumoral impliquant les progéniteurs endothéliaux circulants TAYLOR MARCHETTI Mélissa INSTITUT GUSTAVE ROUSSY - VILLEJUIF Inserm U981 -Biologie des Cellules Circulantes, Laboratoire de Recherche Translationnlle Financement de la Fondation ARC : 3ème année de thèse patients were remarkably consistent with our pre-clinical data, evidencing a new mechanism that should be targeted to improve VDA-based strategies. ● The concept that immediate mobilization of bone marrowderived circulating endothelial progenitor cells (CEPs) is a key mechanism mediating tumor resistance to vascular disrupting agents (VDAs) has prevailed until now. Here, we demonstrate that administration of VDA to tumorbearing mice induces two distinct peaks in CEPs: an early, unspecific CEP efflux after drug administration followed by a never-before-documented late yet more dramatic tumor-specific CEP burst which exclusively infiltrated tumors and incorporated neovessels in response to tumor hypoxia. Combined anti-angiogenic drugs could not disrupt the early peak but completely abrogated the late VDAinduced CEP burst, blunted bone-marrow-derived cell recruitment to tumors and resulted in striking antitumor efficacy, indicating that the late CEP burst was the actual source of tumor recovery after VDA therapy. CEP and circulating endothelial cell kinetics in VDA-treated cancer Publications : Reversing resistance to vascular disrupting agents by blocking late mobilization of circulating endothelial progenitor cells. Taylor M, Billiot F, Marty V, Rouffiac V, Cohen P, Tournay E, Opolon P, Louache F, Vassal G, Laplace, Builhé C, Vielh P, Soria J.C, Farace F. Cancer Discovery May 2012 2; 434-49 Circulating Endothelial Progenitors and Tumor Resistance to Vascular-Targeting Therapies De Palma M, Nucera S. Cancer Discovery May 2012 2; 395 27 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Rôle de l’hélicase FBH1 dans le maintien de la stabilité du génome BACQUIN Agathe PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Utilisation de peptides issus des filaments intermédiaires pour le ciblage de nanocapsules lipidiques contenant du Paclitaxel vers les cellules de glioblastomes (tumeurs cérébrales) BALZEAU Julien INSTITUT GUSTAVE ROUSSY - VILLEJUIF UMR 8200 - Stabilité génétique et oncogenèse Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE D’ANGERS - ANGERS UPRES EA3143 - Laboratoire de Neurobiologie et Transgénèse Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse Introduction : La recombinaison homologue (RH) joue un rôle essentiel au moment de la première division méiotique en favorisant la ségrégation optimale des chromosomes et en participant au brassage génétique. C’est également un processus clé de réparation de l’ADN et de prise en charge des fourches de réplication bloquées. Une mauvaise régulation de ce mécanisme peut cependant provoquer des réarrangements chromosomiques importants et des pertes d’hétérozygoties, qui sont des caractéristiques communes aux cellules tumorales. Plusieurs hélicases anti-recombinogènes ont été décrites chez l’homme telles que les protéines Blm et Wrn, dont les déficiences sont responsables des syndromes de Bloom et de Werner respectivement. L’hélicase humaine FBH1, décrite plus récemment, serait également capable d’inhiber la RH en limitant le recrutement de Rad51, acteur majeur de ce mécanisme. suivi de sa polyubiquitination et de sa dégradation par la voie du protéasome. Cette dégradation dépend de l’action conjuguée de PCNA et du complexe ubiquitine-ligase CRL4(Cdt2). Elle est nécessaire au recrutement optimal de la polymérase translésionnelle êta, qui joue un rôle majeur dans la réplication d’ADN endommagé. Description du projet : Afin de caractériser la fonction et le mode de régulation de l’hélicase FBH1 dans les cellules humaines, nous avons examiné sa localisation subcellulaire en l’absence de dommage et après traitement à différents agents génotoxiques tels que les ultra-violets et les agents méthylants. Nos résultats montrent que FBH1 est recruté au niveau des foyers de réplication où il colocalise avec le facteur de processivité des polymérases réplicatives, PCNA. Après traitement génotoxique, FBH1 s’accumule aux sites de dommages de l’ADN de façon précoce et transitoire. En couplant une approche biochimique et une approche d’imagerie cellulaire, nous montrons que PCNA contrôle l’accumulation de FBH1 pendant la réplication et en réponse à des dommages via une interaction directe par le biais de deux motifs distincts d’interaction à PCNA. De plus, nous montrons que le recrutement de FBH1 est Perspectives : Afin de mesurer l’impact d’une dérégulation de FBH1 sur la réplication de l’ADN, nous projetons d’étudier la dynamique de réplication par peignage, en utilisant différents mutants de FBH1. Par ailleurs, étant donné l’implication des hélicases anti-recombinogènes Blm et Wrn dans des syndromes prédisposant aux cancers, il sera intéressant d’investiguer le niveau d’expression de FBH1 dans différents cancers. ● Conclusion : Notre hypothèse est donc que FBH1 serait recruté sur l’ADN via une interaction avec PCNA, au moment de la réplication ou en réponse à un stress génotoxique, afin de limiter les événements de recombinaison non programmés dépendants de Rad51. Par la suite, PCNA provoquerait la dégradation de FBH1 en collaboration avec le complexe ubiquitine-ligase CRL4(Cdt2) afin de limiter le temps de résidence de FBH1 qui pourrait interférer avec la prise en charge des dommages par le mécanisme de synthèse translésionnelle. Publications : Agathe Bacquin, Caroline Pouvelle, Mylène Perderiset, Carine Tellier-Lebegue, Sophie Salomé-Desnoulez, JeanBaptiste Charbonnier et Patricia L Kannouche. «The helicase Fbh1 is tightly regulated by PCNA via CRL4(Cdt2) proteolysis to promote Translesion DNA Synthesis in human cells» (soumis) 28 des souris porteuses d’un gliome de type GL261. Les souris sont sacrifiées 21 jours après implantation de la tumeur, les cerveaux prélevés et étudiés pour déterminer la localisation des LNC et leurs effets sur les volumes des tumeurs. Les filaments intermédiaires sont l’un trois des constituants du cytosquelette cellulaire, avec les microtubules composés de dimères de tubuline et les filaments d’actine. Les filaments intermédiaires sont spécifiquement exprimés selon le type cellulaire, et au laboratoire il a été montré qu’ils sont capables d’interagir avec les dimères de tubuline sur des sites particuliers appelés TBS pour Tubulin-Binding Site. Des peptides correspondant aux séquences TBS ont été synthétisés et se révèlent être capables d’inhiber la polymérisation de la tubuline in vitro (Bocquet et al., 2009). Un de ces peptides appelé NFL-TBS.40-63, issu de la sous-unité légère des neurofilaments, rentre sélectivement dans les cellules de gliome et détruit le réseau de microtubules, inhibant ainsi la multiplication cellulaire. Ce peptide pénètre peu dans les cellules saines du système nerveux et ne présente pas de toxicité pour ces cellules. Enfin, ce peptide ralentit la croissance de tumeur cérébrale de glioblastome injectée dans le cerveau de rat (Bergès et al., 2012). Ces travaux montrent que les LNC fonctionnalisées avec le peptide NFL-TBS.40-63 rentrent plus rapidement et de façon plus importante dans les cellules de glioblastome que les LNC non-fonctionnalisées. Chez les souris porteuses de gliome, le volume des tumeurs diminue de 60% après traitement avec les LNC contenant du Paclitaxel, et de 75% pour ceux traités avec les LNC remplies de Paclitaxel et fonctionnalisées avec le peptide NFL-TBS.40-63. L’analyse par microscopie en fluorescence montre que les LNC fonctionnalisées avec le peptide sont localisées principalement au niveau de la tumeur à l’inverse des LNC non fonctionnalisées avec le peptide. Ces résultats montrent que le peptide NFL-TBS.40-63 permet de cibler les LNC vers la tumeur de glioblastome, où leur entrée et leur effet sont augmentés par la présence du peptide. ● Ce travail porte sur l’utilisation des propriétés de ciblage du peptide NFL-TBS.40-63 pour le greffer à la surface de nanocapsules lipidiques (LNC) contenant un agent anticancéreux (Paclitaxel), afin de les guider vers les cellules tumorales et de faciliter leur entrée dans les cellules. L’incorporation cellulaire de ces LNC contenant un fluorochrome liposoluble, le DiD (ex/em 644/665nm), est suivie par cytométrie en flux et microscopie sur des lignées de gliome de souris GL261 et sur des cultures primaires d’astrocytes de souris. Du Paclitaxel est encapsulé avec du DiD dans les LNC et testé en culture cellulaire et chez Publications : - Bocquet A, Berges R, Frank R, Robert P, Peterson AC, Eyer J. Neurofilaments bind tubulin and modulate its polymerization. J Neurosci. 2009, 29(35):11043-54. - Berges R, Balzeau J, Peterson A, Eyer J, A Tubulin Binding Peptide Targets Glioma Cells Disrupting Their Microtubules, Blocking Migration, and Inducing Apoptosis. Mol Ther. 2012 Apr 10. 29 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Rôle d’histones méthyltransférases spécifiques de H3K9 dans la régulation de l’équilibre entre prolifération et différenciation cellulaire. Etude des fonctions des protéines virales de la famille EBNA3 dans l’immortalisation des lymphocytes B par le virus d’Epstein-Barr BATTISTI Valentine BAZOT Quentin UNIVERSITE DENIS DIDEROT - PARIS CNRS UMR7216 -Laboratoire d’ Epigénétique et Destin Cellulaire Financement de la Fondation ARC : 3ème année de thèse ECOLE NORMALE SUPERIEURE DE LYON - LYON Unité U758 - Laboratoire de Virologie Humaine Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse et SETDB1 (Fritsch et al, Mol Cell, 2010). Mon projet s’intéresse à l’étude de l’interdépendance des ces quatre KMTs de H3K9. Il porte sur l’étude fine du rôle de ces KMTs dans la régulation de l’équilibre entre prolifération et différenciation cellulaire, plus particulièrement, dans l’établissement progressif de la tri-méthylation de H3K9 sur les promoteurs gènes de la prolifération cellulaire. En utilisant le modèle de différenciation musculaire terminale, j’ai ainsi pu montrer que les 4 KMTs sont essentielles à la différenciation. De manière inattendue, les résultats montrent que 4 KMTs agissent de façon différentielle dans les cellules en prolifération. À l’inverse, en différenciation, les 4 KMTs pourraient coopérer pour établir progressivement la triméthylation de H3K9 inhibitrice sur les gènes de prolifération cellulaire. ● Durant la différenciation musculaire terminale, les myoblastes sortent d’une manière irréversible du cycle cellulaire pour ensuite fusionner et former les myotubes. Ce processus implique l’activation des gènes musculaires, précédée par l’extinction irréversible des gènes de la prolifération cellulaire. Ainsi, notre laboratoire a montré que durant la différenciation terminale, les gènes associés à la prolifération (cibles de E2F) sont éteints par triméthylation de H3K9 par Suv39h1 (Ait-Si-Ali et al, EMBO J 2004; Guasconi et al, Epigenetics 2010…). Or, la tri-méthylase Suv39h1 utilise comme substrat H3K9 qui est déjà monoou diméthylé (Rice et al, Mol Cell 2003), suggérant que Suv39h1 coopérerait avec des mono-/di-méthylases de H3K9. De fait, notre équipe a montré que Suv39h1 forme un mégacomplexe avec les mono/di-methylases GLP, G9a Nous avons ensuite étudié l’effet de la protéine virale EBNA-3A sur l’activation de la transcription induite par Miz-1. Pour cela, nous avons comparé le niveau des transcrits de gènes cibles de Miz-1 dans des LCL exprimant ou non EBNA-3A. De manière intéressante les gènes codant les inhibiteurs du cycle cellulaire p21CIP1, p57KIP1 et p15INK4B sont différemment exprimés en présence d’EBNA-3A. L’utilisation d’un plasmide rapporteur portant le gène de la Luciférase sous le contrôle du promoteur du gène CDKN2B (codant l’inhibiteur p15INK4B) nous a permis de montrer qu’EBNA-3A inhibe l’activation de ce promoteur par Miz-1. De manière intéressante, l’expression d’une protéine EBNA-3A mutée pour son interaction avec Miz-1 n’est plus capable d’inhiber cette activation Miz-1 dépendante. Le virus d’Epstein-Barr (EBV) est un γ-herpesvirus associé à de nombreux cancers chez l’homme. In vitro, l’infection de lymphocytes B primaires par EBV conduit à leur immortalisation (établissement de lignées lymphoblastoides). Dans ces cellules, 9 protéines virales sont exprimées et coopèrent pour stimuler la prolifération des cellules. Nos objectifs sont de mieux comprendre les mécanismes moléculaires par lesquels les 3 protéines de la famille EBNA3 (-3A, -3B et -3C) participent à l’immortalisation des cellules B. Pour cela, nous avons réalisé un crible deux-hybrides dans la Levure en utilisant EBNA-3A, -3B ou -3C comme appâts. Ce crible nous a permis d’identifier de nombreux nouveaux partenaires particulièrement pertinents au vu de ce que l’on connaît des rôles respectifs des protéines EBNA3. Parmi les nouveaux partenaires de la protéine EBNA-3A se trouve le facteur de transcription Miz-1, protéine jouant un rôle clef dans l’arrêt du cycle cellulaire par la transactivation de gènes codant les inhibiteurs du cycle cellulaire p21CIP1, p57KIP1 et p15INK4B. La protéine Miz-1 active la transcription de ses gènes cibles grâce au recrutement de certains coactivateurs. Une de ces protéines co-activatrices, la protéine NPM, interagit avec le domaine POZ de Miz-1, domaine également ciblé par EBNA-3A. Nous avons pu montrer que la protéine NPM est moins présente sur le promoteur du gène CDKN2B dans des LCL n’exprimant pas la protéine EBNA-3A par rapport à des LCL sauvages. Enfin, par des expériences de co-immunoprécipitation dans ces mêmes LCL nous avons pu montrer que Miz-1 interagit beaucoup plus faiblement avec NPM en présence d’EBNA-3A. La protéine virale EBNA-3A est donc capable de moduler l’expression de certains gènes cibles de Miz-1 en inhibant le recrutement de la protéine co-activatrice NPM. Ces résultats permettent de mieux comprendre les mécanismes par lesquels la protéine EBNA-3A, et plus largement EBV, dérégule le cycle cellulaire. ● Dans un premier temps nous avons validé cette interaction par GST-pull down ainsi que par co-immunoprécipitation en cellules humaines. EBNA-3A interagit au niveau de deux domaines de la protéine Miz-1, le domaine POZ et un domaine situé en C-terminal dans une région contigüe au domaine de liaison à l’ADN. Quant à Miz-1, l’interaction avec EBNA-3A se fait via le domaine N-terminal d’EBNA-3A. Dans un deuxième temps nous avons étudié la localisation cellulaire de la protéine cellulaire Miz-1. Cette dernière est connue pour avoir une localisation nucléo-cytoplasmique, cependant, en présence d’EBNA-3A, Miz-1 est retrouvée majoritairement relocalisée dans le noyau. 30 31 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Implication fonctionnelle de la protéine adaptatrice Lnk dans les cellules normales et pathologiques du lignage mégacaryocytaire Rôle de la Poly(ADP-ribose) polymérase-3 (PARP-3) dans la réponse cellulaire aux cassures double-brin. BEN MOUSSA Hajer BOEHLER Christian UFR DE SANTE MEDECINE ET BIOLOGIE HUMAINE DE PARIS XIII - BOBIGNY UMR U978 Inserm - Adaptateurs de signalisation en hématologie Financement de la Fondation ARC : 3ème année de thèse ECOLE SUPERIEURE DE BIOTECHNOLOGIE DE STRASBOURG - ILLKIRCH UMR 7242 CNRS - Equipe « Poly(ADP-ribosyl)ation et Intégrité du génome » Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse PH de Lnk ont été identifiées dans les SMPs. De ce faite, nous avons examiné l’effet de ces mutations sur l’interaction de Lnk avec JAK2WT et JAK2V617F. Nos résultats ont montré que ces modifications de Lnk diminuent sa liaison avec la kinase, notamment avec JAK2V617F. Nous réalisons à présent des essais de prolifération cellulaire dans un contexte SMPs (JAK2V617F) afin de confirmer le rôle de ces mutations dans ces hémopathies. L’adaptateur Lnk est exprimé dans le système hématopoïétique. Il possède différents domaines fonctionnels [dimérisation (DD), PH et SH2]. Les souris Lnk-/- ont montré son rôle comme régulateur négatif crucial des voies de signalisation essentielles pour la prolifération des lignages hématopoïétiques, tel que le lignage mégacaryocytaire. En effet, Lnk est exprimé tout au long de la différenciation mégacaryocytaire et son absence entraîne une hyperprolifération de ce lignage due à l’hypersensibilité à la thrombopoïétine et à la dérégulation des ces voies de signalisation (JAK/STAT et MAPK). Lnk interagit et inhibe, de manière-dose dépendante, la kinase JAK2 via son domaine SH2 est un nouveau site d’interaction dans sa région Nterminale. Le phénotype des souris Lnk-/- s’assimile à celui retrouvé dans les syndromes myéloprolifératifs (SMPs) caractérisés par la surproduction d’une ou plusieurs lignages myéloïdes. Un grand avancé dans ces hémopathies a été fait avec l’identification des mutations dans la kinase JAK2 (V617F, 90%). Récemment, des mutations de Lnk (13%) ont été identifiées dans les SMPs. Ces données ont suggéré un rôle clé de Lnk et JAK2 dans l’origine et/ou le développement de ces syndromes. Cependant, les mécanismes moléculaires impliquant ces deux protéines dans ces pathologies restent à élucider. Mon projet de thèse vise à définir la signification moléculaire de l’interaction Lnk/JAK2 dans la mégacaryopoïèse normale et pathologique notamment de SMPs. Afin de caractériser le nouveau site de liaison de JAK2 en Lnk, nous avons examiné l’effet des formes tronquées de Lnk, ayant sa région Nterminale, sur leur association avec JAK2. Nos résultats ont montré que l’interaction de Lnk avec JAK2V617F est significativement plus forte qu’avec JAK2WT, suggérant une régulation différentielle de deux formes de la kinase par Lnk. L’analyse de l’effet de cette interaction sur l’activité kinase de JAK2, est en cours, et déterminera l’éventuelle utilisation de cette région de Lnk pour inhiber spécifiquement JAK2 mutée dans les SMPs. Nous avons développés une approche appliquée sur l’analyse de Lnk dans des cellules des patients SMPs. Nos résultats précédents ont montré une différence de l’expression de Lnk entre les cellules des patients et celles des contrôles sains. Afin d’examiner l’effet de cette expression différentielle de Lnk sur l’activation de la voie JAK/STAT, nous développons l’analyse par cytométrie en flux de l’activation de cette voie de signalisation et l’expression de Lnk dans les plaquettes SMPs. Nos résultats préliminaires montrent une corrélation entre le niveau d’activation de la voie JAK/ STAT et le niveau d’expression de Lnk. L’ensemble de nos résultats suggèrent que l’altération du complexe Lnk/JAK2 module les réponses cellulaires médiées par JAK2 dans les SMPs. L’identification de la séquence dans la région Nterminale de Lnk permettra son éventuelle utilisation comme inhibiteur spécifique de JAK2V617F pour le traitement de ces maladies. ● Publications : Expression level and differential JAK2-V617F-binding of the adaptor protein Lnk regulates JAK2-mediated signals in myeloproliferative neoplasms. Baran-Marszak F, Magdoud H, Desterke C, Alvarado A, Roger C, Harel S, Mazoyer E, Cassinat B, Chevret S, Tonetti C, Giraudier S, Fenaux P, Cymbalista F, Varin-Blank N, Le Bousse-Kerdilès MC, Kiladjian JJ, Velazquez L. Blood. 2010 Dec 23;116(26):5961-71. Des mutations dans la région Nterminale et le domaine 32 La réaction de Poly(ADP-ribosyl)ation, catalysée par les Poly(ADP-Ribose) Polymérases (PARP, 17 membres), intervient dans un nombre croissant de processus biologiques, parmi lesquels la réparation de l’ADN. PARP-1 et PARP-2 sont décrits comme des acteurs clés du système de réparation par excision de bases. Leur inhibition présente un intérêt thérapeutique double : elle potentialise la radiotoxicité et la cytotoxicité d’agents génotoxiques lors des traitements des cancers par radio- et chimiothérapie, et protège de la mort cellulaire dans des situations pathologiques mettant en jeu un stress oxydatif aigu. Certains inhibiteurs sont déjà engagés dans des essais cliniques pour le traitement de cancers du sein. Nous avons entrepris la caractérisation fonctionnelle de PARP-3, une protéine jusqu’alors peu étudiée. D’une part, nous avons identifié l’existence d’une interaction physique et fonctionnelle de PARP-3 avec les facteurs mitotiques NuMA et Tankyrase-1 (PARP-5a). Ce complexe joue un rôle fondamental dans l’intégrité des télomères et la dynamique du fuseau de microtubules lors de la mitose. donc capables de réparer leurs DSB que via le NHEJ. L’interaction de PARP-3 avec des composants du NHEJ et l’inefficacité des extraits nucléaires de splénocytes issus des souris PARP-3-/- à catalyser le NHEJ dans un système in vitro, implique un rôle important de cette protéine dans cette voie de réparation. Suivant le principe de létalité synthétique, nous avons alors émis l’hypothèse que le ciblage de PARP-3 dans de telles lignées pourrait induire une forte mortalité cellulaire, aussi bien spontanément que suite à un traitement générateur de DSB. D’autre part, nous avons identifié PARP-3 comme un acteur clé de l’intégrité du génome. Par microirradiation laser nous avons montré que PARP-3 est recrutée au niveau des sites de cassure de l’ADN. La déplétion de PARP-3 dans des cellules humaines MRC5 entraîne (i) une accumulation spontanée et une persistance significative des foyers γH2AX, marqueur des cassures double-brin (DSB) après irradiation, (ii) ainsi qu’un délai dans la réparation de ces cassures. De plus la disruption de PARP-1 et -3 chez la souris entraîne une radiosensibilité accrue indiquant un rôle synergique des deux protéines dans la réponse aux dommages. Ces résultats apparaissent comme prometteurs et présentent PARP-3 comme une cible potentielle en thérapie du cancer du sein. ● En accord avec cette hypothèse, nos résultats préliminaires indiquent une très forte diminution de la survie de cellules cancéreuses déficientes en RH après déplétion de PARP-3, et ce même en absence de traitement génotoxique additionnel. Cette létalité est encore augmentée après induction de DSB. La mortalité cellulaire induite par l’absence de PARP-3 s’explique par une instabilité génomique augmentée caractérisée par la génération de micronoyaux et une amplification centrosomale exacerbée. Publications : Boehler, C. and Dantzer, F. PARP-3, a DNA-dependent PARP with emerging roles in double-strand break repair and mitotic progression (2011) Cell Cycle 10(7), 1023-4 Boehler, C., Gauthier, LR., Mortusewicz, O., Biard, DS., Saliou, JM., Bresson, A., Sanglier-Cianferani, S., Smith, S., Schreiber, V., Boussin, F. and Dantzer, F. Poly(ADP-ribose) polymerase 3 (PARP3), a newcomer in cellular response to DNA damage and mitotic progression (2011) Proc Natl Acad Sci USA 108(7), 2783-8 Boehler, C., Gauthier, LR., Yelamos, J., Noll, A., Schreiber, V. and Dantzer F. Phenotypic characterization of Parp-1 and Parp-2 deficient mice and cells (2010) Methods Mol Biol 780, 313-36 La cellule humaine dispose de deux mécanismes distincts pour réparer les DSB : la Recombinaisoon Homologue (RH) et la recombinaison non-homologue (NHEJ pour NonHomologous End-Joining). Près de 20% des cancers du sein sont mutés en BRCA-1/2, protéines jouant un rôle essentiel dans la RH. Ces cellules cancéreuses ne sont 33 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Le complexe CRL2(LRR-1) E3 ubiquitine-ligase régule la stabilité de HTP-3 afin d’inhiber la mise en place de la méiose dans les cellules souches germinales chez C. elegans PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Modifications de la chromatine associées à la sénescence cellulaire CONTREPOIS Kévin BURGER Julien COMMISSARIAT A L’ENERGIE ATOMIQUE DE SACLAY - GIF-SUR-YVETTE CEA/DSV/iBiTec-S/SBIGeM/Equipe stabilité génomique et sénescence Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse INSTITUT JACQUES MONOD - PARIS UMR7592 - Laboratoire Cycle Cellulaire et Développement Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse recombination. More specifically, our results indicate that CRL2LRR-1 targets for proteolytic destruction the HORMA domain- containing protein HTP-3, which is required for loading structural proteins onto meiotic chromosomes and for the formation of the double-strand breaks that initiate meiotic recombination. We propose that the ubiquitinproteolytic system may similarly regulate progression through meiosis in other organisms. ● Precise control of the transition from self-renewal to terminal differentiation in stem cells is critical to maintain a balance between cell populations: an excess of stem cell self-renewal can lead to tumourigenesis, whereas an excess of differentiation can deplete the stem-cell pool. In the adult Caenorhabditis elegans germline, Notch signals emanate from the somatic distal tip cell to maintain germline stem cells (GSCs) in a proliferative state by repressing the expression of meiotic promoting factors. In this study, we show that the ubiquitin-proteolytic system act synergistically with the Notch pathway to prevent meiotic entry. Using a novel temperature-sensitive allele of the cul-2 gene, we found that the CUL-2 RING E3 ubiquitin ligase in combination with the Leucine Rich Repeat 1 substrate recognition subunit (CRL2LRR-1) negatively regulates the meiotic program of chromosome pairing, synapsis, and Publications : CRL2LRR-1 E3-Ligase acts through HTP-3 to prevent progression through meiotic prophase in germline stem cells in C. elegans J. Burger* , J. Merlet*, N. Tavernier, B. Richaudeau, A. T. Moerkamp, R. Ciosk, B. Bowerman and L. Pintard (Soumis à Developmental cell) without DNA damage by expression of the RAF1 kinase. Accumulation of these two variants is regulated by posttranscriptional mechanisms. Interestingly, in contrast to other H2A variants, H2A.J is expressed solely from replication-independent polyA mRNA. H2A.J represents only about 1% of all H2A species in proliferating cells, but it accumulates to nearly 20% of H2A species during longterm replicative senescence. Remarkably, H2A.J, like H2A.X, contains a Ser-Gln (SQ) motif near the C-terminus of the protein. SQ motifs are potential phosphorylation sites for the DNA damage checkpoint kinases ATM/ATR/ DNA-PK. Hence, phospho-H2A.J could play essential roles regarding DNA damage repair in conditions of long-term senescence with persistent DNA damages. H2A.J may thus represent a novel biomarker of senescent cells in mammalian tissues during aging or in different disease processes. ● Cellular senescence is a stress response of mammalian cells leading to a durable arrest of cell proliferation that has been implicated in tumor suppression, wound healing, and aging. The proliferative arrest is mediated by transcriptional repression of genes essential for cell division by the retinoblastoma protein family. This repression is accompanied by varying degrees of large-scale heterochromatin assembly, but little is known regarding the molecular mechanisms involved. We found that both deacetylation of H4-K16Ac (histone H4 acetylation on Lys-16) and expression of HMGA1/2 (high mobility group A) can contribute to DNA compaction during senescence. SIRT2, an NAD-dependent class III histone deacetylase, contributes to H4-K16Ac deacetylation and DNA compaction in human fibroblast cell lines that assemble striking senescence-associated heterochromatic foci (SAHFs). Decreased H4-K16Ac was observed in both replicative and oncogene-induced senescence of these cells. Inhibition of SAHFs formation did not noticeably affect the stability of the senescent state. These results are important in interpreting reported decreases in H4-K16Ac levels during mammalian aging and in cancer cells. Publications : - Contrepois K, Thuret JY, Courbeyrette R, Fenaille F, Mann C. (Epigenetics & Chromatin – manuscrit en révision). SIRT2 deacetylation of H4-K16Ac and heterochromatin assembly in senescence. - Jeanblanc M, Ragu S, Gey C, Contrepois K, Courbeyrette R, Thuret JY, Mann C. (2012). Parallel pathways in RAFinduced senescence and conditions for its reversion. Oncogene. Jun 21;31(25):3072-85. doi: 10.1038/ onc.2011.481. Epub 2011 Oct 24. - Contrepois K, Ezan E, Mann C, Fenaille F. (2010). UltraHigh Performance Liquid Chromatography-Mass Spectrometry for the Fast Profiling of Histone Post-Translational Modifications. J Proteome Res. 9: 5501-5509. Moreover, we identified profound modifications over time in the chromatin of post-mitotic human fibroblasts in vitro. Remarkably, mass spectrometry revealed an enrichment over time of specific H2A/H2B variants (i.e. H2B type 1-K and H2A.J) at the protein and peptide levels in long-term senescent conditions (20-30 days) with persistent DNA damages (i.e. continuous activation of DNA damage repair pathways). This accumulation was not observed in longterm quiescent cells or in cells induced into senescence 34 35 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Régulation du trafic et de l’activité de la métalloprotéase ADAM10 par les Tétraspanines à 8 cystéines Etude de l’immunité cellulaire T CD4 dirigée contre la télomérase : implications pour l’immunothérapie antitumorale et l’immunosurveillance des cancers. DORNIER Emmanuel DOSSET Magalie HOPITAL PAUL BROUSSE - VILLEJUIF UMRS 1004 Inserm/P11- Réponses cellulaires au microenvironnement et cancer Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse ETABLISSEMENT FRANCAIS DU SANG - BESANCON UMR1098 - Interaction Hôte Greffon Tumeur et Ingénierie Cellulaire et Génique Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse L’importance des activités protéolytiques associées à la membrane plasmique dans la progression tumorale est de mieux en mieux définie. Parmi ces molécules, les membres de la famille ADAM (A Disintegrin and Metalloprotease), et ADAM10 en particulier, ont suscité un intérêt tout particulier du fait de la nature de leurs substrats (récepteur de l’EGF, TNFalpha, Notch,…). Dans cette étude nous nous intéressons à la régulation d’ADAM10 par les membres d’une sous-famille de tétraspanines à 8 cystéines (les 8CysTspans). J’ai montré que certaines de ces molécules sont capables d’interagir directement avec ADAM10 et de contrôler sa sortie du réticulum. Au cours de ma dernière année de thèse, j’analyserai l’importance de ces interactions multiples, que ce soit en matière de trafic intracellulaire d’ADAM10 ou de sa fonction dans l’activation de la 36 voie Notch. Mon travail a déjà mis en évidence un nouveau mécanisme de régulation de la protéase ADAM10, et pourrait montrer un nouveau mécanisme de régulation de la voie Notch.Régulation du trafic et de l’activité de la métalloprotéase ADAM10 par les Tétraspanines à 8 cystéines ● The stimulation of CD4+ T helper cell responses has gained considerable interest for cancer immunotherapy. We evaluate the antitumor potential of CD4 T cells specific of novel telomerase-derived peptides referred as universal cancer peptide (UCP) that bind to most commonly found HLA-DR alleles. Publications : “TspanC8 tetraspanins regulate the trafficking of ADAM10/Kuzbanian and Notch receptor activation in flies and mammals” Emmanuel Dornier, Franck Coumailleau, Jean-François Ottavi, Julien Moretti, Michael Tomlinson, Claude Boucheix, Philippe Mauduit, François Schweisguth and Eric Rubinstein, En révision à Journal of Cell Biology We prospectively studied a cohort of 84 advanced NSCLC patients for the presence of naturally occurring UCPspecific CD4 T cells prior chemotherapy (CT). A relevant preclinical HLA-A2/DR1 transgenic mouse model was used to evaluate the potential of UCP-based cancer vaccine. to generate potent tumor-specific CTL responses. Furthermore the use of UCPs in therapeutic vaccination breaks self tolerance against telomerase and eradicates established mouse melanoma by promoting massive CD8+ T cells recruitment at the tumor site. Together with the presence of natural UCP-specific T cell responses in many other cancers, these results support that the stimulation of UCP-specific CD4+ helper T cells is a powerful method to improve cancer vaccines efficiency and provides a new tool for comprehensive monitoring of antitumor responses in cancer patients. ● Publications : Dosset M, Godet Y, Vauchy C et al. Universal cancer peptide-based therapeutic vaccine breaks tolerance against telomerase and eradicates established tumor (En révision, Clin Can Res, 2012). Godet Y, Fabre E, Dosset M et al. Analysis of spontaneous tumor-specific CD4 T-cell immunity in lung cancer using promiscuous HLA-DR telomerase-derived epitopes: potential synergistic effect with chemotherapy response. Clin Cancer Res. 2012 May 15;18(10):2943-53. Significant frequency (38%) of naturally occurring UCPspecific CD4 T-cell responses were detected before CT in advanced NSCLC but not in healthy volunteers. UCPspecific CD4 T-cell clones generated from cancer patients exhibited high avidity and are Th1 polarized. Interestingly, the presence of UCP-specific T cell response was shown to significantly increase overall survival (OS) of patients responding to CT. By using a HLA-A2/DR1 transgenic mouse model, we showed that UCP-specific CD4+ T cells induced after vaccination fulfilled helper features necessary 37 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Exploration d’une polythérapie ciblée dans le traitement des rhabdomyosarcomes DUMONT Sarah CENTRE LEON BERARD - LYON INSERM U 1052/CNRS UMR 5286 - Equipe 11 : Ciblage thérapeutique de la tumeur et de son environnement immunitaire Financement de la Fondation ARC : 1ère à 3ème années de thèse Despite its initial chemosensitivity, rhabdomyosarcoma (RMS) is a deadly tumor, due to rapid chemoresistance onset. While little is known regarding adult RMS, it carcinogenesis seems to be driven by the PAX3/7-FOXO1 translocation in childhood alveolar RMS, suggesting a possible benefit of a targeted approach. This work sought to better understand adult RMS through the study of clinicopathologic and molecular factors and to offer in vitro evidence of targeted therapy efficacy to offer alternative cure strategy. We retrospectively analyzed 239 patients, 10 years of age and greater, diagnosed with RMS at MD Anderson Cancer Center from 1957 through 2003 and evaluated the PAX3/7 translocation status for 105 of them. These samples were formatted into a tissue microarray and fluorescent in situ hybridization (FISH) using break-apart probes for PAX3, PAX7 and FOXO1 was employed. Three small cell sarcoma cell lines were studied RD18 (rhabdomyosarcoma), A204 (undifferentiated sarcoma) and TC 71 (Ewing’s sarcoma). Each cell line was exposed to increasing concentrations of vorinostat (HDAC inhibitor), 17-DMAG (Hsp90 inhibitor), abacavir (anti-telomerase) and sorafenib (tyrosine kinase inhibitor) alone, combined 2 by 2, then with doxorubicin. Viability was assessed by MTS assay. The Chou and Talalay combination index (CI) was used to determine additive (CI=1), synergistic (CI1). Cell cycle analysis, measure of apoptosis by Annexin V and caspase 3/7 activity were studied using flow cytometry analysis and luminescent assays. The translational part of the study showed that less aggressive management of rhadomyosarcoma patients reduced the chance of cure, stressing the need of multimodality therapy. Morevover, there was a trend towards better outcomes for patients with fusion-negative RMS suggesting a possible benefit of a targeted approach to its transcriptional target pathways. The in vitro study showed that, in monotherapy, each agent lead to 30% to 90% decrease in viability but abacavir, which remained less active. Combination therapies with vorinostat, sorafenib and 17-DMAG showed strong synergism. Abacavir was found antagonistic with each drug. Either vorinostat or 17DMAG synergized with 38 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Effet anti-angiogénique des inhibiteurs des kinésines Eg5 et Mklp2: Etude de leur potentiel anti-tumoral dans des modèles pré-cliniques. EXERTIER Prisca UNIVERSITE DES SCIENCES ET TECHNOLOGIES DE BORDEAUX - TALENCE Inserm U1029 - Laboratoire de l’angiogenèse et du micro-environnement des cancers Financement de la Fondation ARC : 3ème année de thèse doxorubicin, achieving 60% cell killing compared to doxorubicin alone 12% (p=0.007). However, no synergy was observed for sorafenib with doxorubicin. The triple therapy vorinostat, 17DMAG and Doxorubicin did not show synergism but transiently increased the subG1 population at 24H, 70% compared to 30% in monotherapy with an increase in early caspase-independent apoptosis (11% to 36%, p= 0.0008). This present work provides clinical, molecular and in vitro evidence of targeted polytherapy relevance in rhabdomyosarcoma. The combinaison screening demonstrated the synergism of dual combinations of vorinostat, 17DMAG and sorafenib. In adjunction to doxorubicin, these combinations enhanced doxorubicin cytotoxicity at therapeutically relevant concentrations. Such data supports the pursuing of targeted therapy combination investigation through clinical trials. ● L’angiogenèse, la formation de nouveaux vaisseaux à partir de vaisseaux pré-existants, est indispensable à la progression tumorale. Elle est dépendante de nombreux facteurs tels que le « Vascular Endothelial Growth Factor » (VEGF). Nous avons modélisé l’angiogenèse induite par le VEGF sur la membrane chorio-allantoidienne (CAM) de l’embryon de poulet. Ce tissu a été isolé et l’expression de gènes a été comparée aux CAMs contrôles par analyse transcriptomique (Affymetrix). En dehors des gènes endothéliaux « classiques » régulés par VEGF, certains gènes codant pour des kinésines mitotiques (KIF4A, KIF11, KIF15, KIF20A et KIF23) ont été induits de manière reproductible. Publications : Sarah N. Dumont SN, Alexander J. Lazar, Julia A. Bridge , Robert S. Benjamin, Jonathan C. Trent. «PAX3/7-FOXO1 Fusion Status in Older Rhabdomyosarcoma Patient Population by Fluorescent In Situ Hybridization», Journal of Cancer Research and Clinical Oncology,J Cancer Res Clin Oncol. 2012 Feb;138(2):213-20. Epub 2011 Nov 17. Poster ASCO 2010 et 2011, Poster CTOS 2010 et presentation orale CTOS 2011 Soumis au journal Cancer: Sarah N. Dumont, Dejka M. Araujo, Mark F. Munsell, Jason Salganick, Amaury G. Dumont, Claude Linassier, Shreyaskumar Patel, Robert S. Benjamin, Jonathan C. Trent Management and Outcome of 239 Adolescent and Adult Rhabdomyosarcoma Patients En ecriture: Sarah N. Dumont, Amaury G. Dumont, Robert S. Benjamin, Jonathan C. Trent Rational for targeted polytherapy in rhabdomyosarcoma: get the genie out of the bottle e-publication ASCO 2012 In vitro, des inhibiteurs chimiques spécifiques d’Eg5 tels que le dimethylenastron (DMN) et l’ispinesib mesilate (ISP, utilisé dans des essais cliniques actuellement), bloquent la prolifération, l’adhésion et la migration des cellules endothéliales ainsi que la tubulogenèse. In vivo, l’injection d’un morpholino contre KIF11 induit des défauts vasculaires des vaisseaux intersomitiques et du vaisseau longitudinal dorsal et, a plus forte dose, une létalité de l’embryon. Dans des modèles pré-cliniques de greffe de cellules tumorales chez la souris et l’embryon de poulet, l’inhibition d’Eg5 réduit l’angiogenèse tumorale d’une manière significative. En conclusion, nos résultats montrent pour la première fois une implication importante d’une kinésine dans l’angiogenèse et suggèrent que l’endothélium représente une cible pharmacologique pour les inhibiteurs des kinésines mitotiques, ce qui devrait avoir des conséquences majeures sur l’élaboration de nouveaux agents anti-kinésine. ● Nous avons focalisé notre recherche sur la kinésine KIF11 (codant pour la protéine Eg5) et son rôle dans l’angiogenèse. Publications : «Kinesin KIF11/Eg5 plays a critical role in physiological and pathological angiogenesis in chick and zebrafish embryos and murine tumor models» en soumission chez Blood 39 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Rôle des isoformes des membres du pore de transition de perméabilité (PTP) mitochondrial dans la communication apoptotique entre le réticulum endoplasmique (RE) et la mitochondrie en réponse au stress RE dans des lignées cancéreuses humaines GALLERNE Cindy FACULTE DE PHARMACIE DE L’UNIVERSITE PARIS XI - CHÂTENAY-MALABRY INSERM U769 - LabEx LERMIT - Signalisation et Physiopathologie Cardiaque Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse Introduction : Les approches et outils disponibles (anticorps, shRNAmir) pour mener à bien mon projet initial ont généré de nombreuses incertitudes (manque de spécificité de reconnaissance et d’extinction des isoformes de VDAC et d’ANT), ne nous permettant pas d’interpréter correctement les résultats obtenus avec les clones stables que nous avons générés. Nous avons donc décidé, de réorienter mon projet de thèse et d’étudier les mécanismes cellulaires et moléculaires d’un inhibiteur de Hsp90 (Heat shock protein 90) le PU-H71, sur le devenir des cellules cancéreuses. La protéine chaperonne Hsp90, dont l’expression et l’activité augmentent dans les cellules cancéreuses, est essentielle à l’activation et la stabilité de nombreuses oncoprotéines. Les Hsp90 ont donc récemment émergé comme nouvelles cibles thérapeutiques anticancéreuses, entrainant le développement de nombreux inhibiteurs de cette chaperonne. Parmi ceux-ci, le PU-H71 s’est avéré efficace pour induire l’apoptose de différentes tumeurs chez la souris. Néanmoins, les mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans la réponse apoptotique induite par PU-H71 sont encore mal connus. l’induction de la voie mitochondriale de l’apoptose, alors que cet inhibiteur s’avère non toxique pour les fibroblastes humains sains. L’apoptose induite par PU-H71 est caractérisée par une perméabilisation de la membrane interne de la mitochondrie, une chute du potentiel membranaire mitochondrial, une surexpression et une activation de la protéine pro-apoptotique Bax, un relargage de cytochrome c et une activation de la caspase-3. De plus, et contrairement à l’inducteur de stress RE thapsigargine, PU-H71 est capable de provoquer l’apoptose dans des cellules cancéreuses qui surexpriment la protéine anti-apoptotique Bcl-2, à un niveau similaire à celui observé dans les cellules qui ne surexpriment pas Bcl-2. Ce résultat indique que PU-H71 contourne la résistance à l’apoptose conférée par la surexpression de Bcl-2. Nous avons également observé que des cellules déficientes pour Bax, qui sont résistantes à l’apoptose induite par PU-H71, peuvent être sensibilisées de façon significative par un traitement combinatoire utilisant PU-H71 et le melphalan ou le cisplatine. Conclusion et perspectives: L’ensemble de ces résultats indique que PU-H71 semble être une molécule très prometteuse dans le cadre du traitement des cancers, en particulier ceux qui présentent une surexpression de Bcl-2. Par ailleurs, PU-H71 pourrait être utilisé efficacement en combinaison avec d’autres molécules à potentiel chimiothérapeutique, notamment dans le cas de tumeurs résistantes aux chimiothérapies conventionnelles. ● Description du projet : Nous avons cherché à (i) décrypter le mode d’action du PU-H71, (ii) déterminer le rôle des protéines Bcl-2 et Bax et (iii) sensibiliser à l’apoptose des cellules cancéreuses résistantes au PU-H71. Nous avons observé que PU-H71 induit l’épissage de l’ARNm de XBP1, et une augmentation de l’expression de Grp94, Grp78, ATF4 et CHOP, démontrant que cette molécule active la voie UPR (Unfolded Protein Response) et induit un stress du réticulum endoplasmique (RE). Par ailleurs, nous avons mis en évidence une augmentation des sites de contact entre le RE et les mitochondries, suggérant une communication apoptotique entre ces deux organites. Dans cinq lignées cancéreuses humaines, nous avons montré que la réponse au stress RE induite par PU-H71 est associée à Publications : Cindy Gallerne, Alexandre Prola and Christophe Lemaire The purine scaffold Hsp90 inhibitor PU-H71 induces endoplasmic reticulum stress and mitochondrial pathway of apoptosis in human cancer cells and overcomes Bcl-2-mediated resistance (article soumis) 40 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Rôle et mécanisme d’action du ligand ADMP1 et du récepteur Alk1/2 dans la signalisation BMP au cours du développement de l’embryon d’oursin Paracentrotus lividus HAILLOT Emmanuel STATION ZOOLOGIQUE - VILLEFRANCHE-SUR-MER UMR7009- Biologie du développement Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse BMP2/4 ligand. Moreover this phenotype is associated with a loss of dorsal gene expression. We also identified a new BMP-related factor that cooperates with BMP2/4 during dorsal ventral axis formation. We called this TGFbeta Maverick/GDF since it is mostly related to Drosophila Maverick and Vertebrate GDF. Inactivation of Maverick caused a mild ventralisation accompanied by ectopic expression of nodal during blastula stages while the double inactivation of BMP2/4 and Maverick caused an extreme ventralization. This is very similar to the phenotype caused by the double inactivation of Alk1/2 and Alk3/6. Surprisingly, although Maverick appears to play a key role in the initiation of dorsal-ventral axis specification, it is expressed at a very low level and we detected a gradient of Maverick mRNA present at 60-cell stage. In sea urchin, TGFβ ligands Nodal and BMP2/4 play crucial roles in establishment of dorso-ventral polarity. Expression of nodal is initiated around the 32- 60 cells stage in the ectoderm. Nodal expression is initially broad but is rapidly restricted to the ventral ectoderm by mechanisms that are not yet understood. Nodal is absolutely required to specify ventral but also dorsal ectoderm. When translation of nodal transcript is prevented, specification of both the ventral and the dorsal ectoderm fails and the ectoderm differentiates into a neurogenic ectoderm. Nodal expressing cells have a long range organizing activity on the ectoderm. This long- range activity of Nodal is assured by BMP2/4. It acts as a relay molecule synthetized in the ventral ectoderm, then translocated to the opposite side. It binds at the Alk3/6 type I receptor and actives phosphorylation of Smad1/5/8 inducing expression of dorsal ectoderm genes. To better understand the role of BMP pathway in establishment of dorso-ventral polarity, we have studied the role of new actors which could have a function in the BMP pathway during the development of sea urchin embryo. In conclusion, we have discovered 3 new actors which participate at the BMP signaling. We showed that Admp1 ligand participate to a compensation system to regulate BMP signaling perturbation. Then we have proved that Alk1/2 receptor is essential to specify dorsal ectoderm as Alk3/6. We have also discovered a BMP maternal GDF2 which contributes at the restriction of nodal at very early stage. Finally we showed that when you repress all BMP signaling, the ventral specification is the default fate in ectoderm. So the dorso ventral axis formation in sea urchin appeared associate with a direct antagonism between Nodal and BMP pathway. ● In this project, we studied the function of two new ligand BMP called ADMP1 and GDF2, as well as a new BMP receptor of type I called Alk1/2. Admp1 ligand is with BMP2/4, the only BMPs ligand expressed in ventral organizer center. We have established that Nodal and FGF are essential to the expression of ADMP1. Surprisingly we have also showed that admp1 expression is negatively regulated by the signaling BMP as it is the case with the vertebrate. To understand the function of admp1, we have repress both admp1 and BMP2/4 expression and showed that the phenotype is stronger that the phenotype induces by BMP2/4 repression alone. Publications : Saudemont A, Haillot E, Mekpoh F, Bessodes N, Quirin M, Lapraz F, Duboc V, Röttinger E, Range R, Oisel A, Besnardeau L, Wincker P, Lepage T. Ancestral regulatory circuits governing ectoderm patterning downstream of Nodal and BMP2/4 revealed by gene regulatory network analysis in an echinoderm.; 2010, PLoS Genetics. 6(12):e1001259. PMID:21203442 Alk1/2 is the second BMP receptor of type 1 present in the sea urchin genome. In studying the function of Alk1/2, we showed that it is essential for BMP signaling. The repression of Alk1/2 induces a phenotype very similar to a loss of 41 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Rôle des facteurs NER dans le processus de transcription ILTIS Izarn INSTITUT DE GENETIQUE ET DE BIOLOGIE MOLECULAIRE ET CELLULAIRE - ILLKIRCH CNRS UMR 7104 - INSERM U 964 - Laboratoire Expression et réparation du génome Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse coupures de l’ADN sur le promoteur afin de favoriser la formation de boucle qui sera ensuite stabilisée par XPF. Pour préserver l’intégrité du génome des différentes lésions de l’ADN (UV, anti-tumoraux...) divers mécanismes de réparations ont été mis en place par la cellule: le mécanisme d’excision de bases (BER), le mécanisme d’excision de nucléotides (NER), la recombinaison homologue ou la réparation par mésappariement. La NER se divise en 2 voies : la GGR (global genome repair) qui élimine les lésions de l’ensemble du génome et la TCR (transcription coupled repair) qui permet de réparer les lésions du brin transcrit de l’ADN. La mutation de gènes impliqués dans la NER sont à l’origine de 3 maladies génétiques: Xeroderma Pigmentosum (XP), la Trichothodystrophie (TTD) et le syndrome de Cockayne (CS). Ces patients présentent une grande variété de symptômes incluant une hypersensibilité à la lumière et une prédisposition aux cancers de la peau. Tous ces signes cliniques ne peuvent pas être expliqué que par un défaut de réparation de l’ADN. On peut donc imaginer que certains facteurs de réparation peuvent être impliqués dans d’autres processus cellulaires. En effet dans un système de gènes sous le contrôle de récepteurs nucléaires (RARβ2 et PPAR), nous avons observé lors de la transcription, le recrutement de l’ARN polymérase II, de ces partenaires, de TFIIH ainsi que celui des facteurs NER : XPC, XPA, RPA, CSB, XPG et XPF. Nous avons également montré que le co-recrutement des facteurs NER avec la machinerie transcriptionnelle influence l’environnement chromatinien du promoteur actif, en induisant une déméthylation de l’ADN autour du promoteur et des modifications post-traductionnelles des histones (PTMs). Nous avons aussi montré que certaines PTMs de la chromatin, n’étaient pas présentes en absence de XPC. Dans des cellules contrôles, on observe une acétylation de H3K9 conformes à l’état chromatinien de la transcription. L’enzyme GCN5 responsable de cette modification est recrutée sur le promoteur de RARβ2 lors du pic d’acétylation de H3K9. En absence de XPC, on observe une absence du recrutement de GCN5 provoquant une déacétylation de H3K9. Des résultats identiques ont été observés dans les cellules de patients XP-C. On peut donc supposer que le recrutement de GCN5 est dépendant de la présence de XPC. Lors de ce projet de recherche, nous avons montré que les mécanismes de transcription et de réparation n’étaient pas deux processus distincts. En effet, nous avons prouvé que les facteurs NER étaient recrutés lors de la transcription et que XPC, XPG et XPF sont impliqué dans des phénomènes de remodelage de la chromatine. Une meilleure compréhension de ces mécanismes de régulation de l’expression des gènes et du rôle des protéines NER permettra de mieux comprendre la pathologie XP et la prédisposition de ces patients à développer des cancers de la peau. ● PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster MyD88 participe à la régulation des mécanismes de réparation de l’ADN et favorise la résistance des cellules tumorales aux agents génotoxiques. MyD88 une nouvelle cible thérapeutique ? KFOURY Alain CENTRE LEON BERARD - LYON NRS UMR 5286 - INSERM U 1052 - Eqpe Signalisation Immunité Innée Oncogénèse Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse damage, resulting in cell death via the tumor suppressor protein p53. Furthermore, we show that knocking down MyD88 sensitizes cancer cells to genotoxic agents in vitro and in vivo. Collectively, these results suggest a novel and original link between inflammation, DNA repair, and cancer, and provide further rationale for MyD88 as a potential therapeutic target in Ras-dependent cancers, in particular in the context of concomitant genotoxic chemotherapy. ● MyD88 is an adaptor molecule in TLR, IL-1R, and IL-18R signalling that was previously shown to be implicated in tumorigenesis through pro-inflammatory mechanisms. We have recently reported that in addition to its role in innate immunity, MyD88 plays a direct role in promoting the optimal activation of the RAS/ERK transformation pathway. Here we show that MyD88 is required for efficient Ras- and ERCC1-dependent DNA repair in cancer cells, and that its inhibition leads to the accumulation of DNA Publications : - NER factors are recruited to active promoters and facilitate chromatin modification for transcription in the absence of exogenous genotoxic attack. Molecular Cell 2010. Le May N, Mota-Fernandes D, VélezCruz R, Iltis I, Biard D, Egly JM. - XPG and XPF endonucleases trigger chromatin looping and DNA demethylation for accurate expression of activated gene. Molecular Cell 2012. Le May N, Fradin D, Iltis I, Bougnères P and Egly JM. Nous avons ensuite étudié le rôle de ces facteurs NER XPC, XPG et XPF. Nous avons mis en évidence que XPG et XPF sont essentiels pour l’établissement de boucles de chromatine entre le promoteur et le terminateur du gène RARβ2. De plus l’abolition ou la mutations du domaine catalytique de XPG et/ou de XPF perturbe la formation de boucle de d’ADN ainsi que la transcription du gène. Nous avons également montrés que l’endonucléase XPG générait des 42 43 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Les G-quadruplexes constituent un obstacle pour la réplication et une menace pour la stabilité du génome PIAZZA Aurèle INSTITUT CURIE - PARIS UMR3244 - Laboratoire « recombinaison et instabilité génétique » Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse Les G-quadruplexes sont des structures à 4 brins formées spontanément par certains acides nucléiques riches en guanines dans des conditions physiologiques in vitro et qui présentent une grande variété de conformations. Lorsque j’ai entrepris ma thèse, de nombreux indices mais peu de preuves expérimentales supportaient l’existence de ces structures in vivo. La première partie de ma thèse a consisté à montrer qu’ils se formaient in vivo, découvrir les mécanismes en charge de leur métabolisme, et étudier les conséquences pathologiques de leur persistance. Publication #4 (en révision): Piazza A, Serero A, Boulé J-B, Legoix-Né P, Lopès J, Nicolas A. « Stimulation of gross chromosomal rearrangements by the human HRAS1, CEB1 and CEB25 minisatellites in S. cerevisiae depends on G-quadruplexes or Cdc13». En révision à PLoS Genetics. Publication #3 Lopes J*, Piazza A*, Bermejo R, Kriegsman B, Colosio A, Teulade-Fichou MP, Foiani M, Nicolas A. (2011), « G-quadruplex-induced genetic instability during leading strand replication », The EMBO Journal, 30, 4033–4046, doi: 10.1038/emboj.2011.316 *: co-premier auteur les G-quadruplexes se forment in vivo, (ii) que l’hélicase Pif1 est impliquée dans leur déroulement, (iii) que leur persistance pathologique perturbe la réplication, (iv) que cette perturbation concerne uniquement le brin à synthèse continue, et (v) que cette perturbation créée un substrat recombinogène qui conduit à l’instabilité génomique de la séquence sous-jacente. En plus d’induire des réarrangements internes aux séquences répétées, les G-quadruplexes stimulent la formation de grands réarrangements chromosomiques associés à la perte de la partie terminale du chromosome (publication #4). En collaboration avec une équipe de biologie structurale qui détermine les structures tridimensionnelles de G-quadruplexes, j’étudie en détail la relation structure-fonction des G-quadruplexes à l’instabilité génomique. Ce travail a été réalisé dans l’organisme modèle S. cerevisiae. Le système expérimental repose sur la mesure de la stabilité de CEB1, une séquence répétée en tandem humaine de type minisatellite (motif unitaire compris entre 10 et 100 pb). Le motif de CEB1 forme un G-quadruplexe in vitro, efficacement déroulé par l’hélicase Pif1 purifiée. Dans un mutant déficient pour l’hélicase Pif1, CEB1 est fréquemment réarrangé (changement du nombre de motifs). Les réarrangements sont souvent complexes et leur formation dépend de la recombinaison homologue. La mutagénèse dirigé du motif de CEB1 m’a permis de montrer que cette instabilité dépendait de la présence de quelques nucléotides essentiels à la formation du G-quadruplexe in vitro (publication #1). Une seconde approche a consisté à traiter des cellules sauvages par Phen-DC3, un ligand spécifique des G-quadruplexes qui inhibe leur déroulement par l’hélicase Pif1 in vitro. Ce ligand induit spécifiquement l’instabilité du minisatellite CEB1, mais n’a pas d’effet sur le minisatellite CEB1 muté. Ces résultats montrent que les G-quadruplexes formés par CEB1, lorsque leur déroulement est inhibé en absence de Pif1 ou en présence du ligand Phen-DC3, conduisent à son réarrangement (publication #2). L’analyse par gel bidimensionnel des intermédiaires de réplication dans CEB1 a permis de montrer que cette instabilité survenait durant la réplication, principalement lorsque les G-quadruplexes étaient formés sur la matrice du brin à synthèse continue (publication #3). Cette étude fondamentale a permis (i) de démontrer que Les séquences capables de former un G-quadruplexe sont présentes au niveau des télomères et des promoteurs de nombreux oncogènes chez l’homme. De très nombreuses molécules spécifiques de ces structures in vitro ont été développées ces dernières années. Le système expérimental que j’ai développé devrait maintenant permettre d’identifier rapidement la spécificité de ces ligands pour des structures G-quadruplexes diverses dans un contexte cellulaire. ● Publications : Publication #1: Ribeyre C, Lopes J, Boulé JB, Piazza A, Guédin A, Zakian VA, Mergny JL, Nicolas A. (2009) « The yeast Pif1 helicase prevents genomic instability caused by G-quadruplexforming CEB1 sequences in vivo », PLoS Genetics, 5, e1000475. Publication #2: Piazza A, Boulé J-B, Lopès J, Mingo K, Largy E, TeuladeFichou M-P, Nicolas A (2010), « Genetic instability triggered by G-quadruplex interacting Phen-DC compounds in Saccharomyces cerevisiae », Nucleic Acids Research, 13, 4337-48. 44 45 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Rôle des lymphocytes T CD4 régulateurs dans la suppression des réponses immunitaires anti-tumorales PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Contrôle de l’homéostasie protéique par un nouveau complexe du reticulum endoplasmique RICHARD Magali POMMIER Arnaud INSTITUT COCHIN - PARIS Inserm U1016, CNRS UMR 8104 -Département Immunologie-Hématologie Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse tively depleting various immune populations, here, we show that Ly-6Chigh monocytes are potent anti-tumor effectors playing a key role in the development of vitiligo and in controlling tumor cell dissemination. Altogether, our data suggest that regulatory CD4 T cells are involved in dampening anti-tumor responses not only by suppressing conventional T cell responses, but also by inhibiting Ly-6Chigh monocytes through an IL-10 dependent mechanism. ● Little is known about the interactions between regulatory T cells and non-T cells in the context of cancer. To study the role of regulatory CD4 T cells in the suppression of anti-tumor responses, we used a model of spontaneous melanoma (MT/ret mice) in which the primary uveal tumor disseminates early, but remains dormant for several weeks. Then, MT/ret mice develop cutaneous metastases and finally distant metastases. Around one third of MT/ret mice develop a vitiligo associated with a delay in tumor progression. Interestingly, regulatory CD4 T cells are more frequent only in the tumor draining lymph nodes of MT/ ret mice without vitiligo and their depletion leads both to a critically increased development of vitiligo correlated to a significant decrease in metastases incidence. By selec- Publications : Ly6Chigh monocytes are potent anti-tumor effectors controlled by regulatory CD4 T cells. Soumis INSTITU DE BIOLOGIE DE L’ECOLE NORMALE SUPERIEURE - PARIS INSERM U1024 - Génétique et Neurobiologie de C. elegans Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse member of the ER Membrane protein Complex (EMC). This complex is composed of six conserved proteins. RNAi against EMC members causes developmental defects, resistance to levamisole and activation of stress reporters. These results suggest that EMC is required for ER homeostasis in metazoans, and especially for proper folding or assembly of AChR subunits. ● In C. elegans, levamisole activates acetylcholine receptors (AChRs) present at the neuromuscular junction causing death at high concentrations. In a screen for mutants partially resistant to levamisole, we identified one mutant allele of a previously uncharacterized gene, which we tentatively named emc-6. emc-6 encodes a small protein containing two predicted transmembrane domains. It is widely conserved from plant to human. EMC-6 is ubiquitously expressed and localizes to the endoplasmic reticulum. AChR expression is reduced by 80% in emc-6 mutants. Biochemical evidence suggests that EMC-6 is acting prior or during AChR assembly. Publications : ER assembly of AChR depends on a new complex essential for ER homeostasis. Magali Richard, Thomas Boulin, Janet Richmond, JeanLouis Bessereau Soumission à PNAS Juillet 2012 Recently, the yeast ortholog of EMC-6 was identified as a 46 47 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Nouvelles molécules perturbant la vascularisation tumorale: Synthèse, évaluation biologique et recherche de métabolites d’ analogues de la combrétastatine A-4. Toxines bactériennes ciblant les GTPases Rho et la voie cyclic-AMP : régulation du cytosquelette d’actine et conséquences sur la perméabilité vasculaire SOUSSI Mohamed Ali STEFANI Caroline FACULTE DE PHARMACIE DE L’UNIVERSITE PARIS XI - CHÂTENAY-MALABRY UMR 8076 Biocis - Laboratoire de Chimie thérapeutique Financement de la Fondation ARC : 1ère à 3ème années de thèse CENTRE MEDITERRANEEN DE MEDECINE MOLECULAIRE - NICE INSERM U1065 - Eqpe Toxines Microbiennes Relation Hôte Pathogènes Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse Dans cette communication, nous présentons nos travaux concernant l’étude in vitro du métabolisme de l’isoCA-4 en présence de microsomes hépatiques humains. Cette étude a permis d’identifier par HPLC et spectrométrie de masse 6 métabolites de phase I. La synthèse, la cytotoxicité et l’inhibition de la polymérisation de la tubuline de ces 6 métabolites sont rapportées. ● La combrétastatine A-4 (CA-4), molécule naturelle isolée d’un saule Sud-Africain, qui est caractérisée par un motif stilbène de géométrie Z, présente des activités cytotoxiques in vitro nanomolaires sur plusieurs lignées cellulaires cancéreuses humaines et inhibe la polymérisation de la tubuline en microtubules à des concentrations micromolaires. De plus, cette molécule qui détruit sélectivement la néovascularisation tumorale est actuellement en phase clinique III et est utilisée aux USA dans le traitement du cancer de la thyroïde. Publications : 1. Mohamed Ali Soussi, Silvio Aprile, Samir Messaoudi, Olivier Provot, Erika Del Grosso, Jérome Bignon, Joelle Dubois, Jean-Daniel Brion, Giorgio Grosa, and Mouad Alami.»The Metabolic Fate of isoCombretastatin A-4 in Human Liver Microsomes: Identification, Synthesis and Biological Evaluation of Metabolites», ChemMedChem 2011, 6, 1781–1788. 2. Mohamed Ali Soussi, Davide Audisio, Samir Messaoudi, Olivier Provot, Jean-Daniel Brion, and Mouâd Alami. «Palladium-Catalyzed Coupling of 3-Halo-Substituted Coumarins, Chromenes, and Quinolones with Various Nitrogen-Containing Nucleophiles», Eur. J. Org. Chem. 2011, 5077–5088. L’inconvénient majeur de cette molécule prometteuse est l’isomérisation partielle de la double liaison en stilbène E inactif en milieu biologique. Pour palier ce problème, des travaux au sein de notre laboratoire ont permis récemment d’identifier et d’évaluer l’isoCA-4, isomère non naturel de la CA-4. Ce composé stable et non isomérisable est constitué d’un motif 1,1-diaryléthylène et présente les mêmes activités biologiques que la CA-4. De récents travaux sur des souris xénogreffées avec des tumeurs humaines richement vascularisées ont montré le caractère antivasculaire de l’isoCA4. 48 bactériens que nous souhaitons apporter un éclairage nouveau dans la compréhension des mécanismes d’induction de perméabilité endothéliale médiés par le remaniement du cytosquelette d’actine. ● La néovascularisation des tumeurs et l’augmentation de perméabilité des vaisseaux tumoraux sont deux étapes critiques de la progression tumorale, contrôlée de façon clés par le cytosquelette d’actine. La perméabilité de l’endothélium est assurée par la formation de différentes structures intra- et intercellulaires. La contraction des cellules endothéliales, médiée par celle du cytosquelette d’actomyosine, permet l’ouverture de jonctions intercellulaires. La formation de larges pores transcellulaires (impliqués dans la transmigraton des leucocytes), de réseaux de tubules vésiculo-vaculaires (VVO) ou de fenestrae, entrainent quand à elles une perméabilité intracellulaire. Il est aussi de plus en plus clair que l’organisation et la dynamique du cytsoquelette d’actomyosine est sous le contrôle de voies de signalisation majeures que sont les voies des MAPK, des GTPases de la famille Rho ou du cyclic-AMP. Ces voies sont également la cible de bactéries pathogènes. C’est par l’étude de ces facteurs Publications : Co first (Maddugoda MP*, Stefani C*), Gonzalez-Rodriguez D, Saarikangas J, Torrino S, Janel S, Munro P, Doye A, Prodon F, Aurrand-Lions M, Goossens PL, Lafont F, Bassereau P, Lappalainen P, Brochard F, Lemichez E (2011). cAMP signaling by anthrax edema toxin induces transendothelial cell tunnels, which are resealed by MIM via Arp2/3-driven actin polymerization. Cell host and Microbe. Gonzalez-Rodriguez D, Maddugoda MP, Stefani C, Janel S, Lafont F, Cuvelier D, Lemichez E, Brochard-Wyart F (2012). Cellular Dewetting: Opening of Macroapertures in Endothelial Cells (2012). Physical Review Letters 49 PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Contrôle de la dynamique de réplication par Chk1 chez les mammifères. TECHER Hervé INSTITUT CURIE - PARIS CNRS UMR 3244 - Dynamique de l’information génétique : bases fondamentales et cancer Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse sion of p53R2, the DNA damage-induced subunit of the ribonucleotide reductase (RNR), in response to increased lesions arising spontaneously in such deficient cells. Our results thus identify a new pathway by which repair cross talks with replication when damage arises in S phase. ● In metazoan cells, inactivation or depletion of various proteins of the DNA damage response (DDR) slows replication forks and increases initiation density suggesting that a common mechanism modulates the replication dynamics in all cases. Here we show that Chk1 or Rad51 deficiency in mammalian cells limits DNA precursor availability, which slows fork movement and, consequently, increases initiation density. The activation of dormant origins relies solely on fork speed, independently of Chk1. We also show that fork slowing results from over-expres- Publications : DNA damage response perturbs replication dynamics via p53R2-dependent modulation of dNTP availability. Hervé Técher et al. Publication soumise. PRIX ALEXANDRE JOËL - Thèse Poster Identification des gènes régulés par les produits du gène de fusion TMPRSS2-ERG dans le cancer de la prostate TIAN Tian INSTITUT DE BIOLOGIE DE LILLE - LILLE CNRS UMR8161 - Eqpe Virus Cancer Transcription Financement de la Fondation ARC : 4ème année de thèse dans ces cellules. A partir des ARN d’échantillons humains de cancer de la prostate, nous avons établi une corrélation entre l’expression du gène OPN et celle de la fusion TMPRSS2-ERG de manière significative. Enfin, dans les tissus cancéreux prostatiques, l’immuno-marquage de l’OPN co-localise avec celui de TMPRSS2-ERG. Ces résultats suggèrent que l’OPN est un gène directement régulé par TMPRSS2-ERG dans le cancer de la prostate, et pourrait contribuer à la formation de la métastase osseuse. Issu de remaniements chromosomiques, le gène de fusion TMPRSS2-ERG a été identifié dans plus de 50% des cas de cancer de la prostate et est associé à un mauvais pronostic. Cette découverte a ouvert une nouvelle voie dans la compréhension du processus de cancérisation de la prostate. De manière intéressante, nous avons montré que le gène ERG, qui code pour un facteur de transcription membre de la famille ETS, est associé à la mise en place du cartilage et du squelette et joue donc un rôle dans la physiologie osseuse. Le cancer de la prostate, lorsqu’il évolue, est connu pour métastaser à l’os dans 80% des cas. Ces métastases sont essentiellement caractérisées par une formation anarchique de l’os, on parle de métastases ostéocondensantes voir mixtes (lytique/condensantes). L’implication de ERG dans le cancer de la prostate et dans la physiologie osseuse, nous a donc poussé à étudier l’implication du gène de fusion TMPRSS2-ERG dans la mise en place des métastases osseuses dérivées du cancer de la prostate. In vivo, ces lignées de cellules cancéreuses prostatiques, qui expriment stablement TMPRSS2-ERG, ont été injectées chez les souris SCID par la voie intra-tibiale afin d’étudier leur capacité à induire la formation de métastases osseuses. L’évaluation par rayons X des surfaces ostéolytiques et de l’ostéoformation ainsi que du volume osseux (BV/TV : Bone Volume/Tissu Volume) nous permettent de souligner une augmentation de la formation osseuse au niveau des métastases induites par les cellules qui expriment la fusion. Pour notre étude, nous avons établi des lignées de cellules cancéreuses prostatiques qui expriment stablement TMPRSS2-ERG, comprenant l’essentiel des domaines fonctionnels de la protéine ERG. Dans un premier temps, parmi les gènes cibles potentiels des facteurs ERG, nous avons étudié le gène de l’Ostéopontine (OPN) dont l’expression est associée au processus métastatique de nombreux cancers. Nos résultats ont montré que son expression est augmentée dans les cellules qui expriment stablement TMPRSS2-ERG. Des expériences d’immunoprécipitation de la chromatine ont montré la fixation spécifique de la protéine ERG sur le promoteur de l’OPN 50 En conclusion, nos résultats suggèrent l’existence d’une influence qualitative et quantitative de l’expression de la fusion TMPRSS2-ERG dans la formation des métastases osseuses dérivées du cancer de la prostate. ● Publications : Flajollet, S., Tian, T. V., Flourens, A., Tomavo, N., Villers, A., Bonnelye, E., Aubert, S., Leroy, X., and Duterque-Coquillaud, M. Abnormal expression of the ERG transcription factor in prostate cancer cells activates osteopontin. Mol Cancer Res 9, 914-924 (2011). 51 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Communication orale Identification de nouveaux facteurs angiocrines contrôlant positivement l’expansion des cellules souches des gliomes GALAN MOYA Eva Maria INSTITUT COCHIN - PARIS Department of Endocrinology, Metabolism and Cancer - Team: Vascular niche and tumor micro-environment Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) PRIX HÉLÈNE STARCK CATÉGORIE POST-DOCTORAT Communication orale / Poster INTRODUCTION: Glioblastoma multiforme are malignant primary tumors of the central nervous system that remain one of the most deadly cancers in adults. These tumors contain self-renewing cancer stem cells (GSC), which are believed to be responsible for the failure of current treatments by inducing angiogenesis, tumour invasion and establishing drug resistance. Thus, targeting GSC population may be interesting for the design of therapies to treat these brain tumours. GSCs are inextricably associated with the brain vasculature, being lodged within an endothelial structure that provides a specific and confined microenvironment, which is probably involved in the regulation of its renewal and fate (Galan-Moya and Gavard, Cell Cycle 2011). A study recently published by our group provides insights on how secreted factors from brain endothelium sustain the GSC population (Galan-Moya et al. EMBO Reports 2011). We show that the two mTOR complexes, mTORC1 and mTORC2, act as an obligatory gateway to maintain GSC expansion. Furthermore, the endothelial secretome sustains mTOR activity and GSC survival, and therefore targeting the communication between endothelial cells and GSC may be an effective therapeutic strategy for glioma. compared to differentiated cultures. Because mTOR is aberrantly active in glioma, phosphorylation of its effectors Akt and S6 were examined. Interestingly, only sphereforming cells exhibited basal activation of Akt and S6, while no signal was detected in differentiated cells. Thus, our data suggest that mTOR activation is lost upon differentiation. Hence, mTOR activation rather relies on environmental modifiers, such as non-adhesive cultures and presence of mitogens, than intrinsic properties. Next, to evaluate its contribution on GSC expansion, mTOR was pharmacologically inhibited at three different levels: mTOR complex 1 (rapamycin), mTOR kinase activity (PP242) and a dual action on PI3K and mTOR (PI103). All drugs significantly alter mTOR phosphorylation and downstream signalling in GSC as well as decrease Sox2-expressing neurospheres number and size, as well as cell viability. Hence, pharmacological inhibition of the mTOR pathway leads to a dramatic drop-off in the number of GSC. To firmly establish the role of the mTOR machinery in GSC maintenance, we knocked down mTOR expression by RNA interference, as well as its partners Rictor and Raptor. We observed that Akt and S6 activation were severely impaired in the absence of mTOR, while Rictor and Raptor silencing hampers only either Akt serine phosphorylation or S6 activation, respectively. Thus, signalling through Raptor and Rictor could still be independently blocked, suggesting that despite its constitutive activation, the mTOR axis is not aberrantly regulated in GSC. Interestingly, Sox2 expression is weakened when either mTOR, Rictor or Raptor are silenced. In addition, GSC expansion is severely diminished as monitored by secondary neurosphere formation and MTT. Altogether, our results suggest that the two mTOR complexes cooperate to maintain GSC properties and that their individual loss of function interferes with GSC survival. As previously mentioned, GSC reside within a specific and confined microenvironment orchestrated by a vascular unit. To further study this aspect, GSC were cultured on brain EC monolayer, using an in vitro model for the human PROJECT DESCRIPTION: Adult GBM contain a subpopulation of cells that retain the ability to expand ex vivo as neurospheres in mitogen-defined medium and share many characteristics with normal stem cells, including self-renewal ability and multipotent differentiation. Our group counts with four patient-derived GSC lines, which can efficiently form neurospheres while expressing neural stem cell markers: the transcription factor Sox2 and the intermediate filament protein Nestin. Upon differentiation assay by induction of cell adhesion and mitogen withdrawal, most cells express Tubulin βIII, a marker for neural lineage. We further investigated whether intrinsic signalling pathways are differentially regulated in growing neurospheres 53 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Communication orale CONCLUSIONS AND PERSPECTIVES: In summary, our study reinforces the emerging concept that brain vasculature supplies essential signals to maintain GSC identity. Altogether, our results unveil an active communication between endothelial cells and GSC, and support a model in which endothelial soluble factors uphold stemness. In this vital dialogue, the mTOR signalling nexus emerges as a central player. Therefore, altering the molecular transmission between endothelial cells and cancer stem cells may be an effective therapeutic strategy for tumour treatment. The identification and further characterization of the EC secreted factors will be necessary for the successful advance of this project. For that purpose the effect of each of these factors on GSC properties and survival will need to be studied. ● blood brain barrier. Surprisingly, in the absence of exogenous mitogens, GSC retained their identity, as evidenced by Sox2 expression and lack of morphological signs of differentiation. This suggests that EC could act as a feeding bed for GSC by providing the essential microenvironment that might recapitulate the vascular niche, at least at the level of GSC protection. To challenge the effects of the endothelial secretome, EC conditioned medium (CM) was used to culture GSC. Interestingly the growth of Sox2/ Nestin-expressing neurospheres persists in the presence of the EC secretome. Overall, our results support the idea of an informative transference between EC and GSC, whereby endothelial secreted factors could retain GSC properties. We next explored whether EC secretome might modulate the mTOR signalling nexus in GSC. Fascinatingly, activation of mTOR downstream effectors Akt and S6 are exclusively restored with endothelial. Supporting this, the use of mTOR inhibitors as well as siRNAs against the different component of the pathway halt endothelial-promoted secondary neurosphere formation and cell viability. Thus, the endothelial secretome might substitute for the additive mitogens contained in GSC culture media and sustain neurosphere integrity and mTOR activity. Publications : -”Semaphorin 3A elevates endothelial cell permeability through PP2A inactivation”. Le Guelte A, Galan-Moya EM, Dwyer J, Treps L, Kettler G, Hebda JK, Dubois S, Auffray C, Chneiweiss H, Bidere N, Gavard J. J Cell Sci. 2012 Jun 8. [Epub ahead of print] -”Differential proteomic analysis of human glioblastoma and neural stem cells reveals HDGF as a novel angiogenic secreted factor”. Thirant C, Galan-Moya EM, Dubois LG, Pinte S, Chafey P, Broussard C, Varlet P, Devaux B, Soncin F, Gavard J, Junier MP, Chneiweiss H. Stem Cells. 2012 May;30(5):845-53. doi: 10.1002/stem.1062. - “Secreted factors from brain endothelial cells maintain glioblastoma stem-like cell expansion through the mTOR pathway”. Galan-Moya EM, Le Guelte A, Fernandes EL, Thirant C, Dwyer J, Bidere N, Couraud PO, Scott MG, Junier MP, Chneiweiss H, Gavard J. EMBO Rep. 2011 May 1;12(5):470-6. Epub 2011 Apr 1. -”Feeding the hungry enemy: an endothelial recipe for glioma stem cells”. Galan-Moya, E.M. and Gavard J. Cell Cycle. 2011 Aug 1;10(15):2403-4. Epub 2011 Aug 1. More recently, in collaboration with the proteomic platform at the Cochin Institute, our group has identified several secreted factors and confirmed their essential role in the maintenance of the GSC phenotype, through the control exerted on the mTor pathway and the regulation of the expression of stemness markers, such as Nestin and Sox-2. Our preliminary results suggest that blocking either the endothelial production of these angiocrine factors or their cognate GSC receptor activation might be of interest to alter the endothelium/GSC dialogue, critical for the integrity of the GSC fraction, rendering glioblastoma more susceptible to conventional therapies (Galan-Moya et al. manuscript in preparation). 54 Isocitrate deshydrogénase et mutation Arg132His : impact pronostique et sur la réponse à la radio- et chimiothérapie LABUSSIERE Marianne INSTITUT DU CERVEAU ET DE LA MOELLE EPINIERE - PARIS CNRS UMR 7225 - INSERM U 975 Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) Description du projet Dans un premier temps, nous avons recherché la mutation du gène IDH1 sur une série de 1838 tumeurs cérébrales. Nos résultats montrent que la mutation de IDH1 n’est présente que dans les gliomes et que sa fréquence est liée au grade et au profil génétique de la tumeur. De façon intéressante, nous avons montré que les gliomes porteurs de la co délétion des chromosomes 1p19q (marqueur de chimiosensibilité) présentaient systématiquement soit la mutation de IDH1, soit une mutation de IDH2, isoforme mitochondriale de IDH1 (Labussiere, et al. Neurology 2010). Enfin, une analyse RPA (recursive partitioning analysis) nous a montré que la mutation de IDH1 est le facteur pronostique indépendant le plus puissant dans les gliomes (article soumis). La mutation IDH1 est quai exclusivement retrouvée dans les gliomes, elle revêt donc un impact diagnostique majeur. Pour la mise au point d’un test diagnostique, nos investigations ont porté sur la recherche de métabolites anormaux produit par l’enzyme mutante et sur la détection de la mutation dans les fluides biologiques. Des expérimentations en biochimie ont été menées en collaboration avec le Dr C. Ottolenghi du Service de Biochimie Métabolique de l’Hôpital Necker. Nous avons recherché le 2 hydroxyglutarate dans le plasma et dans les urines de patients atteints de gliomes. Nos résultats montrent que les patients dont le gliome est porteur de la mutation IDH1 ont un taux urinaire de 2 hydroxyglutarate significativement plus élevé que les patients atteints d’un gliome IDH1 non muté. En parallèle, nous avons mis au point une technique de biologie moléculaire, la COLD PCR HRM, permettant de détecter la mutation IDH1 dans un environnement très contaminé par de l’ADN normal. Nous avons montré que cette approche permettait de mettre en évidence la mutation IDH1 sur des prélèvements anatomopathologiques (berges de la cavité chirurgicale, biopsies non contributives) pour lesquelles l’observation histologique n’identifiait pas de cellules tumorales (Boisselier et al., Human Mutation 2011). Nous avons ensuite entrepris de recherche la mutation du gène IDH1 dans le plasma, afin de permettre le diagnostic à partir d’une simple prise de sang. Introduction Les gliomes sont les tumeurs cérébrales primitives les plus fréquentes et les plus graves. En dépit des progrès réalisés en imagerie, en neurochirurgie ainsi que dans les approches thérapeutiques, le pronostic des patients atteints de tumeurs cérébrales primitives reste très péjoratif : dans le cas des formes les plus graves (glioblastome), la survie médiane n’excède pas 15 mois. Tout récemment, un nouveau gène IDH1 codant pour l’isocitrate deshydrogénase 1 a été retrouvé fréquemment muté dans les gliomes. Les données rapportées dans la littérature suggèrent que la mutation d’IDH1 jouerait un rôle important dans la formation des tumeurs astrocytaires et oligodendrogliales. La mutation de IDH1 se traduit non seulement par une perte de la fonction enzymatique normale (transformation de l’isocitrate en α-ketoglutarate), mais également par un gain de fonction (transformation de l’α-ketoglutarate en 2 hydroxyglutarate). En outre, nous avons montré sur une série de plus de 400 gliomes que cette mutation récurrente Arg132His était très liée au grade histologique et au profil génétique, mais surtout qu’elle était corrélée à un meilleur pronostic. Outre sa valeur de marqueur pronostique, IDH1 revêt une importance fonctionnelle majeure dans la lutte contre le stress oxydatif. En effet, cette enzyme catalyse la carboxylation de l’isocitrate en α-ketoglutarate, conduisant à la génération de NADPH, cofacteur indispensable à la production cytosolique de glutathion réduit, composant anti-oxydant majeur. A ce titre, IDH1 pourrait être impliquée dans la réponse à la radio- et à la chimiothérapie en participant à la résistance à la mort cellulaire. Dans ce cadre, nos objectifs étaient de : 1. démontrer la valeur pronostique sur une très large série de gliomes, 2. élaborer un test simple rapide et reproductible permettant de détecter la présence de la mutation, 3. comparer d’abord in vitro puis in vivo la sensibilité de la forme mutée, par rapport à la forme non mutée, à la radiothérapie et à la chimiothérapie 55 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Communication orale intracellulaire. Des analyses transcriptomiques sont également en cours afin d’étudier les patrons d’expression des cellules tumorales porteuses de la mutation IDH1 par rapport à des cellules tumorales non mutées, dans des condition de normo- et d’hypoxie. Enfin, le rôle d’IDH1 dans la réponse au stress oxydant reste à préciser. Au final, la mutation de IDH1 a ouvert des perspectives à de multiples niveaux dans la compréhension des mécanismes conduisant à la formation des gliomes, ainsi que dans les mécanismes de réponse aux traitements. ● Nos données ont montré que la détection de la mutation IDH1 est possible au niveau plasmatique avec une sensibilité de 60% pour une spécificité de 100%, tous gliomes confondus (Boisselier et., Neurology 2012). Cette sensibilité atteint 71% pour les patients atteints de gliomes de haut grade. Ces travaux font l’objet d’une demande de brevet déposée auprès de l’office européen des brevets. Nous nous sommes ensuite concentrés sur la place de IDH1 dans la réponse aux traitements par radiochimiothérapie et chimiothérapie. Pour cela, nous avons transduit des cellules tumorales gliales humaines (lignée HTB14) avec des systèmes lentiviraux permettant une surexpression de la forme mutée d’IDH1. Nos résultats montrent qu’en conditions classiques de culture cellulaire, la mutation de IDH1 ne modifie pas la sensibilité des cellules tumorales aux traitements (témozolomide, carmustine, radiothérapie). En revanche, il semble qu’en condition d’hypoxie modérée (1% O2) les cellules porteuses de la mutation soient plus sensibles aux effets cytotoxiques de la radiothérapie. Nous tentons de confimer ces données sur des modèles in vivo de xénogreffes orthotopiques chez la souris nude. Enfin, nous avons démarré des premières investigations concernant la croissance des cellules porteuses de la mutation IDH1. Il semble que leur croissance soit fortement dépendante de la présence de glutamine dans le milieu de culture. Des investigations complémentaires sont en cours afin de mieux comprendre cet aspect. Publications : Wang XW, Boisselier B, Rossetto M, Marie Y,Idbaih A, Mokhtari K, Gousias K, Hoang-Xuan K, Delattre JY, Simon M, Labussière M, et al.»IDH1 rs11554137 impact on glioblastoma patients prognosis». Cancer 2012, submitted. Boisselier B, Gállego Pérez-Larraya J, Rossetto M, Labussière M,et al. «Detection of IDH1 mutation in the plasma of glioma patients». Neurology 2012, in press. Rossetto M, Ciccarino P, Boisselier B, Labussière M, et al. «Metabolism of glioma and IDH1/IDH2 mutations». Revue Neurol. 2011, 167 (10), 699-703. Ducray F, Idbaih A, Wang, XW, Cheneau C, Labussiere M et al. “Predictive and prognostic factors for gliomas”. Expert Rev Anticancer Ther. 2011, 11(5), 781-789. Desestret V, Ciccarino P, Ducray F, Crinière E, Boisselier B, Labussière M, et al. «Prognostic stratification of gliomatosis cerebri by IDH1 R132H and INA expression». Journal of Neuro Oncology. 2011, 105 (2), 219-224. Boisselier B, Marie Y, Labussière M, et al. «Cold-PCR HRM: a highly sensitive detection method for IDH1 mutation» Human Mutation 2010, 31 (12), 1360-1365. Labussière M, et al.»IDH1 gene mutations: a new paradigm in glioma prognosis and therapy?». The Oncologist 2010, 15(2), 196-199. Labussière M, et al. «IDH1/IDH2 is systematically mutated in 1p19q codeleted gliomas.» Neurology 2010, 74, 1886-1890. Labussière M, et al. «Prognostic markers in gliomas: a review» Future Oncology 2010, 6 (5), 733-739. Conclusion et perspectives Nos travaux ont montré que la mutation du gène IDH1 était un facteur pronostique de premier ordre dans les gliomes et permettaient de raffiner la classification histologique des gliomes. De plus, la mutation de IDH1 constitue un élément diagnostique de premier ordre. La mesure de l’accumulation de 2 hydroxyglutarate, ainsi que la détection de la mutation dans le plasma apparaisse aujourd’hui comme des outils diagnostiques prometteurs pour le suivi des patients atteints de gliomes. Il semble en outre que la mutation du gène IDH1 induise des modifications très importantes au niveau du métabolisme et de la signalisation Le rôle de Rpp30 (RNaseP protein 30) dans la formation de piRNAs et le contrôle d’éléments transposables pendant l’ovogenèse chez D.melanogaster: une relation inattendue entre les tRNAs et les piRNAs MOLLA HERMAN Anahi INSTITUT CURIE - PARIS INSERM U934, CNRS 3215 - Eq. Développement des cellules germinales. Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) [Clegg,NJ.97] nous a invités à savoir si Rpp30 pourrait être impliqué dans la formation des piRNAs et la régulation des éléments transposables. Rpp30 est une sous-unité du complexe RNase P, une ribozyme très conservé au cours de l’évolution dont la fonction principale connue est le clivage des pre-tRNAs pour former des tRNAs matures [Phizicky.EM et Hopper,AK.2012]. Ainsi, nous nous sommes intéressés à mieux comprendre la relation qui pouvait avoir entre la formation des tRNAs, des piRNAs, et la protection du génome dans la lignée germinale. Dans le laboratoire nous nous intéressons au développement des cellules germinales chez la drosophile, car il s’agit d’un modèle d’étude hautement compétitif et intéressant qui permet de développer la créativité scientifique et d’étudier toute sorte de question biologique. Les ovaires de drosophile sont constitués d’ovarioles, formées des chambres ovariennes issues des cellules souches germinales. Chaque chambre est constituée d’un ovocyte et de 15 cellules nourricières [Huynh,JR. 04]. L’ovocyte donnant l’organisme adulte après fécondation, il est très important de préserver le matériel génétique au sein de la lignée germinale. Dans ce processus, la voie ARN interférence (RNAi) joue un rôle principal, et son dysfonctionnement est lié à des processus cancéreux par de mécanismes mal compris [Esteller.M 2011]. Plusieurs composants de la voie RNAi se trouvent localisés autour des noyaux des cellules nourricières dans « le nuage » [Malone,CD.09]. Parmi les ARNs non codants (ncRNAs) qui y participent nous nous intéressons aux miRNAs, siRNAs et notamment aux piRNAs. Les piRNAs sont des ARNs qui répriment l’expression d’éléments transposables (ET, éléments génétiques «égoïstes» qui peuvent s’insérer dans le génome altérant l’expression génique). les piRNAs inhibent ces ET grâce à leur interaction avec les protéines PIWI [Malone,CD.09]. La formation des piRNAs à partir du transcrit primaire reste un mystère. En effet, il a été suggéré qu’un transcrit serait formé à partir de clusters de piRNAs, et que ce transcrit serait clivé par un facteur inconnu, formant les piRNAs primaires. Puis, ces piRNAs primaires seraient amplifiés au sein du «nuage» en formant les piRNAs secondaires [Senti,KA et Brennecke,J. 2010]. Grâce à des expériences de génétique et d’immunofluorescence, mes résultats ont permis de montrer que la mutation de Rpp30 entraîne un arrêt précoce de l’ovogenèse. Parallèlement, j’ai pu montrer que la mutation d’autres composants du complexe RNaseP provoque le même type d’arrêt. D’autre part, j’ai observé que la mutation de Rpp30 entraîne une altération des quelques composants du «nuage». En accord avec ces résultats, des analyses de séquençage à haut débit que nous faisons en collaboration avec C. Antoniewski (Jussieu) montrent que la population des piRNAs est très affectée dans notre mutant. De plus, ceci s’accompagne d’une dérégulation de certains retrotransposons et d’éléments transposables (ET) comme j’ai pu montrer par qRT-PCR (PCR quantitative). En effet, comme suggéré pour d’autres mutants de la voie des piRNAs, les ET peuvent s’insérer dans le génome et provoquer l’apparition de dommages à l’ADN et activer le « checkpoint » Chk2. De façon intéressante, la mutation de Chk2 dans notre mutant supprime l’arrêt de croissance dans l’ovogenèse et restaure le phénotype. En conclusion, nos résultats montrent que Rpp30 joue un rôle dans la formation des piRNAs et dans la régulation de certains éléments transposables dans la lignée germinale, ouvrant des nouvelles perspectives dans l’étude de la relation des tRNAs et piRNAs. Un crible génétique a été effectué au sein du laboratoire afin de trouver des nouveaux gènes impliqués dans l’ovogenèse précoce. Parmi eux, j’ai pu démontrer que Rpp30 est le gène affecté dans un des mutants, dont la mutation est responsable de la formation de femelle viables mais stériles, avec des ovaires très atrophiés. Sa ressemblance phénotypique avec un mutant de la voie des piRNAs 56 Ainsi, bien que le rôle principale de la RNase P est de cliver des pre-tRNA, Rpp30 pourrait également être responsable 57 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Communication orale Publications : -The ciliary pocket: a once-forgotten membrane domain at the base of cilia. Ghossoub R, Molla-Herman A, et al. Biol Cell. 2011 Mar;103(3):131-44. Review. -The AP-1 clathrin adaptor facilitates cilium formation and functions with RAB-8 in C. elegans ciliary membrane transport. Kaplan OI, Molla-Herman A et al. J Cell Sci. 2010 Nov 15;123(Pt 22):3966-77. Epub 2010 Oct 27. -The ciliary pocket: an endocytic membrane domain at the base of primary and motile cilia. Molla-Herman A et al. J Cell Sci. 2010 May 15;123(Pt 10):1785-95. Epub 2010 Apr 27. -Targeting of beta-arrestin2 to the centrosome and primary cilium: role in cell proliferation control. Molla-Herman A et al. PLoS One. 2008;3(11):e3728. Epub 2008 Nov 14. -Clinical, cellular, and neuropathological consequences of AP1S2 mutations: further delineation of a recognizable X-linked mental retardation syndrome. Molla-Herman A et al. Hum Mutat. 2008 Jul;29(7): 966-74. -Intracellular trafficking of CD23: differential regulation in humans and mice by both extracellular and intracellular exons. Montagnac G, Mollà-Herman A et al. J Immunol. 2005 May 1;174(9):5562-72 du clivage des transcrits primaires qui donnent les piRNAs primaires, pouvant être le facteur tant recherché par la communauté des ncRNAs. Ainsi, nous allons étudier par qRT-PCR si le transcrit primaire est accumulé dans notre mutant et nous allons étudier le processus de clivage des pre-tRNAs en tRNAs matures par Northern Blot. D’autre part, il a été montré très récemment que des tRNAs peuvent former des fragments de tRNAs (tRFs), auparavant considérés comme produits de dégradation. Cependant, ces tRFs peuvent se lier aux protéines PIWI et AGO pouvant jouer un rôle de piRNAs [Sobala,A. and Hutvagner,G.2011]. Ainsi, il est également possible que Rpp30 joue un rôle dans la formation de tRFs qui se comportent comme des piRNAs. Actuellement, nous étudions en détail les tRFs que nous retrouvons dans notre séquençage à haut débit et nos résultats préliminaires montrent qu’il y a une population de tRFs d’une taille similaire aux piRNAs qui disparait dans notre mutant. Finalement, il a été montré que les tRNAs servent des amorces pour le processus de retrotranscription en se liant à des séquences spécifiques de retrovirus comme le HIV et des retrotransposons [Li,Z.2012], ce qui suggère l’importance des tRFs dans la protection du génome d’éléments transposables et met en avant de nouvelles fonctions des ncRNAs, longtemps négligés et très en vogue actuellement. Enfin, grâce à l’aide de la fondation ARC je pourrai bientôt finir ces analyses et soumettre un article scientifique de qualité à un journal international de grande valeur, en aidant dans le futur à une meilleure compréhension du rôle des ncRNAs dans la protection du génome et les processus cancéreux. ● L’éducation des cellules Natural Killers par le récepteur activateur NKp46 calibre leur réactivité fonctionnelle anti-tumorale et anti-virale. NARNI-MANCINELLI Emilie CENTRE D’IMMUNOLOGIE DE MARSEILLE LUMINY - MARSEILLE UMR7280 - laboratoire Cellules Natural Killers et immunité innée Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) Introduction Le système immunitaire est classiquement divisé en 2 composantes : l’immunité innée et l’immunité adaptative. La première ligne de défense de l’organisme dite ‘naturelle’ ou ‘innée’ est essentielle au contrôle rapide d’un stress infectieux, physique ou encore chimique et n’est pas spécifique d’un antigène. La seconde ligne de défense dite ‘adaptative’ se met en place au bout de quelques jours et est spécifique des antigènes rencontrés. L’immunité adaptative est représentée par les lymphocytes T et B qui ont la capacité de garder en mémoire une primo-activation. Lors de leur réexposition à l’agent ayant causé ce stress, les lymphocytes mémoires se réactivent et contrôlent très rapidement l’agression ce qui a pour conséquence de limiter la gravité des symptômes ainsi que leur durée. C’est cette propriété du système immunitaire que nous cherchons à exploiter par la vaccination. les molécules du complexe majeur d’histocompatibilité de classe I (CMH-I) qui sont constitutivement exprimées par les tissus sains mais dont l’expression peut être diminuée à la suite du stress causé par l’infection ou à cause de l’agent infectieux lui-même. Cette réduction du nombre des molécules du CMH-I diminue les signaux inhibiteurs délivrés aux cellules NK les rendant plus sensibles à l’activation. Celle-ci est la conséquence de l’engagement des récepteurs activateurs comme les Killer cell immunoglobuline-like receptors (KIR) activateurs (KIR-S) chez l’homme et les récepteurs Ly49 chez la souris, les récepteurs NKG2D et CD16 et la famille des natural cytotoxicity receptors NKp46, NKp30 et NKp44. Afin de mieux comprendre la régulation de la réactivité des cellules NK, nous avons cherché à générer des souris mutantes qui présentent des défauts d’activation des cellules NK. Pour cela, nous avons induit des mutations de manière aléatoire à la suite de l’injection dans des souris d’un agent mutagène chimique, le N-nitroso-N-éthylurée (ENU), à la suite d’une collaboration initialement mise en place avec le groupe de Bruce Beutler. Les cellules Natural Killers sont aussi des lymphocytes mais sont généralement considérés comme des composants du système immunitaire inné parce qu’ils n’expriment pas de récepteurs spécifiques à un antigène. Bien que le nombre de cas de déficience NK chez l’homme soit extrêmement faible, les cellules NK ont été montrées, chez l’homme et chez la souris, comme étant des acteurs majeurs de la lutte précoce contre des infections virales - et notamment des infections par des virus de la famille des herpesvirus - et de l’immunosurveillance tumorale. Résultats Nous avons identifié une souris, appelée Noé, chez laquelle les cellules NK sont plus réactives face à des cellules tumorales in vitro. Ce phénotype est intrinsèque aux cellules NK de la souris Noé et nous avons montré que l’hyperréactivité de ces cellules permet une meilleure résistance des souris lors d’infections virales. Le séquençage du génome complet de la souris Noé a révélé une mutation dans le gène codant pour le récepteur NKp46. Cette mutation prévient l’expression de NKp46 à la surface des cellules. Comme NKp46 était décrit comme étant un récepteur activateur des cellules NK matures chez l’homme et chez la souris, il était surprenant d’observer que l’absence d’expression d’un récepteur activateur à la surface des cellules NK puisse être responsable de leur hyperréactivité. Cependant, grâce à une complémentation génétique des souris Noé par un transgène NKp46 humain, nous avons Les cellules NK reconnaissent les cellules stressées et/ou infectées et elles les éliminent grâce à des activités effectrices cytolytiques. Les cellules NK sécrètent également des cytokines et participent à l’élaboration des réponses immunitaires adaptatives. L’activation des cellules NK doit donc être strictement régulée afin que ces cellules soient efficaces sans être dangereuses pour l’hôte. Les cellules NK reconnaissent leurs cibles grâce à un système de détection composé de récepteurs inhibiteurs et activateurs. Les récepteurs inhibiteurs des cellules NK interagissent avec 58 59 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Communication orale la conception de nouveaux traitements thérapeutiques anti-tumoraux avec un intérêt particulier pour les patients présentant des déficiences en lymphocytes T, tels que les patients qui subissent une greffe de cellules souches hématopoïétiques ou une chimiothérapie anticancéreuse. pu formellement démontrer que l’expression de NKp46 est nécessaire à la calibration du seuil de réactivité des cellules NK. Nous avons ensuite montré que cette régulation s’opère par l’intermédiaire de la baisse d’expression de Helios, un facteur de transcription de la famille Ikaros connue pour réguler le seuil de réactivité des lymphocytes T et B. La régulation de l’expression de Helios par le récepteur activateur NKp46 n’est pas sans rappeler la régulation des facteurs de transcription de la famille Ikaros par le prérécepteur T et B, suggérant que le lignage lymphoïde utilise des mécanismes similaires pour assurer sa différentiation (discuté dans Narni-Mancinelli et al., Int Immunol., 2011). Nous avons ensuite mis en évidence que la régulation de l’activité des cellules NK est cruciale pour le développement ultérieur de la réponse adaptative antimicrobienne primaire et la génération de lymphocytes mémoires protecteurs. Enfin, nous avons montré que l’injection d’anticorps bloquant anti-NKp46 chez des souris sauvages au cours du développement des cellules NK permet de mimer le phénotype des cellules NK des souris Noé. Ainsi, nous arrivons à programmer des cellules NK qui sont hyperréactives contre des cellules tumorales in vitro. Ces travaux ont fait l’objet d’une publication dans Science (Narni-Mancinelli et al., Science, 2012) ainsi que d’un brevet. Afin d’être en mesure d’exploiter le pouvoir fonctionnel des cellules NK, nous allons également cherché à identifier le(s) ligand(s) de NKp46 exprimé(s) par des cellules en réponse au stress, caractériser l’activité fonctionnelle des cellules NK activées à la suite de l’engagement de NKp46 et évaluer le rôle de cette réponse effectrice dans l’immunité. Nous pensons que les réponses à ces questions constituent un enjeu majeur pour notre compréhension du rôle biologique des cellules NK et pour la conception rationnelle de nouvelles thérapies. ● Publications : E. Narni-Mancinelli, BN. Jaeger, C. Bernat, A. Fenis, S. Kung, A. De Gassart, S. Mahmood, M. Gut, S. Heath, J. Estellé, E. Bertosio, F. Vély, L. Gastinel, B. Beutler, B. Malissen, M. Malissen, I. Gut, E. Vivier and S. Ugolini. Tuning of Natural Killer Cell Reactivity by NKp46 and Helios Calibrates T Cell Responses. 2012. Science. 335(6066):344-8. E. Narni-Mancinelli, S. Ugolini and E. Vivier. NKp46-mediated NK cell tuning. Patent Number 61/499,485. E. Narni-Mancinelli, E. Vivier, YM. Kerdiles. The ‘T-cellness’ of NK cells: unexpected similarities between NK cells and T cells. 2011. Int Immunol. 23(7):427. Perspectives Ces résultats, à priori contre intuitifs, ouvrent la voie pour Identification d’une nouvelle voie de signalisation aPKC-Cortactine-MT1-MMP requise à l’invasion tumorale dans les cancers du sein ROSSE Carine INSTITUT CURIE - PARIS CNRS UMR 144 - Laboratoire de la Dynamique du Cytosquelette et de la Membrane Financement de la Fondation ARC : 2ème Post-doctorat en France (retour) perdent leur architecture polarisée de type apico-basale, deviennent moins adhérentes et acquièrent des capacités migratoires plus importantes. La polarisation cellulaire nécessite la distribution asymétrique de molécules de signalisation, de l’adhérence cellulaire et du cytosquelette ainsi que du trafic membranaire. Parmi les protéines essentielles à la polarité, les kinases C atypiques (aPKC) sont localisées au niveau des jonctions serrées des cellules épithéliales ainsi qu’au front de migration des cellules migrantes, tout comme le complexe exocyste. Les aPKC, PKC zêta et PKC iota, sont des sérine/thréonine kinases qui, contrairement aux autres PKCs, ne sont régulées ni par le diacylglycérol ni par le calcium. De manière notable, PKC iota est oncogénique et surexprimée dans de nombreux cancers dont les cancers du sein. Les cellules cancéreuses ont la capacité de proliférer de manière non contrôlée formant ainsi une tumeur primaire. Mais elles sont également capables d’envahir et ainsi métastaser des organes distants. La formation de métastases est responsable de 90% de la mortalité due aux cancers. La formation de métastases issues de carcinomes requiert tout d’abord une transition épithéliale mésenchymateuse, puis l’invasion des cellules tumorales et enfin l’intravasation de celles-ci qui vont disséminer dans le sang ou la lymphe pour aller coloniser des organes distants. L’invasion tumorale nécessite à la fois la destruction de la membrane basale et la migration des cellules cancéreuses. Les cellules tumorales invasives développent des protrusions membranaires, appelées invadopodes, pour pénétrer la matrice extracellulaire et la remodeler. La dégradation de la matrice associée à ces structures est assurée par des métalloprotéases de la matrice, qui sont membranaires comme MT1-MMP (« membrane type 1 metalloprotease ») ou sécrétées, comme MMP2 ou MMP9. Lors de l’invasion, ces protéases sont délivrées et/ou activées au niveau de l’invadopode. La métalloprotéase clé de ce processus est MT1-MMP : elle est surexprimée dans de nombreux cancers, notamment dans les cancers du sein et est requise pour la dégradation du collagène interstitiel et l’invasion tumorale in vivo. MT1-MMP est internalisée par endocytose puis recyclée pour être délivrée vers l’invadopode grâce à l’intervention d’une machinerie d’exocytose complexe comprenant entre autre le complexe exocyste servant au processus d’arrimage des vésicules de transport de MT1MMP avec la membrane plasmique. Au cours d’un précédent stage postdoctoral à Londres, j’avais montré que l’exocyste était requis pour la migration cellulaire grâce à son interaction avec les aPKCs. Du fait de l’implication de l’exocyste dans le transport de MT1MMP vers l’invadopode et de son interaction avec aPKC, nous avons postulé un rôle des aPKCs dans le trafic de MT1-MMP dans les cellules cancéreuses. En utilisant la lignée de cellules d’adénocarcinome mammaire MDA-MB-231, j’ai premièrement montré que les aPKCs sont nécessaires à la dégradation de la matrice extracellulaire et à l’invasion des cellules tumorales dans des matrices extracellulaires reconstituées (collagène de type I et du matrigel), deux processus dépendant de MT1MMP. J’ai également observé une association de PKCiota avec les endosomes tardifs contenant la majorité du pool intracellulaire de MT1-MMP dont elle contrôle la vitesse de déplacement et l’adressage à la membrane plasmique.’ai également mis en évidence une association de l’actine, de la cortactine (protéine liant l’actine et nécessaire à l’invasion tumorale et à la formation des invadopodes) et du complexe nucléateur de l’actine Arp2/3 au niveau de microdomaines sur la face cytoplasmique des endosomes La perte de la polarité cellulaire est une des signatures des cellules cancéreuses. Elle est corrélée avec « l’agressivité » de la tumeur et la capacité invasive des cellules cancéreuses. Les cellules tumorales d’origine épithéliales (carcinomes) peuvent s’engager dans une transition épithélio-mésenchymateuse au cours de laquelle elles 60 61 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Communication orale raux de patientes traitées à l’Inst. Curie, nous avons observé une augmentation de l’expression de aPKC iota dans des tumeurs et sa relocalisation dans des structures cytoplasmiques granulaires, similaire à l’association d’aPKC iota avec les endosomes MT1-MMP dans les cellules MDAMB-231. De plus, cette relocalisation est corrélée avec le grade tumoral. MT1-MMP. J’ai observé une colocalisation entre la GTPase rab7 et la cortactine au niveau de ces domaines, coïncidant avec la formation d’extensions tubulaires dynamiques des endosomes impliquées dans le trafic de MT1-MMP. J’ai montré que la scission des tubules MT1-MMP/rab7 est dépendante de l’interaction entre la cortactine et la dynamine2 (protéine nécessaire à la scission membranaire). Ces résultats démontrent que la cortactine, l’actine et la dynamine-2 associées aux endosomes tardifs, permettent la génération d’intermédiaires de transport requis lors de l’invasion tumorale.Dans le but de préciser le rôle de aPKC dans le transport de MT1-MMP, j’ai identifié la cortactine comme étant un substrat des kinases aPKCs et j’ai montré que l’inhibition des aPKCs entraine une accumulation des domaines de cortactine sur les endosomes MT1-MMP/ rab7. Dans ces conditions, la cortactine est hypophosphorylée et son interaction avec la dynamine-2 est inhibée ce qui entraine un défaut de scission des tubules MT1-MMP. Par conséquent, un défaut d’activité de aPKC s’accompagne de l’inhibition du transport de MT1-MMP aux invadopodes, entraînant une diminution de l’invasion tumorale. Ce travail, qui implique pour la première fois les aPKCs dans le contrôle du trafic membranaire d’une protéine clé de l’invasion, caractérise une nouvelle voie de signalisation « maléfique » dans les tumeurs du sein. De plus cette étude permet de proposer la cortactine et la phopsho-cortactine comme de nouveaux bio-marqueurs et identifie les aPKC comme de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles dans les tumeurs du sein qui constituent une des causes majeures de mortalité par cancer chez la femme. ● Publications : Rossé C, Irondelle M, Monteiro P, Lagoutte E, Sengmanivong L, Paul-Gilloteaux P, Linch M, Bièche I, Peter Parker P and Chavrier P *. (2012) Breast tumor cell invasion requires formation of MT1-MMP transport intermediates from late endosomes by atypical PKC. Dev Cell. Manuscript en révision. Monteiro P, Hertzog M, Rossé C, Desnos C, Zech T, Formstecher E, Darchen F, Machesky L, GautreauA and Chavrier P (2012) Coordinated function of WASH and exocyst complex underlies the mechanism of invadopodial matrix degradation by tumor cells Nat Cell Biol. Manuscript soumis. Awadelkarim KD, Callens C, Rossé C, Susini A, Vacher S, Rouleau E, Lidereau R, Bièche I. (2012) Quantification of PKC gene family in sporadic breast cancer by qRTPCR assays: Evidence that PKCι/λ overexpression is an independent prognostic factor. Int J Cancer. Papier sous presse. Nous nous sommes ensuite intéressés aux rôles des aPKCs dans les carcinomes mammaires, un des cancers majoritaires chez la femme. En collaboration avec le Dr I. Bièche (Inst. Curie, Hôpital R. Huguenin, St Cloud), nous avons mis en évidence une surexpression des ARNm de PKC zêta et iota dans les tumeurs du sein, et avons observé une forte corrélation positive entre la surexpression de PKC iota et de MT1-MMP à partir d’une collection de 450 tumeurs mammaires. De plus, en nous basant sur les données cliniques de ces patientes nous avons pu établir que la surexpression concomitante de MT1-MMP et aPKC iota constitue un facteur de mauvais pronostique. En collaboration avec le Dr Anne Vincent-Salomon (Inst. Curie, Service d’anatomo-pathologie), nous avons mis en évidence une localisation apicale de aPKCi dans les acini de tissus mammaires normaux. A partir d’échantillons tumo- 62 Plasticité cellulaire et le cancer: le rôle d’une déméthylase histone lors d’un événement reprogrammation cellulaire et l’identification de modificateurs de son activité ZURYN Steven INSTITUT DE GENETIQUE ET DE BIOLOGIE MOLECULAIRE ET CELLULAIRE - STRASBOURG CNRS UMR 7104 - INSERM U 964 - Eqpe Mécanismes Cellulaires Moléculaires Différenciation Système Nerveux Financement de la Fondation ARC : 2ème Post-doctorat en France (retour) findings suggest may stem from their ability to be play a key role in defining and altering cell identity. To further dissect the role these factors play in Y-to-PDA conversion we studied their subcelluar localisations within the changing cell and found that JMJD3 is temporally controlled in a manner that regulates its interaction with the MLL complex. Our results so far suggest that cells maintain an inherent flexibility in cell fate that can moulded by the combined activity of JMJD3 and the MLL complex, which when mutated, as what occurs in many cancers, can go awry. ● Transdifferentiation – conversion of one cell fate to another – either in a normal context (development), a pathological context (cancer initiation), or in an artificial environment (cell reprogramming) is fascinating because it necessitates the shutting down of one cell-type genetic program and uptake of a new program. This dynamic reorganisation of gene expression suggests that active epigenetic reprogramming is critical. Little is known about how this occurs, or what enzymes might mediate the process. We report at the single-cell level that transdifferentiation requires a highly orchestrated interaction of multiple modulators of histone demethylation and methylation. We isolated mutations in the conserved Jumonji domain containing JMJD3 (H3K27 demethylase) in a forward genetic screen in C. elegans where a stereotypical transdifferentiation event – conversion of the Y cell (epithelial) into PDA (a motoneuron) – was blocked. We firstly confirmed that JMJD3 lysine demethylase activity was responsible for this function and then subsequently conducted an RNAi screen to identify other histone modifying enzymes that may work alongside JMJD3 to convert Y into PDA. We identified the Mixed Linegage Lukemia (MLL) complex (H3K4 methyltransferase) as a parallel co-mediator of transdifferentaion, suggesting that multiple histone modifiers combine to elicit cellular identity changes. Interestingly, JMJD3 and the MLL complex have well described roles in cancer, which our Publications : Richard, J.*, Zuryn, S*., Fischer, N., Pavet, V., Vaucamps, N., Jarriault, S. (2011). Direct in vivo reprogramming involves transition through discrete, non-pluripotent steps. Development. 138(8):1483-92. (*Co-first). Faculty of 1000 Recommended. Zuryn, S., Daniele, T., Jarriault, S. (2012). Direct cellular reprogramming in C. elegans: facts, models and promises for regenerative medicine. Wiley Interdiscip Rev Dev Biol. 1(1):138-152. Review. Zuryn, S., Jarriault, S. (2012). Deep Sequencing Strategies for Identifying Mutations from Genetic Screens. Invited Review, Worm (In preparation). 63 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Communication orale Caractérisation des modifications épigénétiques du chromosome X dans les différents types moléculaires de cancers du sein et de lignées cellulaires de cancers du sein CHALIGNÉ Ronan INSTITUT CURIE - PARIS UMR3215 / U934 -Equipe Génétique Développement Cancer Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) l’expression de plusieurs gènes candidats. Nous espérons à terme pouvoir définir des signatures spécifiques des anomalies de chaque sous-type de cancer du sein et peutêtre proposer ainsi un nouvel outil diagnostique ou prognostique. ● Salomon). Nous aimerions définir des « signatures épigénétiques du Xi » qui seraient, soit communes, soit spécifiques à chacun des sous-types moléculaires des cancers du sein. Nous allons par conséquent tester au niveau unicellulaire (RNA/DNA FISH sur tumeurs primaires) et aussi plus global (RNA-seq sur xénogreffe) some X (combinaison d’une approche pan chromosome X et gène candidat) révèle que, même si le Xi reste globalement éteint, certains gènes montrent une réexpression anormale (i.e. bi-allélique) à partir du Xi dans les lignées cellulaires tumorales par rapport aux cellules normales. De plus, par immuno-précipition chromatinienne et analyse de la méthylation des promoteurs des gènes qui échappent à l’inactivation dans un contexte tumoral, nous avons montré qu’il semble que ces gènes présentent une signature chromatienne particulière avec une absence de méthylation de l’ADN, une déplétion en H3K27me3 et un enrichissement de H3Ac au niveau de leur région promotrice. Ceci est cohérent avec le fait que plusieurs mécanismes épigénétiques agissent en synergie pour maintenir le Xi dans un état transcriptionnel inactif et que par conséquent la déstabilisation de plusieurs de ces mécanismes est nécessaire à la réexpression de gènes présents sur le Xi. Grace à des techniques d’hybridation in situ (RNA/DNA FISH), nous avons pu étudier, au niveau unicellulaire, l’expression à partir du Xi de gènes échappant à l’inactivation dans les lignées tumorales. Par cette approche, certains gènes ré-exprimés dans les lignées cellulaires ont également été retrouvés anormalement réactivés dans des xénogreffes de tumeurs du sein et des tumeurs primaires (provenant de cryosections et d’empreintes de tumeurs issue d’exérèse chirurgicale). Ce travail en cours de publication (Chaligné et al, en préparation) montre donc que le chromosome Xi est « épigénétiquement » perturbé dans certains cancers du sein et que ces changements peuvent être à l’origine de l’expression anormale de certains gènes à partir du Xi. Un premier travail réalisé dans mon unité d’accueil a montré l’existence d’une hétérogénéité importante du statut du chromosome X inactif, à un niveau intra- et inter-tumoral dans une série de cancer basal-like apparus dans un contexte de mutation du gène BRCA1 et dans certains carcinomes sporadiques utilisés alors comme contrôles (Vincent-Salomon, Ganem-Elbaz et al., Cancer Research, 2007). Suite à ce travail, le but initial de mon projet était d’étudier de manière systématique l’état épigénétique du chromosome X dans les différents types moléculaires et histologiques de carcinomes mammaires. Nous avons donc analysé au cours de ce travail des marques épigénétiques du chromosome X ainsi que son organisation nucléaire. Nous nous sommes tout d’abord concentrés sur des modèles de lignées cellulaires de cancer du sein pour évaluer l’instabilité épigénétique du Xi via son organisation nucléaire (recouvrement par l’ARN non codant XIST, statut chromatinien). Dans des lignées cellulaires que nous avons choisies pour représenter la diversité des types moléculaires les plus fréquents (ie ZR-75-1 : Luminal; SK-BR-3: HER2+ et MDA-MB-436: Basal-like), il apparait que le Xi a une organisation nucléaire perturbée (comportement anormal de plusieurs marques chromatiniennes tel que H3K27me3, H3K9Ac et H4AC ainsi qu’une disparition partielle de la région DAPI dense que l’on nomme « Corpuscule de Barr »). A l’inverse, certaines marques chromatiniennes, tel que H3K4me2, apparaissent mieux régulées au niveau du Xi. Enfin, le compartiment transcriptionnellement inactif que représente le Xi se caractérise dans les cellules somatiques normales par une absence d’expression des séquences génomiques répétées (Cot1) et une absence de l’ARNpol II. Par IF/RNAFISH, nous avons pu observer une désorganisation de cette structure dans les cellules tumorales avec un défaut de déplétion de Cot1 et de l’ARNpolII. La première partie de notre travail a donc montré que l’organisation du Xi est perturbée dans les cellules tumorales. Nous avons ensuite étudié l’impact de cette désorganisation sur le statut transcriptionnel du Xi. L’analyse transcriptionnelle allèle spécifique du chromo- Notre but initial était d’utiliser le Xi comme sentinelle de l’instabilité épigénétique dans le cancer du sein. Nous avons identifié plusieurs dérégulations épigénétiques du Xi dans des lignées cellulaires. Maintenant, nous souhaitons étendre notre étude à un grand nombre de tumeurs du sein qui sont disponibles grâce à notre collaboration avec l’hôpital (et particulièrement le Dr Anne Vincent- 64 65 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster Etude de la participation d’une voie alternative de réparation de l’ADN dans les processus de déméthylation de l’ADN chez l’homme: interconnexions entre les mécanismes de régulation épigénétique, de réparation de l’ADN et de cancérogenèse GRIN Inga INSTITUT GUSTAVE ROUSSY - VILLEJUIF UMR 8200 CNRS - Unité Stabilité Génétique Oncogenèse Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) Comparison of protein concentrations dependence and time course kinetics of hTDG, MBD4 and MBD4cat on 5hmU•G showed that hTDG is more efficient than MBD4 enzyme. Overall, these results show that MBD4 does not act on 5fC and 5caC residues but can excise 5hmU with good efficiency. MBD4 and MBD4cat proteins can remove 5hmU when opposite to G with good efficiency. Importantly, all tested enzymes were more efficient on 5hmU•G than on T•G duplexes (about 1.5 fold for MBD4s and 6 fold for hTDG) suggesting that MBD4 and hTDG act more specifically on 5hmU bases. Next, we investigated whether 5hmU, 5caC and 5fC residues are also substrates for the previously characterized bacterial and human DNA glycosylases. All three human DNA glycosylases: TDG, MBD4 and SMUG1 excise 5hmU with good efficiency when it present in duplex DNA but only SMUG1 was able to excise 5hmU in single-stranded form. In addition, the human homolog of bacterial Nei, NEIL1 can excise, although with weak efficiency, 5hmU residue in duplex DNA. No detectable activity on 5hmU-containing DNA substrates was observed for hUNG2, hNTH1, ANPG70, hOGG1, NEIL2 glycosylases. Importantly, DNA repair activities of bacterial and human enzymes on 5fC containing oligonucleotides mimic those on 5caC. These results indicate that hTDG is a main human enzyme removing carboxylated and formylated cytosines and confirms previous findings by other laboratories [2-3]. The hUNG2, hNTH1, ANPG70, hOGG1, NEIL2 and hSMUG1 glycosylases have no detectable activity on 5caC and 5fC substrates, whereas MBD4 and NEIL1 exhibited very weak activity on 5caC substrates. Changes in DNA methylation patterns are generally associated with epigenetic changes in human cancers. Many human cancers commonly exhibit global DNA hypomethylation concomitant with specific hypermethylation of tumor-suppressor genes. Understanding dynamics of DNA methylation in during development and cancerogenesis requires studies of DNA demethylation processes. Active DNA demethylation in mammals occurs via hydroxylation of 5-methylcytosine (5mC) to 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) by the Ten-eleven translocation family of proteins (TETs). 5hmC residues in DNA can be further oxidized by TETs to 5-carboxylcytosines and/or deaminated by the AID/APOBEC family proteins to 5-hydroxymethyluracil (5hmU). The fact that 5hmU residues are intermediates of active DNA demethylation that is produced enzymatically by combined action of TETs and AID/APOBEC proteins implies that 5hmU may be generated at significant amount in the cells during reprogramming and cancerogenesis. Excision and replacement of these intermediates is initiated by DNA glycosylases such as thymine-DNA glycosylase (TDG), methyl-binding domain protein 4 (MBD4) and single-strand specific monofunctional uracilDNA glycosylase 1 (SMUG1) in the base excision repair (BER) pathway. In mammalian cells, both mismatch-specific thymine-DNA glycosylase (TDG) and methyl-binding domain protein 4 (MBD4/MED1) prevent mutagenic impact of 5mC deamination by excising thymine from T•G mispairs that is replaced by cytosine in the base excision repair (BER) pathway [1], suggesting a potential link between post-replication repair, apoptosis and DNA methylation. In our work, we report detailed biochemical and structural characterization of human MBD4 which contains mismatch-specific thymine-DNA glycosylase activity. reprogramming processes during cell differentiation and carcinogenesis may lead to identification of the genetic factors associated with cancer and therefore contribute to development of new prevention and therapeutic strategies. ● lar to AlkA and OGG1 and that the conserved amino acid D534 is a putative catalytic residue [4]. To examine the role of the corresponding catalytic D560 residue in human MBD4 protein, we obtained mutant MBD4catD560A and characterized its DNA glycosylase activity. As expected, MBD4catD560A exhibits a drastic, more than 50 fold, decrease in excision rate of 5hmU residue in 5hmU•G duplex as compared to the wild type MBD4cat protein suggesting that D560 is indeed essential for catalytic activity and that this inactive mutant protein can be used to obtain complex with DNA substrate. REFERENCES 1. Cortazar, D., et al., The enigmatic thymine DNA glycosylase. DNA Repair (Amst), 2007. 6(4): p. 489-504. 2. He, Y.F., et al., Tet-mediated formation of 5-carboxylcytosine and its excision by TDG in mammalian DNA. Science, 2011. 333(6047): p. 1303-7. 3. Maiti, A. and A.C. Drohat, Thymine DNA glycosylase can rapidly excise 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine: potential implications for active demethylation of CpG sites. J. Biol. Chem., 2011. 286(41): p. 35334-8. 4. Wu, P., et al., Mismatch repair in methylated DNA. Structure and activity of the mismatch-specific thymine glycosylase domain of methyl-CpG-binding protein MBD4. J. Biol. Chem., 2003. 278(7): p. 5285-91. These findings suggest a new unexpected role of the mismatch-specific thymine/uracil DNA glycosylases in the control of epigenetic information via removal of oxidation/deamination products of 5mC. In the present study, we characterized and compared substrate specificities of hTDG and MBD4 proteins and obtained high resolution crystal structures of the catalytic domain of MBD4 (MBD4cat) in complex with duplex DNA containing T or 5hmU base lesions. Finally, the current crystal structures can be used as a template to develop inhibitors of MBD4cat in the context of the active DNA demethylation process in human cells. In conclusion, using integrated approaches we aim to decipher and characterize at the molecular level mechanisms involved in the active DNA demethylation in human cells. Mechanistic understanding of the epigenetic Publications: Moréra, S., Grin, I., Vigouroux, A., Couvé, S., Henriot, V., Saparbaev, M., Ishchenko, A. A. (2012) Biochemical and structural characterization of the glycosylase domain of MBD4 bound to thymine and 5-hydroxymethyuracil (5hmU)-containing DNA. Nucleic Acids Res. (soumises) In order to get insight into the structural bases of substrate specificity and catalytic mechanism of human MBD4, we performed crystallographic studies of MBD4cat complexed with its DNA substrates. For this purpose, a catalytically inactive MBD4cat mutant has been generated. Previous studies of the crystal structure of the C-terminal domain of murine MBD4 revealed that it is a member of the helix-hairpin-helix DNA glycosylase superfamily simi- At first, we characterized substrate specificity of human full-length MBD4 as well as of it’s catalytic domain (residues 426-580) (MBD4cat) and hTDG proteins by measuring the cleavage rates of 5hmU•G and T•G duplexes. 66 67 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster Rôle des altérations du locus PTEN dans l’instabilité génétique du cancer du sein. Etude par CGH array haute résolution sur puce dédiée. JONES Natalie INSTITUT BERGONIE - BORDEAUX INSERM U916 - Validation et Identification de Nouvelles Cibles en Oncologie (VINCO) Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) tumeurs. Le faible taux de mutation ponctuelle détectée est en accord avec la littérature. Les délétions du gène PTEN sont plus fréquentes dans le cancer du sein et un criblage des réarrangements de grande taille (RGT) a été effectué par 2 techniques. La première, Quantitative Multiplex PCR of Short Fragments (QMPSF), retrouve des pertes de matériel dans 27/135 (20%) tumeurs. Pour confirmer ces résultats et mieux caractériser ces altérations, une puce haute résolution de CGH-array a été construite sous forme d’une puce à façon de la Société AGILENT de format 4 fois 44 K comportant une couverture pan-génomique et une densification de 1010 sondes couvrant le locus PTEN. Selon cette méthodologie, une perte de matériel touchant le locus PTEN a été identifiée dans 27/48 tumeurs avec, par ailleurs, un profil génomique particulier qui a été détecté pour 19 tumeurs montrant de grandes variations du nombre de copies le long du gène avec des pertes bialléliques localisées dans les grands introns de PTEN. Curieusement, ces profils génomiques s’accompagnent d’une conservation de l’expression immunohistochimique de PTEN. La survenue aléatoire d’événements génétiques favorisés par la perte de la stabilité du génome est une caractéristique fondamentale des proliférations tumorales. L’importance de celle-ci est soulignée par la mise en évidence de déficits des systèmes de réparation des bases (MYH), des nucléotides (gènes XP), et des mésappariements de l’ADN (MLH1/MSH2) dans les processus tumoraux. L’instabilité génétique ainsi induite se traduit certes par l’introduction de mutations ponctuelles pouvant toucher oncogènes et gènes suppresseurs de tumeurs, mais également par des aberrations caryotypiques ayant conduit à la distinction entre tumeurs de type MIN (pour microsatellite instability) et de type CIN (pour chromosome instability). Des anomalies constitutionnelles de 9 gènes fortement impliqués dans la réparation d’ADN et menant plutôt aux anomalies de type CIN (TP53, ATM, CHEK2, BRCA1, BRCA2, PALB2, BRIP1, NBS1 et RAD50) ont été décrites dans diverses situations de prédisposition héréditaire au cancer du sein. Un autre gène de prédisposition au cancer du sein, le gène PTEN code pour une phosphatase qui est un régulateur négatif de la voie PI3K-AKT. Des mutations somatiques de ce gène s’observent dans de très nombreux types tumoraux incluant le cancer du sein. Récemment, l’existence d’un role nucléaire de PTEN a été proposée suggérant son implication dans le maintien de la stabilité génétique. Le projet faisant l’objet de ce rapport cherche à argumenter cette hypothèse en recherchant l’existence d’une corrélation entre les altérations de PTEN et le niveau d’instabilité génétique dans le cancer du sein. de PARP nous a conduit à 2 développements de l’étude précédente. 1/ une recherche d’une corrélation entre la perte d’expression de BRCA1 évaluée par RT-PCR quantitative et l’existence d’altération de PTEN dans une série de 71 cancers de sein triples négatifs (équivalant IHC des tumeurs de type basal-like). 2/ une recherche de mutations révertants de PTEN dans des clones cellulaires montés en résistance vis-à-vis de deux inhibiteurs de PARP à partir de lignées cellulaires mutées pour PTEN et BRCA1. ● tiente puisqu’un recul évolutif de 11 années est connu pour ce groupe de tumeurs. Aucune corrélation manifeste ne peut être établie entre le statut PTEN et ces différentes caractéristiques anatomocliniques. Cependant deux points sont à souligner: (i) les altérations de PTEN s’associent à une mutation de TP53 dans 2 groupes de tumeurs seulement: les tumeurs de type basal like qui présentent toutes une inactivation de PTEN et pour la plupart une altération de p53 et les tumeurs très instables sur le plan génomique qui montrent une fréquente altération de p53 et incluent les profils PTEN «unknown». Il semble donc que la concomitance des altérations de TP53 et PTEN soit fortement associée à des génomes très instables alors que les altérations isolées, soit de PTEN, soit de TP53 puissent s’observer dans des tumeurs au génome relativement stable. (ii) Une autre observation intéressante est que les 11 tumeurs «unknown» ont eu toutes une évolution péjorative avec rechute métastatique alors qu’aucune n’avait présenté d’envahissement ganglionnaire axillaire lors du traitement initial. Il s’agit d’un groupe de tumeurs dont l’individualisation risque d’avoir une haute importance clinique. La mise en évidence récente de l’implication de PTEN dans les cancers du sein survenant dans le contexte d’une prédisposition héréditaire liée à BRCA1 ainsi que le rôle de PTEN dans la résistance au traitement par les inhibiteurs Publications : Jones N, Bonnet F, Sfar S, , Lafitte M, Lafon D, Sierankowski G, Brouste V, Banneau G, Tunon de Lara C, Debled M, Mac Grogan G, Longy M, Sevenet N. Comprehensive analysis of PTEN status in breast carcinomas. Soumis pour publication (Oncogene) Bonnet F, Guedj M, Jones N, Sfar S, Brouste V, Elarouci N, Banneau G, Orsetti B, Primois C, Tunon de Lara C, Debled M, de Mascarel I, Theillet C, Sevenet N, de Reynies A, MacGrogan G, Longy M. An array CGH- based genomic instability index (G2I) is predictive of clinical outcome in breast cancer and reveals a subset of tumors without lymph node involvement but with poor prognosis. Soumis pour publication (Genome Research) Finalement, l’ensemble des tumeurs a pu être classé en 4 catégories : «complete loss» n=19 (14%), perte complete d’expression et/ou inactivation biallélique «reduced copy number» n=19 (14%), perte d’hétérozygotie avec conservation d’une expression IHC «unknown» n=11 (8%), profil génomique instable d’interprétation difficile «wildtype» n= 86 (64%) sans altération détéctée. Ces résultats ont été corrélés à diverses classifications tumorales: 1/ la classification intrinsèque en tumeurs Luminales A, Luminales B, Basales like et HER2 enrichi. 2/ la presence ou non d’une mutation de TP53. 3/ le niveau d’instabilité génétique evalué par CGH array selon une classification en 3 niveaux d’intensités croissantes. 4/ l’existence ou non d’un envahissement ganglionnaire axillaire. 5/ l’évolution de la pathologie pour chaque pa- Une exploration exhaustive de PTEN a été réalisée sur une série de 135 cancers du sein sporadiques. L’expression de la protéine a été évaluée par immunohistochimie (IHC). Une absence d’expression a été identifiée dans 18/135 (13%) tumeurs. Les mutations ponctuelles de PTEN ont été criblées par une nouvelle technique de criblage, Enhanced Mismatch Mutation Analysis (EMMA). Six mutations ponctuelles ont été identifiées dans 5/135 (4%) 68 69 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster Recherche et étude des protéines partenaires d’Hsp27 responsables de l’évolution androgéno-indépendante des cancers de la prostate. KATSOGIANNOU Maria INSTITUT PAOLI CALMETTE - MARSEILLE Inserm U1068 -Laboratoire d’Oncologie Moléculaire Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) lulaire d’eIF4E en le protégeant de sa dégradation par la voie ubiquitine-protéasome ce qui augmente la survie des cellules CaP. L’inhibition de l’intéraction entre Hsp27 et eIF4E est en cours d’évaluation comme nouvelle stratégie pour le traitement des CaPs AI. Afin de mettre en évidence les protéines partenaires d’Hsp27 impliquées dans l’évolution AI du CaP, l’équipe a utilisé la technique du Double Hybride par SoS Recrutment System (SRS). Cette technique possède l’avantage de générer un taux faible de faux positifs, permet l’étude et l’identification de protéines partenaires d’Hsp27 modifiées au niveau post-traductionnel dans le cytoplasme de la levure. Nous avons réalisé le criblage des interacteurs d’Hsp27 sur deux banques : une banque de testicule humain sain (Testis) et une banque de cellules tumorales du col de l’utérus (HELA). Pour avoir une estimation représentative de l’ensemble des protéines interagissant avec Hsp27, nous avons testé 5 millions de clones par banque. Ces résultats nous ont permis de mettre en évidence 226 interacteurs potentiels d’Hsp27 dont seulement 2 était déjà connus. Dans le but de comprendre ce nouveau réseau d’interactions d’Hsp27 nous avons réalisé des analyses bioinformatiques permettant de classer les interacteurs selon leurs fonctions biologiques. Dans un premier temps, nous avons utilisé le programme DAVID (Database for Annotation Visualization and Integrated Discovery) (http://david.abcc.ncifcrf.gov/), dédié à l’investigation fonctionnelle de groupes de gènes, basé sur la ressource du « Gene Ontology ». Ensuite, nous avons intégré nos données au sein de l’interactome humain, ce qui nous a permis d’enrichir notre interactome Hsp27. L’analyse bio-informatique de notre interactome a permis de mettre en évidence qu’Hsp27 interagit, comme attendu, avec des protéines impliquées dans l’apoptose, le cycle cellulaire, le catabolisme protéique, l’organisation du cytosquelette et la régulation de la traduction protéique. Mais de façon plus intéressante, nous avons mis en évidence de nouvelles fonctions d’Hsp27 jamais décrites auparavant comme son rôle dans la maturation de l’ARN, l’homéostasie ionique, le transport des protéines et des acides nucléiques, Le cancer de la prostate (CaP) est le cancer le plus fréquent chez l’homme dans les pays industrialisés. La suppression androgénique (castration) demeure la seule thérapie efficace des CaPs métastatiques, permettant une réponse objective dans plus de 80% des cas. Toutefois, elle n’empêche pas la progression androgéno-indépendante (AI) de la maladie qui survient ordinairement dans les 1 à 3 ans après le début du traitement. Ainsi, de nouvelles stratégies thérapeutiques visant les mécanismes moléculaires de résistance doivent être développées. Une des stratégies visant à améliorer la thérapie des CaPs avancés, implique le ciblage de gènes activés lors de la suppression des androgènes, pour retarder ou empêcher l’émergence du phénotype AI. Récemment, P. Rocchi et collaborateurs ont identifié la protéine Hsp27 comme étant hautement surexprimée dans les CaPs AI. Il a été montré que l’inhibition d’Hsp27 par l’utilisation d’un oligonucléotide antisens (ASO) et d’un small interference RNA (siRNA) augmente l’apoptose et améliore l’androgéno- et la chimiothérapie des CaPs. L’équipe a développé et breveté un ASO de seconde génération (OGX-427) ciblant Hsp27 (Rocchi, P., Patent PCT no 10/605, 498, 2005). Une licence internationale a été obtenue et des essais cliniques de phase II utilisant OGX-427 sont en cours aux Etats-Unis et Canada chez des patients porteurs d’un CaP (http://www.oncogenex.ca/). Malgré l’efficacité d’OGX-427, le rôle fonctionnel de la protéine de stress Hsp27 dans la résistance à l’apoptose normalement induite par la castration reste indéfini. Le but de notre projet est d’élucider les mécanismes responsables de l’action d’Hsp27 dans les CaPs AI afin de 1/ Augmenter la sécurité pharmacologique d’OGX-427 et 2/ trouver des nouvelles cibles thérapeutiques et stratégies dont l’action serait plus spécifique des CaPs AI. Récemment, nous avons démontré par double hybride et co-immunoprécipitation qu’Hsp27 interagit avec le facteur eucaryotique d’initiation de la traduction des protéines (eIF4E) actuellement étudié comme cible thérapeutique dans plusieurs cancers y compris les CaPs. Cette interaction permet à Hsp27 de réguler le taux cel- 70 la biodisponibilité et la délivrance de l’ASO TCTP en vue d’une application clinique. Ce projet sera réalisé en collaboration avec l’équipe du Pr. Philippe Barthélémy (Inserm U869, ChemBioMed, Bordeaux) qui est spécialiste dans la chimie des oligonucléotides. ● la régulation de la transcription, la régulation de l’activité GTPase et le métabolisme. Des expériences sont en cours afin de valider biologiquement ces résultats. La validation biologique de notre intéractome nous a conduit à nous intéresser particulièrement à la protéine TCTP (translationally controlled tumour protein) car des études de microarray sur des tissus humains ont montré que TCTP est exprimé dans 18,5% des adénocarcinomes prostatiques avant castration et que sa présence est indétectable dans les pathologies bénignes de la prostate et les échantillons normaux, suggérant que le ciblage de TCTP aurait une faible toxicité pour les cellules normales. Afin d’étudier l’expression de TCTP durant la progression CR, des microarrays ont été réalisés à partir de tissus prélevés sur des patients traités ou non par castration chimique. Les résultats ont mis en évidence que l’expression de TCTP diminue après castration pour devenir fortement exprimé dans 75% des cancers métastatiques résistants. Nous avons développé et breveté un ASO de première génération ciblant TCTP (PCT/EP2011/073186). L’inhibition spécifique de TCTP par cet ASO conduit à une apoptose caspase-3 dépendante des cellules tumorales in vitro et à une diminution de la progression tumorale in vivo chez des souris nude. De façon intéressante, nous avons trouvé que la progression CR était corrélée avec une perte de P53 et que l’inhibition de TCTP par l’ASO restaurait l’expression et la fonction de P53 dans les tumeurs prostatiques résistantes à la castration. Ce travail fait l’objet d’une publication «Targeting TCTP as New Therapeutic Strategy to treat Castration-Resistant Prostate Cancer» en révision et un financement ANR « programme émergence » a été obtenu pour développer un ASO de seconde génération (TCTPLASO) en conjuguant modifications lipidiques à l’oligonucléotide par «Click Chemistry» afin d’améliorer la stabilité, Publications : Katsogiannou, M., Baylot, V., Andrieu, C., Baudot, A., Dusetti, N., Brun, C. and Rocchi, P. Hsp27 interactome mapping uncovers new cellular functions of Hsp27 and reveals involvement in DNA repair and RNA splicing. Soumise (Cancer Cell). Baylot, V., Andrieu, C., Katsogiannou, M., Taieb, D., Acunzo, J., Dusetti, N., Giusiano, S., Fazli, L., Gleave, M., Garrido, C. and Rocchi, P. Translationally Controlled Tumor Protein: a new Hsp27 Protein partner that mediates Cytoprotection in Castration Resistant Prostate Cancer. En revision (Molecular therapy). Baylot, V., Andrieu, C., Katsogiannou, M., Taieb, D., Garcia, S., Giusiano, S., Acunzo, J., Iovanna, J., Gleave, M., Garrido, C. and Rocchi, P. OGX-427 inhibits tumor progression and enhances gemcitabine chemotherapy in pancreatic cancer. Cell Death Dis. 2011 Oct 20;2:e221. Publications de Revue Acunzo, J., Katsogiannou, M. and Rocchi, P. Small Heat Shock Protein as regulators of cell death. Int J Biochem Cell Biol [Epub ahead of print], 2012. Katsogiannou, M., Catapano, C., Peng, L. and Rocchi, P. Active-targeted nanotherapy strategies for prostate cancer. Curr Cancer Drug Targets. 11(8):954-65, 2011. Brevet Baylot, V., Andrieu, C., Katsogiannou, M., Acunzo, J., Rocchi, P. Nucleic acids targeting TCTP for use in the treatment of cancer. Patent PCT/EP2011/073186. 71 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster Le ciblage thérapeutique de Clusterin, par l’utilisation de l’antisens OGX-011 augmente, de manière synergique, l’activité de thérapies ciblées (Acide Zolédronique et inhibiteurs de Hsp90) dans le traitement des tumeurs osseuses. LAMOUREUX François FACULTE DE MEDECINE DE NANTES - NANTES Inserm U957 - Laboratoire de physiopathologie de la résorption osseuse et thérapie des tumeurs osseuses primitives Financement de la Fondation ARC : 2ème Post-doctorat en France (retour) CLU is upregulated after different stresses including hormone withdrawal, chemotherapy or targeted therapies; hence CLU level is high in prostate cancer and osteosarcoma biopsies. Moreover, CLU level was increased in a dose- and time-dependent manner after zoledronic acid or Hsp90 inhibitors treatments in OS and prostate cancer cell lines, by mechanisms including increased HSF-1 transcription activity. The development of OS cells resistant to zoledronic acid showed a higher CLU expression level in these cells than in the sensitive cells. CLU silencing, using OGX-011 or siRNA, abrogates zoledronic acid or Hsp90 inhibitors induced HSF-1 transcriptional activity, while CLU overexpression enhances drugs-induced HSF-1 transcription activity, identifying a role for CLU in the regulation of HSF-1 and the heat shock response itself. CLU knockdown, blocks the translocation to HSF-1 to the nucleus following treatment with zoledronic acid or Hsp90 inhibitors. This effect of CLU on HSF-1 activity is biologically relevant since CLU overexpression protects while CLU silencing enhances, cytotoxicity of zoledronic acid or Hsp90 inhibitors and in vitro in OS and prostate cancer cell lines. Clusterin Inhibition using OGX-011 Synergistically Enhances Targeted Therapies (Zoledronic Acid and Hsp90 Inhibitors) Activity in Bone Tumors. Despite recent improvements in therapeutic management of bone tumors (sarcoma, prostate bone metastasis…), poor therapeutic benefits to conventional chemotherapy or targeted therapies are often observed; so that ongoing challenges are to improve the response to treatments and to enhance overall patient survival. Among new therapeutic approaches, zoledronic acid, currently in Phase III clinical trial in treatment of OS and in clinical use in treatment of bone metastasis in prostate cancer, and Hsp90 inhibitors, in Phase II clinical trials in various solid tumors including prostate cancer and sarcoma, represent promising adjuvant molecules to chemotherapy. However, zoledronic acid and Hsp90 inhibitors trigger the elevation of heat shock proteins (Hsp), including Hsp27, Hsp70 and clusterin (CLU), mainly regulated by the transcription factor, Heat Shock Factor-1 (HSF-1), that could lead to resistance phenomenons and tumor progression. Clusterin is a cytoprotective chaperone protein that promotes cell survival and confers broad-spectrum treatment resistance by inhibiting mitochondrial apoptosis by suppressing p53-activating stress signals and stabilizes cytosolic Ku70-Bax protein complex to inhibit Bax activation. We hypothesized that targeting (CLU) using siRNA or the antisense drug, OGX-011 (2′-methoxyethyl–modified phosphorothioate antisense oligonucleotide that is complementary to clusterin mRNA), will suppress treatmentinduced CLU induction and enhance Hsp90 inhibitors- or zoledronic acid-induced cell death in osteosarcoma (OS) or in prostate cancer cells. The combined effects of OGX-011 with zoledronic acid or Hsp90 inhibitors were investigated in vitro on cell growth, viability, apoptosis and cell cycle repartition of human osteosarcoma (SaOS2, U2OS, MG63 and HOS) and human prostate cancer (PC-3 and LNCaP) cell lines, and in vivo in PC-3 and LNCaP xenograft models. OGX-011 suppressed treatment-induced increases in CLU and synergistically enhanced the activity of zoledronic acid or Hsp90 inhibitors on cell growth and apoptosis by increasing both caspase-3 expression and activity. These biologic events were accompanied by decreased expression of HSPs, Akt, and HSF-1 transcriptional activity. Moreover, OGX-011 synergistically enhanced Hsp90 inhibitors activity in vivo in PC-3 and LNCaP xenograft models by enhancing treatment-induced apoptosis. Collectively these results highlight, for the first time, a biologically relevant feed-forward regulation loop of CLU on HSF-1 and the heat shock response. These results also indicate that zoledonic acid or Hsp90 inhibitors-mediated induction of CLU can be attenuated by OGX-011, with synergistic effects on delaying progression of OS or prostate cancer. ● 72 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster Validation fonctionnelle d’une nouvelle cible candidate pour le traitement du cancer colorectal : un possible rôle oncogénique de la MAP3K ZAK LARTIGUE Lydia INSTITUT BERGONIE - BORDEAUX INSERM U916 - Validation et Identification de Nouvelles Cibles en Oncologie (VINCO) Financement de la Fondation ARC : 2ème Post-doctorat en France (retour) Introduction. Le cancer colorectal est le 3° cancer le plus commun en France, où il constitue la 2° cause de décès par cancer. Son incidence augmente régulièrement et, la maladie métastatique (CCRm), qui concerne plus de 50 % des patients, est découverte dans 25 à 30% des cas au moment du diagnostic du cancer primitif (métastases synchrones). Le traitement de ces formes métastatiques, basé classiquement sur la résection de la tumeur et la radiothérapie et/ou la chimiothérapie, a connu un nouvel essor ces dernières années avec l’arrivée sur le marché de thérapies ciblées. Ces dernières reposent sur l’action d’anticorps monoclonaux (MoAb) comme (i) le cetuximab ou le panitumumab dirigés contre le récepteur tyrosine kinase pour le facteur de croissance épithélial, EGFR ou (ii) le bevacizumab ciblant le facteur de croissance de l’endothélium vasculaire VEGF. Description du projet. Dans le but de rechercher de nouvelles cibles pharmacologiques spécifiquement dérégulées dans le CCR, nous avons réalisé une étude combinant une approche génomique sur des échantillons de tumeurs colorectales (RNA microarray) à une exploration fonctionnelle à haut débit du « potentiel thérapeutique » des cibles surexprimées, dans des modèles cellulaires de CCR in vitro. En suivant des critères de sélection stricts, les CIBLES dont la suppression s’avérait pro-apoptotique, anti-invasive et anti-proliférative ont été retenues ; parmi celles-ci figure la protéine ZAK. ZAK (Zipper sterile-Alpha-motif Kinase) est une protéine kinase (PK) de la famille des MLKs (Mixed-Lineage Kinase) très peu connue. Elle appartient à la voie de signalisation intracellulaire des MAPKs et, agit comme une MAP3K. Les MLKs activent généralement p38 et JNK/SAP mais certains de leurs membres peuvent engager ERK. Si le bénéfice certain de ces thérapies ciblées a été montré en termes de survie sans progression et de survie globale, des études rétrospectives ont cependant rapporté que les patients ne profitaient pas tous de la même manière de ces traitements, à cause de la présence ou de l’apparition de mécanismes de résistance à ces MoAb. Il a par exemple été montré que seulement 10 % à 20 % des patients avec CCRm bénéficiaient cliniquement des anti-EGFR à cause de l’activation oncogénique de la voie en aval de l’EGFR (70 % des patients non répondeurs (NR) portant des altérations sur les protéines KRAS, BRAF, PI3K, PTEN). Bien qu’à une moindre fréquence, les thérapies anti-VEGF se heurtent aussi à des problèmes de résistance intrinsèque ou acquise des cellules cancéreuses, et en absence de biomarqueurs prédictifs de réponse au bevacimumab, les bénéfices cliniques de ces Moab sont difficilement prévisibles. Deux isoformes de ZAK ont été décrites : ZAK-α et ZAK-β, et leur rôle dans l’oncogenèse n’est pas bien connu. Seul un article montre que ZAK-α pourrait favoriser la transformation néoplasique de cellules et le développement de cancers in vitro et in vivo. Sa surexpression induirait en effet la transformation tumorale de cellules épidermiques murines traitées à l’EGF ou au TPA et, la formation de tumeurs dans des souris athymiques. Sous stimulation à l’EGF, ZAK-α s’associerait avec l’histone 3 pour la phosphoryler et participer au remodelage de la chromatine, montrant une possible participation de ZAK-α dans la voie oncogénique des MAPKs activée par l’EGF. Des inhibiteurs spécifiques de ZAK ont été développés par l’industrie pharmaceutique comme le DHP-2 dans le cadre de l’hypertrophie cardiaque (dans laquelle ZAK est impliquée). Il a aussi été montré que le nilotinib et le dasatinib, de nouveaux inhibiteurs de tyrosine kinases développés pour traiter les formes mutées de BCR-ABL dans les leucémies myéloïdes chroniques inhibaient ZAK avec une Ainsi, malgré l’apport indéniable des biothérapies ciblées, l’identification de nouvelles cibles dans le traitement du CCRm reste primordiale pour offrir des alternatives thérapeutiques aux patients résistants ou améliorer la survie globale des patients répondeurs (18 à 24 mois). 73 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster naviguer entre deux compartiments cellulaires : le noyau et le cytosol, alors que ZAK-b, semblerait, après surexpression, avoir une préférence pour le cytosol. En tant que MAP3K, la surexpression de ces protéines induit l’activation des MAPK p38, JNK, ERK et c-JUN. Au niveau fonctionnel, ZAK participerait à la motilité cellulaire. n de valider l’utilisation d’inhibiteurs de ZAK dans des modèles animaux xénogreffés. Sous-réserve de l’obtention de résultats in vitro probants. A cette fin, des lignées cellulaires de CCR sur- ou sous-exprimant de façon stable ZAK-α et ZAK-β viennent d’être générées. grande spécificité. Ainsi, si le rôle de ZAK dans le CCR se confirmait, ces molécules, déjà utilisées en clinique, pourraient offrir une alternative thérapeutique dans cette pathologie. L’objectif de ce projet est d’explorer la pertinence de ZAK comme cible thérapeutique dans le CCR, en particulier dans le contexte de la résistance aux Moabs anti-EGFR. Pour cela, nous nous proposons d’étudier : n le statut d’expression/activation de ZAK dans des collections de tumeurs A ce stade, nous disposons de données montrant une surexpression de ZAK-α (par qPCR) et de ZAK-β (par immunomarquage de puces à tissus ou TMA) dans le tissu tumoral par rapport au tissu sain sur une nouvelle cohorte de CCR. Des données cliniques préliminaires nous permettent par ailleurs de penser que la surexpression de ZAK pourrait être impliquée dans la résistance au traitement, indépendamment du statut mutationnel de KRAS et BRAF. n les corrélations expression de ZAK/ réponse aux Moabs EGFRs par bioinformatique L’analyse in silico semble montrer une corrélation entre l’expression de ZAK dans le panel des lignées du NCI et la sensibilité au dasatinib (anti-Bcr-ABL) et lapatinib (antiHer1/Her2). n le rôle fonctionnel de ZAK dans des modèles cellulaires de CCR. Conclusion et perspectives. A travers ce programme de recherche, nous cherchons à étudier une cible thérapeutique potentielle dans sa globalité depuis la mise en évidence de sa dérégulation dans les cellules tumorales de patients à son mécanisme d’action intracellulaire et au rationnel de son ciblage dans le contexte de la pathologie du CCR. L’étude de ZAK établira les fondements d’une analyse structurée de « validation de cibles thérapeutiques » intégrant les données de patients et de divers modèles biologiques, dont la seule combinaison pourra déboucher sur l’identification de nouveaux traitements. A plus long terme, ce modèle d’étude sera appliqué à d’autres cibles potentielles. ● Publications : Un article est en cours d’écriture : The MAP3K ZAK, a new regulator of colorectal cancer cell migration can be blocked by Nilotinib Au niveau intracellulaire, nous avons pu détecter la protéine ZAK aussi bien dans les TMA que dans les lignées cellulaires tumorales de colon. ZAK-b paraîtrait capable de 74 Étude des voies de tolérance des lésions : introduction d’une lésion unique sur le chromosome NAIMAN Karel CENTRE DE RECHERCHE EN CANCEROLOGIE DE MARSEILLE - MARSEILLE UMR7258 - Instabilité du Génome et Cancérogenèse Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) bination system of phage lambda, and consists in introducing a single lesion at a specific site on the chromosome of a living cell. The preliminary steps have been achieved in the bacteria showing a robust and precise integration. After introducing of a single lesion in the genome, we were able to study the genetic control of the partitioning among Translesion Synthesis and Damage avoidance pathways for different lesions. In physiological conditions, for less blocking lesions like hpG (7-(2-hydroxypropyl)guanine), TLS is the major pathway. However, blocking lesions like AAF-G (guanin modified by N-2-acetylaminofluorene) are bypassed mainly by DA events whereas TLS events represent a minor pathway. We could affect this ratio by modifying the pool of specialized DNA polymerases in the cell. In conclusion, the partition between DA and TLS is function of the nature of the lesion to be bypassed and the pool of polymerases present in the cell. Also we showed that RecA is responsible for the majority of the DA pathway. ● In this work we investigate the metabolism of damaged DNA, using a new methodology that allows to introduce a single lesion at a specific locus on the chromosome of a living cell. The replication of damaged DNA is a universal problem faced by all organisms. DNA lesions arise continuously due to endogenous or environmental agents. In proliferating cells some of these lesions are inevitably encountered during DNA replication and lead to the stalling of the DNA polymerase. Cells possess two main strategies to restore transiently blocked replication forks: Translesion synthesis (TLS) and Damage Avoidance (DA) pathways. While TLS pathways are error-prone and are the major source of point mutations, DA pathways are error-free as they rely on mechanisms related to homologous recombination with the sister chromatid. Whereas TLS has been extensively studied over the past 10 years after the discovery of the specialized translesion DNA polymerases, the damage avoidance pathway remains poorly defined by lack of an appropriate methodology. Therefore, it appeared essential to develop a new technology that would allow to study lesion bypass and determine the structure of the replication fork that encounters a lesion in the genome. The approach we have developed is based upon the site-specific recom- Publications : Monitoring bypass of single replication-blocking lesions by damage avoidance in the Escherichia coli chromosome. Pag s V, Mazón G, Naiman K, Philippin G, Fuchs RP, Nucleic Acids Research (in press) 75 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster Nouveaux algorithmes d’identification de transcrits chimères dans les données de RNASequencing pour l’amélioration du diagnostic en cancérologie. La voie de signalisation Notch comme outil pour suivre les cellules souches et leurs lignages au cours du développement et de la tumorigenèse de la glande mammaire. PHILIPPE Nicolas RODILLA Véronica CENTRE DE RECHERCHE EN BIOCHIMIE MACROMOLECULAIRE - MONTPELLIER CNRS UMR 5237 - Groupe Etudes Transcriptomes Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) INSTITUT CURIE - PARIS CNRS UMR 144 - Unité Compartimentation Dynamique Cellulaires Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) Enfin, à partir de données de cellules leucémiques, des séquences seront sélectionnées par le pipeline précédemment décrit, puis des validations expérimentales seront effectuées. ● Un défi de la transcriptomique par séquençage haut débit (SHD) est d’explorer l’ensemble du répertoire de transcription. L’identification et la caractérisation de nouveaux transcrits, parmi lesquels on trouve les ARN non-codants et les ARN chimères, représentent un enjeu majeur en cancérologie. Nous proposons de relever ce défi en concevant des approches bioinformatiques capables d’identifier des ARN chimères potentiels à partir de données haut débit. Publications : 1) Prédiction d’ARN chimériques à partir de séquençage d’ARN Philippe N.; Salson M.; Ruffle F; Bou Samara E; Boureux A; Commes T.; Rivals E. 7èmes Journées du Cancéropôle GSO du 18 au 19 octobre 2011 2) «Querying large read collections in main memory: a versatile data structure.» Philippe N., Salson M., Lecroq T., Leonard M., Commes T., Rivals E. BMC Bioinformatics 2011, 12:242. 3) A Scalable Indexing Solution to Mine Huge Genomic Sequence Collections E. Rivals, N. Philippe, M. Salson, M. Leonard, T. Commes, T. Lecroq ERCIM News, Vol. 89, p. 20-21, 2012. 4) «CRAC: an integrated approach to read analysis.» Philippe N., Salson M., Commes T., Rivals E. soumis à Genome Biology La méthode permettra d’identifier ces ARN à partir de données de RNA-Sequencing avec une application ciblée en cancérologie pour la détection de nouveaux marqueurs dans les leucémies myéloïdes. L’efficacité repose nécessairement sur la création d’une structure d’indexation adaptée pour un grand ensemble de séquences et sur un algorithme complexe de recherche de séquences dans un génome. À cette approche, nous couplerons une analyse bioinformatique, intégrant la fiabilité des séquences et leurs annotations génomiques permettant, ainsi, une caractérisation et une classification précise des chimères. Un des objectifs sera de constituer une chimèrothèque qui pourra être étendue à un plus grand ensemble de tumeurs. INTRODUCTION. Breast cancer is the leading cause of cancer death in women in Western countries. Although 60-80% of these patients positively respond to chemotherapy, the rate of relapse is 20-70%. Comprehensive gene expression profiling of large sets of tumors have revealed five major molecular subtypes of breast cancer: basal-like, luminal A, luminal B, HER2+/ER–, and normal breast–like (from worst to best prognosis). However, it remains unclear if there are different origins for each different subtype. To answer this question, first we need to understand the cell biology of this tissue, the mammary gland. Mammary gland development occurs post-natally, when the mammary epithelium begins to grow; around 3 weeks of age and during puberty, the distal ends of the mammary ducts enlarge into bulbous structures that proliferate, extend into the fat pad, and branch by bifurcation until the ducts reach the limits of the fat pad. During pregnancy, the reproductive hormones induce the expansion and differentiation of the mammary epithelium into secretory (milk-producing) alveoli. Upon weaning, the alveoli disappear through massive apoptosis, and the gland is remodeled back to a state resembling that of a virgin female (involution). The mammary epithelium is composed of differentiated cells (luminal and myoepithelial cells), stem cells and progenitors. Recently, it has been demonstrated that the mammary gland contains different types of long-lived stem cells (myoepithelial stem cell and luminal stem cell). Nevertheless, there are no specific markers for each specific population. My project suggests that Notch signaling can be used as a tool to follow stem cells, progenitors and their progeny during normal development as well as transformation of the mammary epithelium. identify Notch1-expressing lineages in the mammary gland at different developmental stages, using knock-in mice that allow the conditional expression of a reporter gene under the control of Notch1 promoter. RESULTS. My project is aimed at dissecting the involvement of Notch1 signaling in mammary gland homeostasis and its role in breast cancer. While the Notch signaling pathway has been implicated in controlling stem cell maintenance in a variety of tissues, its precise expression and function in mammary gland stem cells is still under debate. This uncertainty is due on one hand to the lack of lineage tracing studies defining the stem cell hierarchy and their progeny in this tissue and on the other, to the lack of reliable tools to investigate Notch expression in vivo. For this purpose, our laboratory has recently generated a new set of transgenic mice that allows the visualization of Notch expression and activation in normal and malignant cells in virtually all tissue. These new experimental reagents include mice to perform cell lineage tracing of the four Notch receptors; and novel knock-in animals that conditionally express the active form of the four Notch paralogues in a tissue-specific manner. Using these new tools, we have identified a subpopulation of luminal cells that are the responsible for the hormone response. By lineage tracing experiments with Notch1-CreERT2 mice crossed to a double fluorescent reporter line (Rosa26(mT/mG), we characterized the Notch1-expressing cells as a luminal subset population ER (Estrogen Receptor) negative, PR (Progesterone Receptor) negative that is maintained throughout mammary development (from puberty to adulthood). Interestingly, during pregnancy, these cells expand up to 80% of the luminal cells. These results strongly suggest a link between Notch1 and hormone stimulation. By immunofluorescence and FACS analysis, we determined that Notch1-expressing cells are actively diving cells at different developmental stages, correlating with the major response after hormone stimuli. To test their stem cell capacities, we performed transplantations In mammals, there are four Notch receptors (Notch1-4), whose expression patterns and functions can be redundant or specific depending on the tissue context. It is unknown which Notch paralogues are involved in physiological mammary gland development and how specific is their action. For this purpose, my first objective has been to 76 77 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster and tubulogenesis in vitro, facilitating their manipulation. These experiments will be crucial to understand the relationship between the different cell populations coexisting in the mammary gland. Preliminary experiments have shown that treatment of miniglands with Notch inhibitors severely impairs ex vivo tubulogenesis. Thus, we plan to examine, how Notch-expressing cells contribute to tubulogenesis by monitoring these cells during minigland morphogenesis in real time by time-lapse microscopy. To assess the Notch function in vivo, we will use a set of gain of function Notch transgenic mice (Rosa26-Notch1IC), which conditionally express activated form of Notch1 receptor and understand the functional contribution of this receptor to develop mammary tumors. with Notch1-sorted cells injected in cleared fat pads of host mice. This functional assay allows performing serial transplantations to measure self-renewal and to determine stem cell content of Notch1-positive cells. After first transplantation, they were not able to grow on their own, but they did in co-transplantation with myoepithelial cells. Importantly, they could give rise exclusively to luminal cells. PERSPECTIVES. Next, we are interested in elucidating the function of Notch1 receptor during mammary gland development using a gain-of-function approach in vivo. In order to further test the plasticity of these cells, we will then ablate this cell population in vivo, by crossing mice carrying a conditional allele expressing diphtheria toxin A (DTA) with Notch1-CreERT2 mice. Upon tamoxifen injection, these mice express DTA exclusively in the Notch1-expressing cells, leading to ablation of this cell population. In addition, we will eliminate Notch1-expressing cells in 3D organotypic primary mammary cultures grown ex vivo (henceforth referred to as miniglands). These miniglands recapitulate the morphogenesis of glandular structures CONCLUSIONS. By cell tracing experiments we have identified a luminal cell population Notch1 positive that responds to hormone stimulation and contains high proliferative capacities. Mutations in this specific population could be the origin of the most aggressive type of breast cancer, triple negative for ER, PR and HER2. ● Dynamique et mécano-transduction des intégrines à haute-résolution: Mécanismes cellulaires de détection de la rigidité des tissues et implication dans la croissance tumorale. ROSSIER Olivier INSTITUT INTERDISCIPLINAIRE DE NEUROSCIENCES - BORDEAUX UMR 5297 CNRS - Biophysics of Adhesion and Cytoskeleton Lab Financement de la Fondation ARC : 2ème Post-doctorat en France (retour) by α5β1 integrins (Roca-Cusachs, 2009). Integrins are critical in many cellular functions including adhesion, mechanotransduction, cell motility, growth, differentiation and apoptosis. All those functions are implicated in tumor progression (Desgrosellier and Cheresh, 2010). Interestingly, many malignant phenotypes of cancer cells are linked to upregulation of specific integrin heterodimers including α5β1 and αvβ3 (Weaver, 1997; Taddei, 2003). Rigidity of tissues is now regarded as a crucial physical parameter regulating cell behavior in many physiological responses: development (Keller, 2003), stem cell differentiation (Engler, 2006), but also in pathological diseases such as tumor progression (Paszek, 2005; Peyton, 2007) and fibrosis (Ingber, 2003). In the body, cells can experience a wide range of rigidities spanning from soft tissues as in brain or breast to hard ones like bones and cartilages (Discher, 2005). In normal situation native cells, in a given tissue, function and respond optimally to the given rigidity associated within this tissue (Moore, 2010). In cancerous tissues, tumor microenvironment possesses an often radically altered extra-cellular matrix (ECM) that is often associated with tissue stiffening. Clinicians intuitively use such alterations –that essentially «dedifferentiate» the surrounding tissue- to detect tumors through palpation. While the great majority of cancer research has focused on the differences in signaling and gene expression within cancer cells, the insoluble cues conferred by the altered ECM to the tumor and other cells within the tumor stroma are also critical. Whether matrix stiffening actively causes cancer is uncertain, as is the precise mechanism by which cells sense stiffening within the tumor stroma. However, understanding the basis of rigidity sensing in tumor pathogenesis as well as in normal cells may possibly result in a new class of cancer drugs focused on disrupting the mechano-sensing portion of cell motility. At the cellular level, integrins are the core of focal adhesions (FAs) which are micron-sized macromolecular complexes composed of more than 150 different proteins, including actin binding-proteins (ABPs), scaffolding and signalling proteins (Geiger, 2009). Integrins in FAs bind to actin filaments through several ABPs such as talin, filamin and tensin (Delon, 2007). As the adhesion matures, additional proteins are recruited to reinforce the linkage (Burridge, 1984). Integrins in FAs mediate adhesion and force transmission to ECM essential for cell motility and growth. Different αβ-integrins binding to FN perform distinct functions and are simultaneously present in FAs. Although the static nanoscale organization of FAs was described (Kanchanawong, 2010), the role of integrin dynamics during biochemical and biomechanical processes in FAs is still elusive. Using single protein tracking (spt) and super-resolution PALM imaging we revealed the dynamic nano-organizations of β-integrins and talin inside mature FAs. We used mouse embryonic fibroblasts (MEFs) spread on FN and co-transfected with GFP-paxillin as a reporter for FAs. We performed spt using the photoconvertible protein mEOS2 fused to β-integrins and talin. This strategy reduces steric hindrance present in crowded and confined structures such as FAs compared to fluorescently labelled antibodies against extracellular domains of integrins (Galbraith, 2007). By reconstructing thousand β-integrin trajectories outside and inside FAs, we obtained molecular-scale information about β-integrin interactions with components Being the primary links between the ECM and the cell’s actin cytoskeleton, integrin adhesion receptors appear to be key players in the mechanotransduction of ECM physical properties. Integrins are transmembrane heterodimers composed of an α and a β chain. In vertebrates, there are 24 different heterodimers. Integrins mediate binding to a variety of ECM components, including fibronectin (FN), collagen, laminin, and vitronectin. There are important functional differences between integrin complexes. For instance for FN-binding integrins, less stable αvβ3 integrins initiate signal transduction, while higher matrix forces are supported 78 79 PRIX HÉLÈNE STARCK - Post-doctorat Poster of F-actin and the ECM. We plotted the mean square displacement, i.e. surface explored, versus time and extracted instantaneous diffusions (D), diffusion modes (free, confined) and sizes of the confinement domains and dwell times. We showed that integrins alternate between freediffusion and bound states, thus integrins are not constantly active while they reside in FAs. Integrin activation promotes immobilization, stabilized in FAs by simultaneous FN and ABPs connections. The integrin activator talin is recruited in FAs directly from the cytosol without membrane freediffusion, restricting integrin immobilization to FAs. β3integrins immobilizations are enriched and stationary within FAs, whereas β1-integrins are less enriched and display rearward movements. Using chimeric β1-β3integrins, we show that these differences are determined by the extracellular domain of β-integrins. Talin is enriched and partly moving rearward in FAs, consistent with the formation of stable connections with both β-integrins. Thus, differential transmission of F-actin motion to FN occurs through specific integrins within FAs. How can the rigidity of the matrix be sensed by integrins? Integrin involvement in the mechanosensing process was proposed by Ingber (1991), and several reports have shown that extracellular rigidity causes strengthening of the integrin linkage (Choquet, 1997). The lifetime of a bond generally shortens (slips) with applied force. Catch bonds are exceptions to this rule. In response to applied force, the energy landscape of catch bonds changes in such a way as to increase their strength under certain force regimes. Recently, a catch bond between integrin α5β1 and FN was observed in-vitro at forces of 10–30 pN (Kong, 2009). Our goal is to establish whether rigidity sensing of ECM by living cells is based on the catch bond property of integrin-ECM linkages. To this aim, we will develop sensitive force-sensing techniques enabling super resolution microscopy imaging to probe in real time and at the nanometer level, the different nano-dynamics of single β1- and β3-integrins when myosinII-contractile forces are modulated by pharmacological approaches or when ECM-rigidity is varied. ● In the first part of my project, I unraveled a dynamic nanopartitioning of β3- and β1-integrins within FAs which defines the precise location and duration of β-integrin-specific signals that could control local forces during cellular functions such as migration and ECM remodeling. We show that this organization is remodeled in less than a hundred seconds. This more dynamic view of FN-integrinABPs connection implies to reconsider integrin biochemical and mechanical signaling as transient processes constantly relocating within FAs. Publications : Rossier, O., Octeau, V., Sibarita, J.-B., Leduc, C., Tessier, B., Deepak, N., Gatterdam, V., Destaing, O., Albigès-Rizo, C., Tampé, R., Cognet, L., Choquet, D., Lounis, B., & Giannone, G. « β1- and β3-integrins display differential nanodynamic organizations inside focal adhesions. » (en révision à Nature Cell Biology). Etude de la réparation des adduits encombrants et des pontages interbrins de l’ADN induits par le stresse oxydant et/ou les agents anti-canéreux. Applications aux mécanismes de tumorigenèse et de résisatnce aux thérapeutiques anti-cancéreuses. TALHAOUI Ibtissam INSTITUT GUSTAVE ROUSSY - VILLEJUIF UMR8200 - Stabilité Génétique et Oncogenèse Financement de la Fondation ARC : 1er Post-doctorat en France (après la thèse) INTRODUCTION L’ADN est continuellement exposé aux effets délétères des espèces réactives de l’oxygène qui sont à l’origine du stresse oxydant dans les cellules, conduisant à l’altération de l’ADN. La persistance ou l’accumulation des dommages oxydatifs dans le génome est impliquée dans l’apparition de différentes pathologies notamment le cancer, les maladies neurodégénératives et le vieillissement. Les espèces réactives de l’oxygène produisent le 7,8-dihydro-8-oxoguanine (8oxoG) et le 7,8-dihydro-8-oxoadenine (8oxoA) qui sont des adduits hautement mutagènes dans les cellules de mammifères. La grande majorité des bases oxydées de l’ADN sont réparées via la voie BER (Base Excision Repair) initiée par les DNA glycosylases qui coupent la liaison N-glycosidique entre la base modifiée et le désoxyribose. ration du 8oxoA•T et à caractériser, in vivo, les effets physiologiques de ce type de dommage dans des cellules de mammifères. Dans un premier temps, nous avons testé une série d’enzymes de réparation de l’ADN chez la levure, la bactérie et les mammifères. Cette approche avait pour objectif l’identification des cibles potentielles qui pourraient intervenir dans la réparation du 8oxoA•T. Ainsi, cette étude a montré, pour la première fois, que lorsque le 8oxoA se trouve en face de T (8oxoA•T) il est réparé par la glycosylase hTDG (human Thymine DNA Glycosylase) chez l’Homme et par MUG (Mismatch-specific Uracil DNA Glycosylase) chez la bactérie Escherichia Coli. J’ai également montré que TDG peut réparer le dommage 8oxoA non seulement lorsqu’il est apparié avec T (8oxoA•T) mais également avec C (8oxoA•C) et G (8oxoA•G). De plus, nous avons utilisé deux formes de la glycosylase hTDG, la protéine complète et une forme tronquée appelée hTDG « core » qui ne possède que le domaine catalytique. La comparaison des constantes cinétiques de ces deux dernières et de la glycosylase MUG a montré que la hTDG présente une meilleure efficacité d’excision du 8oxoA•T. Cette activité enzymatique à été mesurée à partir d’enzymes purifiées et également à partir d’extraits protéiques de cellules de mammifères et de bactéries E. Coli. A l’heure actuelle, on ne dispose que de très peu de données sur la réparation du 8oxoA chez les mammifères et les mécanismes impliqués dans cette activité demeurent peu étudiés. Néanmoins, des investigations antérieures ont montré que chez les eucaryotes il existe une glycosylase appelée 8-oxoguanine-DNA-Glycosylase 1 (OGG1) qui excise le 8oxoA exclusivement lorsqu’il est apparié avec une base C (Cytosine) (Jensen A et al). Une étude plus récente a identifié une nouvelle enzyme appelée NEIL1 (endonuclease VIII-like protein 1) qui assure cette même fonction chez les mammifères suggérant une importance biologique de la réparation de cette lésion. Il a été rapporté qu’une autre glycosylase présente dans les cellules de mammifères serait capable de réparer le 8oxoA apparié avec une guanine (8oxoA•G) (Girard PM et al). La deuxième partie de cette étude a consisté à vérifier la resynthèse de l’ADN après l’élimination du 8oxoA. Pour atteindre cet objectif j’ai utilisé la technique de la reconstitution, in vitro, de la voie BER. Ainsi, j’ai pu montrer qu’après l’action de la hTDG, la polymérisation et la ligation de l’ADN peut avoir lieu et permettre de rétablir son intégrité. Enfin, nous avons voulu déterminer l’impact de la persistance de 8oxoA dans des cellules de mammifère en culture. Afin de générer ce dommage dans l’ADN j’ai utilisé des cellules MEF sauvages (Mouse Embryonic Fibroblast) et DESCRIPTION DE L’ETUDE Malgré les effets néfastes de l’accumulation du 8oxoA•T dans le génome, aucune étude n’a permis d’identifier une enzyme capable de réparer ce dommage. Dans ce contexte, nous avons cherché à identifier, in vitro, les voies de répa- 80 81 dependent excision of 7,8-dihydro-8-oxoadenine by the Ogg1 protein of Saccharomyces cerevisiae. Carcinogenesis. 1998;19:1299–1305. n Inga R. Grin, Grigory L. Dianov and Dimitry O.Zhakov. The role of mammalian NEIL1 protein in the repair of 8-oxo-7,8-dihydroadenine in DNA. FEBS Lett. 2010; 584: 1553–1557. n Jensen A, Calvayrac G, Karahalil B, Bohr VA, Stevnsner T. Mammalian 8-oxoguanine DNA glycosylase 1 incises 8-oxoadenine opposite cytosine in nuclei and mitochondria, while a different glycosylase incises 8-oxoadenine opposite guanine in nuclei. J. Biol. Chem. 2003;278: 19541–19548. ● des cellules MEF-tdg déficientes que j’ai irradié avec des rayons gamma à différentes doses allant de 0 Gy à 20 Gy. De façon intéressante, cette expérience a montré que les cellules qui n’expriment pas TDG présentent un taux de survie inférieur à celui des cellules sauvages au sixième et huitième jour après irradiation-gamma. CONCLUSIONS ET PERSPECTIVES Le 8oxoA peut se former dans les cellules de mammifères après une irradiation-gamma et l’augmentation de son niveau a été détectée dans différents types de cancer chez l’Homme (Evans LD et al). Notre étude à permis d’identifier le rôle clé de TDG chez l’Homme dans la réparation du dommage 8oxoA et constitue un pas importante dans la caractérisation de cette glycosylase. Néanmoins, le rôle physiologique de TDG dans la lutte contre l’effet mutagénique du 8oxoA nécessite une investigation plus approfondie pour élucider le rôle de cette enzyme in vivo. Publications : 7,8-dihydro-8-oxoadenine, a Highly Mutagenic Adduct, is repaired by E. coli and Human Mismatch-Specific Uracil/ Thymine-DNA Glycosylase. Ibtissam TALHAOUI, Sophie COUVE, Alexander A. ISHCHENKO, Christophe KUNZ, Primo SCHÄR, Murat SAPARBAEV. REFERENCES : n Evans MD, Dizdaroglu M, Cooke MS. Oxidative DNA damage and disease: induction, repair and significance. Mutat. Res. 2004;567:1–61. n Girard PM, D’Ham C, Cadet J, Boiteux S. Opposite base- 82 PRIX kerner de vulgarisation PRIX KERNER DE VULGARISATION ABOU SERHAL DAOU Pascale Centre de Recherche en Cancerologie de Marseille, MARSEILLE Comment dérouter une cellule cancéreuse DAVID Alexandre Institut de Génomique Fonctionnelle, MONTPELLIER « Produco Ergo Sum » Une nouvelle approche pour isoler les cellules initiatrices de tumeur AGUERA GONZALEZ Sonia Institut Pasteur, PARIS Les gardiens de notre organisme DE FORGES Hélène Institut Curie, PARIS Intersections dans les cellules BARTOLETTI Mathieu Centre de Génétique Moléculaire, GIF-SUR-YVETTE A la découverte d’une famille de facteurs impliqués dans le contrôle de la prolifération des cellules DUFOUR Julie Clermont Université, AUBIERE Privée de cholestérol, la tumeur de la prostate fera moins la maligne BENSIMON Julie Commissariat à l’Energie Atomique, FONTENAY-AUX-ROSES Cellules souches cancéreuses et instabilité génétique : un dangereux duo à l’origine des rechutes de cancer du sein ? 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GEORGESS Dan Ecole Normale Supérieure de Lyon, LYON Une autre perspective sur les cancers CARVALHO Kevin Institut Curie, PARIS Reconstruire une cellule pour mieux la comprendre GOC Jérémy Centre de Recherche des Cordeliers, PARIS Le système immunitaire : en première ligne pour combattre la tumeur CHALIGNE Ronan Institut Curie, PARIS Les épimutations : une nouvelle cible dans le traitement du cancer ? ILBOUDO Adeodat Institut de Recherche en Santé, Environnement et Travail, RENNES Recherche d’un nouveau moyen de lutte contre le Virus de l’Hépatite C CHAPELLIER Marion Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon, LYON BMPs, le Ying et le Yang des cellules souches 85 PRIX kerner de vulgarisation POULARD Coralie Centre Léon Bérard, LYON Des points rouges qui font la différence LABUSSIERE Marianne Institut du Cerveau et de la Moelle épinière, PARIS La mutation IDH1 dans les gliomes : une mutation porteuse d’espoir RICHETTA Clémence Centre Européen de Recherche en Virologie et en Immunologie, LYON Pour comprendre le Yin et le Yang de l’autophagie: Identification des protéines régulatrices de l’autophagie MACHICOANE Mickael Institut Pasteur, PARIS Un souci commun aux parents et aux cellules : L’orientation de ses enfants RUIZ Emmanuelle Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon, LYON « Le lion et le rat » : Nouvel espoir thérapeutique contre le cancer MARMIGNON Antoine CNRS / Université Paris sud XI, GIF SUR YVETTE Petits réarrangements entre amis MARNEF Aline Université Paul Sabatier, Toulouse Les ARN non-codants pointent le bout du nez dans la cancérogénèse STEFANI Caroline Centre Méditerranéen de Médecine Moléculaire, NICE Mieux comprendre les bactéries pour soigner le cancer : une idée à creuser MOLLA HERMAN ANAHI Institut Curie, PARIS Comment l’intégrité du génome est-elle protégée de génération en génération? 86 Crédit photo : gettyimages ® - Noak Le Bar Floréal. 9 rue Guy Môquet - BP 90003 - 94 803 Villejuif Cedex - Tél. : 01 45 59 59 93 - www.arc-cancer.net