Valorisation de la tumorothèque et de la banque de muscle - AP-HM

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Valorisation de la tumorothèque et de la banque de muscle - AP-HM
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Valorisation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM
La tumorothèque et la banque de muscles de l’AP-HM ont pour mission de cryoconserver des
échantillons issus de soins pour une utilisation sanitaire, si nécessaire et de recherche après
requalification.
La tumorothèque et la banque de muscles ont été certifiées ISO 9001 fin mars 2010 jusqu’en
août 2013. La biobanque est autorisée à céder des échantillons à visée recherche depuis 2008
(dossier AC 2008-70 renouvelé en 2013 : N° 2013-1786). Sous l’égide du Canceropôle PACA
les deux tumorothèques marseillaises (IPC, AP-HM) et celle de Nice (CHU-CAL) se sont
regroupées pour être labellisées IBIZA depuis 2009 et créer un catalogue virtuel des
échantillons au sein du Canceropôle PACA (www.biobank.paca.com). De plus, les trois
tumorothèques participent au réseau européen BBMRI et sont autorisées à exporter des
prélèvements dans le cadre de cessions à des équipes en dehors du territoire français. Enfin,
depuis février 2014, un site de stockage long terme entièrement automatisé est opérationnel
sur le site de la Timone. Ce changement de locaux et d’organisation expliquent le nonrenouvellement de la certification en 2014. Une nouvelle demande d’accrédiation est engagée.
Cette activité de biobanking doit être valorisée au travers de différentes actions. Ceci est
rapporté dans le présent document pour les années 2007-2015
Tout d’abord, il est nécessaire de communiquer auprès de différentes instances sur l’existence
et les missions de la biobanque. Ceci est rapporté dans le premier paragraphe intitulé
« Actions de communications et publications relatives à l’activité de cryoconservation de la
tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM ».
Par ailleurs, les échantillons utilisés dans le cadre du soin peuvent faire l’objet d’analyses
biologiques qui seront secondairement publiées. De même, il est important que les
échantillons cédés dans le cadre de la recherche puissent permettre des travaux de recherche
dont les résultats seront publiés. En effet, compte tenu de la préciosité des échantillons, il est
particulièrement important qu’ils soient utilisés de la façon la plus optimale possible. Dans ce
contexte, le paragraphe II du présent document rapporte le listing des publications réalisées à
partir des échantillons cédés par la biobanque. Par ailleurs, tout échantillon cédé dans le cadre
de la recherche nécessite au préalable le dépôt d’une demande de cession argumentée et
approuvée secondairement par le Comité Scientifique.
Le paragraphe III rapporte le listing des cessions pour la période 2007-2015 dans le cadre de
la recherche, ainsi que les publications dont elles ont fait l’objet.
Enfin, la participation de la tumorothèque à des réseaux de soins ou à des projets
multicentriques est rapportée dans le paragraphe IV.
1
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I – Actions de communications, rapports d’activité et publications relatives
à l’activité de cryoconservation de la tumorothèque et de la banque de
muscles de l’AP-HM
1. Auprès des organismes de tutelles
2007
Présentation de l’activité de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM auprès
du conseil exécutif de l’AP-HM – 24 Septembre 2007 – D. Figarella-Branger
2008
Nouvelle présentation de l’activité de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’APHM auprès du conseil exécutif de l’AP-HM en vu de la construction d’un site de stockage
long terme – 11 Février 2008 – D. Figarella-Branger
2009
Présentation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM auprès du centre de
coordination en cancérologie (3 C) – Février 2009 – D. Figarella-Branger
2010
Présentation des tumorothèques de Marseille (AP-HM, IPC) lors de la visite AERES de
l’Université – D. Figarella-Branger
2011
Tumorothèque-organisation en région PACA ONCOPACA (3C) – Dr C. Chabanon
Réunion Régionale de Cancérologie
Cancéropôle : l’enjeu des tumorothèques
La lettre de l’Université de la Méditerranée – Décembre 2011
2013
Action de communication à l’occasion des 10 ans du cancéropôle PACA – 13 Février 2013
2014
Présentation de la tumorothèque et de la banque de muscles au nouveau bureau de la direction
de la recherche et de l’innovation de l’AP-HM – 24 Septembre 2014 – D. Figarella-Branger
2. Auprès des patients et des associations de patients
2007
Présentation auprès de l’Association pour la Recherche sur les Tumeurs Cérébrales (ARTC
Sud) – 12 Avril 2007 – D. Figarella-Branger
2008
Présentation du nouveau centre de recherche en oncologie et oncopharmacologie (CRO2) et
de l’intérêt des ressources biologiques. Plaquettes d’information de l’ARTC Sud « Le lien »
2008 – D. Figarella-Branger
2
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2009
La tumorothèque de l’Assistance Publique des hôpitaux de Marseille. Plaquette d’information
de l’ARTC Sud « Le lien » – Octobre 2009
2010
Lettre d’information POLA n°1 – Mars 2010
2011
Lettre d’information POLA n°2 – Mars 2011
2012
Présentation du Cancéropôle PACA et des tumorothèques PACA, par le biais du film « Du
bloc
opératoire
au
laboratoire,
chronique
d’un échantillon
biologique » :
http://vimeo.com/44252496.
Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » n°7 – Octobre 2012
2013
Lettre d’information POLA n°3 – 2013
Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » n°8 – Octobre 2013
2014
Lettre d’information POLA n°4 – Novembre 2014
Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » n°9 – Octobre 2014
2015
Lettre d’information POLA n°5 – Novembre 2015
3. Site Web, plaquettes d’informations grand public
-
-
Site Web du cancéropôle PACA : http://canceropole-paca.com/
Site Web de l’AP-HM volet recherche
Site Web de l’ARTC-Sud : http://www.artcsud.fr/ lien vers la tumorothèque dans l’onglet
Recherche
Site Web de la Base Clinico-Biologique de Glioblastomes (BCB-G) : http://www.frenchglioblastoma-biobank.com/
Information sur la tumorothèque dans le dossier patient AP-HM
Plaquettes éditées par le cancéropôle PACA :
« La conservation d’échantillons biologiques provenant d’individus suspects ou atteints de
cancer : un effort collectif au service des malades et de la science. »
« The virtual PACA tumour bank: a catalogue of biological collections held within the
canceropole PACA. »
« Le patient, acteur de la recherche en cancérologie. »
Réalisation du film « Du bloc opératoire au laboratoire, chronique d’un échantillon
biologique »
Rapports d’activités INCa-DGOS
De 2010 à 2014, la tumorothèque de l’AP-HM a fourni à l’INCa un rapport d’activité.
3
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-
En 2014, la DGOS a adressé à l’AP-HM un questionnaire concernant les CRB en vu de
l’établissement des subventions MERRI. Une réponse commune a été adressée à la DGOS
concernant ce questionnaire (cf infra).
4. Manifestations scientifiques
 Congrès
2006
Tumorothèque et CRB
Société française de neuropathologie – Mars 2006 – D. Figarella-Branger
2008
Chabannon C, Figarella-Branger D, Martin PM, Hofman P, Birtwisle-Peyrotte I, Romain S,
Achache K, Honstettre A, Daufresne LM, Mery O, Bordonne O, Bonnetaud C, Ducord C,
Vaglio P, Jacotot L, D’Arnoux C, Atger V. The Canceropole PACA: Virtual tumor
bank.International Cancer Genome Consortium-15-17 Novembre 2008 – Bethesda – USA
2009
Journée intercancéropôle PACA et GSO
Les tumorothèques des ressources biologiques indispensables à la recherche. Quels enjeux ?
Quelles contraintes ? – Montpellier 12 mai 2009
Format d’échanges des informations entre tumorothèques : une brève histoire – C. Chabannon
2011
Le Club des utilisateurs de l’outil Modul-Bio, le 15 Novembre 2011 (en parallèle du
symposium "Les collections biologiques un enjeu structurant dans les Cancéropôles", 15-16
nov. 2011)
2012
Groupe de Travail Tumorothèques - Cancéropôle PACA, le 25 Juin 2012
2015
11èmes journées Cancéropôle GSO, les 5 et 6 novembre 2015. Tables rondes : Bases de
données clinicobiologiques : enjeux et perspectives des différentes BCB du GSO, BCB
Glioblastomes – Luc BAUCHET, CHU, Montpellier
 Publications
2006
1
Chabannon C, Lassailly F, Romain S, Xerri L, Bonavita MJ, Atger V, Bernard JP,
Maraninchi D, Figarella-Branger D, Martin PM. [The consortium of Biological Resource
Centres (BRC) and tumour cell and tissue banks in the Marseilles metropolitan area]. Med Sci
(Paris) 2006; 22 Spec No 1: 26-31
2
Figarella-Branger D, Colin C, Chinot O, Nanni I, Baeza N, Fina F, Tong S, Eudes N,
Quilichini B, Romain S, Metellus P, Fuentes S, Barrie M, Boucard C, Fraslon C, Bonavita
MJ, Martin PM, Ouafik L. [AP-HM tumour tissue bank: molecular signature of gliomas].
Med Sci (Paris) 2006; 22 Spec No 1: 54-9
4
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2009
3
Delplanque D, Birraux G, Bertoye PH, Postaire E, et les participants à la table ronde
n°7 de Giens XXIV. Collections d’échantillons biologiques humains à visée scientifique.
Pourquoi et comment clarifier la réglementation actuelle ? Thérapie 2009 ; 64 (3) : 215-24
2010
4
Chabannon C, Honstettre A, Daufresne LM, Martin PM, Bonnetaud C, BirtwislePeyrottes I, Romain S, Achache K, Mery O, Bordonne O, Ducord C, Jacotot L, Vaglio P,
d'Arnoux C, Figarella-Branger D, Hofman P, Borg JP, Atger V. [Publication of biological
samples collections catalogues by tumor banks]. Bull Cancer 2010; 97: 181-9
5
Hofman V, Bonnetaud C, Gaziello MC, Ilie M, Lassalle S, Butori C, Lerda N, Selva
E, Gavric-Tanga V, Castillo L, Guevara N, Santini J, Pop D, Venissac N, Mouroux J,
Chabannon C, Hofman P. [The Nice CHU biobank experience to collect patients' informed
consent for research context (2004-2009)]. Ann Pathol 2010; 30: 337-43
2011
6
Lassalle S, Hofman V, Ilie M, Butori C, Bonnetaud C, Gaziello MC, Selva E, GavricTanga V, Guevara N, Castillo L, Santini J, Chabannon C, Hofman P. Setting up a Prospective
Thyroid Biobank for Translational Research: Practical Approach of a Single Institution (20042009, Pasteur Hospital, Nice, France). Biopreserv Biobank 2011; 9: 9-19
7
Chabannon C, Doran P, Hofman P, Seberg O, Cinotti S, Bledsoe M, Deigner HP,
Koschorreck J, Dagher G, Cooreman A, De Blasio P, Riegman P, Hewitt R. Annual
Conferences of the European, Middle Eastern and African Society for Biopreservation and
Biobanking (ESBB): overview of 2011 and preview of 2012. Biopreserv Biobank 2012; 10:
407-15
2012
8
Hofman V, Gaziello MC, Bonnetaud C, Ilie M, Mauro V, Long E, Selva E, GavricTanga V, Lassalle S, Butori C, Papin-Michaud C, Lerda N, Bordone O, Coelle C, Sabourin
JC, Chabannon C, Hofman P. [Setting up indicators in biobanking: why and how?]. Ann
Pathol 2012; 32: 91-101
9
Pellegrini I, Chabannon C, Mancini J, Viret F, Vey N, Julian-Reynier C. Contributing
to research via biobanks: what it means to cancer patients. Health Expect 2012; 17: 523-33
2013
10
Hofman V, Ilie M, Long E, Washetine K, Chabannon C, Figarella-Branger D, Clement
B, Mabile L, Cambon-Thomsen A, Boucher P, Dagher G, Hewitt R, Parodi B, Hofman P.
Measuring the contribution of tumor biobanks to research in oncology: surrogate indicators
and bibliographic output. Biopreserv Biobank 2013; 11: 235-44
11
Lawlor RT, Sluss PM, Langer R, Sughayer MA, Igbe MA, Siddiqui K, De Blasio P,
Duma B, Mendy M, Chabannon C, Ibrahim M. European, Middle Eastern, and African
5
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Society for Biopreservation and Biobanking (ESBB). 2012 Conference Session on
Biobanking in Emerging Countries. Biopreserv Biobank 2013; 11: 176-81
2014
12
Menei P, Figarella-Branger D, Bauchet L, Loiseau H, Denyset M, Roman T, Dehais C,
Delattre JY. French research infrastructures to develop and validate glioma biomarkers.
Neurosurgery 2014; 75: E195-6
6
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II – Publications réalisées avec les ressources biologiques de l’AP-HM
-
-
La (les) section(s) de la publication dans la(les)quelle(s) la Biobanque est citée est (sont)
précisée(s) en italique, entre parenthèses. Si la Biobanque n’est pas mentionnée, cela est
indiqué par un astérisque (*).
L’impact factor (IF) pour les années 2008-2015 est donné en gras entre crochets. Pour les
années suivantes l’IF correspond à l’année de publication.
1. Banque de muscles
A noter que certaines publications sont issues au départ d’analyses réalisées dans le
cadre du sanitaire, d’autres sont issues de cessions réalisées dans le cadre de la recheche.
2008
1
Amati-Bonneau P, Valentino ML, Reynier P, Gallardo ME, Bornstein B, Boissiere A,
Campos Y, Rivera H, de la Aleja JG, Carroccia R, Iommarini L, Labauge P, FigarellaBranger D, Marcorelles P, Furby A, Beauvais K, Letournel F, Liguori R, La Morgia C,
Montagna P, Liguori M, Zanna C, Rugolo M, Cossarizza A, Wissinger B, Verny C,
Schwarzenbacher R, Martin MA, Arenas J, Ayuso C, Garesse R, Lenaers G, Bonneau D,
Carelli V. OPA1 mutations induce mitochondrial DNA instability and optic atrophy 'plus'
phenotypes. Brain 2008; 131: 338-51 (*)
[IF : 9.196]
2
Schleinitz N, Cognet C, Guia S, Laugier-Anfossi F, Baratin M, Pouget J, Pelissier JF,
Harle JR, Vivier E, Figarella-Branger D. Expression of the CD85j (leukocyte Ig-like receptor
1, Ig-like transcript 2) receptor for class I major histocompatibility complex molecules in
idiopathic inflammatory myopathies. Arthritis Rheum 2008; 58: 3216-23 (*)
[IF : 7.764]
2009
3
De Paula AM, Franques J, Fernandez C, Monnier N, Lunardi J, Pellissier JF,
Figarella-Branger D, Pouget J. A TPM3 mutation causing cap myopathy. Neuromuscul
Disord 2009; 19: 685-8 (*)
[IF : 2.638]
4
Krahn M, Beroud C, Labelle V, Nguyen K, Bernard R, Bassez G, Figarella-Branger D,
Fernandez C, Bouvenot J, Richard I, Ollagnon-Roman E, Bevilacqua JA, Salvo E, Attarian S,
Chapon F, Pellissier JF, Pouget J, Hammouda el H, Laforet P, Urtizberea JA, Eymard B,
Leturcq F, Levy N. Analysis of the DYSF mutational spectrum in a large cohort of patients.
Hum Mutat 2009; 30: E345-75 (*)
[IF : 5.34]
2010
5
Claeys KG, Pellissier JF, Garcia-Bragado F, Weis J, Urtizberea A, Poza JJ, Cobo AM,
Stoltenburg G, Figarella-Branger D, Willems PJ, Depuydt CE, Kleiner W, Pouget J, Piraud
M, Brochier G, Romero NB, Fardeau M, Goebel HH, Bonnemann CG, Voit T, Eymard B,
Laforet P. Myopathy with hexagonally cross-linked crystalloid inclusions: delineation of a
clinico-pathological entity. Neuromuscul Disord 2010; 20: 701-8 (*)
[IF : 2.638]
7
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6
Fernandez C, Halbert C, De Paula AM, Lacroze V, Froissart R, Figarella-Branger D,
Chabrol B, Pellissier JF. Non-lethal neonatal neuromuscular variant of glycogenosis type IV
with novel GBE1 mutations. Muscle Nerve 2010; 41: 269-71 (*)
[IF : 2.283]
2011
7
Lehtokari VL, Pelin K, Herczegfalvi A, Karcagi V, Pouget J, Franques J, Pellissier JF,
Figarella-Branger D, von der Hagen M, Huebner A, Schoser B, Lochmuller H, WallgrenPettersson C. Nemaline myopathy caused by mutations in the nebulin gene may present as a
distal myopathy. Neuromuscul Disord 2011; 21: 556-62 (*)
[IF : 2.638]
2012
8
De Paula AM, Bartoli M, Courrier S, Pouget J, Levy N, Pellissier JF, FigarellaBranger D, Krahn M, Attarian S. Further heterogeneity in myopathy with tubular aggregates?
Muscle Nerve 2012; 46: 984-5 (*)
[IF : 2.283]
2013
9
Bohm J, Chevessier F, Maues De Paula A, Koch C, Attarian S, Feger C, Hantai D,
Laforet P, Ghorab K, Vallat JM, Fardeau M, Figarella-Branger D, Pouget J, Romero NB,
Koch M, Ebel C, Levy N, Krahn M, Eymard B, Bartoli M, Laporte J. Constitutive activation
of the calcium sensor STIM1 causes tubular-aggregate myopathy. Am J Hum Genet 2013; 92:
271-8 (*)
[IF : 10.931]
10
Ebbo M, Chagnaud C, Figarella-Branger D, Legall S, Harle JR, Schleinitz N.
Antisynthethase syndrome presenting as peripheral limb fasciitis. Joint Bone Spine 2013; 80:
528-30 (*)
[IF : 2.901]
11
Fernandez C, Bardin N, De Paula AM, Salort-Campana E, Benyamine A, Franques J,
Schleinitz N, Weiller PJ, Pouget J, Pellissier JF, Figarella-Branger D. Correlation of
clinicoserologic and pathologic classifications of inflammatory myopathies: study of 178
cases and guidelines for diagnosis. Medicine (Baltimore) 2013; 92: 15-24 (*)
[IF : 4.256]
12
Malfatti E, Olive M, Taratuto AL, Richard P, Brochier G, Bitoun M, Gueneau L,
Laforet P, Stojkovic T, Maisonobe T, Monges S, Lubieniecki F, Vasquez G, Streichenberger
N, Lacene E, Saccoliti M, Prudhon B, Alexianu M, Figarella-Branger D, Schessl J,
Bonnemann C, Eymard B, Fardeau M, Bonne G, Romero NB. Skeletal muscle biopsy
analysis in reducing body myopathy and other FHL1-related disorders. J Neuropathol Exp
Neurol 2013; 72: 833-45 (*)
[IF : 3.797]
13
Mercier S, Kury S, Shaboodien G, Houniet DT, Khumalo NP, Bou-Hanna C, Bodak
N, Cormier-Daire V, David A, Faivre L, Figarella-Branger D, Gherardi RK, Glen E, Hamel
A, Laboisse C, Le Caignec C, Lindenbaum P, Magot A, Munnich A, Mussini JM, Pillay K,
Rahman T, Redon R, Salort-Campana E, Santibanez-Koref M, Thauvin C, Barbarot S,
Keavney B, Bezieau S, Mayosi BM. Mutations in FAM111B cause hereditary fibrosing
poikiloderma with tendon contracture, myopathy, and pulmonary fibrosis. Am J Hum Genet
2014; 93: 1100-7 (*)
[IF : 10.931]
2014
8
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14
Sevy A, Cerino M, Gorokhova S, Dionnet E, Mathieu Y, Verschueren A, Franques J,
Maues de Paula A, Figarella-Branger D, Lagarde A, Desvignes JP, Béroud C, Attarian S,
Levy N, Bartoli M, Krahn M, Campana-Salort E, Pouget J. Improving molecular diagnosis of
distal myopathies by targeted next-generation sequencing. J Neurol Neurosurg Psychiatry
2015; 87: 340-42 (*)
[IF : 6.807]
2. Tumorothèque
2008
1
Acunzo J, Thirion S, Roche C, Saveanu A, Gunz G, Germanetti AL, Couderc B,
Cohen R, Figarella-Branger D, Dufour H, Brue T, Enjalbert A, Barlier A. Somatostatin
receptor sst2 decreases cell viability and hormonal hypersecretion and reverses octreotide
resistance of human pituitary adenomas. Cancer Res 2008; 68: 10163-70 (*)
[IF : 9.329]
2
Fevre-Montange M, Szathmari A, Champier J, Mokhtari K, Chretien F, Coulon A,
Figarella-Branger D, Polivka M, Varlet P, Uro-Coste E, Fauchon F, Jouvet A. Pineocytoma
and pineal parenchymal tumors of intermediate differentiation presenting cytologic
pleomorphism: a multicenter study. Brain Pathol 2008; 18: 354-9 (*)
[IF : 4.643]
3
Metellus P, Figarella-Branger D, Guyotat J, Barrie M, Giorgi R, Jouvet A, Chinot O.
Supratentorial ependymomas: prognostic factors and outcome analysis in a retrospective
series of 46 adult patients. Cancer 2008; 113: 175-85 (Matériel et Méthodes)
[IF : 5.068]
4
Metellus P, Nanni I, Dussert C, Trinkhaus M, Fuentes S, Chinot O, Ouafik LH, Fina F,
Dufour H, Figarella-Branger D, Grisoli F, Lah TT, Martin PM. [Prognostic implications of
biologic markers in intracranial meningiomas: 120 cases]. Neurochirurgie 2008; 54: 750-6 (*)
[IF : 0.406]
5
Trouillas J, Labat-Moleur F, Sturm N, Kujas M, Heymann MF, Figarella-Branger D,
Patey M, Mazucca M, Decullier E, Verges B, Chabre O, Calender A. Pituitary tumors and
hyperplasia in multiple endocrine neoplasia type 1 syndrome (MEN1): a case-control study in
a series of 77 patients versus 2509 non-MEN1 patients. Am J Surg Pathol 2008; 32: 534-43(*)
[IF : 4.592]
2009
6
Aubert S, Wendling F, Regis J, McGonigal A, Figarella-Branger D, Peragut JC, Girard
N, Chauvel P, Bartolomei F. Local and remote epileptogenicity in focal cortical dysplasias
and neurodevelopmental tumours. Brain 2009; 132: 3072-86 (*)
[IF : 9.196]
7
Barlesi F, Nanni-Metellus I, Breen D, Fina F, Astoul P, Martin PM. Non-small cell
lung cancer-smokers or non-smokers, does it matter? Lung Cancer 2009; 63: 430-2 (*)
[IF : 3.958]
8
Colin C, Voutsinos-Porche B, Nanni I, Fina F, Metellus P, Intagliata D, Baeza N,
Bouvier C, Delfino C, Loundou A, Chinot O, Lah T, Kos J, Martin PM, Ouafik L, FigarellaBranger D. High expression of cathepsin B and plasminogen activator inhibitor type-1 are
strong predictors of survival in glioblastomas. Acta Neuropathol 2009; 118: 745-54
(Remerciements)
[IF : 10.762]
9
Dernière mise à jour : 29/06/2016
9
Deville JL, Bartoli C, Berenguer C, Fernandez-Sauze S, Kaafarani I, Delfino C, Fina
F, Salas S, Muracciole X, Mancini J, Lechevallier E, Martin PM, Figarella-Branger D, Ouafik
L, Daniel L. Expression and role of adrenomedullin in renal tumors and value of its mRNA
levels as prognostic factor in clear-cell renal carcinoma. Int J Cancer 2009; 125: 2307-15 (*)
[IF : 5.085]
10
Guyotat J, Metellus P, Giorgi R, Barrie M, Jouvet A, Fevre-Montange M, Chinot O,
Durand A, Figarella-Branger D. Infratentorial ependymomas: prognostic factors and outcome
analysis in a multi-center retrospective series of 106 adult patients. Acta Neurochir (Wien)
2009; 151: 947-60 (*)
[IF : 1.766]
11
Metellus P, Coulibaly B, Nanni I, Fina F, Eudes N, Giorgi R, Barrie M, Chinot O,
Fuentes S, Dufour H, Ouafik L, Figarella-Branger D. Prognostic impact of O6methylguanine-DNA methyltransferase silencing in patients with recurrent glioblastoma
multiforme who undergo surgery and carmustine wafer implantation: a prospective patient
cohort. Cancer 2009; 115: 4783-94 (*)
[IF : 5.068]
12
Palm T, Figarella-Branger D, Chapon F, Lacroix C, Gray F, Scaravilli F, Ellison DW,
Salmon I, Vikkula M, Godfraind C. Expression profiling of ependymomas unravels
localization and tumor grade-specific tumorigenesis. Cancer 2009; 115: 3955-68 (*)
[IF : 5.068]
13
Salas S, Jezequel P, Campion L, Deville JL, Chibon F, Bartoli C, Gentet JC,
Charbonnel C, Gouraud W, Voutsinos-Porche B, Brouchet A, Duffaud F, Figarella-Branger
D, Bouvier C. Molecular characterization of the response to chemotherapy in conventional
osteosarcomas: predictive value of HSD17B10 and IFITM2. Int J Cancer 2009; 125: 851-60
(Remerciements)
[IF : 5.085]
14
Tchoghandjian A, Fernandez C, Colin C, El Ayachi I, Voutsinos-Porche B, Fina F,
Scavarda D, Piercecchi-Marti MD, Intagliata D, Ouafik L, Fraslon-Vanhulle C, FigarellaBranger D. Pilocytic astrocytoma of the optic pathway: a tumour deriving from radial glia
cells with a specific gene signature. Brain 2009; 132: 1523-35 (Matériel et Méthodes,
Remerciements)
[IF : 9.196]
2010
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methyltransferase and promotes temozolomide responsiveness. Cancer Biol Ther 2014; 15:
938-50 (Remerciements)
[IF : 3.072]
75
Bruno A, Boisselier B, Labreche K, Marie Y, Polivka M, Jouvet A, Adam C,
Figarella-Branger D, Miquel C, Eimer S, Houillier C, Soussain C, Mokhtari K, Daveau R,
Hoang-Xuan K. Mutational analysis of primary central nervous system lymphoma.
Oncotarget 2014; 5: 5065-75 (Affiliations)
[IF : 6.368]
76
Darlix A, Zouaoui S, Virion JM, Rigau V, Mathieu-Daude H, Blonski M, ReyesBotero G, Bessaoud F, Tretarre B, Bauchet F, Capelle L, Fabbro M, Kerr C, Figarella-Branger
D, Duffau H, Taillandier L, Bauchet L. Significant heterogeneity in the geographical
distribution of diffuse grade II/III gliomas in France. J Neurooncol 2014; 120: 547-55 (*)
[IF : 3.070]
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Delattre JY, Dehais C, Ducray F, Figarella-Branger D. [POLA network: a national
network for high-grade oligodendroglial tumors]. Rev Neurol (Paris). 2014; 170(11):643-645.
(*)
[IF : 0.663]
78
Denicolai E, Baeza-Kallee N, Tchoghandjian A, Carre M, Colin C, Jiglaire CJ,
Mercurio S, Beclin C, Figarella-Branger D. Proscillaridin A is cytotoxic for glioblastoma cell
lines and controls tumor xenograft growth in vivo. Oncotarget 2014; 5: 10934-48 (Matériel et
Méthodes)
[IF : 6.368]
79
Etcheverry A, Aubry M, Idbaih A, Vauleon E, Marie Y, Menei P, Boniface R,
Figarella-Branger D, Karayan-Tapon L, Quillien V, Sanson M, de Tayrac M, Delattre JY,
Mosser J. DGKI Methylation Status Modulates the Prognostic Value of MGMT in
Glioblastoma Patients Treated with Combined Radio-Chemotherapy with Temozolomide.
PLoS One 2014; 9: e104455 (Matériel et Méthodes, Remerciements)
[IF : 3.234]
80
Figarella-Branger D, Mokhtari K, Dehais C, Jouvet A, Uro-Coste E, Colin C,
Carpentier C, Forest F, Maurage CA, Vignaud JM, Polivka M, Lechapt-Zalcman E, Eimer S,
Viennet G, Quintin-Roue I, Aubriot-Lorton MH, Diebold MD, Loussouarn D, Lacroix C,
Rigau V, Laquerriere A, Vandenbos F, Michalak S, Sevestre H, Peoch M, Labrousse F,
Christov C, Kemeny JL, Chenard MP, Chiforeanu D, Ducray F, Idbaih A. Mitotic index,
microvascular proliferation, and necrosis define 3 groups of 1p/19q codeleted anaplastic
17
Dernière mise à jour : 29/06/2016
oligodendrogliomas associated with different genomic alterations. Neuro Oncol 2014; 16:
1244-54 (Remerciements)
[IF : 6.776]
81
Joubert C, Boissonneau S, Faguer R, Fina F, Adetchessi T, Fuentes S, Dufour H,
Metellus P. Discordance d’expression du récepteur du facteur de croissance épidermique de
type 2 (HER2) et des récepteurs hormonaux entre les lésions primitives de cancer du sein et
leurs métastases cérébrales Neurochirurgie 2014; 60: 332-3 (*)
[IF : 0.406]
82
Laffaire J, Di Stefano AL, Chinot O, Idbaih A, Gallego Perez-Larraya J, Marie Y,
Vintonenko N, Boisselier B, Farina P, Delattre JY, Figarella-Branger D, Honnorat J, Sanson
M, Ducray F. An ANOCEF genomic and transcriptomic microarray study of the response to
irinotecan and bevacizumab in recurrent glioblastomas. Biomed Res Int 2014; 2014: 282815
(Remerciements)
[IF : 1.579]
83
Lagarde S, Tabouret E, Matta M, Franques J, Attarian S, Pouget J, Maues De Paula A,
Figarella-Branger D, Dory-Lautrec P, Chinot O, Barrie M. Primary neurolymphomatosis
diagnosis and treatment: a retrospective study. J Neurol Sci 2014; 342: 178-81
(Remerciements)
[IF : 2.474]
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Maues De Paula A, Vasiljevic A, Giorgi R, Gomez-Brouchet A, Aubert S, Leroy X,
Duval H, de Pinieux G, Bouvier C. A diagnosis of giant cell-rich tumour of bone is supported
by p63 immunohistochemistry, when more than 50 % of cells is stained. Virchows Arch
2014; 465: 487-94 (Remerciements)
[IF : 2.651]
85
Mear Y, Blanchard MP, Defilles C, Brue T, Figarella-Branger D, Graillon T,
Manavela M, Barlier A, Enjalbert A, Thirion S. Ghrelin receptor (GHS-R1a) and its
constitutive activity in somatotroph adenomas: a new co-targeting therapy using GHS-R1a
inverse agonists and somatostatin analogs. J Clin Endocrinol Metab 2014; 99: E2463-71
(Remerciements)
[IF : 6.209]
86
Pallud J, Audureau E, Noel G, Lechapt-Zalcman E, Duntze J, Guyotat J, Dam-Hieu P,
Le Reste PJ, Faillot T, Litre F, Desse N, Petit A, Emery E, Voirin J, Peltier J, Caire F, Vignes
JR, Barat JL, Langlois O, Dezamis E, Pavlov V, Lefranc M, Bauchet L, Devaux B, Menei P,
Metellus P. Long-term results of carmustine wafers implantation for newly-diagnosed
glioblastomas in France: Controlled propensity matched multicenter cohort study.
Neurochirurgie 2014; 60: 330 (*)
[IF : 0.406]
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Quillien V, Lavenu A, Sanson M, Legrain M, Dubus P, Karayan-Tapon L, Mosser J,
Ichimura K, Figarella-Branger D. Outcome-based determination of optimal pyrosequencing
assay for MGMT methylation detection in glioblastoma patients. J Neurooncol 2014; 116:
487-96 (Remerciements)
[IF : 3.070]
88
Reyes-Botero G, Dehais C, Idbaih A, Martin-Duverneuil N, Lahutte M, Carpentier C,
Letouze E, Chinot O, Loiseau H, Honnorat J, Ramirez C, Moyal E, Figarella-Branger D,
Ducray F. Contrast enhancement in 1p/19q-codeleted anaplastic oligodendrogliomas is
associated with 9p loss, genomic instability, and angiogenic gene expression. Neuro Oncol
2014; 16: 662-70 (Matériel et Méthodes)
[IF : 6.776]
89
Salas S, Jiguet-Jiglaire C, Campion L, Bartoli C, Frassineti F, Deville JL, Maues De
Paula A, Forest F, Jezequel P, Gentet JC, Bouvier C. Correlation between ERK1 and STAT3
18
Dernière mise à jour : 29/06/2016
expression and chemoresistance in patients with conventional osteosarcoma. BMC Cancer
2014; 14: 606 (Matériel et Méthodes)
[IF : 3.36]
90
Secq V, Villeret J, Fina F, Carmassi M, Carcopino X, Garcia S, Metellus I, Boubli L,
Iovanna J, Charpin C. Triple negative breast carcinoma EGFR amplification is not associated
with EGFR, Kras or ALK mutations. Br J Cancer 2014; 110: 1045-52 (*)
[IF : 4.836]
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Tabouret E, Fina F, Vincentelli F, Nanni I, Figarella-Branger D. New IDH1 I113T
mutation associated with BRAF V600E mutation: new driver of gliomagenesis? J Neurol Sci
2014; 342: 204-6 (Matériel et Méthodes)
[IF : 2.474]
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Tabouret E, Boudouresque F, Barrie M, Matta M, Boucard C, Loundou A, Carpentier
A, Sanson M, Metellus P, Figarella-Branger D, Ouafik L, Chinot O. Association of matrix
metalloproteinase 2 plasma level with response and survival in patients treated with
bevacizumab for recurrent high-grade glioma. Neuro Oncol 2014; 16: 392-9 (*) [IF : 6.776]
2015
93
Alentorn A, Dehais C, Ducray F, Carpentier C, Mokhtari K, Figarella-Branger D,
Chinot O, Cohen-Moyal E, Ramirez C, Loiseau H, Elouahdani-Hamdi S, Beauchesne P,
Langlois O, Desenclos C, Guillamo JS, Dam-Hieu P, Ghiringhelli F, Colin P, Godard J,
Parker F, Dhermain F, Carpentier AF, Frenel JS, Menei P, Bauchet L, Faillot T, Fesneau M,
Fontaine D, Motuo-Fotso MJ, Vauleon E, Gaultier C, Le Guerinel C, Gueye EM, Noel G,
Desse N, Durando X, Barrascout E, Wager M, Ricard D, Carpiuc I, Delattre JY, Idbaih A;
POLA Network. Allelic loss of 9p21.3 is a prognostic factor in 1p/19q codeleted anaplastic
gliomas. Neurology 2015; 85: 1325-31 (*)
[IF : 8.286]
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Bielle F, Villa C, Giry M, Bergemer-Fouquet AM, Polivka M, Vasiljevic A, AubriotLorton MH, Bernier M, Lechapt-Zalcman E, Viennet G, Sazdovitch V, Duyckaerts C, Sanson
M, Figarella-Branger D, Mokhtari K; RENOP. Chordoid gliomas of the third ventricle share
TTF-1 expression with organum vasculosum of the lamina terminalis. Am J Surg Pathol
2015; 39: 948-56 (Remerciements)
[IF : 4.592]
95
Bruno A, Alentorn A, Daniau M, Labussière M, Rahimian A, Tabouret E, Polivka M,
Jouvet A, Adam C, Figarella-Branger D, Chrétien F, Eimer S, Houillier C, Soussain C,
Mokhtari K, Hoang-Xuan K. TERT promoter mutations in primary central nervous system
lymphoma are associated with spatial distribution in the splenium. Acta Neuropathol 2015;
130: 439-40 (Affiliations)
[IF : 10.762]
96
Clifford SC, Lannering B, Schwalbe EC, Hicks D, O'Toole K, Nicholson SL,
Goschzik T, Zur Mühlen A, Figarella-Branger D, Doz F, Rutkowski S, Gustafsson G, Pietsch
T; SIOP-Europe PNET Group. Biomarker-driven stratification of disease-risk in nonmetastatic medulloblastoma: Results from the multi-center HIT-SIOP-PNET4 clinical trial.
Oncotarget 2015; 6: 38827-39 (*)
[IF : 6.368]
97
Figarella-Branger D, Mokhtari K, Colin C, Uro-Coste E, Jouvet A, Dehais C,
Carpentier C, Villa C, Maurage CA, Eimer S, Polivka M, Vignaud JM, Laquerriere A,
Sevestre H, Lechapt-Zalcman E, Quintin-Roue I, Aubriot-Lorton MH, Diebold MD, Viennet
G, Adam C, Loussouarn D, Michalak S, Rigau V, Heitzmann A, Vandenbos F, Forest F,
Chiforeanu D, Tortel MC, Labrousse F, Chenard MP, Nguyen AT, Varlet P, Kemeny JL,
Levillain PM, Cazals-Hatem D, Richard P, Delattre JY. Prognostic relevance of
19
Dernière mise à jour : 29/06/2016
histomolecular classification of diffuse adult high grade gliomas with necrosis. Brain Pathol
2015; 25: 418-28 (Remerciements)
[IF : 4.643]
98
Graillon T, Defilles C, Mohamed A, Lisbonis C, Germanetti AL, Chinot O, FigarellaBranger D, Roche PH, Adetchessi T, Fuentes S, Metellus P, Dufour H, Enjalbert A, Barlier A.
Combined treatment by octreotide and everolimus: Octreotide enhances inhibitory effect of
everolimus in aggressive meningiomas. J Neurooncol 2015; 124: 33-43 (Remerciements)
[IF : 3.070]
99
Jullien N, Roche C, Brue T, Figarella-Branger D, Graillon T, Barlier A, Herman JP.
Dose-dependent dual role of PIT-1 (POU1F1) in somatolactotroph cell proliferation and
apoptosis. PLoS One 2015; 10: e0120010 (Remerciements)
[IF : 3.234]
100 Labreche K, Simeonova I, Kamoun A, Gleize V, Chubb D, Letouzé E, Riazalhosseini
Y, Dobbins SE, Elarouci N, Ducray F, de Reyniès A, Zelenika D, Wardell CP, Frampton M,
Saulnier O, Pastinen T, Hallout S, Figarella-Branger D, Dehais C, Idbaih A, Mokhtari K,
Delattre JY, Huillard E, Mark Lathrop G, Sanson M, Houlston RS; POLA Network. TCF12 is
mutated in anaplastic oligodendroglioma. Nat Commun 2015; 6: 7207 (*)
[IF : 11.470]
101 Martinez E, Silvy F, Fina F, Bartoli M, Krahn M, Barlesi F, Figarella-Branger D,
Iovanna J, Laugier R, Ouaissi M, Lombardo D, Mas E. Rs488087 single nucleotide
polymorphism as predictive risk factor for pancreatic cancers. Oncotarget 2015; 6: 39855-64
(Matériels et Méthodes)
[IF : 6.368]
102 Tabareau-Delalande F, Collin C, Gomez-Brouchet A, Bouvier C, Decouvelaere AV,
de Muret A, Pagès JC, de Pinieux G. Chromosome 12 long arm rearrangement covering
MDM2 and RASAL1 is associated with aggressive craniofacial juvenile ossifying fibroma
and extracranial psammomatoid fibro-osseous lesions. Mod Pathol 2015; 28: 48-56 (*)
[IF : 6.187]
103 Tabouret E, Tchoghandjian A, Denicolai E, Delfino C, Metellus P, Graillon T,
Boucard C, Nanni I, Padovani L, Ouafik L, Figarella-Branger D, Chinot O. Recurrence of
glioblastoma after radio-chemotherapy is associated with an angiogenic switch to the
CXCL12-CXCR4 pathway.Oncotarget 2015; 6: 11664-75 (Patients et Méthodes) [IF : 6.368]
104 Vera-Bolanos E, Aldape K, Yuan Y, Wu J, Wani K, Necesito-Reyes MJ, Colman H,
Dhall G, Lieberman FS, Metellus P, Mikkelsen T, Omuro A, Partap S, Prados M, Robins HI,
Soffietti R, Wu J, Gilbert MR, Armstrong TS. Clinical course and progression-free survival of
adult intracranial and spinal ependymoma patients. Neuro Oncol 2015; 17: 440-7(*)
[IF : 6.776]
2016
105 Denicolaï E, Tabouret E, Colin C, Metellus P, Nanni I, Boucard C, Tchoghandjian A,
Meyronet D, Baeza-Kallee N, Chinot O, Figarella-Branger D. Molecular heterogeneity of
glioblastomas; does location matter? Oncotarget 2016; 7: 902-13 (Patients et Méthodes)
[IF : 6.368]
106 Figarella-Branger D, Lechapt-Zalcman E, Tabouret E, Jünger S, de Paula AM,
Bouvier C, Colin C, Jouvet A, Forest F, Andreiuolo F, Quintin-Roue I, Machet MC,
Heitzmann A, Milin S, Sevestre H, Godfraind C, Labrousse F, Metellus P, Scavarda D,
20
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Pietsch T. Supratentorial clear cell ependymomas with branching capillaries demonstrate
characteristic clinicopathological features and pathological activation of nuclear factorkappaB signaling. Neuro Oncol. 2016; 18:919-27 (Remerciements)
[IF : 6.776]
107 Greillier L, Tounsi A, Berenguer-Daizé C, Dussault N, Delfino C, Benyahia Z, Cayol
M, Mabrouk K, Garcia S, Martin PM, Barlesi F, Oufaik L. Functional analysis of the
adrenomedullin pathway in malignant pleural mesothelioma. JTHO 2016; 11: 94-107
(Matériels et Méthodes)
[IF : 5.282]
108 Guérin M, Thariat J, Ouali M, Bouvier C, Decouvelaere AV, Cassagnau E, Aubert S,
Lepreux S, Coindre JM, Valmary-Degano S, Larousserie F, Meilleroux J, Projetti F, Stock N,
Galant C, Marie B, Peyrottes I, de Pinieux G, Gomez-Brouchet A. A new subtype of highgrade mandibular osteosarcoma with RASAL1/MDM2 amplification. Hum Pathol. 2016; 50:
70-8 (Matériels et Méthodes)
[IF : 5.282]
109 Kamoun A, Idbaih A, Dehais C, Elarouci N, Carpentier C, Letouzé E, Colin C,
Mokhtari K, Jouvet A, Uro-Coste E, Martin-Duverneuil N, Sanson M, Delattre JY, FigarellaBranger D, de Reyniès A, Ducray F; POLA network. Integrated multi-omics analysis of
oligodendroglial tumours identifies three subgroups of 1p/19q co-deleted gliomas. Nat
Commun. 2016; 7: 112-63 (Remerciements)
[IF : 11.470]
110 Macagno N, Figarella-Branger D, Mokthari K, Metellus P, Jouvet A, Vasiljevic A,
Loundou A, Bouvier C. Differential Diagnosis of Meningeal SFT-HPC and Meningioma:
Which Immunohistochemical Markers Should Be Used? Am J Surg Pathol 2016. 40: 270-8
(Matériels et Méthodes)
[IF : 4.592]
111 Mascelli S, Nozza P, Jones D. T. W, Colin C, Pistorio A, Milanaccio C, Ravegnani M,
Consales A, Witt O, Morana G, Cama A, Capra V, Biassoni R, Pfister S. M, FigarellaBranger D, Garrè M. L, Raso A.TP53 codon 72 polymorphism may predict early tumour
progression in paediatric pilocytic astrocytoma. Oncotarget 2016 [Epub ahead of print]
(Matériels et Méthodes)
[IF : 6.368]
112 Masliah-Planchon J, Machet MC, Fréneaux P, Jourdain A, Mortemousque I, Raïs KA,
Ballet S, Jouvet A, Figarella-Branger D, Delattre O, Bourdeaut F. SMARCA4-Mutated
Atypical Teratoid/Rhabdoid Tumor with Retained BRG1 Expression. Pediatr Blood Cancer
2016; 63: 568-9 (*)
[IF : 2.386]
113 Taïeb D, Barlier A, Yang C, Pertuit M, Tchoghandjian A, Rochette C, Zattara-Canoni
H, Figarella-Branger D, Zhuang Z, Pacak K, Metellus P. Somatic gain-of-function HIF2A
mutations in sporadic central nervous system hemangioblastomas. J Neurooncol 2016; 126:
473-81 (Matériels et Méthodes)
[IF : 3.070]
21
Dernière mise à jour : 29/06/2016
III – Bilan des cessions de matériel pour projets de recherche et
publications associées
Classées chronologiquement selon les dates de demande de cession. Il peut y avoir plusieurs
cessions pour un même projet.
Code
Biobanque
Titre du projet et investigateur principal (Structure :
AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM)
Nature des
échantillons cédés
Nombre total
de patients
inclus
Publications
2008
068CCL
Etude de l'expression de l'adrénomédulline dans les
gliomes – L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2)
076LIG
Analyse par une approche couplée CGH-array /
transcriptome de la chimiosensibilité des glioblastomes Tissus congelés
– F. Ducray (hors AP-HM)
093GLD
108RCC
109ACO
Tissus congelés
Etude translationnelle de l'impact des marqueurs de
chimiorésistance dans les glioblastomes – P. Metellus Tissus congelés
(AP-HM / CRO2)
Etude de l'expression de l'adrénoméduline et de ses
récepteurs dans les carcinomes du rein – L’H. Ouafik Tissus congelés
(AP-HM / CRO2)
Dosage de l'adrenomédulline et ses récepteurs (ARN +
proteines) dans les cancers colorectaux – L’H. Ouafik Tissus congelés
(AP-HM / CRO2)
11
37
8
19
2
11
15
9
23
68
112MET
Mise au point de la recherche de méthylation de gènes
– D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
ADN tissulaires
36
11, 87
113MPM
Etude de l'expression de l'adrénoméduline, de ses
récepteurs et du VEGF dans les mésothéliomes – L’H.
Ouafik (AP-HM / CRO2)
Tissus congelés
ARN tissulaires
14
10
107
116REG
Analyse du REGF dans une série de glioblastomes par
différentes techniques (FISH, PCR, IHC) – D.
Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
Tissus congelés
60
18
84
Pas de
publication
96
79
117LCV
118STU
Etude du microenvironnement tumoral des lésions
bénignes et malignes des cordes vocales (RT-PCR) – S. Tissus congelés
Duflo (AP-HM)
Etude rétrospective de l'expression de MGMT dans les
glioblastomes traités selon le schéma de STUPP – O.
Tissus congelés
Chinot (AP-HM / CRO2)
120CSC
Dosage du CD133 (ARN) dans une série de
Tissus congelés
glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
48
35
124TEP
Corrélation entre l'expression de différents marqueurs
moléculaires et l'intensité de fixation en TEP-FDG
préthérapeutique dans les glioblastomes – P. Metellus
(AP-HM / CRO2)
9
41
125ECO
Protocole ECOM: Evaluation comparative des
techniques d'analyse de la MGMT comme facteur
ADN tissulaires
prédictif de réponse au Témozolomide dans les
glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
25
51, 79, 87
126TRA
Etude transcriptomique des glioblastomes et corrélation
à la topographie et au taux de cellules CD133+ – D.
ARN tissulaires
Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
8
52
127OLA
Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes
anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
2
47, 77, 80, 88,
93, 97, 100, 109
Tissus congelés
Tissus congelés
22
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Code
Biobanque
Titre du projet et investigateur principal (Structure :
AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM)
Nature des
échantillons cédés
Nombre total
de patients
inclus
Publications
et J-Y. Delattre (hors AP-HM)
118STU
(2ème cession)
124TEP
(2ème cession)
127OLA
(2ème à 4ème
cessions)
129CAV
130ISO
131TFS
135PSA
2009
Etude rétrospective de l'expression de MGMT dans les
glioblastomes traités selon le schéma de STUPP – O.
Tissus congelés
Chinot (AP-HM / CRO2)
Corrélation entre l'expression de différents marqueurs
moléculaires et l'intensité de fixation en TEP-FDG
Tissus congelés
préthérapeutique dans les glioblastomes – P. Metellus
(AP-HM / CRO2)
Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes
anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Tissus congelés
et J-Y. Delattre (hors AP-HM)
Analyse transcriptomique et par CGH array de
glioblastomes répondant ou non au traitement par
campto-avastin à la récidive – O. Chinot (AP-HM /
CRO2) et F. Ducray (hors AP-HM)
Tissus congelés
Protocole ISOPS III: essai de phase II randomisée
multicentrique, détermination du statut MGMT dans
Tissus congelés
une série de glioblastomes – A. Carpentier (hors APHM)
Projet Inca GENOSTT: de la cellule souche aux
remaniements du génome:caractérisation moléculaire et
Tissus congelés
fonctionnelle des tumeurs adipocytaires et fibreuses –
C. Bouvier (AP-HM / CRO2)
Dosage de l'expression de la glycoprotéine PSANCAM par ELISA dans les glioblastomes (tumeur
Tissus congelés
initiale et récidive) – D. Figarella-Branger (AP-HM /
CRO2)
4
79
51
41
3
47, 77, 80, 88,
93, 97, 100, 109
13
82
17
17
19
39, 56, 57
3
15
136CSC
Interaction physique entre les molécules A2B5 et
CD133 dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger
(AP-HM / CRO2)
Tissus congelés
5
28
137PIL
Caractérisation moléculaire des astrocytomes
pilocytiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
Tissus congelés
Lames paraffine
47
101
14, 61
138BIR
Recherche de mutations des gènes IDH1 et IDH2 dans
une série de gliomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / ADN tissulaires
CRO2)
59
24, 36, 45
139EPE
Recherche de la fusion des gènes KIAA1549 et BRAF
dans les épendymomes – D. Figarella-Branger (AP-HM Tissus congelés
/ CRO2)
15
Pas de
publication
ADN tissulaires
ARN tissulaires
Tissus congelés
27
5
8
17
ADN tissulaires
2
24, 36, 45
Tissus congelés
20
74
130ISO
(2ème à 4ème
cessions)
138BIR
(2ème cession)
140MIR
2010
Protocole ISOPS III: essai de phase II randomisée
multicentrique, détermination du statut MGMT dans
une série de glioblastomes – A. Carpentier (hors APHM)
Recherche de mutations des gènes IDH1 et IDH2 dans
une série de gliomes – D. Figarella-Branger (AP-HM /
CRO2)
Analyse de l'expression de miRNA dans les tumeurs du
SNC – F. Boudouresque (CRO2)
23
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Code
Biobanque
141PED
142IDH
150PSA
Titre du projet et investigateur principal (Structure :
AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM)
Recherche de mutations du gène IDH1 dans des
gliomes de l'enfant – D. Figarella-Branger (AP-HM /
CRO2)
Corrélation TEP IDH dans les gliomes – P. Metellus
(AP-HM / CRO2)
Dosage de PSA-NCAM dans le cancer du poumon – D.
Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et P. Thomas (hors
AP-HM)
2011
Nature des
échantillons cédés
Nombre total
de patients
inclus
Publications
ADN tissulaires
4
50, 64
ADN tissulaires
Tissus congelés
16
6
36, 49
Tissus congelés
9
Pas de
publication
127OLA
(5ème à 7ème
cessions)
Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes
anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
et J-Y. Delattre (hors AP-HM)
Tissus congelés
27
47, 77, 80, 88,
93, 97, 100, 109
136CSC
(2ème cession)
Interaction physique entre les molécules A2B5 et
CD133 dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger
(AP-HM / CRO2)
Tissus congelés
8
28
150PSA
(2ème cession)
Dosage de PSA-NCAM dans le cancer du poumon – D.
Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et P. Thomas (hors Tissus congelés
AP-HM)
4
Pas de
publication
152SDF
Implication de l'adrénomédulline et du facteur SDF-1
dans la vascularisation tumorale des glioblastomes –
L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2)
Tissus congelés
23
En cours
154PIN
Analyse du profil génomique des tumeurs corticales de
l'enfant par CGH array – D. Figarella-Branger (AP-HM Tissus congelés
/ CRO2)
19
50
158AST
Analyse de l'expression de cibles thérapeutiques dans
les astrocytomes pilocytiques par RT-PCR quantitative Tissus congelés
– D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
44
67
159ORL
Etude de prédiction de la réponse à une chimiothérapie
d'induction des carcinomes épidermoïdes des voies
Tissus congelés
aérodigestives supérieures. PHRC national 2006 – B.
Lallemant (hors AP-HM)
8
Investigateur
contacté
160SEI
Etude de l'expression du REGF sur des carcinomes
mammaires de haut grade HER2 négatif – C. Charpin
(AP-HM)
Lames paraffine
44
90
161SMG
Classification d'une cohorte de glioblastomes sur la
base de leurs signatures moléculaires – D. FigarellaBranger (AP-HM / CRO2)
Tissus congelés
51
105
Tissus congelés
Paraffine (TMA)
4
203
47, 77, 80, 88,
93, 97, 100, 109
Tissus congelés
2
28
Lames paraffine
5
90
Tissus congelés
ADN tissulaire
ARN tissulaire
46
41
27
105
127OLA
(8ème à 11ème
cessions)
136CSC
(3ème cession)
160SEI
(2ème cession)
161SMG
(2ème cession)
2012
Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes
anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
et J-Y. Delattre (hors AP-HM)
Interaction physique entre les molécules A2B5 et
CD133 dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger
(AP-HM / CRO2)
Etude de l'expression du REGF sur des carcinomes
mammaires de haut grade HER2 négatif – C. Charpin
(AP-HM)
Classification d'une cohorte de glioblastomes sur la
base de leurs signatures moléculaires – D. FigarellaBranger (AP-HM / CRO2)
24
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Code
Biobanque
Titre du projet et investigateur principal (Structure :
AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM)
Nature des
échantillons cédés
Nombre total
de patients
inclus
Publications
162NEO
Etude in situ de l'expression des facteurs de la
néoangiogenèse et des molécules protéolytiques dans
les glioblastomes, au diagnostic et à la récidive – O.
Chinot (AP-HM / CRO2)
Tissus congelés
69
92, 103
163GAN
Recherche de mutation V600E du gène BRAF dans les
gangliogliomes pédiatriques – D. Figarella-Branger
Lames paraffine
(AP-HM / CRO2)
57
60
18
45, 49
34
70
164LGG
165CAR
Caractérisation clinico-radiologique, génomique et
transcriptomique des gliomes de bas grades triple
Tissus congelés
négatifs de l'adulte – D. Figarella-Branger (AP-HM /
CRO2)
Etude du génome des tumeurs cartilagineuses «
conventionnelles » bénignes et malignes. Recherche de
Tissus congelés
nouveaux marqueurs moléculaires diagnostiques et
pronostiques – C. Bouvier (AP-HM / CRO2)
168EPE
PHRC épendymomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2)
Tissus congelés
28
En cours
170MOS
Validation de biomarqueurs du glioblastome – D.
ADN tissulaires
Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et J. Mosser (hors
ARN tissulaires
AP-HM)
32
9
79
Tissus congelés
10
47, 77, 80, 88,
93, 97, 100, 109
Tissus congelés
Lames paraffine
17
92
105
Tissus congelés
12
92, 103
Tissus congelés
Paraffine
115
106
71, 81
Tissus congelés
ADN tissulaires
23
13
62, 86
Tissus congelés
6
En cours
Lames paraffine
25
91
Blocs paraffine
Projet sollicité,
pas de sortie à
ce jour
127OLA
(12ème à 17ème
cessions)
161SMG
(3ème cession)
162NEO
(2ème cession)
171MET
172GLR
177LGG
180PXA
181PIT
2013
Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes
anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
et J-Y. Delattre (hors AP-HM)
Classification d'une cohorte de glioblastomes sur la
base de leurs signatures moléculaires – D. FigarellaBranger (AP-HM / CRO2)
Etude in situ de l'expression des facteurs de la
néoangiogenèse et des molécules protéolytiques dans
les glioblastomes, au diagnostic et à la récidive – O.
Chinot (AP-HM / CRO2)
Mise en évidence d'une signature moléculaire
différentielle entre des tumeurs primitives pulmonaires
et mammaires et la métastase cérébrale associée – P.
Metellus (AP-HM / CRO2)
Projet Gliareg: Etude prospective non randomisée
évaluant l’impact de la chirurgie avec mise en place
d’implants biodégradable in situ de BCNU (Gliadel®)
dans les glioblastomes récidivants de l’adulte
(GliaReG) – P. Metellus (AP-HM / CRO2)
Molecular Profiles in Low Grade Glioma,
Identification of Novel Therapeutic Targets and
Biomarkers for Response to Treatment (EORTC) – P.
Metellus (AP-HM / CRO2)
Caractérisation clinico-radiologique et biologique des
xanthoastrocytomes pléïomorphes – E. Tabouret (APHM / CRO2)
PHRC Pituigène: Identification de marqueurs
d'agressivité tumorale et de malignité des tumeurs
hypophysaires par analyse génomique comparative par
hybridation sur puces à ADN (CGH) – G. Raverot
(hors AP-HM)
25
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Code
Biobanque
Titre du projet et investigateur principal (Structure :
AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM)
Nature des
échantillons cédés
182REI
ETUDE SIOP2001, tumeurs du rein de l'enfant – A.
Coulomb (hors AP-HM)
183PYR
Demande de destockage d’ADN d’astrocytomes
pilocytiques et de gangliogliomes pour la recherche du
ADN tissulaires
polymorphisme R72P de TP53 par pyroséquençage –
D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
184ATA
127OLA
(18ème à 22ème
cessions)
185GBJ
186OHG
187OCG
188EPE
189HGB
190INS
192MEN
Tissus congelés
Blocs paraffine
Nombre total
de patients
inclus
6
Publications
En cours
25
111
Tissus congelés
Lames paraffine
1
13
En cours
Tissus congelés
8
47, 77, 80, 88,
93, 97, 100, 109
Lames paraffine
38
En cours
Paraffine (TMA)
60
En cours
Tissus congelés
Expression de p63 dans les tumeurs osseuses riches en
Lames paraffine
cellules géantes – C. Bouvier (AP-HM / CRO2)
Paraffine (TMA)
Ependymomes intracraniens de l'adulte: analyse des
facteurs pronostiques et caractérisation moléculaire – Blocs paraffine
P. Metellus (AP-HM / CRO2)
Recherche d'anomalie génétique sur le gène VHL dans
les hémangioblastomes apparemment sporadiques – P. Blocs paraffine
Metellus (AP-HM / CRO2)
Analyse neuroradiologique des gliomes de grade II et
Tissus congelés
III impliquant l'insula; corrélation aux données histoBlocs paraffine
moléculaires – P. Metellus (AP-HM / CRO2)
Recherche des transcrits de fusion NAB2-STAT6 dans
Tissus congelés
les méningiomes anaplasiques – C. Bouvier (AP-HM /
ARN tissulaires
CRO2)
31
52
72
84
78
69, 104
37
113
44
58
En cours
(Compes et al)
27
16
110
Protocole ATAG: Chimiothérapie par temozolomidebevacizumab dans les glioblastomes supratentoriels des
sujets de 70 ans et plus présentant un état fonctionnel
altéré (IK < 70) – O. Chinot (AP-HM / CRO2)
2014
Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes
anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
et J-Y. Delattre (hors AP-HM)
Caractérisation clinique, histologique et moléculaire
des glioblastomes de l'adulte jeune – E. Tabouret (APHM / CRO2)
Expression de l'intégrine béta1 et de YAP dans les
ostéosarcomes de haut grade – C. Bouvier (AP-HM /
CRO2)
193PAN
Bile salt-dependent lipase single polymorphism as
ADN tissulaires
predictive risk for pancreatic cancers – E. Mas (CRO2)
49
101
194PED
Caractérisation moléculaire des tumeurs gliales et
Tissus congelés
glioneuronales circonscrites de bas grade de l’enfant et
ADN tissulaires
de l’adulte jeune par droplet digital PCR – F. Fina (APLames paraffine
HM)
3
20
20
En cours
195CIL
Cilengitide (EMD121974) en association à la
radiothérapie chez l’enfant et le jeune adulte porteur
d’un gliome infiltrant du tronc cérébral nouvellement Tissus congelés
diagnostiqué : Etude de phase I – P. Leblond (hors APHM)
4
Pas de
publication
196OST
Etude Intergroupe (SFCE/GSF-GETO) OS 2006
Zoledronate-Ostéosarcome – L. Brugière et S. Piperno- Tissus congelés
Neumann (hors AP-HM)
7
En cours
26
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Code
Biobanque
197MEL
199TUX
200MET
203HEM
Titre du projet et investigateur principal (Structure :
AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM)
Caractérisation moléculaire des mélanomes à
croissance rapide – C. Gaudy (AP-HM)
Etude randomisée multicentrique intergroupe pour les
enfants et adolescents atteints d'un lymphome ou d'une
leucémie à cellules B matures de l'enfant et l'adolescent
avec évaluation d'une diminution de traitement dans les
stades localiséset de l'efficacité du rituximab dans les
stades avancés. Essai Inter B-NHL Ritux 2010 – C.
Schmitt (hors AP-HM)
Protocole métastases cérébrales : étude pilote en vue
d’un essai européen soutenu par l’EORTC (étude
prospective « Window of Opportunity study ») – P.
Metellus (AP-HM / CRO2)
Conséquences psychosociales du dépistage de la
maladie de Von Hippel Lindau chez des patients opérés
d’un hémangioblastome du SNC (PsychoVHL) – P.
Metellus (AP-HM / CRO2)
Nature des
échantillons cédés
Nombre total
de patients
inclus
Publications
Tissus congelés
Plasmas
Culots lymphocytaires
Sang total
34
20
19
10
En cours
Blocs paraffine
Tissus congelés
1
En cours
Tissus congelés
Sang
LCR
4
4
4
Lames paraffine
11
En cours
205AST
Essai multicentrique randomisé: Anti- récepteurs
angiotensin II, steroïdes et radiothérapie dans les Tissus congelés
glioblastomes – A. Carpentier (hors AP-HM)
3
En cours
206CHO
Caractérisation moléculaire en whole exome et
RNAseq des gliomes chordoïdes – F. Bielle (hors APHM)
Tissus congelés
1
94
Tissus congelés
Paraffine
6
7
47, 77, 80, 88,
93, 97, 100, 109
Tissus congelés
4
En cours
Tissus congelés
2
102, 108
Tissus congelés
18
En cours
2015
127OLA
(23ème à 33ème
cessions)
194PED
(2ème cession)
207 OST
208TAU
Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes
anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2)
et J-Y. Delattre (hors AP-HM)
Caractérisation moléculaire des tumeurs gliales et
glioneuronales circonscrites de bas grade de l’enfant et
de l’adulte jeune par droplet digital PCR – F. Fina (APHM)
Recherche d'amplification des gènes MDM2 et
RASAL1dans les ostéosarcomes de bas grade – C.
Bouvier (AP-HM / CRO2) et G. de Pinieux (hors APHM)
Validation d'un marqueur PET-Scan de la protéine Tau
pour le suivi de la progression des glioblastomes – A.
Tchoghandjian (AP-HM / CRO2) et H. Kovacic
(CRO2)
209CGH
Etude en CGH array des anomalies chromosomiques
dans les gliomes de haut grade – D. Figarella-Branger Tissus congelés
(AP-HM / CRO2)
4
Pas de
publication
210GBJ
Caractérisation moléculaire des glioblastomes du sujet
jeune – A. Rousseau (hors AP-HM), D. FigarellaTissus congelés
Branger (AP-HM / CRO2) et E. Tabouret (AP-HM /
CRO2) (Listing 185GBJ)
10
En cours
211MEL
Impact pronostique de la présence d'une forme active
de b-caténine dans le mélanome. C. Gaudy-Marqueste Paraffine (TMA)
et N. Macagno (AP-HM / hors AP-HM)
300
En cours
27
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Code
Biobanque
Titre du projet et investigateur principal (Structure :
AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM)
Nature des
échantillons cédés
Nombre total
de patients
inclus
Publications
212MEL
Caractérisation moléculaire d'une cohorte de
mélanomes métastatiques : étude de l'impact
pronostique du statut mutationnel P53. C. GaudyMarqueste (AP-HM / CRO2 / hors AP-HM)
ADN tissulaires
127
En cours
213SAR
ICGC LMS GSF. S. Salas (AP-HM)
Tissus congelés
Blocs paraffine
3
3
En cours
214MMP
Expression de MMP2, MMP9, CXCL12-CXCR4 et
leurs partenaires chez des patients porteurs d’un
Tissus congelés
glioblastome au diagnostic et au cours du traitement. E. Blocs paraffine
Tabouret et E. Denicolaï (AP-HM / CRO2)
3
3
En cours
214MMP
(2ème cession)
Expression de MMP2, MMP9, CXCL12-CXCR4 et
leurs partenaires chez des patients porteurs d’un
Blocs paraffine
glioblastome au diagnostic et au cours du traitement. E.
Tabouret et E. Denicolaï (AP-HM / CRO2)
10
En cours
215SAF
Protocole UNICANCER 0105-1305/IFCT1301 SAFIR
Tissu congelé
02 LUNG. A. Valette (hors AP-HM)
1
En cours
Tissus congelés
2
En cours
Blocs paraffine
2
En cours
216IAP
217REI
Recherche de la coexpression des inhibiteurs de
l'apoptose et des marqueurs de cellules souches dans
les glioblastomes. A. Tchoghandjian (CRO2) (*tissus
mélanomes destockés pour mises au point)
Valeur des biomarqueurs MMP2 et MMP9 pour
prédire le bénéfice des anti-angiogéniques dans le
cancer du rein. E. Tabouret et E. Denicolai (AP-HM /
CRO2)
218ALT
Rôle des altérations épigénétiques induites par la
mutation IDH1 R132H dans la réactivation de la
télomérase et de la voie ALT dans les gliomes. D.
Figarella-Branger et V. Geli (AP-HM / hors AP-HM)
ADN tissulaires
24
En cours
219HYP
Caractérisation génétique de l'hyperthermie d'effort
(Biopsies musculaires). J. Faure et C. Bosson (hors AP- Tissus congelés
HM)
28
En cours
2016
215SAF
(2ème à 11ème
cession)
Protocole UNICANCER 0105-1305/IFCT1301 SAFIR
Tissus congelés
02 LUNG. A. Valette (hors AP-HM)
12
En cours
220MCM
Evaluation de la valeur pronostique de MCM6 dans les
tumeurs oligodendrogliales anaplasiques avec
Paraffine (TMA)
codélétion 1p19q. G. Gauchotte (hors AP-HM)
706
En cours
221MET
Analyse Génomique comparative de 15 paires de
tumeurs du sein et de leur métastase cérébrale. P.
Tissus congelés
Metellus, F. Bertucci, J. Adélaïde (Clairval / hors APHM)
14
En cours
28
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Code
Biobanque
Titre du projet et investigateur principal (Structure :
AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM)
222MEN
Exome des méningiomes de Grade 3. M. Peyre (hors
AP-HM)
Nature des
échantillons cédés
Tissus congelés
Nombre total
de patients
inclus
Publications
22
En cours
223TAR
A Phase I/II, Open-Label, Multicentre Study to Assess
The Safety, Tolerability, Pharmacokinetics and
Clinicall Efficacy of AZD4547 in Patients with
Tissu congelé
Replapsed/Refractory glioma positive for an FGFR
fusion. M. Sanson et O. Chinot (hors AP-HM / APHM)
1
En cours
224MEL
Caractérisation immunohistochimique de marqueurs
diagnostiques, pronostiques et d’agressivité de
mélanomes. N. Macagno (AP-HM / CRO2)
215
En cours
225STM
Recherche de nouvelles cibles thérapeutiques dans les
Tissus congelés
sarcomes des tissus mous. C. Jiguet-Jiglaire (CRO2)
10
En cours
226TEL
Implication des protéines télomériques dans le
vieillissement physiologique du muscle squelettique. F. Tissus congelés
Magdinier et A. Maues de Paula (AP-HM)
6
En cours
227OST
Recherche de facteurs immunohistochimiques
pronostiques dans les ostéosarcomes conventionnels du Paraffine TMA
protocole OS06 (sarcome 09). C. Bouvier (AP-HM)
173
En cours
228ATR
Etude clinico-biologique sur une série rétrospective
d'ATRT traité en France entre 2009 et 2012. F.
Bourdeaut et C. Godfraind (hors AP-HM)
1
En cours
229TFS
Etude moléculaire des tumeurs fibreuses solitaires des
méninges : recherche des transcrits de fusion NAB2Blocs paraffine
STAT6 et correlations pronostiques. C. Bouvier et P.
Wesselin (AP-HM / hors AP-HM)
102
En cours
230STA
Analyse du statut STAT6 sur méningiomes. N.
Macagno (AP-HM / CRO2)
Paraffine TMA
173
En cours
231MIC
Imagerie des gliomes infiltrants par microscopie
Raman cohérente. H. Rigneault (hors AP-HM)
Tissus congelés
7
En cours
232BRA
BRAVE project. B. Chanez, B. Escudier et L. Derosa
(AP-HM / hors AP-HM)
Blocs paraffine
14
En cours
Paraffine TMA
Tissu congelé
29
Dernière mise à jour : 29/06/2016
Code
Biobanque
233HEM
234EBG
235MAP
236NFK
Titre du projet et investigateur principal (Structure :
AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM)
Nombre total
de patients
inclus
Nature des
échantillons cédés
Publications
Etude des mécanismes génomiques de progression
tumorale des hémangiopericytomes/tumeurs fibreuses
Tissus congelés
solitaires méningés. C. Bouvier et M. Kalamarides
(AP-HM / hors AP-HM)
2
En cours
Analyse de biomarqueurs pronostiques et prédictifs
pour la thérapie du glioblastome (EB1). R. Berges (AP- Lames paraffine
HM / CRO2)
2
En cours
MAPPYACTS Molecular Profiling for Pediatric and
Young Adult Cancer Treatment Stratification. B.
Geoerge (hors AP-HM)
/
En cours
20
106
Tissus congelés
Lames paraffine
Caractéristiques moléculaires et histologiques des
ependymomes. D. Figarella-Branger etT. Pietsch (AP- Lames paraffines
HM / hors AP-HM)
30
Dernière mise à jour : 29/06/2016
IV – Participation de la tumorothèque de l’AP-HM à des réseaux de soins
ou à des projets multicentriques
1. Cancers rares de l’adulte
 Réseaux nationaux de double lecture des cancers rares de l’adulte
-
Sarcomes des tissus mous et des viscères. Réseau RREPS (Réseau de Référence en
Pathologie des Sarcomes) (coordinateur national : JM Coindre – Bordeaux), Marseille :
centre d’expertise régional, coordinateur : C. Bouvier (AP-HM)
-
Mésothéliomes malins de la plèvre et tumeurs rares du péritoine (coordinateur national :
Galateau Salle – Marseille), centre d’expertise régional, coordinateur : L. Garbe (AP-HM)
-
Réseau de Neuro Oncologie Pathologique RENOP (coordinateur national : D. FigarellaBranger)
 Réseaux nationaux de double lecture des tumeurs pédiatriques du SNC
-
Groupe d’étude en Neuropathologie Oncologique Pédatrique. Réseau GENOP
(coordinateur national : A. Jouvet – Lyon, centre de référence coordinateur pour la
relecture anatomopathologique : D Figarella-Branger – Marseille)
 Réseaux cliniques de références
-
Sarcomes des tissus mous et des viscères. Réseau NETSARC (Réseau de centres de
référence dans la prise en charge des sarcomes et tumeurs conjonctives) (coordinateur : JY
Blay – Lyon)
-
Sarcomes osseux. Réseau RESOS (Réseau de Référence des Sarcomes Osseux),
(coordinateur national : F Gouin – Nantes, et sur le versant de la Pathologie, coordinateur :
G de Pinieux – Tours)
-
Tumeurs neuroendocrines malignes rares. Réseau RENATEN (coordinateur : P Niccoli –
Marseille)
-
Tumeurs cérébrales olidodendrogliales de haut
grade. Réseau
POLA
(coordinateur national : JY. Delattre – Paris, centre de référence coordinateur pour la
relecture anatomopathologique : D Figarella-Branger – Marseille)
-
Cancers ORL rares. Réseau REFCOR (coordinateur : F Janot – Paris)
-
Lymphomes primitifs du système nerveux central. Réseau LOC (coordinateur : K HoangXuan – Paris)
-
Tumeurs cérébrales rares de l’adulte. Réseau TUCERA (coordinateur national : H.
Loiseau – Bordeaux, centre de référence coordinateur pour la relecture
anatomopathologique : D Figarella-Branger – Marseille, AP-HM)
31
Dernière mise à jour : 29/06/2016
-
Cancers rares du rein. Réseau CARARE (coordinateur national B. escudier-IGR Villejuif
Marseille : centre d’expertise régional pour la région PACA, coordinateur : L.Daniel (APHM)
2. Bases clinicobiologiques
 Projet POLA (depuis 2008) : Base dédiée au suivi prospectif et à la prise en charge
des oligodendrogliomes anaplasiques.
 Projets BCB INCa :
-
Projet Melbase (depuis 2011) : Suivi d’une cohorte nationale de patients atteints de
mélanome stade IV ou stade III inopérable.
-
Projet BCB Glioblastomes (depuis 2012) : Inclusion de tous les glioblastomes qui ont eu
une cryoconservation d’au moins 3 fragments de 50 mg, des prélèvements sanguins, le
consentement dédié, une mèche de cheveux, et un blic de paraffine surnuméraire sous
embargo pour la recherche.
-
Projet BCB Sarcomes (depuis 2012).
-
Projet BACAP
Pancréatique
-
Base Gliomes Marseille (depuis 2012) : Suivi de tous les cas incidents de gliomes ou de
tumeurs glioneuronales de la file active de patients de l’AP-HM (adultes et enfants), dans
le cadre du programme Gliomes du SIRIC Marseille.
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Base RENOP/TUCERA (depuis 2013) : Base de données à visée pathologique
permettant l’enregistrement des cas revus en relectures interrégionale et nationale dans le
cadre du projet TUCERA.
(depuis
2012) :
Base
AnatomoClinique
de
l’Adenocarcinome
3. Projet carte d’identité des tumeurs Ligue Nationale contre le cancer
-
Projet ANOCEF Ligue : Etude transcriptomique de la réponse à la radiothérapie ou à la
chimiothérapie de première ligne chez les patients présentant un glioblastome.
-
Etude génomique et transcriptionnelle de la réponse au traitement par innotecan et
bevacizumab chez les patients présentant un glioblastome en récidive
-
Projet Chondrosarcome Ligue.
-
STIC ECOM « Evaluation comparative des techniques d’analyse de la MGMT comme
acteur prédictif de réponse au Temozolomide dans les glioblastomes » - coordinateur : V
Quillien - Rennes
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Dernière mise à jour : 29/06/2016
4. Projets structurants régionaux
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SIRIC : Site Intégré de Recherche en Cancérologie et tout spécialement l’axe gliome du
projet SIRIC
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DHU : Départements Hospitalo-Univertaires, dont le DHU IMoTheP (Molecular vectorbased imaging for personalized theranostic applications) (Investigateur : E. Guedj)
labellisé par A*MIDEX en septembre 2015, le DHU EPINEXT (Epilepsie et désordres
de l’excitabilité neuronale) (Investigateur : F. Bartolomei) et le projet Marseille
Immunopôle (MI-DHU) (Investigateur : E. Vivier).
5. Projets internationaux
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« Prospective Assessment of Predictive / Prognostic Molecular Biomarkers in the SIOPLGG 201X Adaptative trial » SIOP-LGG PLGA foundation. Partenaires: Heidelberg,
Rome and Marseille
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Marie Curie International Incoming Fellowships (IIF): FP7-PEOPLE-2013-IIF:
« Broadband screening of therapeutic molecules with AMM, on cellular models of
glioblastoma». Investigateur: E. Pasquier
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Cohorte EORTC “Brain tumour Funder’s” Glioblastomes longs survivants.
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