Valorisation de la tumorothèque et de la banque de muscle - AP-HM
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Valorisation de la tumorothèque et de la banque de muscle - AP-HM
Dernière mise à jour : 29/06/2016 Valorisation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM La tumorothèque et la banque de muscles de l’AP-HM ont pour mission de cryoconserver des échantillons issus de soins pour une utilisation sanitaire, si nécessaire et de recherche après requalification. La tumorothèque et la banque de muscles ont été certifiées ISO 9001 fin mars 2010 jusqu’en août 2013. La biobanque est autorisée à céder des échantillons à visée recherche depuis 2008 (dossier AC 2008-70 renouvelé en 2013 : N° 2013-1786). Sous l’égide du Canceropôle PACA les deux tumorothèques marseillaises (IPC, AP-HM) et celle de Nice (CHU-CAL) se sont regroupées pour être labellisées IBIZA depuis 2009 et créer un catalogue virtuel des échantillons au sein du Canceropôle PACA (www.biobank.paca.com). De plus, les trois tumorothèques participent au réseau européen BBMRI et sont autorisées à exporter des prélèvements dans le cadre de cessions à des équipes en dehors du territoire français. Enfin, depuis février 2014, un site de stockage long terme entièrement automatisé est opérationnel sur le site de la Timone. Ce changement de locaux et d’organisation expliquent le nonrenouvellement de la certification en 2014. Une nouvelle demande d’accrédiation est engagée. Cette activité de biobanking doit être valorisée au travers de différentes actions. Ceci est rapporté dans le présent document pour les années 2007-2015 Tout d’abord, il est nécessaire de communiquer auprès de différentes instances sur l’existence et les missions de la biobanque. Ceci est rapporté dans le premier paragraphe intitulé « Actions de communications et publications relatives à l’activité de cryoconservation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM ». Par ailleurs, les échantillons utilisés dans le cadre du soin peuvent faire l’objet d’analyses biologiques qui seront secondairement publiées. De même, il est important que les échantillons cédés dans le cadre de la recherche puissent permettre des travaux de recherche dont les résultats seront publiés. En effet, compte tenu de la préciosité des échantillons, il est particulièrement important qu’ils soient utilisés de la façon la plus optimale possible. Dans ce contexte, le paragraphe II du présent document rapporte le listing des publications réalisées à partir des échantillons cédés par la biobanque. Par ailleurs, tout échantillon cédé dans le cadre de la recherche nécessite au préalable le dépôt d’une demande de cession argumentée et approuvée secondairement par le Comité Scientifique. Le paragraphe III rapporte le listing des cessions pour la période 2007-2015 dans le cadre de la recherche, ainsi que les publications dont elles ont fait l’objet. Enfin, la participation de la tumorothèque à des réseaux de soins ou à des projets multicentriques est rapportée dans le paragraphe IV. 1 Dernière mise à jour : 29/06/2016 I – Actions de communications, rapports d’activité et publications relatives à l’activité de cryoconservation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM 1. Auprès des organismes de tutelles 2007 Présentation de l’activité de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM auprès du conseil exécutif de l’AP-HM – 24 Septembre 2007 – D. Figarella-Branger 2008 Nouvelle présentation de l’activité de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’APHM auprès du conseil exécutif de l’AP-HM en vu de la construction d’un site de stockage long terme – 11 Février 2008 – D. Figarella-Branger 2009 Présentation de la tumorothèque et de la banque de muscles de l’AP-HM auprès du centre de coordination en cancérologie (3 C) – Février 2009 – D. Figarella-Branger 2010 Présentation des tumorothèques de Marseille (AP-HM, IPC) lors de la visite AERES de l’Université – D. Figarella-Branger 2011 Tumorothèque-organisation en région PACA ONCOPACA (3C) – Dr C. Chabanon Réunion Régionale de Cancérologie Cancéropôle : l’enjeu des tumorothèques La lettre de l’Université de la Méditerranée – Décembre 2011 2013 Action de communication à l’occasion des 10 ans du cancéropôle PACA – 13 Février 2013 2014 Présentation de la tumorothèque et de la banque de muscles au nouveau bureau de la direction de la recherche et de l’innovation de l’AP-HM – 24 Septembre 2014 – D. Figarella-Branger 2. Auprès des patients et des associations de patients 2007 Présentation auprès de l’Association pour la Recherche sur les Tumeurs Cérébrales (ARTC Sud) – 12 Avril 2007 – D. Figarella-Branger 2008 Présentation du nouveau centre de recherche en oncologie et oncopharmacologie (CRO2) et de l’intérêt des ressources biologiques. Plaquettes d’information de l’ARTC Sud « Le lien » 2008 – D. Figarella-Branger 2 Dernière mise à jour : 29/06/2016 2009 La tumorothèque de l’Assistance Publique des hôpitaux de Marseille. Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » – Octobre 2009 2010 Lettre d’information POLA n°1 – Mars 2010 2011 Lettre d’information POLA n°2 – Mars 2011 2012 Présentation du Cancéropôle PACA et des tumorothèques PACA, par le biais du film « Du bloc opératoire au laboratoire, chronique d’un échantillon biologique » : http://vimeo.com/44252496. Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » n°7 – Octobre 2012 2013 Lettre d’information POLA n°3 – 2013 Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » n°8 – Octobre 2013 2014 Lettre d’information POLA n°4 – Novembre 2014 Plaquette d’information de l’ARTC Sud « Le lien » n°9 – Octobre 2014 2015 Lettre d’information POLA n°5 – Novembre 2015 3. Site Web, plaquettes d’informations grand public - - Site Web du cancéropôle PACA : http://canceropole-paca.com/ Site Web de l’AP-HM volet recherche Site Web de l’ARTC-Sud : http://www.artcsud.fr/ lien vers la tumorothèque dans l’onglet Recherche Site Web de la Base Clinico-Biologique de Glioblastomes (BCB-G) : http://www.frenchglioblastoma-biobank.com/ Information sur la tumorothèque dans le dossier patient AP-HM Plaquettes éditées par le cancéropôle PACA : « La conservation d’échantillons biologiques provenant d’individus suspects ou atteints de cancer : un effort collectif au service des malades et de la science. » « The virtual PACA tumour bank: a catalogue of biological collections held within the canceropole PACA. » « Le patient, acteur de la recherche en cancérologie. » Réalisation du film « Du bloc opératoire au laboratoire, chronique d’un échantillon biologique » Rapports d’activités INCa-DGOS De 2010 à 2014, la tumorothèque de l’AP-HM a fourni à l’INCa un rapport d’activité. 3 Dernière mise à jour : 29/06/2016 - En 2014, la DGOS a adressé à l’AP-HM un questionnaire concernant les CRB en vu de l’établissement des subventions MERRI. Une réponse commune a été adressée à la DGOS concernant ce questionnaire (cf infra). 4. Manifestations scientifiques Congrès 2006 Tumorothèque et CRB Société française de neuropathologie – Mars 2006 – D. Figarella-Branger 2008 Chabannon C, Figarella-Branger D, Martin PM, Hofman P, Birtwisle-Peyrotte I, Romain S, Achache K, Honstettre A, Daufresne LM, Mery O, Bordonne O, Bonnetaud C, Ducord C, Vaglio P, Jacotot L, D’Arnoux C, Atger V. The Canceropole PACA: Virtual tumor bank.International Cancer Genome Consortium-15-17 Novembre 2008 – Bethesda – USA 2009 Journée intercancéropôle PACA et GSO Les tumorothèques des ressources biologiques indispensables à la recherche. Quels enjeux ? Quelles contraintes ? – Montpellier 12 mai 2009 Format d’échanges des informations entre tumorothèques : une brève histoire – C. Chabannon 2011 Le Club des utilisateurs de l’outil Modul-Bio, le 15 Novembre 2011 (en parallèle du symposium "Les collections biologiques un enjeu structurant dans les Cancéropôles", 15-16 nov. 2011) 2012 Groupe de Travail Tumorothèques - Cancéropôle PACA, le 25 Juin 2012 2015 11èmes journées Cancéropôle GSO, les 5 et 6 novembre 2015. Tables rondes : Bases de données clinicobiologiques : enjeux et perspectives des différentes BCB du GSO, BCB Glioblastomes – Luc BAUCHET, CHU, Montpellier Publications 2006 1 Chabannon C, Lassailly F, Romain S, Xerri L, Bonavita MJ, Atger V, Bernard JP, Maraninchi D, Figarella-Branger D, Martin PM. [The consortium of Biological Resource Centres (BRC) and tumour cell and tissue banks in the Marseilles metropolitan area]. Med Sci (Paris) 2006; 22 Spec No 1: 26-31 2 Figarella-Branger D, Colin C, Chinot O, Nanni I, Baeza N, Fina F, Tong S, Eudes N, Quilichini B, Romain S, Metellus P, Fuentes S, Barrie M, Boucard C, Fraslon C, Bonavita MJ, Martin PM, Ouafik L. [AP-HM tumour tissue bank: molecular signature of gliomas]. Med Sci (Paris) 2006; 22 Spec No 1: 54-9 4 Dernière mise à jour : 29/06/2016 2009 3 Delplanque D, Birraux G, Bertoye PH, Postaire E, et les participants à la table ronde n°7 de Giens XXIV. Collections d’échantillons biologiques humains à visée scientifique. Pourquoi et comment clarifier la réglementation actuelle ? Thérapie 2009 ; 64 (3) : 215-24 2010 4 Chabannon C, Honstettre A, Daufresne LM, Martin PM, Bonnetaud C, BirtwislePeyrottes I, Romain S, Achache K, Mery O, Bordonne O, Ducord C, Jacotot L, Vaglio P, d'Arnoux C, Figarella-Branger D, Hofman P, Borg JP, Atger V. [Publication of biological samples collections catalogues by tumor banks]. Bull Cancer 2010; 97: 181-9 5 Hofman V, Bonnetaud C, Gaziello MC, Ilie M, Lassalle S, Butori C, Lerda N, Selva E, Gavric-Tanga V, Castillo L, Guevara N, Santini J, Pop D, Venissac N, Mouroux J, Chabannon C, Hofman P. [The Nice CHU biobank experience to collect patients' informed consent for research context (2004-2009)]. Ann Pathol 2010; 30: 337-43 2011 6 Lassalle S, Hofman V, Ilie M, Butori C, Bonnetaud C, Gaziello MC, Selva E, GavricTanga V, Guevara N, Castillo L, Santini J, Chabannon C, Hofman P. Setting up a Prospective Thyroid Biobank for Translational Research: Practical Approach of a Single Institution (20042009, Pasteur Hospital, Nice, France). Biopreserv Biobank 2011; 9: 9-19 7 Chabannon C, Doran P, Hofman P, Seberg O, Cinotti S, Bledsoe M, Deigner HP, Koschorreck J, Dagher G, Cooreman A, De Blasio P, Riegman P, Hewitt R. Annual Conferences of the European, Middle Eastern and African Society for Biopreservation and Biobanking (ESBB): overview of 2011 and preview of 2012. Biopreserv Biobank 2012; 10: 407-15 2012 8 Hofman V, Gaziello MC, Bonnetaud C, Ilie M, Mauro V, Long E, Selva E, GavricTanga V, Lassalle S, Butori C, Papin-Michaud C, Lerda N, Bordone O, Coelle C, Sabourin JC, Chabannon C, Hofman P. [Setting up indicators in biobanking: why and how?]. Ann Pathol 2012; 32: 91-101 9 Pellegrini I, Chabannon C, Mancini J, Viret F, Vey N, Julian-Reynier C. Contributing to research via biobanks: what it means to cancer patients. Health Expect 2012; 17: 523-33 2013 10 Hofman V, Ilie M, Long E, Washetine K, Chabannon C, Figarella-Branger D, Clement B, Mabile L, Cambon-Thomsen A, Boucher P, Dagher G, Hewitt R, Parodi B, Hofman P. Measuring the contribution of tumor biobanks to research in oncology: surrogate indicators and bibliographic output. Biopreserv Biobank 2013; 11: 235-44 11 Lawlor RT, Sluss PM, Langer R, Sughayer MA, Igbe MA, Siddiqui K, De Blasio P, Duma B, Mendy M, Chabannon C, Ibrahim M. European, Middle Eastern, and African 5 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Society for Biopreservation and Biobanking (ESBB). 2012 Conference Session on Biobanking in Emerging Countries. Biopreserv Biobank 2013; 11: 176-81 2014 12 Menei P, Figarella-Branger D, Bauchet L, Loiseau H, Denyset M, Roman T, Dehais C, Delattre JY. French research infrastructures to develop and validate glioma biomarkers. Neurosurgery 2014; 75: E195-6 6 Dernière mise à jour : 29/06/2016 II – Publications réalisées avec les ressources biologiques de l’AP-HM - - La (les) section(s) de la publication dans la(les)quelle(s) la Biobanque est citée est (sont) précisée(s) en italique, entre parenthèses. Si la Biobanque n’est pas mentionnée, cela est indiqué par un astérisque (*). L’impact factor (IF) pour les années 2008-2015 est donné en gras entre crochets. Pour les années suivantes l’IF correspond à l’année de publication. 1. Banque de muscles A noter que certaines publications sont issues au départ d’analyses réalisées dans le cadre du sanitaire, d’autres sont issues de cessions réalisées dans le cadre de la recheche. 2008 1 Amati-Bonneau P, Valentino ML, Reynier P, Gallardo ME, Bornstein B, Boissiere A, Campos Y, Rivera H, de la Aleja JG, Carroccia R, Iommarini L, Labauge P, FigarellaBranger D, Marcorelles P, Furby A, Beauvais K, Letournel F, Liguori R, La Morgia C, Montagna P, Liguori M, Zanna C, Rugolo M, Cossarizza A, Wissinger B, Verny C, Schwarzenbacher R, Martin MA, Arenas J, Ayuso C, Garesse R, Lenaers G, Bonneau D, Carelli V. OPA1 mutations induce mitochondrial DNA instability and optic atrophy 'plus' phenotypes. Brain 2008; 131: 338-51 (*) [IF : 9.196] 2 Schleinitz N, Cognet C, Guia S, Laugier-Anfossi F, Baratin M, Pouget J, Pelissier JF, Harle JR, Vivier E, Figarella-Branger D. Expression of the CD85j (leukocyte Ig-like receptor 1, Ig-like transcript 2) receptor for class I major histocompatibility complex molecules in idiopathic inflammatory myopathies. Arthritis Rheum 2008; 58: 3216-23 (*) [IF : 7.764] 2009 3 De Paula AM, Franques J, Fernandez C, Monnier N, Lunardi J, Pellissier JF, Figarella-Branger D, Pouget J. A TPM3 mutation causing cap myopathy. Neuromuscul Disord 2009; 19: 685-8 (*) [IF : 2.638] 4 Krahn M, Beroud C, Labelle V, Nguyen K, Bernard R, Bassez G, Figarella-Branger D, Fernandez C, Bouvenot J, Richard I, Ollagnon-Roman E, Bevilacqua JA, Salvo E, Attarian S, Chapon F, Pellissier JF, Pouget J, Hammouda el H, Laforet P, Urtizberea JA, Eymard B, Leturcq F, Levy N. Analysis of the DYSF mutational spectrum in a large cohort of patients. Hum Mutat 2009; 30: E345-75 (*) [IF : 5.34] 2010 5 Claeys KG, Pellissier JF, Garcia-Bragado F, Weis J, Urtizberea A, Poza JJ, Cobo AM, Stoltenburg G, Figarella-Branger D, Willems PJ, Depuydt CE, Kleiner W, Pouget J, Piraud M, Brochier G, Romero NB, Fardeau M, Goebel HH, Bonnemann CG, Voit T, Eymard B, Laforet P. Myopathy with hexagonally cross-linked crystalloid inclusions: delineation of a clinico-pathological entity. Neuromuscul Disord 2010; 20: 701-8 (*) [IF : 2.638] 7 Dernière mise à jour : 29/06/2016 6 Fernandez C, Halbert C, De Paula AM, Lacroze V, Froissart R, Figarella-Branger D, Chabrol B, Pellissier JF. Non-lethal neonatal neuromuscular variant of glycogenosis type IV with novel GBE1 mutations. Muscle Nerve 2010; 41: 269-71 (*) [IF : 2.283] 2011 7 Lehtokari VL, Pelin K, Herczegfalvi A, Karcagi V, Pouget J, Franques J, Pellissier JF, Figarella-Branger D, von der Hagen M, Huebner A, Schoser B, Lochmuller H, WallgrenPettersson C. Nemaline myopathy caused by mutations in the nebulin gene may present as a distal myopathy. Neuromuscul Disord 2011; 21: 556-62 (*) [IF : 2.638] 2012 8 De Paula AM, Bartoli M, Courrier S, Pouget J, Levy N, Pellissier JF, FigarellaBranger D, Krahn M, Attarian S. Further heterogeneity in myopathy with tubular aggregates? Muscle Nerve 2012; 46: 984-5 (*) [IF : 2.283] 2013 9 Bohm J, Chevessier F, Maues De Paula A, Koch C, Attarian S, Feger C, Hantai D, Laforet P, Ghorab K, Vallat JM, Fardeau M, Figarella-Branger D, Pouget J, Romero NB, Koch M, Ebel C, Levy N, Krahn M, Eymard B, Bartoli M, Laporte J. Constitutive activation of the calcium sensor STIM1 causes tubular-aggregate myopathy. Am J Hum Genet 2013; 92: 271-8 (*) [IF : 10.931] 10 Ebbo M, Chagnaud C, Figarella-Branger D, Legall S, Harle JR, Schleinitz N. Antisynthethase syndrome presenting as peripheral limb fasciitis. Joint Bone Spine 2013; 80: 528-30 (*) [IF : 2.901] 11 Fernandez C, Bardin N, De Paula AM, Salort-Campana E, Benyamine A, Franques J, Schleinitz N, Weiller PJ, Pouget J, Pellissier JF, Figarella-Branger D. Correlation of clinicoserologic and pathologic classifications of inflammatory myopathies: study of 178 cases and guidelines for diagnosis. Medicine (Baltimore) 2013; 92: 15-24 (*) [IF : 4.256] 12 Malfatti E, Olive M, Taratuto AL, Richard P, Brochier G, Bitoun M, Gueneau L, Laforet P, Stojkovic T, Maisonobe T, Monges S, Lubieniecki F, Vasquez G, Streichenberger N, Lacene E, Saccoliti M, Prudhon B, Alexianu M, Figarella-Branger D, Schessl J, Bonnemann C, Eymard B, Fardeau M, Bonne G, Romero NB. Skeletal muscle biopsy analysis in reducing body myopathy and other FHL1-related disorders. J Neuropathol Exp Neurol 2013; 72: 833-45 (*) [IF : 3.797] 13 Mercier S, Kury S, Shaboodien G, Houniet DT, Khumalo NP, Bou-Hanna C, Bodak N, Cormier-Daire V, David A, Faivre L, Figarella-Branger D, Gherardi RK, Glen E, Hamel A, Laboisse C, Le Caignec C, Lindenbaum P, Magot A, Munnich A, Mussini JM, Pillay K, Rahman T, Redon R, Salort-Campana E, Santibanez-Koref M, Thauvin C, Barbarot S, Keavney B, Bezieau S, Mayosi BM. Mutations in FAM111B cause hereditary fibrosing poikiloderma with tendon contracture, myopathy, and pulmonary fibrosis. Am J Hum Genet 2014; 93: 1100-7 (*) [IF : 10.931] 2014 8 Dernière mise à jour : 29/06/2016 14 Sevy A, Cerino M, Gorokhova S, Dionnet E, Mathieu Y, Verschueren A, Franques J, Maues de Paula A, Figarella-Branger D, Lagarde A, Desvignes JP, Béroud C, Attarian S, Levy N, Bartoli M, Krahn M, Campana-Salort E, Pouget J. Improving molecular diagnosis of distal myopathies by targeted next-generation sequencing. J Neurol Neurosurg Psychiatry 2015; 87: 340-42 (*) [IF : 6.807] 2. Tumorothèque 2008 1 Acunzo J, Thirion S, Roche C, Saveanu A, Gunz G, Germanetti AL, Couderc B, Cohen R, Figarella-Branger D, Dufour H, Brue T, Enjalbert A, Barlier A. Somatostatin receptor sst2 decreases cell viability and hormonal hypersecretion and reverses octreotide resistance of human pituitary adenomas. Cancer Res 2008; 68: 10163-70 (*) [IF : 9.329] 2 Fevre-Montange M, Szathmari A, Champier J, Mokhtari K, Chretien F, Coulon A, Figarella-Branger D, Polivka M, Varlet P, Uro-Coste E, Fauchon F, Jouvet A. Pineocytoma and pineal parenchymal tumors of intermediate differentiation presenting cytologic pleomorphism: a multicenter study. Brain Pathol 2008; 18: 354-9 (*) [IF : 4.643] 3 Metellus P, Figarella-Branger D, Guyotat J, Barrie M, Giorgi R, Jouvet A, Chinot O. Supratentorial ependymomas: prognostic factors and outcome analysis in a retrospective series of 46 adult patients. Cancer 2008; 113: 175-85 (Matériel et Méthodes) [IF : 5.068] 4 Metellus P, Nanni I, Dussert C, Trinkhaus M, Fuentes S, Chinot O, Ouafik LH, Fina F, Dufour H, Figarella-Branger D, Grisoli F, Lah TT, Martin PM. [Prognostic implications of biologic markers in intracranial meningiomas: 120 cases]. Neurochirurgie 2008; 54: 750-6 (*) [IF : 0.406] 5 Trouillas J, Labat-Moleur F, Sturm N, Kujas M, Heymann MF, Figarella-Branger D, Patey M, Mazucca M, Decullier E, Verges B, Chabre O, Calender A. Pituitary tumors and hyperplasia in multiple endocrine neoplasia type 1 syndrome (MEN1): a case-control study in a series of 77 patients versus 2509 non-MEN1 patients. Am J Surg Pathol 2008; 32: 534-43(*) [IF : 4.592] 2009 6 Aubert S, Wendling F, Regis J, McGonigal A, Figarella-Branger D, Peragut JC, Girard N, Chauvel P, Bartolomei F. Local and remote epileptogenicity in focal cortical dysplasias and neurodevelopmental tumours. Brain 2009; 132: 3072-86 (*) [IF : 9.196] 7 Barlesi F, Nanni-Metellus I, Breen D, Fina F, Astoul P, Martin PM. Non-small cell lung cancer-smokers or non-smokers, does it matter? Lung Cancer 2009; 63: 430-2 (*) [IF : 3.958] 8 Colin C, Voutsinos-Porche B, Nanni I, Fina F, Metellus P, Intagliata D, Baeza N, Bouvier C, Delfino C, Loundou A, Chinot O, Lah T, Kos J, Martin PM, Ouafik L, FigarellaBranger D. High expression of cathepsin B and plasminogen activator inhibitor type-1 are strong predictors of survival in glioblastomas. Acta Neuropathol 2009; 118: 745-54 (Remerciements) [IF : 10.762] 9 Dernière mise à jour : 29/06/2016 9 Deville JL, Bartoli C, Berenguer C, Fernandez-Sauze S, Kaafarani I, Delfino C, Fina F, Salas S, Muracciole X, Mancini J, Lechevallier E, Martin PM, Figarella-Branger D, Ouafik L, Daniel L. Expression and role of adrenomedullin in renal tumors and value of its mRNA levels as prognostic factor in clear-cell renal carcinoma. Int J Cancer 2009; 125: 2307-15 (*) [IF : 5.085] 10 Guyotat J, Metellus P, Giorgi R, Barrie M, Jouvet A, Fevre-Montange M, Chinot O, Durand A, Figarella-Branger D. Infratentorial ependymomas: prognostic factors and outcome analysis in a multi-center retrospective series of 106 adult patients. Acta Neurochir (Wien) 2009; 151: 947-60 (*) [IF : 1.766] 11 Metellus P, Coulibaly B, Nanni I, Fina F, Eudes N, Giorgi R, Barrie M, Chinot O, Fuentes S, Dufour H, Ouafik L, Figarella-Branger D. Prognostic impact of O6methylguanine-DNA methyltransferase silencing in patients with recurrent glioblastoma multiforme who undergo surgery and carmustine wafer implantation: a prospective patient cohort. Cancer 2009; 115: 4783-94 (*) [IF : 5.068] 12 Palm T, Figarella-Branger D, Chapon F, Lacroix C, Gray F, Scaravilli F, Ellison DW, Salmon I, Vikkula M, Godfraind C. Expression profiling of ependymomas unravels localization and tumor grade-specific tumorigenesis. Cancer 2009; 115: 3955-68 (*) [IF : 5.068] 13 Salas S, Jezequel P, Campion L, Deville JL, Chibon F, Bartoli C, Gentet JC, Charbonnel C, Gouraud W, Voutsinos-Porche B, Brouchet A, Duffaud F, Figarella-Branger D, Bouvier C. Molecular characterization of the response to chemotherapy in conventional osteosarcomas: predictive value of HSD17B10 and IFITM2. Int J Cancer 2009; 125: 851-60 (Remerciements) [IF : 5.085] 14 Tchoghandjian A, Fernandez C, Colin C, El Ayachi I, Voutsinos-Porche B, Fina F, Scavarda D, Piercecchi-Marti MD, Intagliata D, Ouafik L, Fraslon-Vanhulle C, FigarellaBranger D. Pilocytic astrocytoma of the optic pathway: a tumour deriving from radial glia cells with a specific gene signature. Brain 2009; 132: 1523-35 (Matériel et Méthodes, Remerciements) [IF : 9.196] 2010 15 Amoureux MC, Coulibaly B, Chinot O, Loundou A, Metellus P, Rougon G, FigarellaBranger D. Polysialic acid neural cell adhesion molecule (PSA-NCAM) is an adverse prognosis factor in glioblastoma, and regulates olig2 expression in glioma cell lines. BMC Cancer 2010; 10: 91 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.36] 16 Bennani B, Gilles S, Fina F, Nanni I, Ibrahimi SA, Riffi AA, Nejjari C, Benajeh DA, El Abkari M, Martin PM, Ouafik L. Mutation analysis of BRAF exon 15 and KRAS codons 12 and 13 in Moroccan patients with colorectal cancer. Int J Biol Markers 2010; 25: 179-84 (*) [IF : 1.371] 17 Carpentier A, Metellus P, Ursu R, Zohar S, Lafitte F, Barrie M, Meng Y, Richard M, Parizot C, Laigle-Donadey F, Gorochov G, Psimaras D, Sanson M, Tibi A, Chinot O, Carpentier AF. Intracerebral administration of CpG oligonucleotide for patients with recurrent glioblastoma: a phase II study. Neuro Oncol 2010; 12: 401-8 (*) [IF : 6.776] 10 Dernière mise à jour : 29/06/2016 18 Coulibaly B, Nanni I, Quilichini B, Gaudart J, Metellus P, Fina F, Boucard C, Chinot O, Ouafik L, Figarella-Branger D. Epidermal growth factor receptor in glioblastomas: correlation between gene copy number and protein expression. Hum Pathol 2010; 41: 815-23 (Remerciements) [IF : 2.769] 19 Ducray F, de Reynies A, Chinot O, Idbaih A, Figarella-Branger D, Colin C, KarayanTapon L, Chneiweiss H, Wager M, Vallette F, Marie Y, Rickman D, Thomas E, Delattre JY, Honnorat J, Sanson M, Berger F. An ANOCEF genomic and transcriptomic microarray study of the response to radiotherapy or to alkylating first-line chemotherapy in glioblastoma patients. Mol Cancer 2010; 9: 234 (*) [IF : 4.257] 20 El Ayachi I, Baeza N, Fernandez C, Colin C, Scavarda D, Pesheva P, FigarellaBranger D. KIAA0510, the 3'-untranslated region of the tenascin-R gene, and tenascin-R are overexpressed in pilocytic astrocytomas. Neuropathol Appl Neurobiol 2010; 36: 399-410 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.927] 21 Lah TT, Nanni I, Trinkaus M, Metellus P, Dussert C, De Ridder L, Rajcevic U, Blejec A, Martin PM. 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Mitotic index, microvascular proliferation, and necrosis define 3 groups of 1p/19q codeleted anaplastic 17 Dernière mise à jour : 29/06/2016 oligodendrogliomas associated with different genomic alterations. Neuro Oncol 2014; 16: 1244-54 (Remerciements) [IF : 6.776] 81 Joubert C, Boissonneau S, Faguer R, Fina F, Adetchessi T, Fuentes S, Dufour H, Metellus P. Discordance d’expression du récepteur du facteur de croissance épidermique de type 2 (HER2) et des récepteurs hormonaux entre les lésions primitives de cancer du sein et leurs métastases cérébrales Neurochirurgie 2014; 60: 332-3 (*) [IF : 0.406] 82 Laffaire J, Di Stefano AL, Chinot O, Idbaih A, Gallego Perez-Larraya J, Marie Y, Vintonenko N, Boisselier B, Farina P, Delattre JY, Figarella-Branger D, Honnorat J, Sanson M, Ducray F. An ANOCEF genomic and transcriptomic microarray study of the response to irinotecan and bevacizumab in recurrent glioblastomas. Biomed Res Int 2014; 2014: 282815 (Remerciements) [IF : 1.579] 83 Lagarde S, Tabouret E, Matta M, Franques J, Attarian S, Pouget J, Maues De Paula A, Figarella-Branger D, Dory-Lautrec P, Chinot O, Barrie M. Primary neurolymphomatosis diagnosis and treatment: a retrospective study. J Neurol Sci 2014; 342: 178-81 (Remerciements) [IF : 2.474] 84 Maues De Paula A, Vasiljevic A, Giorgi R, Gomez-Brouchet A, Aubert S, Leroy X, Duval H, de Pinieux G, Bouvier C. A diagnosis of giant cell-rich tumour of bone is supported by p63 immunohistochemistry, when more than 50 % of cells is stained. Virchows Arch 2014; 465: 487-94 (Remerciements) [IF : 2.651] 85 Mear Y, Blanchard MP, Defilles C, Brue T, Figarella-Branger D, Graillon T, Manavela M, Barlier A, Enjalbert A, Thirion S. Ghrelin receptor (GHS-R1a) and its constitutive activity in somatotroph adenomas: a new co-targeting therapy using GHS-R1a inverse agonists and somatostatin analogs. J Clin Endocrinol Metab 2014; 99: E2463-71 (Remerciements) [IF : 6.209] 86 Pallud J, Audureau E, Noel G, Lechapt-Zalcman E, Duntze J, Guyotat J, Dam-Hieu P, Le Reste PJ, Faillot T, Litre F, Desse N, Petit A, Emery E, Voirin J, Peltier J, Caire F, Vignes JR, Barat JL, Langlois O, Dezamis E, Pavlov V, Lefranc M, Bauchet L, Devaux B, Menei P, Metellus P. Long-term results of carmustine wafers implantation for newly-diagnosed glioblastomas in France: Controlled propensity matched multicenter cohort study. Neurochirurgie 2014; 60: 330 (*) [IF : 0.406] 87 Quillien V, Lavenu A, Sanson M, Legrain M, Dubus P, Karayan-Tapon L, Mosser J, Ichimura K, Figarella-Branger D. Outcome-based determination of optimal pyrosequencing assay for MGMT methylation detection in glioblastoma patients. J Neurooncol 2014; 116: 487-96 (Remerciements) [IF : 3.070] 88 Reyes-Botero G, Dehais C, Idbaih A, Martin-Duverneuil N, Lahutte M, Carpentier C, Letouze E, Chinot O, Loiseau H, Honnorat J, Ramirez C, Moyal E, Figarella-Branger D, Ducray F. Contrast enhancement in 1p/19q-codeleted anaplastic oligodendrogliomas is associated with 9p loss, genomic instability, and angiogenic gene expression. Neuro Oncol 2014; 16: 662-70 (Matériel et Méthodes) [IF : 6.776] 89 Salas S, Jiguet-Jiglaire C, Campion L, Bartoli C, Frassineti F, Deville JL, Maues De Paula A, Forest F, Jezequel P, Gentet JC, Bouvier C. Correlation between ERK1 and STAT3 18 Dernière mise à jour : 29/06/2016 expression and chemoresistance in patients with conventional osteosarcoma. BMC Cancer 2014; 14: 606 (Matériel et Méthodes) [IF : 3.36] 90 Secq V, Villeret J, Fina F, Carmassi M, Carcopino X, Garcia S, Metellus I, Boubli L, Iovanna J, Charpin C. Triple negative breast carcinoma EGFR amplification is not associated with EGFR, Kras or ALK mutations. Br J Cancer 2014; 110: 1045-52 (*) [IF : 4.836] 91 Tabouret E, Fina F, Vincentelli F, Nanni I, Figarella-Branger D. New IDH1 I113T mutation associated with BRAF V600E mutation: new driver of gliomagenesis? J Neurol Sci 2014; 342: 204-6 (Matériel et Méthodes) [IF : 2.474] 92 Tabouret E, Boudouresque F, Barrie M, Matta M, Boucard C, Loundou A, Carpentier A, Sanson M, Metellus P, Figarella-Branger D, Ouafik L, Chinot O. Association of matrix metalloproteinase 2 plasma level with response and survival in patients treated with bevacizumab for recurrent high-grade glioma. Neuro Oncol 2014; 16: 392-9 (*) [IF : 6.776] 2015 93 Alentorn A, Dehais C, Ducray F, Carpentier C, Mokhtari K, Figarella-Branger D, Chinot O, Cohen-Moyal E, Ramirez C, Loiseau H, Elouahdani-Hamdi S, Beauchesne P, Langlois O, Desenclos C, Guillamo JS, Dam-Hieu P, Ghiringhelli F, Colin P, Godard J, Parker F, Dhermain F, Carpentier AF, Frenel JS, Menei P, Bauchet L, Faillot T, Fesneau M, Fontaine D, Motuo-Fotso MJ, Vauleon E, Gaultier C, Le Guerinel C, Gueye EM, Noel G, Desse N, Durando X, Barrascout E, Wager M, Ricard D, Carpiuc I, Delattre JY, Idbaih A; POLA Network. Allelic loss of 9p21.3 is a prognostic factor in 1p/19q codeleted anaplastic gliomas. Neurology 2015; 85: 1325-31 (*) [IF : 8.286] 94 Bielle F, Villa C, Giry M, Bergemer-Fouquet AM, Polivka M, Vasiljevic A, AubriotLorton MH, Bernier M, Lechapt-Zalcman E, Viennet G, Sazdovitch V, Duyckaerts C, Sanson M, Figarella-Branger D, Mokhtari K; RENOP. Chordoid gliomas of the third ventricle share TTF-1 expression with organum vasculosum of the lamina terminalis. Am J Surg Pathol 2015; 39: 948-56 (Remerciements) [IF : 4.592] 95 Bruno A, Alentorn A, Daniau M, Labussière M, Rahimian A, Tabouret E, Polivka M, Jouvet A, Adam C, Figarella-Branger D, Chrétien F, Eimer S, Houillier C, Soussain C, Mokhtari K, Hoang-Xuan K. TERT promoter mutations in primary central nervous system lymphoma are associated with spatial distribution in the splenium. Acta Neuropathol 2015; 130: 439-40 (Affiliations) [IF : 10.762] 96 Clifford SC, Lannering B, Schwalbe EC, Hicks D, O'Toole K, Nicholson SL, Goschzik T, Zur Mühlen A, Figarella-Branger D, Doz F, Rutkowski S, Gustafsson G, Pietsch T; SIOP-Europe PNET Group. Biomarker-driven stratification of disease-risk in nonmetastatic medulloblastoma: Results from the multi-center HIT-SIOP-PNET4 clinical trial. Oncotarget 2015; 6: 38827-39 (*) [IF : 6.368] 97 Figarella-Branger D, Mokhtari K, Colin C, Uro-Coste E, Jouvet A, Dehais C, Carpentier C, Villa C, Maurage CA, Eimer S, Polivka M, Vignaud JM, Laquerriere A, Sevestre H, Lechapt-Zalcman E, Quintin-Roue I, Aubriot-Lorton MH, Diebold MD, Viennet G, Adam C, Loussouarn D, Michalak S, Rigau V, Heitzmann A, Vandenbos F, Forest F, Chiforeanu D, Tortel MC, Labrousse F, Chenard MP, Nguyen AT, Varlet P, Kemeny JL, Levillain PM, Cazals-Hatem D, Richard P, Delattre JY. Prognostic relevance of 19 Dernière mise à jour : 29/06/2016 histomolecular classification of diffuse adult high grade gliomas with necrosis. Brain Pathol 2015; 25: 418-28 (Remerciements) [IF : 4.643] 98 Graillon T, Defilles C, Mohamed A, Lisbonis C, Germanetti AL, Chinot O, FigarellaBranger D, Roche PH, Adetchessi T, Fuentes S, Metellus P, Dufour H, Enjalbert A, Barlier A. Combined treatment by octreotide and everolimus: Octreotide enhances inhibitory effect of everolimus in aggressive meningiomas. J Neurooncol 2015; 124: 33-43 (Remerciements) [IF : 3.070] 99 Jullien N, Roche C, Brue T, Figarella-Branger D, Graillon T, Barlier A, Herman JP. Dose-dependent dual role of PIT-1 (POU1F1) in somatolactotroph cell proliferation and apoptosis. PLoS One 2015; 10: e0120010 (Remerciements) [IF : 3.234] 100 Labreche K, Simeonova I, Kamoun A, Gleize V, Chubb D, Letouzé E, Riazalhosseini Y, Dobbins SE, Elarouci N, Ducray F, de Reyniès A, Zelenika D, Wardell CP, Frampton M, Saulnier O, Pastinen T, Hallout S, Figarella-Branger D, Dehais C, Idbaih A, Mokhtari K, Delattre JY, Huillard E, Mark Lathrop G, Sanson M, Houlston RS; POLA Network. TCF12 is mutated in anaplastic oligodendroglioma. Nat Commun 2015; 6: 7207 (*) [IF : 11.470] 101 Martinez E, Silvy F, Fina F, Bartoli M, Krahn M, Barlesi F, Figarella-Branger D, Iovanna J, Laugier R, Ouaissi M, Lombardo D, Mas E. Rs488087 single nucleotide polymorphism as predictive risk factor for pancreatic cancers. Oncotarget 2015; 6: 39855-64 (Matériels et Méthodes) [IF : 6.368] 102 Tabareau-Delalande F, Collin C, Gomez-Brouchet A, Bouvier C, Decouvelaere AV, de Muret A, Pagès JC, de Pinieux G. Chromosome 12 long arm rearrangement covering MDM2 and RASAL1 is associated with aggressive craniofacial juvenile ossifying fibroma and extracranial psammomatoid fibro-osseous lesions. Mod Pathol 2015; 28: 48-56 (*) [IF : 6.187] 103 Tabouret E, Tchoghandjian A, Denicolai E, Delfino C, Metellus P, Graillon T, Boucard C, Nanni I, Padovani L, Ouafik L, Figarella-Branger D, Chinot O. Recurrence of glioblastoma after radio-chemotherapy is associated with an angiogenic switch to the CXCL12-CXCR4 pathway.Oncotarget 2015; 6: 11664-75 (Patients et Méthodes) [IF : 6.368] 104 Vera-Bolanos E, Aldape K, Yuan Y, Wu J, Wani K, Necesito-Reyes MJ, Colman H, Dhall G, Lieberman FS, Metellus P, Mikkelsen T, Omuro A, Partap S, Prados M, Robins HI, Soffietti R, Wu J, Gilbert MR, Armstrong TS. Clinical course and progression-free survival of adult intracranial and spinal ependymoma patients. Neuro Oncol 2015; 17: 440-7(*) [IF : 6.776] 2016 105 Denicolaï E, Tabouret E, Colin C, Metellus P, Nanni I, Boucard C, Tchoghandjian A, Meyronet D, Baeza-Kallee N, Chinot O, Figarella-Branger D. Molecular heterogeneity of glioblastomas; does location matter? Oncotarget 2016; 7: 902-13 (Patients et Méthodes) [IF : 6.368] 106 Figarella-Branger D, Lechapt-Zalcman E, Tabouret E, Jünger S, de Paula AM, Bouvier C, Colin C, Jouvet A, Forest F, Andreiuolo F, Quintin-Roue I, Machet MC, Heitzmann A, Milin S, Sevestre H, Godfraind C, Labrousse F, Metellus P, Scavarda D, 20 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Pietsch T. Supratentorial clear cell ependymomas with branching capillaries demonstrate characteristic clinicopathological features and pathological activation of nuclear factorkappaB signaling. Neuro Oncol. 2016; 18:919-27 (Remerciements) [IF : 6.776] 107 Greillier L, Tounsi A, Berenguer-Daizé C, Dussault N, Delfino C, Benyahia Z, Cayol M, Mabrouk K, Garcia S, Martin PM, Barlesi F, Oufaik L. Functional analysis of the adrenomedullin pathway in malignant pleural mesothelioma. JTHO 2016; 11: 94-107 (Matériels et Méthodes) [IF : 5.282] 108 Guérin M, Thariat J, Ouali M, Bouvier C, Decouvelaere AV, Cassagnau E, Aubert S, Lepreux S, Coindre JM, Valmary-Degano S, Larousserie F, Meilleroux J, Projetti F, Stock N, Galant C, Marie B, Peyrottes I, de Pinieux G, Gomez-Brouchet A. A new subtype of highgrade mandibular osteosarcoma with RASAL1/MDM2 amplification. Hum Pathol. 2016; 50: 70-8 (Matériels et Méthodes) [IF : 5.282] 109 Kamoun A, Idbaih A, Dehais C, Elarouci N, Carpentier C, Letouzé E, Colin C, Mokhtari K, Jouvet A, Uro-Coste E, Martin-Duverneuil N, Sanson M, Delattre JY, FigarellaBranger D, de Reyniès A, Ducray F; POLA network. Integrated multi-omics analysis of oligodendroglial tumours identifies three subgroups of 1p/19q co-deleted gliomas. Nat Commun. 2016; 7: 112-63 (Remerciements) [IF : 11.470] 110 Macagno N, Figarella-Branger D, Mokthari K, Metellus P, Jouvet A, Vasiljevic A, Loundou A, Bouvier C. Differential Diagnosis of Meningeal SFT-HPC and Meningioma: Which Immunohistochemical Markers Should Be Used? Am J Surg Pathol 2016. 40: 270-8 (Matériels et Méthodes) [IF : 4.592] 111 Mascelli S, Nozza P, Jones D. T. W, Colin C, Pistorio A, Milanaccio C, Ravegnani M, Consales A, Witt O, Morana G, Cama A, Capra V, Biassoni R, Pfister S. M, FigarellaBranger D, Garrè M. L, Raso A.TP53 codon 72 polymorphism may predict early tumour progression in paediatric pilocytic astrocytoma. Oncotarget 2016 [Epub ahead of print] (Matériels et Méthodes) [IF : 6.368] 112 Masliah-Planchon J, Machet MC, Fréneaux P, Jourdain A, Mortemousque I, Raïs KA, Ballet S, Jouvet A, Figarella-Branger D, Delattre O, Bourdeaut F. SMARCA4-Mutated Atypical Teratoid/Rhabdoid Tumor with Retained BRG1 Expression. Pediatr Blood Cancer 2016; 63: 568-9 (*) [IF : 2.386] 113 Taïeb D, Barlier A, Yang C, Pertuit M, Tchoghandjian A, Rochette C, Zattara-Canoni H, Figarella-Branger D, Zhuang Z, Pacak K, Metellus P. Somatic gain-of-function HIF2A mutations in sporadic central nervous system hemangioblastomas. J Neurooncol 2016; 126: 473-81 (Matériels et Méthodes) [IF : 3.070] 21 Dernière mise à jour : 29/06/2016 III – Bilan des cessions de matériel pour projets de recherche et publications associées Classées chronologiquement selon les dates de demande de cession. Il peut y avoir plusieurs cessions pour un même projet. Code Biobanque Titre du projet et investigateur principal (Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) Nature des échantillons cédés Nombre total de patients inclus Publications 2008 068CCL Etude de l'expression de l'adrénomédulline dans les gliomes – L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2) 076LIG Analyse par une approche couplée CGH-array / transcriptome de la chimiosensibilité des glioblastomes Tissus congelés – F. Ducray (hors AP-HM) 093GLD 108RCC 109ACO Tissus congelés Etude translationnelle de l'impact des marqueurs de chimiorésistance dans les glioblastomes – P. Metellus Tissus congelés (AP-HM / CRO2) Etude de l'expression de l'adrénoméduline et de ses récepteurs dans les carcinomes du rein – L’H. Ouafik Tissus congelés (AP-HM / CRO2) Dosage de l'adrenomédulline et ses récepteurs (ARN + proteines) dans les cancers colorectaux – L’H. Ouafik Tissus congelés (AP-HM / CRO2) 11 37 8 19 2 11 15 9 23 68 112MET Mise au point de la recherche de méthylation de gènes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) ADN tissulaires 36 11, 87 113MPM Etude de l'expression de l'adrénoméduline, de ses récepteurs et du VEGF dans les mésothéliomes – L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2) Tissus congelés ARN tissulaires 14 10 107 116REG Analyse du REGF dans une série de glioblastomes par différentes techniques (FISH, PCR, IHC) – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Tissus congelés 60 18 84 Pas de publication 96 79 117LCV 118STU Etude du microenvironnement tumoral des lésions bénignes et malignes des cordes vocales (RT-PCR) – S. Tissus congelés Duflo (AP-HM) Etude rétrospective de l'expression de MGMT dans les glioblastomes traités selon le schéma de STUPP – O. Tissus congelés Chinot (AP-HM / CRO2) 120CSC Dosage du CD133 (ARN) dans une série de Tissus congelés glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) 48 35 124TEP Corrélation entre l'expression de différents marqueurs moléculaires et l'intensité de fixation en TEP-FDG préthérapeutique dans les glioblastomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2) 9 41 125ECO Protocole ECOM: Evaluation comparative des techniques d'analyse de la MGMT comme facteur ADN tissulaires prédictif de réponse au Témozolomide dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) 25 51, 79, 87 126TRA Etude transcriptomique des glioblastomes et corrélation à la topographie et au taux de cellules CD133+ – D. ARN tissulaires Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) 8 52 127OLA Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) 2 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109 Tissus congelés Tissus congelés 22 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Code Biobanque Titre du projet et investigateur principal (Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) Nature des échantillons cédés Nombre total de patients inclus Publications et J-Y. Delattre (hors AP-HM) 118STU (2ème cession) 124TEP (2ème cession) 127OLA (2ème à 4ème cessions) 129CAV 130ISO 131TFS 135PSA 2009 Etude rétrospective de l'expression de MGMT dans les glioblastomes traités selon le schéma de STUPP – O. Tissus congelés Chinot (AP-HM / CRO2) Corrélation entre l'expression de différents marqueurs moléculaires et l'intensité de fixation en TEP-FDG Tissus congelés préthérapeutique dans les glioblastomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Tissus congelés et J-Y. Delattre (hors AP-HM) Analyse transcriptomique et par CGH array de glioblastomes répondant ou non au traitement par campto-avastin à la récidive – O. Chinot (AP-HM / CRO2) et F. Ducray (hors AP-HM) Tissus congelés Protocole ISOPS III: essai de phase II randomisée multicentrique, détermination du statut MGMT dans Tissus congelés une série de glioblastomes – A. Carpentier (hors APHM) Projet Inca GENOSTT: de la cellule souche aux remaniements du génome:caractérisation moléculaire et Tissus congelés fonctionnelle des tumeurs adipocytaires et fibreuses – C. Bouvier (AP-HM / CRO2) Dosage de l'expression de la glycoprotéine PSANCAM par ELISA dans les glioblastomes (tumeur Tissus congelés initiale et récidive) – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) 4 79 51 41 3 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109 13 82 17 17 19 39, 56, 57 3 15 136CSC Interaction physique entre les molécules A2B5 et CD133 dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Tissus congelés 5 28 137PIL Caractérisation moléculaire des astrocytomes pilocytiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Tissus congelés Lames paraffine 47 101 14, 61 138BIR Recherche de mutations des gènes IDH1 et IDH2 dans une série de gliomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / ADN tissulaires CRO2) 59 24, 36, 45 139EPE Recherche de la fusion des gènes KIAA1549 et BRAF dans les épendymomes – D. Figarella-Branger (AP-HM Tissus congelés / CRO2) 15 Pas de publication ADN tissulaires ARN tissulaires Tissus congelés 27 5 8 17 ADN tissulaires 2 24, 36, 45 Tissus congelés 20 74 130ISO (2ème à 4ème cessions) 138BIR (2ème cession) 140MIR 2010 Protocole ISOPS III: essai de phase II randomisée multicentrique, détermination du statut MGMT dans une série de glioblastomes – A. Carpentier (hors APHM) Recherche de mutations des gènes IDH1 et IDH2 dans une série de gliomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Analyse de l'expression de miRNA dans les tumeurs du SNC – F. Boudouresque (CRO2) 23 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Code Biobanque 141PED 142IDH 150PSA Titre du projet et investigateur principal (Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) Recherche de mutations du gène IDH1 dans des gliomes de l'enfant – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Corrélation TEP IDH dans les gliomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Dosage de PSA-NCAM dans le cancer du poumon – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et P. Thomas (hors AP-HM) 2011 Nature des échantillons cédés Nombre total de patients inclus Publications ADN tissulaires 4 50, 64 ADN tissulaires Tissus congelés 16 6 36, 49 Tissus congelés 9 Pas de publication 127OLA (5ème à 7ème cessions) Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et J-Y. Delattre (hors AP-HM) Tissus congelés 27 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109 136CSC (2ème cession) Interaction physique entre les molécules A2B5 et CD133 dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Tissus congelés 8 28 150PSA (2ème cession) Dosage de PSA-NCAM dans le cancer du poumon – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et P. Thomas (hors Tissus congelés AP-HM) 4 Pas de publication 152SDF Implication de l'adrénomédulline et du facteur SDF-1 dans la vascularisation tumorale des glioblastomes – L’H. Ouafik (AP-HM / CRO2) Tissus congelés 23 En cours 154PIN Analyse du profil génomique des tumeurs corticales de l'enfant par CGH array – D. Figarella-Branger (AP-HM Tissus congelés / CRO2) 19 50 158AST Analyse de l'expression de cibles thérapeutiques dans les astrocytomes pilocytiques par RT-PCR quantitative Tissus congelés – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) 44 67 159ORL Etude de prédiction de la réponse à une chimiothérapie d'induction des carcinomes épidermoïdes des voies Tissus congelés aérodigestives supérieures. PHRC national 2006 – B. Lallemant (hors AP-HM) 8 Investigateur contacté 160SEI Etude de l'expression du REGF sur des carcinomes mammaires de haut grade HER2 négatif – C. Charpin (AP-HM) Lames paraffine 44 90 161SMG Classification d'une cohorte de glioblastomes sur la base de leurs signatures moléculaires – D. FigarellaBranger (AP-HM / CRO2) Tissus congelés 51 105 Tissus congelés Paraffine (TMA) 4 203 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109 Tissus congelés 2 28 Lames paraffine 5 90 Tissus congelés ADN tissulaire ARN tissulaire 46 41 27 105 127OLA (8ème à 11ème cessions) 136CSC (3ème cession) 160SEI (2ème cession) 161SMG (2ème cession) 2012 Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et J-Y. Delattre (hors AP-HM) Interaction physique entre les molécules A2B5 et CD133 dans les glioblastomes – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Etude de l'expression du REGF sur des carcinomes mammaires de haut grade HER2 négatif – C. Charpin (AP-HM) Classification d'une cohorte de glioblastomes sur la base de leurs signatures moléculaires – D. FigarellaBranger (AP-HM / CRO2) 24 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Code Biobanque Titre du projet et investigateur principal (Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) Nature des échantillons cédés Nombre total de patients inclus Publications 162NEO Etude in situ de l'expression des facteurs de la néoangiogenèse et des molécules protéolytiques dans les glioblastomes, au diagnostic et à la récidive – O. Chinot (AP-HM / CRO2) Tissus congelés 69 92, 103 163GAN Recherche de mutation V600E du gène BRAF dans les gangliogliomes pédiatriques – D. Figarella-Branger Lames paraffine (AP-HM / CRO2) 57 60 18 45, 49 34 70 164LGG 165CAR Caractérisation clinico-radiologique, génomique et transcriptomique des gliomes de bas grades triple Tissus congelés négatifs de l'adulte – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) Etude du génome des tumeurs cartilagineuses « conventionnelles » bénignes et malignes. Recherche de Tissus congelés nouveaux marqueurs moléculaires diagnostiques et pronostiques – C. Bouvier (AP-HM / CRO2) 168EPE PHRC épendymomes – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Tissus congelés 28 En cours 170MOS Validation de biomarqueurs du glioblastome – D. ADN tissulaires Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et J. Mosser (hors ARN tissulaires AP-HM) 32 9 79 Tissus congelés 10 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109 Tissus congelés Lames paraffine 17 92 105 Tissus congelés 12 92, 103 Tissus congelés Paraffine 115 106 71, 81 Tissus congelés ADN tissulaires 23 13 62, 86 Tissus congelés 6 En cours Lames paraffine 25 91 Blocs paraffine Projet sollicité, pas de sortie à ce jour 127OLA (12ème à 17ème cessions) 161SMG (3ème cession) 162NEO (2ème cession) 171MET 172GLR 177LGG 180PXA 181PIT 2013 Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et J-Y. Delattre (hors AP-HM) Classification d'une cohorte de glioblastomes sur la base de leurs signatures moléculaires – D. FigarellaBranger (AP-HM / CRO2) Etude in situ de l'expression des facteurs de la néoangiogenèse et des molécules protéolytiques dans les glioblastomes, au diagnostic et à la récidive – O. Chinot (AP-HM / CRO2) Mise en évidence d'une signature moléculaire différentielle entre des tumeurs primitives pulmonaires et mammaires et la métastase cérébrale associée – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Projet Gliareg: Etude prospective non randomisée évaluant l’impact de la chirurgie avec mise en place d’implants biodégradable in situ de BCNU (Gliadel®) dans les glioblastomes récidivants de l’adulte (GliaReG) – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Molecular Profiles in Low Grade Glioma, Identification of Novel Therapeutic Targets and Biomarkers for Response to Treatment (EORTC) – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Caractérisation clinico-radiologique et biologique des xanthoastrocytomes pléïomorphes – E. Tabouret (APHM / CRO2) PHRC Pituigène: Identification de marqueurs d'agressivité tumorale et de malignité des tumeurs hypophysaires par analyse génomique comparative par hybridation sur puces à ADN (CGH) – G. Raverot (hors AP-HM) 25 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Code Biobanque Titre du projet et investigateur principal (Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) Nature des échantillons cédés 182REI ETUDE SIOP2001, tumeurs du rein de l'enfant – A. Coulomb (hors AP-HM) 183PYR Demande de destockage d’ADN d’astrocytomes pilocytiques et de gangliogliomes pour la recherche du ADN tissulaires polymorphisme R72P de TP53 par pyroséquençage – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) 184ATA 127OLA (18ème à 22ème cessions) 185GBJ 186OHG 187OCG 188EPE 189HGB 190INS 192MEN Tissus congelés Blocs paraffine Nombre total de patients inclus 6 Publications En cours 25 111 Tissus congelés Lames paraffine 1 13 En cours Tissus congelés 8 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109 Lames paraffine 38 En cours Paraffine (TMA) 60 En cours Tissus congelés Expression de p63 dans les tumeurs osseuses riches en Lames paraffine cellules géantes – C. Bouvier (AP-HM / CRO2) Paraffine (TMA) Ependymomes intracraniens de l'adulte: analyse des facteurs pronostiques et caractérisation moléculaire – Blocs paraffine P. Metellus (AP-HM / CRO2) Recherche d'anomalie génétique sur le gène VHL dans les hémangioblastomes apparemment sporadiques – P. Blocs paraffine Metellus (AP-HM / CRO2) Analyse neuroradiologique des gliomes de grade II et Tissus congelés III impliquant l'insula; corrélation aux données histoBlocs paraffine moléculaires – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Recherche des transcrits de fusion NAB2-STAT6 dans Tissus congelés les méningiomes anaplasiques – C. Bouvier (AP-HM / ARN tissulaires CRO2) 31 52 72 84 78 69, 104 37 113 44 58 En cours (Compes et al) 27 16 110 Protocole ATAG: Chimiothérapie par temozolomidebevacizumab dans les glioblastomes supratentoriels des sujets de 70 ans et plus présentant un état fonctionnel altéré (IK < 70) – O. Chinot (AP-HM / CRO2) 2014 Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et J-Y. Delattre (hors AP-HM) Caractérisation clinique, histologique et moléculaire des glioblastomes de l'adulte jeune – E. Tabouret (APHM / CRO2) Expression de l'intégrine béta1 et de YAP dans les ostéosarcomes de haut grade – C. Bouvier (AP-HM / CRO2) 193PAN Bile salt-dependent lipase single polymorphism as ADN tissulaires predictive risk for pancreatic cancers – E. Mas (CRO2) 49 101 194PED Caractérisation moléculaire des tumeurs gliales et Tissus congelés glioneuronales circonscrites de bas grade de l’enfant et ADN tissulaires de l’adulte jeune par droplet digital PCR – F. Fina (APLames paraffine HM) 3 20 20 En cours 195CIL Cilengitide (EMD121974) en association à la radiothérapie chez l’enfant et le jeune adulte porteur d’un gliome infiltrant du tronc cérébral nouvellement Tissus congelés diagnostiqué : Etude de phase I – P. Leblond (hors APHM) 4 Pas de publication 196OST Etude Intergroupe (SFCE/GSF-GETO) OS 2006 Zoledronate-Ostéosarcome – L. Brugière et S. Piperno- Tissus congelés Neumann (hors AP-HM) 7 En cours 26 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Code Biobanque 197MEL 199TUX 200MET 203HEM Titre du projet et investigateur principal (Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) Caractérisation moléculaire des mélanomes à croissance rapide – C. Gaudy (AP-HM) Etude randomisée multicentrique intergroupe pour les enfants et adolescents atteints d'un lymphome ou d'une leucémie à cellules B matures de l'enfant et l'adolescent avec évaluation d'une diminution de traitement dans les stades localiséset de l'efficacité du rituximab dans les stades avancés. Essai Inter B-NHL Ritux 2010 – C. Schmitt (hors AP-HM) Protocole métastases cérébrales : étude pilote en vue d’un essai européen soutenu par l’EORTC (étude prospective « Window of Opportunity study ») – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Conséquences psychosociales du dépistage de la maladie de Von Hippel Lindau chez des patients opérés d’un hémangioblastome du SNC (PsychoVHL) – P. Metellus (AP-HM / CRO2) Nature des échantillons cédés Nombre total de patients inclus Publications Tissus congelés Plasmas Culots lymphocytaires Sang total 34 20 19 10 En cours Blocs paraffine Tissus congelés 1 En cours Tissus congelés Sang LCR 4 4 4 Lames paraffine 11 En cours 205AST Essai multicentrique randomisé: Anti- récepteurs angiotensin II, steroïdes et radiothérapie dans les Tissus congelés glioblastomes – A. Carpentier (hors AP-HM) 3 En cours 206CHO Caractérisation moléculaire en whole exome et RNAseq des gliomes chordoïdes – F. Bielle (hors APHM) Tissus congelés 1 94 Tissus congelés Paraffine 6 7 47, 77, 80, 88, 93, 97, 100, 109 Tissus congelés 4 En cours Tissus congelés 2 102, 108 Tissus congelés 18 En cours 2015 127OLA (23ème à 33ème cessions) 194PED (2ème cession) 207 OST 208TAU Projet POLA: prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques – D. Figarella-Branger (AP-HM / CRO2) et J-Y. Delattre (hors AP-HM) Caractérisation moléculaire des tumeurs gliales et glioneuronales circonscrites de bas grade de l’enfant et de l’adulte jeune par droplet digital PCR – F. Fina (APHM) Recherche d'amplification des gènes MDM2 et RASAL1dans les ostéosarcomes de bas grade – C. Bouvier (AP-HM / CRO2) et G. de Pinieux (hors APHM) Validation d'un marqueur PET-Scan de la protéine Tau pour le suivi de la progression des glioblastomes – A. Tchoghandjian (AP-HM / CRO2) et H. Kovacic (CRO2) 209CGH Etude en CGH array des anomalies chromosomiques dans les gliomes de haut grade – D. Figarella-Branger Tissus congelés (AP-HM / CRO2) 4 Pas de publication 210GBJ Caractérisation moléculaire des glioblastomes du sujet jeune – A. Rousseau (hors AP-HM), D. FigarellaTissus congelés Branger (AP-HM / CRO2) et E. Tabouret (AP-HM / CRO2) (Listing 185GBJ) 10 En cours 211MEL Impact pronostique de la présence d'une forme active de b-caténine dans le mélanome. C. Gaudy-Marqueste Paraffine (TMA) et N. Macagno (AP-HM / hors AP-HM) 300 En cours 27 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Code Biobanque Titre du projet et investigateur principal (Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) Nature des échantillons cédés Nombre total de patients inclus Publications 212MEL Caractérisation moléculaire d'une cohorte de mélanomes métastatiques : étude de l'impact pronostique du statut mutationnel P53. C. GaudyMarqueste (AP-HM / CRO2 / hors AP-HM) ADN tissulaires 127 En cours 213SAR ICGC LMS GSF. S. Salas (AP-HM) Tissus congelés Blocs paraffine 3 3 En cours 214MMP Expression de MMP2, MMP9, CXCL12-CXCR4 et leurs partenaires chez des patients porteurs d’un Tissus congelés glioblastome au diagnostic et au cours du traitement. E. Blocs paraffine Tabouret et E. Denicolaï (AP-HM / CRO2) 3 3 En cours 214MMP (2ème cession) Expression de MMP2, MMP9, CXCL12-CXCR4 et leurs partenaires chez des patients porteurs d’un Blocs paraffine glioblastome au diagnostic et au cours du traitement. E. Tabouret et E. Denicolaï (AP-HM / CRO2) 10 En cours 215SAF Protocole UNICANCER 0105-1305/IFCT1301 SAFIR Tissu congelé 02 LUNG. A. Valette (hors AP-HM) 1 En cours Tissus congelés 2 En cours Blocs paraffine 2 En cours 216IAP 217REI Recherche de la coexpression des inhibiteurs de l'apoptose et des marqueurs de cellules souches dans les glioblastomes. A. Tchoghandjian (CRO2) (*tissus mélanomes destockés pour mises au point) Valeur des biomarqueurs MMP2 et MMP9 pour prédire le bénéfice des anti-angiogéniques dans le cancer du rein. E. Tabouret et E. Denicolai (AP-HM / CRO2) 218ALT Rôle des altérations épigénétiques induites par la mutation IDH1 R132H dans la réactivation de la télomérase et de la voie ALT dans les gliomes. D. Figarella-Branger et V. Geli (AP-HM / hors AP-HM) ADN tissulaires 24 En cours 219HYP Caractérisation génétique de l'hyperthermie d'effort (Biopsies musculaires). J. Faure et C. Bosson (hors AP- Tissus congelés HM) 28 En cours 2016 215SAF (2ème à 11ème cession) Protocole UNICANCER 0105-1305/IFCT1301 SAFIR Tissus congelés 02 LUNG. A. Valette (hors AP-HM) 12 En cours 220MCM Evaluation de la valeur pronostique de MCM6 dans les tumeurs oligodendrogliales anaplasiques avec Paraffine (TMA) codélétion 1p19q. G. Gauchotte (hors AP-HM) 706 En cours 221MET Analyse Génomique comparative de 15 paires de tumeurs du sein et de leur métastase cérébrale. P. Tissus congelés Metellus, F. Bertucci, J. Adélaïde (Clairval / hors APHM) 14 En cours 28 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Code Biobanque Titre du projet et investigateur principal (Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) 222MEN Exome des méningiomes de Grade 3. M. Peyre (hors AP-HM) Nature des échantillons cédés Tissus congelés Nombre total de patients inclus Publications 22 En cours 223TAR A Phase I/II, Open-Label, Multicentre Study to Assess The Safety, Tolerability, Pharmacokinetics and Clinicall Efficacy of AZD4547 in Patients with Tissu congelé Replapsed/Refractory glioma positive for an FGFR fusion. M. Sanson et O. Chinot (hors AP-HM / APHM) 1 En cours 224MEL Caractérisation immunohistochimique de marqueurs diagnostiques, pronostiques et d’agressivité de mélanomes. N. Macagno (AP-HM / CRO2) 215 En cours 225STM Recherche de nouvelles cibles thérapeutiques dans les Tissus congelés sarcomes des tissus mous. C. Jiguet-Jiglaire (CRO2) 10 En cours 226TEL Implication des protéines télomériques dans le vieillissement physiologique du muscle squelettique. F. Tissus congelés Magdinier et A. Maues de Paula (AP-HM) 6 En cours 227OST Recherche de facteurs immunohistochimiques pronostiques dans les ostéosarcomes conventionnels du Paraffine TMA protocole OS06 (sarcome 09). C. Bouvier (AP-HM) 173 En cours 228ATR Etude clinico-biologique sur une série rétrospective d'ATRT traité en France entre 2009 et 2012. F. Bourdeaut et C. Godfraind (hors AP-HM) 1 En cours 229TFS Etude moléculaire des tumeurs fibreuses solitaires des méninges : recherche des transcrits de fusion NAB2Blocs paraffine STAT6 et correlations pronostiques. C. Bouvier et P. Wesselin (AP-HM / hors AP-HM) 102 En cours 230STA Analyse du statut STAT6 sur méningiomes. N. Macagno (AP-HM / CRO2) Paraffine TMA 173 En cours 231MIC Imagerie des gliomes infiltrants par microscopie Raman cohérente. H. Rigneault (hors AP-HM) Tissus congelés 7 En cours 232BRA BRAVE project. B. Chanez, B. Escudier et L. Derosa (AP-HM / hors AP-HM) Blocs paraffine 14 En cours Paraffine TMA Tissu congelé 29 Dernière mise à jour : 29/06/2016 Code Biobanque 233HEM 234EBG 235MAP 236NFK Titre du projet et investigateur principal (Structure : AP-HM / CRO2 ou hors AP-HM) Nombre total de patients inclus Nature des échantillons cédés Publications Etude des mécanismes génomiques de progression tumorale des hémangiopericytomes/tumeurs fibreuses Tissus congelés solitaires méningés. C. Bouvier et M. Kalamarides (AP-HM / hors AP-HM) 2 En cours Analyse de biomarqueurs pronostiques et prédictifs pour la thérapie du glioblastome (EB1). R. Berges (AP- Lames paraffine HM / CRO2) 2 En cours MAPPYACTS Molecular Profiling for Pediatric and Young Adult Cancer Treatment Stratification. B. Geoerge (hors AP-HM) / En cours 20 106 Tissus congelés Lames paraffine Caractéristiques moléculaires et histologiques des ependymomes. D. Figarella-Branger etT. Pietsch (AP- Lames paraffines HM / hors AP-HM) 30 Dernière mise à jour : 29/06/2016 IV – Participation de la tumorothèque de l’AP-HM à des réseaux de soins ou à des projets multicentriques 1. Cancers rares de l’adulte Réseaux nationaux de double lecture des cancers rares de l’adulte - Sarcomes des tissus mous et des viscères. Réseau RREPS (Réseau de Référence en Pathologie des Sarcomes) (coordinateur national : JM Coindre – Bordeaux), Marseille : centre d’expertise régional, coordinateur : C. Bouvier (AP-HM) - Mésothéliomes malins de la plèvre et tumeurs rares du péritoine (coordinateur national : Galateau Salle – Marseille), centre d’expertise régional, coordinateur : L. Garbe (AP-HM) - Réseau de Neuro Oncologie Pathologique RENOP (coordinateur national : D. FigarellaBranger) Réseaux nationaux de double lecture des tumeurs pédiatriques du SNC - Groupe d’étude en Neuropathologie Oncologique Pédatrique. Réseau GENOP (coordinateur national : A. Jouvet – Lyon, centre de référence coordinateur pour la relecture anatomopathologique : D Figarella-Branger – Marseille) Réseaux cliniques de références - Sarcomes des tissus mous et des viscères. Réseau NETSARC (Réseau de centres de référence dans la prise en charge des sarcomes et tumeurs conjonctives) (coordinateur : JY Blay – Lyon) - Sarcomes osseux. Réseau RESOS (Réseau de Référence des Sarcomes Osseux), (coordinateur national : F Gouin – Nantes, et sur le versant de la Pathologie, coordinateur : G de Pinieux – Tours) - Tumeurs neuroendocrines malignes rares. Réseau RENATEN (coordinateur : P Niccoli – Marseille) - Tumeurs cérébrales olidodendrogliales de haut grade. Réseau POLA (coordinateur national : JY. Delattre – Paris, centre de référence coordinateur pour la relecture anatomopathologique : D Figarella-Branger – Marseille) - Cancers ORL rares. Réseau REFCOR (coordinateur : F Janot – Paris) - Lymphomes primitifs du système nerveux central. Réseau LOC (coordinateur : K HoangXuan – Paris) - Tumeurs cérébrales rares de l’adulte. Réseau TUCERA (coordinateur national : H. Loiseau – Bordeaux, centre de référence coordinateur pour la relecture anatomopathologique : D Figarella-Branger – Marseille, AP-HM) 31 Dernière mise à jour : 29/06/2016 - Cancers rares du rein. Réseau CARARE (coordinateur national B. escudier-IGR Villejuif Marseille : centre d’expertise régional pour la région PACA, coordinateur : L.Daniel (APHM) 2. Bases clinicobiologiques Projet POLA (depuis 2008) : Base dédiée au suivi prospectif et à la prise en charge des oligodendrogliomes anaplasiques. Projets BCB INCa : - Projet Melbase (depuis 2011) : Suivi d’une cohorte nationale de patients atteints de mélanome stade IV ou stade III inopérable. - Projet BCB Glioblastomes (depuis 2012) : Inclusion de tous les glioblastomes qui ont eu une cryoconservation d’au moins 3 fragments de 50 mg, des prélèvements sanguins, le consentement dédié, une mèche de cheveux, et un blic de paraffine surnuméraire sous embargo pour la recherche. - Projet BCB Sarcomes (depuis 2012). - Projet BACAP Pancréatique - Base Gliomes Marseille (depuis 2012) : Suivi de tous les cas incidents de gliomes ou de tumeurs glioneuronales de la file active de patients de l’AP-HM (adultes et enfants), dans le cadre du programme Gliomes du SIRIC Marseille. - Base RENOP/TUCERA (depuis 2013) : Base de données à visée pathologique permettant l’enregistrement des cas revus en relectures interrégionale et nationale dans le cadre du projet TUCERA. (depuis 2012) : Base AnatomoClinique de l’Adenocarcinome 3. Projet carte d’identité des tumeurs Ligue Nationale contre le cancer - Projet ANOCEF Ligue : Etude transcriptomique de la réponse à la radiothérapie ou à la chimiothérapie de première ligne chez les patients présentant un glioblastome. - Etude génomique et transcriptionnelle de la réponse au traitement par innotecan et bevacizumab chez les patients présentant un glioblastome en récidive - Projet Chondrosarcome Ligue. - STIC ECOM « Evaluation comparative des techniques d’analyse de la MGMT comme acteur prédictif de réponse au Temozolomide dans les glioblastomes » - coordinateur : V Quillien - Rennes 32 Dernière mise à jour : 29/06/2016 4. Projets structurants régionaux - SIRIC : Site Intégré de Recherche en Cancérologie et tout spécialement l’axe gliome du projet SIRIC - DHU : Départements Hospitalo-Univertaires, dont le DHU IMoTheP (Molecular vectorbased imaging for personalized theranostic applications) (Investigateur : E. Guedj) labellisé par A*MIDEX en septembre 2015, le DHU EPINEXT (Epilepsie et désordres de l’excitabilité neuronale) (Investigateur : F. Bartolomei) et le projet Marseille Immunopôle (MI-DHU) (Investigateur : E. Vivier). 5. Projets internationaux - « Prospective Assessment of Predictive / Prognostic Molecular Biomarkers in the SIOPLGG 201X Adaptative trial » SIOP-LGG PLGA foundation. Partenaires: Heidelberg, Rome and Marseille - Marie Curie International Incoming Fellowships (IIF): FP7-PEOPLE-2013-IIF: « Broadband screening of therapeutic molecules with AMM, on cellular models of glioblastoma». Investigateur: E. Pasquier - Cohorte EORTC “Brain tumour Funder’s” Glioblastomes longs survivants. 33