Brochure du 1ère Atelier BID

Transcription

BID Capacity Enhancement Workshop
Biodiversity Data Mobilization
Information Brochure
Version 3, August 2016
Atelier de Renforcement des Capacités BID
Mobilisation des Données sur la Biodiversité
Brochure Informative
Version 3, Août 2016
8 August - 6 November 2016 | 8 Août - 6 Novembre 2016
Image by Fabio Itilaw a
http://goo.gl/WoBVTv
First BID Capacity Enhancement Workshop: Biodiversity Data Mobilization
August-November 2016
1. Introduction
In 2015, the GBIF Secretariat officially started Biodiversity Information for Development (BID), a
multi-year, €3.9 million programme funded by the European Union with the aim of increasing the
amount of biodiversity information available for use in scientific research and policymaking in the
‘ACP’ nations of sub-Saharan Africa, the Caribbean and the Pacific. One of the main
implementation mechanisms of the programme is a set of public calls to support projects directly
contributing to the objectives of the programme. More information about the programme is available
at http://www.gbif.org/programme/bid.
This workshop aims to contribute to enhancing the capacity of the project teams to plan and
implement biodiversity data publishing efforts effectively and according to GBIF standards. It will
have a strong focus on the technical aspects of the data mobilization —in particular everything
related to the data lifecycle: digitization, management and online publishing. The social aspects of
the process will also be considered.
The event will have two editions: one with online and on-site components (blended learning edition)
and one where participants will follow all parts on the internet (online learning edition). Both will
have a strong practical approach (including a significant component of group work). Participants will
have the possibility to evaluate their learning and receive an official certification in the form of a
Mozilla Open Badge. The official language of the workshop will be English, but there will be partial
support for French speakers through francophone groups, trainers and resources.
Only individuals nominated by a BID project representative and mentors selected by the GBIF
Secretariat can subscribe to this workshop. In section 11 of this brochure you will find the contact
information of the event organizers if you need help.
This brochure includes a draft agenda for participants. Time is expressed in UTC/GMT +2 (CAT).
General information about the workshop information is available at:
http://community.gbif.org/pg/groups/52434/
The BID programme is funded by the
European Union and co-funded by GBIF.
ENGLISH
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Première Atelier de Formation BID: Mobilisation des Données sur la Biodiversité
Août-Novembre 2016
1. Introduction
En 2015, le Secrétariat du GBIF a officiellement lancé l’Information sur la Biodiversité pour le
Développement ou Biodiversity Information for Development (BID), un programme pluriannuel
de 3.9 millions d’euros financé par l’Union Européenne, dont le but est d’augmenter la quantité
d’informations sur la biodiversité disponibles pour la recherche scientifique et la prise de décisions
dans les pays de la zone « ACP » : Afrique sub-saharienne, les Caraïbes et la région Pacifique.
L’une des principales mises en application du programme consiste en un ensemble d’appels à
projets publics visant à financer des projets qui contribuent directement aux objectifs du
programme. Plus d’informations sur le programme sont disponibles à l’adresse
http://www.gbif.org/programme/bid (en Anglais).
Cet atelier vise à améliorer les capacités des équipes des projets dans la planification et la mise en
œuvre des efforts de numérisation de données sur la biodiversité, de façon efficace et compatible
avec les standards GBIF. Il sera particulièrement centré sur les aspects techniques de la mise à
disposition des données – notamment tout ce qui concerne le cycle de vie des données :
numérisation, gestion et publication en ligne. D’autres aspects plus sociologiques du processus
seront également abordés.
L’événement comprendra deux parcours d’apprentissage : mixte, avec des éléments en ligne et sur
site, et en ligne, où tous les éléments sont sur Internet. Tous auront une approche fortement
pratique (cela inclura notamment une proportion significative de travail de groupe). Les participants
auront la possibilité d’évaluer les connaissances qu’ils auront acquises, et de recevoir une
certification officielle sous la forme d’un Mozilla Open Badge. La langue principale de l’atelier sera
l’anglais, mais les participants parlant français seront aidés par des groupes, des formateurs et
ressources francophones.
Seules des personnes nommées par un porteur (ou représentant) de projet BID et les mentors
sélectionnées par le Secrétariat du GBIF peuvent s’inscrire à cet atelier. Vous trouverez les
coordonnés des organisateurs dans la section 11 de cette brochure si vous avez besoin d’aide.
Cette brochure comprend un agenda non définitif de l’événement. Le temps est exprimé en
UTC/GMT +2 (CAT).
Des informations générales sur l'atelier sont disponibles à :
http://community.gbif.org/pg/groups/52434/
Le programme BID est financé par
l'Union européenne et cofinancé par GBIF.
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FRANÇAIS
2. BID Community Activities
The BID programme has a strong focus on enhancing capacity for effective mobilization and use of
biodiversity information. Through activities like this workshop, we are aiming to establish a
community of practice to support the implementation of funded projects. This community involves all
those working on the BID funded projects, who have expertise to share and who will be contributing
best practices through their project work, and also experts from the GBIF community, involved as
volunteer mentors to assist the project teams.
2.1. Volunteer Mentors
Six people have been selected to represent the mentors in this workshop. They are following the
workshop along with the other participants, and will be able to assist others in their groups on topics
within their areas of expertise, face-to-face, via the online forums and the BID-community mailing
list. The workshop trainers have also joined the mentor group and some project representatives
have already signed up to support fellow project team members.
2.2. Project posters
We have prepared posters summarizing each of the BID projects. Project representatives can use
these posters to facilitate discussions with other participants and mentors during community-specific
activities.
2.3. Presentation on the role of mentors
One of the mentors will share views on the role of mentors in the BID community in the opening
session.
2.4. Discuss with mentors
During the workshop, project representatives will be invited to discuss your project with the mentors,
particularly highlighting any areas where you think that further support may be required.
2.5. Participate as a BID volunteer mentor after the workshop
After successfully completing this workshop, we invite you to consider joining as a BID mentor to
provide support to others in the community. Further information is available here
links.gbif.org/bid_mentors_call and from bid.gbif.org.
ENGLISH
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Août-Novembre 2016
2. Activités Connectés à la Communauté BID
Le programme BID met fortement l’accent sur le renforcement des capacités pour la mobilisation et
l'utilisation efficace d'information sur la biodiversité. Au travers des activités comme cet atelier, nous
visons à établir une communauté de pratique pour soutenir la mise en œuvre des projets financés.
Cette communauté comprend tous ceux qui travaillent sur les projets financés par BID, ayant déjà
une expertise à partager et qui identifieront des meilleures pratiques au fur et à mesure de la mise
en place des activités de leur projet; ainsi que des experts de la communauté GBIF, impliqués à
titre de mentors bénévoles « volunteer mentors » pour aider les équipes de projet.
2.1. Mentors bénévoles
Six personnes ont été sélectionnées pour représenter les mentors dans cet atelier. Ils suivent
l'atelier de la même manière que les autres participants, et seront en mesure d'aider les autres
membres de leurs groupes sur les sujets dans leurs domaines d'expertise, en face-à-face, via les
forums en ligne, et via la liste de diffusion « BID-community ». Les formateurs de l'atelier ainsi que
certains représentants des projets ont également rejoint le groupe de mentors et seront ainsi en
mesure de soutenir les autres membres des équipes de projet.
2.2. Posters des projets
Nous avons préparé des posters résumant chacun des projets BID. Les représentants de projet
peuvent utiliser ces posters pour encourager les discussions avec les autres participants et les
mentors durant les activités de l’atelier visant à renforcer la communauté.
2.3. Présentation sur le rôle des mentors
Un des mentors partagera des vues sur le rôle des mentors dans la communauté BID pendant la
séance d'ouverture.
2.4. Echangez avec des mentors
Pendant l'atelier, les représentants de projet seront invités à parler de leurs projets avec les
mentors, et pourront aborder en particulier les domaines identifiés comme pouvant nécessiter un
soutien supplémentaire.
2.5. Participez en tant que mentor bénévole après l'atelier
Après d’avoir réussi cet atelier, nous vous inviterons à rejoindre le groupe de mentors BID afin
d’apporter un support à la communauté. De plus amples informations sont disponibles à
links.gbif.org/bid_mentors_call et sur le site Internet bid.gbif.org.
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FRANÇAIS
3. Workshop Structure
Both versions of the workshop (based on blended and online learning) are divided in three sections:



First section: preparatory activities. This section is exclusively online and all participants
will go through it at the same time. It will prepare you for the rest of the workshop. It includes
four short modules (0 to III) and it requires around 10 hours to complete.
Second section: main section of the workshop. This section is the most important as it
addresses the main learning objectives of the workshop. It includes six modules (IV to X)
and requires approximately 30 hours to complete.
Third section: follow-up activities. This section includes complementary information and
the activities required to complete the workshop certification. It includes two modules (XI and
XII) and requires approximately 10 hours to complete.
Each section is divided in different modules which are described in this brochure. This is the general
calendar for all sections.
First section
Second section
Third section
Blended learning edition
Online learning edition
8-21 August 2016
8-21 August 2016
22-25 August 2016
19 September - 16 October 2016
2 - 25 September 2016
17 October - 6 November 2016
4. Prerequisites for the Workshop
To make best use of the activities around this workshop, nominated candidates should possess as
many as possible of the following skills, some of which will also be refreshed through the first
section of the workshop:
 Basic skills in computer and internet use, and in particular in the use of spreadsheets,
databases and tools for geographical data representation (e.g. Google Maps, GIS software).
 Basic knowledge about geography and biodiversity informatics: geography and mapping
concepts, basic taxonomy and nomenclature rules, data(set) types, basic knowledge about
GBIF and other relevant initiatives working in biodiversity informatics and how they operate.
 Basic understanding of the data publishing model of GBIF, the tools available and how to
use them for publishing.
 A good command of at least one of the two main languages used during the meeting:
English and French. Parts of the course will be conducted in English only, so basic
understanding of English is required.

Experience as a trainer, for example leading seminars, workshops or other training activities
in topics related to biodiversity informatics. They need to be able to adapt generic training
materials to specific contexts and languages maintaining their instructional value.
ENGLISH
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Août-Novembre 2016
3. Structure de l’Atelier
Les deux parcours s’apprentissage (mixte et en ligne) sont subdivisés en trois sections :

Première section : activités préparatoires. Cette section est accessible exclusivement en
ligne et tous les participants doivent y assister en même temps. Elle vous préparera au reste
de l’atelier. Elle comporte quatre courts modules (0 à III) et son achèvement nécessite 10
heures.
 Deuxième section : section principale de l’atelier. Cette section est la plus importante car
elle aborde les objectifs d’apprentissage principaux de l’atelier. Elle comporte six modules
(IV à X) et son achèvement nécessite environ 30 heures.
 Troisième section : activités de suivi. Cette section comprend l’information
complémentaire et les activités obligatoires pour la certification de la participation à l’atelier.
Elle comprend deux modules (XI et XII) et nécessite environ 10 heures.
Chaque section est subdivisée en modules, décrits dans cette brochure. Le calendrier général de
tous les modules est illustré ci-dessous.
Parcours d’apprentissage mixte
Parcours d’apprentissage en ligne
Première section
8-21 août 2016
8-21 août 2016
Deuxième section
22-25 août 2016
19 septembre - 16 octobre 2016
Troisième section
2 - 25 septembre 2016
17 octobre - 6 novembre 2016
4. Prérequis pour l’Atelier
Afin d’exploiter au mieux les activités proposes au cours de cet atelier, les participants devraient
posséder le plus grand nombre des capacités techniques et connaissances suivantes, qui seront
passées en revue pendant la première section de l’atelier :
 Capacités basiques relatives à l’utilisation d’un ordinateur et d’internet, notamment
l’utilisation de tableurs, bases de données et outils dédiés aux données géographiques (par
exemple Google Maps, logiciel de SIG).
 Connaissances basiques en informatique liée à la géographie et à la biodiversité : concepts
géographiques et cartographiques, règles basiques de taxonomie et de nomenclature, types
de jeux de données, connaissances basiques sur le GBIF et les autres initiatives liées à la
bio-informatique, et sur leur fonctionnement.
 Compréhension basique du schéma de publication des données du GBIF, des outils
disponibles et de leur utilisation dans le cadre de la publication de données.

Bonne compréhension d’au moins une des deux langues principales utilisées au cours de
l’atelier : anglais ou français. Certaines parties de l’atelier seront réalisées uniquement en
anglais, une compréhension minimale de l’anglais est donc demandée.

Expérience en tant que formateur, par exemple dans l’animation de séminaires, ateliers ou
autres activités de formation sur des sujets liés à la bio-informatique. Il est nécessaire de
savoir adapter les documents et ressources génériques utilisés dans l’atelier à des
contextes spécifiques et à d’autres langues, tout en maintenant leur valeur pédagogique.
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FRANÇAIS
5. First section: Preparatory Activities
Both editions: 8-21 August 2016
Participants should reserve around 10 hours to complete online activities in these two weeks.
Monday, 8 August 2016
Module 0: Introduction to the course and platform
The first module of the online preparatory activities will help participants to familiarize themselves with the
workshop structure, the online platform that will be used during the workshop and the challenges of learning
online.
Activity 0.1: Welcome to the workshop
Activity 0.2: Introduction to the eLearning platform
Activity 0.3: Introduction to learning in the online environment
Module I: Basics of Biodiversity Informatics
This module aims at helping the student to consolidate some basic concepts used in biodiversity informatics,
and to get familiar with the basic characteristics of biodiversity datasets.
Activity I.1: Video introducing biodiversity informatics
Activity I.2: Familiarize yourself with a biodiversity dataset and template
Module II: GBIF and the BID programme
The landscape of biodiversity informatics initiatives in the XXI century is complex, with many organizations
working on different aspects of it. This module reviews the role of GBIF and the BID programme in that context.
Activity II.1: Introduction to GBIF, to BID and the BID community
Module III: Workshop sessions preliminary work
The trainers will present the students with some additional preparatory materials and activities on the topics that
will be studied during the main section of the workshop.
Activity
Activity
Activity
Activity
Activity
III.1:
III.2:
III.3:
III.4:
III.5:
ENGLISH
Preliminary questionnaire
Introduction to data quality in biodiversity data mobilization
Explore BDI tools
Familiarize yourself with digitization workflows
Installation of Open Refine (optional)
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Août-Novembre 2016
5. Première Section : Activités Préparatoires
Tous les parcours d’apprentissage : 8-21 Août 2016
Il est conseillé aux participants de réserver environ 10 heures pour compléter les activités en ligne
dans ces deux semaines.
Lundi, 8 Août 2016
Module 0 : Introduction à l’atelier et aux plateformes en ligne
Ce tout premier module des activités de préparation en ligne aidera les participants à se familiariser avec la
structure de l’événement, avec les plateformes en ligne qui seront utilisées et avec les défis de l’apprentissage
en ligne.
Activité 0.1 : Bienvenue à l'Atelier
Activité 0.2 : Connexion et familiarisation avec la plate-forme
Activité 0.3 : L’Apprentissage en ligne
Module I : Les bases de l’informatique liée à la biodiversité
Ce module vise à aider les participants à consolider leurs connaissances sur les concepts basiques utilisés en
informatique de la biodiversité, et à les familiariser avec les caractéristiques de base des jeux de données sur la
biodiversité.
Activité I.1 : Introduction à l’informatique de la biodiversité
Activité I.2 : Familiarisez-vous avec un jeu de données sur la biodiversité
Module II : GBIF et le programme BID
Le paysage des initiatives sur l’informatique liée à la biodiversité au XXIème siècle est complexe, avec beaucoup
d’organisations travaillant sur différents aspects de cette thématique. Ce module passera en revue le rôle de
GBIF et du programme BID dans ce contexte.
Activité II.1 : Introduction à GBIF, BID et à la communauté BID
Lundi, 15 Août 2016
Module III : Travaux préparatoires pour les sessions de l’atelier
Les formateurs présenteront aux étudiants des ressources supplémentaires pour préparer les sessions, ainsi
que des activités sur les sujets qui seront abordés durant la section principale de l’atelier.
Activité III.1 : Questionnaire préliminaire
Activité III.2 : Introduction à la qualité des données dans le cadre de la mobilisation des données
sur la biodiversité
Activité III.3 : Explorez les outils BDI
Activité III.4 : Familiarisez-vous avec les flux de travail de numérisation existants
Activité III.5 : Installation d’Open Refine (en option)
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FRANÇAIS
6. Main Section of the Workshop:
Blended learning: 22-25 August 2016. Online learning: 19 Sept – 16 Oct 2016.
This draft schedule is provided to those participating in the on-site event to get a sense of the
contents planned.
The online version of this workshop section will cover the same set of modules and topics but using
different delivery channels.
Module IV: INTRO TO THE ON-SITE EVENT
This module will enable the participants to get acquainted with each other, with the platforms that we will use
during the main section of the workshop and with the basic theoretical concepts that will be used across
modules.
08:30 – Registration
09:00 - Session 1: Welcome and introduction to the on-site event
This session will include a comb ination of:
 a formal opening session involving representatives from the EU in Rwanda, the Rwandan government and our
local host;
 an explanation of all the practical information that we will need during the course, especially ab out the use of
digital platforms and tools; and
 a review of the outcome of the preparatory activities.
10:30 - Coffee/tea break
11:00 - Session 2: Foundations for the workshop
During this session we will have the opportunity to review the contents planned for th is workshop section and discuss key
concepts that we will b e using in all modules, in particular ab out b iodiversity digital data management. It will b e a
theoretical interactive session where students will have the opportunity to contrib ute with their answers and experiences.
12:30 - Lunch break
Module V: PLANNING A BIODIVERSITY DATA MOBILIZATION PROJECT
This module will help us to understand the different stages that should be taken into account when planning a
digitization project, and how to adapt them to our specific situation.
13:30 - Session 3: Digitization project planning: how to decide what to do and when to do it?
This session will include a theoretical presentation and discussion around the key project planning stages for successfully
implementing a digitization project and how to create a viab le workflow. We will cover topics such as: What things should
b e formally structured just at the b eginning? What can b e left to ‘wait and see’?; Who needs to know what and when?
15:00 - Session 4: Digitization planning practical exercise: Will it work?
Practical role-play group session. Using the methods discussed in Session 3 group s will b e tasked to create an actual
executab le project plan/work -flow. Each member of the group will b e assigned a stakeholder role and members will work
together to create a work -flow for a BID-like small digitization project. These will then b e presented to the whole group for
discussion of commonalities and differences.
17:00 - End of the day
ENGLISH
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Août-Novembre 2016
6. Section Principale de l’Atelier
Apprentissage mixte : 22-25 août 2016. Apprentissage en ligne : 19 sept – 16 oct 2016.
Ce programme non définitif est diffusé afin de permettre aux participants à l’atelier d’avoir un aperçu
du contenu de cet événement.
La version en ligne de cette section de l’atelier couvrira le même ensemble de modules et de
thématiques mais en utilisant d’autres moyens de diffusion.
Lundi, 22 Août 2016
Module IV : INTRO À L’ÉVÉNEMENT SUR PLACE
Ce module permettra aux participants de faire connaissance, de se familiariser avec les outils que nous
utiliserons durant cette section de l’atelier et avec les concepts théoriques de base qui seront utilisés dans les
différents modules.
08:30 - Enregistrement
09:00 - Séance 1 : Bienvenue et introduction à l’événement sur place
Cette session comprendra :
 Une cérémonie d’ouverture officielle avec des représentants de l’Union Européenne au Rwanda, du
gouvernement rwandais et de l’institution accueillant l’atelier ;
 Une explication relative à toutes les informations pratiques dont nous aurons b esoin durant l’atelier, notamment
pour l’utilisation des plateformes et outils numériques ; et
 Un compte-rendu des activités réalisées avant la formation
10:30 - Pause café/thé
11:00 - Séance 2 : Base de la formation
Durant cette session, nous aurons l’opportunité de passer en revue le contenu de chaque module de la formation et de
discuter les concepts-clefs que nous utiliserons dans tous les modules, en particulier ceux traitant de la gestion des
données numérisées sur la b iodiversité. Il s’agira d’une session interactive et théorique à laquelle les participants auront
l’opportunité de contrib uer avec leurs réponses et leurs expériences personnelles.
12:30 - Pause déjeuner
Module V : PLANIFICATION D’UN PROJET DE MOBILISATION DES DONNÉS
Ce module a pour objectif d’aider à la compréhension des différentes étapes qui doivent être prises en compte
dans la planification d’un projet de numérisation, et à les adapter à des situations spécifiques.
13:30 - Séance 3 : Planification d’un projet de numérisation : comment décider quoi faire et le
moment pour le faire?
Cette session comprendra une présentation théorique et une discussion autour des étapes-clefs de la planification réussie
d’un projet de numérisation et de la création d’un workflow fonctionnel. Nous ab orderons des sujets tels que : Qu’est -ce
qui doit être structuré de façon formelle dès le déb ut ? ; Qu’est-ce qui peut être mis en attente et repris plus tard ? ; Qui
doit savoir quoi et quand ?
15:00 - Séance 4 : Exercice pratique de planification de la numérisation : Marchera-t-il?
Session pratique avec jeu de rôle en groupe. L’utilisation des méthodes discutées dans la session 3 sera demandée afin
de créer une planification de projet/workflow fonctionnelle et réalisab le. Chaque membre du groupe se verra assigner un
rôle de preneur de décision et les membres travailleront ensemble à créer un workflow pour un projet de numérisation
semb lable à un projet BID. Les résultats seront ensuite présentés au groupe entier pour discuter des points communs et
des différences propres à chaque projet.
17:00 - Fin de la journée
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FRANÇAIS
Tuesday, 23 August 2016
Module VI: BIODIVERSITY DATA DIGITIZATION
This theoretical/practical module will help identifying the type of data each participant is working with, and how
best to digitize relevant information using best practices and existing tools and techniques .
09:00 - Session 5: Biodiversity data types: which kind of data are we working with?
Practical session to identify which kind of data people are dealing with and useful information to digitize in priority.
Includes group discussions and roleplays to familiarize with different kinds of data (collections, ob servations, samplingevent, taxonomic, possib ly pictures) and how to b est share the related information.
11:00 - Session 6: Principles of data management in digitization
Theoretical and practical session focused on b est practices and data quality principles in the context of data digitization.
Includes a short presentation on data quality and coherence (especially on sub jects like georeferencing, dates, names and
taxa cross-checking), followed b y a group discussion on good practices and a practical exercise using simple
spreadsheets.
12:30 - Lunch break
13:30 - Session 7: Practical demonstration on digitization: tools and feedback
Demo session focused on digitization tools and software, including a short demonstration of one example tool and
discussions ab out other options availab le (e.g. citizen science transcription projects, sampling event data)
Module VII: DATA CURATION, FORMATTING & TRANSFORMATION
This mainly practical module will help with the basic tools and concepts used for data validation and cleaning,
and how data can be converted into Darwin Core.
15:00 - Session 8: Basic concepts of data cleaning
The first part of this session will enab le the participants to get familiarized with the main concepts of data cleaning, related
tools, and b est practices in the curation process. The second part will consist in a theoretical/practical exercise with
examples of technical and consistency validation checks.
ENGLISH
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Août-Novembre 2016
Mardi, 23 Août 2016
Module VI : NUMÉRISATION DES DONNÉES SUR LA BIODIVERSITÉ
Ce module théorique et pratique aidera les participants à identifier le type de données qu’ils manipulent dans
leurs travaux, et à numériser les informations qu’il est important de partager grâce aux bonnes pratiques, outils
et techniques existants.
09:00 - Séance 5 : Types des données sur la biodiversité : Avec quels types des données
travaillons-nous ?
Session pratique pour identifier les types de données avec lesquelles les participants travaillent, ainsi que les informations
utiles à numériser en priorité. Cette session comprend des discussions de groupe et des jeux de rôle afin de se
familiariser avec les différents types de données existants (collections, ob servations, données d’échantillonnage, données
taxonomiques, données multimédia…) et de mieux partager les informations correspondantes.
11:00 - Séance 6 : Principes de la gestion des données pendant la numérisation
Session pratique et théorique centrée sur les b onnes pratiques et les principes sur la qualité des données dans le
contexte de la numérisation de données. Cette session comprend une courte présentation sur la qualité et la cohérence
des données (notam ment sur les sujets tels que le géoréférencement, les dates, noms scientifiques et vérification de
taxons), suivie d’une discussion de groupe sur les b onnes pratiques et un exercice pratique d’utilisation de tab leurs.
13:30 - Séance 7 : Démo pratique de numérisation : outils et réactions
Session d démonstration et d’échanges centrée sur les outils et logiciels de numérisation, comprenant une courte
démonstration d’un des outils et des discussions sur les autres options disponib les (par exemple les projets de
transcription d’étiquettes grâce aux sciences participatives, les données d’échantillonnage…)
Module VII : LE TRAITEMENT, LA MISE EN FORME ET LA TRANSFORMATION DES
DONNÉES
Ce module principalement pratique aidera les participants à utiliser les outils et concepts de base pour la
validation et le nettoyage de données, et à convertir leurs données au format Darwin Core.
15:00 - Séance 8 : Concepts de base sur le nettoyage des données
La première partie de cette session permettra aux participants de se familiariser avec les concepts principaux du
nettoyage de données, les outils associés, et les meilleures pratiques utilisées dans le processus de curation. La seconde
partie consistera en un exercice théorique/pratique avec des exemples de validation technique et de vérification de la
cohérence.
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FRANÇAIS
Wednesday, 24 August 2016
09:00 - Session 9: Other data management tools
Practical/theoretical session focused on easy to use tools to validate and clean datasets in three main categories:
nomenclatural, format, and geographical.
11:00 - Session 10: Use of OpenRefine
Practical/theoretical session focused on OpenRefine as an easy tool to improve the quality of b iod iversity datasets b y
using the default features, existing web services and regular expressions.
12:30 – Lunch break
Module VIII: DATA PUBLISHING USING IPT
This module focuses on the process of making biodiversity data freely available online, also known as publishing
the data online. We will use the freely available tool that GBIF recommends for this purpose: the Integrated
Publishing Toolkit (IPT).
13:30 - Session 11: Basic data publishing concepts
Presentation and discussion ab out topics such licenses, metadata, mandatory fields, how an IPT instance can host
datasets for different pub lishing institutions, etc.
15:00 - Session 12: Simple data publishing using the IPT
Practical demonstration and discussion covering the b asics of pub lishing using the IPT tool (principles, user interface,
workflow, metadata, dataset visib ility, ...) through the pub lication of a typical occurrence dataset stored in a spreadsheet
file.
ENGLISH
13
Août-Novembre 2016
Mercredi, 24 Août 2016
09:00 - Séance 9 : Autres outils pour la gestion des données
Session pratique/théorique centrée sur des outils faciles d’utilisation pour valider et nettoyer les jeux de données dans
trois catégories : nomenclature, format, et information géographique.
11:00 - Séance 10 : Utilisation d’OpenRefine
Session pratique/théorique centrée sur OpenRefine, un outil facile à prendre en main pour améliorer la qualité des jeux de
données sur la b iodiversité en utilisant les fonctionnalités de b ase, les web services existants et les expressions
régulières.
Module VIII : PUBLICATION DE DONNÉES AVEC L’IPT
Ce module se concentre sur le processus de rendre les données sur la biodiversité accessibles en ligne de façon
libre et gratuite, aussi appelé publication des données en ligne. Pour ce faire, nous utiliserons le principal outil
mis à disposition par le GBIF : l’Integrated Publishing Toolkit (IPT).
13:30 - Séance 11 : Concepts de base sur la publication des données
Présentation et discussion autour de sujets tels que les licences, métadonnées, champs ob ligatoires, l’héb ergement de
jeux de données de différentes institutions sur la même installation IPT, etc.
15:00 - Séance 12 : Publication simple de données en utilisant l’IPT
Démonstration pratique et discussion sur les étapes de b ase du processus de pub lication des données utilisant l’outil IPT
(principes, interface utilisateur, workflow, métadonnées, visib ilité du jeu de données…) grâce à la pub lication d’un je u de
données d’occurrence typique sous la forme d’un fichier tab leur.
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FRANÇAIS
Thursday, 25 August 2016
09:00 - Session 13: Advanced data publishing using the IPT
Practical demonstration and discussion covering advanced IPT feature s and pub lication of a complex, sampling-event
dataset. The emphasis will b e put on the use of extensions and the core/extension relationship, b ut we will cover other
topics such as datab ase sources, row filtering / translation if time allows.
Module IX: FREE PRACTICE
This module will feature free practice sessions where the students will have the opportunity to practice using
examples provided by the organizers, or using their own examples and datasets. A focus will be suggested for
each session but the participants will have the option to choose where to concentrate their efforts based on their
skills and needs.
11:00 - Session 14: Practical session
The students will b e suggested to start with an exercise of data digitization using simple spreadsheets.
12:30 - Lunch break
13:30 - Session 14 (cont): Practical session
We will review an example dataset to evaluate its fitness for use and will perform b asic data cleaning procedures on it.
15:00 - Session 14 (cont): Practical session
We will continue working with example datasets and we will connect them to an IPT to make them freely available online
through the GBIF network.
Module X: EVALUATION
Last module of the on-site workshop where we will review the contents covered, evaluate it, and discuss follow ups.
16:00 - Session 15: Summary of the workshop section and evaluation of the on-site event.
During this session we will review the contents covered b y the on-site workshop section, and the participants will have the
opportunity to provide feedb ack via an evaluation session. We will also discuss the follow-up activities during the third
workshop section, in particular everything connected with the assessment of the participants and the certification p rocess.
17:00 - End of the on-site event
ENGLISH
15
Août-Novembre 2016
Jeudi, 25 Août 2016
09:00 - Séance 13 : Publication avancée de données en utilisant l’IPT
Démonstration pratique et discussion sur les fonctionnalités avancées de l’IPT et la pub lication d’un jeu de données
complexe (données d’échantillonnage). L’utilisation des extensions et des relations coeur de standard/extensions sera
particulièrement mise en avant, mais d’autres sujets seront également couverts comme la liaison de l’IPT à une b ase de
données, le filtrage des lignes et la traduction en fonction du temps restant.
Module IX : PRATIQUE LIBRE
Ce module comprendra des sessions libres de travaux pratiques, durant lesquelles les participants auront
l’occasion de s’exercer en utilisant les exemples fournis par les formateurs, ou en utilisant leurs propres
exemples et jeux de données. Un thème sera suggéré pour chaque session, mais les participants auront le loisir
de choisir où concentrer leurs efforts en fonction de leurs capacités et de leurs besoins.
11:00 - Séance 14 : Séance pratique
Il sera suggéré aux participants de réaliser un exercice de numérisation de données utilisant un fichier tab leur simple.
13:30 - Séance 14 (cont) : Séance pratique
Nous examinerons un jeu de données d’échantillonnage afin d’évaluer son adéquation à l’usage et nous effectuerons des
procédures b asiques de nettoyage de données sur celui-ci.
15:00 - Séance 14 (cont) : Séance pratique
Nous continuerons à travailler sur des fichiers modèles et nous les connecterons à l’IPT pour les rendre lib rement
accessib les en ligne dans le réseau GBIF.
Module X : ÉVALUATION
Dernier module de l’atelier sur place, où nous reviendrons sur et évaluerons le contenu de chaque module, et
discuterons de la suite des événements.
16:00 - Séance 15 : Sommaire de la formation et évaluation de l’événement sur place.
Pendant cette session, nous reviendrons sur les thèmes ab ordés au cours de cette section de l’atelier, et les participants
auront l’occasion de partager leur avis via une session d’évaluation. Nous discuterons aussi des activités de la troisième
section de l’atelier, en particulier tout ce qui concerne l’auto-évaluation des participants et le processus de certification.
17:00 - Fin de l’événement sur place
16
FRANÇAIS
7. Third section: Follow-up Activities
Blended learning: 26 Aug – 18 Sept 2016. Online learning: 17 Oct – 6 Nov 2016
Participants should reserve around 10 additional hours to complete the online activities which are
part of the third section of the workshop.
Module XI: Data access via GBIF.org
As a complement to the contents outlined above, the last content module will focus on the use of GBIF.org to
access data published through the network. An important component of this module will concentrate in the
feedback mechanisms that GBIF.org offers to data publishers.
Activity
Activity
Activity
Activity
XI.1:
XI.2:
XI.3:
XI.4:
GBIF.org basic navigation
GBIF.org downloads
Feedback to data publishers through GBIF.org
Publishers visibility and recognition in GBIF.org
Module XII: Certification-related activities
This final component will include the submission of final assignments by the participants in the workshop, their
assessment by the trainers and the delivery of the certification and badges to those who comply with the
requirements defined for the workshop.
Activity XII.1: Final assignment and evaluation.
ENGLISH
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Août-Novembre 2016
7. Troisième Section : Activités de Suivi
Apprentissage mixte : 26 août – 18 sept 2016. Apprentissage en ligne : 17 oct – 6 nov 2016
Il est conseillé aux participants de réserver environ 10 heures supplémentaires pour compléter les
activités en ligne du troisième section de l’atelier.
Module XI : Accéder aux données via le GBIF.org
En complément de ce qui aura déjà été vu, le dernier module de contenu formatif sera dédié à l’utilisation du site
GBIF.org pour accéder aux données publiées dans le réseau. Une composante importante de ce module sera la
possibilité d’envoyer des retours d’utilisateurs, que le GBIF.org met à disposition des fournisseurs de données.
Activité
Activité
Activité
Activité
XI.1
XI.2
XI.3
XI.4
: Navigation sur GBIF.org
: Téléchargements sur GBIF.org
: Retour aux éditeurs de données via GBIF.org
: La visibilité et la reconnaissance des éditeurs sur GBIF.org
Module XII : Activités liées à la certification
Ce dernier élément inclura la soumission des devoirs par les participants à l’atelier, leur évaluation par les
formateurs et la distribution de la certification et des badges aux participants ayant r empli les critères définis
pour l’atelier.
Activité XII.1 : Exercice final et évaluation.
18
FRANÇAIS
8. Trainers, Coordinators and Local Organizers
BID Workshop trainers and coordinators, from right to left: Nicolas No é, Sophie Pamerlon,
Sharon Grant, Néstor Beltrán, Mélianie Raymond and Alberto González-Talaván.
Trainers
The workshop has been designed, developed and implemented with the collaboration of four
trainers. Néstor Beltrán is the Head of the Content Management Section at SiB Colombia, leads
the data curation, formatting and transformation modules and facilitates the yellow groups. Nicolás
Noé is an IT expert at the Belgian Biodiversity Platform, leads the data publication modules and
facilitates the blue groups. Sharon Grant is Technology Liasion to Science at Chicago’s Field
Museum, leads the data mobilization planning modules and facilitates the red groups. Sophie
Pamerlon is the Biodiversity data engineer of GBIF France, leads the data digitization modules and
facilitates the green groups.
Coordinators
The event is organized and coordinated by the GBIF Secretariat. Alberto
González-Talaván (Senior Programme Officer for Training) and Mélianie
Raymond (Senior Programme Officer for Nodes Development) are the
main event coordinators, facilitating the cooperation of the different teams
contributing to the success of this workshop.
Local Organizer (on-site event)
The on-site event in Kigali, Rwanda has been organised in collaboration with
the Abertine Rift Conservation Society (ARCOS). Sam Kanyamibwa
(Executive Director), Faustin Gashakamba (Director – Development,
Information Systems) and Yvonne Bigengimana (Event Manager) are the
main contacts from ARCOS in the context of this event.
ENGLISH
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Août-Novembre 2016
8. Formateurs, Coordinateurs et Organisateurs Locaux
Les formateurs et coordinateurs BID, de droite à gauche : Nicolas Noé, Sophie Pamerlon,
Sharon Grant, Néstor Beltrán, Mélianie Raym ond et Alberto González-Talaván.
Formateurs
L’atelier a été élaboré, développé et mis en place en collaboration avec quatre formateurs. Néstor
Beltrán est responsable de la section « Gestion du Contenu » au SIB Colombie, il dirige les
modules sur la gestion, la mise en forme et la transformation des données, et anime les groupes
jaunes. Nicolas Noé est un expert informatique à la plateforme belge sur la biodiversité, il dirige les
modules sur la publication des données et anime les groupes bleus. Sharon Grant est médiatrice
technologique pour les Sciences au Field Museum de Chicago, elle dirige les modules de
planification de la mobilisation des données et anime les groupes rouges. Sophie Pamerlon est
ingénieure sur les données de biodiversité au GBIF France, elle dirige les modules de numérisation
des données et anime les groupes verts.
Coordinateurs
L’événement est organisé et coordonné par le Secrétariat du GBIF. Alberto
González-Talaván (Senior Programme Officer en charge des formations)
et Mélianie Raymond (Senior Programme Officer en charge du
développement des points nodaux) sont les coordinateurs principaux de
l’événement et supervisent la coopération entre les différentes équipes
contribuant au succès de cet atelier.
Organisateurs locaux (événement sur place)
L’atelier sur place à Kigali, au Rwanda, a été organisé en collaboration avec
la Société de Conservation du Rift Albertin (Albertine Rift Conservation
Society (ARCOS)). Sam Kanyamibwa (Directeur Exécutif), Faustin
Gashakamba (Directeur – Développement, Systèmes d’Information) et
Yvonne Bigengimana (Gestionnaire d’Evénement) sont les principaux
contacts pour ARCOS dans le contexte de cet événement.
20
FRANÇAIS
9. Work Groups
These are the four English speaking work groups that will be used during the two editions of
the workshop.
YELLOW GROUPS
Language English. Facilitated by Néstor Beltrán
Jean Ganglo (Benin)
Komlan Edjedu Sodjinou (Togo)
Kudzai Mafuwe (Zimbabwe)
Laura Russell (USA)
Wycliffe Mutero (Kenya)
Dedan Kabuu Ngatia (Kenya)
Kisimenda Flora Lourenço Muambalo (Mozambique)
Olebogeng Suwe (Botwswana)
Paulo John Lyimo (Tanzania)
Wilson Busienei (Kenya)
RED GROUPS
Language English. Facilitated by Sharon Grant
Gilbert Muvunankiko (Rwanda, ARCOS)
Gladys Odey Schwinger (Ghana)
Katia Cezón García (Spain)
María Auxiliadora Mora (Costa Rica)
Sara Raquel Figueira Fernandes (Angola)
Anastacia Makati (Botswana)
Boikhutso Lerato Rapalai (Botswana)
Laban Njoroge (Kenya)
Samuel Ojele (Uganda)
Tsitsi Sithandiwe Maponga (Zimbabwe)
ENGLISH
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Août-Novembre 2016
9. Groupes de Travail
Ceux-ci sont les quatre groupes de travail francophones qui seront utilisés au cours des
deux éditions de l'atelier.
GROUPES BLEUS
Langue Française. Animés par Nicolas Noé
Modalité d’Apprentissage Mixte
Alain Jaures Gbetoho (Benin)
Andry Jean Marc Rakotomanjaka (Madagascar)
Francisco Kabisayi Kapuadi (DR Congo)
Koua Serge Beranger N’Goran (Ivory Coast)
Sekou Magassouba (Guinea)
Modalité d’Apprentissage en Ligne
Faï Chabi-Yaoure (Benin)
Jacob Koundouonon Moutouama (Benin)
Joseph Tuyishimire (Rwanda, ARCOS)
Romaric Serge Lokossou (Benin)
Yves Bertrand Soukontoua (Cameroon)
GROUPES VERTS
Langue Française. Animés par Sophie Pamerlon
Modalité d’Apprentissage Mixte
Aboudou Raoufou Radji (Togo)
Fatimata Niang Diop (Senegal)
Mwanga Mwanga Ithe Jean-Claude (DR Congo)
Pulchérie Bissiengou (Gabon)
Ravelomanana Andrianjaka (Madagascar)
Modalité d’Apprentissage en Ligne
Charles Nounagnon Gangnibo (Benin)
Henri Mbale Kunzi (DR Congo)
Jaona Ranaivo (Madagascar)
Mathieu Gueye (Senegal)
22
FRANÇAIS
10. The eLearning Platform Supporting the BID Workshop
Much of the work during the workshop will happen either online, or supported by online resources.
We will use an electronic learning (eLearning) platform based on the software ATutor to s upport our
work online.
Each section of the workshop will be made available as a ‘course’ hosted on the eLearning platform.
You will automatically gain access to the next section when it is time to start it. You do not need to
worry about subscribing to any of the courses available in the platform.
10.1. Connecting to the eLearning Platform and Creating your Online
Profile
The address of the eLearning platform is http://elearning.gbif.es/.
If you haven’t never logged into the platform before, you will be presented with the login screen. You
will have received credentials to access the eLearning platform in an email from the workshop
organizers. Please use these credentials to gain access to the platform. If you have not received
credentials by the day that the online activities officially start, please request them by
contacting [email protected].
Before you start exploring the workshop contents, we recommend that you spend some time getting
familiar with the platform and getting your profile information ready for interactions among s tudents
and facilitators using the platform.
To access the profile configuration area, you need to go to your ‘start page’ and find the ‘profile’ tab
on the top of the page. The profile-related options are available on the main area of the page.
Consider at least:



Changing your password: As the password was generated for you, consider changing it
the first time you log in. You probably want to use one that only you know and you can
remember easily.
Add some basic information about yourself: this workshop has an important social
component and we will be working frequently as a group. You can contribute to facilitating
interactions online by adding information such as: where you work, your country of residence
and maybe a URL with an online profile (e.g. LinkedIn profile).
Add a profile image: It is a good idea to add a profile picture so that all your contributions
can be more easily identified.
ENGLISH
23
Août-Novembre 2016
10. La Plateforme de e-Learning de l’Atelier BID
Beaucoup des tâches durant l’atelier auront lieu soit complètement en ligne, soit à l’aide de
ressources en-ligne. Nous utiliserons une plateforme d’apprentissage électronique de e-learning
basée sur le logiciel ATutor pour faciliter notre travail en-ligne.
Chaque section de l’atelier sera diffusée sous forme d’un ‘cours’ hébergé sur la plateforme de elearning. L’accès en temps utile à la section suivante est automatique. Vous n’avez pas à vous
préocupper de votre inscription à chacun des cours disponible sur la plateforme.
10.1. Connexion à la Plateforme de e-Learning et Création de votre Profil
en-Ligne
L’adresse de la plateforme de e-learning est http://elearning.gbif.es/.
Si vous ne vous êtes jamais inscrit à la plateforme auparavant, vous serez dirigés vers l’écran
d’inscription. Vos paramètres d’authentification à la plateforme vous seront envoyé dans un e-mail
de la part des organisateurs de l’atelier. Veuillez utiliser ces paramètres pour accéder la plateforme.
Si vous ne les avez toujours pas reçu le jour du début des activités de formation en-ligne, veuillez
alors les demander en contactant [email protected].
Avant que vous ne preniez connaissance du contenu de l’atelier, nous vous conseillons de prendre
le temps de vous familiariser avec la plateforme et de mettre à jour les informations de votre profil
afin d’échanger plus facilement avec les autres étudiants et intervenants utilisant la plateforme.
Pour accéder à l’écran de configuration de votre profil, veuillez vous rendre sur ‘ma page d’accueil’
et cliquer sur l’onglet ‘profil’ en haut de la page. Les options permettant de modifier votre profil sont
accessibles sur la zone principale de la page :



Modifier votre mot de passe : Comme ce mot de passe a été généré pour vous,
veuillez le modifier lors de la première visite. Choisissez une mot de passe que personne
d’autre que vous ne peut connaître et facile à retenir.
Ajouter quelques informations à propos de vous : cet atelier comporte un important
aspect social et le travail en groupe sera fréquent. En ajoutant des informations telles que
votre endroit de travail, votre pays de résidence et éventuellement un lien Internet avec
un profil en-ligne (ex: page LinkedIn), vous rendrez le contact en ligne avec les autres
participants plus facile.
Ajouter une image à votre profil : ajouter une image illustrant votre compte est une
bonne idée, votre contribution à l’atelier sera ainsi plus facilement identifiable.
24
FRANÇAIS
10.2. Accessing the Different Components of the eLearning Spaces
('courses')
The main navigation system is the tabs bar at the top of the window (marked with number 1 in the
image). Be aware that the set of tabs change when you are in different parts of the platform. When
you are in a ‘course’, you will have access to the following areas:




Site-map: presents all contents of the ‘course’.
Forum: the main mechanism of communication during the workshop.
Groups: where you can check the groups to which you have been subscribed and
access the forum sections reserved for each group.
Export content: Use this tool to download the content of the course (or one of the
sections) and use it offline.
When inside a ‘course’, you will see a column on the left called the ‘sidebar’ (marked with number 2
in the image). That bar gives access to the contents, and to additional tools.
ENGLISH
25
Août-Novembre 2016
10.2. Accéder aux Différentes Composantes de l’Espace de eLearning ('Cours')
Le principal moyen de naviguer dans le site est la barre d’onglets au sommet de l’écran (numéro 1
sur l’image). Ayez à l’esprit que la structure de ces onglets change quand vous vous déplacez dans
le site. A l’intérieur d’un ‘cours’, vous accédez aux zones suivantes :




Plan du site : affiche tout le contenu du ‘cours’.
Forums : le principal moyen de communication au cours de l’atelier.
Groupes: vous pourrez suivre ici les groupes auxquels vous vous êtes inscrits et accéder
aux sections du forum réservées aux groupes.
Exporter du contenu : Cet outil permet de télécharger le contenu du cours (ou d’une de
ses sections) et d’y accéder sans connexion.
Lorsque vous êtes à l’intérieur d’un ‘cours’, une colonne ‘barre latérale’ (table des matières) est
affichée à gauche de l’écran (numéro 2 sur l’image). Elle permet d’accéder aux contenus, ainsi qu’à
des outils additionnels.
26
FRANÇAIS
11. Need Help?
Please use the following mechanisms if you need help while completing this workshop:



Administrative and technical problems: If you have issues connected to your
nomination to participate in the workshop, or problems accessing any of the online
resources, please contact [email protected].
Content-related problems: If you have any doubts about the contents of the workshop,
send a message to your work group forum in the eLearning platform where your group
facilitators and peers will have the chance to discuss and provide you with guidance.
Travel arrangements (only for participants of the on-site event in Kigali): If you need
help with your travel arrangements for Kigali, please contact our local organizers Mr.
Faustin Gashakamba ([email protected]) and Ms. Yvonne Bigengimana
([email protected]).
12. Acknowledgements
The contents of this leaflet have been produced by Alberto González-Talaván, Katia Cezón García,
Laura Russell, Mélianie Raymond, Néstor Beltrán, Nicolas Noé, Sharon Grant and Sophie
Pamerlon.
Translated into French by Mélianie Raymond, Nicolas Noé and Sophie Pamerlon.
ENGLISH
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Août-Novembre 2016
11. Besoin d’Aide ?
Veuillez effectuer les démarches suivantes si vous avez besoin d’aide au cours de l’atelier :



Problèmes administratifs et techniques : en cas de demandes liées à votre sélection
pour l’atelier, ou de problèmes pour accéder au matériel pédagogique en ligne, veuillez
contacter [email protected].
Problèmes de contenu : en cas de doute à propos du contenu de l’atelier, n’hésitez pas
à envoyer un message sur le forum de votre groupe de travail dans la plate-forme de
eLearning. Les facilitateurs pédagogiques et les autres étudiants auront ainsi
l’opportunité d’en discuter et de vous apporter de l’aide.
Disposition du voyage (exclusivement pour les participants à la partie en présentiel à
Kigali): Si vous avez besoin d’aide pour votre venue à Kigali, veuillez contacter les
organisateurs locaux M. Faustin Gashakamba ([email protected]) et
Mme. Yvonne Bigengimana ([email protected]).
12. Remerciements
Le contenu de cette brochure a été produit par Alberto González-Talaván, Katia Cézon García,
Laura Russell, Mélianie Raymond, Néstor Beltrán, Nicolas Noé, Sharon Grant et Sophie Pamerlon.
Traduit en français par Mélianie Raymond, Nicolas Noé et Sophie Pamerlon.
28
FRANÇAIS

Brochure du 1ère Atelier BID

Transcription

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