Lieu : Laboratoire d`informatique de Tours (LI), / Unité Physiologie

Lieu : Laboratoire d’informatique de Tours (LI), / Unité Physiologie de la Reproduction
et des Comportements (PRC)
Durée : 1 an
Contact : Anne Poupon ([email protected])
Dans le cadre du projet Biosystémique, nous recherchons une personne titulaire
d’une thèse pour une durée de 1 an. L’objectif est d’adapter et d’utiliser des
techniques de traitement automatique des langues (annotation avec les cascades de
graphes Unitex), actuellement utilisées dans le projet Istex par un doctorant sur la
reconnaissance d’entités nommées, afin d’extraire d’articles scientifiques les
résultats des expériences individuelles citées. Cela permettra, à partir d’un corpus
très important de publications, de disposer d’un « catalogue » des expériences
réalisées. La première partie du travail sera donc un travail d'expert du domaine
auprès d'un expert en recherche d'information. Dans un deuxième temps, un corpus
de publications concernant la voie ß-arrestine dans la signalisation des récepteurs
couplés aux protéines G RCPG) sera traité par cette nouvelle méthode, et utilisé
pour découvrir des éléments nouveaux dans cette voie.
Nous recherchons une personne de formation biologie ou bioinformatique ayant une
grande habitude de la recherche bibliographique, et ayant de solides connaissances
en biologie cellulaire et moléculaire, idéalement dans le domaine de la signalisation
des RCPG. Son rôle sera dans une première partie de participer à la mise au point
du processus d’annotation des articles en lien étroit avec le doctorant du LI. Dans un
deuxième temps, son rôle sera de sélectionner un corpus de publications
scientifiques et d’extraire des connaissances à partir des items identifiés par la
méthode.