Analyses biologiques des sols - SOL

Laboratoire et bureau d’études au service de l’agronomie et de la protection de l’environnement
Rte de Duillier 50 - CP 1381 - 1260 NYON 1 Suisse - Tél : +41 (0)22 363 43 04 - www.sol-conseil.ch
Analyses biologiques des sols
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Laboratoire et bureau d’études au service de l’agronomie et de la protection de l’environnement
Méthodes d’analyses
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Paramètres microbiens
Biomasse microbienne ATP
- Mesure permettant d’exprimer la masse des microorganismes vivants par unité
de sol. L’adénosine triphosphate (ATP) et l’adénosine diphosphate (ADP)
sont présentes dans toute cellule vivante. Hydrolysées à la mort de la cellule,
il s’agit d’un indicateur de la masse vivante
Minéralisation du carbone (Min.-C)
- Estimation de la quantité de MO minéralisée par les microorganismes du sol. La mesure est
la somme de CO2 libéré durant 15 jours d’incubation. La valeur est transformée mathématiquement en équivalent de matière organique (microgrammes de MO / g MS du sol sur 15 j)
La méthode est la même que la respiration basale mais à intervalle de temps différent et sur
échantillon sec puis ré-humecté
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Méthodes d’analyses: ATP+CO2
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Deux mesures effectuées:
- ATP: mesure de la biomasse
Représente la masse totale des
microorganismes présents: bactéries,
champignons, etc.
- CO2: respiration, mesure
l’activité de cette biomasse
Représente l’activité de ces microorganismes.
Des conditions pédologiques optimales
doivent être réunies pour qu’ils soient actifs.
Source: Groupe de travail « Biologie du sol – application »
(BSA), N. Rossier et al.
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Laboratoire et bureau d’études au service de l’agronomie et de la protection de l’environnement
Méthodes d’analyses: CO2 (description)
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• Etape 1: ré-humectation du sol par capillarité
• Etape 2: incubation à 25°C (durée: 3 jours pour ré activer l’activité)
• Etape 3: introduction de la solution de NaOH
• Etape 4: titration jours 4-9 et 15 pour avoir la respiration
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Mesures
pendant
l’incubation
à 25°C
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Laboratoire et bureau d’études au service de l’agronomie et de la protection de l’environnement
Méthodes d’analyses: ATP (description)
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• Etape 1: extraction de la terre à la fin des 15 jours de mesure de CO2
• Etape 2: préparation pour mesure avec ajout d’un tampon
• Etape 3: dosage au bioluminomètre (enzyme fluorescente)
• Etape 4: transformation de la valeur d’absorbance en équivalent d’ATP
Jour 15
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Laboratoire et bureau d’études au service de l’agronomie et de la protection de l’environnement
Méthodes d’analyses: ATP+CO2 (résumé)
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Procédé aérobie naturel de transformation des
matières organiques d’origine végétale et animale.
Source: Méthode modifiée selon Nicolas Maire,
1999, Espagne
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Laboratoire et bureau d’études au service de l’agronomie et de la protection de l’environnement
Méthodes d’analyses: ATP+CO2 (résumé)
Rte de Duillier 50 - CP 1381 - 1260 NYON 1 Suisse - Tél : +41 (0)22 363 43 04 - www.sol-conseil.ch
Points forts :
• Seule mesure d’activité biologique pratiquée en routine
• 2 mesures pour 4 paramètres: ATP, CO2, minéralisation du Corg, rapport
CO2/ATP
• Possibilité de stockage longue durée au congélateur pour mesurer l’ATP
(depuis le filtrat issu des mesures de CO2)
Limites :
• Enzyme ne se conserve pas => besoin de faire les mesures en séries
• Précaution de manipulation (aucun contact «physique» avec l’opérateur)
• Optimisation de la méthode pour pratique de routine
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Laboratoire et bureau d’études au service de l’agronomie et de la protection de l’environnement
Méthodes d’analyses: ATP+CO2 (prélèvement)
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• Prélèvement classique d’un mélange représentatif de la parcelle
Coordonnées
Nom parcelle
ATP
2-20cm
12 à 15 prélèvements/parcelle
répartis régulièrement
le mélange constitue
l’échantillon (1kg)
• Echantillon stocké au frais 4-5 °C (surtout ne pas congeler)
• Analyse possible 3 fois par an (selon calendrier)
• Utilisation de la feuille de demande spéciale (en cours d’établissement)
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Laboratoire et bureau d’études au service de l’agronomie et de la protection de l’environnement
Méthodes d’analyses: ATP+CO2 (délais)
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Réception + préparation
(séchage 30°C et broyage)
Sem 1
Sem 2
Mesure du CO2
Sem 3
Mesure de l’ATP et interprétation des résultats
Sem 4
Sem 5
Périodes d’analyses
• Réalisation calendaire: se référer au calendrier.
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