choisir la technologie adaptée à son projet

Formation continue
Provence-Alpes-Côte d’Azur et Corse
choisir la technologie adaptée à son projet
Chercheurs et ingénieurs
Les méthodes de séquençages, principes et applications
Les différentes méthodes de séquençage à haut‐débit : Solid, Illumina, Ion Torrent, 454 Roche, Pacific Biosciences
• Principe et fonctionnement
• Capacités de séquençage
• Comparatif des différentes méthodes, forces et faiblesses
• Technologies de demain
Les différentes applications NGS : quelle méthode choisir en fonction de mon application ?
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Génomique
Transcriptomique
Epigénomique
Métagénomique et biodiversité
Conclusions
12 personnes
De l’échantillon à la séquence : les grandes étapes méthodologiques
Préparation des échantillons
Extraction des ADN et ARN
Différentes approches d’amplification par PCR
Méthodes de capture et d’enrichissement
Construction des différents types de banques Fragmentation/Sizing
Méthodes de purification, d’amplification et de quantification
• Séquençage des banques (exemples)
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L’analyse des données de séquençage
• Principaux formats de fichiers de sortie de données • Quelques outils d’analyse
S. Hughes et M.B. Gillet ‐ BIOSciences & Co
Délégation régionale Inserm
Marie‐Laure Olive, Responsable formation ‐ demat‐form.dr‐[email protected]
Personnels travaillant dans une structure mixte Inserm : inscription via www.sirene.inserm.fr rattachée à la région : Paca / domaine : TS1 ‐ BM ‐ Génome ‐ Trans.
Personnels CNRS : formulaire d’inscription papier à transmettre à [email protected] Autres personnels : formulaire papier à transmettre à demat‐form.dr‐[email protected]
Formation en partenariat avec le CNRS
Délégation Provence et Corse
Photo/Dooley, Kevin