Andrea M. Rau
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Andrea M. Rau
Andrea M. Rau Département de Statistique Purdue University 150 N. University Street West Lafayette, IN USA 47907-2067 Téléphone: (001)765-490-1735 Téléfaxe: (001)765-494-0558 Mail: [email protected] http://www.stat.purdue.edu/∼arau Personnel Née: le 29 novembre, 1982 à Minot, ND USA. Nationalité: américaine. Langues: anglais, francais. Formation B.A. en Français et Mathématiques (avec distinction en Statistique), mai 2005 Saint Olaf College, Northfield, MN, USA. M.S. en Statistique Appliquées, mai 2007 Purdue University, West Lafayette, Indiana, USA. Ph.D. en Statistique, août 2010 Purdue University, West Lafayette, Indiana, USA. Encadrante: R. W. Doerge Comité de thèse: Florence Jaffrézic (INRA-GABI, Jouy en Josas, France), Jayanta Ghosh (Purdue University), Bruce Craig (Purdue University), Alan Qi (Purdue University) Sujet: Inférence rétrospective de réseaux de gènes à partir de données génomiques temporelles Expérience Professionelle Assistante de recherche pour R. W. Doerge, Purdue University, Département de Statistique Dates: janvier 2008 - août 2010 Responsabilités: Contribuer aux projets de recherche en bioinformatique et statistique; analyser les données d’expression de gènes (microarray, tiling array, RNA Sequencing) afin de trouver les gènes differentiallement exprimés. Auteuse de contribution: Purdue University, Département de Statistique Dates: août 2007 - août 2008 Responsabilités: Ecrire des profiles de professeurs et d’anciens étudiants afin de les poster sur le site internet du département. Consultante: Technical Assistance Program, Purdue University, Département de Statistique Dates: mars 2007 - décembre 2007 Responsabilités: Concevoir un rapport du Indiana Public Health System Quality Improvement Project, assister les entreprises à améliorer les opérations par application de solutions conduites par données. Consultante: Statistical Consulting Service, Purdue University, Département de Statistique Dates: janvier 2007 - décembre 2007 Responsabilités: Travailler avec professeurs, personnels, et étudiants dans la communauté de Purdue á concevoir et analyser les expériences, assister avec les logiciels statistiques. A. RAU, CV 2010, 1 de 5 Enseignante de laboratoire: Purdue University, Departement de Statistique Dates: août 2006 - décembre 2006 Cours: STAT 301, Méthologie élémentaire de statistique. Responsabilités: Diriger les sessions de laboratoire, noter les examens. Texte: Moore et McCabe, Introduction to the Practice of Statistics, (4th edition, 2003) Stage statistique: Walgreens Corporation, Deerfield, IL Dates: mai 2006 - août 2006 Responsabilités: Introduire les séries temporelles au groupe de “Media Spend” dans le département de marketing pour analyser les effets des changements publicitaires sur les ventes de magasins, employer les modèles d’intervention pour examiner l’impacte de nouveaux compétiteurs auprès de Walgreens actuels. Stage statistique: Mayo Clinic, Rochester, MN Dates: janvier 2005 Responsabilités: Appliquer les analyses de la littérature pharmacocinétique aux données d’une épreuve clinique (première phase), déterminer une modèle d’échantillonnage limité (Limited Sampling Model). Publications Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, R. W. Doerge (2010). “An empirical Bayesian method for estimating biological networks from temporal microarray data.” Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology: Vol. 9: Iss. 1, Article 9. Alfred F. Furth, Sumithra J. Mandrekar, Angelina D. Tan, Andrea Rau, Sara J. Felten, Matthew M. Ames, Alex A. Adjei, Charlies Erlichman, Joel M. Reid (2008). “A limited sample model to predict area under the drug concentration curve for 17-(allylamino)-17-demethoxygeldanamycin and its active metabolite 17-(amino)-17-demethoxygeldanomycin”, Cancer Chemotherapy Pharmacology 61(1): 39-45. Manuscrits soumis Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, R. W. Doerge (2010). “Approximate Bayesian approaches for reverse engineering biological networks.” Proceedings of the Kansas State University Conference on Applied Statistics in Agriculture. Manhattan, Kansas (submitted). Shu Zhang, Xiaomei Zheng, Lingling An, Andrea Rau, Paul L. Auer, R. W. Doerge, David Foster (2010). “Effects of green tea extract and epigallocatechin-3-gallate on gene expression in Caco-2 cells.” Nutrition (submitted). Autres publications Andrea Rau (2008). “Success of Volunteer Statistical Consulting Service Leads to Expanded Network.” The Statistical Consultant, 25(1). Andrea Rau (2008). “STATCOM Network Engages Growing Number of Student Volunteers.” Newsletter for the Section on Statistical Education, 13(1). Andrea Rau (2008). “Success of Statistical Service Leads to Expanded Network.” Amstat News, April 2008. A. RAU, CV 2010, 2 de 5 Présentations Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, R. W. Doerge. “Approximate Bayesian methods for reverse engineering biological networks”, Conference on Applied Statistics in Agriculture, Kansas State University. Manhattan, Kansas, le 26 avril 2010. Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, R. W. Doerge. “Approximate Bayesian methods for reverse engineering biological networks”, Bioinformatics seminar, Purdue University. West Lafayette, Indiana, le 13 avril 2010. Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, R. W. Doerge. “Reverse-Engineering Gene Networks from Microarray Data with Dynamic Bayesian Networks”, GENESYS Satellite Meeting at the European Conference on Complex Systems. Warwick, UK, le 22 septembre 2009. Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, R. W. Doerge. “Using Dynamic Bayesian Networks with Hidden States to Infer Gene Regulatory Networks”, Joint Statistical Meetings of the American Statistical Association. Washington, DC, le 5 août 2009. Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, R. W. Doerge. “Inférence sur les réseaux génomiques par des modèles espace-état”, Séminaire de l’AgroParisTech. Paris, France, le 22 juin 2009. Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, R. W. Doerge. “Inférence sur les réseaux génomiques par des modèles espace-état”, Séminaire de GABI, INRA. Jouy-en-Josas, France, le 15 juin 2009. Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, R. W. Doerge. “Reverse Engineering Gene Regulatory Networks”, 11ème Séminaire des doctorants du département de Génétique Animale, INRA. Jouy-en-Josas, France, les 23 et 24 mars 2009. Andrea Rau and Meghan Honerlaw. “STATCOM: Statistics in the Community”, Luncheon of the Chicago Chapter of the American Statistical Association (ASA). Chicago, IL, le 7 novembre 2007. Shraddha Mehta, Alex Lipka, and Andrea Rau. “STATCOM: Statistics in the Community”, Meeting of Statistics Department Outstanding Alumni Awardees, Purdue University. West Lafayette, IN, septembre 2007. Posters Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, and R. W. Doerge. “Reverse-Engineering Genetic Regulatory Interactions from Transcriptomic Data using Dynamic Bayesian Networks.” Second Biennial Newcastle Workshop on Statistical Bioinformatics and Stochastic Systems Biology. Newcastle, UK, les 18 et 19 mai 2009. Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, and R. W. Doerge. “An Empirical Bayes Approach to Inferring Genetic Regulatory Interactions with Dynamic Bayesian Networks.” Conference on Applied Statistics in Agriculture at Kansas State University. Manhattan, KS, les 19-21 avril 2009. Andrea Rau, Florence Jaffrézic, Jean-Louis Foulley, and R. W. Doerge. “An Empirical Bayes Approach to Inferring Genetic Regulatory Interactions with Dynamic Bayesian Networks.” Gordon conference on Quantitative Genetics and Genomics. Galveston, TX, les 22-27 février 2009. A. RAU, CV 2010, 3 de 5 Douglas D. Baumann and Andrea Rau. “Seven Years of StatCom at Purdue: Managing a Growing Number of Student Volunteers.” Joint Statistical Meetings of the American Statistical Association. Denver, CO, le 4 août 2008. Andrea Rau. “Inferring Gene Regulatory Network through Linear Feedback State Space Models.” 10th Seminar of Doctoral Students in the Animal Genetics Department. Toulouse, France, les 20-21 mars 2008. Bourses et honneurs Bourse de doctorant, Graduate Women in Science Programs (2010) Bourse de doctorant, Conference on Applied Statistics in Agriculture at Kansas State University à Manhattan, KS (2010) Bourse de doctorant, BioC Conference à Seattle, Washington (2009) Mention honorable, Gertrude M. Cox Scholarship (2009) Bourse de doctorant, Gordon Conference on Quantitative Genetics and Genomics à Galveston, Texas (2009) A.H. Ismail Interdisciplinary Program Doctoral Research Travel Award (2009) Vertical Integration of Research and Education in the Mathematical Sciences (VIGRE) Fellowship (bourse externe de la National Science Foundation), Purdue University (2005-2010) Membre de Phi Beta Kappa, société universitaire d’honneur académique (2005) Distinction departementale en statistique, Saint Olaf College (2005) Co-presidente de Pi Delta Phi (société universitaire d’honneur française), Saint Olaf College (20042005) Buntrock Academic Scholarship, Saint Olaf College (2001) National Merit Scholar (2001) Presidential Scholar (2001) Services Organisatrice d’une table ronde invitée (2009): “The Pros of Pro Bono Statistics” aux Joint Statistical Meetings de l’Association Américaine de Statistique (ASA) à Washington, DC. Président du comité de “Student Pro Bono Statistics” de l’ASA (2009). Membre du comité de “Student Pro Bono Statistics” de l’ASA (2009-2010). Coordonnatrice du réseau StatCom, (2007-2008): Statistics in the Community (StatCom) est une organization volontaire d’étudiants en statistique qui fournit les services professionels et gratuits de consultation statistique aux groups non bénéfices et gouvernmentaux. Chef de projet de StatCom, (2007): Assister une équipe d’étudiants travaillant avec le Conseil du Lafayette Downtown Development. Chef d’équipe de StatCom (2006): Précepteuse de mathématiques pour les jeunes au Lafayette A. RAU, CV 2010, 4 de 5 Juvenile Drug Treatment Court. Organizations professionelles American Statistical Association (ASA) A. RAU, CV 2010, 5 de 5