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Spécialiste en biologie moléculaire, votre partenaire de l’extraction à l’amplification CATALOGUE HOSPITALIER Sommaire ■ Extraction p6 Maxwell ® 16 IVD instrument, extraction petits volumes Extraction manuelle p 13 HSM 2.0 Instrument, extraction grands volumes p 14 p7 ■ Quantification p 16 ■ Analyse STR p 20 ■ Focus épigénétique p 26 ■ Amplification (Coffrets - Mix) p 28 ■ Identification (Spectrométrie de Masse) p 36 ■ Recherche Translationnelle p 38 ■ Démarche Promega p 40 Services p 40 Centre de formation PETAL p 41 Site Feynman Center cGMP p 42 Développement durable p 43 Les produits sont identifiés CE IVD s’ils bénéficient du marquage CE IVD (Conformité Européenne pour le Diagnostic In Vitro) ou RUO (Research Use Only) s'ils sont utilisés en recherche uniquement. Promega, des solutions automatisées et ciblées pour répondre aux besoins des laboratoires hospitaliers Les progrès en biologie moléculaire ces dernières années ont permis l’émergence de découvertes médicales extraordinaires dans des domaines tels que les maladies rares, la cancérologie, les maladies infectieuses... En plus des nouvelles armes thérapeutiques en cours de développement (biomédicaments), les techniques de biologie moléculaire permettent également d’étudier les pathologies au niveau moléculaire d’un point de vue génétique humaine, comme la détection de mutations. Le facteur pronostic, basé sur une caractérisation moléculaire des maladies, devient un élément fondamental dans la prise en charge du patient. L’émergence d’une méde cine personnalisée est désormais possible. Des techniques universelles, telles que la PCR largement utilisée en recherche, sont désormais routinières dans de nombreux laboratoires hospitaliers. Les tests de biologie moléculaire ouvrent ainsi la voie à une biologie nouvelle et trouvent leur place dans le paysage de la biologie hospitalière. 3 Avec plus de 30 ans d’existence, Promega est présent dans le monde avec 14 filiales et 50 distributeurs. Il se positionne comme un acteur incontournable en biologie moléculaire. Détenteur de plus de 500 brevets pour la conception de réactifs, notamment dans les domaines de la génomique, de la protéomique, de l’identification génétique humaine, Promega contribue aux travaux de la communauté scientifique internationale. 4 Promega, une solide expertise en biologie moléculaire Plus qu’un spécialiste, un partenaire Promega a développé une expertise et un savoir-faire dans des domaines variés tels que la recherche fondamentale, la biologie clinique, le screening de molécules à visée thérapeutique ou la médecine légale. Ses produits sont cités au travers de milliers de publications scientifiques et médicales parmi lesquelles Oncology, Science, Nature. Promega développe des solutions automatisées et ciblées à destination des laboratoires hospitaliers : services de génétique (oncogénétique, cytogénétique…), HLA, immunologie, hématologie, oncologie, anatomopathologie, infectiologie. Promega vous accompagne ainsi depuis l’extraction (automatisée ou manuelle) jusqu’à l’amplification. Un service de qualité optimale • Un marquage CE IVD ou RUO selon les produits • Des normes ISO 9001 et ISO 13485 • Un SAV de qualité et de proximité • Une plateforme technique à votre écoute (Hotline - Messenger) • Des délais et des conditions de livraison optimaux (respect de la chaîne du froid) • n laboratoire d’application disponible pour suivre, tester des produits, réaliser U des formations (Lyon) • n site industriel classé cGMP pour la production de produits réglementés pour U l'industrie pharmaceutique ou l'industrie du diagnostic 5 Extraction Promega offre des solutions automatisées dans le but de répondre aux besoins de standardisation des méthodes et d'optimisation des flux de laboratoires. De la microbiopsie au grand volume de sang (10 mL), Maxwell ® 16 IVD System et HSM 2.0 Instrument permettent d’extraire ADN ou ARN en toute confiance. Maxwell 16 IVD System (CE IVD) ® Extraction automatisée de petits volumes Rapidité Extraction automatisée de 1 à 16 échantillons en 30-45 minutes. Facilité d’utilisation •D es cartouches pré-remplies adaptées à un large panel d’échantillons • Moins de traitements en amont • P rotocoles pré-enregistrés et faciles d'utilisation • U n écran tactile Traçabilité • U n lecteur de code barres pour le suivi des échantillons et des runs • E xportation des données vers un PC Fiabilité AS3050 • A bsence de contamination croisée • L ampe UV pour la décontamination • Procédé unique de déplacement de billes magnétiques, sans pipetage de liquides • A reproductibilité assurée : aucune variation d'un run à l'autre • S ervice de maintenance préventive pour garantir le fonctionnement optimal du système Extraction à partir d'un large panel d’échantillons ADN génomique • Sang total / Buffy coat • Tissus frais/congelés • FFPE • Cellule • Salive • Ecouvillons • Fluides corporels ARN total • Sang total / Buffy coat • Cellules • Tissus Gagnez 6 fois plus de temps dans vos extractions ! ADN/ARN de virus • Plasma • Sérum • Ecouvillons Optimisation des coûts : réduisez de 50% vos dépenses en extractions* Coût des extractions Temps utilisateur 90 min. 15 min. 22,5 E 11,5 E -50% Colonnes (manuel) Cartouches (automate) Colonnes (manuel) Cartouches (automate) * Coût global = prix du réactif + temps technicien 7 Hématologie / Oncologie / Génétique Extraction d'ARN à partir de prélèvements de sang, cellules et tissus Moins de contamination par l'ADN 80 35 80 70 30 60 70 50 60 40 50 30 40 20 30 Maxwell® 16/simply RNA Q TRIzol-Manual Faible contamination par l’ADN génomique 6,5 à 9 Ct de moins sur ces réactions correspondent à une contamination en ADN génomique 90 à 500 fois plus élevée 25 20 simply RNA Blood 15 simply QRNA Marque RNABlood Blood Mini 10 20 lisée par3 mL de sang (ng/µl) Donneur 0 10 6 10 5 10 4 10 3 HEK 293 Cells ang (ng/µl) 10027MA 5 par mL de sang (ng/µl) 33,6 24,6 27,1 2 mL Donneur 3 Marque Donneur Q RNA Blood Mini de sang normalisée par (ng/µl) Donneur 3 Concentration Marque Q RNA Blood Mininormalisée 27,8 27,8 25,6 simply RNA Blood Donneur 1 Concentration 10 Marque Q RNA Blood Mini Donneur 3 24,1 24 24 simply RNA Blood2 Donneur Donneur 1 0 20 19,7 20,8 0 10 17 18,1 18,4 Donneur 2 Des concentrations élevées en ARN Average Cq (n=3) RNARNA (ng/ul per per ml blood input) (ng/ul ml blood input) by Absorbance by Absorbance La qualité de l’ARN extrait d’un prélèvement est primordiale pour la recherche de mutations génétiques impliquées dans les cancers ou les maladies héréditaires. Trois kits Maxwel ® 16 dédiés à l’extraction d’ARN à partir de sang (EDTA et Paxgene), cellules ou tissus sont désormais disponibles et offrent une solution rapide et efficace. Grâce au traitement à la DNase inclus dans la cartouche, l’ARN obtenu est quasi exempt d’ADN (<0,017%). 10 6 No RT Rendement d’extraction d’ARN sur 10 millions de cellules N° échantillon Rendement extraction en ng Ratio A260/A280 concentration en ng.µl-1 volume d'élution en µl 1 7680 2,06 256 30 2 6060 2,06 202 30 3 6450 2,07 215 30 4 7950 2,09 265 30 5 9030 2,07 301 30 6 8310 2,08 277 30 7 7620 2,06 254 30 8 8700 2,09 290 30 9 9120 2,09 304 30 10 5100 2,08 170 30 11 4470 2,09 149 30 12 8760 2,07 292 30 13 7920 2,06 264 30 14 5160 2,04 172 30 15 4050 2,05 135 30 16 8550 2,05 285 30 8 L'automate Maxwell® nous permet d'extraire simultanément jusqu'à 16 ARN en 1 heure environ. Ceci représente un gain de temps considérable en comparaison de notre ancienne technique manuelle. Ainsi à partir de culots secs de 10M de cellules nous obtenons des ARN de quantité et de qualité adéquates pour nos techniques de qPCR. Dr O. K. Laboratoire d'Hématologie Moléculaire, APHP Anatomopathologie Extraction d'ADN à partir de tissus inclus en paraffine Promega propose une solution automatisée d’extraction d’ADN à partir de tissus inclus en paraffine. L’association du Maxwel® 16 et du kit Maxwel ® LEV FFPE offre une solution complète aux laboratoires d’Anatomopathologie et d’Oncologie, permettant une extraction en 30 minutes sans étape de déparaffinage au préalable. Cette solution permet de s’affranchir des contraintes liées à l’extraction manuelle, technique longue et fastidieuse nécessitant souvent l’utilisation de solvants toxiques. Les laboratoires augmentent ainsi en rapidité et en efficacité pour le rendu d’analyses. 200bp100bp pur 1/5 1/10 Trois dilutions (pur, 1/5, 1/10) de l’ADN extrait à partir d’une coupe d’adénocarcinome colique macrodisséquée qui est amplifiée par PCR multiplexe ciblant les exons 11 et 13 du gène KIT (respectivement 150 et 116bp) et l’exon 15 du gène BRAF (173bp). Nous utilisons l’extracteur Maxwell®pour extraire l’ADN à partir de coupes de tissus inclus en paraffine. L’augmentation du nombre d’échantillons traités nécessitait d’automatiser l’étape d’extraction pour réduire les risques d’erreurs liés à la manipulation des échantillons et pour gagner du temps. La qualité des éluats issus du Maxwell®a réduit le nombre d’échec d’amplification surtout pour les petites biopsies. AS3050 Kit Maxwell® 16 FFPE Plus LEV DNA Purification 9 Dr C. L.M. Laboratoire de Génétique Moléculaire Plateforme de Génétique Moléculaire des Cancers (INCa) de Brest HLA / Transplantation / Immunologie Des extractions sécurisées pour des résultats reproductibles Pourquoi le Maxwell ® est la solution des laboratoires HLA ? U ne solution automatisée qui remplace les méthodes d’extraction d’ADN sur colonne, consommatrices de temps et sujettes aux erreurs de manipulation. L e nombre de transplantations d’organes et de moelle osseuse augmente. Les laboratoires HLA sont amenés à travailler plus vite. L e Maxwell ® apporte un gain de temps considérable dans le typage HLA pour la recherche de donneurs compatibles. Il donne des résultats reproductibles et des rendements élevés. Le risque d’erreur est également réduit du fait d'une simplification des manipulations rendant l’automate facilement accessible. 50 Laboratoires HLA EFS Rhône-Alpes Sang Buffy Coat (2,5 ml) 40 Rendement (µg) Nous cherchions justement un véritable automate d’extraction des acides nucléiques. Une partie des manipulations nécessitait l’intervention d’une technicienne, et seuls six échantillons pouvaient être traités à la fois. Désormais en 40 min. environ, ce sont jusqu’à 16 échantillons qui sont préparés. Le Maxwell® 16 nous a donc permis de libérer du temps technicien, il se révèle particulièrement utile pour les grandes séries. 30 20 6691MC 10 0 1 2 3 4 5 Echantillon Publications 1. Effects of infectious mononucleosis and HLA-DRB1*15 in multiple sclerosis. TR. Nielsen, K. Rostgaard, J. Askling, R. Steffensen, A. Oturai, C. Jersild, N. Koch-Henriksen, PS. Sørensen, and H. Hjalgrim. Multiple Sclerosis, Apr 2009; 15: 431 - 436. 2. IL-17 Is Necessary for Host Protection against Acute-Phase Trypanosoma cruzi Infection. Yoshiyuki Miyazaki, Shinjiro Hamano, Seng Wang, Yohei Shimanoe, Yoichiro Iwakura, and Hiroki Yoshida. J. Immunol., Jul 2010; 185: 1150 - 1157. 10 Virologie Pourquoi le Maxwell ® est la solution des laboratoires de virologie ? L’automate Maxwell ® 16 permet de répondre à des besoins urgents, tout en garantissant la qualité optimale des acides nucléiques extraits. Ce système d'une grande fiabilité donne des résultats reproductibles d’un run à l’autre. Sa lampe UV et son procédé unique de déplacements de billes magnétiques, sans avoir recours à l'aspiration de liquide, assurent l’absence de contamination croisée et préserve la sécurité des utilisateurs. Le risque d’erreur est réduit du fait de la simplification des manipulations. Virus Acides Nucléiques Type d'échantillons Applications Influenza (Flu) ARN Sécrétions Nasales (M4 media) RT PCR classique (CDC 5 primer set) Respiratory virus panel ARN Sécrétions Nasales / NP / BAI Luminex RV Hepatis C Virus (HCV) ARN Plasma Genotypage HCV (Siemens) Adenovirus ADN Sécrétions QuantiTect Virus (Qiagen) Human Immunodeficiency Virus (HIV) ARN Plasma PCR classique Cyto megalovirus (CMV) ADN Plasma PCR en temps réel (Roche Hvb-probe), Artus (Qiagen) Herpes Simplex Virus (SHV) ADN Sécrétions PCR classique HPV ADN Sécrétions Third Wave Invader Extraction personnalisée selon les virus. Validation de l’extraction d’une large gamme de virus avec le Maxwell ® 16 Viral Total nucleic acid purification kit. Cette solution a été adoptée par de nombreux biologistes qui souhaitent détecter des infections grippales, des infections du système nerveux (ex. CMV, VIH), des infections respiratoires (adénovirus), des infections du tractus génital (ex. HPV), des infections systémiques (ex. HCV)… Le Maxwell® 16 nous a permis d’extraire des acides nucléiques viraux à partir de sécrétions respiratoires. Nous avons pu faire, en 36 min., des extractions sur 16 prélèvements différents à partir de volumes de 200 μl et ainsi mettre en évidence la présence de virus à partir d’ADN génomique ou d’ARN. La limite dans la détection des virus ne dépend pas de la méthode d’extraction utilisée mais de la sensibilité de l’amplification utilisée. Les rendements obtenus sont comparables à ceux du QIACube, qui utilise des colonnes de silice. Mais en plus nous avons particulièrement apprécié le gain de temps grâce au Maxwell® 16 et sa simplicité d’utilisation. F. P., Pilar Pérez-Breña Inmaculada Casas - Centro Nacional de Microbiología. Instituto de Salud Carlos III - Madrid Publications 1. Association of polymorphism in FcGR3A gene and progression of low-grade precursor lesions of cervical carcinoma - P. Conesa-Zamora, V. Santaclara, E. Gadea-Niñoles, S. Ortiz-Reina and M. Perez-Guillermo. 2. Genotype distribution of human papillomavirus (HPV) and co-infections in cervical cytologic specimens from two outpatient gynecological clinics in a region of southeast Spain - Pablo Conesa-Zamora, Sebastián Ortiz-Reina, Joaquín Moya-Biosca, Asunción Doménech-Peris, Francisco Javier Orantes-Casado, Miguel Pérez-Guillermo and Marcos Egea-Cortines. 11 Kit d'extraction automatisée avec le Maxwell® 16 Volume d’élution Type d'acide nucléique Type d'échantillon Prise d’essai Kit Maxwell® 16 Elution dans 300 à 600 µL Cartouches SEV ADN Sang Buffy coat 400 µl de sang frais 500 µl de buffy coat Maxwell® 16 Blood DNA Purification Kit AS1015 (CE-IVD) AS1010 Tissus 20 à 50 mg Maxwell® 16 Tissue DNA Purification Kit AS1030 Cellules 5 millions cell. Maxwell ® 16 Cell DNA Purification Kit AS1020 DNA IQ™ Reference Sample Kit for Maxwell® 16 AS1040 Traces Elution dans 50 à 100 µL Cartouches LEV ADN Sang total Fluides biologiques 400 µl Maxwell® 16 LEV Blood DNA Kit AS1290 Ecouvillons buccaux 1 ou 2 Maxwell® 16 Buccal Swab LEV DNA Purification Kit AS1295 Tissus paraffinés 10 x 5 µ Maxwell ® 16 FFPE Plus LEV DNA Purification Kit AS1135 Cellules <10000 cell. Maxwell ® 16 Cell LEV DNA Purification Kit AS1140 DNA IQ ™ Casework Pro Kit AS1240 Traces ARN ADN + ARN viral Référence catalogue Sang total (EDTA et Paxgene) 2,5 mL de sang frais Maxwell® 16 LEV simplyRNA Blood Kit AS1310 Tissus 20 mg Maxwell® 16 LEV simplyRNA Tissue Kit AS1280 Cellules 5 millions cell. Maxwell ® 16 LEV simplyRNA Cells Kit AS1270 Plasma Sérum Fluides biologiques 300 µl Maxwell® 16 Viral Total Nucleic Acid Purification kit AS1155 (CE-IVD) AS1150 Maintenance Préventive Maintenance Préventive Annuelle Vérification de l’appareil et réalisation des tests standards Contactez votre délégué commercial pour en savoir plus sur les autres contrats et services après-vente disponibles 12 SA1310 Extraction manuelle Type d'acide nucléique Type d'échantillon Solution Promega Rendements (µg) Méthode d'extraction ADN Sang, tissu, cellules, bactéries, levures, champignons Wizard ® Genomic DNA Purification Variable selon les échantillons Solution saline ARN Conditionnement Cat.# 100 extractions / 300 µl de sang A1120 500 extractions / 300 µl de sang A1125 100 extractions / 10 ml de sang A1620 Tissu Cellules Wizard® SV Genomic DNA Purification System 30 Membrane 50 preps 250 preps A2360 A2361 Tissu Cellules Wizard ® SV 96 Genomic DNA Purification System 30 Membrane 1 x 96 preps 4 x 96 preps A2370 A2371 Tissu FFPE MagneSil® Genomic, Fixed Tissue System 400 ng Billes magnétiques 100 preps MD1490 Sang Reliaprep™ Blood gDNA Miniprep System 4-10 µg Membrane 10 preps 100 preps 250 preps A5080 A5081 A5082 Tissu ReliaPrep™ gDNA Tissue Miniprep System 4-10 µg Membrane 100 preps 250 preps A2051 A2052 Tissu paraffinés FFPE ReliaPrep ™ FFPE gDNA Miniprep System 4-10 µg 10 réactions 100 réactions A2351 A2352 Sang, tissus animal ou végétal, bactéries SV Total RNA Isolation System Variable selon les échantillons Membrane 10 preps 50 preps 250 preps Z3101 Z3100 Z3105 Cellules ReliaPrep™ RNA Cell Miniprep System Variable selon les échantillons Membrane 10 preps 50 preps 250 preps Z6010 Z6011 Z6012 Tissu paraffinés FFPE ReliaPrep ™ FFPE Total RNA Miniprep System Variable selon les échantillons Membrane 10 réactions 100 réactions Z1001 Z1002 Tissu ReliaPrep ™ RNA Tissue Miniprep System Variable selon les échantillons Membrane 10 preps 50 preps 250 preps Z6110 Z6111 Z6112 13 NOUVEAU NOUVEAU HSM 2.0 Instrument (Kit associé : ReliaPrep™ Large Volume HT gDNA System) Extraction automatisée d’ADN à partir de grands Intégré dans la plateforme de pipetage Freedom EVO 100 pour une extraction ADN entièrement automatisée A2715 - Research Use Only - 14 volumes de sang (2 à 10 ml) Concentration (ng/ul) 250 150 100 50 0 INPUT Tubes primaires de sang Moyenne A260/A280 = 1,86 200 2 2,5 PROCESS Extraction ADNg (de 2 à 10 ml) • Jusqu’à 32 échantillons (2 à 10 ml) • Sang total (frais ou congelé), buffy coat, salive • Identification des tubes primaires par lecture de code-barre (système PosID) •H SM 2.0 (agitation, chauffage et aimantation) couplé au robot pipeteur Tecan • Technologie d’extraction en billes magnétiques (ReliaPrep™ LV HT purification system) • P as de déplacement d’échantillons pendant l’extraction 3 3,5 4 4,5 5 5,5 Volume de sang (ml) 6 6,5 OUTPUT Obtention d’ADN pur • Coûts en réactifs et consommables maitrisés • P rêt pour des applications type PCR, long PCR, séquençage, CGH Array, HRM… • Prêt pour être archivé dans une biobanque • Rendement # 300 µg pour 10 ml • Traçabilité totale des échantillons (du tube primaire à l’ADN extrait) • 32 échantillons extraits en # 3,5h Kits d'extraction automatisés Type d'acide nucléique Type d'échantillon Solution Promega Rendements (µg) Temps moyen (minutes) Conditionnement Cat.# ADN Sang total, buffy coat, salive ReliaPrep™ Large Volume HT gDNA Isolation System # 300 μg pour 10 ml 32 échantillons extraits en # 3,5h 96 × 10 ml preps A2751 15 Quantification fine et précise d'ADN et d'ARN Promega offre une solution complète (réactif et lecteur) de dosage de l’ADN ou de l’ARN en fluorescence. Les nouveaux systèmes Quantifluor permettent ainsi de mesurer de façon simple et rapide de petites quantités avec une linéarité et une sensibilité optimale. PLus 10 fois Sensible optimisé pour les que le Qubit 2.0 fluorometer Aucun accessoire marqueurs fluorescents QuantiFluor simple & fourni avec le intuitif Quantus Software Calibration unique pour le traitement des données Produit (Instrument & réactifs) Conditionnement Réf. Instrument E6150 QuantiFluor dsDNA System 1 ml E2670 QuantiFluor ssDNA System 1 ml E3190 QuantiFluor RNA System 1 ml E3310 Quantus™ Fluorometer ™ ™ ™ En savoir plus - Research Use Only - 17 Instrument Quantus Fluorometer Quantification d’acides nucléiques Haute sensibilité Combinés au Quantus ™, les marqueurs fluorescents Quantifluor ™ permettent d’obtenir une sensibilité supérieure à l’absorbance pour les échantillons : • précieux ou difficiles Limites de détection • pauvres en acides nucléiques • de mesurer précisément vos acides nucléiques • d e garantir le succès de vos applications telles que la qPCR ou le séquençage haut débit QuantiFluor® ST Fluorometer 200 pg/ml FOIS 10 PLUS Sensible Qubit® 2.0 Fluorometer 500 pg/ml 40 000 FOIS PLUS • d e distinguer les molécules d’intérêt (ADN simple ou double brin, ARN) au sein d’échantillons complexes Compatible avec tous types de fluorophores Sensible 10−2 10−1 100 101 102 dsDNA (ng/ml) Spécifications Taille 22,7 x 11,5 x 4,5 cm Poids 400 grammes Gamme dynamique linéaire 5 logs (dépend du type de mesure) Détecteur Capteur de silicium solide Filtres d’excitation Filtres d’émission Rouge : 640 nm (shortpass) Bleu : 495 nm (shortpass) Rouge : 660-720 nm Bleu : 510-580 nm Type de calibration Point unique (blanc et standard) Format des tubes Tubes PCR de 0,5 ml (Axygen - Référence PCR-05-C) Arrêt automatique Après une heure d’inactivité Compatibilité électrique 5V - 0,2A maximum Configuration nécessaire (pour le Quantus® Software en option) Garantie Windows® XP, Windows® 7 (32 ou 64 bit) .NET Framework 4.0 ou supérieur 1 port USB libre 1 an - Research Use Only - 18 103 NanoDrop® 2000 Fluorometer 2 µg/ml 104 11574MC Haute spécificité La quantification par fluorescence permet : Quantus™ Fluorometer 50 pg/ml • très dilués Réactifs QuantiFluor™ dsDNA System Comparing QuantiFluor dsDNA against PicoGreen 1000000 100000 10000 •H aute spécificité : se lie spécifiquement à l'ADN double brin RFU 1000 •S ensibilité augmentée : beaucoup plus sensible que la mesure de l’absorbance à 260 nm pour les échantillons faiblement concentrés. Une détection supérieure ou équivalente au PicoGreen avec une limite à 50 pg/ml PicoGreen 100 QuantiFluor DNA 10 9587MA 1 0.1 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000 10000 100000 Calf Thymus DNA [ng/mL] QuantiFluor™ RNA System RNA Detection Range UV abs (NanoDorp) •S ensibilité augmentée : une sensibilité qui augmente significativement par rapport au Nanodrop sur de faibles concentrations d'échantillons QuantiFluor™ RNA } High Concentration Range Competitor P •P lus économique : moins de template d'ARN requis comparé à la spectrophotométrie QuantiFluor™ RNA Competitor P } Low Concentration Range 10 -3 10 -2 10 -1 10 0 10 1 10 10556MA Competitor Q 2 10 3 10 4 RNA Concentration (ng/µ) • Facile à mettre en place : un système qui inclus tous les réactifs nécessaires à la préparation et la quantification d'ARN •B on ratio coût/efficacité : des prix compétitifs pour tenir compte des contraintes budgétaires des utilisateurs - Research Use Only - 19 Analyse moléculaire Promega a développé une expertise de pointe dans le domaine de l’analyse moléculaire et plus spécifiquement dans les techniques d’analyses de fragments STRs par électrophorèse capillaire, permettant d’identifier des mutations à l’origine de certaines pathologies. Leader du marché en identité génétique, Promega développe de nouveaux kits d’analyse STR, ouvrant de nouvelles perspectives pour les laboratoires hospitaliers de génétique, de cytogénétique et d’immunologie (transplantation de moelle). Y Chromosome Analysis System La prévalence des troubles de la fertilité masculine est estimée à 10% de la population générale. Ces troubles sont définis par un déficit quantitatif et/ou fonctionnel des spermatozoïdes et peuvent être liés à des anomalies chromosomiques comme des micro délétions du chromosome Y. L'identification de ces troubles majeurs de la fertilité liés à ces microdélétions est possible grâce au kit de détection Promega Y Chromosome Analysis System suivant les recommandations de la EAA / European Molecular Genetic Quality Network. Bénéfices • F acile à utiliser : un Master Mix multiplex avec 20 paires de primers, dont un contrôle interne garantissant un panel standardisé de résultats • A nalyse "State-of-the-Art" : le kit est marqué CE IVD et les paires de primers sont en accord avec les recommandations EMQN et incluent l'amplification SRY • R obuste : utilisation de la GoTaq ® DNA Polymérase qui minimise les pics B A M 1 2 M 3 C 4 M 5 • F lexible : amplifie l'ADN génomique purifié en utilisant des méthodes variées et avec un thermocycleur PE480 (oil overlay) ou PE9600/9700 (non-oil overlay) Applications • Infertilité masculine • Procréation médicalement assistée (FIV, ICSI) •D étection de régions spécifiques du chromosome Y humain D 6 M 7 E 8 M 9 10 M 500 – 400 – 300 – – 500 – 400 – 300 200 – – 200 100 – – 100 – 50 50 – 4322TA09_3A bp Analyse en multiplex d'ADN génomique mâle. Puits : 1, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex A avec l'ADN mâle ; 2, réaction contrôle sans ADN ; 3, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex B avec l'ADN mâle ; 4, réaction contrôle sans ADN ; 5, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex C avec l'ADN mâle ; 6, réaction contrôle sans ADN ; 7, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex D avec l'ADN mâle ; 8, réaction contrôle sans ADN ; 9, produits de réactions d'amplification utilisant le Master Mix Multiplex E avec l'ADN mâle ; Puit M : 50bp DNA. Step Ladder (Cat.# G4521). Les réactions ont été réalisées sur thermocycleur et séparées sur gel 4% NuSieve ® 3:1 Plus TBE Buffer Reliant ® gel. Produit Nous avons choisi le kit Promega pour sa facilité d'utilisation, le fait qu’il soit prêt à l'emploi permettant une validation simple de notre méthode avec un Kit CE IVD puisque nous sommes actuellement en démarche d'accréditation selon la norme EN NF ISO 15189, et enfin la réponse qu’il apporte à une demande expresse de nos correspondants qui souhaitent faire bénéficier à leurs clients du test le plus complet du marché avec une cartographie détaillée de la région AZF Laboratoire Alpigene - Lyon Conditionnement Réf. Y Chromosome Deletion Detection System, Version 2.0 25 réactions MD1531 Y Chromosome AZF Analysis System (CE IVD) 25 réactions MD1631 - Research Use Only - - Research Use Only - 21 Microsatellite Instability (MSI) Analysis System Permet de mesurer l’instabilité des microsatellites (MSI) qui se caractérise par la variation anormale du nombre de séquences répétées dans l'ADN tumoral comparé à l'ADN du même patient provenant de tissus sains. Bénéfices •O btention du phénotype complet MSI : une simple multiplex PCR amplifie 5 marqueurs mono nucléotidiques pour le génotypage du statut MSI-H • T raçabilité de l’échantillon : la co-amplification de séquences répétées pentanucléotidiques hautement polymorphiques permet un suivi des échantillons • S uit les recommandations : 2003 NCI Workshop, Bethesda Applications •D ans le cadre de la recherche de prédispositions héréditaires au cancer colorectal (HNPCC, Syndrome de Lynch), les instances internationales recommandent la recherche d'instabilité de microsatellites (MSI) dans l'ADN tumoral du patient. Ce précriblage somatique permet d'orienter le clinicien vers l'étude constitutionnelle des gènes MMR, facilitant le diagnostic précoce et la prise en charge du patient Purification ADN Dosage ADN Amplification ADN Electrophorese Capillaire Analyse des profils Maxwell ® 16 FFPE Plus ReliaPrep ™ FFPE gDNA Quantifluor dsDNA Dye MSI Analysis system v1.2 Spectrale dédiée (ABI 3100/3130/3500) Panel et bins téléchargeables pour GeneMapper 4.0 - Research Use Only - 22 NR-21 BAT-26 BAT-25 NR-24 MONO-27 Penta D 4639TA Penta C Instabilité des Microsatellites mise en avant grâce au kit MSI Analysis System. Lecture sur électrophorégramme. Une comparaison entre des échantillons témoins (en haut) et des échantillons avec une tumeur du colon MSI positive (en bas) en utilisant le kit MSI Analysis System. Deux nanogrames d'ADN génomique ont été amplifiés et analysés avec l'analyseur ABI PRISM® 3100, et les modèles alléliques des différents échantillons représentés graphiquement. La présence de nouveaux allèles au niveau des échantillons tumoraux (cf. les flèches) absents dans l'échantillon témoin indique une instabilité des microsatellites. Ce kit est dérivé de marqueurs déterminés par notre groupe, l’UMRS INSERM 938, et amplifiant dans une réaction de PCR pentaplex (Suraweera et al., Gastroenterology, 123(2002)1804). Il permet de déterminer le statut MSI des tumeurs héréditaires et sporadiques quels que soient leur défaut moléculaire et leur localisation tumorale. Dans la majorité des cas, il n’est pas indispensable d’analyser de manière comparative les ADN normaux des patients (Buhard et al., J. Clin. Oncol., 24(2006)241). Cette comparaison est cependant conseillée pour les tumeurs présentant un défaut du gène MSH6 et/ou provenant de l’endomètre (Wong et al., Carcinogenesis, 27(2006)951). R. H., DR1 INSERM - Equipe Microsatellites et Cancers Mononucleolides Pentanucleolides BAT-25 Penta C BAT-26 Penta D Produit MSI Analysis System, Version 1.2 MONO-27 NR-21 NR-24 - Research Use Only - 23 Conditionnement Réf. 100 réactions (50 paires réactions) MD1641 Kits d’analyse STRs Un outil puissant pour l’identification de cellules humaines et la caractérisation de mélanges d’ADN. Promega STR kit Avantages Pouvoir discriminant PowerPlex 16 HS System Multiplex, validé sur de nombreux cycleurs et analyseurs 3.10 -19 PowerPlex® Fusion System Analyse multiplex sur 24 locis discriminants, 5 dye fluorencents Amplification directe sur papiers FTA, non FTA et écouvillons Très sensible. Obtention d'un profil ADN à partir de 100 pg de template d'ADN 6.58 * 10 -29 PowerPlex® 18D System Multiplex, optimisé pour l’amplification directe sur carte FTA 4.10 -22 PowerPlex® 21 System Multiplex, excellent pouvoir discriminant, résistance accrue aux inhibiteurs et compatible avec l’amplification directe (FTA) 7.10-27 PowerPlex® CS7 System Multiplex sur 7 loci discriminants, économique NC PowerPlex® Y23 System Nombre de loci supérieur aux autres kits sur le marché - Le plus sensible Amplification rapide (90min) - Compatible avec amplification directe - Analyse locus par locus - - Research Use Only - ® MonoPlex System PowerPlex® 16 HS Systems Bénéfices • S ensible : obtention de résultats reproductibles à partir de 0,1ng d'ADN • D iscriminant : système avec 16 loci (D18S51, D21S11, TH01, D3S1358, Penta E, FGA, TPOX, D8S1179, vWA, Amelogenine, CSF1PO, D16S539, D7S820, D13S317, D5S818 et Penta D). Indice de paternité de 1,520,000 • F lexible : convient à l'utilisation d'une large variété d'analyseurs génétiques d’Applied Biosystems • C omplet : le kit contient un standard de poids moléculaire et une échelle allélique Applications • • • • • • • A nalyse ADN médecine légale Test de paternité Test d’identité humaine Identification sur des cultures de cellules souches C ontamination cellulaire maternelle E tude de zygotie des jumeaux D étermination du sexe fœtal à un stade précoce D3 THO1 D5 A 60 100 D21 D13 D7 vWA D8 D18 D16 TMR CSF1PO TPOX 200 Penta E Penta D FGA 300 Fluorescein - Research Use Only - 24 400 JOE 500 Exemple d’utilisation des STRs en pratique clinique Analyse STRs et cytogénétique Fœtus Père Mère Nous utilisons le kit PowerPlex 16 en routine pour la recherche de contamination du matériel fœtal (villosités trophoblastiques et liquide amniotique) non cultivé par des cellules maternelles lors du prélèvement. Le profil obtenu à partir du prélèvement est systématiquement comparé à celui de la mère et, si possible à celui du père. Nous avons déterminé expérimentalement un seuil de sensibilité de 0,5 % de contamination en mélangeant les ADN d’une fille et de sa mère à des concentrations différentes (de 10 à 0,01 %). Le marqueur présenté sur l’exemple montre une contamination du tissu fœtal par des cellules maternelles (trois allèles chez le fœtus dont les deux de la mère). Ce prélèvement n’a pu être analysé et l’éventualité de refaire un prélèvement a été discutée avec la famille et le gynécologue préleveur. Dr F. P., pôle biologie-pathologie-pharmacie-santé publique, GH Paris Sud Produit Conditionnement Réf. PowerPlex® 16 HS System 100 réactions 400 réactions DC2101 DC2100 PowerPlex ® Fusion System 200 réactions 800 réactions DC2402 DC2408 PowerPlex ® 18D System 200 réactions DC1802 PowerPlex 21 System 200 réactions DC8902 PowerPlex CS7 System 100 réactions DC6613 PowerPlex Y23 System 50 réactions DC2305 PowerPlex Y23 System 200 réactions DC2320 - Research Use Only - ® ® ® ® - Research Use Only - 25 Epigénétique L’épigénétique est la science relative aux changements de phénotype biologique sans changement fondamental du génome de l’organisme. Orchestrés par des enzymes qui modulent la structure de la chromatine, les changements épigénétiques influent sur les modifications post-traductionnelles et donc sur les profils d’expression génique et leur répression. La compréhension des processus globaux de la régulation des gènes permet d’améliorer la compréhension de la biologie du développement et cellulaire. Cette approche fournit des pistes d’identification de nouveaux agents thérapeutiques contre diverses maladies humaines telles que les cancers. La Méthylation de l’ADN est l’un des processus à l’origine des changements épigénétiques. Heritage parental ou réponse à un facteur environnemental, ce mécanisme influence directement le niveau d’expression des gènes et peut être la cause de pathologies. Promega propose des solutions pour l’étude de ces processus et leurs analyses. MethylEdge™ Bisulfite Conversion System Le Methyledge Bisulfite Conversion System est une méthode rapide et efficace pour réaliser la conversion au bisulfite et évaluer le niveau de méthylation de l'ADN. Ce kit permet une conversion de l’ADN en 2h tout en conservant son intégrité. L’ ADN converti est ainsi directement utilisable pour différentes applications nécessitant une haute sensibilité. Le système permet de travailler à partir de petites quantités d’ADN genomique (100 pg - 2 µg) et le système garantit une conversion supérieure à 90% avec une fragmentation minime. Le kit permet de réaliser 50 réactions de conversion au bisulfite et inclut les contrôles ADN pour la validation pré et post conversion. Bénéfices • Haute efficacité de conversion de l’ADN • Conversion rapide en moins de 2h D1 D1 P1 P1 Z1 Z1 N1 N1 D2 D2 P2 P2 Z2 Z2 N2 N2 Protocole rapide B B Input Genomic DNA (100pg - 2µg) 8 Min 60 Min Incubate Incubate Bisulfite Conversion Reduced DNA Fragmentation Degree of DNA fragmentation after conversion. DNA was purified from whole blood using the ReliaPrep™ Blood gDNA Miniprep System (1) or Maxwell® 16 LEV Blood Kit (2) and was converted using the Promega MethylEdge™ Bisulfite Conversion System (P) or a competing bisulfite conversion kit (Z or N). B = BenchTop 1kb DNA Ladder, D = nonconverted, purified DNA. Elute In-column Desulfonation Schematic diagram of the MethylEdge™ Bisulfite Conversion System protocol. Convert DNA samples efficiently in less than 2 hours with minimal preprocessing steps. 11325TA 11325TA Denature DNA ~24 Min 11407MA B B • Fragmentation minime : obtention d’ADN intact • C onservation pratique à température ambiante réduisant les manipulations de préparation Produit Conditionnement MethylEdge Bisulfite Conversion System Réf. 50 réactions N1301 Methylated Human Control DNA 5 μg N1231 Converted Methylated Human Control DNA 1 μg N1221 ™ Methylation Specific Restriction Enzymes Conditionnement Réf. 1000 u 5000 u R6311 R6315 MboI 200 u R6711 MspI 2000 u 10 000 u 10 000 u R6401 R6405 R4404 100 u 500 u R6191 R6195 HpaII MspI (HC) Sau3AI En savoir plus sur la méthylation En savoir plus sur l'épigénétique - Research Use Only - 27 Amplification : précision, rendement, sensibilité Promega a développé des solutions innovantes et ciblées pour répondre aux besoins précis requis par les méthodes de PCR actuelles. Tous les réactifs Promega pour la PCR ont été testés minutieusement pour y assurer l’obtention de résultats optimaux. Ces réactifs sont largement utilisés en laboratoire dans le domaine de la recherche et ont démontré toute leur efficacité. Ces produits sont notamment utilisés dans les tests d’identité génétique et de contrôle qualité en industrie. PCR avec les Taq Promega Des résultats compétitifs et reproductibles dans le temps, sans aucune variation d'un lot à l'autre GoTaq® G2 Hot Start Polymerase et ses Master Mixes Formulés avec la nouvelle Taq deuxième génération, pour une utilisation facile à température ambiante. Les nouveaux “Master Mixes” sont sensibles, et résistants aux inhibiteurs de PCR. • S implification des réactions de mise au point et gain de temps avec un master mix prêt à l’emploi • Préparation des réactions à température ambiante • Absence d'amplifications non spécifiques grâce à la technologie de l’enzyme Hot Start GoTaq® G2 Hot Polymerase produces excellent specificity and higher yield with difficult targets. The 1.5kb fragment of the Corynephage omega gene, a hot-start model of specificity, was amplified from 500ng of plasmid DNA using GoTaq® G2 Hot Start Polymerase with Green (G) and Colorless (C) Buffers and the competitors (R, Q, L1, L2, L3). • P erformance PCR Satisfaction Garantie pour une utilisation sans risque Les premiers essais avec la GoTaq G2 Hot Start Green Master Mix sont très satisfaisants. Nous n'observons à ce jour aucune différence notable avec la première génération. De plus, le colorant simplifie grandement les manipulations et n'interfère pas avec les séquences. Mme A.P Ingénieur Plateau de Biologie Moléculaire - CHU de Nîmes Gels d’agarose de fragments d’ADN de différents gènes amplifiés avec le MasterMix GoTaq® G2 Hot Start Analyse de séquence ADN amplifiée avec le MasterMix GoTaq® G2 Hot Start - Research Use Only - 29 GoTaq® Long PCR Master Mix Obtenir une bonne élongation et une amplification fidèle de longs fragments d’ADN est une condition importante pour réussir clonages, mutagenèses dirigées ou séquençage ADN. La Gotaq ® Long PCR Master Mix répond à cette exigence. • P erformante sur de longs amplicons U ne amplification optimisée sur de longs amplicons d’ADNg jusqu’à 30kb (40kb sur de l’ADN lambda) • S pécificité et sensibilité supérieures L e mix contient la Gotaq ® Hot Start Polymérase et une polymerase thermostable à activité « proofreading » dont l’efficace activité correctrice permet une haute processivité • Simple à utiliser P réparation à température ambiante • Confiance assurée C omprend des dimères de primers et un template d’ADNg Diagnostic de l’Incontinentia Pigmenti, maladie dominante lié à l’X, en recherchant la délétion récurrente de l’exon 4 à l’exon 10 du gène NEMO (IKBKG) Bande 14 KB (tout NEMO) Le kit GoTaq® Long PCR Master Mix de Promega est très facile d’utilisation du fait de la présentation en mix prêt à l’emploi. En suivant exactement le protocole de PCR proposé, nous avons réussi à amplifier sans problème un fragment d’intérêt de 14 Kb jusqu’alors jamais amplifié. Nous avons aussi obtenu des résultats de très bonne qualité en travaillant sur de l’ADN mitochondrial. Dr B. T. Plateau Technique de Biologie Moléculaire - CHU Bordeaux Hôpital Pellegrin Bande parasite variable non spé 2.5 KB Délétion 4-10 1.8 KB LR non spé : 1 : délété 2 : échec 3 : délété 4: normal LR spé NEMO : 1 : délété gène NEMO 2 : normal 3 : délété 4 : normal Bande parasite 2.4 KB Dél 4-10 2.6 KB - Research Use Only - 30 Les GoTaq® G2 DNA Polymérases disponibles à l'unité Application Produit PCR GoTaq ® G2 Hot Start Polymerase Caractéristiques Cdt. Réf. • Tampon de charge coloré pour un dépôt direct sur gel • Concentration en MgCl2 ajustable 100 u 500 u 2 500 u (5 x 500 u) 10 000 u M7401 M7405 M7406 M7408 GoTaq ® G2 DNA Polymerase • Tampon de charge coloré pour un dépôt direct sur gel • Concentration en MgCl2 1,5mM 100 u 500 u 2 500 u (5 x 500 u) M7841 M7845 M7848 GoTaq® G2 Flexi DNA Polymerase • Tampon de charge coloré pour un dépôt direct sur gel • Concentration en MgCl2 ajustable 100 u 500 u 2 500 u (5 x 500 u) 10 000 u (20 x 500 u) M7801 M7805 M7806 M7808 Cdt. Réf. • M élange prêt à l'emploi, incluant un tampon vert pour le dépôt sur gel 100 réactions 1000 réactions MXXXX MXXXX GoTaq ® G2 Colorless Master Mix (bientôt disponible) • M élange prêt à l'emploi, tampon incolore 100 réactions 1000 réactions MXXXX MXXXX GoTaq ® G2 Hot Start Green Master Mix • Mélange prêt à l'emploi avec la GoTaq ® Hot Start Polymérase • Tampon coloré pour dépôt direct sur gel 100 réactions 1 000 réactions M7422 M7423 GoTaq ® G2 Hot Start Colorless Master Mix • Mélange prêt à l'emploi avec la GoTaq ® Hot Start Polymérase • Tampon incolore 100 réactions 1 000 réactions M7432 M7433 100 réactions M4021 200 μl 1000 μl U1511 U1515 4 x 40 µM 10 µM 4 x 200 µM 4 x 25 µM U1240 U1330 U1410 U1420 Les GoTaq® G2 DNA Polymérases disponibles en coffrets Gagnez du temps et diminuez le risque d’erreur en limitant le nombre de manipulations ! Application Produit Coffrets PCR Master Mix GoTaq® G2 Green Master Mix (bientôt disponible) Coffrets PCR GoTaq ® Long PCR Master Mix dNTPs dNTP Mix Set of dATP, dCTP, dGTP, dTTP Set of 4 dNTP's, 100mM Caractéristiques • Mélange prêt à l'emploi pour l'amplification de fragments PCR >10kb • Contient la Hot Start polymérase plus une polymérase thermostable à l'activité correctrice • Haut degré de pureté (>98%), solution prémélangée contenant des dATP, dCTP, dGTP, et dTTP à 10mM • Haut degré de pureté (>98%). Nos dNTPs sont également disponibles séparément, et sous forme de mix PCR Nucleotide Mix Une solution contenant chaque dNTP (dATP, dTTP, dGTP, dCTP) à 10 mM. Il est recommandé d’utiliser 200 µM de chaque dNTP pour une réaction PCR de 50 μl. Produit Conditionnement Réf. PCR Nucleotide Mix, 200 μl 200 rx C1141 PCR Nucleotide Mix, 1000 μl 1000 rx C1145 - Research Use Only - 31 Reverse Transcriptase Sensible, efficace et compétitive ! GoScript • • • • 512 E ™ U ltra-active : des économies sur chaque réaction S ensible : détection des transcrits d'ARN rares P rocessive : transcription de longs ARN messagers R ésistante : synthétisez des ADNc en présence d'inhibiteurs forts 290 E 267 E Enzyme X ou Y (50 réactions) 255 E GoScript RT (100 réactions) Système complet X (50 réactions) GoScript System (50 réactions) Comparaison tarifaire No RT Application Produit RT, RT PCR, RT qPCR GoScript™ Reverse Transcriptase GoScript ™ Reverse Transcription System O R O R Enzyme X O R Enzyme Y O R Enzyme Z O GoScript ™ R O R 8672TA Les ARN Totaux humains ont été transcrits en utilisant des oligo(dT) (O) ou random primers® selon les recommandations du fabriquant. Le cDNA a été ensuite analysé par PCR en utilisant la Gotaq (Cat.# M7122) avec des amorces pour un amplicon de 940bp à l'extrémité 5’ du transcript APC de 8.9kb. Les Gels représentent les résultats de 3 expériences distinctes. No RT : réaction de contrôle sans reverse-transcriptase. Enzyme W Caractéristiques Cdt. Réf. • GoScript Reverse Transcriptase • Tampon réactionnel 5X, 25 mM MgCl2 100 réactions 500 réactions A5003 A5004 • Oligo(dT)15primer, Random Primers, dNTPs Mix, RNAsin® • MgCl2, GoScript Reverse Transcriptase 50 réactions 100 réactions A5000 A5001 Autres Reverse Transcriptases Application Produit Caractéristiques Cdt. Réf. One-step RT-PCR (Haute Sensibilité) Access RT-PCR System •R éaction de RT PCR en une seule étape • Utilisé pour des ARNs rares ou des templates avec des structures secondaires importantes • Contrôle maximum : chaque composant est en tube séparé 20 réactions 100 réactions A1260 A1250 500 réactions A1280 • Réaction de RT PCR en une seule étape • Utilisé pour des ARNs rares ou des templates avec des structures secondaires importantes • Prêt à l'emploi 20 réactions 100 réactions A1701 A1702 500 réactions A1703 • Polymérase RNA-dependante utilisée pour des templates d'ARN messager de grande taille (>5 kb) 10 000u 50 000u M1701 M1705 AccessQuick™ RT-PCR System Reverse Transcription (synthèse d'un simple brin d'ADNc) M-MLV Reverse Transcriptase Set de dUTP, dATP, dCTP et dGTP Produit Concentration Conditionnement Réf. Set de dUTP, dATP, dCTP et dGTP 10 µmol chacune 1000 rx U1335 Set de dUTP, dATP, dCTP et dGTP 40 µmol chacune 4000 rx U1245 Sélectionnez la Reverse Transcriptase pour votre application - Research Use Only - 32 PCR en temps réel avec le Mix qPCR Des résultats fiables et reproductibles à des prix compétitifs ! GoTaq® qPCR Master Mix avec BRYT Green® Dye •P lus grande intensité du signal Identification précoce des Ct, détection de faibles quantités d’ADN de départ • P lus haute sensibilité D étection précise des cibles contenues dans un même échantillon • S pécificité et stabilité garantie P erformance de la GoTaq ® Hot Start Polymérase qui empêche la formation de dimères d’amorces, fiabilité du kit •C onfiance assurée D es résultats et une facilité d’utilisation identiques au SYBR ® Green I, compatibilité avec l’ensemble des thermocycleurs utilisés pour le SYBR ® Green I, une performance Promega PCR Garantie A. B. C. Courbes de fusion (A et B) et d’amplification (C) obtenues avec le kit GoTaq® qPCR Master Mix, l’automate LightCycler 2.0 et un programme d’amplification-fusion en temps réel du gène rrs (ADNr 16S). Cette qPCR a été réalisée pour la détection d’ADN bactérien dans des prélèvements cliniques (prélèvements osseux dans cet exemple). Les courbes A et B montrent l’excellente répétabilité des points de fusion déterminés pour la bactérie mise en évidence dans tous les prélèvements testés (Staphylococcus epidermidis). La courbe C montre l’excellente sensibilité (ADN bactérien non mis en évidence par PCR en point final) et spécificité (témoin négatif : pas de signal) de détection de l’ADN cible bactérien. Unité de Bactériologie - Pôle de Biologie-Pathologie - CHRU - Hôpital Cavale Blanche - Brest Application Produit Caractéristiques Cdt. Réf. qPCR GoTaq ® qPCR Master Mix • 2X GoTaq® Master Mix avec GoTaq® Hot Start, CRX inclus 200 réactions (1 x 5 ml) 1 000 réactions (25 x 1 ml) A6001 A6002 RT qPCR GoTaq ® 2-Step RT-qPCR System •C ombine la GoScript ultra-actif pour synthétiser l’ADNc, avec la fluorescence ultra-brillante de GoTaq® qPCR Master Mix afin de fournir une quantification optimisée et sensible d’ARN complets RT-qPCR & qPCR plus sensibles et résultats optimisés 50 réactions RT + 200 réactions qPCR A6010 GoTaq ® 1-Step RT-qPCR System • E laboré pour l’analyse quantitative de l’ARN en utilisant un protocole en une étape dans un seul tube Combine le BRYT Green ® Dye et le tampon RT optimisé pour améliorer l’exactitude et la sensibilité des données 200 réactions A6020 - Research Use Only - 33 PCR en temps réel avec la qPCR Probe Des nouveaux masters mixes sensibles et résistants aux inhibiteurs de PCR GoTaq® Probe qPCR Master Mix Ces masters mix 2X, prêts à l’emploi permettent de simplifier la préparation des réactions qPCR basées sur la technologie de sonde fluorescente. Trois kits sont actuellement disponibles : qPCR, 1-Step RT-qPCR et 2-Step RT-qPCR. Ces mix ont été conçus et optimisés pour la détection et la quantification de séquences spécifiques, l’analyse de l’expression de gènes et la détection de variations de séquence. L’activation rapide de la hot-start et la processivité des enzymes permettent une utilisation des Gotaq Probe Systems avec un large panel de thermocycleurs standards et “Fast Cycling”. • Excellente sensibilité • Résistant aux inhibiteurs • H aute stabilité : utilise une chimie hot Start bloquée par anticorps. Réactions de préparation possibles à température ambiante • A daptabilité : compatible avec des programmes de qPCR standards et "fastcycling”. Adapté à tous les thermocycleurs • S imple d'utilisation : ajoutez seulement vos échantillons, sondes et amorces. Le mix ne contient pas directement de fluorophore de référence. Un tube séparé de carboxy-Xrhodamine (CXR) est inclus dans le kit permettant de l’ajouter aux réactions d’amplification en fonction de l’instrument Les résultats obtenus avec le kit GoTaq Probes qPCR Master Mix sont satisfaisants et comparables à notre kit habituel. Les efficacités obtenues pour les 2 systèmes de qPCR testés sont très proches et les courbes d’amplification ont une allure normale. Nous avons fait quelques tests en double, ce qui explique le peu de positifs en dehors des contrôles pour les programmes d’amplification, j’ai juste allongé les temps de dénaturation. Y.B - Ingenieur hospitalier Laboratoire de Bacteriologie - Bron Mix Takara Mix Promega Application Produit qPCR GoTaq ® Probe qPCR System RT qPCR GoTaq® Probe 2-step RT-qPCR System GoTaq® Probe 1-step RT-qPCR System Caractéristiques Cdt. Réf. 200 réactions 1000 réactions A6101 A6102 • S ystème composé du GoScript Reverse Transcription System & GoTaq® Probe qPCR master mix. Très robuste, synthétise de longs cDNA en présence d'inhibiteurs. Grande stabilité à température ambiante pour travailler en haut débit 200 réactions A6110 • S ystème 50X combinant de GoScript Reverse Transcriptase 200 réactions A6120 • A ctivation rapide de la hot-start, préparation facile à température ambiante, compatible avec un large panel de thermocylceurs standards et "Fast Cycling" et RNasin Plus Rnase Inhibitor. Incorpore la GoTaq® Probe qPCR Master Mix formulée avec du dUTP, pour permettre aux utilisateurs d'incorporer l'UNG pour un contrôle des possibles contaminations. Stable à température ambiante - Research Use Only - 34 Marqueurs ADN de poids moléculaire bp 5 μl/lane (250 μl - 50 lanes) G7511 BenchTop pGEM® DNA Markers 5 μl/lane (250 μl - 50 lanes) G7521 BenchTop 1 kb DNA Ladder BenchTop 100 bp DNA Ladder G7531 6 μl/lane (600 μl - 100 lanes) G7541 6 μl/lane (300 μl - 50 lanes) G8291 – 1,353 – 1,078 – 872 – 1,605 – 603 – – – – – 676 517 460 396 350 – – – – 222 179 126 75/65 [51,36] – – – – – – – – – – 2,645 – 1,198 310 281/271 234 194 – 118 – 72 3177TA12_0A BenchTop PCR Markers 6 μl/lane (300 μl - 50 lanes) bp 2% agarose 2% agarose BenchTop ΦX174 DNA/Hae III Markers Cat.# g 7511 BenchtTop pGEM® DNA Markers Cat.# g 7521 – 1,500 10,000 8,000 6,000 5,000 4,000 – – – – – – – 3,000 – 2,500 – 2,000 bp 1,000 900 800 700 600 500 – 400 – 1,000 – 750 – 1,500 – 300 – 500 – 1,000 – 200 – 300 – 750 – 150 – 500 – 50 2% agarose BenchTop PCR Markers Cat.# g 7531 – 100 – 250 253 0973TC03_5A BenchTop ΦX174 DNA / HaeIII Markers bp bp 1409TA03_6A Réf. 0094TA05_3A Conditionnement 3176TA12_0A Produit 0.7% agarose BenchTop 1kb DNA Ladder Cat.# g 7541 2% agarose BenchTop 100bp DNA Ladder Cat.# g 8291 Biochimie de laboratoire Diamond Nucleic Acid Dye Sensible et stable à température ambiante, ce fluorophore se lie à l’ADN simple et double brin ainsi qu’à l’ARN. Il peut ainsi être utilisé pour visualiser facilement par coloration les acides nucléiques sur gel, sans prélavage, ni décoloration préalable. Ce fluorophore est compatible avec les gels d’agarose natif et dénaturé ou polyacrylamide. De même il peut être lu par n’importe quel système de lecture de gels par imagerie. • S ensible : Détection de petites quantités d’acides nucléiques • Peu toxique : Alternative au Bromure d’Ethidium • S table 90 jours à température ambiante : Conservation facile et utilisation rapide • F lexible : Compatible avec une grande variété de gels et d’équipements d’imagerie (UV transillumination avec caméra Polaroid ou digitale, GE ImageQuant ou Bio-Rad Gel Doc systems) Produit Diamond Nucleic Acid Dye Conditionnement Réf. 500 μl H1181 Nuclease-Free Water Chaque lot est testé par notre process qualité et certifié sans activité Dnase et Rnase. Produit Nuclease-Free Water Conditionnement Réf. 50 ml (2x25 ml) 150 ml P1193 P1195 Consultez les solutions disponibles pour la biochimie et le laboratoire - Research Use Only - 35 Identification: Spectrométrie de masse L'analyse protéomique, appliquée aux pathologies humaines, a vu ces dernières années l'émergence de nouvelles techniques. Ces progrès significatifs ont montré l'importance de l'approche protéomique globale dans l'identification de marqueurs biologiques. Ces méthodes, en particulier en spectrométrie de masse, se sont montrées convaincantes pour suivre rapidement et précisément l'évolution de certaines pathologies, en particulier en cancérologie. La préparation des échantillons est une étape cruciale dans l’analyse protéomique des prélèvements biologiques. Promega offre des solutions qui permettent d’optimiser cette étape pré-analytique et qui conditionnent l’obtention de résultats fiables par spectrométrie de masse. 36 Trypsines pour l'identification des protéines Produit Trypsin Gold, Mass Spectrometry Grade Trypsin/Lys-C Mix, Mass Spec Grade Immobilized Trypsin Sequencing Grade Modified Trypsin Conditionnement Réf. 100 μg V5280 20 μg 100 μg 100 μg (5 × 20 µg) V5071 V5072 V5073 2 ml 4 ml (2 × 2 ml) V9012 V9013 100 μg (5 × 20 µg) 100 μg (1 × 100 µg) V5111 V5117 ProteaseMAX™ Surfactant, Trypsin Enhancer Améliore la performance enzymatique des digestions par les protéases en facilitant l'accès de celles-ci aux sites de coupure. Produit ProteaseMax Surfactant, Trypsin Enhancer ™ (a) Conditionnement Réf. 1 mg 5 x 1 mg V2071 V2072 Un panel de protéases pour un séquençage de qualité Des protéases spécifiques et non spécifiques permettent de générer de multiples peptides pour les analyses en spectrométrie de masse. Produit Conditionnement Réf. Thermolysin 25 mg V4001 Elastase 5 mg V1891 Pepsin Chymotrypsin, Sequencing Grade 250 mg V1959 25 μg 4 x 25 μg V1061 V1062 rLys-C, Mass Spec Grade 15 μg V1671 Glu-C, Sequencing Grade 50 μg ((5 × 10 µg) V1651 Asp-N, Sequencing Grade 2 μg V1621 Endoproteinase Lys-C, Sequencing Grade 5 μg V1071 Arg-C, Sequencing Grade 10 μg V1881 Glycosidases Détermination de la localisation et de la structure des glycons par spectrométrie de masse. Suivi du trafic des protéines. Produit Endo H Protein Deglycosylation Mix Conditionnement Réf. 10 000 unités 500 u/μl 50 000 unités 500 u/μl V4871 V4875 20 réactions V4931 Fetuin 500 μg 10 mg/ml V4961 PNGase F 500 unités 10 u/μl V4831 - Research Use Only - 37 Recherche translationnelle Véritable intermédiaire entre la recherche fondamentale et la recherche clinique, la recherche translationnelle permet de répondre à des besoins ciblés en biologie clinique. Promega, fort de son expérience reconnue en recherche fondamentale, est un véritable partenaire dans l’élucidation des complexités de la vie à l’échelle cellulaire et génétique. Du cancer aux cellules souches en passant par les maladies infectieuses, génétiques ou hématologiques, Promega apporte les outils nécessaires aux scientifiques pour comprendre les processus fondamentaux de la vie. Il s'agit par exemple de comprendre de quelle manière une maladie se développe pour ainsi mettre en place des techniques maisons adaptées en matière de prévention, de dépistage et de traitement. La biologie fondamentale en pleine évolution contribue ainsi, avec Promega, à l’essor de la biologie clinique et à l’expansion d’une médecine de plus en plus personnalisée. Un expert reconnu pour répondre à des besoins ciblés en recherche translationnelle Transduction du Signal • A nalyse des mécanismes cellulaires •G PCR • R écepteur nucléaire • Tests biochimiques Métabolisme / ADME • Cytochrome P450 • UDP Glucuronosyltransferase • Glutathione • Proteasome • DUB/SENP/NEDP • NAD/NADH-Glo ™ Assay • Acétylation des histones Mort cellulaire • Viabilité cellulaire • Cytotoxicité • Apoptose • Stress oxidatif (Ros-Glo ™) ATP Gas AC cAMP ATP ATP ATP PKA DEAD CELL PROTEASE GSSG P450 GSH LIVE CELL PROTEASE P450 UGT Caspase-3 ProCaspase-3 Analyse du génome !" Fonction des protéines • qPCR • E xtraction d'acides nucléiques manuelle et automatisée • F onction des promoteurs • C ontrôle post-transcriptionnel • A uthentification des lignées cellulaires • Méthylation de l’ADN • E xpression • L ocalisation • Interactions protéine-protéine • A nalyse structurale • Tests biochimiques 39 Un service de qualité Depuis plus de 30 ans, la société Promega s’engage au quotidien auprès des scientifiques au fil de leurs projets. Plus que des produits innovants, c’est la notion de partenariat qui est renforcée grâce à des services de proximité, de qualité (hotline avec des spécialistes, délais de livraison réduits, respect total de la chaine du froid). Promega met également à disposition des scientifiques un centre de formation PETAL pour des formations standards ou sur-mesure. L’exigence de qualité passe également par l’installation d’un nouveau site de production industriel classé cGMP (Manheim, USA). Enfin Promega, c’est un engagement environnemental global acté grâce à un ensemble de mesures. Laboratoire de formation et d'application Biologie moléculaire Identification Humaine Protéomique Le centre de formation et d’application européen PETAL ouvert en 2009 à Charbonnières accueille tout au long de l’année des groupes (jusqu’à 30 personnes) pour des formations standards ou sur- mesure. Ces formations centrées sur la biologie moléculaire, la biologie cellulaire, la protéomique et l'identification humaine sont destinées aux chercheurs, cliniciens, techniciens, étudiants qui souhaitent aborder sous un angle pratique les dernières techniques de laboratoire. Programme complet Pour plus de renseignements Tél. 04 37 22 50 00 [email protected] Biologie Cellulaire Programme personnalisé 41 Site industriel Promega classé cGMP* Une référence en terme d'exigence de production industrielle Conformité cGMP = emballage dans le respect des règles de bonne pratique de fabrication. • ualité maintenue grâce à des mécanismes multiples de sécurité intégrés à l’ensemble Q du processus • 25 000 m2 de production, laboratoires d’essai et de formation : - Production de produits règlementés pour l’industrie pharmaceutique ou diagnostic - Laboratoire pour tester les produits en condition réelle • Bâti selon les normes de développement durable • Plus de 100 personnes *Current Good Manufacturing Practices Promega, un engagement environnemental Business Travel Carbon Footprint Global Carbon Footprint Goal Status 2,097 11% 75 7 72 67 67 2012 2014 GOAL 2008 29 9 RAIL 80 AUTO 83 2008 Reams per Million in Revenue Gallons Per Million in Revenue 64 2,880 2,813 55 45 1,213 62 10 52 8 576 686 9 681 1,463 2,139 2,087 10% Indexed /Million in Revenue 607 1,044 2012 Global Paper Usage 3% 66 2,090 2008 Less Water Used 58 40 7 855 Global Water Usage Global Water Usage 64 1,691 Reduction in CO2 Emissions Million BTUs of Gross 93 AIR Tons of C02 Per Million in Revenue Une responsabilité environnementale entretenue par un programme strict qui a débuté en juillet 2009 et matérialisé par la publication d’un rapport développement durable annuel (2009 et 2012) qui rend compte de son engagement : 6600 574 8% Below Goal 98 2008 2012 2014 GOAL En savoir plus sur l'engagement environnemental Promega 43 107 65 88 96 96 2012 2014 GOAL Service marché public 04 37 22 50 01 Conditions commerciales 04 37 22 50 03 [email protected] Renseignements techniques 0 800 488 000 [email protected] Pour commander 0 800 487 999 Parc d’activités des Verrières - 24, chemin des Verrières 69260 Charbonnières-les-Bains Tél. 04 37 22 50 00 www.promega.com Panacee - ©istockphoto, fotolia [email protected]