X. Massart AWE - Comité du lait
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X. Massart AWE - Comité du lait
1/04/2012 www.optimir.eu POSTULAT Spectre Moyen Infra Rouge du lait = Miroir de l’état des vaches FERTILITE Ex. : Gestation ? ALIMENTATION Ex. : Balance énergétique ? SANTE ANIMALE Ex. : Mammites ? IMPACT ENVIRONNEMENTAL Ex. : CH4 ? 1 1/04/2012 RESUME DU PROJET Programme INTERREG IV B Europe du Nord-Ouest Æ Fonds FEDER Durabilité et rentabilité des exploitations laitières. Nouveaux outils de suivi de troupeau: 9 Via Internet (application web) 9 Basés sur l’analyse spectrale (MIR) des échantillons du Contrôle Laitier AWE asbl = chef de file Æ coordination du projet Du 01/01/2011 au 31/09/2015 PARTENAIRES • 6 pays • 17 partenaires et 1 sous-partenaire 11 organismes de contrôle laitier 6 centres de recherche ou universités 1 laboratoire de référence Organismes de CL Pays AWE asbl BE Chambre régionale Agriculture Alsace FR Laboratoire Pays Comité du Lait asbl BE Centres de recherche Pays Institut de l’Elevage FR Gembloux Agro-Bio Tech (ULg) BE CRA-W (DVPA) BE UK TEAGASC IR Irish Cattle Breeding Federation IR Scottish Agricultural College UK CONVIS LU Université de Hohenheim DE ADECL62 (Pas-de-Calais) FR CLASEL (Sarthe & Mayenne) FR SCL25 (Doubs et territoire de Belfort) FR France Conseil Elevage FR LKV Baden-Württemberg DE LKV Nordrhein-Westfalen National Milk Recording DE 2 1/04/2012 PARTENAIRES WALLONS (futurospectre) Coordination Expertise MIR et recherche Laboratoire de référence Expertise modélisation et recherche PARTENAIRES Europe du Nord Ouest 3 1/04/2012 MISE EN PLACE 1. Mise en commun des ressources des organismes de contrôle laitier Æ base de données transnationale commune couplant les : données phénotypiques des vaches données conventionnelles du CL (calibration MG, prot, etc.) données spectrales brutes Données Données Données Données ... de gestation sur la balance énergétique de santé mammaire sur les émissions de méthane + Données Contrôle Laitier = BASE DE DONNEES TRANSNATIONALE COMMUNE MISE EN PLACE Baden Wurttemberg 300,000 7,000 France 1,860,700 36,670 Ireland 435,000 6,200 Luxembourg 35,000 640 Nordrhein Westfalen 320,000 5,600 United Kingdom 1,234,000 7,540 Wallonia 74,000 1,250 4 1/04/2012 MISE EN PLACE 2. Mise en commun des ressources et expertises des centres de recherche et universités Æ corrélation entre les données phénotypiques des vaches et le spectre du lait grâce à la base de données transnationale Æ indicateurs spectraux Vaches Vaches Vaches Vaches ... gestantes mobilisant ses réserves avec mammite émettant peu de méthane + = Nouveaux indicateurs de performance basés sur l’évolution du spectre MIR MISE EN PLACE 3. Développement de bio-modèles et d’équations prédictives pour la construction et la mise en ligne d’outils Internet à destination des éleveurs et des conseillers en ferme : Diagnostic de gestation Détection de rations déséquilibrées Détection de mammites Jauge des émissions de méthane … … 5 1/04/2012 STANDARDISATION DES REPONSES SPECTRALES POUR L’INTEGRATION DANS LA BD TRANSNATIONALE COMMUNE 4 3 2 0 2 3 F. Dehareng , J.A. Fernández Pierna, C. Grelet, V. Baeten, P. Dardenne Centre wallon de Recherches agronomiques Département Valorisation des Productions Unité Technologies de la Transformation des Produits www.cra.wallonie.be STANDARDISATION CONTEXTE Plusieurs laboratoires (> 20) Plusieurs marques d’analyseur MIR (Foss, Bentley, Delta) Plusieurs modèles au sein d’une même marque CONSTAT Variation des réponses sur le même échantillon entre appareils Variation des réponses au cours du temps sur le même échantillon et le même appareil CONCLUSION Un modèle développé sur un appareil à un moment peut entraîner des résultats erronés en étant utilisé sur un autre appareil et/ou à un autre moment. Les spectres bruts ne sont pas comparables entre eux ! Impossibilité de créer de modèles valides sur base des spectres bruts Nécessité de STANDARDISER les spectres 6 1/04/2012 STANDARDISATION Piece-wise Direct Standardization (PDS) Proposed by Wang et al. La PDS est basée sur le fait que l’information spectrales contenue dans une certaine longueur d’onde sur l’instrument « maitre » est fortement corrélée au spectre des longueurs d’ondes voisines de l’instrument esclave. Master Slave Méthode de transformation qui calque la réponse d’instruments “esclaves” sur la réponse d’un instrument “maître” 7 1/04/2012 STANDARDISATION Envoi mensuel de gammes de lait chez tous les partenaires OptiMIR depuis octobre 2011 Æ échantillons identiques 3 labos 2 labos 3 labos 17 labos 3.5 Foss = Master Bentley = Esclave 3 2.5 2 Foss: 1060 longueurs d’ondes 1.5 1 0.5 Bentley: 889 longueurs d’ondes 0 -0.5 0 200 400 600 800 1000 1200 8 1/04/2012 3.5 3 2.5 2 Foss: résultat en transmittance 1.5 1 Bentley: résultat en absorbance 0.5 0 -0.5 0 200 400 600 Avant standardisation 2 800 1000 1200 Après standardisation 0.2 5 0.15 1 0.1 5 0.05 0 0 5 -0.05 250 300 350 400 450 250 300 350 400 450 9 1/04/2012 CONCLUSION 1. Rassemblement des OCL autour d’objectifs communs 2. Mise à niveau des OCL (TDM, calibrations, etc.) 3. Mise au point de la standardisation de spectres « Esclaves » par rapport à un spectre « Maîtres » : ICAR 06/2011 Validation dans le temps Paramètres propres à chaque machine 4. Base de données transnationale commune Æ harmonisation des données et outil statistique puissant 5. Combinaison des expertises des centres de recherche et universités Æ approche globale 10