Mécanique Moléculaire Contrôle du 26 avril 2007 (Durée : 30 min )

UNIVERSITÉ DU MAINE
MASTER 1 BIOLOGIE
Mécanique Moléculaire
Contrôle du 26 avril 2007 (Durée : 30 min )
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Entourer la ou (les) réponses qui vous semblent les plus correctes
Quel est l'ordre de grandeur maximal du temps de repliement d'une protéine de taille moyenne ?
Une détermination de structure de protéines par rayons X
ou RMN sur cristal moléculaire pur permet-elle de tenir
compte de l'eet du solvant ?
Même question pour la température
Le Hamiltonien est déni par la somme de l'énergie cinétique T et potentielle V d'un système
Pour un oscillateur harmonique, V est en k(~r − r~0 )3
On peut relier la température à l'énergie cinétique moyenne
des atomes d'un système
À haute température, les congurations d'énergie potentielle élevée deviennent probables
Des programmes tels que CHARMM (mécanique moléculaire)
peuvent décrire les eets quantiques (tels que les spectres
d'absorption de la lumière) dans les petites molécules
Des programmes tels que GAUSSIAN (chimie quantique)
peuvent permettre d'estimer les courbes d'énergie potentielles dans des liaisons telles que C-C dans une protéine
À l'heure actuelle, les programmes de mécanique moléculaire sur superordinateur permettent de prédire la forme et
la fonction d'une protéine à partir de sa séquence ADN
Le calcul distribué (folding@home) permet d'espérer des
progrès en étude du repliement des protéines
La nature chimique d'une protéine, plus que sa forme, permet de comprendre sa fonction
1 ps
1 ms
oui
non
oui
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oui
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