Compte-rendu

3ème réunion « Data Rescue »
Rédacteur
Alain Damiano
compte-rendu
Date création :
01.07.05
Référence:
21.007CR/1
Dernière modif. :
04/08/2005 3:09
Pages
3
Diffusion : participants à la réunion, documents du projet, web
Résumé : une réunion restreinte des personnels de l’US Osiris a été réalisée pour faire le point et programmer la
suite de l’opération Data Rescue. Une liste d’actions prioritaires a été identifiée.
Lieu de réunion : Sète, CRHMT, Salle Méditerranée
Date : Mercredi 29 juin 2005, de 10H30 à 12H30
Organisateur : Pierre CHAVANCE
Participants : Peggy BRETAUDEAU / Pierre CHAVANCE / Jean LE FUR / Alain DAMIANO
Objectifs : bilan et poursuite de l’opération « Data Rescue »
Ordre du jour (proposé par P. Chavance):
1/ Liens de DataRescue avec le projet Ecoscope
2/ Bilan de l’avancement des travaux
3/ Outils et méthodes à développer
4/ Calendrier prévisionnel
Compte-rendu
1/ Lien de DataRescue avec le projet Ecoscope
J. Le Fur a indiqué que le DataRescue était représenté par le module 2.1 du circuit des savoirs (avec une procédure spécifique pour la prise en compte des données). Si cette position est acceptée, il est nécessaire de
conserver une trace de la réunion sous forme d’un compte rendu assurance qualité.
P.Chavance confirme l’appartenance de l’action à l’ensemble Ecoscope
Le travail va se dérouler en trois phases :
Récupération des données,
Etude en parallèle des procédures – amélioration du circuit des données
Cas d’étude thématique (avec P. Cury)
Approche du DataRescue (que va-t-on faire pour les données ?)
04/08/05 – Ecoscope - 21CR.reunion_data_rescue3.1c.doc
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2/ Avancement des travaux
Tableau Excel élaboré par A.Damiano et P.Bretaudeau (doc n° 21.004) -> il faut maintenant récupérer
les données. Sur certaines données il y a des décisions à prendre (récupération de données sur cassettes, sur papier, à saisir, à restructurer ?). Toutes les données vont être récupérées si possible sur le
disque dur data rescue (un dossier par ligne dans le tableau)
Il faut veiller à poursuivre l’alimentation du tableau inventaire (qui devrait être transformé en base access)
Etude sur le thon germon (P.Bretaudeau) -> avancé mais encore du travail à réaliser. A ce propos la
question se pose de l’opportunité d’accepter la base germon sachant que ces données sont localisées
dans le Golfe de Gascogne même si on sait que le DataRescue est plus large que l’Ecoscope… Les
données Germon ne sont pas prioritaires mais il serait bon de stocker le travail effectué par Peggy. Ces
données pourraient servir de travaux pratiques pour illustrer les difficultés rencontrées lors de leur sauvegarde. Peggy rappelle que pour certaines données on a fait de nouveaux traitements, des hypothèses et que cela crée une nouvelle base
Travail sur les méta-données (P.Bretaudeau avec l’assistance de J.LeFur ?) -> doc lues mais à synthétiser
Tableau indicateur des données présenté par J.Le Fur. Il propose un graphique destiné à visualiser des
indicateurs de données disponibles dans le module Data Rescue :
Données stockées
Données référencées
Données normées
Par ailleurs, P.Bretaudeau s’inquiète que les chercheurs puissent fournir des données de mauvaise qualité
(brute, sans information) alors que nous n’avons pas les connaissances thématiques.
3/ Outils et méthodes à développer
Pierre explique qu’il souhaiterait une sorte de « guichet data rescue» où l’on proposerait un service potentiel,
mais il faut élaborer un guide d’utilisation de ce guichet. Jean précise que les procédures sont déjà mises au
point pour les savoirs et qu’il suffit maintenant d’étendre ces procédures aux données. Entre autres, le « proposant » d’un savoir ou de données est responsable de ce qu’il propose.
En ce qui concerne StatBase et TrawlBase, Pierre pense que nous devons être garants de ces données, quitte à
mettre des « flags » sur les données douteuses, mais Jean soulève le problème du « versioning » (difficulté à
garder des données remises à jour en permanence). Dans Istam on est censé retravailler sur TrawlBase et si
une nouvelle version est créée on décrira la procédure de mise à jour et on fera tourner le nouveau jeu dans le
circuit avec la méta-donnée associée.
Grossièrement, selon J. Le Fur, la structure des données de Data Rescue serait la suivante (voir figure ci-après) :
une base conservée qui contiendrait les données brutes, enregistrées mais non formatées, une base « référencée » selon les critères du circuit des savoirs et qui pourrait être accessible, utilisable et articulée avec les autres
savoirs de l’Ecoscope. Une base « normée », enfin, qui serait formatée selon une norme de méta-données.
04/08/05 – Ecoscope - 21CR.reunion_data_rescue3.1c.doc
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Figure 1 Les trois bases constitutives du data rescue Ecoscope et leur taille relative prévisible
0010100011100101001101100100110100110101010011010000001011111111001010100111110
modules
1111101000010111010101101000100001010011100001110111000111101110100011010010110
distribution; Dixinn; Drepane 0.0
africana; durée de vie; eau; eau douce; économie; effort de pêche; emploi;
non vides
enclavement; engin de pêche; entreprise; Environnement; espadon voilier; établissement public; Ethmalosa
1111000100100110000001000010110100000101100100100100011110010001010001101001111
Ecoscope
fimbriata; ethmalose; évolution
annuelle; évolution mensuelle; Exploitation; exportation; Faune; fécondité;
1000100010101101100000001101111001011010100001010001111000100001010110110011011
fil; filet ichtyoplanctonique; filet maillant calé; filet maillant dérivant; filet maillant encerclant; filet tournant;
1000010110000101100001010100110110000100110001010011110111111111001000000000011
fleuve; flottille; fond accidenté; fond marin; Forécariah (préfecture); forgeron ailé; fraîcheur; fumeuse; fumoir;
Galeocerdo cuvieri; Galeoides decadactylus; gastéropodes;
0011101110111100010001010100110010010011110000101000000101111101001110111100101
0.1 Gestion; gestion; glace; glacière; granulométrie;
Guinée; halieutique; Harpacticoïde; historique; horizon; ichtyoplanctonologie; îles de Loos; importation;
0110111101101100110110100000100100010101010010000110101011000100010000111011110
construction
Infrastructure; interaction entre pêcheries; intrant; invention; investissement; jour de mer; juvénile; Kassa (îles
prototype
1100111010011100010111001011101001111010101111001010100011101110100011001010111
(e.g.,
ISOlieu19115
– ligne; ligne glacière;
de Loos); ketiakh; larves de poisson; latitude;du
Lepidochelys
olivacea;
ou localisation;
limite; liquide; littoral guinéen; localisation; longitude; longueur; lutite; mâchoiron; mangrove; mangrove
1101010001111101100010011011011011100101011111000000011100010011010000101000111
guinéenne; marché; marché intérieur; marchés de l'intérieur;
marée; masse d'eau; matière en suspension;
Syscolag)
0010100110110010011010011010101001101000000101111111100101010011111011111010000
maturité; méduse; Menippe nodifrons; mesure ou indicateur; méthode de pêche; métier; Ministère de la Pêche et
de l'Aquaculture; mollusques; moteur; moyen d'existence; navigation; navire; nourriture; Océanographie
1011101010110100010000101001110000111011100011110111010001101001011011110001001
3.0 marin; otolithe; outil;
1.0
2.0
4.0oxygène; palangre; Parapenaeopsis
5.0
Physique;
oeufs; oiseau; organe; organisme
atlantica;
0011000000100001011010000010110010010010001111001000101000110100111110001000101
pays d'origine; pêche à la dorade; pêche artisanale; pêche continentale; pêche crevettière; pêche illicite; pêche
0110110000000110111100101101010000101000111100010000101011011001101110000101100
Mobilisation
Articulation
Co
nservation
Restitutions
Conduite
industrielle;
pêche maritime;
pêcheur; pélagique; Pelecanus
rufescens; pélican; Penaeus
kerathurus; Penaeus
notialis;
période de ponte; petit capitaine;
phosphate;
pirogue; pirogue
en projet
béton; plante; plateau
0010110000101010011011000010011000101001111011111111100100000000001100111011101
des savoirs
des peuplement;des
des
savoirs
savoirs
du
continental; poissons; Politique;
préfecture; prix; processus ou phénomène; Production; productivité; produit
savoirs
1110001000101010011001001001111000010100000010111110100111011110010101101111011
congelé; produit de pêche; produit transformé; profil de capture; profondeur; Pseudotolithus elongatus;
0110011011010000010010001010101001000011010101100010001000011101111011001110100
ptérygopode; puissance; quantité; raie; Ramsar; recette; recherche; réduction de la pauvreté; régime alimentaire;
réglementation; relation taille-poids; relief; rendement; rentabilité; répartition; reproduction; requin; requin
1110001011100101110100111101010111100101010001110111010001100101011111010100011
1.1
3.1Ressource; Rhinobatos 4.1
5.1 roche; sable;
bordé;2.1
requin marteau; requin tigre;
cemiculus; Rhinoptera bonasus;
1110110001001101101101110010101111100000001110001001101000010100011100101001101
saison; saison sèche; salinité; Sangareah (baie de); science;
séchoir;de
Secteur; sédiment; seiche; Sénégal; senne
outils
outils
typologies
d onnées
tournante;
Sepia bertheloti; Sepia
officinalis; sex-ratio; silicate; silure; Sonit pêche;coordination
sparidés; statistique; stock;
1001001101001101010100110100000010111111110010101001111101111101000010111010101
(rétempérature;
unions)
synthèse
(bases,
(&m
eta stratégie
de pêche; surexploitation;
surveillance;
taille; taxon;
taxonomie; Technologie;
temps ou
d'acquis ition
1010001000010100111000011101110001111011101000110100101101111000100100110000001
/
en
treptété
ôts)
ty toponymie;
polo gie s) tortue; tortue(indicateurs
date;
yèlè (filet); TJB;
luth; tortue olivâtre;
traduction; trait de chalut;
(guichet)
bord) ZEE; zone de pêche; zooplancton.
0000101101000001011001001001000111100100010100011010011111000100010101101100000
transformateur; Transformation; upwelling; valeur; tableaux
vase; vers;devitesse;
0011011110010110101000010100011110001000010101101100110111000010110000101100001
0101001101100001001100010100111101111111110010000000000110011101110111100010001
5.2
2.2
3.2
4.2
1.2
0101001100100100111100001010000001011111010011101111001010110111101101100110110
assurance
o utils de
produits de
documen1000001001000101010100100001101010110001000100001110111101100111010011100010111
études
quali té
sav oir
communitation
0010111010011110101011110010101000111011101000110010101111101010001111101100010
de cas
(conna issances)
(C I, etc .)
cation
0110110110111001010111110000000111000100110100001010001110010100110110010011010
0110101010011010000001011111111001010100111110111110100001011101010110100010000
1010011100001110111000111101110100011010010110111100010010011000000100001011010
5.3
1.3
4.3
0000101100100100100011110010001010001101001111100010001010110110000000110111100
1011010100001010001111000100001010110110011011100001011000010110000101010011011
validations
plate-for me
ressources
0000100110001010011110111111111001000000000011001110111011110001000101010011001
technique
& logistique
0010011110000101000000101111101001110111100101011011110110110011011010000010010
(p rototype)
Base normée
utilisable
avec les outils
Ecoscopes
Base référencée et mise à disposition
Base stockée/archivée/conservée
4/ Calendrier des actions
Les priorités sont définies comme suit :
1°) Rapatriation physique et sauvegarde des jeux de données brutes (stockage)
2°) Référencement : description de la structure et des variables. Établissement d’une notice (échanges avec le
proposant). Dans un premier temps, il s’agit d’étudier un cas simple qui va permettre d’établir les procédures à
suivre. Le choix s’est porté sur les sardinelles de Côte d’Ivoire.
3°) Norme de métadonnées ISO 19115 : Peggy sollicite l’aide de Jean. L’action est repositionnée en priorité
secondaire.
Le plus urgent est d’avoir du tangible et que des données commencent à être stockées dans DataRescue. Peggy et Alain sont chargés de commencer le stockage et l’étude de cas avec l’appui de Jean
Rédaction : Alain Damiano / corrections J.Le Fur, P.Chavance / saisie : AD, JLF
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04/08/05 – Ecoscope - 21CR.reunion_data_rescue3.1c.doc
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