UFR de Biologie / UMR CNRS Ecologie Microbienne / Equipe

UFR de Biologie / UMR CNRS Ecologie Microbienne / Equipe Symbiose mycorhizienne
Poste de Maître de Conférences
(section CNU : 67)
Ecologie moléculaire des microorganismes eucaryotes
Thème de recherche
Le candidat s'intègrera dans une équipe développant une nouvelle approche de génomique
environnementale visant à révéler la diversité taxonomique et fonctionnelle des microorganismes
eucaryotes des sols. Ces organismes très divers (champignons, protistes…), bien moins étudiés que
les procaryotes, représentent un immense réservoir de gènes encore méconnu et inexploité et ils
jouent des rôles essentiels dans la vie des sols (dégradation de la matière organique, prédation
bactérienne, interactions pathogènes ou symbiotiques avec les animaux et les végétaux…).
Cette thématique pluridisciplinaire fait converger différentes approches expérimentales pour
étudier les fonctions réellement assurées dans un sol par l'ensemble des microorganismes eucaryotes,
qu'ils soient cultivables ou pas. Deux axes de recherche sont actuellement développés: le premier pour
révéler la diversité des mécanismes mis en jeu par ces microorganismes pour résister à une pollution
des sols par des métaux lourds, le deuxième pour étudier la diversité des systèmes enzymatiques
permettant la dégradation des litières végétales, ces deux aspects présentant un fort potentiel de
développement biotechnologique et de valorisation.
Profil des candidats
Plusieurs disciplines sont concernées par cette thématique de recherche: l'écologie microbienne
(manipulation et clonage d'acides nucléiques environnementaux), la génomique structurale et
fonctionnelle des eucaryotes, la phylogénie moléculaire et la biologie moléculaire des eucaryotes
(expression de gènes clonés dans des microorganismes eucaryotes modèles). Le candidat devra
posséder une expérience de recherche avérée dans un ou plusieurs de ces domaines afin de compléter
l'expertise de l'équipe d'accueil et renforcer cette nouvelle orientation.
Profil d’enseignement
Le candidat retenu participera à des enseignements de microbiologie générale, d'écologie microbienne
ainsi que de biologie végétale, essentiellement dans le contexte des interactions plantesmicroorganismes :
Master EEME, M1 Microbiologie: module Microorganismes et Santé des Plantes;
Master EEME, M1 BGSTU : module Développement Végétal, Parasitisme et Symbiose;
Master EEME, M1 Chimie et Biologie Végétales : module Taxinomie et Ressources Végétales;
Licence ST, L1 : module Biologie des Organismes (partie BOV);
Développement souhaité de nouveaux enseignements en Masters Recherche et Pro sur les
communautés de microorganismes eucaryotes (diversité et fonctions)
Contact
Recherche : Roland Marmeisse (responsable d’équipe), Tel. 0472448047, Fax. 0472431643,
[email protected]
Enseignement : Gilles Gay (prof.), Tel. 0472448047, Fax. 0472431643, [email protected]