Initiation à l`interrogation de la base de données MEDLINE :

CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE NIMES
Institut de Formation aux Métiers de la Santé
3 bis rue Kléber - 30029 NIMES Cedex 9
Documentation
Tél. 8.40.15 / Télécopie – 8.69.50 / email : [email protected]
Initiation à l’interrogation de la base de données
MEDLINE :
1 - Choisir ses mots clés :
Dans MESH Bilingue si vous ne connaissez pas la traduction anglaise de vos motsclés.
Accès : http://mesh.inserm.fr/mesh/search/index.jsp
Cliquer sur « Aide à la recherche » pour plus d’info.
Utilisation :
Taper dans le champs de recherche le mot clé français de votre recherche. Cliquer sur
« rechercher ». Une liste de propositions s’affiche en bas de la page. On vous propose une
liste de descripteurs français, de synonymes, leur traduction en américain…
-
Dans la colonne « Code Catégorie Mesh » il y a un code correspondant au domaine dans
lequel ce mot clé est utilisé (exp : C = maladie), et à la position du mot clé dans
l’arborescence du thésaurus MESH. (moins le nombre possède de chiffre, plus il se trouve
à la racine de l’arborescence : expl : Maladie de l’œil = C11 ; Trouble de ma réfraction
oculaire = C11 744 ; Myopie = C 11 744 636…)
Vous pouvez voir l’arborescence complète en cliquant sur la colonne de droite : « Vue
arborescence complète »
Astuce : accéder à l’arborescence d’un terme peut vous aider à trouver des mots-clés
pour votre recherche (synonymes, termes associés, termes génériques ou spécifiques…)
Une fois que vous avez trouvé votre terme, vous n’avez plus qu’à le copier-coller dans la
partie recherche de MEDLINE (voir plus loin)
Dans MESH Database (Thésaurus de Medline) si vous connaissez le terme anglais
approprié.
Accès : www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez + Mesh database (colonne de droite)
Inscrire le descripteur dans le champs. Cliquer sur « Go »
On obtient une liste de termes avec une définition qui vous permet de choisir le terme
approprié.
Pour lancer directement la recherche dans MEDLINE, sélectionner le terme choisi en
cochant la case correspondante. Puis ouvrir le menu déroulant en cliquant sur la flèche
correspondant au champs « send to », choisir « Search box with AND » et cliquer sur
« Search Pubmed »
-
Documentation – IFMS
Catherine Chabrier
[email protected]
Méthodologie
Utilisation de MedLine
2 - Affiner sa recherche :
- Cliquer sur le terme choisi (en bleu) puis sélectionner un terme spécifique en cochant la
case correspondante : la recherche se limitera à cet axe là.
- Cocher « Restrict search to major topic headings only » : pour restreindre la recherche
aux articles dont votre terme est un des sujets principaux.
- Combinez plusieurs mots clé : vous utiliserez les opérateurs booléens « AND », « OR » ou
« NOT » pour restreindre ou élargir votre champ de recherche.
Expl de requête combinant à la fois la fonction : « Restrict search to major topic headings only »
et les différents opérateurs booléens :
Dans MeSH (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez) ,
demandez le premier terme : Zidovudine, cliquez sur « go »
Selectionnez le terme, précisez : « Restrict search to major topic headings only »
Demandez le 2ème terme : Delavirdine
Selectionnez le terme, précisez : « Restrict search to major topic headings only »
Précisez : « Search box with OR »
Demandez le 3ème terme : « Acquired Immodeficiency Syndrome »
Selectionnez le terme, précisez : « Restrict search to major topic headings only »
Précisez : « Search box with AND »
Dans le champs recherche de PUBMED : s’affiche alors la requête suivante :
(“Zidovudine”[MAJR]OR “Delavirdine”[MAJR])AND “Acquired Immodeficiency
Syndrome”[MeSH]
Votre recherche se traduit par : des articles de revue traitant de près ou de loin de l’“Acquired
Immodeficiency Syndrome”, et parlant précisément soit du Zidovudine soit du Delavirdine.
Vous obtenez 896 références.
En résumé :
[MAJR] affine votre recherche, [MeSH] l’élargit
« AND » et « NOT » affinent votre recherche « OR » l’élargit,
Lancer votre recherche dans MEDLINE : cliquer sur « Search Pubmed »
Une fois votre recherche lancée dans PUBMED, vous pouvez encore l’affiner :
- En précisant vos critères de recherche avec l’onglet « Limits » : vous pourrez sélectionner
la langue, la date de publication, le type de document, les tranches d’âge…
Documentation – IFMS
Catherine Chabrier
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Utilisation de MedLine
3 - Stratégie de recherche :
A partir de votre sujet de recherche :
- Décomposer le thème en concepts, mots clés (termes génériques, termes spécifiques, termes
associés, synonymes…)
- Chercher les termes MESH qui correspondent aux concepts dégagés. (les traduire en anglais)
- Saisir les termes MESH les uns après les autres dans la boîte de recherche en utilisant les
opérateurs booléens AND, OR et NOT
Si vous obtenez trop de références :
- Limiter avec un qualificatif
- Limiter avec un ou plusieurs mots clés
- Limiter avec les limites de la « Advanced search »
- Limiter avec une recherche dans un champs en particulier (Limits )
- Limiter en utilisant le [MAJR]
Si vous n’obtenez pas assez de références :
- Utiliser un terme moins spécifique
- Associez-les avec d’autres termes (voir http://mesh.inserm.fr/mesh/search/index.jsp)
- Affichez les mots MeSH des références pertinentes pour trouver d’autres mots MeSH qui vous
permettront de relancer la recherche
En cliquant sur « Advanced search » :
Vous limiterez la recherche à un champs particulier.
- Sélectionner le champs voulu
- Inscrivez votre terme (aidez-vous de l’index pour l’affiner si nécessaire)
- Cliquez sur AND, votre terme s’affiche dans le champs recherche
- Appliquez autant de fois que vous souhaitez insérer de termes
- Lancez la recherche en cliquant sur SEARCH
Vous accéderez à l’historique de vos recherches
Vous pourrez enregistrer le résultat d’une recherche :
- Sauvegarde temporaire (8 heures) : cliquez sur « send to » (mots bleus) « clipboard » (pour le
visionner, retourner sur « Advanced search » , cliquez sur Pubmed Clipbord
-Sauvegarde sur fichier : cliquez sur « send to » (mots bleus) , « file ».
Documentation – IFMS
Catherine Chabrier
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