L`actualité R4ciam L`actualitéR ciam
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AVRIL 2015, N O 4 L’actualité R4ciam maic4R étilautca’L Pour fêter le printemps, nous vous proposons une promenade du côté de FUN, plate-forme qui met en ligne des MOOC (Massive Open Online Courses). Pourquoi ne pas profiter des nouvelles possibilités qu’offre le numérique pour élargir ses compétences ? Actuellement, plusieurs des MOOC affichés vous proposent une introduction à R ou bien s’appuient sur R pour présenter des concepts statistiques. • Introduction à la statistique avec R : du 30 mars au 8 mai 2015 : L’objectif de ce cours est de savoir analyser des données, de comprendre ce que l’on fait et de pouvoir communiquer ses résultats. Les méthodes abordées sont : les techniques descriptives, les tests, l’analyse de variance, les modèles de régression linéaire et logistique, les données censurées (de survie). À noter, le cours inclut des vidéos de pratique sous RStudio. • Fondamentaux en statistiques : du 26 mars au 30 avril 2015 : Ce cours est une introduction aux concepts de base en statistique. Il met l’accent sur l’application pratique . . . et repose sur l’utilisation du logiciel libre et gratuit R, dont l’installation et la manipulation seront expliquées pas à pas en semaine 0. • Analyse des données multidimensionnelles : du 2 mars au 30 mars : L’objectif est de comprendre et appliquer les quatre méthodes fondamentales de l’analyse des données : analyse en composantes principales (ACP), analyse factorielle des correspondances (AFC), analyse des correspondances multiples (ACM) et classification ascendante hiérarchique (CAH). Agenda : annonces • Une nouvelle version de R est sortie le 9 mars 2015. Il s’agit de la version 3.1.3 ((2015-03-09) ) appelée Smooth Sidewalk. • La dernière version de RStudio est sortie le 7 mars 2015. Il s’agit de la version 0.98.1103 (www.rstudio.com). R4ciam : nouvelles fiches • Savez-vous créer un wordle, à la mode de chez nous ? R4ciam : nouveaux tutoriels • Outliers ou données extrêmes, comment les détecter ? que faire de ces observations ? • Utilisation de l’interface R Commander Agenda : séminaires, conférences • Conférence sur les données manquantes à Rennes les 18 et 19 juin 2015. Plus d’information sur le site missDATA 2015. Agenda : ouvrages, publications • Le dernier numéro du R Journal est sorti en décembre 2014 (journal.r-project.org/archive/2014-2/). • Le dernier numéro de Journal of Statistical Software est un numéro spécial sur l’analyse spatiale (www.jstatsoft.org/v63). • Modélisation Prédictive et Apprentissage Statistique avec R, Stéphane T UFFERY, Technip • Initiation au logiciel R : premiers pas en analyse de données : survol théorique et applications avec Rcmdr et FactoMineR, Jean-Pierre A SSELIN DE B EAUVILLE, Sacha VARIN, AcademiaL’harmattan Focus : une task view Les Task views sont des compilations disponibles sur le site du CRAN, regroupant par grands thèmes/disciplines, les packages R jugés les plus pertinents pour le thème ou la discipline (voir la fiche Les Task views et le package ctv) La task view « Bayesian » maintenue par Jong Hee Park, recense les packages R autour des analyses bayésiennes. Elle présente plus de 110 packages. Focus : un site install.packages("ctv") library("ctv") Un site sur lequel on peut déposer des « bouts de code » ou install.views("Bayesian") « snippets » R. il s’agit de www.jstatsoft.org, cliquer sur l’onglet # update.views("Bayesian") « Code Snippets » (à droite). Focus : une fonction R est un logiciel très actif avec des mises à jours régulières et relativement fréquentes. Pour connaitre la version de R utilisée ainsi que les packages chargés, on peut utiliser la fonction sessionInfo(). > sessionInfo() R version 3.1.3 (2015-03-09) Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit) Running under: OS X 10.9.5 (Mavericks) Détente : un script amusant Sur le blog Ripples, on peut trouver un script R permettant la génération de figures mathématiques assez esthétiques. Ces figures changent à chaque exécution du script. locale: [1] fr_FR.UTF-8/ ... attached base packages: [1] stats graphics grDevices utils ... Focus : un package Le package installr maintenu par Tal G ALILI, propose, pour les utilisateurs de R sous Windows, différentes fonctions permettant l’installation d’applications externes (git, GitHub, LyX, RStudio, etc.) depuis R. Il fournit aussi la fonction updateR(). Cette fonction vérifie l’existence d’une nouvelle version de R et lorsque cette dernière existe, se charge du téléchargement et de l’installation. Différents arguments permettent d’affiner l’installation et par exemple, de conserver ou non la version précédente. Rédaction : > paste(sample(auteurs), collapse=", ") [1] "F. Dessaint, C. Chabanet" ;-) fortunes::fortune() > My solution when I run into mysteries like this is to put ’browser()’ in the function just before or after the line of interest. The magnitude and direction of my stupidity usually become clear quickly. -- Patrick Burns (February 2006) Pour nous joindre, proposer une fiche, s’inscrire à la liste de diffusion, . . . une seule adresse : ciam.inra.fr/r4ciam/contact