SANTO Fiche-2012 - Flotte oceanographique française

Transcription

Valorisation des campagnes à la mer
Navires Ifremer - IRD - IPEV
Fiche “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques ”
(à envoyer par courriel à [email protected] )
Nom de la campagne : SANTO 2006
Navire : Alis
Engins lourds : dragues, chaluts
Dates de la campagne : 9/9 au 26/10/2006
Zone(s) : Vanuatu (Pacifique Sud-Ouest)
Nombre de jours sur zone/en transit : 6 j. transit, 3 j.
escale
Chef de mission principal (Nom, prénom et organisme) : Philippe BOUCHET, chef de projet SANTO 2006
Bertrand RICHER de FORGES (DR IRD), chef de mission
Nombre de chercheurs et d’enseignants-chercheurs (en mer / à terre) : 3 en mer, 25 à terre
Nombre d’ingénieurs et de techniciens (en mer / à terre) : 2 en mer, 58 à terre
Nombre d’étudiants (en mer / à terre) : 1 en mer, 8 à terre
Fiche remplie par : Philippe BOUCHET
Date de rédaction ou d’actualisation de la fiche : 20/3/2011
actualisée le 24/3/2012
Adresse : MNHN; UMR 7138, 55 rue Buffon, 75005 Paris
Email : [email protected]
Tel : 01 40 79 31 03
Fax :
Résultats majeurs obtenus
1 – Contexte scientifique et programmatique de la campagne
La campagne océanographique SANTO 2006 a fait partie de l'expédition éponyme SANTO 2006, dont
elle constituait le principal moyen navigant du module marin. L'expédition SANTO 2006 a été le projet
commun de trois organismes (Muséum national d’histoire naturelle, Institut de recherche pour le
développement, Pro-Natura International) liés par une convention tripartite.
L'expédition comprenait également la campagne SANTOBOA. Bien que pleinement intégrée au reste de
l'expédition, la campagne SANTOBOA fait également partie de la série de campagnes BOA (Bois coulés
et Organismes Associés) et elle fait l'objet d'une fiche de valorisation séparée.
Les îles du Pacifique sont célèbres pour le très haut niveau d’endémisme et la grande vulnérabilité de
leurs faunes et de leurs flores. Bien que la valeur scientifique et patrimoniale des écosystèmes du Vanuatu
ait conduit à classer ce pays comme « point chaud » de la biodiversité, l’archipel souffrait d’un déficit de
connaissances en comparaison avec d’autres archipels du Pacifique Sud. L’expédition Santo 2006 sur l’île
d’Espiritu Santo avait pour but d’inventorier les faunes et les flores marines, terrestres et dulçaquicoles de
cette île, en portant un accent particulier sur les compartiments négligés (invertébrés, plantes,
champignons) de la biodiversité. Tous les milieux, depuis les grands fonds marins au large de l’île
jusqu’aux récifs, grottes, rivières, forêts et montagnes ont été inventoriés. Des échantillons de tissus
biologiques, des enregistrements de sons et des photos numériques des organismes vivants ont complété
les prélèvements d’organismes complets. L’expédition a impliqué sur le terrain plus de cent cinquante
scientifiques, bénévoles et étudiants de vingt-cinq pays.
Le module marin s'est déroulé entre le 5 août et le 22 octobre ; il a impliqué 97 participants (scientifiques,
étudiants, personnel d'appui, bénévoles) de 18 pays. En moyenne, les participants sont restés sur place 30
jours, et il y avait en moyenne 65 personnes présentes simultanément sur le site. Le caractère international
de l'expédition s'est notamment manifesté dans la place faite dans le programme à plusieurs sousensembles placés sous la responsabilité de "vétérans" de Panglao 2004: Terry Gosliner (California
Academy of Sciences; nudibranches), Peter Ng (Singapour; crustacés décapodes), Marco Oliverio
(Université de Rome; commensaux, associés et parasites), Ellen Strong (Smithsonian Institution;
barcoding moléculaire). Cependant, Santo 2006 a été l'occasion de mobiliser des compétences nouvelles:
le groupe de John Gray (Université d'Oslo; échantillonnage quantitatif), de Richard Pyle (Bishop
Museum, Honolulu; plongées profondes), de Claude Payri (IRD, Nouméa; algues).
Arrival seafreight
from Nouméa
Departure seafreight
from Nouméa
Arrival seafreight
from Paris
Algae
Rapid Assessment
L
1
2
3
Ma
4
5
6
7
8
1
L
2
3
4
5
6
7
L
8
9
L
L
10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 1
July
August
2
3
4
5
6
7
8
September
Arrival seafreight
from Manilla
tangle netting, lumun lumun, traps
Invertebrates
2
3
4
5
6
7
8
Santo
Nouméa
1
9
Sandby
Quantitative sampling
10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 1
September
Santo Boa
Trimix diving
2
3
4
5
6
7
8
Transit
Nouméa
Alis Santo
Transit
Santo
Algae
9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31
October
Au sein de l'expédition, l'Alis a été utilisé du 12/9 au 23/10 comme un navire de station marine pour des
sorties à la journée au départ de notre base au Vanuatu Maritime College à Luganville pour :
(1) réaliser des prélèvements qualitatifs par engins trainants (dragues, chaluts) dans la tranche
bathymétrique inaccessible à la plongée (de 30 à 800 mètres de profondeur) ;
(2) réaliser des prélèvements quantitatifs à la benne dans la tranche bathymétrique accessible à la plongée,
pour comparaisons méthodologiques ;
(3) déplacer des équipes de biologistes pour aller faire des prélèvements en marée ou en plongée sur des
sites éloignés.
Il faut aussi remarquer le confort appréciable apporté à l'ensemble de l'expédition par la présence d'un
navire de recherche disposant de facilités de communication, d'un atelier avec un bon outillage, et de
membres d'équipage (machine) pouvant apporter à l'équipe à terre leur aide en mécanique et électricité.
Le laboratoire à terre, installé dans un hangar à bateaux reconverti pour l'occasion.
2 – Rappel des objectifs
Le module marin de l'expédition s'inscrivait dans la continuité d'opérations similaires conduites
précédemment en Nouvelle-Calédonie, aux Iles Australes et aux Philippines, couvrant le gradient de
biodiversité récifale du Pacifique Sud, depuis le pôle "chaud" (Philippines) jusqu'au pôle "froid" (Iles
Australes). Dans ce contexte, les objectifs du module marin de l'expédition SANTO 2006 étaient à la fois
généraux et particuliers:
2.1. Objectif méthodologique : comment "mesure"-t-on la biodiversité d'un écosystème côtier
complexe?
L'objectif méthodologique de SANTO 2006 était de comparer le pour et le contre de chacune des façons
de "mesurer" la biodiversité des écosystèmes marins tropicaux, en déployant simultanément les trois
approches à une échelle spatiale pertinente pour la conservation et la gestion des espaces :
(a) un inventaire taxonomique du type "chaque espèce compte" ;
(b) un échantillonnage quantitatif classique ;
(c ) un Rapid Assessment Survey.
Rassembler les tenants des trois approches sur un même site permettra de partager idées et points de vues,
et pourrait idéalement déboucher sur la mise au point de nouveaux protocoles de "mesure" de la
biodiversité dans des environnements riches en espèces mais où l'expertise taxonomique est un facteur
très limitant.
Une précédente étude de site (Bouchet et al. 2002, Biol. J. Linn. Soc. 75: 421-436) a permis de réconcilier
la force de l'approche naturaliste avec les mérites d'une stratégie d'échantillonnage standardisée. Le goulet
d'étranglement taxonomique avait été contourné en utilisant des "morphospecies", sans essayer de mettre
des noms d'espèces sur le petit macrobenthos. L'extension, par la même équipe, de la méthodologie à
d'autres sites du Sud-Ouest Pacifique a montré que l'approche naturaliste peut être rendue réplicable, et
ses résultats montrent des niveaux de richesse spécifique insoupçonnés par les autres approches.
2.2. Objectif particulier : inventorier un site et le situer dans le contexte du gradient de biodiversité du
Pacifique Sud.
En choisissant un site dans l'archipel du Vanuatu, le projet SANTO 2006 avait pour objectif de mettre à
niveau les connaissances sur la biodiversité récifale dans un archipel qui souffre d'un déficit d'études et
d'inventaires par rapport à la Nouvelle-Calédonie voisinne. Les résultats obtenus devaient être comparés à
ceux obtenus par la même équipe à Rapa, dans l'archipel des Australes (Polynésie française), qui
représente le "pôle froid" du gradient de biodiversité, et à Koumac, Touho et Lifou (en NouvelleCalédonie), qui occupent une position intermédiaire. L'échelle spatiale des sites d'étude est celle du
paysage (50-300 km²) et les taxons cibles sont des invertébrés benthiques peu mobiles (mollusques,
crustacés décapodes).
Certains des résultats attendus du Projet SANTO, et de l'atelier de Biodiversité Marine SANTO 2006 en
particulier relèvaient de la taxonomie (Exploration et connaissance de la biodiversité), d'autres relèvaient
de la mise à niveau des collections de référence (Constitution de collections de nouvelle génération),
d'autres enfin touchaient à la macroécologie (Structure de la guilde d’espèces).
3 – Principaux résultats obtenus
Outre les articles originaux publiés dans les périodiques et listés dans la fiche R1, les résultats de
l'expédition SANTO 2006 dans leur ensemble ont donné lieu à deux volumes collectifs : un numéro
thématique de Zoosystema consacré aux résultats zoologiques de Santo ; The Natural History of Santo, un
volume collectif (104 co-auteurs; paru en avril 2011) qui a fait l'objet d'une restitution au Vanuatu en juin
2011 (voir fiche R2).
(1) Exploration et connaissance de la biodiversité.
L'expédition a rassemblé un ensemble de compétences et d'expériences tout à fait exceptionnel, et
l'inventaire des mollusques et des crustacés décapodes a été particulièrement exhaustif ; les algues et les
poissons ont également fait l'objet de prélèvements soutenus ; les autres taxons (échinodermes,
péracarides, coraux) ont été plus superficiellement inventoriés. Une attention particulière a été apportée à
l'exploration de milieux particuliers et d'organismes requérant un échantillonnage ciblé : milieux
réducteurs (les bois coulés représentant un cas particulier) ; mangroves ; commensaux, associés et
parasites ; mollusques mésopsammiques ; nudibranches.
La partie profonde des récifs coralliens, au delà de 60 mètres et jusqu'à 150 mètres, est presque toujours
négligée dans les inventaires de biodiversité récifale à cause de son inaccessibilité. Au cours de Santo
2006, cette tranche bathymétrique a été explorée à la fois par des approches low tech (tramails et lumun
lumun) et high tech (plongées au mélange trimix et recycleur). La partie "récifs profonds" de Santo 2006
a d'ailleurs été particulièrement signalée par le Census of Marine Life au sein de son programme Census
of Coral Reefs ("CReefs").
Au total, 588 événements de collecte ont été réalisés : 76 sorties intertidales ; 188 prélèvements ciblés en
plongée ; 46 brossages ; 45 suceuses ; 37 tangle nets et lumun lumun ; 44 dragages côtiers ; 2 chalutages
côtiers ; 40 prélèvements quantitatifs (benne) ; 5 filières de nasses ; 105 dragages et chalutages hauturiers.
Quelques chiffres rendent compte de la richesse spécifique de cette partie de la province Indo-Pacifique :
- 1103 espèces de crustacés décapodes (603 crabes, 500 autres décapodes), dont environ 100
espèces nouvelles ; banque associée d'images d'animaux vivants pour les 2/3 des espèces.
- 3818-4044 espèces de mollusques (chiffre estimé fondé sur une projection à partir des
Terebridae et des Triphoridae) dont 380 nudibranches ; environ 1000 espèces nouvelles; banque
associée d'images d'animaux vivants représentant 2250 sujets et environ 1500 espèces.
- 486 espèces de poissons, dont 15 espèces nouvelles.
- 271 espèces d'algues.
Ces chiffres peuvent être mis en perspective en utilisant les coraux comme groupe indicateur, et il
apparait que la richesse spécifique à Santo est de même magnitude que dans le Coral Triangle (cidessous).
Malgré cette richesse en espèces du site d'étude, les participants n'ont paradoxalement pas été
particulièrement impressionnés par le foisonnement de la vie sur les récifs de Santo. En fait, (1) le milieu
est extrêment hétérogène et la plupart des espèces n'ont été échantillonnées qu'une seule, ou deux, fois ;
(2) comme ailleurs dans les écosystèmes tropicaux, la plupart des espèces sont démographiquement rares
ou très rares. Par exemple, sur un total de 588 événements de récolte, seulement 187 (32%) ont donné des
Triphoridae, et 28% des espèces de Triphoridae n'ont été échantillonnées que dans une (16%) ou deux
(12%) stations (Albano et al. 2011). Malgré un effort d'échantillonnage particulièrement élevé (23238
spécimens de Triphoridae), 21% des 259 espèces de Triphoridae ne sont représentées que par 1 ou 2
spécimens, autrement dit 0,3% des échantillons (77 specimens) représentent 21% de la diversité de la
famille. Au final, Santo n'est sans doute pas un site d'une richesse exceptionnelle, mais comme nous y
avons déployé une force de travail de dimension exceptionnelle il en est résulté un inventaire
exceptionnellement complet.
(2) Constitution de collections de nouvelle génération : collections moléculaires et photographie
numérique.
Un des résultats les plus remarquables de nos expéditions est la réconciliation de la taxonomie classique,
où les espèces ont été décrites sur la base de coquilles vides, et des approches modernes de la
systématique, fondée sur les animaux vivants. Nous avons maintenant optimisé l'effort de collecte et de
tri, où les échantillons sont triés par morpho-espèces au laboratoire immédiatement après le terrain,
chaque morpho-espèce faisant l'objet d'une photographie de l'animal vivant et d'une fixation pour le
séquençage moléculaire. Comme exemples de la nouvelle génération d'articles de systématique engendrés
par ce matériel, citons les descriptions de Frigidocardium helios Ter Poorten & Poutiers, 2009 [Bivalvia]
ou Iotyrris devoizei Kantor, Puillandre, Olivera & Bouchet, 2008 [Gastropoda], dont les holotypes (types
porte-nom) ont été séquencés avec succès, établissant un lien objectif entre un spécimen, un nom et une
séquence.
Avec plus de 5000 échantillons, la collection moléculaire de mollusques constituée pendant SANTO 2006
a suscité l'intérêt de nombreux chercheurs dans le monde. Ainsi, le travail de Holford et al. (2008) sur la
phylogénie moléculaire des gastéropodes Terebridae est fondée sur les séquences de 154 spécimens
appartenant à 64 espèces, dont respectivement 97 et 39 ont pour source l'expédition Santo 2006. La
collection moléculaire issue de l'expédition est l'une des collections phares retenues par la Fondation
Sloan pour le programme MarBoL (Marine Barcoding of Life) qui a bénéficié d'un financement
spécifique en 2008-2009. Au fur et à mesure du séquençage et de l'identification des vouchers, les
données recueillies lors de SANTO 2006 sont mises en ligne sur BOLD (Barcode of Life Database,
http://www.boldsystems.org/).
(3) Comparaison méthodologique
La comparaison méthodologique qui faisait partie des objectifs de la campagne a été un demi-succès /
demi-échec.
Du côté du succès, Fred Wells, qui a réalisé les "Rapid Assessments" de mollusques pour Conservation
International, a pu déployer à Santo la même approche. Il est intéressant de noter que les résultats obtenus
à Santo sont cohérents avec ceux obtenus ailleurs dans la même province biogéographique, mais
traduisent une richesse spécifique pratiquement inférieure d'un ordre de grandeur à celle résultant de
l'inventaire taxonomique de type "chaque espèce compte". Ces résultats sont à mettre en parallèle avec
l'effort de collecte et de tri derrière chaque type de résultat : l'inventaire taxonomique requiert un effort
pratiquement 100 fois supérieur à celui du Rapid Assessment. Cette comparaison ne porte pas de
jugement sur l'efficacité des deux approches. Il est clair que si l'objectif est d'évaluer les potentialités d'un
site en matière de conservation, alors seuls les Rapid Assessments permettent d'obtenir des résultats dans
un laps de temps compatible avec la prise de décision en matière de gestion environnementale. Par contre,
si l'objectif est de documenter des propriétés macroécologiques (rareté, endémisme, structure
dimensionnelle), alors l'approche de l'inventaire taxonomique de type "chaque espèce compte" est très
supérieure.
Le demi-échec est celui de l'inventaire quantitatif, malgré la présence d'un écologiste du calibre de John
Gray. En effet, nous avons réalisé rapidement que les fonds meubles de la région de Luganville étaient
trop grossiers pour permettre la mise en oeuvre de la benne, et nous avons dû nous rabattre sur des fonds
de 60-80 mètres, ce qui ne permettait plus de faire une comparaison avec les prélèvements qualitatifs faits
en plongée. Le décès de John Gray, moins d'un an après l'expédition, a également été un facteur
aggravant. Cette comparaison méthodologique reste donc à reprendre lors d'une prochaine expédition.
2838
~3000
~2500
~4000
~6000
~500
13
16
16
11
12
19
RAPID
ASSESSMENT
Koumac
Touho
Lifou
Santo
Panglao
Rapa
Journée-personnes
400
400
500
1200
1200
250
TOUTES
ESPECES
Espiritu Santo, Vanuatu
Northern Madagascar
Calamian Group, Philippines
Milne Bay, Papua New Guinea
Ashmore Reef
Montebello Islands
Nb espèces
Mollusques
572
525
651
643
433
633
Site
Tableau récapitulatif
Nombre
1
Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées
dans JCR (Journal Citation Reports )
2
3
Publications dans d’autres revues ou ouvrages scientifiques faisant référence dans le
domaine
Publications électroniques sur le réseau Internet
1
4
Publications sous forme de rapports techniques
0
5
Articles dans des revues ou journaux « grand public »
"beaucoup"
6
Communications dans des colloques internationaux
7
Communications dans des colloques nationaux
8
Nouvelles espèces (animales, végétales, microorganismes) décrites
non
comptabilisées
non
comptabilisées
34
9
Rapports de contrats (Union européenne, FAO, Convention, Collectivités …)
0
10
Applications (essais thérapeutiques ou cliniques, AMM …)
0
11
Brevets
0
12
Publications d’atlas (cartes, photos)
0
13
Documents vidéo-films
oui
14
DEA ou MASTER 2 ayant utilisé les données de la campagne
≥4
15
Thèses ayant utilisé les données de la campagne
≥5
16
Traitement des échantillons et des données
Si en cours, préciser et donner les échéances
Transmission au SISMER des données acquises avec les moyens communs du navire
en cours
17
Année n : 0
Année n+1 : 3
Année n+2 : 8
Année n+3 : 12
Année n+4 : 14
Année n+5 : 10
Année n+6 :
Année n+7 :
…
22
Oui
(NB : cette transmission est systématique dans le cadre des navires gérés par Genavir)
18
Transmission au SISMER de données autres que celles acquises avec les moyens
communs du navire
Transmission à d’autres banques de données
19
Transmission à d’autres équipes de données ou d’échantillons
20
Considérez-vous la publication des résultats terminée
Si en cours préciser et donner les échéances
Non
Oui
(GBIF, OBIS)
Oui
en cours
Fournir pour chacune des rubriques en classant année par année :
Rubriques 1 à 7 incluses : liste des publications et colloques avec les noms d’auteurs suivant la présentation en vigueur pour
les revues scientifiques.
Rubriques 8 à 13 : Liste des références des rapports, des applications, des brevets, atlas ou documents vidéo
Rubriques 14 et 15 : Nom et Prénom des étudiants, Laboratoire d’accueil. Sujet du DEA ou MASTER 2 ou de la thèse, Date de
soutenance
Rubriques 17 à 19 incluses : données transmises à des banques de données ou à des équipes auxquelles.
Rubrique 20 : Si la publication des résultats n’est pas terminée, pouvez-vous donner un échéancier ?
Références
R1 - Références des publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées dans JCR
(vérifier dans la base « Journal Citation Reports » via « ISI Web of Knowledge » si les revues sont bien référencées) et
résumés des principales publications. (Les classer par année).
Nota: les articles fondés essentiellement sur les résultats de la campagne SANTO 2006, y compris descriptions d'espèces
nouvelles, sont marquées d'une astérisque *. Les autres sont des articles qui utilisent des échantillons de Santo dans un
cadre plus large. J'ai mis un échantillonnage de résumés qui reflètent la diversité des types de résultats.
2007
FEDOSOV, A., 2007. Anatomy of accessory rhynchodeal organs of Veprecula vepratica and Tritonoturris subrissoides: new
types of foregut morphology in Raphitominae (Conoidea). Ruthenica, 17(1-2): 33-41.
*NG, P.K.L. & M.R. MANUEL-SANTOS, 2007. Establishment of the Vultocinidae, a new family for an unusual new genus
and new species of Indo-West Pacific crab (Crustacea: Decapoda: Brachyura: Goneplacoidea), with comments on the
taxonomy of the Goneplacidae. Zootaxa, 1558: 39-68.
ABSTRACT. A new family, Vultocinidae, is established for an unusual new genus and new species of crab (Crustacea:
Brachyura: Goneplacoidea) here described from relatively deep waters in the central Philippines and Vanuatu. Although
Vultocinus anfractus, new genus, new species, superficially resembles pilumnid genera like Lophoplax and pseudoziid genera
like Planopilumnus in its deeply sculptured carapace and leg surfaces, its male abdomen and gonopods appear to affiiliate it
with the Goneplacidae sensu lato instead. However, its suite of many unusual characters requires the recognition of a new
family for Vultocinus. Comparisons of the Vultocinidae with the Goneplacidae sensu stricto suggests that the subfamily
Mathildellinae, presently regarded as a subfamily, should be recognised as a full family; and two other problematic constituent
genera, Progeryon and Conleyus, are also referred to their respective families in the Goneplacoidea. The genus Paragalene is
also referred to the Progeryonidae. The extent of the sterno-abdominal cavity along the thoracic sternites, structure of the
posterior thoracic sternites, position of the press button of the male abdominal locking mechanism and form of the first four male
abdominal segment as characters in the taxonomy of the Goneplacoidea is also discussed.
*NG, P.K.L. & T. NARUSE, 2007, Liagore pulchella, a new species of xanthid crab (Crustacea: Decapoda: Brachyura) from
Vanuatu. Zootaxa, 1665: 53-60.
2008
HOLFORD M., PUILLANDRE N., TERRYN Y., CRUAUD C., OLIVERA B. & P. BOUCHET 2008. — Evolution of the
Toxoglossa venom apparatus as inferred by molecular phylogeny of the Terebridae. Mol. Biol. Evol. 25(12):1–11.
ABSTRACT. Toxoglossate marine gastropods, traditionally assigned to the families Conidae, Terebridae, and Turridae, are one
of the most populous animal groups that use venom to capture their prey. These marine animals are generally characterized by
a venom apparatus that consists of a muscular venom bulb and a tubular venom gland. The toxoglossan radula, often
compared with a hypodermic needle for its use as a conduit to inject toxins into prey, is considered a major anatomical
breakthrough that assisted in the successful initial radiation of these animals in the Cretaceous and early Tertiary. The
pharmacological success of toxins from cone snails has made this group a star among biochemists and neuroscientists, but
very little is known about toxins from the other Toxoglossa, and the phylogeny of these families is largely in doubt. Here we
report the first molecular phylogeny for the Terebridae and use the results to infer the evolution of the venom apparatus for this
group. Our findings indicate that most of the genera of terebrids are polyphyletic, and one species (‘‘Terebra’’ (s.l.) jungi) is the
sister group to all other terebrids. Molecular analyses combined with mapping of venom apparatus morphology indicate that the
Terebridae have lost the venom apparatus at least twice during their evolution. Species in the genera Terebra and Hastula have
the typical venom apparatus found in most toxoglossate gastropods, but all other terebrid species do not. For venomous
organisms, the dual analysis of molecular phylogeny and toxin function is an instructive combination for unraveling the larger
questions of phylogeny and speciation. The results presented here suggest a paradigm shift in the current understanding of
terebrid evolution, while presenting a road map for discovering novel terebrid toxins, a largely unexplored resource for
biomedical research and potential therapeutic drug development.
*KANTOR Y., PUILLANDRE N., OLIVERA B. & BOUCHET P. 2008. — Morphological proxies for taxonomic decision in
turrids (Mollusca, Neogastropoda): a test of the value of shell and radula characters using molecular data. Zoological Science
25: 1156-1170.
ABSTRACT. The state of the art of turrid (=Turridae s. l.) systematics is that shells — when they include the protoconch — are
reliable species-level identifiers, but inadequate proxies for allocation to genera or subfamilies. Generally, the radula is used for
allocation to a (sub)family, but the hypothesis that the radula is a more adequate proxy than the shell for relationships has not
yet been tested by molecular data. Species of Xenuroturris may have drastically different radulae, with either “semi-enrolled” or
“duplex” marginal teeth, although their shells are very similar or even almost indistinguishable. Molecular data confirm that
specimens with different types of radulae constitute different species, but two species of a pair with respectively semi-enrolled
and duplex teeth end up being not closely related. However, it is still unresolved whether species with semi-enrolled (=Iotyrris)
and duplex teeth (=Xenuroturris) form two supported monophyletic clades. Iotyrris devoizei n.sp. and I. musivum n.sp. are
described from Vanuatu, where they occur sympatrically with I. cingulifera and Xenuroturris legitima.
*McLAUGHLIN, P.A. & D.L. RAHAYU, 2008, A new genus and species of hermit crab of the family Paguridae (Crustacea:
Anomura: Paguroidea) from the Vanuatu Archipelago. Proceedings of the Biological Society of Washington, 121(3):365-373.
ABSTRACT. During a survey of the biodiversity of the southeastern part of Espiritu Santo, Vanuatu Archipelago, specimens of
a tiny but distinctive new hermit crab species, referable to a new genus, were discovered in the shallow waters off the island.
Herein, Pumilopagurus tuberculomanus new genus, new species, is described and illustrated. The genus is characterized by
the development of a massive right cheliped, more than 0.7 total body length; male with a short left sexual tube directed from
left to right across the ventral body surface and very short right sexual tube; and female with single left gonopore. Its relationship
to other pagurid genera of comparable small body size is discussed.
N'YEURT, A. & C. PAYRI, 2008. Sebdenia cerebriformis sp. nov. (Sebdeniaceae, Sebdeniales) from the south and western
Pacific Ocean. Phycological Research, 56(1): 13-20.
PUILLANDRE, N., SAMADI, S., BOISSELIER, M.-C., SYSOEV, A., KANTOR, Y., CRUAUD, C., COULOUX, A. &
BOUCHET, P., 2008. — Starting to unravel the toxoglossan knot: molecular phylogeny of the "turrids" (Neogastropoda:
Conoidea). Molecular Phylogenetics and Evolution 47 (2008): 1122-1134.
*PYLE, R.L., J.L. EARLE & B.D. GREENE, 2008, Five new species of the damselfish genus Chromis (Perciformes:
Labroidei: Pomacentridae) from deep coral reefs in the tropical western Pacific. Zootaxa, 1671: 3-31.
ABSTRACT. Five new species of the damselfish genus Chromis (Perciformes: Labroidei: Pomacentridae) are described from
specimens collected from deep (>60 m) coral-reef habitat in the western Pacific by divers using mixed-gas closed-circuit
rebreather gear. Two of the five new species (C. abyssus and C. circumaurea) are each described from specimens taken at a
single locality within the Caroline Islands (Palau and Yap, respectively); one (C. degruyi) is described from specimens collected
or observed throughout the Caroline Islands, and two (C. brevirostris and C. earina) are described from specimens collected
from several localities throughout the Caroline Islands, Fiji, and Vanuatu. All five species can easily be distinguished from other
known Chromis, and from each other, on the basis of color and morphology. These new species represent the first five scientific
names prospectively registered in the official ICZN ZooBank registry. Moreover, the electronic online edition of this document
has been specially formatted with many embedded links to additional resources available online via the internet to enhance
access to taxonomically-relevant information, and as a demonstra-tion of the utility of international standards for biodiversity
informatics.
RICHER DE FORGES, B. &. NG, P.K. L., 2008, New western Pacific records of Homolidae De Haan, 1839, with descriptions
of new species of Homolochunia Doflein, 1904, and Latreillopsis Henderson, 1888 (Crustacea: Decapoda: Brachyura),
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*BAMBER, R. N., 2009, Two new species of shell-inhabiting tanaidaceans (Crustacea, Peracarida, Tanaidacea,
Pagurapseudidae, Pagurapseudinae) from the shallow sublittoral off Vanuatu. Zoosystema, 31(3): 407-418.
ABSTRACT. Recent Pacific collections included numerous specimens of gastropod-shell inhabiting tanaidaceans of the
subfamily Pagurapseudinae, from shallow waters off Vanuatu (7 to 21 m depth). The two sympatric species present are new to
science, and are described herein. Pagurapseudes queirosi n. sp. is distinguished from other species with identical antennular
flagellum and uropod segmentation by having only two pairs of pleopods (the other species having at least three pairs), and a
large dorsal plumose seta, arising from a distinct tubercle on the merus of pereopod 1, inter alia. Macrolabrum mansoris n. sp.
has a characteristic rostrum morphology, and three segments in the main flagellum of the antennule (all other congeneric
species having either two or four segments).
*CASTRO, P., 2009.- Shallow-water Trapeziidae and Tetraliidae (Crustacea: Brachyura) of the Philippines (Panglao 2004
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*MACPHERSON, E., 2009, New species of squat lobsters of the genera Munida and Raymunida (Crustacea, Decapoda,
Galatheidae) from Vanuatu and New Caledonia. Zoosystema, 31(3): 431-451.
MATTIO, L., C. PAYRI & M. VERLAQUE, 2009. Taxonomic revision and geographic distribution of the subgenus
Sargassum (Fucales, Phaeophyceae) in the western and central Pacific Islands based on morphological and molecular
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*NEUSSER, T.P. & M. SCHRÖDL, 2009, Between Vanuatu tides: 3D anatomical reconstruction of a new brackish water
acochlidian gastropod from Espiritu Santo. Zoosystema, 31(3): 453-469.
ABSTRACT. The majority of known acochlidian sea slug species are marine mesopsammic, while some others are limnic. The
structural, functional and evolutionary background of the invasion of freshwater systems was hardly explored. During the
expedition SANTO 2006 to Espiritu Santo, Vanuatu, we discovered a unique new acochlidian species in a brackish water
habitat. Pseudunela espiritusanta n. sp. inhabits the underside of intertidal rocks deeply embedded into coarse sand, the
interstices of which are fi lled with a mixture of fresh subsoil and seawater. Pseudunela espiritusanta n. sp. is herein described
in full external and anatomical detail using computer-based 3-dimensional reconstruction techniques from serial histological
sections. Th is new species possesses a typical acochlidian central nervous and digestive system; it is a simultaneous
hermaphrodite with a special androdiaulic reproductive system and complex, stylet-bearing copulatory organs with associated
glands. Such penial features may indicate a relationship with marine mesopsammic Pseudunela (Pseudunelidae) species, while
e.g., the larger body size, the broad foot, and the presence of a special ventricular cell layer may be potential synapomorphies
with limnic, benthic Acochlidiidae (Strubellia and Acochlidiidae s.s.). Pseudunela espiritusanta n. sp. shares its special shape of
head tentacles with both Pseudunela and Strubellia, while other characters are potentially synapomorphic with either one or the
other taxon. Regardless of its unresolved exact systematic position, Pseudunela espiritusanta n. sp. evidently links marine and
limnic taxa by its intermediate ecological and morphological features. Its considerable body size and well-developed heart and
kidney can be considered as preadaptations to overcome osmotic challenges when colonising rivers from brackish coastal
sands.
N'YEURT, A. & C. PAYRI, 2009. Four new species of Rhodophyceae from Fiji, Polynesia and Vanuatu, South Pacific.
Phycological Research, 57(1): 12-24.
ABSTRACT. Four new species of Rhodophyceae are described from the South Pacific, with type localities in Fiji, French
Polynesia and Vanuatu. Chondria bullata from the Tuamotus (French Polynesia), Vanuatu, Palmerston Atoll (Cook Islands) and
Fiji is unique owing to its nonconstricted axes with markedly protruding, bubble-like cortical cells. Halymenia nukuhivensis, from
the Marquesas Islands in French Polynesia, is distinguished from others in the genus by its dichotomous, papery blades issued
from a strap-shaped basal region, and the equal proportion of anti-clinal, periclinal and oblique filaments in its medullary layer.
Jania articulata, so far known only from the Tuamotus in French Polynesia and Manihiki in the Northern Cook Islands,
superficially resembles the genus Amphiroa with its articulated branches with numerous genicula between successive
dichotomies, and its large axis diameter. Meristotheca peltata from the Fiji Islands is unique among the genus by its distinctly
peltate, erect habit. The recent high number of newly described species from the South Pacific region emphasizes the need for
more in-depth surveys, particularly in deeper outer reef slope habitats, which remain for the most part unexplored and could
yield particularly interesting new taxa or distributional records.
OLIVERIO M., BARCO A., RICHTER A., MODICA M. V., 2009. The coralliophiline radiation: repeated colonizations into
the deep? The Nautilus 123(3): 113-120.
PAYRI, C. & H. VERBRUGGEN, 2009. Pseudocodium mucronatum, a new species from New Caledonia, and an analysis of
the evolution of climatic preferences in the genus (Bryopsidales, Chlorophyta). Journal of Phycology, 45(4): 953-961.
RICHER DE FORGES, B. &. NG, P.K. L., 2009, New genera, new species and new records of Indo-West Pacific spider crabs
(Crustacea: Brachyura: Epialtidae: Majoidea). Zootaxa, 2025: 1-20.
2010
BARCO, A., M. CLAREMONT, D.G. REID, R. HOUART, P. BOUCHET, S.T. WILLIAMS, C. CRUAUD, A. COULOUX
& M. OLIVERIO, 2010. A molecular phylogenetic framework for the Muricidae, a diverse family of carnivorous
gastropods. Molecular Phylogenetics and Evolution, 56: 1025-1039.
*CABEZAS, P., E. MACPHERSON & A. MACHORDOM, 2010. Taxonomic revision of the genus Paramunida Baba, 1988
(Crustacea: Decapoda: Galatheidae): a morphological and molecular approach. Zootaxa, 2712: 1-60.
*CASTRO, P., 2010.- A new species and new records of palicoid crabs (Crustacea, Decapoda, Brachyura, Palicoidea,
Palicidae, Crossotonotidae) from the Indo-West Pacific region. Zoosystema, 32(1): 73-86.
CASTRO, P. & P.K.L. NG, 2010. Revision of the family Euryplacidae Stimpson, 1871 (Crustacea: Decapoda: Brachyura:
Goneplacoidea). Zootaxa, 2375: 1-130.
CHAN, T.Y., H.C. LEI, C.P. LI & K.H. CHU, 2010. Phylogenetic analysis using rDNA reveals polyphyly of Oplophoridae
(Decapoda: Caridea). Invertebrate Systematics, 24(2): 172–181.
*CLARK, P.F. & P.K.L. NG, 2010. Description of the first zoea of Domecia glabra Alcock, 1899 (Crustacea: Brachyura,
Domeciidae) and implications for the systematics of Trapezioidea. Proceedings of the Biological Society of Washington,
123(4): 258–273.
ABSTRACT. The first zoeal stage of the heterotreme domeciid crab Domecia glabra Alcock, 1899 (Trapezioidea), an obligate
symbiont on hard corals, is described for the first time on the basis of laboratory-hatched material from Vanuatu. Its morphology
is compared to other known zoeae of the Trapeziidae and Tetraliidae. The first stage zoea bears a remarkable similarity to
larvae of the thoracotrematous Pinnotheridae, but the resemblance is superficial as their antennal morphologies are different.
The key characters of Domecia ally it most closely with Tetralia in the Trapezioidea and supports molecular studies that they are
sister taxa. Unfortunately, the zoeal and DNA studies do not give conclusive evidence with regard to whether the Domeciidae is
truly trapezioid.
MARTIN LESCANNE J., ROUSSEAU F., REVIERS B., PAYRI C., COULOUX A., CRUAUD C. & LE GALL L., 2010.
Phylogenetic analyses of the Laurencia complex (Rhodomelaceae, Ceramiales) support recognition of five genera:
Chondrophycus, Laurencia, Osmundea, Palisada, and Yuzurua stat. nov. European Journal of Phycology 45 (1): 51-61.
MATTIO, L., C. PAYRI & M. VERLAQUE & B. DE REVIERS, 2010. Taxonomic revision of Sargassum sect.
Acanthocarpicae (Fucales, Phaeophyceae). Taxon, 59 (3): 896–904.
OLIVERIO M., MODICA M. V., 2010. Relationships of the haematophagous marine snail Colubraria (Rachiglossa:
Colubrariidae), within the neogastropod phylogenetic framework. Zoological Journal of the Linnean Society, 158: 779-800.
ABSTRACT. The gastropod genus Colubraria includes marine shallow-water species from tropical, subtropical, and temperate
rocky coral environments. At least six species are known to feed on fish blood. Although there is general consensus in placing
Colubraria in the Neogastropoda, the actual relationships and the systematic position of Colubraria and related genera are
unknown. This is partly the consequence of the lack of a clear phylogenetic framework for the Neogastropoda. This study
attempts to propose a phylogenetic framework for the Neogastropoda, by testing: (1) a preliminary phylogenetic arrangement for
a large number of recognized neogastropod families; (2) the position of Colubraria within the neogastropods; and (3) the
relationships of Colubraria within one of the major neogastropod lineages. We used two different molecular data sets. The first
set included representatives of at least 14 neogastropod families, for points (1) and (2), and was based on mitochondrial (16S,
12S, and cytochrome oxidase subunit I, COI) and nuclear (28S) DNA sequences, giving a total of 3443 aligned positions. The
second data set, for point (3), included 30 buccinoid sequences from mitochondrial 16S, giving a total of 1029 aligned positions.
We also studied the anatomy of the type species of Colubraria and compared it with other neogastropods within the new
phylogenetic framework. The results included the first phylogeny of the neogastropod based on 50% of the recognized families.
This clearly indicated that the nematoglossan Cancellariidae represent a basal offshoot of the monophyletic Neogastropoda,
and that the toxoglossan Conoidea are the sister group to the Rachiglossa. Within the Rachiglossa, a colubrariid clade, worthy
of family ranking, showed clear buccinoid affinities. Most of the anatomy of Colubraria is congruent with a buccinoid model. The
peculiar anatomical features that do not conform to the buccinoid model seem to be related to the evolution of haematophagous
feeding.
PUILLANDRE, N., A. V. SYSOEV, B. M. OLIVERA, A. COULOUX & P. BOUCHET, 2010. Loss of planktotrophy and
speciation: geographical fragmentation in the deep-water gastropod genus Bathytoma (Gastropoda, Conoidea) in the western
Pacific. Biodiversity and Systematics, 8(3): 371-394.
ABSTRACT. Dispersal capabilities are crucial in how speciation patterns are determined in marine invertebrates. Species
possessing a long-living planktonic larva apparently have a dispersal advantage over those with non-planktotrophic
development, and their distant populations may exchange genetic material, maintaining a broad geographical range for the
species. Recent species of the gastropod genus Bathytoma (Conoidea) are all characterized by non-planktotrophic
development, having most probably lost a free-swimming larva in the pre-Pliocene, as Miocene fossils have protoconchs
indicating planktotrophic larval development. All have a bathyal distribution (100–1500 m), which implies that their capability for
direct expansion on the bottom is restricted by both deep-sea basins and shallow-water areas, especially in insular West and
South-West Indo-Pacific. Therefore, it can be hypothesized that Bathytoma populations should represent numerous, mostly
allopatric taxa restricted to a single or contiguous island groups. We tested this hypothesis using molecular and morphological
characters independently. One hundred and thirty-eight specimens from the Philippines, Solomons, Vanuatu, and the Coral Sea
were sequenced for one mitochondrial (COI) and one nuclear (ITS2) gene, and 14 operational molecular units were recognized.
When these molecular units are overlaid over shell characters, 13 species (11 unnamed) and one form of uncertain status are
recognized: three occur in the Philippines, six in the Solomons and one in New Caledonia. Broad distributions (interarchipelagic) are uncommon (three species). On the whole, the phylogeographic pattern of the diversity in the genus is rather
complex and probably also reflects processes of sympatric and fine-scale allopatric speciation, and local extinctions. The eleven
new species are described and named.
SHIH, H.-T., T. NARUSE & P.K.L. NG, 2010, Uca jocelynae sp. nov., a new species of fiddler crab (Crustacea: Brachyura:
Ocypodidae) from the Western Pacific. Zootaxa 2337: 47–62.
VOLLAND, J.M., L. FRENKIEL, D. ALDANA ARANDA & O. GROS, 2010, Occurrence of Sporozoa-like microorganisms
in the digestive gland of various species of Strombidae. Journal of Molluscan Studies, 76: 196-198.
WILLIAMS, S.T., K.M. DONALD, H.G. SPENCER & T. NAKANO, 2010, Molecular systematics of the marine gastropod
families Trochidae and Calliostomatidae (Mollusca: Superfamily Trochoidea). Molecular Phylogenetics and Evolution,
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*YANG, C.W., T.Y. CHAN and K.H. CHU, 2010, Two new species of the “Heterocarpus gibbosus Bate, 1888” species group
(Crustacea: Decapoda: Pandalidae) from the western Pacific and north-western Australia. Zootaxa. 2372: 206-220.
2011
*ALBANO, P., B. SABELLI & P. BOUCHET, 2011. The challenge of small and rare species in marine biodiversity surveys:
microgastropod diversity in a complex tropical coastal environment. Biodiversity and Conservation, 20: 3223-3237.
ABSTRACT. Although molluscs feature prominently in the semi-popular and academic literature on marine biodiversity, field
surveys largely ignore the small and rare species that form the majority of marine molluscan diversity. As a result of a massive
effort to sample the benthic molluscs of a complex tropical coastal environment, 23,238 gastropod specimens representing 259
species of Triphoridae—a family with most adult species ranging from 2 to 10 mm—were obtained from a 45,000 hectares study
area off the island of Espiritu Santo, Vanuatu. Most species are represented by fewer than 20 specimens and, despite the
intensity of the sampling effort, 13% of the species are unique singletons. Spatial heterogeneity was high: out of 416 sampling
events, 187 contained triphorids, and 42% of the species occurred at fewer than 5 stations. Most species were small (68%
below 5 mm) or very small (22% below 3 mm). A faunal turnover was documented at around 10 m, and another at around 60 m,
at the onset of the ‘‘twilight zone’’ that is particularly difficult to sample. On the order of 70% of the species are probably new to
science. When dealing with taxonomically difficult groups a morphospecies segregation approach is operationally appropriate to
detect patterns of richness, rarity and spatial turn-over. Very few, if any, conservation surveys have the human and funding
resources to carry out baseline surveys of the intensity that generated the results presented here. However, as species
numbers are often used to promote the conservation interest of a reef, a bay or a stretch of coast, it is essential to know how the
numbers were generated: absolute numbers of species are meaningless unless sampling effort and techniques, area surveyed,
and size classes targeted are described. This is very rarely the case, even in the academic literature.
BOUCHET, P., Y. KANTOR, A. SYSOEV & N. PUILLANDRE, 2011. A new operational classification of the Conoidea
(Mollusca, Gastropoda). Journal of Molluscan Studies, 77: 273-308.
*CABEZAS, P., E. MACPHERSON & A. MACHORDOM, 2011. Allogalathea (Decapoda: Galatheidae): a monospecific
genus of squat lobster? Zoological Journal of the Linnean Society, 162: 245–270.
ABSTRACT. The genus Allogalathea was established by Baba in 1969 to include the well-known species Galathea elegans.
This species is widely distributed across the Indo-West Pacific Ocean, and is characterized by living in close association with
crinoids, and by its conspicuous coloration. Although the genus is considered monospecific, different colour patterns and
discrete morphological variations mainly associated with the rostrum and chelipeds have been reported. These differences
could point to cryptic species, thereby questioning Allogalathea as a monotypic taxon. To address this issue, we sequenced the
mitochondrial cytochrome oxidase I (COI; 658 bp) and 16S rRNA (882 bp) genes and the nuclear gene phosphoenolpyruvate
carboxykinase (PEPCK; 598 bp) in numerous specimens from eight different localities, and also examined their morphological
characters. DNA sequences were analysed using maximum-parsimony, maximum-likelihood, and Bayesian approaches of
phylogenetic inference. The resulting trees were combined with morphological evidence to test species boundaries. Our
molecular data revealed four deeply divergent clades, which can be distinguished by subtle morphological differences in the
spinulation and length : breadth ratio of the P1 carpus, spinulation of the walking legs, and shape of the rostrum. Our findings
indicated that Allogalathea elegans is in fact a species complex comprising four different species, which, although genetically
very distinct, are morphologically very similar. We provide morphological descriptions and a key to these four species of the
genus.
CLAREMONT, M., D.G. REID & S.T. WILLIAMS, 2011, Evolution of corallivory in the gastropod genus Drupella. Coral
Reefs, 30: 977–990.
KOMATSU, H. & P.K.L. NG, 2011, Kabutos, a new genus for the western Pacific leucosiid crab, Merocryptus durandi
Serène, 1955 (Crustacea: Decapoda: Brachyura). Zootaxa, 2881: 31–38.
LAI, J.C.Y., J.C.E. MENDOZA, D. GUINOT, P.F. CLARK & P.K.L. NG, 2011, Xanthidae MacLeay, 1838 (Decapoda:
Brachyura: Xanthoidea) systematics: A multi-gene approach with support from adult and zoeal morphology. Zoologischer
Anzeiger, 250: 407–448.
ABSTRACT. Currently, 13 subfamilies are recognised in the brachyuran family Xanthidae: Actaeinae, Antrocarcininae,
Chlorodiellinae, Cymoinae, Etisinae, Euxanthinae, Kraussiinae, Liomerinae, Polydectinae, Speocarcininae, Xanthinae,
Zalasiinae and Zosiminae. This classification has been based on shared adult features like a transversely ovate carapace, well
defined dorsal carapace regions, usually with lateral dentition, stout chelipeds and relatively short ambulatory legs. Such
characters are now considered to be convergent. Consequently a number of higher xanthid taxa may be artifical and not
monophyletic. A broad sample of 147 xanthid species representing 75 out of 124 genera from all 13 xanthid subfamilies were
sampled in a multi-gene analysis. Four markers (three mitochondrial and one nuclear) were used and yielded a tree with ca. 30
xanthid clades. Monophyletic support was demonstrated for the Antrocarcininae (although substantially redefined), Cymoinae,
and Polydectinae. Almost every other subfamily was para- or polyphyletic. Furthermore, the two other families of the
Xanthoidea, Pseudorhombilidae and Panopeidae, were found nested within the Xanthidae. The molecular results were
consistent with phylogenetic relationships implied by a suite of novel and/or neglected “ventral” adult characters including
sternal characters, position of genital openings and morphology of the first zoea, instead of “dorsal” characters traditionally used
to infer xanthid relationships.
MODICA, M.V., P. BOUCHET, C. CRUAUD, J. UTGE & M. OLIVERIO, 2011. Molecular phylogeny of the nutmeg shells
(Neogastropoda, Cancellariidae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 59(3): 685-697.
*NEUSSER, T.P., K.M. JÖRGER & M. SCHRÖDL, 2011, Cryptic species in tropic sands - Interactive 3D anatomy,
molecular phylogeny and evolution of meiofaunal Pseudunelidae (Gastropoda, Acochlidia). PLoS ONE, 6(8): e23313.
doi:10.1371/journal.pone.0023313
ABSTRACT. Background Towards realistic estimations of the diversity of marine animals, tiny meiofaunal species usually are
underrepresented. Since the biological species concept is hardly applicable on exotic and elusive animals, it is even more
important to apply a morphospecies concept on the best level of information possible, using accurate and efficient methodology
such as 3D modelling from histological sections. Molecular approaches such as sequence analyses may reveal further, cryptic
species. This is the first case study on meiofaunal gastropods to test diversity estimations from traditional taxonomy against
results from modern microanatomical methodology and molecular systematics. Results The examined meiofaunal Pseudunela
specimens from several Indo-Pacific islands cannot be distinguished by external features. Their 3D microanatomy shows
differences in the organ systems and allows for taxonomic separation in some cases. Additional molecular analyses based on
partial mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) and 16S rRNA markers revealed considerable genetic structure that
is largely congruent with anatomical or geographical patterns. Two new species (Pseudunela viatoris and P. marteli spp. nov.)
are formally described integrating morphological and genetic analyses. Phylogenetic analysis using partial 16S rRNA, COI and
the nuclear 18S rRNA markers shows a clade of Pseudunelidae species as the sister group to limnic Acochlidiidae. Within
Pseudunela, two subtypes of complex excretory systems occur. A complex kidney already evolved in the ancestor of
Hedylopsacea. Several habitat shifts occurred during hedylopsacean evolution. Conclusions Cryptic species occur in tropical
meiofaunal Pseudunela gastropods, and likely in other meiofaunal groups with poor dispersal abilities, boosting current diversity
estimations. Only a combined 3D microanatomical and molecular approach revealed actual species diversity within Pseudunela
reliably. Such integrative methods are recommended for all taxonomic approaches and biodiversity surveys on soft-bodied and
small-sized invertebrates. With increasing taxon sampling and details studied, the evolution of acochlidian panpulmonates is
even more complex than expected.
PUILLANDRE N., C.P. MEYER, P. BOUCHET & B.M. OLIVERA, 2011. Genetic divergence and geographic variation in
the deep-water Conus orbignyi complex (Mollusca: Conoidea). Zoologica Scripta, 40(4): 350-363.
ABSTRACT. The cone snails (family Conidae) are a hyperdiverse lineage of venomous gastropods. Two standard markers,
COI and ITS2, were used to define six genetically divergent groups within a subclade of Conidae that includes Conus orbignyi;
each of these was then evaluated based on their shell morphology. We conclude that three forms, previously regarded as
subspecies of C. orbignyi are distinct species, now recognized as C. orbignyi, C. elokismenos and C. coriolisi. In addition, three
additional species (C. pseudorbignyi, C. joliveti and C. comatosa) belong to this clade. Some of the proposed species (e.g. C.
elokismenos) are possibly in turn complexes comprising multiple species. Groups such as Conidae illustrate the challenges
generally faced in species delimitation in biodiverse lineages. In the case of C. orbignyi complex, they are not only definable,
genetically divergent lineages, but also considerable geographical variation within each group. Our study suggests that an
intensive analysis of multiple specimens within a single locality helps to minimize the confounding effects of geographical
variation and can be a useful starting point for circumscribing different species within such a confusing complex.
PUILLANDRE, N., Y. KANTOR, A. SYSOEV, A. COULOUX, C. MEYER, T. RAWLINGS, J. TODD, & P. BOUCHET,
2011. The dragon tamed? A molecular phylogeny of the Conoidea (Mollusca, Gastropoda). Journal of Molluscan Studies,
77: 259-272.
2012 et sous presse
CASTELIN, M., N. PUILLANDRE, Yu. I. KANTOR, Y. TERRYN, C. CRUAUD, P. BOUCHET & M. HOLFORD.
Macroevolution of venom apparatus innovations in auger snails (Gastropoda; Conoidea; Terebridae). Molecular
Phylogenetics and Evolution
CLAREMONT M., D.G. REID D.G. & S.T. WILLIAMS, 2012. Speciation and dietary specialization in Drupa, a genus of
predatory marine snails (Gastropoda: Muricidae). Zoologica Scripta 41: 137-149.
KANTOR, Yu.I., N. PUILLANDRE, A. RIVASSEAU & P. BOUCHET.. Neither a buccinid nor a turrid: A new family of
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Le Guyader & O. Pascal (eds), The Natural History of Santo. Patrimoines Naturels, 70: 458-464.
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NG. 2011. Focus on selected biota: Unusual and spectacular crustaceans. In: P. Bouchet, H. Le Guyader & O. Pascal (eds), The
Natural History of Santo. Patrimoines Naturels, 70: 410-420.
FRICKE R., J.L. EARLE, R.L. PYLE & B. SERET. 2011. Focus on selected biota: Checklist of the fishes. In: P. Bouchet, H.
HOEKSEMA B.W. & A. GITTENBERGER. 2011. The position of Santo in relation to the centre of maximum marine
biodiversity (the Coral Triangle). In: P. Bouchet, H. Le Guyader & O. Pascal (eds), The Natural History of Santo. Patrimoines
Naturels, 70: 369-372.
KANO Y. & T. HAGA. 2011. Focus on selected (micro)habitats: Sulfide rich environments. In: P. Bouchet, H. Le Guyader &
O. Pascal (eds), The Natural History of Santo. Patrimoines Naturels, 70: 373-374.
NEUSER T. 2011. Focus on selected (micro)habitats: Marine interstitial. In: P. Bouchet, H. Le Guyader & O. Pascal (eds), The
Natural History of Santo. Patrimoines Naturels, 70: 375-376.
PAYRI C. 2011. Benthic algal and seagrass communities from Santo Island in relation to habitat diversity. In: P. Bouchet, H.
PLAZIAT J.C. & P. LOZOUET. 2011. Focus on selected (micro)habitats: Mangrove environments of South East Santo. In: P.
Bouchet, H. Le Guyader & O. Pascal (eds), The Natural History of Santo. Patrimoines Naturels, 70: 377-382.
SCHIAPARELLI S., C. FRANSEN & M. OLIVERIO. 2011. Focus on selected biota: Marine partnerships in Santo's reef
environments. Parasites, commensals and other organisms that live in close association. In: P. Bouchet, H. Le Guyader & O.
Pascal (eds), The Natural History of Santo. Patrimoines Naturels, 70: 449-457.
WAREN A. 2011. Focus on selected biota: Molluscs on biogenic substrates. In: P. Bouchet, H. Le Guyader & O. Pascal (eds),
The Natural History of Santo. Patrimoines Naturels, 70: 438-448.
WELLS F. 2011. Focus on selected biota: A Rapid Assessment of the marine molluscs of southeastern Santo. In: P. Bouchet,
H. Le Guyader & O. Pascal (eds), The Natural History of Santo. Patrimoines Naturels, 70: 431-437.
Articles sur l'expédition elle-même
BOUCHET, P., H. LE GUYADER & O. PASCAL, 2008. Des voyages de Cook à l'expédition Santo 2006 : un renouveau des
explorations naturalistes des iles du Pacifique. Journal de la Société des Océanistes, 126-127: 167-185.
BOUCHET, P., H. LE GUYADER & O. PASCAL, 2009. The SANTO 2006 Global Biodiversity Survey: an attempt to
reconcile the pace of taxonomy and conservation. Zoosystema, 31(3): 401-406.
FAUGERE, E., 2008. - L’exploration contemporaine de la biodiversité. Approche anthropologique de l’expédition Santo 2006.
Journal de la Société des Océanistes, 126-127: 195-206.
ROBILLARD, M., 2008.- Perception plurielle de la biodiversité de Santo: scientifiques et Ni-van, un double regard. Journal
de la Société des Océanistes, 126-127: 221-229.
R3 – Références des publications électroniques sur le réseau Internet. (Les classer par année).
N’YEURT, A. & PAYRI, C.E. 2007. Etude de la collection d’algues marines de l’île de Santo, Vanuatu.
www.crisponline.net/Portals/1/PDF/ENG-Algae-Santo-Vanuatu.pdf
R5 – Références des articles parus dans des revues ou des journaux « grand public ». (Les classer par
année).
Diffusion des résultats et Communication
www.santo2006.org
Site officiel de la mission, conçu, mis à jour et animé par ATOM. Il est composé de 3 volets : un Espace
Scientifique, un Espace Pédagogique et un Espace Grand Public.
[Le site n'est plus actif depuis 2009]
http://www.ird.fr/recherche/santo2006/blog/
Blog bilingue français-anglais consacré spécifiquement aux résultats du module Biodiversité Marine.
Créé et alimenté depuis Santo par l’un des participants (Adriaan Gittenberger), il a fourni
quotidiennement des "histoires" illustrées à caractère scientifique. En 2006-2007, ce blog a également été
accessible à partir du site du Census of Marine Life (www.coml.org).
http://santo2006.ens-lyon.fr/
Au sein de ce site pédagogique, en français, destiné à valoriser l'expédition en direction des enseignants et
des classes du primaire et secondaire, http://santo2006.ens-lyon.fr/donnees/biodivmarine est
spécifiquement consacré au module Biodiversité Marine.
[Site inactif depuis 2009]
Presse. Le Module marin, comme l’ensemble du Projet Santo 2006, aura bénéficié d’une importante
couverture médiatique avant et pendant les opérations sur le terrain. Entre juin et fin novembre 2006, plus
de 30 articles de journaux ont été consacrés à Santo 2006, en France comme à l’étranger, et de
nombreuses courtes émissions de radios ont été réalisées, dont certaines en duplex avec l’île de Santo.
On relève en particulier:
AFP 29/06/2006 Santo 2006 : une expédition qui se veut modèle sur le plan éthique
Environnement-online.com 30/06/2006 Santo 2006 : cap sur l’île-planète
Euréka n°6 juillet/août/septembre, les Aventuriers de la Biodiversité
L’Humanité 03/07/2006 Cap sur Santo, mine d’or de la biodiversité
Environnement & stratégies 07/07/2006 « Ne pas avoir de vision utilitariste de la biodiversité »
Le Figaro 08/07/2006 Cap sur la biodiversité de l’île de Santo
Vanuatu Daily News 12/09/2006 Marine scientific research targets survey from sea bottom to ridge crests
GEO n°332 octobre 2006 Santo: une île échantillon exceptionnelle!
Un "Point Contact" au Palais de la Découverte a été inauguré le 5 octobre 2006 par le Ministre Délégué à
l’Enseignement Supérieur et à la Recherche et le Directeur du Muséum national d’Histoire naturelle. En
2006, ce Point Contact a fonctionné tous les jours, et a permis au public de s’informer sur le déroulement
de la mission.
Posters. Une série de 10 posters destinée aux écoles et associations du Vanuatu, a été imprimée avec le
soutien de la Commission Européenne au Vanuatu. Les textes en bislama (la langue véhiculaire du
Vanuatu), en français et en anglais, présentent quelques résultats marquants de l'expédition, et font passer
des messages plus généraux sur la biologie, l'écologie et le développement durable.
Ouvrage grand public.
TARDIEU V. & L. BARNEOUD 2007. Santo. Les explorateurs de l'île planète. Belin, Paris. 288 pp.
R6 – Références des communications dans des colloques internationaux. (Les classer par année).
Je ne les ai pas recensées.
R7 – Références des communications dans des colloques nationaux. (Les classer par année).
Je ne les ai pas recensées.
R8 – Références des nouvelles espèces (animales, végétales, microorganismes) décrites, lieux où sont
déposés les holotypes.
Vertebrata
Chromis brevirostris Pyle, Earle & Greene, 2008 [Pisces; holotype from Caroline Is]
Chromis earina Pyle, Earle & Greene, 2008 [Pisces]
Echinodermata
Asterodiscides bicornutus Lane & Rowe, 2009
Mollusca
Frigidocardium helios Ter Poorten & Poutiers, 2009 [Bivalvia]
Iotyrris devoizei Kantor, Puillandre, Olivera & Bouchet, 2008 [Gastropoda]
Iotyrris musivum Kantor, Puillandre, Olivera & Bouchet, 2008 [Gastropoda]
Lienardia roseangulata Fedosov, 2011 [Gastropoda]
Myurella lineaperlata Holford & Terryn, 2008 [Gastropoda]
Pseudunela espiritusanta Neusser & Schrödl, 2009 [Gastropoda]
Pseudunela marteli Neusser, Jörger & Schrödl, 2011 [Gastropoda]
Strioterebrum illustre Malcolm & Terryn, 2012 [Gastropoda]
Zebina striaticallosa Faber, 2011 [Gastropoda]
Crustacea
Allogalathea babai Cabezas, Macpherson & Marchordom, 2011 [holotype from New Caledonia]
Allogalathea inermis Cabezas, Macpherson & Marchordom, 2011 [holotype from New Caledonia]
Euclosiana guinotae Galil & Ng, 2010 [Decapoda]
Liagore pulchella Ng & Naruse, 2007 [Decapoda]
Macrolabrum mansoris Bamber, 2009 [Tanaidacea]
Munida jubata Macpherson, 2009 [Decapoda]
Munida mica Macpherson, 2009 [Decapoda]
Munida pauxilla Macpherson, 2009 [Decapoda]
Munida squarrosa Macpherson, 2009 [Decapoda]
Pagurapseudes queirosi Bamber, 2009 [Tanaidacea]
Pumilopagurus tuberculomanus McLaughlin & Rahayu, 2008 [Decapoda]
Petrarctus holthuisi Yang, Chen & Chan, 2008 [Decapoda; holotype from the Philippines]
Raymunida vittata Macpherson, 2009 [Decapoda]
Sadayoshia inermis Macpherson & Baba, 2010 [Decapoda: holotype from Solomon Is]
Sadayoshia lipkei Macpherson & Baba, 2010 [Decapoda: holotype from Austral Is]
Sadayoshia tenuirostris Macpherson & Baba, 2010 [Decapoda: holotype from Solomon Is]
Serpenthusa brucei Naruse, Castro & Ng, 2009 [Decapoda]
Uca jocelynae Shih, Naruse & Ng, 2010 [Decapoda; holotype from Taiwan]
Vultocinus anfractus Ng & Manuel-Santos, 2007 [Decapoda; holotype from the Philippines]]
Algae
Chondria bullata N'Yeurt & Payri, 2009 [holotype from Tuamotus]
Pseudocodium mucronatum Payri & Herbruggen, 2009 [holotype from New Caledonia]
Sebdenia cerebriformis N'Yeurt & Payri, 2008 [holotype from Fiji]
Sauf exceptions, holotypes déposés au MNHN (animaux) et herbier de Nouméa (algues).
R13 – Liste des documents vidéo-films. (Les classer par année).
Un long métrage produit par Atom Productions.
R14 – DEA ou MASTER 2 ayant utilisé les données de la campagne (Nom et Prénom de l’étudiant, Laboratoire
d’accueil. Sujet du DEA ou MASTER ou de la thèse, Date de soutenance)
Compte tenu du nombre de participants à terre, je n'ai certainement pas connaissance de tous les masters ayant
utilisé les données de la campagne. J'ai listé ci-dessous uniquement ceux encadrés par moi ou soutenus au sein
de l'unité à laquelle j'appartiens.
M2: Amandine AVILES, Sciences Po. Sujet: Retour sur l'expédition Santo 2006 [Analyse de la communication sur
l'expédition]. Soutenance 2010.
M2: Julien BRISSET, UMS 2700. Barcoding moléxculaire des poissons de Santo 2006. Soutenance 2008.
M2: Julie MARTIN LESCANNE, UMR 7138, Sujet: Phylogénie et biogéographie des morphotypes du complexe
Laurencia (Ceramiales, Rhodophyta). Soutenance 2009.
R15 – Thèses ayant utilisé les données de la campagne (Nom et Prénom de l‘étudiant, Laboratoire d’accueil. Sujet du
DEA ou MASTER ou de la thèse, Date de soutenance)
Compte tenu du nombre de participants à terre, je n'ai certainement pas connaissance de toutes les thèses ayant
utilisé les données de la campagne. J'ai listé ci-dessous uniquement celles encadrées par moi ou soutenues au
sein de l'unité à laquelle j'appartiens.
Thèse : Paolo ALBANO, Université de Bologna, Italie, Labo. di Zoologia. Sujet: Biodiversité des
microgastéropodes d'un écosystème corallien. Thèse à soutenir en 2011.
Thèse : Lucie BITTNER, UMR 7138. Sujet: Phylogénie des Corallinales (Rhodophyta) et analyse de leur diversité
génétique dans le Pacifique Sud. Thèse soutenue en 2009.
Thèse : Lydiane MATTIO, UMR 7138/IRD. Sujet: Taxonomie du genre Sargassum (Fucales, Phaeophyceae) en
Nouvelle-Calédonie et dans le Pacifique Sud. Approches morphologique et moléculaire. Thèse soutenue en 2010.
Thèse : Nicolas PUILLANDRE, UMR7138. Sujet: Diversité des gastéropodes marins : morphospecies et
barcoding des Turridae. Thèse 2005-2008 (soutenue).
R16 – Traitements des échantillons et des données en cours (types et échéances)
R1, R18 et R19 – Liste des données et échantillons transmis (Préciser les destinataires, SISMER, autres
banques, équipes scientifique …)
R20 – Liste des résultats restant à publier - échéance
Aujourd'hui, 6 ans après la phase de terrain, je considère que le bilan de synthèse de l'expédition s'achève avec la
sortie du Natural History of Santo. Pour autant, l'exploitation taxonomique d'une campagne océanographique dans
la province tropicale Indo-Pacifique n'est jamais achevée. Une analyse des espèces nouvelles marines publiées
dans le monde au cours des années 2000 montre qu'il se passe en moyenne 12 ans (médiane 9 ans) entre la
collecte du premier échantillon d'une espèce nouvelle sur le terrain et sa publication dans la littérature scientifique.
Les 34 espèces nouvelles publiées à ce jour ne représentent donc que la partie émergée de l'iceberg de la
valorisation de l'expédition. Notre équipe anime un important réseau international de systématiciens qui continuent
à travailler sur les échantillons collectés pendant Santo 2006, et – toutes expéditions confondues – les
expéditions/campagnes de notre équipe sont la source de 20% des nouvelles espèces marines décrites dans le
monde (50% en se limitant aux seuls mollusques). Nous sommes en train de développer un réseau similaire pour
les collections moléculaires qui vont également continuer à être source de données pour la phylogénie de
nombreux groupes.
_________________________________________

SANTO Fiche-2012 - Flotte oceanographique française

Transcription

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