INRA

L’aventure génétique,
Le cas du lapin
Histoire de lapins...
Le lapin européen
(Oryctolagus Cuniculus)
Il fait partie de l’ordre des
lagomorphes,
littéralement
«ceux qui ressemblent aux
lièvres»
Cet ordre se distingue de
celui des rongeurs en
particulier par l’existence
d’une deuxième paire
d’incisives à
la mâchoire supérieure
Moyen Age :
Il possède :
Début de la domestication.
2 x 22 chromosomes
Les « connins » ou «counils »
vivent en
soit 44 chromosomes
De la Renaissance au XIXème siècle :
Des élevages de production apparaissent
(Olivier de Serres),
les lapins sont élevés en clapier
et les races se multiplient
avec des croisements raisonnés
garenne close
A partir du XVème siècle :
Les grands navigateurs
diffusent le lapin dans le monde
Création maquette : © G. Cattiau / INRA Tlse / Fête de la Science / UPS Toulouse / novembre 2009
A la fin du Vème siècle :
Le lapin est présent sur tout le territoire
de l’Empire Romain
Originaire d’Andalousie,
Les fossiles les plus anciens
datent de 6M d’années
Station d’Amélioration Génétique des animaux (SAGA)
Unité Expérimentale Lapins (SELAP)
INRA de Toulouse
Midi-Pyrénées
www.toulouse.inra.fr
XIème siècle avant J.C. :
Les Phéniciens découvrent le
lapin
et nomment l’Espagne
I-SEPHAN-IM
« le pays des lapins »
qui deviendra plus tard
HISPANIA
Alimentation
Agriculture
Environnement
L’aventure génétique,
Le cas du lapin
Rôle de l’INRA
dans le schéma national d’amélioration génétique
1961 : Début des recherches sur la génétique et la sélection du lapin
à l’INRA.
1968 : Création du schéma national d’amélioration
génétique du lapin
Création du
progrès génétique
Sélectionneurs
(races pures)
Firmes privées et INRA
v
Multiplication
des reproducteurs
améliorés
Multiplicateurs Firmes, groupements d’éleveurs,
(Animaux croisés) centre d’insémination artificielle
v
Groupements
d’éleveurs
Producteurs
(lapin de chair)
v
1970 : Création de la Station d’Amélioration Génétique des
Animaux et de la Station Expérimentale Lapins à Toulouse
1972 : Sélection et diffusion des lignées INRA
© INRA
Création maquette : © G. Cattiau / INRA Tlse / Fête de la Science / UPS Toulouse / novembre 2009
Bâtiment SAGA (INRA Auzeville)
© INRA
Souche A1077
Souche A2066
© INRA
2008 : Création du pôle expérimental cunicole de Toulouse,
arrêt de la diffusion des lignées INRA vers les
professionnels, appui scientifique et logistique aux
professionnels renforcé
© INRA
© INRA
© INRA
Pôle expérimental cunicole INRA
Station d’Amélioration Génétique des animaux (SAGA)
Unité Expérimentale Lapins (SELAP)
INRA de Toulouse
Midi-Pyrénées
www.toulouse.inra.fr
Firmes de sélection privées :
Grimaud frères, Eurolap, Hycole
Alimentation
Agriculture
Environnement
L’aventure génétique,
Le cas du lapin
La sélection c’est quoi ?
Accouplement des reproducteurs
Choix des reproducteurs
Génération n+1
Génération n
• Choisir des reproducteurs dans une population à partir d’une valeur d’index
• La supériorité des reproducteurs choisis est transmise aux descendants
• Le progrès génétique se cumule au long des générations
Calcul de la valeur d’index des candidats
Création maquette : © G. Cattiau / INRA Tlse / Fête de la Science / UPS Toulouse / novembre 2009
• A partir des performances des animaux
• En connaissant les facteurs de milieu d’élevage
• En connaissant le degré de parenté (de ressemblance) des animaux
La performance résulte
des effets génétiques et des effets milieux
Poids
2,7
2,6
2,3
Milieu 1
?
Gènes 1
Milieu 2
?
Gènes 2
Animal 1
Animal 2
Classement des individus selon leur index génétique
Index Gènes 2
Index Gènes 1
Station d’Amélioration Génétique des animaux (SAGA)
Unité Expérimentale Lapins (SELAP)
INRA de Toulouse
Midi-Pyrénées
www.toulouse.inra.fr
Alimentation
Agriculture
Environnement
L’aventure génétique,
Le cas du lapin
La génomique :
Les outils de sélection du futur
• Le séquençage complet du génome du lapin a été
réalisé en 2009 grâce à une collaboration entre l’INRA
et le Broad institute (USA)
- Le génome est une succession de 4 bases (GCAT)
qui constitue le code génétique de chaque individu
- La séquence est l’ordre d’enchaînement de ces
bases
© Photothèque INRA
Création maquette : © G. Cattiau / INRA Tlse / Fête de la Science / UPS Toulouse / novembre 2009
• Les marqueurs génétiques :
- Un marqueur est une portion du génome qui est variable
selon les individus
- La connaissance de la séquence complète permet d’identifier
des marqueurs
• Le SNP* est un marqueur qui varie pour une seule base :
- Marqueur Animal 1 : TGCTATAGACGTACTGAT
- Marqueur Animal 2 : TGCTATAGTCGTACTGAT
• Plusieurs millions de marqueurs SNP sont présents sur le génome
© INRA
© INRA
• Génotypage et sélection génomique :
- Le génotypage permet de connaître la
forme (séquence) du marqueur
- La relation entre la forme du marqueur
et les performances des animaux est
calculée
- On sélectionne les animaux qui ont
les formes de marqueurs les plus
favorables pour les caractères intéressants
* SNP : Single Nucleotide Polymorphism
Station d’Amélioration Génétique des animaux (SAGA)
Unité Expérimentale Lapins (SELAP)
INRA de Toulouse
Midi-Pyrénées
www.toulouse.inra.fr
Alimentation
Agriculture
Environnement
© INRA
L’aventure génétique,
Le cas du lapin
Choix des critères de sélection :
Une volonté permanente de répondre aux attentes professionnelles
et sociétales
Les critères de sélection sont les caractères
pour lesquels on souhaite une amélioration
de la valeur génétique des animaux
© INRA
Les critères sont choisis pour répondre au triple enjeu
du développement durable :
Rentabilité économique
- Augmentation de la productivité
- Diminution des coûts de production
Respect de l’environnement
- Diminution des intrants (aliment, énergie, médicaments)
- Diminution des rejets (médicaments, effluents)
Création maquette : © G. Cattiau / INRA Tlse / Fête de la Science / UPS Toulouse / novembre 2009
Demande sociale
- Qualité des produits
- Santé des animaux
- Bien être animal
- Facilité d’élevage
© INRA
Social
Qualité du produit
Critères de sélection
pour l’amélioration
de la valeur génétique
Qualités maternelles
Longévité de la femelle Fertilité
Résistance aux maladies
Prolificité
Environnement
Efficacité alimentaire
Station d’Amélioration Génétique des animaux (SAGA)
Unité Expérimentale Lapins (SELAP)
INRA de Toulouse
Midi-Pyrénées
www.toulouse.inra.fr
Economique
Vitesse de croissance
Alimentation
Agriculture
Environnement
L’aventure génétique,
Le cas du lapin
Une grande diversité à préserver
60 races patrimoniales en France, parfois en voie de disparition
Papillon anglais 2 à 3,5kg
© INRA
© INRA
Bélier français 5 à 8 kg
© INRA
© INRA
Lapin nain 0,6 à 2 kg
Fauve de Bourgogne 3 à 5 kg
© INRA
Angora français
Face aux souches commerciales, ces races sont un véritable
réservoir de gènes aujourd’hui inconnus ou non valorisés mais peutêtre précieux pour demain (par exemple résistance naturelle aux
maladies…)
Création maquette : © G. Cattiau / INRA Tlse / Fête de la Science / UPS Toulouse / novembre 2009
Pendant 4 ans, les chercheurs ont étudié différentes races
domestiques européennes dans un but d’inventorier leur
diversité génétique, de la caractériser et de la conserver, en
collaboration avec les associations d’éleveurs, notamment la FFC
(Fédération Française de Cuniculiculture).
Un nouveau programme international va permettre de
poursuivre l’étude de la biodiversité du lapin à l’aide des outils les
plus récents de la génétique moléculaire (marqueurs SNP).
Conservation :
© INRA
- Populations vivantes (conservation in situ) :
éleveurs sélectionneurs de la FFC
- Populations dormantes (conservation ex situ) :
cryobanque nationale
- 55 populations stockées
- 18 000 embryons issus de 1300 lapines
© INRA
Station d’Amélioration Génétique des animaux (SAGA)
Unité Expérimentale Lapins (SELAP)
INRA de Toulouse
Midi-Pyrénées
www.toulouse.inra.fr
Alimentation
Agriculture
Environnement
L’aventure génétique,
Le cas du lapin
Partenariat scientifique et professionnel :
Un schéma cohérent pour la production et le
transfert des connaissances
Ministère de l’Alimentation,
de l’Agriculture
et de la Pêche
Ministère de l’Enseignement
supérieur
et de la Recherche
Laboratoires étrangers
Italie, Espagne, USA, Australie
Institut Technique de
l’Aviculture
SYSELAF
Sélectionneurs
privés
FENALAP
Fédération des
Eleveurs
de lapins de chairs
INRA
Station d’Amélioration
Génétique des
Animaux
Pôle
Expérimental
LAPINS
Création maquette : © G. Cattiau / INRA Tlse / Fête de la Science / UPS Toulouse / novembre 2009
Fabricants
d’aliments
Groupements
d’éleveurs
Laboratoire de
Génétique Cellulaire
TANDEM
Nutrition, écosystème
digestif
CLIPP
Interprofession
‘’Lapin de France’’
Infectiologie
des Animaux
et Santé Publique
Physiologie de la
Reproduction et du
Comportement
Tutelles
Partenariat Partenariat
(Ministères) scientifique professionnel
Station d’Amélioration Génétique des animaux (SAGA)
Unité Expérimentale Lapins (SELAP)
INRA de Toulouse
Midi-Pyrénées
www.toulouse.inra.fr
Alimentation
Agriculture
Environnement