13 - Master Ingénieries pour la Santé et le Médicament

Domaine de Formation : Sciences, Techniques et Santé
Mention : Ingénieries pour la Santé et le Médicament (Master ISM)
Spécialité : Méthodes de Recherche en Environnement et en Santé (MRES) - Master M2 Recherche
Titre : Migrations aviaires et introduction potentielle de virus grippaux au sein d’une zone
humide méditerranéenne (El Kala-Algérie)
Auteur : Bilel OUZROUT.
Directeurs de stage : P. SABATIER, Z. BOUSLAMA
Laboratoires d’accueil :
Equipe EPSP-Laboratoire TIMC, ENVL, 1 avenue Bourgelat, 69280 MARCY L’ETOILE
Laboratoire des écosystèmes terrestres et aquatiques, Université Badji Mokhtar, ANNABA
Résumé : Les épidémies récentes de grippe, localisées à Hong-Kong en 1997 puis
étendues aux cinq continents à partir de 2003, ont mis en évidence le rôle spécifique des
oiseaux sauvages dans la transmission du virus. Il est apparut que la classe des oiseaux
était la véritable clef de voûte de l’écologie des virus grippaux, et que les phénomènes
migratoires avaient un impact décisif sur la dispersion des virus. Si 1% des oiseaux quittant
leurs zones de reproduction eurasiennes, lors des migrations de retour, étaient infectés, le
nombre d’oiseaux susceptible d’introduire, chaque année des Orthomyxovirus sur le
continent africain, serait de 40 millions.
Considérant l’exemple de la région d’El Kala (Nord est algérien), l’un des plus grands sites
d’hivernage accueillant plus de 200 espèces d’oiseaux, nous estimons le risque
d’introduction des virus grippaux au sein d’une zone humide méditerranéenne, en ne
mobilisant que des informations relatives à l’abondance et à la richesse spécifique des
oiseaux, issues de la surveillance des populations. Nous étudions successivement : (1) les
principales origines des oiseaux migrateurs ; (2) l’abondance et la diversité des espèces
durant un cycle annuel ; (3) la période durant laquelle les contacts interspécifiques des
oiseaux, issus d’origine différentes, sont les plus importants.
Nous identifions, ainsi, les groupes d’espèces susceptibles d’introduire des virus grippaux au
sein d’une zone donnée lors d’une période donnée. Les biais introduits par les méthodes de
dénombrement des oiseaux, ont été corrigés par la prise en compte de plusieurs comptages
mensuels et annuels (RAMSAR). Au total, nous montrons qu’il est possible d’apprécier
l’introduction potentielle de virus zoonotiques par les oiseaux migrateurs, en utilisant des
données issues de la surveillance ornithologique de routine, des populations aviaires au sein
d’une zone humide.
Mots-clés : Grippe aviaire, Introduction, Oiseaux, Migration, Algérie.
Domaine de Formation : Sciences, Techniques et Santé
Mention : Ingénieries pour la Santé et le Médicament (Master ISM)
Spécialité : Méthodes de Recherche en Environnement et en Santé (MRES) - Master M2 Recherche
Titre : Bird migrations and potential introduction of avian influenza in a Mediterranean
wetland of Algeria (El Kala)
Auteur : Bilel OUZROUT.
Directeurs de stage : P. SABATIER, Z. BOUSLAMA
Laboratoires d’accueil :
Equipe EPSP-Laboratoire TIMC, ENVL, 1 avenue Bourgelat, 69280 MARCY L’ETOILE
Laboratoire des écosystèmes terrestres et aquatiques, Université Badji Mokhtar, ANNABA
Abstract: Last outbreaks of influenza, localized in Hong-Kong in 1997 and extended to the
five continents since 2003, highlight the specific role of wild birds in the transmission of virus.
It appeared that the birds was the keystone of the ecology of the flu virus, and that the
migrations had a deciding impact on the dispersal. If 1% of the birds leaving the reproductive
areas of Eurasia, when they are migrating back to Africa, would be infected, the amount of
birds able to introduce, each year, Orthomyxovirus, would be around 40 millions.
We consider the area of El Kala (North eastern Algeria), one of the largest wintering sites
taking in more than 200 species of birds, as an example to highlight how ad hoc information
already available on birds’ movements, abundance, and diversity can help assessing the
introduction risk for bird borne diseases in the western Mediterranean wetlands. We address
successively: (1) the main geographic origins of birds observed in western Mediterranean
wetlands; (2) the abundance and the diversity in species during the year cycle; (3) the
interspecies contacts between birds from different origins most likely to occur. To address
these issues, we used crude empiric indexes, which are known to have biases yet prove
valuable within the scope of our objectives.
We identify key groups of species likely to introduce flu virus from a given area at a given
time of year. The main source of error, related to the fact that the probability of detecting a
bird is <1, is corrected by considering several monthly and annual (RAMSAR) times series.
We merely show that information already available on birds may lead to better studying the
potential introduction of zoonotic pathogens, and understanding of animal and human health
issues associated with.
Key Words: Avian Flu, Introduction, Birds, Migration, Algeria.