Protein`eXpert, UNE JEUNE POUSSE « BIO-TECH

R E C H E R C H E
E N
D I R E C T
CNRS INFO • N° 396
SEPTE MBRE 2001
Protein’eXpert, UNE JEUNE POUSSE « BIO-TECH »
De la protéine recombinante à la protéomique recombinante
Le récent séquençage du génome de différentes espèces a révélé une importante
masse d'informations génétiques à analyser. La caractérisation fonctionnelle des protéines issues de ces gènes sera l’un des atouts majeurs pour la compréhension des
mécanismes moléculaires impliqués dans la régulation des cellules normales et
pathologiques. La production de protéines recombinantes représente ainsi une activité clé pour la recherche bio-médicale. Dans ce contexte, deux docteurs de l'Institut
de biologie structurale1 (IBS) ont créé Protein'eXpert, une société de biotechnologie
spécialisée dans la production de protéines recombinantes. Un transfert de technologie est en cours dans le cadre de la loi sur l'innovation ainsi qu'un contrat de valorisation entre le CNRS et Protein'eXpert.
Protein'eXpert2 est spécialisée dans la production de protéines recombinantes pour les études
fonctionnelles et structurales, production qui est déclinée sous plusieurs formes :
• production de protéines à façon chez la bactérie E. coli (étude de faisabilité), puis mise
à l’échelle (20 mg) ;
• production de protéines in vitro dans le système « Rapid Translation System » RTS (RocheDiagnostics) dans le cadre d’une collaboration entre Protein’eXpert et Roche-Diagnostics ;
• production de protéines à haut débit : afin de pouvoir satisfaire la demande des programmes de génomique structurale, Protein’eXpert est en train de développer une plate-forme
de production automatisée allant du clonage à la protéine purifiée.
• ingénierie moléculaire : il s'agit de réduire la taille des protéines par ingénierie informatique puis par ingénierie moléculaire (biologie moléculaire) à partir des structures cristallographiques diffractant à faible résolution (3 à 4 Å). Le principe consiste à déléter les parties mobiles
non essentielles à la fonctionnalité des protéines, pour augmenter leur compaction et favoriser
leur aptitude à cristalliser. Cette stratégie permet d'obtenir ensuite des cristaux qui diffractent à
haute résolution. La partie ingénierie moléculaire fait l’objet d’un contrat de valorisation entre
le CNRS et Protein’eXpert.
Protein’eXpert, qui n’a pas encore un an d’existence, a déjà produit une vingtaine de protéines, impliquées dans des pathologies comme le cancer, le Sida, ainsi que des enzymes pour
des applications biotechnologiques. Ses clients sont des laboratoires de recherche publique ou
privée. Grâce à sa plate-forme de production de protéines à haut débit, Protein’eXpert commence à produire ses premières collections de protéines en format plaque 96 puits (proteotek)
et souhaite commercialiser des proteoteks début 2002. L’ère de la protéomique 3 recombinante
semble lancée.
Adresse du serveur : http://www.proteinexpert.com
1 CNRS-CEA-Université
Grenoble 1. Protein'eXpert est
le fruit d’une collaboration
entre des chercheurs
du Laboratoire de cristallographie
macromoléculaire dirigé
par Otto Dideberg et des chercheurs du Laboratoire d'ingénierie des macromolécules dirigé
par Thierry Vernet.
2 L'effectif de Protein'eXpert
est de sept personnes et devrait
atteindre une quinzaine
de personnes au deuxième
semestre 2002.
3
Voir programme
« Protéomique et génie
des protéines », dans ce numéro
de CNRS Info pp. 5-6.
Contact chercheur :
Nicolas MOUZ,
Institut de biologie
structurale (IBS),
CNRS-CEA-Université
Grenoble 1,
tél. : 04 38 78 40 62
mél : [email protected]
Contact Protein'eXpert :
Tristan ROUSSELLE,
tél. : 04 38 78 47 66
mél : contact@
proteinexpert.com
Contact département
des Sciences chimiques
du CNRS :
Laurence MORDENTI,
tél. : 01 44 96 41 09
mél : laurence.mordenti@
cnrs-dir.fr
28