PROTEIN CRYSTALLIZATION
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PROTEIN CRYSTALLIZATION
Berichte aus der Verfahrenstechnik Bo-Hyun Ryu Protein Crystallization by Solvent Freeze-Out Technology Shaker Verlag Aachen 2010 Bibliographic information published by the Deutsche Nationalbibliothek The Deutsche Nationalbibliothek lists this publication in the Deutsche Nationalbibliografie; detailed bibliographic data are available in the Internet at http://dnb.d-nb.de. Zugl.: Halle, Univ., Diss., 2009 Copyright Shaker Verlag 2010 All rights reserved. No part of this publication may be reproduced, stored in a retrieval system, or transmitted, in any form or by any means, electronic, mechanical, photocopying, recording or otherwise, without the prior permission of the publishers. Printed in Germany. ISBN 978-3-8322-9004-7 ISSN 0945-1021 Shaker Verlag GmbH • P.O. BOX 101818 • D-52018 Aachen Phone: 0049/2407/9596-0 • Telefax: 0049/2407/9596-9 Internet: www.shaker.de • e-mail: [email protected] Abstract Crystallization has exhibited great potential in downstream processing of the proteins. In order to provide the required amounts of crystalline proteins, efficient and reproducible methods for the crystallization of various kinds of proteins on a large scale are required. However, due to the complexity of the proteins, such methods are not found yet. Hence, new strategies have been sought in order to better understand and improve the crystallization processes in order to avoid large amounts of salts as crystallizing agent. For those purposes the “solvent freeze out technology” for crystallizing proteins is introduced here as an advanced crystallization technology which is efficient and reproducible. This new technique in protein crystallization involves the freeze out (a layer crystallization for the solvent, known from melt crystallization) of the solvent in order to enrich and therefore supersaturate the protein solution. The process is thus primarily a solid-layer melt crystallization technique with a secondary solution crystallization step generating the protein crystals. Problems and advantages of the technology are discussed on the basis of experimental results. As such it suffers from a problem common to solid-layer melt crystallization, namely inclusions of impurities in the crystalline solid layer. In the specific case presented here, the major impurity found in the ice layer is the protein. The dependence of the concentration of the protein found in the ice upon the final temperature of the cold finger as well as on the cooling rate applied has been investigated and is presented here. The question of the maximum allowable layer growth rate is discussed on the basis of the known criteria. The major parameters concerning the inclusion effect of solute in the ice are the ice growth rate (vice), mass transfer coefficient of the solute (k), the interface temperature (ti) and the interface concentration (ci) of the solute between the ice and the solution with the boundary layer conditions. In order to avoid inclusions in the ice, the allowable maximum ice growth rate (vmax) for the process should be defined depending on the optimum criterion of vice/k. The empirical evaluation of the estimated criterion of vice/k to the freeze out protein crystallization process is assessed on the basis of separation efficiency which is represented as effective distribution coefficient (keff). Key words: solvent freeze-out, protein crystallization, solid layer melt crystallization, protein inclusion, the optimum criterion of vice/k, the allowable maximum ice growth rate (vmax), separation efficiency Abstract Der Kristallisation wird insbesondere für Downstream-Prozesse von Proteinen eine sehr große Bedeutung beigemessen. Um gewünschte Mengen an kristallinem Produkt (Proteinen) erhalten zu können, sind effiziente und reproduzierbare Kristallisationsprozesse für verschiedenste Proteine im großtechnischen Maßstab unabdingbar. Aufgrund der komplexen Proteinstruktur konnten derartige Verfahren aber bis heute nicht etabliert werden. Daher wird zurzeit nach neuen Strategien gesucht, um den Gesamtprozess besser verstehen und letztendlich verbessern zu können und um die bisher benötigten großen Mengen an Salz als Kristallisationsagenz zu vermeiden. Aus diesem Grunde wird hier die effiziente und reproduzierbare „solvent freeze out“ Technologie für die Kristallisation von Proteinen vorgestellt. Diese neue Technik der Proteinkristallisation beinhaltet das Ausfrieren des Lösungsmittels, um die Proteinkonzentration in der Lösung zu erhöhen und somit eine Übersättigung zu generieren. Auf den ersten Blick handelt es sich um eine klassische Schmelzkristallisation an einer festen Oberfläche, die allerdings an eine Lösungskristallisation der Proteinkristalle in Lösung gekoppelt ist. Probleme und Vorteile der neuen Technik werden hier auf Grundlage von experimentellen Daten aufgezeigt und diskutiert. Das größte Problem stellt dabei der Einschluss von Fremdstoffen in der festen Kristallisationsschicht dar. In diesem speziellen Fall ist die Hauptverunreinigung gleichzeitig unser Zielprodukt, das Protein selbst. Die Abhängigkeiten der Proteinkonzentration im Eis von der Kühlfingertemperatur und der angewendeten Kühlrate wurden untersucht und die Ergebnisse werden hier dargestellt. Dabei wird die Frage nach der maximalen Eiswachstumsgeschwindigkeit unter Berücksichtigung bekannter Kriterien diskutiert. Die wichtigsten Parameter hinsichtlich des Einschlusseffektes von Protein im Eis sind die Eiswachstumsgeschwindigkeit (vice), die Stofftransportkoeffizienten der gelösten Stoffe (k), die Grenzflächentemperatur (ti) und die Grenzflächenkonzentration (ci) in der Grenzschicht Eis/Lösung. Um den Einschluss von Zielprotein im Eis zu vermeiden, darf eine maximale Eiswachstumsgeschwindigkeit (vmax), die auf Grundlage eines optimalen Kriterium vice/k definiert wurde, nicht überschritten werden. Die empirische Abschätzung des Parameters vice/k für das Ausfrieren während eines Proteinkristallisationsprozesses beruht auf der Trenneffektivität, welche durch den effektiven Verteilungskoeffizienten (keff) beschrieben wird. Key words: Ausfrieren von Lösungsmittel, Proteinkristallisation, Schmelzkristallisation an festen Grenzflächen, Proteineinschlüsse, der Optimierungsparameter vice/k, zulässige maximale Eiswachstumsgeschwindigkeit (vmax), Trenneffektivität