Le contrôle du cycle cellulaire en cas de lésions de l`ADN : arrêt
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Le contrôle du cycle cellulaire en cas de lésions de l`ADN : arrêt
Ch. Leroy, M.C. Marsolier-Kergoat Le contrôle du cycle cellulaire en cas de lésions de l'ADN : arrêt, recovery et adaptation. Ch. Leroy, M.C. Marsolier-Kergoat Service de Biochimie et de Génétique Moléculaire CEA/Sackay, Gif-sur-Yvette - France. Résumé L’apparition de lésions de l’ADN déclenche des mécanismes de surveillance, ou "checkpoints" qui contrôlent l’intégrité du génome. Ces checkpoints induisent plusieurs réponses, transcriptionnelles et cellulaires, qui favorisent la réparation de l’ADN endommagé. En particulier, l’activation des checkpoints de l’ADN entraîne des blocages du cycle cellulaire à toutes les phases, en fonction du stade auquel les lésions surviennent. Ces blocages sont généralement temporaires et les cellules finissent par reprendre leur cycle de division, que leurs lésions aient été réparées (il s’agit alors de "recovery", ou rétablissement) ou demeurent irréparables (il s’agit dans ce cas d’adaptation). Les mécanismes génétiques contrôlant ces phénomènes sont très conservés chez les eucaryotes, et commencent à être bien appréhendés chez la levure Saccharomyces cerevisiae, qui sert d’organisme modèle pour leur étude. Lésion de l’ADN - Checkpoint - Cycle cellulaire - Saccharomyces cerevisiae INTRODUCTION ðLa prolifération des cellules eucaryotes doit être strictement contrôlée dans la mesure où une perte de ce contrôle peut conduire à la mort cellulaire ou à une multiplication anarchique caractéristique de l’état cancéreux. Cette régulation s’effectue par intégration de signaux positifs et négatifs. Parmi les systèmes de régulation négative, les checkpoints ou mécanismes de surveillance du cycle cellulaire interviennent en subordonnant les transitions entre les phases du cycle à l’accomplissement préalable d’événements cellulaires prérequis. Ainsi, les checkpoints mi- totiques bloquent la séparation des chromatides soeurs, c.a.d. le passage métaphase/anaphase, tant que le fuseau des microtubules n’est pas correctement organisé. Les checkpoints de l’ADN constituent un autre mécanisme de surveillance, activé par des blocages de la réplication ou par des lésions de l’ADN. Cette activation entraîne l’inhibition de la progression Correspondance : Marie-Claude Marsolier-Kergoat - Service de Biochimie et de Génétique Moléculaire, CEA/Saclay 91191 Gif-sur-Yvette Cedex - France Tel : 01.69.08.83.54 - Fax : 01.69.08.47.12 - E-mail : [email protected] Médecine Nucléaire - Imagerie fonctionnelle et métabolique - 2002 - vol.26 - n°3 133 Le contrôle du cycle cellulaire en cas de lésions de l'ADN : arrêt, recovery et adaptation du cycle cellulaire à différentes phases ainsi que d’autres réponses comme l’activation transcriptionnelle d’un large régulon de gènes, appelé le "DNA-damage regulon", qui inclut des gènes impliqués dans les voies majeures de réparation [1]. Chez l’homme, les défauts des checkpoints de l’ADN sont considérés comme critiques pour l’apparition et l’évolution des tumeurs [2]. De fait, des mutations de plusieurs composants de ces voies ont été associées à des syndromes prédisposant au cancer (Ataxia Telangiectasia ou Li-Fraumeni par exemple). et initient un signal, des transducteurs qui le transmettent et l’amplifient, et des effecteurs qui agissent sur les machineries cellulaires du cycle ou de la transcription. ðChez S. cerevisiae, l’activation des checkpoints de l’ADN inhibe la transition G1/S [3], ralentit la progression de la phase S [4] et retarde la ségrégation des chromosomes [5] lorsque l’ADN est endommagé au cours des phases G1, S ou G2, respectivement. Les lésions de l’ADN sont rapidement soumises à différentes modifications enzymatiques, de sorte qu’il est difficile de savoir si les lésions primaires constituent le signal perçu par les checkpoints ou si ce signal n’est pas constitué par les lésions modifiées par les complexes de réparation, voire par l’association des complexes et des lésions. Quelle que soit la nature de ce signal, un modèle précis émerge maintenant chez S. cerevisiae dans le cas des cassures double-brin (CDB) de l’ADN, qui constituent les lésions les plus délétères. Selon ce modèle, deux groupes de protéines sont recrutés simultanément mais indépendamment sur les CDB et en Figure 1 constituent les senseurs (Figure 1, [6, 7]). Le premier groupe comprend Mec1, qui est un transducteur essentiel des voies de checkpoint (voir cidessous), et Ddc2. Le deuxième groupe comprend des protéines présentant des homologies avec des facteurs de réplication de l’ADN : Rad17, Mec3 et Ddc1, dont la structure est proche de celle de PCNA (Proliferating Cell Nuclear Antigen), et Rad24, homologue aux cinq sous-unités de RFC (Replication Factor C). Les protéines Rad24, Rad17, Mec3, Ddc1, Mec1 et Ddc2 ont été impliquées dans la signalisation pendant les phases G1 et G2 de tous les autres types de lésions de l’ADN, mais sans qu’ait été établi un modèle moléculaire aussi précis [8]. Enfin, durant la phase S, les lésions de l’ADN sont détectées par des mécanismes spécifiques impliquant directement la machinerie de réplication, par exemple la sous-unité d’ADN polymérase Pol2 ou la sousunité Rfc5 du Replication Factor C [9, 10]. Les senseurs Les transducteurs ðComme toute voie de transduction, les checkpoints de l’ADN comportent des senseurs qui détectent les lésions ðQuatre protéines, Mec1, Rad9 et deux CHeckpoint Kinases, Chk1 et Chk2 (ou Rad53), jouent ensuite un Les protéines des checkpoints de l’ADN sont remarquablement conservées chez les eucaryotes, indiquant que l’organisation de ces voies s’est maintenue à travers l’évolution. La conservation de ces systèmes légitime l’utilisation d’organismes modèles unicellulaires comme les levures Saccharomyces cerevisiae et Schizosaccharomyces pombe, qui offrent des possibilités d’analyse uniques combinant des approches de biologie moléculaire, de génétique, de génomique et de biochimie. Dans cette revue, nous nous concentrerons sur les checkpoints de l’ADN et le contrôle du cycle cellulaire chez la levure S. cerevisiae. La levure S. pombe et les cellules de mammifères seront mentionnées en cas de différences importantes. L’ACTIVATION DES CHECKPOINTS DE L’ADN ET LES BLOCAGES DU CYCLE CELLULAIRE 134 rôle essentiel dans la transduction du signal, quels que soient les senseurs initialement impliqués [11, 12]. Mec1 est une protéine kinase présentant des homologies structurales avec des phospho-inositide kinases (PIK) et est l’homologue des protéines humaines ATM et ATR (Ataxia Telangiectasia Mutated/Related). Les cellules des patients atteints d’ataxie telangiectasie présentent des défauts de checkpoints et sont très sensibles aux radiations ionisantes. Les patients euxmême ont une forte propension à développer de multiples cancers, ce qui souligne les relations entre tumorigénèse et checkpoints de l’ADN. Rad9 possède un domaine BRCT, le domaine C-terminal de la protéine Brca1, Breast Cancer Associated 1, et serait l’homologue de ce suppresseur de tumeurs. Chk1 et Rad53 (Chk2) sont deux protéine kinases et des mutations dans l’homologue humain de Rad53, hChk2, ont été associées à certaines formes du syndrome de LiFraumeni, qui prédispose au cancer. Des données convergentes suggèrent qu’après la fixation des protéines Rad24/Rad17/Mec3/Ddc1 et Mec1/ Ddc2 sur les lésions, le complexe Rad17/Mec3/Ddc1 recruterait les substrats de Mec1, les protéines Rad9, Rad53 et Chk1 [6]. Après leur activation par phosphorylation, Rad53 et Chk1 phosphoryleraient à leur tour leurs cibles et induiraient les réponses transcriptionnelles et cellulaires. Les effecteurs du contrôle du cycle cellulaire L’inhibition de la tr ansition G1/S transition Sidorova et Breeden ont montré qu’après traitement par l’agent alkylant MMS (Methyl Methane Sulfonate) en phase G1, Rad53 phosphoryle le régulateur transcriptionnel Swi6, ce qui inhibe l’expression des cyclines Cln1 et Cln2, dont l’association avec la cycline-dépendante kinase (CDK) Cdc28 est indispensable au passage en phase S [13]. Le ralentissement de la réplication pendant la phase S Lorsque des lésions de l’ADN sont Médecine Nucléaire - Imagerie fonctionnelle et métabolique - 2002 - vol.26 - n°3 Ch. Leroy, M.C. Marsolier-Kergoat détectées au cours de la phase S, Mec1 et Rad53 bloquent l’activation des origines tardives de réplication [14, 15], probablement en inhibant la phosphorylation de la sous-unité B du complexe ADN polymérase α/ primase requis pour l’initiation de la synthèse d’ADN. Cette phosphorylation, qui dépend normalement des complexes formés par la CDK Cdc28 et les cyclines de type B (Cdc28/Clb) est en effet réprimée lorsque les checkpoints de l’ADN sont activés et se trouve déréprimée en présence de fortes concentrations de formes inactives de Rad53 qui inhibent également les checkpoints [16]. Le b locag yc le cellulair blocag locagee du ccyc ycle cellulairee en phase G2/M Le blocage en phase G2/M est le point de contrôle le mieux caractérisé chez S.cerevisiae. Rad53 est requis pour maintenir une forte activité du complexe Cdc28/Clb, qui empêche à la fois l’anaphase et la sortie de la mitose [17]. Par ailleurs, Cdc5, un membre de la famille des polo kinases, est nécessaire pour le passage en anaphase et pour la sortie de mitose, et est phosphorylé d’une façon dépendante de Rad53 en cas de lésions de l’ADN. On peut donc supposer que Rad53 inhiberait l’activité de Cdc5, lui-même inhibiteur de l’activité Cdc28/Clb, ce qui empêcherait à la fois l’anaphase et la sortie de mitose. La kinase Chk1 opèrerait dans une voie parallèle en stabilisant par phosphorylation la protéine Pds1, qui doit être détruite par le protéasome pour permettre l’anaphase [17]. Les mécanismes inhibant la sortie de mitose chez les eucaryotes supérieurs diffèrent de ceux de S. cerevisiae. Dans les cellules de mammifères, l’arrêt en G2 en cas de dommage de l’ADN est principalement maintenu par une phosphorylation de la CDK Cdc2. La déphosphorylation et l’inactivation de Cdc2 permettant la sortie de mitose sont catalysées par la phosphatase Cdc25. Lorsque les checkpoints sont activés, les kinases Chk1 et Chk2 phosphorylent Cdc25C sur le résidu Ser-216, ce qui entraîne sa translocation dans le cy- toplasme, sa séquestration par liaison avec des protéines 14-3-3 et son inactivation [11]. Les mécanismes contrôlant les blocages du cycle cellulaire de S. cerevisiae en cas de lésions de l’ADN sont schématisés sur la figure 2 2. L’INACTIVATION DES CHECKPOINTS DE L’ADN : LE RETOUR DANS LE CYCLE DE DIVISION PAR "RECOVERY" OU PAR ADAPTATION ðDe manière générale, les voies de signalisation activées par un stimulus doivent ultérieurement être inactivées pour permettre le retour de la cellule à un état physiologique plus normal. Cette inactivation prend deux formes, soit le "recovery" (approximativement,‘rétablissement’), lorsque le stimulus qui a déclenché l’activation de la voie disparaît, soit l’adaptation, lorsque les cellules qui sont continuellement exposées au même stimulus y deviennent progressivement moins sensibles. Pour les checkpoints de l’ADN, le "recovery" se produit si les cellules sont capables de réparer leurs lésions, l’adaptation, en cas de lésions irréparables. Peu de données sont disponibles en ce qui concerne les mécanismes génétiques du "recover y" chez S. cerevisiae après lésions de l’ADN. Par contre, des données récentes suggèrent un rôle pour la CDK Cdc2 et la protéine Crb2 de S. pombe (les homologues respectifs de Cdc28 et de Rad9 de S. cerevisiae) dans ce processus. Les cellules mutantes crb2-T215A, affectées au niveau d’un site de phosphorylation de Crb2 par Cdc2, s’arrêtent normalement en phase G2 après irradiation aux UV, mais sont incapables de reprendre leur cycle de division par la suite alors que leurs capacités de réparation semblent intactes [18]. Il reste à déterminer si la protéine Rad9 de S. cerevisiae ou ses homologues humains pourraient être impliqués dans les mêmes mécanismes. Médecine Nucléaire - Imagerie fonctionnelle et métabolique - 2002 - vol.26 - n°3 L’adaptation a été étudiée chez S. cerevisiae essentiellement après la formation de coupures double-brin de l’ADN (CDB). Ces CDB sont induites par l’expression d’endonucléases et sont rendues irréparables. Une seule CDB suffit à activer les checkpoints de l’ADN et à entraîner un arrêt prolongé en phase G2/M, auquel les cellules finissent par échapper (elles s’adaptent) malgré la présence persistante du chromosome cassé [19]. La formation d’une CDB non réparée est suivie par la dégradation 5'-3' des extrémités de la coupure, ce qui entraîne l’apparition d’ADN simple brin, et il semble que la capacité des cellules à s’adapter dépende de l’extension de cet ADN simple brin. Ainsi, les cellules sont capables de s’adapter en présence d’une seule CDB, mais pas de deux CDB. De même, la délétion de YKU70 entraîne à la fois une accélération de la dégradation des extrémités du chromosome cassé et une incapacité des cellules à s’adapter. Inversement, les délétions de MRE11 ou de RAD50, qui réduisent la vitesse de formation d’ADN simple brin, suppriment le défaut d’adaptation des mutants YKU70 et permettent l’adaptation avec deux CDB [20]. Des données récentes suggèrent que le complexe RPA (qui possède la propriété de se lier à l’ADN simple brin) pourrait évaluer l’extension de l’ADN simple brin et moduler directement l’adaptation [20]. Outre les protéines YKU70, Yku80, Mre11, Rad50 et Rfa1 qui sont impliquées dans la maturation des CDB et peuvent donc agir directement sur le signal perçu par les checkpoints, la polo kinase Cdc5 et la caséine kinase II influencent elles aussi l’adaptation des cellules, sans que le mécanisme sous-jacent soit clairement défini [21]. L’adaptation des levures à des lésions irréparables de l’ADN se conçoit bien d’un point de vue évolutif dans la mesure où il s’agit d’organismes unicellulaires pour lesquels il vaut mieux reprendre le cycle de division et peut-être survivre que mourir sans rien tenter. Pour des organismes multicel-lulaires cependant, cette stratégie peut apparaître dangereuse puisque les cellules qui adaptent fixeront des mutations dans leur descendance. Le 135 Le contrôle du cycle cellulaire en cas de lésions de l'ADN : arrêt, recovery et adaptation 3’ 3’ 5’ 5’ Mec3 Ddc2 Rad17 Rad24 Mec1 Ddc1 P Ddc2 Mec1 Rad17 5’ Mec3 3’ 5’ P Ddc1 Rad53/ Chk2 Rad24 P Ddc2 Chk1 Mec1 Rad17 5’ P Chk1 Rad53/ Chk2 P Rad9 Mec3 3’ 5’ P Ddc1 Rad9 P Figure 1. Modèle moléculaire de la détection des cassures double-brin de l’ADN et des premières étapes de la transduction du signal (d’après [6]). Les groupes de protéines Mec1/Ddc2 et Rad17/Mec3/Ddc1 avec Rad24 sont recrutés sur les sites des lésions simultanément mais indépendamment. Le complexe Rad17/Mec3/Ddc1 recruterait ensuite les substrats de Mec1 (Rad9, Rad53/Chk2 et Chk1), qui les activ er ait en les phosphor ylant. P indique la phosphor ylation (toujour activer erait phosphorylant. phosphorylation (toujourss dépendante de Mec1) des protéines auquel il est superposé : Ddc1, Ddc2, Rad9, Rad53/Chk2 et Chk1. Mec1 Rad53 Dun1 Swi6 Cdc28 Swi4 Polα/ primase Chk1 Cdc5 Pds1 Induction de gènes de réparation Arrêt en phase G1 Ralentissement de la réplication en phase S Cdc28 Arrêt en métaphase et inhibition de la sortie de mitose Figure 2. Mécanismes contrôlant les ar rêts ou rralentissement alentissement du ccyc yc le cellulair arrêts ycle cellulairee de S. cer ceree visiae en cas de lésions de l’ADN l’ADN.. A noter que ces v oies de tr ansduction ffonctionnent onctionnent par des phosphor ylations en cascade : la major ité des pr otéines qui y sont impliquées voies transduction phosphorylations majorité protéines (Mec1, Rad53/Chk2, Chk1, Dun1, Cdc28, Cdc5) sont des protéine kinases. 136 Médecine Nucléaire - Imagerie fonctionnelle et métabolique - 2002 - vol.26 - n°3 Ch. Leroy, M.C. Marsolier-Kergoat checkpoint en phase G1/M des mammifères comprend également un composant permettant l’adaptation, dont la dérégulation peut entraîner une instabilité génomique [22]. Des études plus approfondies seront requises pour déterminer les relations entre adaptation et tumorigénèse chez les eucaryotes supérieurs. CONCLUSIONS ðDans cette revue, nous avons exploré des données récentes concernant les checkpoints de l’ADN et le contrôle du cycle cellulaire chez un organisme modèle, Saccharomyces cerevisiae. La conservation de ces voies chez les eucaryotes suggère fortement qu’elles fonctionnent chez les humains comme des mécanismes suppresseurs de tumeurs, ce qui laisse entrevoir la possibilité de thérapies anti-cancéreuses fondées sur la modulation pharmacologique de leur activité. Cell cycle control after DNA damage : arrest, recovery and adaptation. DNA damage triggers surveillance mechanisms, the DNA checkpoints, that control the genome integrity. The DNA checkpoints induce several responses, either cellular or transcriptional, that favor DNA repair. In particular, activation of the DNA checkpoints inhibits cell cycle progression in all phases, depending on the stage when lesions occur. These arrests are generally transient and cells ultimately reenter the cell division cycle whether lesions have been repaired (this process is termed "recovery") or have proved unrepairable (this option is called "adaptation"). The mechanisms controlling cell cycle arrests, recovery and adaptation are largely conserved among eukaryotes, and much information is now available for the yeast Saccharomyces cerevisiae, that is used as a model organism in these studies. DNA damage - Checkpoint - Cell cycle - Saccharomyces cerevisiae RÉFÉRENCES 1. Friedberg EC, Walker GC, Siede W. DNA Repair and Mutagenesis:ASM Press, Washington DC ; 1995. 2. Hartwell LH, Kastan MB. Cell cycle control and cancer. Science 1994 ; 266(5192) : 1821-8. 3. Siede W, Friedberg AS, Friedberg EC. RAD9-dependent G1 arrest defines a second checkpoint for damaged DNA in the cell cycle of Saccharomyces cerevisiae. Proc Natl Acad Sci U S A 1993 ; 90(17) : 7985-9. 4. Paulovich AG, Hartwell LH. A checkpoint regulates the rate of progression through S phase in S. cerevisiae in response to DNA damage. Cell 1995 ; 82(5) : 841-7. 5. Weinert TA, Hartwell LH.The RAD9 gene controls the cell cycle response o DNA damage in Saccharomyces cerevisiae. 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