Projet de thèse avec financement 3 ans Université Bretagne

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Projet de thèse avec financement 3 ans Université Bretagne
Projet de thèse avec financement 3 ans
Université Bretagne Occidentale – Brest
Contact :
Laurent Corcos, PhD
INSERM U1078-ECLA
Directeur de la SFR ScInBioS
Faculté de médecine
22, avenue Camille Desmoulins
29200 BREST, France
[email protected]
Tel 33 2 98 01 83 01
Fax 33 2 98 01 83 22
http://www.univbrest.fr/umr1078/menu/La_recherche/Themes_de_recherche/Cancerol
ogie_appliquee_et_epissage_alternatif_
TITRE : CAractérisation Multiparamétrique des Cancers de l’OEsophage et de L’ESTomac
(CAMCOEST)
Résumé du projet L’incidence des cancers de l’estomac et de la jonction œsogastrique
augmente. Environ 6 550 nouveaux cas de cancers de l'estomac ont été diagnostiqués
en France en 2012, la région du Grand Ouest étant particulièrement touchée, et le
département du Finistère se situant au premier rang. Le pronostic de ce cancer est
particulièrement mauvais avec 30 % de stades métastatiques au diagnostic. Les
thérapeutiques disponibles montrent alors leurs limites. L’objet de ce projet sera
d’étudier un groupe de tumeurs de notre base de données clinico-biologiques. Il
s’agira, d’une part, d’identifier des cibles actionnables de l’oncogénèse en combinant
les données d’une analyse de génomique et de transcriptomique comparatives de
tumeurs au stade précoce (endobrachy-œsophage) et avancé métastatique, ainsi
qu’un échantillonnage multiple au sein de chaque tumeur afin de bénéficier de
l’information phylogénétique portée par l’hétérogénéité intra-tumorale. D’autre part, il
s’agira d’analyser, dans un modèle cellulaire bien caractérisé (lignée cancéreuse
gastrique humaine HGT-1), les rôles joués par certains des gènes dont la dérégulation
aura été mise en évidence par l’approche pangénomique, dans des voies magnifiées
(prolifération, résistance à l’apoptose, invasion, etc.) ou au contraire inhibées
(suppression tumorale) dans ce cancer. Enfin, l’ensemble de ces informations sera
intégré dans un modèle de biologie systémique construit sur la base d’équations
booléennes, voire d’équations différentielles ordinaires selon le nombre et la nature des
paramètres identifiés.