Fiche unité Inserm 964 - Inserm Grand-Est

Institut de génétique et de biologie
moléculaire et cellulaire (IGBMC)
Unité 964
Directeur : Bertrand Séraphin
En partenariat avec : Université de Strasbourg
CNRS
1 rue Laurent Fries
B.P. 10142
67404 Illkirch cedex
Tél. : + 33 (0)3 88 65 32 00
Fax. + 33 (0)3 88 65 32 01
[email protected]
www.igbmc.fr
Equipes
 Biologie du développement et cellules souches
Biophysique de la croissance et de la division cellulaire
Gilles Charvin, [email protected]
Rôle de l'acide rétinoïque dans le développement de la souris
Pascal Dolle, [email protected]
Différenciation et physiopathologie des cellules endocrines pancréatiques et intestinales
Gérard Gradwohl, [email protected]
Analyses moléculaires et génétiques de la neurogénèse chez drosophila melanogaster
Pascal Heitzler, [email protected]
Plasticité cellulaire et reprogrammation directe chez c. Elegans
Sophie Jarriault, [email protected]
Forces et signaux régulant la morphogenèse des tissus
Michel Labouesse, [email protected]
Développement des muscles et des vertèbres
Olivier Pourquié, [email protected]
Biologie moléculaire des lymphocytes B
Bernardo Reina San Martin, [email protected]
La signalisation cellulaire du stress dans le métabolisme et l’inflammation
Romeo Ricci, [email protected]
Physique cellulaire
Daniel Riveline, [email protected]
Biologie cellulaire de l’intégrité du génome
Evi Soutoglou, [email protected]
Cycle cellulaire et signalisation de l'ubiquitine
Izabela Sumara, [email protected]
Chromatine et épigénétique dans le développement de l'embryon précoce de souris
Maria Elena Torres-Padilla, [email protected]
Etude des interactions mécanique et génétique lors de la morphogénèse du poisson zèbre
Julien Vermot, [email protected]
 Biologie structurale intégrative
Biologie structurale de cibles épigénétiques
Jean Cavarelli, [email protected]
Modélisation moléculaire
Annick Dejaegere, [email protected]
Structure et dynamique des polymères biologiques par résonance magnétique nucléaire
Bruno Kieffer, [email protected]
Grands complexes impliques dans l'expression des gènes
Bruno Klaholz, [email protected]
Expression de l'information génétique
Dino Moras, [email protected]
Bases moléculaires de la régulation de la chromatine et de la transcription
Christophe Romier, [email protected]
Stabilité de la chromatine et mobilité de l'ADN
Valérie Lamour et Marc Ruff, [email protected] et [email protected]
Architecture des systèmes nucléoprotéiques par microscopie électronique 3D
Patrick Schultz, [email protected]
Régulation de la transcription
Albert Weixlbaumer, [email protected]
Ribosomes
Marat Yusupov, [email protected]
Bases moléculaires de la synthèse protéique par le ribosome
Gulnara Yusupova, [email protected]
 Génomique fonctionnelle et cancer
Dissection génétique des voies de signalisation des récepteurs nucléaires chez la souris.
Pierre Chambon et Daniel Metzger, [email protected] et [email protected]
Hématopoïèse et leucémogenèse chez la souris.
Susan Chan et Philippe Kastner, [email protected] et [email protected]
Expression et réparation du génome.
Frédéric Coin et Jean-Marc Egly, [email protected] et [email protected]
Contrôle de l’expression des gènes et cancer.
Irwin Davidson, [email protected]
Rôle des voies de signalisation de l’acide rétinoïque dans la différenciation des cellules
souches de la lignée germinale.
Norbert Ghyselinck et Manuel Mark, [email protected] et [email protected]
Mécanismes cellulaires et moléculaires de la différenciation du système nerveux.
Angela Giangrande, [email protected]
Biologie des systèmes des décisions du destin cellulaire dans les cellules normales et
tumorales.
Hinrich Gronemeyer, [email protected]
Chromatine et régulation épigénétique.
Ali Hamiche, [email protected]
Biologie moléculaire et cellulaire des cancers du sein.
Marie-Christine Rio et Catherine Tomasetto,
[email protected] et [email protected]
Dialogue entre les récepteurs nucléaires de l'acide rétinoïque et les voies de signalisation
Cécile Rochette-Egly, [email protected]
Epigénétique fonctionnelle et régulation de la chromatine.
Robert Schneider, [email protected]
Réseaux et complexes protéiques régulant la dégradation des ARN messagers eucaryotes.
Bertrand Séraphin, [email protected]
Organisation spatiale du génome au cours du développement des lymphocytes T
Thomas Sexton, [email protected]
Modifications de la chromatine et régulation de la transcription des gènes lors de la
différentiation cellulaire.
Laszlo Tora, [email protected]
Ontogénèse et pluripotence des cellules germinales primordiales.
Stéphane Viville, [email protected]
Biologie moléculaire et cellulaire du cancer.
Bohdan Wasylyk, [email protected]
 Médecine translationnelle et neurogénétique
Maladies à gain de fonction d’ARN.
Nicolas Charlet-Berguerand, [email protected]
Génétique et physiopathologie de maladies neurodéveloppementales et épileptogènes
Jamel Chelly, [email protected]
Physiopathologie des aneuploïdies, gènes a effet de dose et trisomie 21.
Yann Herault, [email protected]
Système opioïde et fonction cérébrale.
Brigitte Kieffer, [email protected]
Physiopathologie des maladies neuromusculaires.
Jocelyn Laporte, [email protected]
Mécanismes génétiques des maladies neuro-développementales.
Jean-Louis Mandel, [email protected]
Mécanismes fondamentaux et physiopathologiques impliques dans les ataxies récessives.
Hélène Puccio, [email protected]
Maladies par expansion de polyglutamine : des mécanismes pathogéniques aux stratégies
thérapeutiques.
Yvon Trottier, [email protected]
projet scientifique
Institut européen de recherche biomédicale de haut niveau associant CNRS, Inserm et Université de
Strasbourg, l'IGBMC emploie plus de 750 personnes (dont 250 étudiants et post-docs).
50 nationalités y sont représentées.
Ses 50 équipes de recherche bénéficient d'un environnement technologique de pointe composé de
plusieurs plateformes de haute technologie et services scientifiques.
La recherche s'organise en 4 départements :
 Biologie structurale intégrative,
 Génomique fonctionnelle & cancer,
 Biologie du développement & cellules souches,
 Médecine translationnelle & neurogénétique
Pour explorer les mécanismes qui régulent l'expression des gènes dans le développement, la
physiologie et les maladies, l'IGBMC a mis en place ces dernières années une stratégie scientifique
définissant 4 priorités transversales interdépartementales :
 Signalisation cellulaire et dynamique nucléaire,
 Modèles murins pour les maladies humaines,
 Bioinformatique et biocomputing
 Analyses intégratives de l’expression des gènes et de l’epigénome
Laboratoire d’excellence depuis 2012, l'IGBMC renforce son environnement scientifique grâce au
recrutement de chaires d’excellence, de formations de haut niveau, et d'une politique forte de transfert
de technologies vers le monde industriel. En 2015, l’IGBMC a inauguré son troisième bâtiment, qui
abrite le Centre de Biologie Intégrative (CBI).
Chaque année, plus de 250 publications scientifiques sont publiées dont 25 sont relayées pour le
grand public sur igbmc.fr.
Les personnels de l’IGBMC s’impliquent également dans plusieurs rendez-vous annuels avec le grand
public dont la Fête de la science, le Téléthon et le Relais pour la vie.
Retombées attendues en santé publique
L’IGBMC se distingue par des travaux dans plusieurs domaines d’importance en santé publique :
identification et traitement de maladies génétiques, développement des cellules souches, génération
de modèles et d’études préclinique pour des cancers, utilisation d’étude structurale pour les études
mécanistiques et l’optimisation de médicaments, recherches en immunologie et maladies infectieuses,
études de maladies métaboliques. Ces études bénéficient d’une forte expertise dans la génération de
modèles animaux ainsi que de liens privilégiés avec la faculté de médecine de Strasbourg.
Les études des maladies génétiques se focalisent sur les maladies rares touchant les muscles et le
système nerveux et incluent le développement de thérapies géniques.
Leaders dans le domaine de la recherche sur les cellules souches, les chercheurs de l’IGBMC
travaillent dans l’objectif de développer une gamme d’outils utiles à la médecine régénérative, grâce à
une meilleure compréhension des mécanismes de reprogrammation cellulaire et de formation
embryonnaire d’un organe.
Des retombées directes en santé publique sont attendues des travaux issus de projets collaboratifs
avec des industries dans des domaines aussi variés que l’optimisation de nouvelles molécules
thérapeutiques comme les antibiotiques, les traitements novateurs contre le diabète de type II, et les
troubles cognitifs liés à la trisomie 21. Dans le domaine du cancer, les recherches menées à l’IGBMC
contribuent à la définition de nouvelles cibles ainsi qu’aux développements diagnostiques et
thérapeutiques.
Activités valorisables, licences, brevets
Les innovations des équipes de l’IGBMC ont permis le dépôt de 18 brevets depuis 2012 dans
différents domaines d’application (traitement des maladies rares, du cancer et d’autres maladies ;
outils de diagnostic ; biotechnologies ; chimie ; traitement du signal).
6 projets de maturation « preuve de concept » ont été soutenus par la SATT Conectus Alsace
depuis 2012, pour les projets Synaggreg, OneagainstS100b, RiboViz, NGS-QC Generator,
DynaCure et SSGT).
4 start-up ont été créées depuis 2011 : ANAGENESIS Biotechnologies, BRCELL (anciennement
RINGTECH), AAVLife et CASC4DE.
Lauréat
Investissement d’Avenir
Contrats européens
en cours
ERC Starting et Advanced
Grant
en cours
Laboratoire d’excellence

HEM_ID (Kastner)
 Nicolas CHARLET (ERC Stg)
INRT (INRT = Integrative

SARCOSI (Laporte)
 Romeo RICCI (ERC Stg)
biology : Nuclear dynamics,

EPIGENESYS (Torres-Padilla)
 Maria-Elena TORRES-
Regenerative and

ADDRESS (Soutoglou & Egly)
PADILLA (ERC Stg)
Translational medicine)

NADRCT (Soutoglou)

In Vivo_RA_NonCanon
Infrastructures en
biologie et santé :
(M-C Indiv. chez Ghyselinck)
 Sophie JARRIAULT
(ERC Cog)

AB SYSBIO (Hérault)
-
PHENOMIN

NR-NET (Tora)
-
FRISBI

GLORIA (Gaveriaux-Ruff)
-
France GENOMIQUE
-
INGESTEM

NEUROPAIN (Kieffer)
 Laszlo TORA (ERC Adg)

PLURIMES (Pourquié)
 Marat YUSUPOV (ERC Adg)

A-PARADDISE (Romier)

REGTRANS (Weixlbaumer)
 Michel LABOUESSE (ERC
Adg)
[ERC ≤ 2015]
Hélène PUCCIO (ERC Stg)
Robert SCHNEIDER (ERC Stg)
+
2 NIH, 3HFSP & 2 Interreg
Bruno KLAHOLZ (ERC Stg)
Jean-Marc EGLY (ERC Adv)
Olivier POURQUIE (ERC Adv)
Pôle de compétitivité
Dans le cadre du pôle de compétitivité "santé" Alsace BioValley, 3 grands projets associant de multiples
partenaires, sont actuellement financés :

projet MIDI (financement Région Alsace et FEDER de 310 000 €),

projet ATHOS (financement OSEO FUI et Région Alsace de 960 000 €)

projet TRIAD (financement BPI FUI de 375 000 €).
Les 10 dernières publications majeures du laboratoire
Structure of the human 80S ribosome.
Heena Khatter, Alexander G. Myasnikov, S. Kundhavai Natchiar & Bruno P. Klaholz
Nature April 22, 2015
Insulin granules. Insulin secretory granules control autophagy in pancreatic β cells.
Goginashvili A, Zhang Z, Erbs E, Spiegelhalter C, Kessler P, Mihlan M, Pasquier A, Krupina K, Schieber N,
Cinque L, Morvan J, Sumara I, Schwab Y, Settembre C, Ricci R.
Science Feb. 20, 2015
Iron Regulatory Protein 1 Sustains Mitochondrial Iron Loading and Function in Frataxin Deficiency.
Alain Martelli, Stéphane Schmucker, Laurence Reutenauer, Jacques R.R. Mathieu, Carole Peyssonnaux,
Zoubida Karim, Hervé Puy, Bruno Galy, Matthias W. Hentze, Hélène Puccio
Cell Metabolism Feb. 2015
Nuclear position dictates DNA repair pathway choice.
Lemaître C, Grabarz A, Tsouroula K, Andronov L, Furst A, Pankotai T, Heyer V, Rogier M, Attwood KM, Kessler
P, Dellaire G, Klaholz B, Reina-San-Martin B, Soutoglou E.
Genes & Development Nov. 15, 2014.
Structural basis for the inhibition of the eukaryotic ribosome.
Garreau de Loubresse N, Prokhorova I, Holtkamp W, Rodnina MV, Yusupova G, Yusupov M.
Nature Sept. 25, 2014
The SAGA coactivator complex acts on the whole transcribed genome and is required for RNA polymerase II
transcription.
Bonnet J, Wang CY, Baptista T, Vincent SD, Hsiao WC, Stierle M, Kao CF, Tora L, Devys D.
Genes & Development. Sept. 15, 2014
Transdifferentiation. Sequential histone-modifying activities determine the robustness of transdifferentiation.
Zuryn S, Ahier A, Portoso M, White ER, Morin MC, Margueron R, Jarriault S.
Science Aug. 15, 2014
Domains of genome-wide gene expression dysregulation in Down's syndrome
Letourneau A, Santoni FA, Bonilla X, Sailani MR, Gonzalez D, Kind J, Chevalier C, Thurman R, Sandstrom RS,
Hibaoui Y, Garieri M, Popadin K, Falconnet E, Gagnebin M, Gehrig C, Vannier A, Guipponi M, Farinelli L, Robyr
D, Migliavacca E, Borel C, Deutsch S, Feki A, Stamatoyannopoulos JA, Herault Y, van Steensel B, Guigo R,
Antonarakis SE.
Nature April 17, 2014
Prevention and reversal of severe mitochondrial cardiomyopathy by gene therapy in a mouse model of
Friedreich's ataxia.
Perdomini M, Belbellaa B, Monassier L, Reutenauer L, Messaddeq N, Cartier N, Crystal RG, Aubourg P,
Puccio H.
Nature Medicine May 2014
ANP32E is a histone chaperone that removes H2A.Z from chromatin.
Obri A, Ouararhni K, Papin C, Diebold ML, Padmanabhan K, Marek M, Stoll I, Roy L, Reilly PT, Mak TW,
Dimitrov S, Romier C, Hamiche A.
Nature Jan. 30, 2014