Présentation DR CS 2011

Transcription

Conseil Scientifique de la
Fondation Infectiopôle Sud
Professeur Didier Raoult
Hôtel Nord Pinus - Place du Forum - 13200 Arles, France
Histoire de l’IHU
A.
B.
C.
D.
E.
F.
G.
Rapport de Mission sur le bioterrorisme
Contrat de Plan Etat-Région (CPER)
RTRS Infectiopôle Sud
Pôle des Maladies Infectieuses
Les unités de recherche à Marseille
L’IHU POLMIT
Méditerranée Infection
380 pages
Lien internet : http://www.ifr48.com/spip.php?article80
Recommandation
Il est indispensable d'y mettre en place une
surveillance sur la mortalité, une déclaration par
syndromes et sur la consommation de molécules
à activité antiinfectieuse (pharmacosurveillance)
afin de détecter les événements anormaux.
Infectiopôle
Créer rapidement 7 infectiopôles à Paris (Necker, IPP), Marseille, Lyon, Lille, Bordeaux, Toulouse et Montpellier avec
un financement (PHRC et ministère de la Recherche).
Faire réaliser un projet par site intégrant les forces en présence et en développant des thèmes spécifiques.
Créer des ensembles épidémiologiques dans ces infectiopôles associant CIRE, ORS, CNR et créer les Centres de
Référence manquants.
Délocaliser des forces de l’InVS dans ces pôles.
Créer des Centres de Référence par exemple par syndrome.
- Pneumonie sévère à Lyon
- Maladies tropicales à Marseille
- Maladies transmises par les arthropodes à Marseille
- Maladies sexuellement transmises à Bordeaux
- Mycologie médicale à Lille
Créer un comité de pilotage national et un comité d’évaluation international.
Créer un comité de pilotage national et un comité d’évaluation international.
Confier le développement de la recherche sur les agents de bioterrorisme orphelins aux infectiopôles avec les moyens
afférents:
- Tularémie à Marseille
- Chlamydia psittaci à Bordeaux
- Burkholderia à Toulouse
- Pox virus à Lyon
Développer les collections locales des infectiopôles.
- Phages à Toulouse.
- Rickettsies à Marseille
- Virus émergents à Marseille/Lyon
- Charbon à IP Paris
- Peste à IP Paris
- F. tularensis à Marseille
Il faut créer des infectiopôles Outremer en réunissant Institut Pasteur, IRD et SSA et en choisissant un seul site par
continent.
Il faut demander à l'IRD de respecter les engagements de l'Etat et de localiser des forces en médecine tropicale à
Marseille.
Histoire de l’IHU
A.
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F.
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L’IHU POLMIT
72 pages
Projet CPER
•
Regrouper les forces du CHU en un pôle transversal de maladies infectieuses et microbiologie incluant des
acteurs ayant une formation commune :
- Les 2 services de maladies infectieuses (Pr. Ph. Brouqui, Pr. A. Stein)
- Les 3 services de bactériologie-virologie- hygiène (Pr. B. La Scola, Pr. M. Drancourt, Pr. D. Raoult)
- Les CISIH, le CLIN, la Parasitologie
•
Organiser avec le SAMU (JP. Auffray) et les urgentistes (B. Sékéné) :
- Le préacheminement des urgences contagieuses (infections respiratoires)
- La standardisation des prélèvements et des thérapeutiques des patients hospitalisés
•
Mettre en place une standardisation des thérapeutiques d’infections chroniques (evidence based ou protocole
approuvé) :
- Endocardites
- Infections sur matériel osseux
- Zoonoses chroniques
- Prise en charge HIV (à faire avec le CISIH)
- Prise en charge des hépatites chroniques (à faire avec les gastroentérologues)
•
Mettre en place une plate-forme médicale ouverte pour la gestion des malades contagieux :
- Lits ouverts
- Responsabilité médicale partagée isolement des BMR :
- traitement des tuberculoses,
- maladies contagieuses pédiatriques,
- soins intensifs de patients contagieux,
- soins d’urgence.
•
Mettre en place une plate-forme biologique :
- Laboratoires A3P3: 1000 m2
- Proteomique
- Séquençage
- Microarray
- Biologie structurale
Les acteurs du projet CPER
L'université
L'établissement français du sang
Le CHU
Le CNRS
L'INSERM
L'IMTSSA
L'institut Pasteur
L'IRD
Les centres nationaux de référence et les centres collaborateurs
OMS
Les IFR
Le génopole
Les plates-formes du projet CPER
La bioinformatique
La protéomique
L'expression des protéines
La biologie structurale
Le transcriptome
L'étude morphologique
Animaleries transgéniques
Manipulation des pathogènes
Biothèque
Le plan de financement
Histoire de l’IHU
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L’IHU POLMIT
16 pages
8 projets CTRS/RTRS ont été retenues dont le RTRS Infectiôpole Sud
Création de la Fondation Infectiôpole Sud
•
•
•
•
Date du décret : 27/11/2007
Date du Journal Officiel : 29/11/2007
Statut : Fondation de Coopération Scientifique
Plan de financement :
– 7,5 M€ de dotation initiale dont 1 M€ de dotation non consomptible
– soit 4 M€ de l’Etat et 3,5 M€ des 14 membres fondateurs (250 K€ / fondateur).
1. Aider à la construction d’un bâtiment.
2. Financer des équipements innovants.
3. Formation pour les étudiants du Sud.
4. Organiser et animer la coopération scientifique.
Composition du Comité de Pilotage
Didier RAOULT, Université de la Méditerranée, Marseille
Tél 04 91 32 43 75 - [email protected]
Yolande OBADIA, Observatoire Régional de la Santé
Tél. 04 91 59 89 00 - [email protected]
MARSEILLE
MONTPELLIER
Jean-Pierre GORVEL, Luminy, Marseille
Didier FONTENILLE, IRD, Montpellier
Jean-Louis MEGE, Ecole doctorale, Marseille
Christian DEVAUX , Université Montpellier 1
Tel. : 04 34 35 94 02 - [email protected]
Bruno PRADINES, IMTSSA
Tel. 04 91 15 01 10 - [email protected]
Jacques REYNES, CHU de Montpellier
Tél. 04 67 33 72 20 - [email protected]
NICE
Henri VIAL, université de Montpellier
Pierre DELLAMONICA, CHU de Nice
Tél . 04 92 03 55 15 - [email protected]
NIMES
Emmanuel LEMICHEZ, Université de Nice Sophia
Antipolis
Albert SOTTO, CHU de Nîmes
[email protected]
LE FINANCEMENT DES EQUIPEMENTS 2008 - 2011
Depuis 2008, plus de 2.5 M € de matériel a été financé par l’Infectiopôle Sud dont plus de k€ par
le Conseil régional PACA:
Financement 2008
Montpellier
Marseille
Nice
Total 2008
107 121 €
286 368 €
245 834 €
639 323 €
Financement 2009
Montpellier
Marseille
Nice
Total 2009
208 791 €
331 309 €
114 500 €
654 600 €
Financement 2010
Montpellier
Marseille
Nice
Total 2010
109 473 €
286 368 €
245 834 €
641 675 €
Financement 2011
Montpellier
Marseille
Nice
Total 2011
Total 2008 - 2011
100 179 €
311 250 €
156 988 €
568 417 €
2 504 015 €
EQUIPEMENT FINANCE PAR L’INFECTIOPOLE SUD 2008
Total financement Infectiopôle Sud 2008: 278 000 €
Financement 2008
Laboratoires bénéficiaires
Equipement demandé
Montant de la
subvention
Marseille
AFMB
Financement d'un poste d'assistant Ingénieur pour 2
ans
66 000 €
CIML
Co-financement d'un système de fractionnement des
extraits biologiques
25 000 €
Inserm - CNRS
Aménagement d’une pièce de culture
57 000 €
IFR 48
Faculté de médecine
Acquisition d'un système d'analyse miniaturisée du
génome entier par optical mapping
80 000 €
Inserm
Co-financement d'un microscope multi photon
25 000 €
Total - Marseille 2008
253 000 €
Nice
Université de Nice Sophia Antipolis
Frais de fonctionnement des premiers
développements technologiques utilisant un
Séquenceur SolidTM pour de séquençage
massivement parallèle
25 000 €
Total - Nice 2008
25 000 €
Total 2008
278 000 €
Total financement intégral Infectiopôle Sud 2009: 230 463 €
Equipement financé par la Fondation Infectiopole Sud
Equipement demandé
Montant de la
subvention
IBMM
Faculté de pharmacie
Montpellier
Chaîne Ultra Performance Liquide Chromatographie
(UPLC, Waters)
38 291 €
URMITE
Marseille
Dépannage "GS FLX"
11 672 €
Laboratoire de virologie
Hôpital Lapeyronie
Montpellier
Cytomètre en flux
39 500 €
IRD
Montpellier
Equipement Pôle Santé Internationale
32 000 €
CPBS
Montpellier
Plateau technique d'histologie de la plate-forme
d'expérimentation animale (A3/L3)
48 000 €
Institut Bouisson Bertrand
Montpellier
Equipement mutualisé Pôle Santé
38 000 €
IGMM
Montpellier
Plateforme bioinformatique
13 000 €
INSERM U895 - C3M
Nice
Système de détection en bioluminiscence de type IVIS
Xenogen
10 000 €
Sous-total subvention Fondation Infectiopole
Sud
230 463 €
EQUIPEMENT FINANCE A PARITE PAR LE CONSEIL
REGIONAL PACA ET L’INFECTIOPOLE SUD 2009
Total co-financement région PACA 2009 / Infectiopôle Sud: 424 137 €
Equipement co-financé Fondation Infectiopole Sud / Conseil Régional PACA (50%)
Laboratoire bénéficiaire
Equipement demandé
Montant de la
subvention
URMITE
Marseille
Spectromètre de masse
99 500 €
URMITE
Marseille
Insectarium
96 000 €
INSERM U895 - C3M
Nice
Laboratoire de niveau L3
104 500 €
CNRS UMR 5236
Marseille
Calculateurs - Stokage sécurité - Evaporateur
64 137 €
CIML
Marseille
Isolateur - 2 hottes - 1 ordinateur portable
60 000 €
Sous- total subvention co-financement
Fondation Infectiopole Sud / CR PACA
424 137 €
Co-financement CR PACA 2009
200 000 €
Soit un total de 654 600 € pour 2009
EQUIPEMENT FINANCE PAR
L’INFECTIOPOLE SUD 2010
Total financement intégral Infectiopôle Sud 2010 : 107 121 €
Equipement demandé
Montant de la
subvention
CPBS / UM 2
Montpellier
Lecteur et laveur de microplaques
12 000 €
IRD
Montpellier
PCR en temps réel
48 241 €
UMR2724
Montpellier
2 agitateur incubateur XL réfrigéré
1 électroporateur
1 table anti-vibrations pour microscope
46 880 €
Sous-total subvention Fondation
Infectiopole Sud 2010
107 121 €
REGIONAL PACA ET L’INFECTIOPOLE SUD 2010 (1/2)
Total co-financement région PACA / Infectiopôle Sud 2010 – Marseille: 286 368 €
Equipement demandé
Montant de la
subvention
Marseille
URMITE - CNRS - IRD UMR 6236
Plateforme robotique à haut débit pour PCR
120 000 €
CNRS -UMR 6236
Matériels nécessaires au maintient en vie des
vers et à leur reproduction, ainsi qu’a leur
entretien en environnement stérile
38 272 €
AFMB UMR 6098
4 Serveurs Apple Xserve
1 Switch réseau 48 ports
26 236 €
URMITE
Enceinte d’incubation en atmosphère sous
hydrogène
Appareil de lyse mécanique des parois
bactériennes
41 860 €
CIML
Microscope confocal à acquisition ultra rapide
“spinning disk”
60 000 €
286 368,20 €
REGIONAL PACA ET L’INFECTIOPOLE SUD 2010 (2/2)
Total co-financement région PACA / Infectiopôle Sud 2010 – Nice : 245 834 €
Equipement demandé
Montant de la
subvention
Nice
INSERM U895 - C3M
Remplacement de matériel de microscopie
28 315 €
Hôpital l'Archet - Inserm U576
Laser (405nm) sur un cytomètre trieur
65 780 €
Faculté de Médecine de Nice
Microscope inversé à fluorescence
36 000 €
Université de Nice Sophia Antipolis
Lecteur de type G2565CA
60 000 €
CHU de Nice – Hôpital de l’Archet
Matériel de capture pour phlébotomes ou
moustiques
55 739 €
Total - Nice 2010
245 834,14 €
Total équipement co-financé région PACA / Infectiopôle Sud 2010: 532 202 €
Soit un total de 639 323 € pour 2010
Total financement intégral Infectiopôle Sud 2010 : 100 179 €
Laboratoires bénéficiaires et associés
Equipement demandé
Montant de la subvention
UMR5235 - CNRS / UM 1 & 2
Montpellier
un osmoseur
une « armoire » d’hébergement pour le poissonzèbre
33 000 €
UMR 5236 - CPBS
Montpellier
Lecteur de microplaques multimode (absorbance et
fluorescence) pour plateforme L3
17 179 €
UMR5236 - CNRS/UM 1 & 2
Montpellier
un bras de chargement twister II
* un incubateur à 37°C compatible avec le robot
CALIPER
* un logiciel de pilotage du bras de chargement vers
l’incubateur
* une navette de transfert (sortie robot CALIPER
vers bras twister)
50 000 €
Sous-total subvention Fondation
Infectiopole Sud 2011
100 179 €
REGIONAL PACA ET L’INFECTIOPOLE SUD 2011 1/3
Total co-financement région PACA 2011 / Infectiopôle Sud : 468 238 €
Equipement demandé
Montant de la subvention
Marseille
LATP UMR 6632
CNRS -UMR 6236
AFMB UMR 6098
INSERM UMR 891/ INSTITUT PAOLI
CALMETTES / IBiSA CANCER
3 lames
17 093 €
Matériel nécessaire au suivis de l’ubiquitinylation, à la mesure des
taux d’ubiquitinylation et à la purification de protéines ubiquitinylées
afin d’identification :
- Analy prot spect service
- centrifugeuse refrigeré
- RNA seq service
- cryo polystat
50 000 €
Un laser nanoseconde 266nm, adapté à des études de cinétique rapide
dans le cadre de la caractérisation du mode d’action de molécules
antivirales.
Un système de synthèse en parallèle adapté pour l’optimisation des
hits
Un outil d’analyse pour les molécules nouvellement synthétisées
84 000 €
compteur de cellules automatisé
12 600 €
Total co-financement région PACA 2011 / Infectiopôle Sud – Marseille : 311 250 €
Un congélateur vertical -30 C acceptant les racks de plaque 96 puits
dans lesquelles sont livrées les chimiothèques
Une étuve CO2 stérilisable réservée au criblage de la chimiothèque
pour l’inhibition de la réplication virale en cellules
17 701 €
UVE- UMR190 - IRD
Le cœur du dispositif est constitué d’un microscope à fluorescence,
confocal, inversé et motorisé.
Il est équipé d’un module FCS, d’une camera
et d’un incubateur tempéré à CO2.
35 000 €
URMITE
Faculté de Médecine
Lyophilisateur haut-débit pour lyophilisation des réactifs de diagnostic
moléculaire utilisés dans le SENEPOC (point-of-care, Sénégal): deux
unités.
58 614 €
CIML
UMS - CIPHE
Cryostat
36 242 €
AFMB UMR 6098
311 250,00 €
Total co-financement région PACA 2011 / Infectiopôle Sud – Nice : 156 988 €
Nice
INSERM U895 - C3M
2 enceintes pour hamsters
29 117 €
ERI21/EA 4319
Système de détection microplaque multimarquage envision xcite
mono detecteur
58 847 €
Matériel de culture des parasites :
- 1 étuve à CO2 pour la préparation de stades amastigotes
axéniques de Leishmania infantum et pour la culture de
monocytes.
- 1 agitateur magnétique et chauffant pour la préparation des
milieux de culture.
Matériel de quantification des parasites en culture, d’évaluation de
Inserm U895 / CHU de Nice / Université
la viabilité et quantification des charges parasitaires par
de Nice-Sophia Antipolis
luminescence:
- 1 lecteur de plaques
- 1 ordinateur PC pour le lecteur de plaques
Matériel d’évaluation des charges parasitaires par PCR en temps
réel :
- 1 hotte pour PCR
- 1 pipette multicanaux
- 1 Logiciel « GeneMapper » d’Applied
Total - Nice 2011
→ Soit un total de 568 417 € pour 2011
69 024 €
156 988,00 €
Boursiers Infectiopôle Sud 2008 - 2012
Total thèses : 45
Total Post-Doc : 35
Total Master 2 : 35
Internes : 11
Total Boursiers 2008 - 2012 : 131
Professeurs : 5
Répartition des bourses de thèses et des
contrats post-doctoraux par ville 2008 – 2012 (1/2)
35 contrats post-doctoraux
45 bourses de thèses
Marseille
Marseille
11
13
3
13
7
3
8
3
2
10
Montpellier
2
Nice
1
Montpellier
1
1
Nîmes
Nîmes
2
Nice
Répartition des contrats de professeurs invités par ville
Ville
Sujet de recherche
Nationalité
"Pharmacologie de l'ARN polymérase bactérienne et la résistance au Rifampicin"
Russie
Ecologie des phlébotomes, épidémiologie des leishmanioses
Turquie
Import of mitochondrial porin VDAC1 by rickettsiae — an evolutionary connection
and possible molecular basis of obligate endosymbiosis
Russie
Montpellier
Marseille
"Neuradapt: évaluation des troubles neurocognitifs chez les patients séropositifs pour
le VIH"
Nice
Italie
"Le suivi longitudinal des patients séropositifs pour au VIH présentant des troubles
neurocognitifs"
Annonces
Published in Nature
Published in Lancet
Rayonnement vers le Sud Infectiopôle Sud 1/4
Origines des candidatures – Financement 2010 et 2011
Canada
Etats Unis
Cuba
Mexique
Guatemala
Guyane F
Pérou
Brésil
Russie
Estonie
Royaume-Uni
Allemagne
Irlande
Pologne
Belgique Autriche
Ukraine
Moldavie
Slovénie
France
Roumanie
Espagne
Italie Bosnie
Chine
Portugal
Turquie Arménie
Pakistan
Liban
Corée du Sud
Tunisie
Iran
Nepal
Jordanie
Koweït
Maroc
Bangladesh
Algérie
Egypte Bahreïn Inde
Tchad
Thaïlande
Mali
Sénégal
Vietnam
Burkina Faso Bénin
Soudan Djibouti
Nigéria
Guinée
Philippines
Ethiopie
Cote d’Ivoire
TogoCameroun
Malaisie
Sri Lanka
Ghana
Kenya
Congo RDC
Indonésie
Malawi Comores
Namibie
Légende
Zimbabwe
Australie
1 personne
Uruguay
Argentine
41 personnes
Kenya
59 personnes
Burkina Faso 83 personnes
France
430 personnes
Inde
441 personnes
Madagascar
Afrique du Sud
Origine des boursiers Infectiopôle Sud 2008 - 2012
Russie
Espagne
États-Unis
Maroc
Sénégal
Mexique
Guinée
Colombie
Légende
Italie
Turquie
Burkina Faso
Gabon
Cameroun
10 chercheurs
Inde
Congo
Comores
1 chercheur
5 chercheurs
Argentine
Chine
Chypre
Liban
Tunisie Égypte
Algérie
Soudan
Sud-Afrique
Vietnam
Thaïlande
Origine des boursiers Infectiopôle Sud 2008 - 2011
Soudan; 1 Sud-Afrique; 1
Egypte; 1
Espagne; 1 Syrie; 1 USA; 1
Comores; 1
Colombie; 1
Inde; 10
Argentine; Chypre; 1
1 Turquie; 2
Russie; 2
Maroc; 6
Mexique; 2
Liban; 2
Tunisie; 5
Italie; 2
Congo; 2
Chine; 4
Vietnam; 3
Thaïlande; 3
Guinée; 4
Gabon; 3
Cameroun; 3
Burkina; 3
Sénégal; 4
Algérie; 3
Origine des boursiers Infectiopôle Sud 2008 – 2011
Amérique du Sud;
3
En cours de
recrutement; 1
Europe; 3
Afrique
Sub-Saharienne; 19
Maghreb
Moyen-Orient; 16
Asie; 15
Sujets de recherche des boursiers Infectiopôle Sud
parasitologie
21%
Bactériologie
50%
virologie
19%
Vecteurs
10%
12
10
8
2008
6
2009
4
2010
2
0
Bactériologie
Vecteurs
virologie
parasitologie
Répartition des financements de chercheurs par ville
2008 – 2012 (2/2)
Ville
Doctorants
Post-Doctorants
Professeurs Invités
Montpellier – Marseille
13
11
Nice - Marseille
3
3
Nîmes - Nice
1
Montpellier - Nice
3
1
Montpellier - Nîmes
1
1
Marseille
13
12
2
Montpellier
8
7
2
Nice
3
3
1
TOTAL
45
38
5
Journées Infectiopôle Sud 1/5
2008 – Nice
Définition du projet Infectiopôle Sud :
- Création d’un pôle de maladies infectieuses
- Partenaires :
- Urgences
- Contagion
- Traitement des infections chroniques
- Plateformes médicales
- Plateformes biologiques
- Conjuguer la recherche, le transfert, la surveillance, l’infection et le soin : l’Infectiopôle
Thèmes abordés :
1. Sante publique et réponse aux maladies infectieuses : JP. Gorvel – A. Flahaut
2. Biologie des processus infectieux : M. Benkirane – S. Cole
3. Réponses thérapeutiques : P. Hofman – P. Courvalin
4. Infectiologie en régions : M. Morillon – T. Baltz
2009 - Marseille
Présentation de l’évolution de l’Infectiopôle Sud durant l’année 2008-2009.
Actions sur les recommandations du comité scientifique de 2008.
Thèmes abordés :
1. La mise au point sur les maladies émergentes, en particulier respiratoires et
diarrhéiques, par des experts internationaux.
2. Le rapport entre recherche et l’industrie, session organisée par Eurobiomed avec
l’aide du vice-président, Pierre Dellamonica.
3. La valorisation des travaux menés par les boursiers de l’Infectiopôle sud.
2010 - Montpellier
Présentation de l’évolution de l’Infectiopôle Sud durant l’année
2009-2010
Thèmes abordés :
1. Les pathologies prédominantes dans les pays du Sud présentées part
des experts internationaux de l’Infectiopôle Sud
2. La valorisation des travaux menés par les boursiers de l’Infectiopôle
Sud par la sélection d’un boursier par ville (Montpellier, Marseille et
Nice) par le Comité de Pilotage
2011 - Nice
Présentation de l’évolution de l’Infectiopôle Sud depuis 2008
Bilan sur les activités de la fondation Infectiopôle Sud et évolution vers l’IHU;
Thèmes abordés :
La valorisation des travaux menés par les boursiers de l’Infectiopôle Sud : présentation
de posters par tous les boursiers, et sélection de 12 boursiers par un jury scientifique
nommé parmi le Comité de Pilotage, incluant un représentant de chaque ville
(Marseille, Montpellier, Nice).
Nomination et remise de prix à la fin de la journée de 7 boursiers (Médailles d’or,
d’Argent, de Bronze et Prix du Meilleur Poster)
Étudiant (T/P) (Sexe)
(Pays)
Médaille d’Or
CORRALES Rosa
Milagros
(P) (F)
(Argentine)
Titre
ÉquipeVille
M. bovis/
phagosome
maturation
Kremer, L
Montpellier
Benkirane
M,
Montpellier
Médaille
d’Argent
MEZIANE Oussama
(T) (M)
(Maroc)
HIV /RNAi
Médaille
d’Argent
OURY BARRY
Abdoulaye
(T) (M)
(Guinée)
Coxellia burnettii
Ghigo, E
lps membrane
Marseille
trafficking
DIABATE Mamady
(D) (M)
(Guinée)
CNF1
Hemolysine
Médaille de
Bronze
Journées Infectiopôle Sud
5/5
2011 – Nice
LISTE DES NOMINÉS
Lemichez,
E
Nice
Morocco
Tunisia
Thailand
Guinea
Médaille de
Bronze
Médaille de
Bronze
Meilleur Poster
EL BAIDOURI Fouad Genetic structure
(T) (M)
/ évolution
(Maroc)
Leishmania
Ravel, C
Montpellier
SURASOMBATPATT
ANA Pornopat
(T) (F)
(Thaïlande)
Transmission of
Dengue virus
Misse,
Montpellier
SASSI Mohamed
(T) (M)
(Tunisie)
Mycobacterium
chelonaeCambillau,
abscessus
complex and type Marseille
VII secretion
system
Argentina
Site Internet
Fréquentation annuelle
2009 2027
2010 6833
2011 (YTD) 8465
Histoire de l’IHU
A.
B.
C.
D.
E.
F.
G.
L’IHU POLMIT
75 pages
Création du Pôle des Maladies Infectieuses
• 01/01/2007 : l'ensemble des établissements de l'AP-HM fonctionne
désormais sur la base d'une organisation en pôles d'activité.
• Pôle Infectieux n°8 : responsable Pr P. Brouqui
–
–
–
–
–
–
Fédération de Microbiologie, Virologie et Hygiène Hospitalière : D. Raoult,
B. La Scola, M. Drancourt.
Service des maladies infectieuses, Hôpital Nord : P. Brouqui.
Unité d’hospitalisation, Hôpital de la Conception : P. Parola.
Service des Maladies Infectieuses, Hôpital de la Conception : A. Stein.
Service de Parasitologie : R. Piarroux
CLIN : PE. Fournier
Pôle : 3 services classés (1er, 20ème , 23ème) par « le Point ».
Total charges
Résultat déficitaire du
pôle
Dépenses
2010
31 335 395 Total recettes
Résultat excédentaire
du pôle
Recettes
2010
33 140 199
1 804 804
SIGAPS
• Meilleur SIGAPS (18 % de l’AP-HM).
Résultat balance par service
SERVICE
2009
2010
ECART
∆ (%)
FEDERATION CLINIQUE
766 105
797 373
31 268
4%
PARASITOLOGIE
-114 215
11 513
125 728
110%
MALADIES INFECTIEUSES NORD
455 112
402 052
-53 060
-12%
MALADIES INFECTIEUSES CONCEPTION
461 614
593 519
131 905
29%
TOTAL PÔLE 8
1 568 616
1 804 457
235 841
15%
Histoire de l’IHU
A.
B.
C.
D.
E.
F.
G.
Pôle Maladies Infectieuses
L’IHU POLMIT
203 pages
URMITE
Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes
LOCALISATION
o Faculté de Médecine, Faculté de Pharmacie, Faculté d’Odontologie
o Surface totale de l’unité : 2 668 m²
FORCES
o 12 équipes de recherche – 12 thématiques
o 3 équipes délocalisées : 1 IRBA Marseille, 1 Dakar Sénégal, 1 Algérie
o 236 personnels présents sur le site Timone : 136 titulaires, 100 étudiants
o 30 personnels titulaires à Dakar, 16 personnels titulaires à l’IRBA, 3
personnels dans l’équipe émergente d’Alger
o BUDGET annuel consolidé : 10,923 K€
12 équipes de recherche – 12 thématiques de recherche
E1
Didier Raoult : Unité des Rickettsies et des pathogènes émergents
E2
Michel Drancourt : Outils pour la détection, l'identification et la caractérisation des pathogènes émergents
E3
Eric Ghigo & Jean-Louis Mège : Infections, genre et grossesse
E4
Bernard La Scola : Virus émergents et pathologies humaines
E5
Philippe Parola : Veille et Approche Entomologique des Maladies Vectorisées Emergentes
E6
Jean-Marc Rolain : Mucoviscidose microbiote et prise en charge thérapeutique
E7
Laurent Papazian : Infections respiratoires sévères émergentes et leur prise en charge
E8
Bruno Pradines : Maladies tropicales émergentes
E9
Pierre-Edouard Fournier : Equipe émergente : Génomique bactérienne
E10
Christelle Desnues : Equipe émergente : PathoVirome
E11
Jean-François Trape : Paludisme et maladies émergentes en Afrique : détection, épidémiologie et lutte.
E12
Idir Bitam : Equipe émergente : Maladies bactérienne vectorisées en Algérie
PRODUCTION (sur 20072007-2010)
o 934 Publications scientifiques (période 2007-2010 )
o 99 publications avec un Impact Factor IF>10 (période 20072010)
• 8 publications dans New England Journal of Medicine
• 2 Nature
• 8 Lancet
o 12 brevets, 1 société incubée INODIAG ayant créé 23 emplois, 1
start-up (AmiKana.Biologics)
o Découverte de 90 bactéries pathogènes pour les hommes, ainsi
que la découverte des plus gros virus connus sur la terre.
o Premier rang mondial pour sur 28 domaines de recherche, pour
les chercheurs de l’unité.
o Création des plus grandes séries mondiales pour 9 des domaines
de recherche de l’unité.
o 9 prix de prestige obtenus (sur 2007-2010) par des chercheurs de
l’URMITE
EVALUATION – contractualisation
Production
A+ Leadership international. La production de cette unité est au meilleur niveau
international. C’est une référence incontournable
dans son domaine. Plusieurs de ses productions ont été distinguées par des
invitations à des conférences majeures, des prix, une valorisation significative.
Classement A+ (ce qui classe l’URMITE dans les 19
premières de la vague B)
Classement : Première unité ex-æquo en France
Renouvellement du statut UMR (Unité Mixte de
Recherche) et contractualisation pour 6 nouvelles années.
UMR190:
Emergence des Pathologies Virales
Directeur:
X. de Lamballerie
Institution porteuse:
Aix-Marseille université
Institutions partenaires:
IRD & EHESP
Institution associée:
AP-HM
Création en 2008, arrivée progressive de nouveaux personnels
- M Souris, researcher, IRD (1 FTE)
- D Buchillet, reseacher, IRD (1FTE)
- A Dubot-Pérès, engineer, IRD (1 FTE) - L Thirion, researcher, IRD (1 FTE)
- JJ Lemasson, technician, IRD (1 FTE)
- N Leblanc, administrative, IRD (1 FTE)
- C Gazin, engineer, AP-HM (0.5 FTE)
- K Almani, technician, AP-HM (0.3 FTE)
- P Gallian, researcher, EFS (0.5 FTE)
U178
(IRD)
2008
2009
2010
2011
2012
EA3292
(UAM2)
- M Bessaud, post-doc (1 FTE)
- JL Romette, professor UAM2 (1 FTE)
- Y Boehmann, post-doc (1 FTE)
- L Ninove, assistant professor, UAM2 (0.5 FTE)
- B Pastorino, engineer, UAM2 (1 FTE)
- MT Aristodemo, secretary, UAM2 (1 FTE)
- R Monier, technician, UAM2 (1 FTE)
CIRR
CRISIS-H
- M Setbon, researcher, EHESP (0.5 FTE)
- J Raude, assistant professor, EHESP (0.5 FTE)
- A Constant, assistant professor, EHESP (0.5 FTE)
- P Crépey, professor, EHESP (0.5 FTE)
- R Freund, professor, EHESP (0.5 FTE)
- A Kieffer, research assistant, EHESP (1 FTE)
- R Ducos, PharmD, EHESP (0.3 FTE)
- L Houari, administrative, EHESP (0.5 FTE)
- I Elhamdi, administrative, EHESP (0.5 FTE)
Financement 2008-2011
Projets Européens
3 projets (dont 2 coordonnés par l’unité) pour un total de 3.1 millions d’euros attribués à l’unité
ANR
2 projets (dont 1 coordonné par l’unité) pour un total de 0.4 million d’euros attribué à l’unité
PHRC
3 projets (dont 1 coordonné par l’unité) pour un total de 0.55 million d’euros attribué à l’unité
AUTRES
7 projets (dont 2 coordonnés par l’unité et 2 financés par des industriels) pour un total de 1.1 million
d’euros attribué à l’unité
Publications 2008-2011
Journaux Internationaux à Comité de Lecture
~170 articles dont:
~50% signés en première ou dernière position
~20% co-signés par des partenaires de pays du Sud
Evaluation AERES des unités de Marseille
composantes de l’IHU - Notations
Histoire de l’IHU
A.
B.
C.
D.
E.
F.
G.
L’IHU POLMIT
L’IHU POLMIT
203 pages
IHU Marseille: Environment and Collaborations
IBISA
IRT, Lyon
Drug
screening
IHU BUILDING
Immunophenomics
HIA Laveran,
Marseille
Morphology
Proteomic
P3A3 Lab
cell culture
arthopods
Structural
Genomics
IBiSA
MicroBioGenomic
CHU, Nice
IRD
Montpellier
SOUTH NETWORK
SENEGAL
ALGERIA
Immunomonitoring
Study of contagion management
in the 21° century
Observation, evaluation,
traceability, prevention in
personnel
Flu paradigm, unforeseeable
outbreaks, Measles, Cholera in
Haiti
Optimising care (diagnostic
treatment)
Detection of abnormal
phenomena and quantification,
syndrome based (seasonal variation,
mortality/bacteriema)
Observatory
Africa (Senegal)
The Comoros
Euro-Mediterranean
Maghreb project
E-CDC travellers
WHO centres
Homeless population
Soldiers
Environment
Water, ground, arthropods
Humans samples
24.000/year for diagnostic
10 kits/pathologies
Emerging organisms
Problem→ sample → isolation → sequence → tool for diagnosis→
evaluation → publication → test dissemination
Cross-disciplinary: making connections
Transcriptomics
genomics
Immunology
Anthopology
Applied Microbiology
Infectious diseases
Proteomics
Glycomics
Social science
Come and go south
In Marseille with Nice and Montpellier.
With IRD
- Senegal platforms.
Forming students from the South (98 doc and post doc in 3 years).
Transferring technology (POC in Dielmo).
Creating a network on zoonotic and tropical emerging infections.
New professions
« Proof of concept »
Knowledge
Sharing
Scientific
monitoring
Patents
Market
monitoring
(needs)
Technologic
Platforms
(means)
Industrials
Partners
IHU
« Infectiopole »
Laboratory
(diagnostic)
VALORISATION
Invent
Cohorts
(patients)
SATT
PACA
Start up
Spin off
Collections
(biologic
(biological
banks)
IRT Lyon
EVALUATION
Protect
Develop
INDUSTRIAL DEVELOPMENT
Transfer
Evaluate
Create value
Diagnostic kits
Diagnostic kits
I.H.U
Hospitalization
Consultation
Diagnostic kits
Emergency room
P.O.C.
Assistance Publique
des Hôpitaux de
Marseille
Other
Core Laboratory
Clinics , hospitals , laboratories
in France and abroad
P.O.C.
Remote , mobile P.O.C .
Remote P.O.C. in
patient’s vicinity
Remote P.O.C
Strengthes and weaknesses
STRENGTHES
WEAKNESS
SCIENCE
- Infectious diseases, microbiology,
- Parasitology beside Malaria and
virology
entomology
Goal going from 9-10th to 7-8th in Solution by reinforcing
Europe
relationships with Montpellier,
Recruitment on fungi
LEADERS
- 10 out of 50 highest publishers in
- Number of professionals still low
France in the domains
Recruitment accelerated
TOOLS AND PLATFORMS
- Culture outstanding
Glycomics, structural biology, and
- Genomic: very good (1 ERC Grant) proteomics still weak
Develop the current ongoing cooperations
(B. Henrissat, C. Cambillau)
SAMPLING/COHORT
- Cohorts, largest in Africa, many
- Basic French sampling
series (world largest), travellers
Co-development with EFS (2 chairs)
(soldiers!)
+ all the French blood bank
- Kits
DIAGNOSTIC
- Samples outstanding
-Low transfer rate
- Home made diagnostic excellent
(1 company; 1 start up)
Mixing leaders and industrials
Union for the Mediterranean project
PHYSIOPATHOLOGY
- Good question, rising from physicians - Low level compared to competition
- Large cohort of single diseases (WD, Involve CIML (Malissen B., Vivier
Q fever)
E., Gorvel JP.) and IPC (Olive D.)
SOCIAL SCIENCES
- Anthropology (Paleomicrobiology),
Cost effectiveness studies
Ongoing with ministry of health,
Ethics, Economy
integration of J.P Moatti’s team
USING THE MONEY
Building : 20,000 m²
Managing conflicts of interest
Subsidiary and Cooperation
Not creating new definite positions of technicians and
scientists
BUT financing strategic points currently not well financed (too
long, too different), creating contracts with international calls to
recruit outstanding scientists for 4 years until recruited if adapted.
Contract with “oldies”
Attending students from the South (Africa, middle East) with
Infectiopôle Sud
Incentive for the best papers
Sponsoring risky subjects
Why Infectious diseases? Why here? Why me?
ID causes > 30 % of death world wide, Big three, Respiratory, Diarrheic, Cancer, vaccine
protected
My field has grown in 25 years from <50> to 8000 citations/year in Marseille my lab has
gone from 1 person to 240 including 65 foreign people
Our pole already makes benefits (> 1,2 M €/year) and 30 % of income is generated by
research or reference tests
Citations Yearly (Microbiology/Virology/Infectious diseases)
Total/ Marseille/ 25 years/ citations
I am 58 years old
I have an experience on management (ex president of university)
I have already worked and published with nearly all Pi of the project
I have created a company (small)
Histoire de l’IHU
A.
B.
C.
D.
E.
F.
G.
L’IHU POLMIT
14 pages
Fondation « Méditerranée Infection »
• 14/10/2011 : les statuts modificatifs ont été adoptés à l'unanimité par
le premier conseil d’administration suivant la transformation de
l'Infectiopôle Sud.
• 3 départements :
– Le bâtiment,
– L’excellence à Marseille,
– Infectiopôle Sud.
Localisation IHU POLMIT
PROJETS IHU
•
•
•
•
20 000 m²
3 unités de 30 lits avec chambre seule (2ème Conception 2012)
10 lits HDJ
Recherche chaire d’excellence :
– Parasitologie tropicale,
– Mycologie,
– Epidémiologie transmissible.
• Co-développement des sciences humaines et sociales
• Conservation antenne Nord
• Prix :
– meilleure publication,
– personnel.

Présentation DR CS 2011

Transcription

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