Pence Annual Report French 2000

Transcription

Le Réseau canadien
de génie protéique
1999 -2000
R A P P O R T
A N N U E L
À la découverte de protéines pour le nouveau millénaire
TABLE DES MATIÈRES
Perspective du président
1
Message des dirigeants du réseau
2
Le réseau en bref
4
Le programme de recherche en bref
5
Profils de nos succès
13
Projets industriels
15
Initiatives de PENCE
17
Avantages pour les Canadiens
17
Hommage à notre excellence scientifique 18
Membre
des Réseaux
de centres d'excellence
Canada
Extraits des états financiers
20
Le réseau PENCE et ses
partenaires strategiques
21
750 Heritage Medical Research Centre
Edmonton, (Alberta) Canada T6G 2S2
Tél. : 780/492-8851
Téléc. : 780/492-6995
courriel : [email protected]
www.pence.ca
PERSPECTIVE DU PRÉSIDENT
PENCE s'est servi de son expérience au cours de la dernière année pour se préparer à ce qui l'attend,
compte tenu des exigences auxquelles doivent satisfaire les RCE au cours de leur dernière période de
financement. Bob Hodges et ses collègues ont travaillé avec acharnement afin d'évaluer les recettes qu'un
réseau de recherche sur les protéines serait en mesure générer en commercialisant les résultats de ses
travaux pour assurer sa survie à la fin de la troisième période de financement. Leur analyse a clairement
démontré que la structure institutionnelle existante n'offrait pas de voie toute tracée pouvant permettre
de soutenir les réseaux de recherche fondamentale en sciences biologiques avec les recettes tirées de
la commercialisation du savoir nouveau issu de la recherche ou produit par le secteur privé. Nous nous
sommes servis de notre propre expérience de la commercialisation pour étudier la possibilité d'établir
un institut national de commercialisation rattaché aux réseaux de sciences biologiques qui pourrait
faciliter le transfert des connaissances nouvelles de la recherche de base vers d'éventuelles applications
commerciales. Des discussions avec les pouvoirs publics, le secteur privé et nombre de spécialistes des
sciences biologiques ont fait ressortir la nécessité d'un institut novateur du genre pour atteindre les
objectifs de commercialisation établis par le gouvernement pour la recherche de base. Si pareil institut
peut être établi, le RCE aura toute la latitude voulue pour se concentrer sur les possibilités de croissance
exponentielle en recherche fondamentale, ce qui est d'une importance capitale pour la recherche sur la
structure et la fonction des protéines. PENCE a donc deux objectifs clés pour l'avenir :
1. Établir avec d'autres RCE en sciences biologiques et le secteur privé un institut sans but lucratif chargé
de la commercialisation, que nous avons présenté comme CNBiocom.
2. Définir le nouveau champ de recherche de base sur les protéines qui pourrait utiliser la structure de
réseau créée par PENCE pour travailler dans le secteur de la protéomique.
Par suite de la démission de Bob Hodges comme directeur de PENCE, Steve Withers a pris la relève pour
assurer la direction scientifique des nouveaux développements en recherche. Bob Church dirige le
développement commercial en collaboration avec d'autres membres du conseil et le travail d'entreprenariat
de Graeme Macaloney au bureau de PENCE. Pendant tous ces changements s'opéraient, le travail du
personnel, des membres du conseil et des membres du réseau PENCE a été extraordinaire.
Nous n'aurions peut-être pas été en mesure de définir les enjeux aussi clairement que nous l'avons fait
sans le leadership de Bob Hodges. Il a apporté une contribution clé à ces développements et je lui en
suis très reconnaissant. Steve Withers a suivi les traces de Bob et du regretté Michael Smith en mettant
en valeur le concept du RCE comme réseau national de recherche fondamentale sur les protéines. Mike
Smith craignait toujours que les pressions en faveur de la commercialisation ne détournent PENCE de
son but et de sa base en recherche fondamentale. Il a appuyé sans réserve notre approche de la
restructuration de PENCE pour remettre le cap sur la recherche de base et réduire l'effet latéral de la
commercialisation. Pour ce faire, cependant, nous devons mettre sur pied un établissement national qui
créera l'équilibre synergique entre la recherche fondamentale et la commercialisation. Il était tout entier
derrière l'approche que nous suivons. Si nous atteignons ces objectifs, ce sera un tribut à Mike et à sa
contribution à la recherche fondamentale en sciences biologiques au Canada ainsi qu'à la mise en route
de l'un des RCE de très haute qualité en sciences biologiques.
J. Fraser Mustard
Président du conseil d'administration
1
Message des
DIRIGEANTS DU RESEAU
Dr. Robert Hodges,
Ex-chef de la direction /
directeur scientifique
(Juin 2000)
PENCE Inc., par suite de son plan stratégique en vue de la phase III, a obtenu un
financement pour sept ans de plus, à hauteur de 18,7 millions de dollars pour les quatre
premières années (1998-2002), et encore à déterminer pour la période de 2003 à 2005.
La deuxième année de la phase III (1er avril 1999 au 31 mars 2000) a été une autre année
fructueuse pour PENCE. Une subvention de 4,5 millions de dollars du RCE a permis
d'obtenir des contributions en espèces de 2,26 millions de dollars d'autres sources. Les
chercheurs ont publié 196 articles scientifiques et ont déposé 7 ententes de nondivulgation et 6 demandes de brevet. Huit licences ont également été concédées à
l'industrie, ou des négociations en ce sens se sont poursuivies. PENCE a également
négocié une participation dans deux sociétés nouvellement créées, Molecular Templates
Inc. et Converzyme Inc. De plus, Exella Ventures Inc., nouvelle entreprise de capital de
risque créée en partenariat avec le Réseau canadien sur les maladies génétiques (RCMG)
et le Réseau canadien de recherche sur les bactérioses (RCRB), a été constituée en
société. Le partenaire principal, RCMG, est actuellement en quête de financement
pour Exella.
La dernière année a été marquée par des changements et des progrès considérables au
Centre d'affaires national de PENCE - changements au niveau du personnel et de la
planification stratégique de la recherche et des activités de commercialisation du réseau
pour les cinq prochaines années. En février 2000, Taryn Campbell, notre responsable du
marketing et des communications, a quitté PENCE pour de nouveaux horizons. Le conseil
d'administration a assisté au départ de Julia Levy, de QLT Phototherapeutics Inc., qui
devait consacrer ses énergies en priorité au développement de produits à QLT et à la
croissance rapide de l'entreprise.
Steve Withers,
Chef de la direction /
(Juillet 2000)
Dr. Graeme Macaloney,
Chef de l'exploitation /
gestionnaire du réseau
2
En décembre 1999, Robert Hodges a annoncé son intention de démissionner, à compter
du 30 juin 2000, du double poste, qu'il occupait depuis cinq ans, de chef de la direction
et de directeur scientifique de PENCE Inc. Son dévouement et ses contributions à PENCE
ont été immenses. C'est sous sa direction que PENCE a été constituée en société et que
son financement renouvelé pour la phase III, recevant plus de fonds que tout autre réseau
du Programme de réseaux de centres d'excellence. Les partenariats de PENCE avec
l'industrie ont également atteint de nouveaux sommets, comme le démontrent les
statistiques de cette année et des années précédentes. Bob a pris congé pour mener des
recherches au Centre des sciences de la santé de l'Université du Colorado.
Stephen Withers a été choisi pour succéder à Robert Hodges après un long processus
de recrutement. Steve sera directeur scientifique intérimaire et chef de la direction. Il
sera assisté de Brian Sykes, directeur du centre régional de l'Alberta de PENCE. Steve
fait partie des départements de chimie et de biochimie de l'Université de la ColombieBritannique, où il est titulaire de la chaire Khorana de chimie biologique. Il est membre
fondateur de PENCE et fait partie de son conseil d'administration depuis quatre ans.
Rapport annuel de PENCE Inc. 2000
Relativement à l'avenir de PENCE, le conseil et la direction a poursuivi les rencontres de
l'an dernier du groupe de travail avec les chercheurs principaux, les membres du conseil
d'administration, la direction et des intervenants clés de l'extérieur pour figer le processus
d'examen et de planification dans un « plan stratégique » : Future Vision for PENCE and
the Life Science NCEs (Vision de l'avenir de PENCE et des RCE en sciences de la vie). Ce
plan a été établi avec la participation de Gordon MacNabb, O.C., P.Eng., ancien sousministre fédéral, ancien président du CRSNG et ancien président de PRECARN. Les
principales recommandations issues de cet exercice ont été la création d'un comité
consultatif international sur la recherche (CCIR), la réorientation de PENCE comme réseau
de recherche protéomique et la création d'un nouveau réseau national de commercialisation
avec les autres RCE en sciences de la vie.
Le mandat du CCIR est de conseiller la direction de PENCE quant à l'orientation future
du réseau vers la recherche sur les protéines et de le positionner à l'avant-scène internationale.
Le CCIR est un comité d'une importance critique parce qu'il a recours à un processus
d'examen indépendant par des pairs pour s'assurer que la recherche de PENCE est de
calibre mondial. En font partie Cyril Kay, président (Canada), Michel Chrétien (Canada),
Chris Dobson (Royaume-Uni), Kurt Drickamer (Royaume-Uni), Jack Greenblatt (Canada),
Robert Hodges (Canada), Howard Schachman (États-Unis) et Michael Smith (Canada).
L'initiative de recherche protéomique attend l'habile direction de Steve Withers.
Pour sa part, l'initiative de commercialisation a débuté, une stratégie à long terme consistant
à faire appel à divers intervenants du secteur privé, des RCE et des gouvernements pour
communiquer les avantages d'une nouvelle initiative nationale de commercialisation et
recevoir une rétroaction. Le but ultime est d'obtenir des fonds des gouvernements fédéral
et provinciaux ainsi que du secteur privé pour cette initiative afin qu'elle devienne une
entreprise distincte, mais rattachée à PENCE et aux RCE en sciences de la vie.
Malgré les nombreux changements, et les autres à venir, certains concepts de base
demeurent : la recherche sur les protéines restera à l'avant-scène de la biotechnologie;
l'excellence scientifique et la création de réseaux de recherche stratégique dans tout le
Canada favoriseront la mise au point de nouveaux produits, de nouveaux services et de
nouvelles technologies; la formation et le recyclage du personnel au Canada sont essentiels;
et la mise en commun des technologies de multiples établissements améliorera le processus
de transfert technologique, la création d'entreprises et l'investissement de capital de risque
dans la technologie canadienne.
Pour terminer, une triste nouvelle, les décès récents des cofondateurs de PENCE Inc.,
Michael Smith, lauréat du prix Nobel de chimie (4 octobre 2000), et de Larry Weiler, ancien
directeur du département de chimie de l'Université de la Colombie-Britannique (28 avril
1999). C'est grâce à leurs efforts que la proposition qui allait déboucher sur la création de
PENCE a pu être élaborée, et Michael a bien sûr été le directeur de PENCE pendant ses
quatre premières années d'existence. Les deux laissent un grand vide.
Novembre 2000
Dr. Robert Hodges,
Ex-chef de la direction /
(Juin 2000)
Steve Withers,
Dr. Graeme Macaloney,
Chef de la direction /
(Juillet 2000)
Chef de l'exploitation /
gestionnaire du réseau
3
LE RÉSEAU
E N
B R E F
Le réseau PENCE
L'engagement
ferme de PENCE
Inc. à l'égard de
l'excellence
scientifique
combinée à des
stratégies de
commercialisation axées sur
le marché nous
permettent de
mettre des
techniques de
recherche
innovatrices à la
disposition des
industries
pharmaceutiques, chimiques
et biotechnologiques ainsi que
des secteurs
spécialisés de
l'industrie des
soins de santé.
PENCE Inc. (le Réseau canadien de génie protéique) est un réseau dynamique d'éminents chercheurs
spécialisés dans l'étude des technologies protéiques. Constitué en société sans but lucratif vouée à la
recherche et à la commercialisation des découvertes, PENCE est un partenariat unique regroupant 18
universités, hôpitaux et instituts de recherche de partout au Canada. PENCE compte à son actif des
technologies protéiques concurrentielles au niveau mondial et des idées de recherche novatrices censées
aboutir à de nouveaux composés protéiques aux applications diverses, à de nouveaux médicaments
et à de nouveaux outils biotechnologiques. Nos partenaires industriels bénéficient ainsi du savoir parmi les plus grands au monde - du réseau PENCE dans le domaine des protéines et des peptides.
Créé en 1990, par l'innitiative des Réseaux de centres d'excellence du governement féderal,, PENCE
aura investi quelque 64 millions de dollars dans la recherche sur les protéines et la recherche fondamentale
d'ici à 2002. La phase III du programme de recherche
sera financée à hauteur de 18,7 millions de dollars
pour les quatre premières années (1998-2002). L'an
PENCE Inc.
prochain, PENCE fera l'objet d'un « examen de miLe Réseau canadien de centres d'excellence en génie protéique
parcours » par un comité de pairs international. La
teneur, les progrès et la direction du programme de
recherche feront seront alors soumis à un examen
Centre d'affaires national
critique. Nous serons ainsi certains que pour le reste
Centre régional de l'Alberta
de la phase III et la phase IV (2003-2005), PENCE sera
positionné pour jouer un rôle clé dans le domaine en
évolution de la protéomique.
Centre régional de la C.-B.
Le réseau PENCE comprend quatre centres
régionaux (Figure 1) situés à Vancouver (Université de
la Colombie-Britannique), à Edmonton (Université de
l'Alberta), à Toronto (Université de Toronto) et à
Montréal (Université de Montréal). Le Centre d'affaires
national, à Edmonton, est chargé de l'administration
du réseau et de la commercialisation des technologies
protéiques créées au sein du réseau PENCE.
Centre régional du Québec
Centre régional de l'Ontario
Qu'est-ce que le génie protéique?
Figure 1
Tous les organismes vivants sont constitués de
protéines. Celles-ci sont formées d'un assemblage
d'unités appelées acides aminés, reliées entre elles
par une longue chaîne. La conformation de chaque chaîne détermine la fonction des protéines, qui
peuvent jouer le rôle d'enzymes, d'hormones, de messagers chimiques et de récepteurs. Un grand
nombre de maladies sont attribuables à un déséquilibre protéique, soit parce qu'une protéine particulière
est absente, défectueuse, ou présente en trop petite ou en trop grande quantité. Le génie protéique
tire parti du savoir acquis sur la structure et la fonction des protéines pour élaborer des produits
thérapeutiques, des vaccins passifs et actifs, des systèmes diagnostiques, des outils de recherche, et
des produits et des enzymes à vocation industrielle, environnementale et agricole.
Qu'est-ce que la protéomique?
Le terme « protéome » a été créé en 1994 comme équivalent linguistique du concept de génome. Il
désigne l'ensemble des protéines qui sont exprimées et modifiées au cours de la vie d'une cellule. La
protéomique, ou la génomique fonctionnelle alors, est l'étude à grande échelle du protéome à l'aide
de technologies qui incluent l'expression et la séparation des protéines, la caractérisation de la structure
et de la fonction des protéines, et la conception rationnelle de médicaments. Chacun de ces champs
de la protéomique a besoin de la gestion des données et de la bioinformatique pour prendre en charge
les quantités astronomiques de données et créer des connaissances à valeur ajoutée qui peuvent en
bout de ligne déboucher sur de nouveaux produits, services ou technologies.
4
LE PROGRAMME DE RECHERCHE
E N
B R E F
Le programme de recherche de PENCE est divisé en sept thèmes, chacun dirigé par un
éminent spécialiste. Chaque thème est en plus divisé en sous-projets distincts confiés à
des équipes pluridisciplinaires composées de chercheurs canadiens de renom. La plupart
de ces chercheurs se sont acquis une réputation mondiale et comptent de nombreuses
récompenses à leur palmarès; certains même ont été décorés de l'Ordre du Canada.
Les sept thèmes de recherche sont les suivants :
T h è m e A :
Récepteurs et transduction de signal :
Traitements futurs des allergies, de l'inflammation et du cancer
Chercheur principal :
John Schrader, Biomedical Research Centre, Université de la Colombie-Britannique
Équipe de recherche :
Eric Ball (Université Western Ontario), Gary Brayer (Université de la Colombie-Britannique),
Ian Clark-Lewis (Université de la Colombie-Britannique), Robert Hodges (Université de
l'Alberta), Lewis Kay (Université de Toronto), Emil Pai (Université de Toronto), Tony Pawson
(Mt. Sinai Hospital), Jim Rini (Université de Toronto), Brian Sykes (Université de l'Alberta),
Mike Tyers (Mt. Sinai Hospital), Alice Vrielink (Université McGill), Hermann Ziltener
(Université de la Colombie-Britannique).
À la découverte
de protéines
Aperçu des projets de recherche du thème A
pour le nouveau
Élaboration d'inhibiteurs de l'action de l'IL-5
Chef de projet : John Schrader, Université de la Colombie-Britannique
millénaire
Un des objectifs de ce projet est de découvrir en vue de la conception d'inhibiteurs des
peptides ciblant le domaine extracellulaire de la chaîne du récepteur de l'IL-5 et de
supprimer ses interactions avec l'IL-5 ou sa capacité d'interagir avec la sous-unité du
récepteur ßc. Cette partie du projet est réalisée en collaboration avec Aventis. Un
deuxième objectif consiste à caractériser la structure tridimensionnelle du domaine
intracellulaire du récepteur de l'IL-5 et à définir la base structurale de l'association
avec la molécule de signal critique, JAK-2 kinase, que nous avons déjà démontrée. Nous
cherchons à valider l'interaction du domaine intracellulaire du récepteur de l'IL-5 et
de la JAK-2 kinase comme cible de composés qui permettront de bloquer la capacité
de l'IL-5 de produire et d'activer des éosinophiles et de prévenir leur mort apoptotique.
Cette partie du projet a été réalisée en collaboration de Novartis au début.
Le principal objectif commercial du projet est d'élaborer des composés peptidiques
faisant fonction d'antagonistes de l'IL-5 et de mettre au point une méthode de sélection
de composés à l'aide d'un mécanisme novateur d'inhibition de l'action de l'IL-5. Le but
est de mettre au point un médicament qui bloque les mécanismes pathogènes qui
sous-tendent les changements chroniques dans l'asthme. De nouveaux partenaires
industriels sont actuellement recherchés pour le projet.
Interactions protéine-protéine modulaires dans la transduction de signal - structure,
fonction et inhibition
Chef de projet : Tony Pawson, Mt. Sinai Hospital
Ce projet de recherche se divise en trois sous-projets :
1 analyse des protéines adaptrices modulaires et de leurs partenaires liants
2 détermination de la structure-fonction du récepteur McklO, identification de ses
ligands physiologiques
3 analyse des interactions protéine et du cycle cellulaire à l'aide de levure
Les principales maladies ciblées sont les cancers du sein, de l'ovaire et du cerveau,
ainsi que des leucémies spécifiques. Un partenaire industriel dont le nom ne peut être
dévoilé pourrait participer à la recherche portant sur des inhibiteurs spécifiques d'une
famille de kinases sérine-thréonine.
5
Traitements novateurs des maladies inflammatoires
Chef de projet : Ian Clark-Lewis, Université de la Colombie-Britannique
Cette recherche consiste à caractériser des peptides correspondant à l'extrémité Nterminale des chimiokines. Les petites molécules étant préférables sur le plan
thérapeutique, l'étude des peptides s'annonce prometteuse. L'importance du domaine
N-terminal dans la fonction des chimiokines a été démontrée, et nous avons constaté
que SDF et vMIP2, chimiokine d'origine virale, se liait à l'un des récepteurs de la
chimiokine. Un peptide SDF était biologiquement actif aussi, mais sous forme de dimère
surtout. La recherche vise à déterminer le fondement de cette propriété.
Dans un autre projet, nous avons terminé la détermination de la structure de l'éotaxine,
chimiokine en cause dans l'allergie. Une étude de la fonction-structure qui a nécessité
la création de ponts disulfures non naturels dans l'IL-8 a été menée à terme. La
détermination de plusieurs de ces structures haute résolution par rayons X a été
terminée récemment et devrait permettre un examen plus poussé des effets structuraux
locaux des modifications.
Études structurales des phosphodiestérases à nucléotides cycliques
Chef de projet : Alice Vrielink, Université McGill
L'AMP cyclique et le GMP cyclique sont d'importants messagers secondaires qui influent
sur la croissance et la prolifération des cellules par les voies de transduction de signal.
Les taux de nucléotides cycliques sont déterminés par le rythme de leur synthèse et
de leur dégradation. La présence de phosphodiestérases à nucléotides cycliques (PDE)
(enzymes responsables de la dégradation de l'AMP et du GMP cycliques) peut servir
à contrôler les messagers et, donc, la croissance cellulaire. Le projet vise à déterminer
les structures tridimensionnelles des PDE et à mettre leurs propriétés structurales en
corrélation avec des analyses fonctionnelles portant sur la régulation de l'activité
enzymatique et la liaison substrat-inhibiteur. Au point de vue commercial, cette recherche
pourrait déboucher sur la conception et l'élaboration d'inhibiteurs permettant de traiter
l'asthme et d'autres maladies inflammatoires. Un important partenaire dans ce projet
est Merck-Frosst, qui s'intéresse aux applications anti-inflammatoires en général et à
cette classe de cibles biologiques en particulier.
T h è m e B :
Protéinases et pathologies : base de données structure-fonction
de cibles thérapeutiques
Nabil Seidah,
Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM)
Michel Chrétien (Institut Loeb de recherche en santé), Mirek Cygler (IRB/McGill), Peter
Davies (Université Queen's), John Elce (Université Queen's), Zhongchao Jia (Université
Queen's), Claude Lazure (IRCM), Robert Ménard (IRB/McGill), John Mort (Université
McGill), Feng Ni (IRB/McGill), Andrew Storer (IRB/McGill).
6
Aperçu des projets de recherche du thème B
Application pharmacologique et médicale des précurseurs de convertases
Chef de projet : Nabil Seidah, Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM)
Le principal objectif de ce projet est de déterminer la structure et la fonction des
précurseurs de convertases (PC), dont la furine, PC5, PC7, PCI et PC2/7B2, au moyen
de la RMN et de la cristallographie par rayons X. Les résultats fournissent de nouvelles
cibles pour la conception de médicaments contre la maladie d'Alzheimer, les infections
virales et la resténose entre autres. Le partenaire industriel collaborant à cette recherche
est T2C2, qui a formé une société dérivée (Converzyme Inc.).
Des protéases à cystéine régulatoires : la dipeptidyl peptidase I et ses homologues
Chef de projet : John Mort, Université McGill
La cathepsine C (ou dipeptidyl peptidase I) est une protéase à cystéine qui intervient
dans les processus physiologiques normaux et les états pathologiques. Cette amino
dipeptidase est une cible possible se prêtant à la mise au point de traitements
immunothérapeutiques contrôlant l'activation des granzymes et ciblant l'apoptose
cellulaire. Notre programme s'inscrit dans le prolongement de nos travaux antérieurs
sur plusieurs autres membres de cette famille de protéases dont le nombre augmente
rapidement, et il débouchera sur une base de données structure-fonction qui servira
à l'élaboration d'inhibiteurs de la cathepsine C. Notre recherche devrait éventuellement
permettre de traiter des maladies inflammatoires et auto-immunes comme
l'artériosclérose, la leucémie, la sclérose en plaques et la myasthénie. Elle pourrait
aussi trouver des applications intéressantes dans la transplantation d'organes, où il
est impératif de supprimer les réponses immunitaires pour prévenir le rejet.
Études structure-fonction sur la calpaïne et conception d'inhibiteurs
Chef de projet : John Elce, Université Queen's
Cette recherche vise à déterminer la structure de la calpaïne, avec ou sans mobilisation
de calcium et d'inhibiteurs, et à élucider la régulation de cette activité. Les résultats
serviront à la recherche et à la conception rationnelle d'inhibiteurs spécifiques de la
calpaïne à vocation clinique. Nous avons récemment réussi à déterminer la structure
de la calpaïne en l'absence de calcium, et nous tentons maintenant de déterminer les
structures liées par covalence à divers inhibiteurs - en présence de calcium ou non.
C'est un objectif difficile à atteindre en raison de l'agrégation et de l'autolyse rapides
de la calpaïne en présence de calcium.
À la découverte
de protéines
pour le nouveau
millénaire
De grandes sociétés pharmaceutiques sont à la recherche d'inhibiteurs spécifiques à
vocation clinique qui pourraient servir à traiter les AVC, entre autres affections
neurodégénératives. L'activation anormale de la calpaïne intervient dans certains
troubles comme l'ischémie cérébrale, la maladie d'Alzheimer, l'infarctus du myocarde
et l'agrégation plaquettaire.
Nous avons reçu une importante aide de Warner-Lambert Canada, et Hoechst Marion
Roussel a également fourni des inhibiteurs en vue des essais de cristallisation. Des
travaux supplémentaires consistent en des études structure-fonction du motif à main
EF et d'autres mutations de la calpaïne d'après la nouvelle structure disponible. Une
souris transgénique déficiente en calpaïne fait l'objet d'études biocellulaires poussées
sur la fonction de la calpaïne in vivo.
7
T h è m e C :
Applications médicales de la dimérisation
Randy Irvin,
Université de l'Alberta
Dave Bundle (Université de l'Alberta), Jean Gariépy (Institut du cancer de l'Ontario/Université
de Toronto), Mark Glover (Université de l'Alberta), Robert Hodges (Université de l'Alberta),
Bruce Lennox (Université McGill), Maureen O'Connor-McCourt (IRB/McGill), Cyril Kay
(Université de l'Alberta), Brian Sykes (Université de l'Alberta).
Aperçu des projets de recherche du thème C
Biodétecteurs et applications diagnostiques reposant sur la technologie de la
super-hélice hétérodimérique à deux brins
Chef de projet : Robert Hodges, Université de l'Alberta
Le principal objectif de cette recherche est l'élaboration d'un biodétecteur électrochimique
robuste et économique qui, combiné à la polyvalence et aux caractéristiques conceptuelles
de notre super-hélice hétérodimérique à deux brins, devrait éliminer les obstacles à
l'emploi de biodétecteurs dans une vaste gamme d'applications.
Le biodétecteur est un dispositif récemment mis au point et breveté, qui fonctionne
sur le principe de la détection électrochimique des interactions récepteur-ligand. Ce
procédé unique consiste en une couche simple de molécules hautement ordonnées
qui adhèrent chimiquement à une surface or dotée d'un peptide capteur. Le signal est
déclenché par un peptide transporteur de ligands qui forme un composé complexe avec
un peptide de capture pour donner une super-hélice hétérodimérique à deux brins dans
la monocouche lipidique. L'utilité de l'hétérodimérisation pour l'immobilisation de
ligands sur les surfaces et la détection d'interactions protéiques avec les ligands
immobilisés est démontrée dans diverses applications protéomiques. Par l'entremise
de sa filiale Sensium Technologies Inc., Helix BioPharma permet l'utilisation sous licence
de technologies issues de cette recherche en vue de la mise au point de biodétecteurs
pour une vaste gamme d'applications médicales.
Criblage de banques de peptides synthétiques à la recherche de ligands (mucines)
Chef de projet : Jean Gariépy, Institut du cancer de l'Ontario
Les stratégies actuelles et futures d'administration de médicaments anticancéreux
dépendent toutes de l'exploitation de petits ligands pouvant cibler les cellules cancéreuses
et y transporter des fragments cytotoxiques et diagnostiques. Dans ce projet, nous
comptons utiliser des peptidothèques et des méthodes de criblage à haut débit pour
trouver de petits ligands peptides capables de cibler les cellules du cancer du sein et
d'autres cellules épithéliales cancéreuses. Notre groupe se concentre sur la recherche
de ligands peptidiques se liant aux séquences répétées en tandem de la mucine
MUC1 - important antigène dont la structure est nettement définie sécrété par
les tumeurs.
8
Peptidothèques au service de la découverte et de la mise au point de médicaments
Chef de projet : Robert Hodges, Université de l'Alberta
Combiner la puissance des procédures de sélection des pharmacothèques et l'élaboration
de matrices pouvant conférer des contraintes structurelles à une catégorie de molécules
est une façon rationnelle de trouver des ligands dotés de nouveaux pouvoirs de liaison
pour les programmes de découverte de médicaments. La super-hélice hétérodimérique
à deux brins a été utilisée comme matrice pour révéler une bibliothèque de séquences
sur la face exposée au solvant de la super-hélice dans ce système modèle. Cette
bibliothèque contient environ 1,9 million de composés à évaluer.
Dès qu'une séquence est identifiée, elle donne lieu à l'élaboration et à la synthèse d'un
peptidomimétique monomérique, qui est ensuite évalué en vue d'un usage thérapeutique
possible (selon sa stabilité et sa résistance à la protéolyse). Ses coordonnées moléculaires
peuvent également servir à un programme de conception rationnelle de médicaments
sur la base de structures.
Une jeune entreprise, DDL (Drug Discovery Libraries Inc.), est en train d'être créée pour
permettre aux sociétés pharmaceutiques et biotechnologiques d'optimiser leurs
programmes de découverte de médicaments. Cette entreprise se concentrera sur la
découverte de médicaments dans des secteurs privilégiant la technologie.
Le Design de novo de motifs structuraux destinés à des applications
de génie protéique
Chef de projet : Maureen O'Connor-McCourt, IRB/Université McGill
Les hélices à deux brins jouent un important rôle dans le contrôle d'une foule de
réponses cellulaires, en particulier dans les cascades de signaux complexes qui modulent
les réponses à un large éventail de facteurs environnementaux et cellulaires. Ce projet
vise à étudier divers systèmes bispiralés pour la conception et la production de bioréactifs
moléculaires qui peuvent utiliser ces systèmes efficacement pour contrôler la dimérisation
spécifique (comme homodimères ou hétérodimères spécifiques) ou l'oligimérisation
de différentes protéines en vue d'applications de génie protéique.
À la découverte
de protéines
pour le nouveau
millénaire
T h è m e D :
Conception et création de peptides et de protéines destinés
à des applications biotechnologiques
Peter Davies,
Université Queen's, Kingston (Ontario)
Robert Hodges (Université de l'Alberta), Randy Irvin (Université de l'Alberta), Zongchao
Jia (Université Queen's), Cyril Kay (Université de l'Alberta), Ron McElhaney (Université
de l'Alberta), Brian Sykes (Université de l'Alberta), David Wishart (Université de l'Alberta).
9
Aperçu des projets de recherche du thème D
Design et applications de peptides hélicoïdaux antigel
Chef de projet : Peter Davies, Université Queen's
Les protéines antigel permettent aux poissons de survivre au froid. Elles se lient à la
surface d'un germe cristallin et empêchent la formation de glace. Les applications
potentielles sont susceptibles d'intéresser les secteurs de l'alimentation surgelée
(additif aux aliments surgelés), de l'agriculture (protection des récoltes, tolérance accrue
des plantes au gel) et du génie biomédical (cryopréservation des produits sanguins,
adjuvants en cryochirurgie). La collaboration (avec entente de licence) se poursuit entre
A/F Protein Inc., l'Université Queen's et PENCE (Université de l'Alberta).
Peptides antébactériens
Chef de projet : Randy Irvin, Université de l'Alberta
Compte tenu de l'émergence d'une résistance étendue aux antimicrobiens - qui menace
l'efficacité de tous les antibiotiques existants - il est impératif de découvrir de nouvelles
classes d'antibiotiques. Le projet privilégie les peptides cycliques liés à la gramicidine
S (GS) - antibiotique actif au niveau de la membrane qui a été étudié à fond, mais dont
la toxicité restreint présentement l'usage clinique. Le profil de la relation structureactivité de la GS a été modifié afin de produire une série d'antibiotiques nouveaux
moins toxiques et dont l'activité antimicrobienne est optimisée pour certaines indications
cliniques. Micrologix Biotech Inc. s'est associée à PENCE pour poursuivre le
développement de cette technologie en vue de sa commercialisation.
T h è m e E :
Enzymes microbiennes à vocation industrielle
Grant Mauk,
Université de la Colombie-Britannique
Donal Leech (Université de Montréal), Grant Mauk (Université de la Colombie-Britannique),
Mike Paice (Institut canadien de recherches sur les pâtes et papiers (PAPRICAN)), Jeff Tolan
(Iogen), Theresa White (Iogen).
Aperçu des projets de recherche du thème E
La laccase recombinée pour la délignification des pâtes
Chef de projet : Mike Paice, Institut canadien de recherches sur les pâtes et papiers
(PAPRICAN)
Ce travail a pour but d'obtenir une variante de la laccase au potentiel de réduction, à
la stabilité thermique et à la plage de pH améliorés, et de trouver de nouveaux médiateurs
et procédés permettant d'optimiser la dégradation de la lignine par la laccase. Le projet
devrait permettre de produire une laccase recombinée et d'améliorer les médiateurs
de la laccase dans les futurs stades de délignification et de blanchiment - à moindre
coût par rapport aux méthodes traditionnelles. D'autres applications sont aussi possibles
dans l'industrie du textile et du traitement des effluents. L'Institut canadien de recherches
sur les pâtes et papiers (PAPRICAN) à Montréal est un partenaire important dans cette
initiative qui collabore étroitement avec les chercheurs de PENCE.
10
T h è m e F :
Les technologies fondées sur les glucides
Tony Warren,
Gary Brayer (Université de la Colombie-Britannique), Charles Haynes (Université de la
Colombie-Britannique), Doug Kilburn (Université de la Colombie-Britannique), Lawrence
McIntosh (Université de la Colombie-Britannique), Maureen O'Connor-McCourt
(IRB/McGill), Peter Ottensmeyer (Institut du cancer de l'Ontario/Université de Toronto),
Steve Withers (Université de la Colombie-Britannique), Jim Rini (Université de Toronto),
David Rose (Institut du cancer de l'Ontario/Université de Toronto, Harry Schachter
(Hospital for Sick Children/Université de Toronto).
Aperçu des projets de recherche du thème F
Synthèse enzymatique des oligosaccharides à l'aide de glycosidases modifiées
Chef de projet : Steve Withers, Université de la Colombie-Britannique
Ce projet vise à poursuivre le développement d'une plate-forme technologique brevetée,
les glycosynthases (des glycosidases modifiées qui élaborent des glucosides, mais sans
les hydrolyser), pour synthétiser des oligosaccharides à haut rendement à partir de
substrats peu coûteux. Les oligosaccharides ont diverses applications : additifs des
préparations lactées pour nourrisson se comportant comme des agents anti-infectieux
identiques à ceux du lait maternel, agents antiulcéreux et produits thérapeutiques
servant à traiter les otites. Notre partenaire collaborateur est NEOSE Technologies Inc.
Détermination de la structure tridimensionnelle des glycosyltransférases et des
glycosidases à visée thérapeutique
Chef de projet : Jim Rini, Université de Toronto
Les glycoconjugués jouent des rôles importants dans de nombreux processus d'interaction
normaux et pathologiques cellule-cellule : embryogenèse, inflammation, réactions
immunitaires, métastases, infections virales et bactériennes, etc. Les inhibiteurs de ces
processus pourraient donc avoir des vertus antiinflammatoires, antivirales et
antimétastatiques. Notre partenaire dans ce projet est GlycoDesign Inc., société dérivée
de PENCE.
À la découverte
de protéines
pour le nouveau
millénaire
La structure-fonction et les applications des domaines liant les glucides
Chef du projet : Charles Haynes, Université de la Colombie-Britannique
La recherche consiste à déterminer la structure et la fonction des domaines liant les
glucides, et à créer des applications connexes. Le potentiel commercial de cette plateforme fondée sur les domaines liant la cellulose a été exploité aux termes de licences
concédées à Novo Nordisk A/S, dans le secteur des textiles et des détergents, et à CBD
Technologies Inc., dans tous les autres champs. Parmi les applications, citons le ciblage
de régions choisies de leur substrat par les enzymes, l'immobilisation enzymatique et
la purification de protéines de fusion des domaines liant la cellulose. Les domaines liant
la cellulose peuvent également être utilisés comme sondes pour caractériser les propriétés
de la fibre, ainsi que pour obtenir des informations sur les facteurs limitant la conversion
de la biomasse.
11
T h è m e G
Bioinformatique
:
Brian Sykes,
Université de l'Alberta,
Suzanne Fortier (Université Queen's), Janice Glasgow (Université Queen's), John Gunn (Université
de Montréal), Lewis Kay (Université de Toronto), Francois Major (Université de Montréal) Lawrence
McIntosh (Université de la Colombie-Britannique), Enrico Purisima (IRB/McGill), Chris Upton
(Université de Victoria), Benoit Roux (Université de Montréal), et David Wishart
(Université de l'Alberta).
Aperçu des projets de recherche du thème G
RMN et reconnaissance moléculaire
Chef de projet : Lawrence McIntosh, Université de la Colombie-Britannique
Cette recherche vise à élaborer et à appliquer de nouvelles méthodes de spectroscopie RMN
pour comprendre comment les protéines reconnaissent et fixent les ligands - petites molécules
à autres protéines. La compréhension du fondement moléculaire de cette reconnaissance est
essentielle dans les domaines du génie protéique et de la conception de médicaments. Les
progrès récents des techniques d'acquisition et de traitement informatique des données de
RMN, combinés à de nouvelles méthodes biosynthétiques de marquage isotopique sélectif,
permettent d'étudier des protéines et des complexes protéiniques beaucoup plus volumineux
à une vitesse et avec une précision croissantes. Un site Internet d'accès réservé a été établi
pour permettre la libre diffusion de logiciels RMN récents parmi les chercheurs de PENCE. De
plus, de nouveaux trains d'impulsions RMN nécessaires à l'acquisition de données sont
distribués gracieusement à bien au-delà d'une centaine de laboratoires partout dans le monde.
Bioinformatique et conception de médicaments basée sur des structures
Chef de projet : David Wishart, Université de l'Alberta
La bioinformatique est une application de la technologie de l'information vouée au traitement
et à l'analyse informatisée des données de séquences protéiques et d'ADN. La conception de
médicaments fondée sur des structures est une technique informatique qui consiste à utiliser
les structures tridimensionnelles des ligands et des récepteurs présumés pour concevoir et
tester de nouveaux médicaments. Le projet vise à créer un logiciel destiné à optimiser la
recherche en chimie des protéines et la découverte de médicaments à base de protéines. Nos
partenaires industriels incluent BioTools Inc., Molecular Mining Inc., CERCA et Merck Frosst.
12
PROFILS
D E
N O S
S o c i é t é s
S U C C E S
é t a b l i e s
Les technologies issues de PENCE ont joué un rôle déterminant dans la création de
plusieurs sociétés prospères comme BioTools Inc., Cytovax Biotechnologies Inc.,
GLYCODesign Inc. et Sensium Technologies Inc. Un bref portrait de chacune suit.
BioTools Incorporated est une société de biotechnologie privée qui se consacre à la
production de logiciels de bioinformatique de qualité. Ses trois produits vedettes PepTool, GeneTool et ChromaTool - sont conçus pour favoriser la technologie de pointe
en offrant une interface puissante et intuitive qui permet d'accéder à des données de
séquences protéiques et à des outils analytiques. BioTools offre également des services
de consultation et de création de logiciels à contrat, mettant ainsi les talents de ses
programmeurs à la disposition de ses clients pour créer un produit adapté à leurs
besoins.
Cytovax Biotechnologies Inc. se concentre sur la mise au point et la commercialisation
de vaccins et de produits thérapeutiques pour la prévention et le traitement des maladies
infectieuses. Elle se sert de sa plate-forme technologique anti-adhésine pour mettre
au point des vaccins à base de peptides et des anticorps monoclonaux afin de prévenir
et de traiter une vaste gamme d'infections. Cytovax a signé une entente de licence et
de co-développement avec BioChem Pharma Inc. pour les deux premières cibles
bactériennes fondées sur cette technologie.
GLYCODesign Inc. est une société biopharmaceutique canadienne qui cherche à
améliorer la santé humaine en élaborant, par sa plate-forme de recherche glycobiologique
unique, de nouvelles stratégies thérapeutiques et des médicaments potentiels pour
des maladies éventuellement mortelles comme le cancer, les maladies infectieuses,
l'inflammation et les maladies cardio-vasculaires. La plate-forme technologique de
GLYCODesign incorpore des techniques informatiques poussées permettant de
déterminer et d'accélérer la conception, l'optimisation et la mise au point d'agents
glycothérapeutiques.
À la découverte
de protéines
pour le nouveau
millénaire
Sensium Technologies Inc. poursuit le développement de la technologie de détection
moléculaire de Helix BioPharma Corp. obtenue sous licence de PENCE, de l'Université
de l'Alberta et de l'Université McGill. Cette remarquable technologie est utilisée pour
la détermination et l'étude de cibles médicamenteuses et de nouveaux diagnostics.
Sensium entend utiliser cette nouvelle technologie afin de pousser plus avant la
recherche protéomique pour elle-même et Helix BioPharma Corp., mais aussi pour
d'autres sociétés pharmaceutiques.
13
S o c i é t é s
é m e r g e n t e s
CONVERZYME INC.
Converzyme Inc., société de recherche et développement canadienne évolutive, est
un formidable exemple de la manière dont deux établissements d’enseignement
canadiens, soit l’Institut de recherches cliniques de Montréal et l’Institut LOEB d’Ottawa,
le Réseau de centres d’excellence sur le génie protéique et T2C2, partenariat limité de
capital de risque, peuvent unir leurs efforts pour créer une entreprise de recherche
de pointe.
Converzyme Inc. est donc une société de recherche de pointe dont la stratégie de
découverte de médicaments repose sur un portefeuille exclusif de protéases-sérine,
les proprotéines convertases. Les convertases protéiques sont des cibles
médicamenteuses potentielles pour d'importantes affections humaines comme la
maladie d'Alzheimer, la resténose, le cancer métastatique, et les troubles liés au
cholestérol et aux acides gras.
Converzyme a obtenu une licence exclusive pour commercialiser toute la propriété
intellectuelle créée par l'Institut de recherches cliniques de Montréal dans les laboratoires
de Nabil G. Seidah et de Michel Chrétien relativement aux proprotéines convertases.
Cette recherche est financée en partie par PENCE dans le cadre du projet B1 - Applications
pharmacologiques et médicales des précurseurs de convertases. Elle a donné lieu à
deux brevets et à trois demandes de brevet jusqu'ici.
Présentement, PENCE et Converzyme poursuivent l'effort de recherche à l'IRCM et à
l'Institut LOEB en finançant plusieurs chercheurs de PENCE. Le but de cette recherche
est de mettre au point des traitements permettant de cibler les membres de la famille
des proprotéines convertases en cause dans la resténose et la maladie d'Alzheimer en
particulier. Les marchés pour le traitement de ces maladies sont à l'heure actuelle
indéfinis pour ce qui est des remèdes.
MOLECULAR TEMPLATES INCORPORATED
Molecular Templates Incorporated (MTI) a été créé par Jean Gariépy, avec l'aide du
Technology Transfer and Research Business Development Office de l'University Health
Network, et du Bureau de développement commercial de PENCE. Jean Gariépy est le
chercheur principal de PENCE; il est aussi scientifique principal à l'Institut du cancer
de l'Ontario (qui fait partie du University Health Network) et professeur à l'Université
de Toronto. Chez, MTI, Jean Gariépy occupe le poste de directeur scientifique. Il sera
secondé par Leigh Revers (agente des activités scientifiques) et David B. Shindler
(président).
MTI a bénéficié dernièrement d'un investissement initial d'un syndicat financier formé
de Milestone Medica, du Sunnybrook Working Ventures Medical Breakthrough Fund,
et d'un investisseur privé.
La mission de Molecular Templates Inc. (MTI) est de créer une classe entièrement
nouvelle et efficace d'agents anticancéreux. Molecular Templates Inc. utilise une
approche combinatoire pour modifier une puissante cytotoxine naturellement présente
dans l'organisme afin de lui conférer la capacité de cibler sélectivement et de tuer
différents types de cellules cancéreuses. Contrairement aux agents chimiothérapeutiques
actuels qui ont peu de spécificité tissulaire, et donc d'importants effets secondaires,
les toxines de MTI seront tissu-spécifiques, ce qui leur procurera un grand avantage
par rapport aux thérapies concurrentes. La technologie a également d'autres applications
thérapeutiques et diagnostiques. MTI se concentrera au départ sur la mise au point
d'agents thérapeutiques pour les cancers du sein et de la prostate.
14
PROJETS
INDUSTRIELS COURANTS
PENCE attribue une grande part de ses succès à des partenariats stratégiques clés
avec des sociétés biotechnologiques et pharmaceutiques dans une foule de domaines
de recherche différents. Dans l'ensemble, les collaborations avec l'industrie ont été
profitables à PENCE grâce à des projets de recherche mixtes entre l'industrie, PENCE
et les partenaires industriels de PENCE. Des projets sélectionnés sont présentés
sommairement ci-après.
Nos partenaires, qui sont parmi les principaux joueurs dans l'industrie, incluent
A/F Protein Inc.
Hoechst Marion Roussel
AltaRex Inc.
IBIS Pharmaceuticals Inc.
AstraZeneca
Iogen Corp.
Bayer Biological Products
BioTools Inc.
Biomira Inc.
Cangene Corporation
CBD Technologies Inc.
Converzyme Inc.
Merck Frosst Canada Inc.
Micrologix Biotech Inc.
NEOSE Technologies Inc.
Novartis Pharmaceuticals Inc.
À la découverte
Novo Nordisk Inc.
Cytovax Biotechnologies Inc.
Osprey Pharmaceuticals Inc.
Glaxo Wellcome Inc.
Pasteur Mérieux Connaught Ltd.
GLYCODesign Inc.
Sensium Technologies Inc.
Helix BioPharma Corp.
et Warner-Lambert Canada Inc.
de protéines
pour le nouveau
millénaire
A/F Protein Inc.
Subvention de recherche avec le Dr Davies (Université Queen's) et son équipe en vue
d'établir la structure de protéines antigel hélicoïdales (AFP) par RMN et cristallographie
par rayons X, ainsi que des méthodes de production d'une plate-forme fondée sur les
AFP stabilisées.
AstraZeneca
Subvention de recherche au Dr Kay (Université de Toronto) pour un projet de trois ans
en vue de l'élaboration de méthodes RMN permettant d'étudier la structure, la dynamique
et la thermodynamique de protéines et de complexes protéiques - et plus particulièrement
d'approches RMN pour l'étude des systèmes de poids moléculaire élevé.
BioTools Inc.
Au départ une société dérivée de PENCE, BioTools fournit aujourd'hui une subvention
de recherche au Dr Wishart (Université de l'Alberta) et à son équipe en vue de la mise
au point d'applications destinées à rehausser le pipeline technologique existant de
l'entreprise. L'effort de recherche porte sur l'élaboration de nouvelles méthodes pour
découvrir les relations éloignées entre la séquence et la structure; la prédiction de la
solubilité, de la stabilité et de la structure des protéines; la mise au point de techniques
d'exploration en profondeur des données; et l'étude des stratégies d'arrimage des
protéines-ligands.
CBD Technology Inc. / Novo Nordisk Inc.
Subvention de recherche au Dr Haynes (Université de la Colombie-Britannique) et à
son équipe pour déterminer la structure, la fonction et la modification potentielle des
sites de liaison de la cellulose dans leur interaction avec divers polypeptides.
15
Converzyme Inc.
Subvention de recherche avec le Dr Seidah (IRCM) et son équipe pour déterminer la
structure, la fonction et les cibles médicamenteuses potentielles des proprotéines
convertases.
Les laboratoires des Drs Hodges et Irvin à l'Université de l'Alberta s'appliqueront à mettre
au point un vaccin peptidique synthétique anti-Pseudomonas.
Glaxo Wellcome Inc.
Contrat de recherche avec le Dr Clark-Lewis (Université de la Colombie-Britannique) et
son équipe pour l'étude, à l'aide d'analogues peptidiques, d'inhibiteurs du domaine Nterminal de l'interface chimiokine-récepteur.
GLYCODesign Inc.
Subvention de recherche avec le Dr Rini (Université de Toronto) et son équipe pour la
détermination de la structure des glycosyltransférases et des glycosidases comme outil
pour la conception d'agents glycothérapeutiques.
Helix BioPharma Corp./Sensium Technologies Inc.
Ententes de R-D et de licence en vue d'établir une plate-forme technologique de biodétection
fondée sur la super-hélice hétérodimérique à deux bruns du Dr Hodges (Université de
l'Alberta) et de créer un biodétecteur novateur, la carte « BIOSMART®».
Contrat avec le laboratoire du Dr Ziltener (Université de la Colombie-Britannique) visant
à passer au crible un certain nombre de composés afin de trouver des inhibiteurs
de l'IL-5R.
Contrat de trois ans pour un projet de recherche de PENCE avec le Dr François Major, de
l'Université de Montréal. Le Dr Major travaillera à la modélisation tridimensionnelle de
séquences brevetées d'ARN à l'aide du logiciel novateur MC-SYM mis au point à son
laboratoire.
Iogen Corp.
Subvention de recherche au groupe du Dr Mauk (Université de la Colombie-Britannique)
pour la mise au point d'une classe d'enzymes appelées « laccases » servant à la dégradation
de la lignine, sous-produit de l'industrie des pâtes et papiers. Iogen a embauché un
chercheur postdoctoral qui travaillera avec l'équipe du Dr Mauk.
Subvention de recherche avec le Dr Vrielink (McGill) et son équipe pour l'étude des
phosphodiestérases (PDE). Le travail consiste à déterminer au moyen de la cristallographie
par rayons X et de la RMN les structures de diverses PDE.
Micrologix Inc.
Entente de R-D et de licence avec le Dr Hodges (Université de l'Alberta) et son équipe
pour l'élaboration d'un groupe de peptides cycliques antibactériens devant servir d'agents
thérapeutiques de nouvelle génération.
Subvention de recherche avec le Dr Withers (Université de la Colombie-Britannique) et
son équipe pour la transformation de glycosidases en enzymes synthétiques capables
d'élaborer des oligosaccharides.
Subvention de recherche avec le laboratoire du Dr Schrader (Université de la ColombieBritannique) pour trouver des cibles spécifiques de l'IL-5.
Warner-Lambert Canada Inc.
Contrat de recherche avec le Dr Elce (Université Queen's) et son équipe afin de résoudre
la structure cristalline d'une calpaïne particulière.
16
I N I T I AT I V E S D E P E N C E
Exella - fonds potentiel de capital de risque multiréseaux
Sous l'impulsion du Réseau canadien sur les maladies génétiques (RCMG), en partenariat avec le
Réseau canadien de recherche sur les bactérioses (RCRB) et PENCE, Exella Ventures Inc., à condition
d'obtenir le financement requis, procurera des capitaux de démarrage aux entreprises émergentes
du réseau. Des efforts sont en cours pour tenter d'assurer le financement d'Exella.
Comité consultatif international sur la recherche
Ce comité d'experts de renom international dans le domaine de la chimie et de la biochimie des
protéines a été formé pour conseiller et guider PENCE relativement à son positionnement pour rester
à l'avant-scène dans ce domaine.
Fonds des nouvelles initiatives
Le Fonds des nouvelles initiatives remplace le Programme des fonds de lancement de PENCE,
Alimenté par l'industrie, il sert à soutenir les initiatives de R-D, le maillage et le recrutement de
nouveaux partenaires industriels en vue de l'exploitation des technologies issues du réseau.
Stages PENCE en biotechnologie
Grâce à l'AHFMR (Alberta Heritage Foundation for Médical Research) et au BHRC (Biotechnology
Human Resource Council), PENCE a pu fournir à trois diplômés (MBA) de l'Université de l'Alberta
une expérience professionnelle précieuse dans les domaine de la commercialisation et du transfert
de technologie. PENCE apprécie grandement le dynamisme et les idées novatrices de ses stagiaires. À la découverte
Groupe de travail sur la protéomique
Un nouveau groupe de travail PENCE sur la protéomique a été formé pour déterminer comment
PENCE pourrait jouer un rôle directeur dans la création d'une « Initiative canadienne en
protéomique ». Composé de chercheurs de PENCE, le groupe de travail élaborera une stratégie à
long terme pour PENCE relativement à cette initiative.
de protéines
pour le nouveau
millénaire
AVANTAGES
POUR LES CANADIENS
PENCE poursuit la mise en œuvre d'une vaste gamme de programmes visant à commercialiser des
découvertes et des technologies protéiques novatrices dont pourront bénéficier l'industrie et 1'économie
canadiennes. Au cours de l'année écoulée, des progrès considérables ont été accomplis en vue de
la réalisation de notre mandat d'excellence dans la recherche scientifique, de maillage à l'échelle du
Canada, de transfert de technologie, de commercialisation, et de formation de la prochaine génération
de chercheurs-inventeurs et de dirigeants d'entreprise.
Depuis sa création en 1990, le réseau PENCE a produit plus de 1 300 publications et a obtenu 39
brevets. Soixante-dix pour cent des ses publications sont le résultat de collaborations avec des
chercheurs à l'intérieur et à l'extérieur du réseau. PENCE est fier de son personnel hautement
spécialisé. Le réseau offre une expérience de formation unique à des stagiaires en leur permettant
de travailler aux côtés de scientifiques universitaires et industriels au sein d'équipes multidisciplinaires.
Depuis 1990, plus de 200 stagiaires ont complété leur formation et travaillent dans l'industrie ou le
milieu universitaire partout dans le monde.
Dans le cadre du Programme de RCE, PENCE a investi près de 20 millions de dollars dans du matériel
et des installations de pointe, ce qui a permis de rehausser l'infrastructure de recherche du Canada.
PENCE prévoit mettre constamment à niveau ces installations pour maintenir son rang international
dans le domaine du génie protéique.
Nos chercheurs créent de nombreux débouchés commerciaux pour les technologies du réseau. Les
nombreuses sociétés auxquelles PENCE a donné naissance sont une source vitale de création
d'emplois de possibilités de R-D collective. Ces sociétés sont à l'origine de nouveaux produits, services
et technologies qui permettent d'améliorer la position du Canada sur le marché mondial des
biotechnologies.
17
HOMMAGE À NOTRE
EXCELLENCE SCIENTIFIQUE
Dimitris Argyropoulos (Université McGill, Centre de recherche sur les pâtes et papiers) a
été nommé fellow de l'Académie internationale des sciences du bois et fellow de l'Institut
de chimie du Canada pour ses contributions remarquables à la science.
Michel Chrétien (Institut Loeb de recherche en santé) - en 2000 : doctorat honorifique de
l'Université Memorial (Terrre-Neuve), et Médecin de mérite de l'Actualité médicale et Prix
Galien. En 1999 : doctorat honorifique de l'Université de Guelph. Prix Henry Friesen et
Médaille d'honneur de la Fondation pour la recherche en santé de l'ACIM (maintenant Les
compagnies de recherche pharmaceutique du Canada, Rx&D).
Peter Davies (Université Queen's) - boursier de recherche Killam (depuis le 1er janvier
2000), et récipiendaire du Prix d'excellence en recherche de l'Université Queen's.
Charles Deber (Hospital for Sick Children) a reçu le prix Vincent DuVigneaud 2000 de
l'American Peptide Society, qui vise à reconnaître « les réalisations extraordinaires dans
la recherche sur les peptides ». Son laboratoire a mis au point le programme TM Finder
pour prédire les segments transmembranaires dans les protéines. Le programme est
maintenant disponible sur Internet à http://www.bioinformatics-canada.org/TM/.
Zongchao Jia (Université Queen's) a reçu le premier prix d'excellence en recherche du
gouvernement de l'Ontario et le prix Basmajian pour l'excellence en recherche médicale
de l'Université Queen's.
Claude Lazure (Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM)) a été invité à faire
partie du comité de biochimie et de biologie moléculaire du Conseil de recherches médicales
(2000). Il a également été examinateur interne pour les bourses de chercheur principal de
la FRSQ en 2000. Il fait partie du comité d'examen interne de la HSCF (1999 et 2000) et est
président des réunions satellites de l'Union internationale de biochimie et de biologie
moléculaire qui auront lieu à Toronto en 2003.
Ron McElhaney (Université de l'Alberta) a été choisi pour recevoir le prix Avanti pour la
recherche sur les lipides de la Biophysical Society for Excellence in lipid and membrane
research.
Lawrence McIntosh (Université de la Colombie-Britannique) a reçu la bourse de recherche
Alexander von Humbolt (1999) et la bourse de Scientifique d'IRSC (2000).
Tony Pawson (Mount Sinai Hospital) a reçu le prix international J. Allyn Taylor en médecine
(2000), le prix Killam en médecine (2000), et a été reçu Officier de l'Ordre du Canada (2000)
Harry Schachter (Hôpital pour enfants et Université de Toronto). En 2000, a organisé le
Deuxième Symposium international sur les glycosyltransférases à l'Hôpital pour enfants.
A été conférencier invité au cours avancé 2000 de la Fédération des sociétés européennes
de biochimie (FEBS) sur les glycoconjugués à Lille (France), ainsi qu'au cours sur les
glycoconjugués dans les systèmes biologiques à Stockholm (Suède) et au symposium sur
les « anomalies congénitales de la glycosylation » à Boston (Massachusetts).
John Schrader (Université de la Colombie-Britannique) a reçu le prix Cinader, de la Société
canadienne d'immunologie, en 1999, et le prix UBC Killam, de l'Université de la ColombieBritannique (Canada), en 2000.
Nabil Seidah (Institute de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM)) a reçu la medaille
d'honneur, de la Fondation de Recherche Santé PMAC (maintenant les Companies à base
Recherche Pharmaceutique du Canada, Rx & D).
Brian Sykes (Université de l'Alberta) a été nommé fellow de la Royal Society of London
(FRS) en juillet 2000, et directeur du département de biochimie en juillet 1999. Il est
également responsable de NANUC (National High Field Nuclear Magnetic Resonance
Centre), le seul centre de résonance magnétique nucléaire de 800 MHz dans l'ouest canadien.
David Wishart (Université de l'Alberta) est titulaire de la chaire de recherche IRSC-Rx&D
(2000-2005).
18
HOMMAGE À NOTRE
EXCELLENCE SCIENTIFIQUE
Stagiaires postdoctoraux et étudiants diplômés
(Le nom du chercheur principal superviseur est indiqué entre parenthèses)
Sarah Everts, Université de la Colombie-Britannique (Lawrence McIntosh) - CRSNG BES-B
(refusé).
Steffen Graether, Université de l'Alberta (Brian Sykes) - bourse de recherche de l'AHFMR
et allocation de recherche d'IRSC.
Chris Hosfield, Université Queen's (Zongchao Jia ) - bourse de recherche au doctorat du CRM.
Robert Ingham, Mount Sinai Hospital (Tony Pawson) - bourse de recherche de l'INCC.
David Keizer, Université de l'Alberta (Brian Sykes) - bourse de voyage de l'AHFMR.
Christoph Mayer, Université de la Colombie-Britannique (Steve Withers) - Bourse de la Swiss
National Science Foundation Fellowship.
Siew Hwa Ong, Mount Sinai Hospital (Tony Pawson) - bourse de scientifique (recherche
médicale) du NMRC-Singapore Totalisator Board.
À la découverte
Pamela Plant, Mount Sinai Hospital (Tony Pawson) - bourse de recherche d'IRSC.
Nadia Rabah, Institut de recherches cliniques de Montréal (Claude Lazure) - bourse de
stagiaire du FCAR-FRSQ et bourse de la Division de médecine expérimentale de l'Université
McGill pour le rendement scolaire.
de protéines
pour le nouveau
Johann Schloegl, Université de la Colombie-Britannique (Steve Withers) - bourse de recherche
Erwin Schroedinger, Autriche.
millénaire
Robert Steven, Mount Sinai Hospital (Tony Pawson) - bourse de recherche d'IRSC.
Chris Tarling, Université de la Colombie-Britannique (Steve Withers) - bourse postdoctorale
de la Royal Society (Royaume-Uni).
Gary Van Domselaar, Université de l'Alberta (David Wishart)- bourse d'études supérieures
de la FRS de Rx&D (2000-2002).
David Vocadlo, Université de la Colombie-Britannique (Steve Withers) - bourse d'études
supérieures du CRSNG.
Spencer Williams, Université de la Colombie-Britannique (Steve Withers) - bourse de recherche
postdoctorale Killam.
David Zechel, Université de la Colombie-Britannique (Steve Withers) - bourse d'études
supérieures Killam; bourse d'études supérieures de l'université.
19
EXTRAITS DES ÉTATS
F I N A N C I E R S
PENCE Inc.
Extraits des états financiers
pour l'exercice terminé le 31 mars
BILAN DES OPÉRATIONS ET ACTIF NET NON AFFECTÉ
2000
RECETTES
Contributions
Redevances et autres recettes
DÉPENSES
Programmes de recherche
Installations centrales
Subventions d'équipement aux membres
Programmes de réseautage
Dépenses de fonctionnement nationales et régionales
Insuffisance des recettes sur les dépenses pour l'exercice
Actif net non affecté en début d'exercice
Actif net non affecté en fin d'exercice
1999
5 919 645 $
78 591
5 998 236
7 916 596 $
10 695
7 927 291
4 308 892
341 362
423 069
127 313
912 717
6 113 353
(115 117)
369 861
254 744 $
5 446 861
263 239
1 618 619
73 335
595 808
7 997 862
(70 571)
440 432
369 861 $
ÉTAT DE LA SITUATION FINANCIÈRE
ACTIF
Courant
Espèces
14 564 $
Sommes détenues par les établissements membres [note 3] 2 357 450
Contributions à recevoir
123 400
2 495 414
PASSIF ET ACTIF NET
Courant
Sommes payables
155 688
Contributions reportées [note 4]
2 084 982
2 240 670
Actif net
Actif net non affecté
254 744
2 495 414 $
14 358 $
1 486 723
135 175
1 636 256
21 881
1 244 514
1 266 395
369 861
1 636 256 $
Note 3. Les sommes détenues par les établissements membres représentent le solde des subventions des RCE et des autres
fonds détenus au nom de PENCE à la fin de l'exercice.
Note 4. Les contributions reportées représentent les fonds des RCE et les autres fonds de subventions qui devaient être
dépensés pour des projets de recherche ou des équipements précis, mais qui n'avaient pas été utilisés à la fin de l'exercice.
PENCE reçoit la plus grande partie de ses fonds du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie (CRSNG) et
du Conseil de recherches médicales (CRM) dans le cadre du Programme de RCE. Le financement futur dans le cadre de ce
programme devrait s'établir à 4 500 000 $ par année jusqu'au 31 mars 2002, sous réserve de la disponibilité annuelle
des fonds. La capacité de PENCE de rester viable dépend d'une aide financière continue dans le cadre du
Programme de RCE.
Il n'est pas tenu compte de la valeur des contributions en nature de biens et services dans les
présentés états financiers. Des états financiers vérifiés complets sont disponibles sur demande.
20
LE RÉSEAU PENCE ET SES
PARTENAIRES STRATEGIQUES
* Signataires de l'entente de réseau pour la phase III de PENCE Inc.
Universités*
Université de l'Alberta
Université de Calgary
Université de Guelph
Université de Montréal
Université de Toronto
Université de Victoria
Université de Waterloo
Université McGill
Université Queen's
Université Simon Fraser
Université Western Ontario
Instituts de recherche et hôpitaux *
Hospital for Sick Children
Institut de recherche en biotechnologie
Institut de recherches cliniques de Montréal
Institut Loeb de recherche en santé (Université d'Ottawa, Hôpital d'Ottawa)
Mt. Sinai Hospital
Ontario Cancer Institute/Princess Margaret Hospital
Organismes fédéraux*
Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada
Conseil de recherches médicales
Autres
Alberta Peptide Institute
Alberta Research Council
Alberta Science & Research Authority
Blake, Cassels & Graydon
British Columbia Science Council
Centre de recherché en calcul appliqué (CERCA)
Fondation canadienne pour l'innovation
Founder's Network
Iota Pi Law Group
Japanese Society for the Promotion of Science
Killam Foundation
Ontario Innovation Fund
PAPRICAN
Province de l'Ontario
Réseau canadien sur les maladies génétiques
Réseau canadien de recherche sur les bactérioses
Samuel Lunenfeld Research Institute
Swiss National Science Foundation
À la découverte
de protéines
pour le nouveau
millénaire
Industrie
A/F Protein Inc.
AltaRex Inc.
AstraZeneca
Bayer Biological Products
BioTools Inc.
Biomira Inc.
Cangene Corporation
CBD Technologies Inc.
Converzyme Inc.
Glaxo Wellcome Inc.
GLYCODesign Inc.
Helix BioPharma Corp.
Iogen Corp.
Micrologix Biotech Inc.
Novo Nordisk Inc.
Osprey Pharmaceuticals Inc.
Pasteur Mérieux Connaught Ltd.
Sensium Technologies Inc.
Warner-Lambert Canada Inc.
21
LE RÉSEAU DU PENCE
CHERCHEURS ET ADMINISTRATION
Les chercheurs du réseau PENCE
D. Argyropoulos, Université McGill
E. Ball, Université Western Ontario
G. Brayer, Université de la Colombie-Britannique
D. Bundle, Université de l'Alberta
M. Chrétien, Institut Loeb de recherche en santé
I. Clark-Lewis, Université de la Colombie-Britannique
M. Cygler, Institut de recherche en biotechnologie
P. Davies, Université Queen's
J. Elce, Université Queen's
S. Fortier, Université Queen's
J. Gariépy, Université de Toronto
J. Glasgow, Université Queen's
M. Glover, Université de l'Alberta
J. Gunn, Université de Montréal
C. Haynes, Université de la Colombie-Britannique
R. Hill, Ontario Cancer Institute
O. Hindsgaul, Université de l'Alberta
R. Hodges, Université de l'Alberta
Z. Huang, Merck Frosst Canada Inc.
R. Irvin, Université de l'Alberta
Z. Jia, Université Queen's
C. Kay, Université de l'Alberta
L. Kay, Université de Toronto
D. Kilburn, Université de la Colombie-Britannique
R. Kluger, Université de Toronto
G. Krepinsky, Université de Toronto
C. Lazure, Institut de recherches cliniques de Montréal
D. Leech, Université de Montréal
B. Lennox, Université McGill
F. Major, Université de Montréal
A.G. Mauk, Université de la Colombie-Britannique
R. McElhaney, Université de l'Alberta
L. McIntosh, Université de la Colombie-Britannique
R. Ménard, Institut de recherche en biotechnologie/McGill
J. Mort, Université McGill
F. Ni, Institut de recherche en biotechnologie/McGill
M. O'Connor-McCourt, Institut de recherche en biotechnologie/McGill
F.P. Ottensmeyer, Ontario Cancer Institute
E. Pai, Université de Toronto
M. Paice, Institut canadien de recherches sur les pâtes et papiers
A. Pawson, Mt. Sinai Hospital
M. Pinto, Université Simon Fraser
E. Purisima, Institut de recherche en biotechnologie/McGill
J. Rini, Université de Toronto
D. Rose, Ontario Cancer Institute
B. Roux, Université de Montréal
J. Saddler, Université de la Colombie-Britannique
U. Saragovi, Université McGill
H. Schachter, Hospital for Sick Children
J. Schrader, Université de la Colombie-Britannique
N.G. Seidah, Institut de recherches cliniques de Montréal
A. Storer, Institut de recherche en biotechnologie
B. Sykes, Université de l'Alberta
M. Tyers, Mt. Sinai Hospital
C. Upton, Université de Victoria
A. Vrielink, Université McGill
R.A.J. Warren, Université de la Colombie-Britannique
D. Wishart, Université de l'Alberta
S. Withers, Université de la Colombie-Britannique
H. Ziltener, Université de la Colombie-Britannique
Chercheurs industriels PENCE
J. Carver, GLYCODesign Inc.
J. Dennis, GLYCODesign Inc.
D. Segal, Helix BioPharma Corp.
Chercheurs affiliés au réseau
Y. Aubin, Merck Frosst Canada Inc.
C. Deber, Hospital for Sick Children
L. Howell, Hospital for Sick Children
G. Lajoie, Université de Waterloo
H. Lee, Université de Guelph
G. Privé, Ontario Cancer Institute
B. Sarkar, Hospital for Sick Children
J. Trevors, Université de Guelph
H. Vogel, Université de Calgary
22
CONSEIL D'ADMINISTRATION DE PENCE
1 9 9 9 - 2 0 0 0
J.F. Mustard, président, Founders' Network
B. Brennan, PhilomBios
M. Chrétien, Institut Loeb de recherche en santé
R.B. Church, Université de Calgary
R. Fraser, Université de l'Alberta
B.W. Gray, Blake, Cassels & Graydon
N. Harrison, Ventures West Management Inc.
R.S. Hodges, Université de l'Alberta
J. Levy, QLT Phototherapeutics Inc.
M. Piper, Université de la Colombie-Britannique
S. Withers, Université de la Colombie-Britannique
C. Yip, Université de Toronto
G. Macaloney, Centre d'affaires national PENCE (membre d'office sans droit de vote)
L. Mealing, CRSNG (membre d'office - sans droit de vote)
COMITÉ CONSULTATIF INTERNATIONAL SUR LA
RECHERCHE
1 9 9 9 - 2 0 0 0
C. Kay, président, Université de l'Alberta (Canada)
M. Chrétien, Institut Loeb de recherche en santé (Canada)
C. Dobson, University of Oxford (Royaume-Uni)
K. Drickamer, University of Oxford (Royaume-Uni)
J. Greenblatt, Université de Toronto (Canada)
R. Hodges, Université de l'Alberta (Canada)
H. Schachman, Université de la Californie, Berkeley (États-Unis)
M. Smith, Université de la Colombie-Britannique (Canada)
COMITÉ DE GESTION ET DE PLANIFICATION
SCIENTIFIQUE
1 9 9 9 - 2 0 0 0
Hodges, président, Université de l'Alberta (Juin 2000)
S. Withers, président, Université de la Colombie-Britannique (Juillet 2000)
D. Bundle, Université de l'Alberta
Z. Huang, Merck Frosst Canada Inc.
R. Irvin, Université de l'Alberta
L. Kay, Université de Toronto
D. Rose, Ontario Cancer Institute
H. Schachter, Hospital for Sick Children, Toronto
J. Schrader, Université de la Colombie-Britannique
D. Segal, Helix BioPharma Corp.
A. Storer, Institut de recherche en biotechnologie, Montréal
R.A.J. Warren, Université de la Colombie-Britannique
G. Macaloney, PENCE Inc. (membre d'office - sans droit de vote)
R. Joseph, PENCE Inc. (membre d'office - sans droit de vote)
L. Mealing, PENCE Inc. (membre d'office - sans droit de vote)
Centre d'affaires national
1 9 9 9 - 2 0 0 0
R. Hodges, chef de la direction et directeur scientifique, (Juin 2000)
S. Withers, chef de la direction et directeur scientifique, (juillet 2000)
G. Macaloney, directeur de l'exploitation
T. Campbell, chef, Marketing et Communications/coordonnatrice
de projet
R. Joseph, chef, Développement commercial
D. Wilchak, coordonnatrice, Finances et Administration
E. Poirier, secrétaire du réseau
I. Dijkstra, Développement commercial - stagiaire MBA
D. Lesoway, Marketing et Communications - stagiaire MBA
D. Lo, Développement commercial - stagiaire MBA
R. Yakimchuk, adjointe, Finances et Administration (temps partiel)
Directeurs des centres régionaux de PENCE
1 9 9 9 - 2 0 0 0
A.G. Mauk, Colombie-Britannique
E. Pai, Ontario (co-directeur)
H. Schachter, Ontario (co-directeur)
J. Mort, Québec
B. Sykes, Alberta

Pence Annual Report French 2000

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