stage SpoonKIM 2015 sfds (44,88 Ko)

OffredeStage:Sélectiondevariablesetintégrationdeconnaissancespour
ladétectiondesignalenpharmacovigilance
Contexte:Lapharmacovigilanceapourobjectifdedétecterleplusprécocement
possible les effets indésirables de médicaments commercialisés.
Traditionnellement, Elle s’appuie sur l’analyse de données de notifications
spontanées(unenotificationétantladéclarationpardesprofessionnelsdesanté
(médecins,pharmaciens,...)àdescentresdepharmacovigilancedelasurvenue
d’événements indésirables dont l’origine suspectée est médicamenteuse). A
l’échelle nationale, ces notifications spontanées constituent de grands
ensemblesdedonnéescequiamotivéledéveloppementd’outilsstatistiquesde
génération de signaux permettant l’identification de couples médicaments –
événements indésirables potentiellement associés. Ces outils statistiques ont
tout d’abord reposé sur l’analyse des notifications sous une forme agrégée, i.e.
croisant l’ensemble des médicaments avec l’ensemble des événements
indésirables présents dans la base. Plus récemment, avec l’amélioration des
capacités de calcul, la possibilité de retourner à l’analyse des données
individuelles est apparue et des approches par régression logistique ont été
proposées,notammentlarégressiondetypeLASSO.LeLASSOestuneméthode
dite pénalisée, développée pour permettre l’ajustement de modèles en grande
dimension. Avec ces approches, l’idée est de régresser chaque événement
indésirable (plusieurs milliers) sur l’ensemble des médicaments de la base
(plusieursmilliers).
Objectif:L’objectifdustageestd’étendrel’utilisationdelarégressionLASSOà
la prise en compte d’information a priori concernant les similarités physicochimiques entre médicaments; l’idée sous jacente étant que des médicaments
prochesd’unpointdevuephysico-chimiqueontplusdechancesdepartagerle
mêmetyped’effetsindésirables.
Ce stage est proposé à un étudiant en M2 Biostatistique / Statistique ou en
troisième année d’école d’ingénieur (ENSAI, ENSAE, ISUP, INSA, ENSIMAG…),
avec un intérêt pour les questions en santé et de bonnes compétences en
programmation R. Il sera effectué au sein de l’équipe «Biostatistique et
Pharmacoépidémiologie» (Dir. Pascale Tubert-Bitter). Cette équipe fait partie
de l’unité Inserm U1181 B2PHI «Biostatistique, Biomathématique,
Pharmacoépidémiologie et Maladies Infectieuses» (Dir. Didier Guillemot). Le
stageseraco-encadréparIsmaïlAhmed(chargéderecherche)etPascaleTubertBitter (Directeur de recherche). Il aura lieu au sein de l’hôpital Paul Brousse à
Villejuif(accèsmétroligne7).
Afindepostuleràcestage,lecandidatestinvitéàenvoyerunCV,unelettrede
motivation à Ismaïl Ahmed ([email protected]). Idéalement il devrait
aussi faire parvenir le relevé de ses notes ainsi que le nom de un ou deux
référents(oudeslettresderecommandation).
Duréedestage:6mois
Gratificationdestage:environ500euros(grillesInserm)