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La génétique
Génétique des haploides Neurospora cerevisiae pombe L’analyse de tétrades • L’analyse de tétrades est utilisée pour localiser des gènes chez les champignons et des algues unicellulaires. • Ces organismes sont haploides et présentent un cycle de développement haplobiontique ou haplodiplobiontique Analyse de tétrades • Exemples – Neurospora crassa – moisissure rose – Saccharomyces cerevisiae – levure de bièrre – Chlamydomonas reinhardtii – algue unicellulaire • Ces organismes sont haploides Cycle haplodiplobiontique de la levure Cycle haplobiontique de Neurospora Tétrades ordonnées • Neurospora – Une octade correspond à une tétrade qui a subi une mitose supplémentaire – L’ordre des spores dans l’asque correspond à la position des chromatides à la méiose – On peut différencier la ségrégation des allèles à la première ou la deuxième division de la méiose – Un crossing over entre le gène et le centromère conduit à une ségrégation à la deuxième division de la méiose (asques postréduits) – Le nombre d’asques postréduits divisé par deux donne la distance gène centromère Pas de crossing over gène - centromère 2ème division 1ère division Les centromères ségrègent vers deux pôles différents à la seconde division de la méiose, les demi tétrades sont homogènes et A et a sont séparés à la première division de la méiose. Les asques sont préréduits 1 crossing over gène – centromère 4 possibilités Les allèles A et a ségrègent à la deuxième division de la méiose les demi tétrades sont hétérogènes; Les asques sont postréduits Pour déterminer la distance gène centromère Si il n’y a pas de crossing over – Les demi tétrades sont homogènes avec a ou A – Les asques sont préréduits ségrégation à la 1ère division de la méiose Si il y a eu un crossing over Les demi tétrades sont hétérogènes avec A et a Les asques sont postréduits Ségrégation à la seconde division de la méiose Distance = % de postréduction /2 Ségrégation digénique digénique Ségrégation dans le le cas cas de de la la liaison liaison physique physique dans Lesdifférents différentstypes typesde despores sporesobtenues obtenues Les Danslelecroisement croisementab abxxaa++bb++ Dans ab Parental ab Parental + + Parental aa+bb+ Parental + Recombiné aa+bb Recombiné ab++ Recombiné ab Recombiné Les33types typesde detétrades tétradesobtenues obtenuessont: sont: Les Génotypes parentaux Génotype du zygote 2N Ditypes Parental (DP) Tétratypes (T) Ditypes Recombinés (DR) Origine des différentes tétrades •• •• •• •• •• Lesrègles: règles: Les Larecombinaison recombinaisonméiotique méiotiqueest est La réciproque réciproque LesDP DPproviennent proviennentde del’absence l’absencede de Les crossingover overou oude dedouble doublecrossing crossingover over crossing touchantles lesmême mêmechromatides chromatides touchant LesDR DRproviennent proviennentde dedouble doublecrossing crossing Les overtouchant touchant44chromatides chromatidesdifférentes différentes over LesTétratypes Tétratypesproviennent proviennentde desimple simple Les crossingover overou oude dedouble doublecrossing crossingover over crossing touchant33chromatides chromatides touchant Croisement ab x ++ gènes sur le même chromosome 0 crossing over résultats Types d’asques Ditype parental 1 crossing over Tétratype 2 crossing over 2 chromatides Ditype parental + 2 crossing over 3 chromatides résultats Types d’asques Tétratype 2ème possibilité Tétratype 2 crossing over 4 chromatides Ditype recombiné Pour déterminer la distance entre deux gènes : Les tétratypes tétratypes contiennent contiennent ½ ½ de de spores spores •• Les recombinantes et et 1/2 1/2 de de spores spores parentales parentales recombinantes Les DR DR ne ne contiennent contiennent que que des des spores spores recombinées recombinées •• Les •• •• Les DP DP ne ne contiennent contiennent que que des des spores spores parentales parentales Les (1/2 TT ++ DR)/total DR)/total asques asques == recombinants recombinants // total total (1/2 On multiplie multiplie par par 100 100 pour pour exprimer exprimer le le résultat résultat en en % % •• On Ségrégation di-génique di-génique Ségrégation dans le le cas cas de de l’indépendance l’indépendance dans Ségrégation de deux gènes sur des chromosomes différents avec : Allèle j = Allèle b = Croisement : j b+ x j+ b Génotypes et phénotypes des spores obtenues j b+ j+ b j+ b+ j b Les différents types de tétrades sont : DP DR IV Origine des différentes tétrades LesDP DPproviennent proviennent: : Les delalarépartition répartitiondes descentromères centromèresààlala11èreère **de divisionde delalaméiose méiose division del’absence l’absencede decrossing crossingover overou oud’un d’uncrossing crossing **de overentre entrechacun chacundes desgènes gènesetetson soncentromère centromère over LesDR DRproviennent proviennent •• Les delalarépartition répartitiondes descentromères centromèresààlala11èreère **de divisionde delalaméiose méiose division del’absence l’absencede decrossing crossingover overou oud’un d’uncrossing crossing **de overentre entrechacun chacundes desgènes gènesetetson soncentromère centromère over LesTétratypes Tétratypesproviennent: proviennent: •• Les d’uncrossing crossingover overentre entreun undes des22gènes gènesetetson son **d’un centromère centromère delalarépartition répartitiondes descentromères centromèresààlala11èreère **de divisionde delalaméiose méioseetetd’un d’uncrossing crossingover overentre entrechacun chacun division desgènes gènesetetson soncentromère centromère des Post-réduction Pré-réduction Pré-réduction Post-réduction DR DP IV IV DP DR IV IV IV DR DP IV IV IV IV DP DR IV IV IV IV IV IV DR IV IV IV IV DP DR IV IV IV IV IV DP 1-p p q Post-réduction 1-q Pré-réduction Pré-réduction Post-réduction DR DP IV IV DP DR IV IV IV DR DP IV IV IV IV DP DR IV IV IV IV IV IV DR IV IV IV IV DP DR IV IV IV IV IV DP = ffpp ++ ffqq –– 3/2f 3/2fppffqq ffIV IV = (attention pp et et qq sont sont exprimés exprimés en en fréquence fréquence !)!) (attention Analyse de tétrades • Poser les questions dans le bon ordre !!! Est ce que DP = DR? oui non DP = DR indépendance Le rapport DP/DR/T est- il 1:1:4? oui non liaison Y a -t-il des tétratypes? oui non T <2/3 T =2/3 Indépendance physique Indépendance génétique DP > DR Calculer la distance %R= (2*T + 4*DR)/4*Total asques Mutations fortement liées
