Licence Biologie Mathématiques

Licence
Biologie
Mathématiques
L’ARBRE DU VIVANT
Diversité, aperçu systématique et classification phylogénétique
des organismes vivants
François
Lallier
Jonas
Collen
Christophe
Six
Jean-Yves
Toullec
OBJECTIFS DE L’UE ARBRE DU VIVANT
• Notion
de diversité des organismes et de leurs
relations phylogénétiques vs écologiques
• historique, fondamentaux
• Notion
théorie évolution,...
de classification phylogénétique :
• synapomorphies, plesiomorphies, convergence, cladistique,...
• Aperçu
• accent
sélectif mais couvrant tous les domaines
sur les Eucaryotes
• Contact
LBM
physique avec cette diversité
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UE AV PLANNING
45 heures de cours
20 heures de TP
2 sorties terrain
LBM
60 /100 Examen écrit
30 /100 Examen TP
10 /100 Herbier (CC)
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UN OUVRAGE DE RÉFÉRENCE
01. L’exploration de la vie
• Campbell
I La chimie de la vie
02. L’organisation chimique fondamentale de la vie
03. La singularité vitale de l’eau
04. Le carbone et la diversité moléculaire de la vie
05. Structure et fonction des macromolécules
II La cellule
06. Exploration de la cellule
07. Structure et fonction des membranes
08. Introduction au métabolisme
09. La respiration cellulaire et la fermentation
10. La photosynthèse
11. La communication cellulaire
12. Le cycle cellulaire
III La génétique
13. La méiose et les cycles de développement sexués
14. Mendel et le concept de gène
15. Les bases chromosomiques de l’hérédité
16. Les bases moléculaires de l’hérédité
17. Du gène à la protéine
18. La génétique des Virus et des Procaryotes
19. Les génomes eucaryotes : structure, régulation et
évolution
20. La biotechnologie
21. La génétique du développement embryonnaire
IV Les mécanismes de l’évolution
22. La «descendance avec modification» : l’évolution
selon Darwin
23. L’évolution des populations
24. L’origine des espèces
25. Phylogenèse et systématique
LBM
V La diversité biologique à travers l’évolution
26. L’arbre de la vie : une introduction à la diversité
biologique
27. Les Procaryotes
28. Les Protistes
29. La diversité des Végétaux I : la colonisation des
milieux terrestres
30. La diversité des Végétaux II : l’évolution des
plantes à graines
31. Les Eumycètes
32. Introduction à la diversité des Animaux
33. Les Invertébrés
34. Les Vertébrés
VI Anatomie et physiologie végétales
35. Anatomie, croissance et développement des
Végétaux
36. Le transport des nutriments chez les Vasculaires
37. La nutrition chez les Végétaux
38. La reproduction des Angiospermes et la
biotechnologie végétale
39. Les réponses des Végétaux aux stimulus internes
et externes
VII Anatomie et physiologie animales
40. La structure et la fonction chez les Animaux :
principes fondamentaux
41. La nutrition chez les Animaux
42. La circulation et les échanges gazeux
43. Le système immunitaire
44. L’osmorégulation et l’excrétion
45. Les hormones et le système endocrinien
46. La reproduction chez les Animaux
47. Le développement chez les Animaux
48. Les systèmes nerveux
49. Les mécanismes sensoriels et moteurs chez les
Animaux
VIII L’écologie
50. L’écologie et la biosphère : introduction
51. La biologie du comportement
52. L’écologie des populations
53. L’écologie des communautés
54. Les écosystèmes
55. La biologie de la conservation et l’écologie de la
restauration
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UE AV PLAN DU COURS
Introduc)on
Des pro)stes et des algues
F. Lallier – 9 février
Campbell Chapitre 25
J. Collen – 21 février
Campbell Chapitre 28
Les origines de la vie
Les champignons
F. Lallier – 9 février
Campbell Chapitre 26
J. Collen – 24 février
Campbell Chapitre 31
Les procaryotes
Les plantes
F. Lallier – 10 février
Campbell Chapitre 27
C. Six – 6, 9 & 20 mars
Campbell Chapitres 29-30
Les animaux
J.Y. Toullec – 20 mars, 3 & 10 avril, 3 mai
Campbell Chapitres 32-34
LBM
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UN 2
ND
OUVRAGE DE RÉFÉRENCE
• Lecointre
LBM
& Le Guyader
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DES OUVRAGES PLUS SPÉCIALISÉS
• Le
«Brock»
• Ouvrage
de référence
en microbiologie
•
Chapitres utiles
02. Vue d'ensemble de la vie microbienne
II Evolution et diversités microbiennes
11. Evolution et systématique microbienne
12. Diversité des procaryotes : les Bactéria
13. Diversité procaryote : les archaea
III Diversité métabolique et écologie microbienne
17. Diversité métabolique
19. Ecologie microbienne
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DES OUVRAGES PLUS SPÉCIALISÉS
• Le
«de Reviers»
•
Le tome 1 situe les diverses lignées
d'« algues » parmi les autres êtres
vivants, analyse leur nature
composite, et expose les notions
fondamentales de phycologie.
•
Le tome 2 présente les onze
grands ensembles d'algues
comprenant, d'une part, un
embranchement de procaryotes
(les cyanobactéries) et, d'autre
part, dix groupes d'eucaryotes.
LBM
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DES OUVRAGES PLUS SPÉCIALISÉS
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L’ARBRE DU VIVANT... EN 2007
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